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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-10-06 |
MCT1-mediated endothelial cell lactate shuttle as a target for promoting axon regeneration after spinal cord injury
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.96374
PMID:39310103
|
研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤后内皮细胞乳酸穿梭机制对轴突再生的调控作用 | 首次发现MCT1介导的内皮细胞-神经元乳酸穿梭是促进脊髓损伤后轴突再生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 探究脊髓损伤后代谢改变对神经组织重塑和功能恢复的影响 | 脊髓损伤小鼠模型、内皮细胞、神经元 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 代谢组学、单细胞RNA测序、腺相关病毒技术 | NA | 代谢数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1062 | 2025-10-06 |
Conditional ablation of DIS3L2 ribonuclease in pre-meiotic germ cells causes defective spermatogenesis and infertility in male mice
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.98620
PMID:39310107
|
研究论文 | 本研究通过建立条件性基因敲除小鼠模型,揭示了DIS3L2核糖核酸酶在雄性小鼠精子发生过程中的关键作用 | 首次系统研究了DIS3L2在雄性生殖细胞发育中的功能,发现其在精原细胞分化和精母细胞减数分裂进程中的关键调控作用 | 研究仅局限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究DIS3L2核糖核酸酶在雄性生殖细胞发育和精子发生过程中的生物学功能 | 条件性基因敲除小鼠模型的睾丸组织和生殖细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 条件性基因敲除,bulk RNA-seq,scRNA-seq | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | 条件性敲除小鼠睾丸组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1063 | 2025-10-06 |
Hepatocyte-specific Smad4 deficiency inhibits hepatocarcinogenesis by promoting CXCL10/CXCR3-dependent CD8+- T cell-mediated anti-tumor immunity
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.97276
PMID:39346534
|
研究论文 | 本研究通过肝细胞特异性Smad4缺失小鼠模型,揭示了Smad4通过调控CXCL10/CXCR3信号通路影响CD8+ T细胞抗肿瘤免疫的新机制 | 首次发现肝细胞Smad4通过CXCL10/mTOR/LDHA通路调控CD8+ T细胞糖酵解和抗肿瘤功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明肝细胞Smad4在肝细胞癌发生发展中的具体作用机制 | 肝细胞特异性Smad4缺失小鼠和肝细胞癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,流式细胞术,细胞因子检测 | NA | 基因表达数据,免疫细胞浸润数据,代谢通路数据 | 小鼠模型和人类HCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1064 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-Seq analysis of molecular changes during radiation-induced skin injury: the involvement of Nur77
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.100417
PMID:39346541
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析辐射诱导皮肤损伤过程中的分子变化,发现Nur77的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示辐射诱导皮肤损伤的转录组框架和细胞间通讯,鉴定出Nur77作为新型治疗靶点 | 样本量有限,仅包含一名核事故患者和动物模型 | 阐明辐射诱导皮肤损伤的分子机制和潜在治疗靶点 | 人类皮肤样本(核事故患者)和大鼠皮肤样本 | 单细胞组学 | 辐射性皮肤损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一名人类患者和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1065 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic sequencing reveals immune microenvironment features of Mycobacterium tuberculosis granulomas in lung and omentum
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99038
PMID:39431015
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研究论文 | 通过空间转录组测序揭示肺部和网膜结核肉芽肿免疫微环境特征 | 首次从空间维度系统比较肺部和网膜结核肉芽肿的细胞组成差异,并利用类器官-巨噬细胞共培养模型验证THBS1在细胞外基质重塑中的关键作用 | 样本量较小(仅4例临床活检样本),需要更大规模研究验证发现 | 分析结核肉芽肿细胞群体的空间转录组特征,理解肉芽肿形成和发展的核心转录组特征 | 结核分枝杆菌感染的肺组织和网膜组织,以及非结核患者的对照组织 | 空间转录组学 | 结核病 | 空间转录组测序,类器官-巨噬细胞共培养 | NA | 空间转录组数据 | 4例临床活检样本(2例结核感染,2例非结核对照) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1066 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies Senescent Osteocytes That Trigger Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-12-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-0857
PMID:39312185
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现衰老骨细胞是乳腺癌骨转移中引发骨破坏的关键因素 | 首次揭示乳腺癌骨转移中骨细胞发生早衰并产生促破骨细胞生成的衰老相关分泌表型 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限 | 探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程的机制 | 乳腺癌骨转移小鼠模型和患者样本中的骨细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多重原位杂交,人工智能辅助分析 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 乳腺癌骨转移小鼠和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1067 | 2025-10-06 |
Dynamic Evolution of Fibroblasts Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Human Pancreatic Cancer
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0489
PMID:39485038
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示人类胰腺癌中成纤维细胞的动态演化过程 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析,开发新方法注释癌细胞基因组改变,首次系统揭示成纤维细胞在胰腺癌中的时空分化轨迹和细胞间互作网络 | NA | 研究胰腺导管腺癌中肿瘤微环境的基质重塑机制 | 正常、炎症和恶性胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1068 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus and Spatial Transcriptomics Revealing Host Response Differences Triggered by Mutated Virus in Severe Dengue
2024-11-15, Viruses
DOI:10.3390/v16111779
PMID:39599894
|
研究论文 | 通过单核和空间转录组技术揭示突变登革热病毒引发严重宿主反应差异的分子机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组技术分析突变登革热病毒在肝脏组织中的宿主反应差异,并鉴定出NRG/ErbB信号通路的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究突变登革热病毒引发严重宿主反应的分子机制 | 小鼠肝脏组织(未感染组、轻度感染NGC组、严重感染N10组) | 空间转录组学 | 登革热 | 单核RNA测序, 空间RNA测序, 计算机分子建模分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 小鼠肝脏组织样本(未感染、轻度感染、严重感染三组) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1069 | 2025-10-06 |
GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish
2024-Oct-30, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqae151
PMID:39499852
|
研究论文 | 通过斑马鱼垂体单细胞转录组分析揭示GnRH与促性腺激素细胞间的相互作用机制 | 首次在斑马鱼中通过单细胞RNA测序揭示LH和FSH促性腺激素细胞中促性腺激素β亚基的表达比例及GnRH受体的差异表达模式 | Gnrh3与促性腺激素细胞相互作用的具体结果仍不明确 | 阐明下丘脑Gnrh3及其他机制调控垂体促性腺激素细胞的作用 | 野生型和gnrh3基因敲除成年雌性斑马鱼的垂体细胞 | 单细胞转录组学 | 生殖内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 野生型和gnrh3-/-成年雌性斑马鱼的所有垂体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1070 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of a parasitic flatworm provides a molecular map of drug targets and drug resistance genes
2024-10-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53215-3
PMID:39414795
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组技术构建了肝片吸虫的分子图谱,识别了组织特异性基因表达模式 | 首次提供了寄生虫肝片吸虫的空间转录组图谱,揭示了药物靶点和耐药基因的组织特异性表达 | NA | 构建寄生虫肝片吸虫的空间转录组图谱,识别组织特异性基因表达和药物靶点 | 肝片吸虫(Fasciola hepatica)寄生虫 | 空间转录组学 | 寄生虫感染 | 空间转录组学,原位杂交 | NA | 空间转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1071 | 2025-10-06 |
TGF-β-mediated crosstalk between TIGIT+ Tregs and CD226+CD8+ T cells in the progression and remission of type 1 diabetes
2024-10-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53264-8
PMID:39406740
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了1型糖尿病进展和缓解过程中TIGIT+ Tregs与CD226+CD8+ T细胞之间的相互作用机制 | 首次发现TIGIT+CCR7+ Tregs和CD226+CCR7+CD8+ T细胞在糖尿病缓解期的动态变化,并证实它们通过TGF-β信号通路相互作用 | 研究样本量有限,动物模型与人类疾病存在差异 | 探索1型糖尿病免疫调节机制并寻找生物标志物 | 1型糖尿病患者和糖尿病小鼠模型的免疫细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序,机器学习,细胞通讯分析,体外功能实验 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | 不同疾病阶段的1型糖尿病患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1072 | 2025-10-06 |
Non-homogenous intratumor ionizing radiation doses synergize with PD1 and CXCR2 blockade
2024-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53015-9
PMID:39397001
|
研究论文 | 本研究探索了非均匀肿瘤内电离辐射剂量与PD1和CXCR2阻断联合治疗的协同效应 | 首次提出在同一个肿瘤内结合低剂量放疗的免疫刺激特性和高剂量放疗的细胞杀伤特性,并与免疫调节剂联合使用 | 研究仅限于小鼠模型中的结直肠癌和乳腺癌,尚未在人体验证 | 提高放疗疗效同时减少毒性,改善放疗与免疫检查点联合治疗的治疗指数 | 免疫活性雌性小鼠的结直肠癌和乳腺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌, 乳腺癌 | 流式细胞术, 细胞因子分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1073 | 2025-10-06 |
Cell type and regulatory analysis in amphioxus illuminates evolutionary origin of the vertebrate head
2024-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52938-7
PMID:39402029
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、信号通路扰动和顺式调控分析,揭示了脊椎动物头部特征的进化起源 | 首次在文昌鱼中鉴定出前索板样和神经嵴样细胞群体,并证明其发育调控机制在脊椎动物中具有保守性 | 研究主要基于模式生物文昌鱼,需要更多物种验证来确认进化保守性 | 探索脊椎动物头部特征的进化起源 | 文昌鱼胚胎发育过程中的细胞类型 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、信号通路扰动、顺式调控分析、跨物种转基因实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 文昌鱼胚胎发育样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1074 | 2025-10-06 |
Best practices for differential accessibility analysis in single-cell epigenomics
2024-10-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53089-5
PMID:39394227
|
研究论文 | 本文系统评估了单细胞表观基因组学数据中差异可及性分析的统计方法并提出了最佳实践方案 | 首次对单细胞ATAC-seq数据中差异可及性分析的统计方法进行系统性评估,并开发了相应的R软件包 | 评估主要基于匹配的bulk ATAC-seq或scRNA-seq数据,可能存在方法评估的局限性 | 确定单细胞表观基因组学数据差异可及性分析的最佳统计方法 | 单细胞ATAC-seq数据的差异可及性分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq, bulk ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 表观基因组学数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, bulk ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1075 | 2025-10-06 |
WGCNA reveals a biomarker for cancer-associated fibroblasts to predict prognosis in cervical cancer
2024-Sep-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000001129
PMID:38946034
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研究论文 | 通过WGCNA识别癌症相关成纤维细胞生物标志物并构建宫颈癌预后预测模型 | 首次基于CAF相关基因构建宫颈癌预后模型,并通过单细胞测序和实验验证关键基因在成纤维细胞中的特异性表达 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发基于癌症相关成纤维细胞基因特征的宫颈癌预后预测模型 | 宫颈癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序,实时荧光定量PCR,免疫组织化学 | LASSO Cox回归模型,WGCNA网络分析 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的宫颈癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1076 | 2025-10-06 |
Caveats in Interpretation of Molecular Diagnostics in Heart Allografts
2024-07-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004895
PMID:38294835
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综述 | 本文批判性评估了分子诊断技术在心移植排斥反应诊断中的局限性 | 首次系统分析分子诊断在心移植活检中应用的注意事项和分类方法缺陷 | 基于组织学标签的基因列表存在可重复性问题,分子分类与组织学诊断一致性低(仅40%),治疗意义未探索 | 评估分子诊断技术区分心移植排斥反应类型的准确性和可靠性 | 心脏移植活检样本 | 分子诊断 | 心血管疾病 | 分子分类器分析,生物信息学分析,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1077 | 2025-10-06 |
MEK1/2-PKM2 Pathway Modulates the Immunometabolic Reprogramming of Proinflammatory Allograft-infiltrating Macrophages During Heart Transplant Rejection
2024-05-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004899
PMID:38238904
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研究论文 | 本研究揭示了MEK1/2-PKM2通路在心脏移植排斥期间促炎性移植物浸润巨噬细胞免疫代谢重编程中的关键作用 | 首次发现MEK1/2-PKM2通路调控移植物浸润巨噬细胞的免疫代谢重编程,并证实MEK1/2抑制剂trametinib可改善慢性心脏移植排斥 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究心脏移植排斥过程中移植物浸润巨噬细胞免疫代谢表型的分子调控机制 | 心脏移植物浸润免疫细胞,特别是巨噬细胞 | 免疫代谢学 | 心脏移植排斥 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因敲除 | 小鼠移植模型 | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1078 | 2025-10-06 |
Sequencing of Physically Interacting Cells in Human Kidney Allograft Rejection to Infer Contact-dependent Immune Cell Transcription
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004762
PMID:37638864
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术推断人类肾脏移植排斥反应中物理相互作用细胞的转录程序 | 开发了结合CD45阳性富集策略和CITE-seq的测序物理相互作用细胞计算方法,能够从单细胞RNA测序数据中推断细胞间物理接触的转录特征 | 样本量相对较小(11例活检样本),空间信息在单细胞测序过程中丢失 | 研究人类肾脏移植排斥反应中免疫细胞间物理接触依赖的转录调控机制 | 人类肾脏移植活检样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 肾脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序,CITE-seq(转录组和表位细胞索引测序) | 测序物理相互作用细胞计算方法 | 单细胞转录组数据,表面蛋白表达数据 | 11例人类肾脏移植活检样本,产生31,203个高质量单细胞文库 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10X Genomics平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 1079 | 2025-10-06 |
Multiomics Data Reveal the Important Role of ANXA2R in T Cell-mediated Rejection After Renal Transplantation
2024-02-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004754
PMID:37677931
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了ANXA2R在肾移植后T细胞介导排斥反应中的关键作用 | 首次发现ANXA2R作为新型TCR相关基因在TCMR中发挥重要作用,并证实ANXA2R+CD8+T细胞在排斥反应中显著增加 | 样本量相对有限(12个多组学数据集,23个病理切片),需要更大规模研究验证 | 阐明肾移植后T细胞介导排斥反应的TCR受体库特征并识别新的治疗靶点 | 肾移植患者的移植肾组织 | 生物信息学 | 肾移植排斥反应 | 多组学分析,单细胞转录组测序,免疫荧光染色,基因集富集分析 | TRUST4算法,多种免疫细胞浸润算法 | 多组学数据,转录组数据,单细胞数据,病理图像 | 12个多组学数据集,23个临床病理切片 | NA | 单细胞转录组测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1080 | 2025-10-06 |
Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of macrophage-like smooth muscle cells in advanced atherosclerotic plaque
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.87201
PMID:38389849
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示巨噬细胞样平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化斑块中的关键作用 | 发现具有中间表型的巨噬细胞样平滑肌细胞亚型,并鉴定IRF8通过激活NF-κB信号通路促进平滑肌细胞向巨噬细胞转分化的新机制 | NA | 探究晚期动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞表型多样性及其分子机制 | 人颈动脉粥样硬化斑块组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq, 谱系追踪技术 | NA | 单细胞转录组数据, bulk RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |