单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1101	2025-03-22	Tuft cells and fibroblasts promote thymus regeneration through ILC2-mediated type 2 immune response 2024-01-12, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.abq6930 PMID:38215193	研究论文	本文研究了胸腺再生机制，特别是通过ILC2介导的2型免疫反应中胸腺绒毛细胞和成纤维细胞的作用	揭示了胸腺绒毛细胞和成纤维细胞通过激活2型免疫反应在胸腺再生中的新角色	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证	探讨胸腺再生的机制，特别是非T细胞的胸腺造血细胞的作用	小鼠胸腺细胞，特别是ILC2、胸腺绒毛细胞和成纤维细胞	免疫学	NA	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	使用地塞米松诱导的急性胸腺萎缩小鼠模型
1102	2025-03-22	Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche 2024-01-05, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152 PMID:38181095	研究论文	本文探讨了皮肤中调节性T细胞（Treg）在维持毛囊干细胞（HFSC）生态位免疫特权中的作用	开发了一种技术，将基因重组限制在皮肤中的调节性T细胞，揭示了皮肤Treg通过高亲和力IL-2受体表达在细胞外方式中保护HFSC生态位的机制	研究主要集中在皮肤中的Treg，未涉及其他非淋巴器官中的免疫耐受机制	研究皮肤中调节性T细胞在维持毛囊干细胞生态位免疫特权中的作用	皮肤中的调节性T细胞和毛囊干细胞生态位	免疫学	脱发症	基因重组技术、空间转录组学	NA	基因表达数据、空间转录组数据	NA
1103	2025-03-22	Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0298133 PMID:38363768	研究论文	本研究探讨了clusterin (CLU)在调控von Willebrand因子(VWF)中的作用，特别是在von Willebrand病(VWD)中的影响	首次通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析识别CLU作为VWF的潜在调控因子，并使用siRNA和CRISPR-Cas9技术在人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)中进行验证	研究未发现CLU敲低对Weibel-Palade小体(WPBs)的数量或大小有显著影响，且未探讨CLU在其他类型细胞中的作用	研究CLU在VWF调控中的作用，特别是在VWD中的机制	人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)	分子生物学	von Willebrand病	siRNA, CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据, 蛋白质水平数据	人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)
1104	2025-03-21	Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-related platelet bias: implications for bone marrow transplantation and blood disorders 2024-Dec-02, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-04084-6 PMID:39623507	研究论文	本文探讨了造血干细胞（HSCs）的异质性和与年龄相关的血小板偏向性，及其对骨髓移植和血液疾病的影响	揭示了血小板偏向性造血干细胞（P-HSCs）的存在及其在衰老过程中的扩展，提供了跨物种血小板偏向性HSCs的进化保守性证据	当前方法学存在局限性，需要进一步研究以优化HSC疗法并改善血液疾病的临床结果	研究HSCs的异质性和血小板偏向性对骨髓移植和血液疾病的影响	造血干细胞（HSCs）	血液学	血液疾病	单细胞RNA测序，分子条形码	NA	NA	NA
1105	2025-03-21	Local Controlled Delivery of IL-4 Decreases Inflammatory Bone Loss in a Murine Model of Periodontal Disease 2024-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2400332 PMID:39465979	研究论文	本文探讨了在慢性炎症性疾病中，通过局部控制递送IL-4来减少炎症性骨丢失的可行性	使用可生物降解聚合物载体封装IL-4，并在口腔内局部递送，以靶向巨噬细胞，从而减少炎症性骨丢失并促进骨再生	研究仅在鼠类模型中进行，尚未在人体中验证其效果	评估在慢性炎症性疾病中，通过局部控制递送IL-4来减少炎症性骨丢失的可行性	鼠类模型中的牙周病	免疫学	牙周病	单细胞RNA测序技术	NA	基因表达数据	鼠类模型
1106	2025-03-21	Endocytosis as a critical regulator of hematopoietic stem cell fate -implications for hematopoietic stem cell and gene therapy 2024-Sep-27, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-024-03927-6 PMID:39334274	评论	本文讨论了内吞作用在造血干细胞（HSCs）命运中的关键调节作用，及其对造血干细胞和基因治疗的影响	揭示了MYCT1蛋白在HSCs维持中的新作用，特别是在调节内吞作用和环境感知方面	尽管在体外培养HSCs方面取得了显著进展，但仍未完全理解所有潜在机制及其在HSCs增殖时的变化	探讨内吞作用在HSCs命运中的调节作用，及其对细胞治疗和基因治疗应用的影响	造血干细胞（HSCs）和造血祖细胞（HSPCs）	再生医学	血液和免疫细胞相关疾病	敲低、过表达、单细胞RNA测序和移植实验	NA	NA	NA
1107	2025-03-21	In vivo CRISPR screens identify Mga as an immunotherapy target in triple-negative breast cancer 2024-Sep-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2406325121 PMID:39298484	研究论文	本文通过体内CRISPR筛选，识别了Mga作为三阴性乳腺癌免疫治疗的潜在靶点	通过七种同源肿瘤模型的迭代体内CRISPR筛选，识别了跨癌症类型的核心和上下文依赖性免疫逃逸途径，并发现Mga敲除显著增强抗肿瘤免疫并抑制肿瘤生长	Mga在肿瘤免疫景观中的精确调控机制尚需进一步研究	探索肿瘤免疫逃逸机制，并寻找有效的抗癌治疗靶点	三阴性乳腺癌（TNBC）	癌症研究	乳腺癌	CRISPR筛选、转录组学、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、单细胞RNA测序数据	七种同源肿瘤模型
1108	2025-03-21	A practical handbook on single-cell RNA sequencing data quality control and downstream analysis 2024-Sep, Molecules and cells IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.mocell.2024.100103 PMID:39094968	review	本文提供了一本实用的手册，指导单细胞RNA测序数据的质量控制和下游分析	提出了选择高质量细胞的指南和分析过程中的注意事项，为改进单细胞分析质量奠定了基础	未提及具体的技术或模型限制	提高单细胞RNA测序数据的质量和分析流程的标准化	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1109	2025-03-21	Pharmacology of Hydrogen Sulfide and Its Donors in Cardiometabolic Diseases 2024-Aug-15, Pharmacological reviews IF:19.3Q1 DOI:10.1124/pharmrev.123.000928 PMID:38866561	综述	本文综述了硫化氢（HS）及其供体在心脏代谢疾病（CMDs）中的生理作用和药理作用的最新研究进展	强调了HS通过调节蛋白质的硫化修饰在CMDs发病机制中的重要性，并探讨了新兴技术如多组学、肠道菌群分析、类器官和单细胞测序在HS药理研究中的应用	未具体提及研究的局限性	探讨内源性HS及其供体在心脏代谢疾病中的生理和药理作用	心脏代谢疾病（CMDs）	药理学	心血管疾病	多组学、肠道菌群分析、类器官、单细胞测序	NA	NA	NA
1110	2025-03-21	Transfer Learning Reveals Cancer-Associated Fibroblasts Are Associated with Epithelial-Mesenchymal Transition and Inflammation in Cancer Cells in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma 2024-May-02, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1660 PMID:38587552	研究论文	本研究通过整合人类肿瘤的单细胞数据和人类类器官共培养实验，揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）中癌症相关成纤维细胞（CAF）与上皮细胞的上皮-间质转化（EMT）和炎症的关联	引入了从人类单细胞数据到类器官共培养分析的迁移学习，用于实验验证细胞间相互作用的发现，并识别了成纤维细胞介导的EMT和炎症调控	研究主要基于体外实验和计算模型，未涉及体内实验验证	探索PDAC中CAF与上皮细胞之间的相互作用及其对EMT和炎症的影响	胰腺导管腺癌（PDAC）中的癌症相关成纤维细胞（CAF）和上皮细胞	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序、类器官共培养实验	迁移学习	单细胞RNA测序数据、转录数据	NA
1111	2025-03-21	Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotype and phenotype in chronic lymphocytic leukemia 2024-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.15.585298 PMID:38559060	研究论文	本研究利用长读长单细胞RNA测序技术，探讨了慢性淋巴细胞白血病（CLL）中癌症亚克隆的基因型和表型特征	采用MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，显著提高了转录本的覆盖范围，并扩展了可用于将细胞与癌症亚克隆关联的信息突变集	研究样本量较小，仅涉及六名CLL患者	研究CLL亚克隆中是否存在额外的驱动突变加速亚克隆扩展，以及突变亚克隆是否表现出与其他癌症亚克隆不同的转录组行为	慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者	数字病理学	慢性淋巴细胞白血病	长读长单细胞RNA测序（MAS-seq）	NA	RNA测序数据	六名CLL患者
1112	2025-03-20	The SWI/SNF chromatin remodelling complex regulates pancreatic endocrine cell expansion and differentiation in mice in vivo 2024-Oct, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-024-06211-7 PMID:38958700	研究论文	本研究探讨了SWI/SNF染色质重塑复合体在小鼠胰腺内分泌细胞扩展和分化中的调控作用	揭示了BRG1和BRM ATPase亚基在内分泌细胞发育中的关键作用，并通过单细胞RNA-seq技术分析了基因表达的变化	研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类	研究SWI/SNF染色质重塑复合体在内分泌细胞发育中的作用	小鼠的胰腺内分泌细胞	分子生物学	糖尿病	单细胞RNA-seq	NA	基因表达数据	胚胎15.5天的小鼠内分泌细胞
1113	2025-03-20	Spatial microenvironments tune immune response dynamics in the Drosophila larval fat body 2024-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.12.612587 PMID:39345471	研究论文	本文研究了果蝇幼虫脂肪体中抗菌肽的异质表达，揭示了免疫反应在空间上的动态模式	首次使用活体光片荧光显微镜在单细胞分辨率下捕捉整个幼虫组织的免疫反应动态，并发现抗菌肽表达的空间模式与微生物定位相关但不受其驱动	研究仅限于果蝇幼虫脂肪体，未涉及其他组织或物种	探讨组织免疫反应的空间动态模式及其机制	果蝇幼虫脂肪体	生物医学	NA	活体光片荧光显微镜、空间转录组学	NA	图像、基因表达数据	果蝇幼虫
1114	2025-03-20	Single-Cell Sequencing Technology and Its Application in the Study of Central Nervous System Diseases 2024-Jun, Cell biochemistry and biophysics IF:1.8Q4 DOI:10.1007/s12013-023-01207-3 PMID:38133792	研究论文	本文探讨了单细胞测序技术及其在中枢神经系统疾病研究中的应用	单细胞测序技术能够对混合细胞群体中的单个细胞进行精确分析，并从中枢神经系统的不同空间位置、时间阶段和细胞类型中收集细胞，从而发现与特定疾病相关的细胞亚群及其相关基因	NA	探索单细胞测序技术在中枢神经系统疾病研究中的应用	中枢神经系统中的细胞，包括神经元和胶质细胞（如星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞）	生物信息学	中枢神经系统疾病	单细胞测序技术	NA	基因表达数据	NA
1115	2025-03-20	Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells from Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway 2024-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.18.585556 PMID:38562805	研究论文	本研究探讨了Ibudilast在保护视网膜双极细胞免受兴奋性毒性视网膜损伤中的作用，并激活了mTOR通路	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了Ibudilast在视网膜损伤中的神经保护机制，并发现其通过激活mTOR通路发挥作用	研究主要基于鸡的兴奋性毒性视网膜损伤模型，尚未在人体中进行验证	研究Ibudilast在保护视网膜神经元免受兴奋性毒性损伤中的作用及其机制	视网膜双极细胞和Müller胶质细胞	神经科学	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	鸡的兴奋性毒性视网膜损伤模型
1116	2025-03-20	The BCL-2 inhibitor APG-2575 resets tumor-associated macrophages toward the M1 phenotype, promoting a favorable response to anti-PD-1 therapy via NLRP3 activation 2024-01, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-023-01112-y PMID:38062129	研究论文	本文研究了BCL-2抑制剂APG-2575如何通过激活NLRP3信号通路，将肿瘤相关巨噬细胞从M2型转化为M1型，从而增强抗PD-1疗法的效果	首次发现APG-2575通过直接结合NF-κB p65激活NLRP3信号通路，介导巨噬细胞重极化，从而改善肿瘤免疫微环境	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索APG-2575如何通过改变肿瘤微环境增强抗PD-1疗法的效果	小鼠模型和人类肿瘤样本	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序，多重免疫组化	小鼠模型	RNA测序数据，免疫组化数据	小鼠模型和人类肿瘤样本
1117	2025-03-19	Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome 2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.12.626682 PMID:39713308	研究论文	本文研究了STAT3功能获得性突变（GOF）导致的CD8+ T细胞功能失调及其分子机制	揭示了STAT3 GOF通过改变嘌呤能信号通路导致CD8+ T细胞功能失调的新机制	研究主要基于STAT3 GOF患者和小鼠模型，可能不适用于其他类型的免疫失调疾病	探讨STAT3 GOF变异如何导致CD8+ T细胞功能失调及其分子机制	STAT3 GOF患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞	免疫学	自身免疫性疾病	高维免疫分析、单细胞RNA测序、功能评估	NA	基因表达数据、功能数据	STAT3 GOF患者和小鼠模型的CD8+ T细胞
1118	2025-03-19	Single-cell analysis reveals a unique microenvironment in peri-implantitis 2024-12, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.13982 PMID:38566468	研究论文	本研究通过单细胞分析揭示了种植体周围炎的独特微环境	首次通过单细胞RNA测序技术比较了种植体周围炎、牙周炎和健康个体的微环境差异，发现了种植体周围炎特有的免疫微环境特征	样本量有限，未进行长期随访研究	揭示种植体周围炎的独特微环境，为寻找新的治疗方法提供依据	种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的活检样本	数字病理学	牙周病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	种植体周围炎患者、牙周炎患者和健康个体的活检样本
1119	2025-03-19	Single-cell profiling reveals a conserved role for hypoxia-inducible factor signaling during human craniotomy infection 2024-Nov-19, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101790 PMID:39426374	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类颅骨切开术感染期间的细胞和分子特征，特别是低氧诱导因子（HIF）信号的作用	首次在人类颅骨切开术感染中识别出粒细胞性髓系来源抑制细胞的主导地位，并通过单细胞转录组分析揭示了HIF信号在感染中的保守作用	研究为回顾性研究，可能受到样本选择和数据的限制	探索人类颅骨切开术感染的细胞和分子特征，寻找潜在的治疗靶点	人类颅骨切开术感染患者和小鼠模型	数字病理学	感染性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	超过2,500例颅骨切开术患者
1120	2025-03-19	Association between biological ageing and periodontitis: Evidence from a cross-sectional survey and multi-omics Mendelian randomization analysis 2024-10, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.14040 PMID:38956929	研究论文	本文通过横断面调查和多组学孟德尔随机化分析，探讨了生物老化与牙周炎之间的关系及其潜在因果关系	结合横断面数据、孟德尔随机化（MR）和多组学整合分析，首次揭示了生物老化与牙周炎之间的因果关系及其潜在分子机制	研究主要基于观察性数据，因果关系的确立仍需进一步实验验证	探讨生物老化与牙周炎之间的关系及其潜在因果关系	3189名NHANES数据参与者及大规模meta-牙周炎GWAS数据集	生物医学	牙周炎	多组学整合分析、孟德尔随机化（MR）、单细胞测序	多变量回归分析、两步MR中介分析	基因组数据、横断面调查数据	3189名NHANES数据参与者