单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 1161 - 1180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1161 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Revealing Host Response Differences Triggered by Mutated Virus in Severe Dengue
2024-11-15, Viruses
DOI:10.3390/v16111779
PMID:39599894
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组技术揭示突变登革热病毒引发严重宿主反应差异的分子机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组技术分析突变登革热病毒在肝脏组织中的宿主反应差异，并鉴定出NRG/ErbB信号通路的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究突变登革热病毒引发严重宿主反应的分子机制 | 小鼠肝脏组织（未感染组、轻度感染NGC组、严重感染N10组） | 空间转录组学 | 登革热 | 单核RNA测序, 空间RNA测序, 计算机分子建模分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 小鼠肝脏组织样本（未感染、轻度感染、严重感染三组） | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1162 | 2025-10-06 |
GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish
2024-Oct-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae151
PMID:39499852
|
研究论文 | 通过斑马鱼垂体单细胞转录组分析揭示GnRH与促性腺激素细胞间的相互作用机制 | 首次在斑马鱼中通过单细胞RNA测序揭示LH和FSH促性腺激素细胞中促性腺激素β亚基的表达比例及GnRH受体的差异表达模式 | Gnrh3与促性腺激素细胞相互作用的具体结果仍不明确 | 阐明下丘脑Gnrh3及其他机制调控垂体促性腺激素细胞的作用 | 野生型和gnrh3基因敲除成年雌性斑马鱼的垂体细胞 | 单细胞转录组学 | 生殖内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 野生型和gnrh3-/-成年雌性斑马鱼的所有垂体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1163 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of a parasitic flatworm provides a molecular map of drug targets and drug resistance genes
2024-10-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53215-3
PMID:39414795
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组技术构建了肝片吸虫的分子图谱，识别了组织特异性基因表达模式 | 首次提供了寄生虫肝片吸虫的空间转录组图谱，揭示了药物靶点和耐药基因的组织特异性表达 | NA | 构建寄生虫肝片吸虫的空间转录组图谱，识别组织特异性基因表达和药物靶点 | 肝片吸虫（Fasciola hepatica）寄生虫 | 空间转录组学 | 寄生虫感染 | 空间转录组学，原位杂交 | NA | 空间转录组数据，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1164 | 2025-10-06 |
TGF-β-mediated crosstalk between TIGIT+ Tregs and CD226+CD8+ T cells in the progression and remission of type 1 diabetes
2024-10-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53264-8
PMID:39406740
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了1型糖尿病进展和缓解过程中TIGIT+ Tregs与CD226+CD8+ T细胞之间的相互作用机制 | 首次发现TIGIT+CCR7+ Tregs和CD226+CCR7+CD8+ T细胞在糖尿病缓解期的动态变化，并证实它们通过TGF-β信号通路相互作用 | 研究样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异 | 探索1型糖尿病免疫调节机制并寻找生物标志物 | 1型糖尿病患者和糖尿病小鼠模型的免疫细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序，机器学习，细胞通讯分析，体外功能实验 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | 不同疾病阶段的1型糖尿病患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1165 | 2025-10-06 |
Non-homogenous intratumor ionizing radiation doses synergize with PD1 and CXCR2 blockade
2024-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53015-9
PMID:39397001
|
研究论文 | 本研究探索了非均匀肿瘤内电离辐射剂量与PD1和CXCR2阻断联合治疗的协同效应 | 首次提出在同一个肿瘤内结合低剂量放疗的免疫刺激特性和高剂量放疗的细胞杀伤特性，并与免疫调节剂联合使用 | 研究仅限于小鼠模型中的结直肠癌和乳腺癌，尚未在人体验证 | 提高放疗疗效同时减少毒性，改善放疗与免疫检查点联合治疗的治疗指数 | 免疫活性雌性小鼠的结直肠癌和乳腺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌, 乳腺癌 | 流式细胞术, 细胞因子分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1166 | 2025-10-06 |
Cell type and regulatory analysis in amphioxus illuminates evolutionary origin of the vertebrate head
2024-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52938-7
PMID:39402029
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、信号通路扰动和顺式调控分析，揭示了脊椎动物头部特征的进化起源 | 首次在文昌鱼中鉴定出前索板样和神经嵴样细胞群体，并证明其发育调控机制在脊椎动物中具有保守性 | 研究主要基于模式生物文昌鱼，需要更多物种验证来确认进化保守性 | 探索脊椎动物头部特征的进化起源 | 文昌鱼胚胎发育过程中的细胞类型 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、信号通路扰动、顺式调控分析、跨物种转基因实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 文昌鱼胚胎发育样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1167 | 2025-10-06 |
Best practices for differential accessibility analysis in single-cell epigenomics
2024-10-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53089-5
PMID:39394227
|
研究论文 | 本文系统评估了单细胞表观基因组学数据中差异可及性分析的统计方法并提出了最佳实践方案 | 首次对单细胞ATAC-seq数据中差异可及性分析的统计方法进行系统性评估，并开发了相应的R软件包 | 评估主要基于匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据，可能存在方法评估的局限性 | 确定单细胞表观基因组学数据差异可及性分析的最佳统计方法 | 单细胞ATAC-seq数据的差异可及性分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq, bulk ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 表观基因组学数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, bulk ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1168 | 2025-10-06 |
WGCNA reveals a biomarker for cancer-associated fibroblasts to predict prognosis in cervical cancer
2024-Sep-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000001129
PMID:38946034
|
研究论文 | 通过WGCNA识别癌症相关成纤维细胞生物标志物并构建宫颈癌预后预测模型 | 首次基于CAF相关基因构建宫颈癌预后模型，并通过单细胞测序和实验验证关键基因在成纤维细胞中的特异性表达 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发基于癌症相关成纤维细胞基因特征的宫颈癌预后预测模型 | 宫颈癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，实时荧光定量PCR，免疫组织化学 | LASSO Cox回归模型，WGCNA网络分析 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和GEO数据库中的宫颈癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1169 | 2025-10-06 |
Caveats in Interpretation of Molecular Diagnostics in Heart Allografts
2024-07-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004895
PMID:38294835
|
综述 | 本文批判性评估了分子诊断技术在心移植排斥反应诊断中的局限性 | 首次系统分析分子诊断在心移植活检中应用的注意事项和分类方法缺陷 | 基于组织学标签的基因列表存在可重复性问题，分子分类与组织学诊断一致性低（仅40%），治疗意义未探索 | 评估分子诊断技术区分心移植排斥反应类型的准确性和可靠性 | 心脏移植活检样本 | 分子诊断 | 心血管疾病 | 分子分类器分析，生物信息学分析，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1170 | 2025-10-06 |
MEK1/2-PKM2 Pathway Modulates the Immunometabolic Reprogramming of Proinflammatory Allograft-infiltrating Macrophages During Heart Transplant Rejection
2024-05-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004899
PMID:38238904
|
研究论文 | 本研究揭示了MEK1/2-PKM2通路在心脏移植排斥期间促炎性移植物浸润巨噬细胞免疫代谢重编程中的关键作用 | 首次发现MEK1/2-PKM2通路调控移植物浸润巨噬细胞的免疫代谢重编程，并证实MEK1/2抑制剂trametinib可改善慢性心脏移植排斥 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究心脏移植排斥过程中移植物浸润巨噬细胞免疫代谢表型的分子调控机制 | 心脏移植物浸润免疫细胞，特别是巨噬细胞 | 免疫代谢学 | 心脏移植排斥 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，基因敲除 | 小鼠移植模型 | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1171 | 2025-10-06 |
Sequencing of Physically Interacting Cells in Human Kidney Allograft Rejection to Infer Contact-dependent Immune Cell Transcription
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004762
PMID:37638864
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术推断人类肾脏移植排斥反应中物理相互作用细胞的转录程序 | 开发了结合CD45阳性富集策略和CITE-seq的测序物理相互作用细胞计算方法，能够从单细胞RNA测序数据中推断细胞间物理接触的转录特征 | 样本量相对较小（11例活检样本），空间信息在单细胞测序过程中丢失 | 研究人类肾脏移植排斥反应中免疫细胞间物理接触依赖的转录调控机制 | 人类肾脏移植活检样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序，CITE-seq（转录组和表位细胞索引测序） | 测序物理相互作用细胞计算方法 | 单细胞转录组数据，表面蛋白表达数据 | 11例人类肾脏移植活检样本，产生31,203个高质量单细胞文库 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10X Genomics平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 1172 | 2025-10-06 |
Multiomics Data Reveal the Important Role of ANXA2R in T Cell-mediated Rejection After Renal Transplantation
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004754
PMID:37677931
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了ANXA2R在肾移植后T细胞介导排斥反应中的关键作用 | 首次发现ANXA2R作为新型TCR相关基因在TCMR中发挥重要作用，并证实ANXA2R+CD8+T细胞在排斥反应中显著增加 | 样本量相对有限（12个多组学数据集，23个病理切片），需要更大规模研究验证 | 阐明肾移植后T细胞介导排斥反应的TCR受体库特征并识别新的治疗靶点 | 肾移植患者的移植肾组织 | 生物信息学 | 肾移植排斥反应 | 多组学分析，单细胞转录组测序，免疫荧光染色，基因集富集分析 | TRUST4算法，多种免疫细胞浸润算法 | 多组学数据，转录组数据，单细胞数据，病理图像 | 12个多组学数据集，23个临床病理切片 | NA | 单细胞转录组测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1173 | 2025-10-06 |
Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of macrophage-like smooth muscle cells in advanced atherosclerotic plaque
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.87201
PMID:38389849
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示巨噬细胞样平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化斑块中的关键作用 | 发现具有中间表型的巨噬细胞样平滑肌细胞亚型，并鉴定IRF8通过激活NF-κB信号通路促进平滑肌细胞向巨噬细胞转分化的新机制 | NA | 探究晚期动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞表型多样性及其分子机制 | 人颈动脉粥样硬化斑块组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq, 谱系追踪技术 | NA | 单细胞转录组数据, bulk RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1174 | 2025-10-06 |
Mrc1+ macrophage-derived IGF1 mitigates crystal nephropathy by promoting renal tubule cell proliferation via the AKT/Rb signaling pathway
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.89174
PMID:38389846
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Mrc1+巨噬细胞来源的IGF1通过AKT/Rb信号通路促进肾小管细胞增殖，从而缓解晶体肾病的机制 | 首次构建了乙醛酸盐诱导晶体肾病的单细胞图谱，发现Mrc1巨噬细胞亚型通过分泌IGF1促进肾小管修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究晶体肾病中的细胞特征和细胞间通讯，寻找潜在治疗靶点 | 小鼠肾脏细胞，包括肾小管细胞、免疫细胞和间质细胞 | 单细胞生物学 | 晶体肾病 | 单细胞RNA测序 | Seurat, CellChat | 单细胞转录组数据 | 超过40000个单细胞，来自不同时间点(0,1,4,7天)的乙醛酸盐处理小鼠肾脏 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 1175 | 2025-10-06 |
Precision targeting of β-catenin induces tumor reprogramming and immunity in hepatocellular cancers
2024-Dec-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5494074/v1
PMID:39711542
|
研究论文 | 本研究开发了一种靶向β-catenin的siRNA脂质纳米颗粒疗法，可重编程肿瘤微环境并增强免疫治疗在肝癌中的疗效 | 首次证明靶向β-catenin的LNP-CTNNB1可通过重编程肿瘤细胞信号和免疫微环境，克服Wnt活性肝癌对免疫检查点抑制剂的耐药性 | 研究主要基于临床前模型，需要在人类临床试验中进一步验证 | 开发针对β-catenin突变肝细胞癌的新型治疗策略，克服免疫治疗耐药性 | β-catenin突变的肝细胞癌模型和患者 | 数字病理 | 肝癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, siRNA技术 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 多个免疫活性HCC模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1176 | 2025-10-06 |
Derivation of transplantable human thyroid follicular epithelial cells from induced pluripotent stem cells
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.004
PMID:39515316
|
研究论文 | 本研究从人类诱导多能干细胞成功分化出可移植的甲状腺滤泡上皮细胞 | 开发了表达NKX2-1和PAX8位点荧光标记物的新型iPSC系，建立了无血清培养基逐步分化方案 | iPSC来源的甲状腺滤泡细胞在体内无法挽救甲状腺功能减退症 | 开发治疗术后和先天性甲状腺功能减退症的新型治疗方法 | 人类诱导多能干细胞分化的甲状腺滤泡细胞 | 干细胞与再生医学 | 甲状腺功能减退症 | 单细胞RNA测序，异种移植 | NA | 基因表达数据，蛋白质检测数据 | 多个iPSC细胞系，无甲状腺免疫缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1177 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals molecular cues underlying the site specificity of the adult mouse oral mucosa and its stem cell niches
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.007
PMID:39547226
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示成年小鼠口腔黏膜及其干细胞微环境的分子特征 | 首次应用空间转录组学技术系统解析口腔黏膜不同部位的分子特征，并鉴定出成纤维细胞生长因子通路作为口腔上皮干细胞的潜在微环境因子 | 研究仅限于小鼠模型，人类口腔黏膜可能存在物种特异性差异 | 解析成年小鼠口腔黏膜部位特异性的分子机制及其干细胞微环境维持机制 | 成年小鼠的舌部、颊部和腭部口腔黏膜组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学(tomo-seq)，类器官形成效率检测 | NA | 空间转录组数据，类器官实验数据 | 成年小鼠的多个口腔部位组织样本 | NA | 空间转录组学 | tomo-seq | NA |
| 1178 | 2025-10-06 |
Bone morphogenetic protein 4 induces hematopoietic stem cell development from murine hemogenic endothelial cells in culture
2024-12-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.005
PMID:39547225
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现BMP4信号在E9.5造血内皮细胞中激活，并证明BMP4可诱导早期造血内皮细胞分化为造血干细胞 | 首次发现BMP4是促进早期造血内皮细胞向造血干细胞分化的关键因子，为体外诱导造血干细胞提供了新方法 | 研究仅使用小鼠胚胎细胞，尚未在人类细胞中验证 | 阐明早期造血内皮细胞向造血干细胞分化的信号需求 | 小鼠胚胎E9.5和E10.5时期的造血内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎E9.5和E10.5时期的造血内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1179 | 2025-10-06 |
Validation of non-destructive morphology-based selection of cerebral cortical organoids by paired morphological and single-cell RNA-seq analyses
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.09.005
PMID:39393360
|
研究论文 | 通过配对形态学和单细胞RNA测序分析验证基于非破坏性形态学的脑皮质类器官筛选方法 | 首次证明非破坏性形态分析可准确区分由脑皮质组织构成的类器官与其他脑组织类器官 | NA | 评估脑类器官分化培养中形成的类器官形态与其细胞组成的关系 | 脑类器官 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 形态学图像,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1180 | 2025-10-06 |
Lineage-specific dynamics of loss of X upregulation during inactive-X reactivation
2024-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2024.10.001
PMID:39486405
|
研究论文 | 本研究探讨了失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的变化规律 | 首次揭示了Xi重新激活与Xa上调状态丢失在不同细胞类型中的非同步性现象 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞数据相对有限 | 探究失活X染色体重新激活过程中活性X染色体上调状态的动态变化 | 小鼠胚胎外胚层、诱导多能干细胞、生殖细胞、胚胎外内胚层干细胞和人类B细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | 基因表达数据 | 多种细胞类型，具体样本数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |