单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7507 篇文献，本页显示第 1041 - 1060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2025-05-04 |
Single-cell mitophagy patterns within the tumor microenvironment modulate intercellular communication, impacting the progression and prognosis of hepatocellular carcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1448878
PMID:39835122
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析肝细胞癌肿瘤微环境中的线粒体自噬模式，探讨其对细胞间通讯及患者预后的影响 | 首次在单细胞水平揭示肝细胞癌肿瘤微环境中线粒体自噬的异质性模式及其与细胞通讯的关系 | 未证实线粒体自噬对免疫治疗效果的直接影响 | 探究肝细胞癌肿瘤微环境中线粒体自噬的细胞特异性模式及其临床意义 | 肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 肿瘤微环境研究 | 肝细胞癌 | scRNA-seq, NMF聚类, CellChat, Monocle, SCENIC | NA | 单细胞转录组数据 | 来自肝细胞癌患者的25,189个细胞 |
| 1042 | 2025-05-04 |
Single-cell sequencing analysis reveals cancer-associated pericyte subgroup in esophageal squamous cell carcinoma to predict prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474673
PMID:39835116
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research paper | 通过单细胞测序分析揭示了食管鳞状细胞癌中与癌症相关的周细胞亚群，用于预测预后 | 识别了六种周细胞亚型，并发现其中两种亚型与预后显著相关，为免疫治疗提供了新的靶点 | 研究仅基于转录组数据，未深入探讨这些亚型在肿瘤微环境中的具体作用机制 | 探究食管鳞状细胞癌中癌症相关周细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的癌症相关周细胞 | digital pathology | esophageal squamous cell carcinoma | scRNA-seq, Bulk RNA-seq, 多重免疫荧光, 药物预测与分子对接 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 大样本单细胞转录组测序数据 |
| 1043 | 2025-05-04 |
Single-cell transcriptome atlas of peripheral immune features to Omicron breakthrough infection under booster vaccination strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1460442
PMID:39835127
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和T细胞/B细胞受体测序，分析了加强疫苗接种策略下Omicron突破感染的免疫特征 | 揭示了Omicron突破感染后免疫细胞的I型干扰素通路激活、T和B淋巴细胞的分化特征以及TCR/BCR克隆扩增的模式，并发现第四剂雾化Ad5-nCoV疫苗可能诱导'训练免疫'现象 | 样本量较小（15例PBMC样本），且仅针对特定疫苗（Ad5-nCoV）的效果进行了观察 | 探究加强疫苗接种策略下Omicron突破感染的免疫特征 | 外周血单个核细胞（PBMC） | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序、TCR/BCR测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15例PBMC样本（来自Omicron感染者和未感染的疫苗接种者） |
| 1044 | 2025-05-04 |
Single-cell RNA sequencing and immune microenvironment analysis reveal PLOD2-driven malignant transformation in cervical cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522655
PMID:39840054
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫微环境分析，揭示了PLOD2在宫颈癌恶性转化中的作用 | 鉴定了宫颈癌中的8种细胞类型和5种恶性上皮细胞亚群，建立了NNMT CAEPCs风险评分（NCRS）模型，并验证了PLOD2作为预后基因的重要性 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分仅限于体外实验 | 探索宫颈癌肿瘤微环境，寻找潜在治疗靶点 | 宫颈癌恶性上皮细胞（EPCs）及其亚群 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NCRS模型 | RNA测序数据 | 来自UCSC和ArrayExpress数据库的数据 |
| 1045 | 2025-05-04 |
Targeting immune cellular populations and transcription factors: unraveling the therapeutic potential of JQF for NAFLD
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1445924
PMID:39840059
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研究论文 | 本研究探讨了降糖清热方（JQF）对非酒精性脂肪肝病（NAFLD）的治疗潜力及其作用机制 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示JQF通过调节特定免疫细胞亚群和转录因子发挥治疗作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探索JQF对NAFLD的治疗机制 | 高脂饮食诱导的NAFLD小鼠模型 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 组织病理学数据 | NAFLD小鼠模型（具体数量未说明） |
| 1046 | 2025-05-04 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity and function of mast cells in human ccRCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494025
PMID:39840068
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research paper | 该研究通过单细胞转录组学揭示了人类透明细胞肾癌（ccRCC）中肥大细胞的异质性和功能 | 首次在ccRCC中进行了全面的肥大细胞单细胞研究，鉴定了四种肥大细胞特征基因，并揭示了肥大细胞在ccRCC中的表型转变 | 样本量较小（仅4名ccRCC患者），且需要进一步验证肥大细胞在ccRCC中的具体作用机制 | 探究ccRCC中肥大细胞的异质性和功能 | 透明细胞肾癌（ccRCC）患者组织样本 | digital pathology | 肾癌 | 单细胞测序、空间转录组学、多重免疫组化（mIHC） | NA | 单细胞转录组数据、批量组织测序数据 | 4名ccRCC患者的组织样本，整合了在线测序数据库的数据 |
| 1047 | 2025-05-04 |
Comprehensive bioinformatics analysis identifies metabolic and immune-related diagnostic biomarkers shared between diabetes and COPD using multi-omics and machine learning
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1475958
PMID:39845878
|
研究论文 | 通过多组学和机器学习方法，识别糖尿病和慢性阻塞性肺疾病（COPD）共有的代谢和免疫相关诊断生物标志物 | 首次通过多中心患者队列、多组学分析和多种机器学习算法，识别出糖尿病和COPD共有的4个生物标志物（CADPS、EDNRB、THBS4和TMEM27），并在单细胞测序、临床样本和动物模型中验证了其稳健性 | 未明确说明样本的具体数量或来源限制，且未提及外部验证队列的结果 | 探索糖尿病和COPD之间的分子机制联系，并识别共有的诊断生物标志物 | 糖尿病和COPD患者的多中心队列数据、临床样本和动物模型 | 生物信息学 | 糖尿病, 慢性阻塞性肺疾病 | 多组学分析（包括基因表达分析）、机器学习算法、单细胞测序 | 多种机器学习算法（未具体说明）、WGCNA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 多中心患者队列（具体数量未说明）、临床样本和动物模型 |
| 1048 | 2025-05-04 |
Deciphering hub genes and immune landscapes related to neutrophil extracellular traps in rheumatoid arthritis: insights from integrated bioinformatics analyses and experiments
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1521634
PMID:39845946
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析和实验，揭示了类风湿性关节炎中与中性粒细胞胞外陷阱相关的枢纽基因和免疫景观 | 首次阐明了RA滑膜微环境中中性粒细胞的异质性与成纤维细胞的通讯机制，并鉴定和验证了4个潜在的NET相关生物标志物 | 研究结果需要进一步在更大规模的临床队列中进行验证 | 探索NETs在RA发病机制中的分子机制和关键基因 | 类风湿性关节炎患者和佐剂诱导的关节炎大鼠模型 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫组织化学、实时定量PCR | 机器学习（三种技术） | RNA测序数据、微阵列数据 | 多个GEO数据集和临床队列 |
| 1049 | 2025-05-04 |
Impact of glioma metabolism-related gene ALPK1 on tumor immune heterogeneity and the regulation of the TGF-β pathway
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1512491
PMID:39845963
|
研究论文 | 该研究通过整合多源胶质瘤数据集，利用NMF和WGCNA方法识别关键代谢基因，并构建预测模型，探讨ALPK1基因在胶质瘤免疫异质性和TGF-β通路调控中的作用 | 采用多数据集策略和101种机器学习技术组合构建预测模型，首次阐明ALPK1基因在胶质瘤免疫调控中的相关性 | 研究结果需要进一步实验验证，且样本来源可能影响模型的泛化能力 | 探索胶质瘤分子分型、寻找新的预后生物标志物并理解其免疫微环境特征 | 胶质瘤患者及其相关基因表达数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | NMF, WGCNA, 单细胞测序 | LASSO+GBM | 基因表达数据 | 多源胶质瘤数据集（未明确具体数量） |
| 1050 | 2025-05-04 |
Exploring the shared mechanism of fatigue between systemic lupus erythematosus and myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome: monocytic dysregulation and drug repurposing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1440922
PMID:39845969
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研究论文 | 探索系统性红斑狼疮(SLE)和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征(ME/CFS)之间疲劳的共同机制，包括单核细胞失调和药物再利用 | 首次识别了SLE和ME/CFS共有的58个重叠基因，并确定了5个关键靶点(IL1β、CCL2、TLR2、STAT1、IFIH1)，发现这些靶点在单核细胞中富集，并通过RT-qPCR验证了在激活的单核细胞中的上调表达 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索SLE和ME/CFS中疲劳的共同机制并预测潜在治疗药物 | 系统性红斑狼疮(SLE)和肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征(ME/CFS) | 生物信息学 | 自身免疫性疾病/神经系统疾病 | 生物信息学分析(GO、KEGG、PPI网络构建)、单细胞聚类、RT-qPCR、分子对接 | THP-1细胞炎症模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1051 | 2025-05-04 |
Exploring the role of metabolic pathways in TNBC immunotherapy: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2024, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2024.1528248
PMID:39850483
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review | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）中代谢途径与免疫功能之间的相互作用，强调了单细胞和空间转录组学技术的最新进展 | 探讨了代谢重编程在调节免疫细胞功能中的关键作用，并提出了针对代谢途径的策略可能增强免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的响应性 | NA | 研究TNBC中代谢途径与免疫功能的相互作用及其对免疫治疗的影响 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | digital pathology | breast cancer | single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics | NA | transcriptomics data | NA |
| 1052 | 2025-05-04 |
Integrated single-cell RNA sequencing reveals the tumor heterogeneity and microenvironment landscape during liver metastasis in adenocarcinoma of esophagogastric junction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484234
PMID:39850884
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research paper | 利用单细胞RNA测序技术揭示食管胃结合部腺癌肝转移过程中的肿瘤异质性和微环境景观 | 首次在AEGJ肝转移中鉴定出一种特定的成纤维细胞类型，并发现SFRP2基因在周细胞中的高表达可能通过Wnt通路影响血管稳定性和血管生成 | 样本量较小，未进行功能验证实验 | 探究食管胃结合部腺癌肝转移的细胞和分子机制 | 食管胃结合部腺癌肝转移患者的肿瘤组织和微环境 | digital pathology | esophagogastric junction adenocarcinoma | single-cell RNA sequencing, immunofluorescence staining | NA | RNA-seq data, immunofluorescence images | AEGJ肝转移患者样本（具体数量未明确说明） |
| 1053 | 2025-05-04 |
Combining single-cell analysis and molecular docking techniques to construct a prognostic model for colon adenocarcinoma and uncovering inhibin subunit βb as a novel therapeutic target
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1524560
PMID:39850875
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研究论文 | 结合单细胞分析和分子对接技术构建结肠腺癌预后模型，并揭示抑制素亚基βb作为新型治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序数据和分子对接技术，构建基于失巢凋亡相关基因的结肠腺癌预后模型，并发现INHBB作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于体外细胞实验 | 探索失巢凋亡与结肠腺癌的生物学联系及其在肿瘤进展中的机制，寻找新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者和细胞系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、分子对接、基因敲除 | Cox比例风险模型、Lasso回归 | 转录组数据、临床信息 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌患者数据 |
| 1054 | 2025-05-04 |
Integrated single-cell and bulk transcriptome analysis of R-loop score-based signature with regard to immune microenvironment, lipid metabolism and prognosis in HCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487372
PMID:39850878
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research paper | 该研究通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了一个基于R-loop评分的特征模型，以探索其在HCC免疫微环境、脂质代谢和预后中的作用 | 首次构建了基于R-loop评分的特征模型，揭示了R-loop调节基因（RLRGs）与HBV感染、脂质代谢及HCC进展的关系，并发现CLTC作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，缺乏对R-loop形成和功能机制的深入实验验证 | 探索R-loop在HCC进展中的作用，并构建预后风险模型以识别潜在治疗靶点 | HCC患者的单细胞和批量转录组数据，以及体外和体内实验验证 | digital pathology | hepatocellular carcinoma | scRNA-seq, WGCNA分析 | 预后风险模型 | 转录组数据 | 来自GSE149614和CRA002308的HCC患者数据，以及TCGA数据库的数据 |
| 1055 | 2025-05-04 |
Macrophage heterogeneity and oncogenic mechanisms in lung adenocarcinoma: insights from scRNA-seq analysis and predictive modeling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491872
PMID:39850883
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析探索了肺腺癌中巨噬细胞的异质性及其潜在的致癌机制，并基于巨噬细胞相关基因构建了一个预后模型 | 揭示了巨噬细胞亚群的复杂性及其在肺腺癌中的潜在致癌作用，构建了一个基于巨噬细胞标记基因的预后模型，并验证了其在预测预后和免疫治疗效果方面的有效性 | 研究主要依赖于TCGA数据，可能受到样本量和数据质量的限制，且细胞实验仅验证了COL5A1的致癌机制 | 探索肺腺癌中巨噬细胞的特性及其对预后的影响，并构建一个有效的预后模型 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 | digital pathology | lung cancer | scRNA-seq, RT-PCR | Lasso regression, multivariate Cox regression | scRNA-seq data, clinical data | TCGA数据集及多个外部验证数据集 |
| 1056 | 2025-05-04 |
The emergence of DNAM-1 as the facilitator of NK cell-mediated killing in ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1477781
PMID:39835114
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研究论文 | 本研究探讨了DNAM-1在卵巢癌中促进NK细胞介导的杀伤作用 | 揭示了DNAM-1在卵巢癌中作为NK细胞杀伤促进因子的新作用，并发现PVR/DNAM-1轴在肿瘤免疫逃逸中的关键作用 | 样本量相对有限(80例)，且主要为观察性研究，缺乏机制层面的深入探索 | 探索卵巢癌中NK细胞的表型和功能特征及其与临床预后的关系 | 80名卵巢癌患者的血液、原发肿瘤和转移组织中的NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 流式细胞术、scRNA-seq | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 80名卵巢癌患者样本 |
| 1057 | 2025-05-04 |
Integrating single cell analysis and machine learning methods reveals stem cell-related gene S100A10 as an important target for prediction of liver cancer diagnosis and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1534723
PMID:39840058
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研究论文 | 结合单细胞分析和机器学习方法，揭示干细胞相关基因S100A10作为肝癌诊断和免疫治疗预测的重要靶点 | 首次将单细胞RNA测序与机器学习技术结合，识别出与肝癌干细胞相关的关键基因S100A10，并验证其作为预后标志物的潜力 | 研究仅针对肝癌，未在其他癌症类型中验证S100A10的普适性 | 提高肝癌的诊断精度和免疫治疗效果 | 肝癌干细胞相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未提及） |
| 1058 | 2025-05-03 |
Single-cell RNA sequencing reveals S100A8/A9hi neutrophils-induced endothelial cell death and lymphocyte infiltration after ischemic stroke
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151023
PMID:39579533
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究缺血性中风后中性粒细胞、内皮细胞和T细胞的转录变化及其对血脑屏障破坏的影响 | 揭示了S100A8/A9高表达中性粒细胞诱导的内皮细胞死亡和淋巴细胞浸润的新机制，并发现S100A8/A9抑制剂paquinimod具有神经保护作用 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证 | 探究缺血性中风后免疫细胞与血脑屏障之间的相互作用机制 | 中性粒细胞、内皮细胞和T细胞 | 生物医学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 |
| 1059 | 2025-05-03 |
Revealing the roles of IL-7R in abdominal aortic aneurysm through integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151042
PMID:39586133
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq和批量RNA-seq分析，揭示IL-7R在腹主动脉瘤中的作用 | 首次通过整合单细胞和批量RNA-seq数据，发现IL-7R在腹主动脉瘤中的关键作用及其通过JAK/STAT通路促进IFN-γ分泌的机制 | 研究主要基于公共数据库数据，缺乏临床样本验证 | 探索腹主动脉瘤的发病机制及潜在治疗靶点 | 腹主动脉瘤组织中的基因表达及免疫细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫荧光染色 | NA | RNA-seq数据, 单细胞数据 | 三个批量RNA-seq数据集及单细胞RNA-seq数据 |
| 1060 | 2025-05-03 |
Explainable deep neural networks for predicting sample phenotypes from single-cell transcriptomics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae673
PMID:39814561
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研究论文 | 开发了一个名为singleDeep的端到端流程，用于通过训练深度神经网络分析和分类单细胞RNA测序数据，以预测样本表型 | 提出了singleDeep，一个针对单细胞RNA测序数据优化的新型分类算法，能够提供样本表型的稳健预测和特征描述，并在诊断性能上优于传统机器学习方法和替代单细胞方法 | 未明确提及具体局限性，但暗示现有单细胞分析方法在可用性方面存在不足 | 开发适用于单细胞RNA测序数据的分类算法，用于精准医学应用中的样本表型预测 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮, 阿尔茨海默病, 新冠肺炎 | scRNA-Seq | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及多种疾病条件下的数据集 |