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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics unveil a unique molecular profile of mesenchymal stem/stromal cell-induced myeloid-derived immune suppressor cells
2024-Jun-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.009
PMID:38795702
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1022 | 2025-10-06 |
The reparative immunologic consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596699
PMID:38895305
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研究论文 | 本研究探讨自体造血干细胞移植作为难治性克罗恩病细胞疗法的免疫修复机制 | 首次通过高维细胞表型分析和功能研究揭示干细胞移植通过重建肠道巨噬细胞促进黏膜愈合的机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证HSC异质性对移植结果的影响 | 阐明干细胞移植治疗难治性克罗恩病的免疫修复机制 | 难治性克罗恩病患者的外周血、肠道组织样本和干细胞移植物 | 免疫学 | 克罗恩病 | 质谱流式细胞技术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), T细胞受体(TCR)测序, 流式细胞术 | 异种移植模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 基因组数据 | 难治性克罗恩病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞技术 | NA | NA |
| 1023 | 2025-10-06 |
Protocol to dissect and dissociate the mouse brainstem for single-cell RNA-seq applications
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102908
PMID:38461411
|
研究论文 | 提出一种用于小鼠脑干单细胞RNA测序的解剖、解离和冷冻保存实验方案 | 针对小脑干结构开发了允许异步样本收集和下游处理的实验流程 | 仅在新生小鼠和特定脑区进行验证,尚未在其他脑区广泛测试 | 开发适用于小脑结构单细胞RNA测序的样本制备方法 | 新生小鼠脑干组织,特别是preBötzinger复合体 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 新生小鼠脑干样本 | NA | 单细胞RNA-seq | SmartSeq3 | SmartSeq3 cDNA文库制备 |
| 1024 | 2025-10-06 |
Protocol for acquiring high-quality fresh mouse lung spatial transcriptomics data
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102825
PMID:38280199
|
研究论文 | 本文提出了一种获取高质量新鲜小鼠肺组织空间转录组数据的实验方案 | 针对肺组织肺泡空腔导致切片困难的问题,开发了专门的肺灌注和冷冻切片方法 | NA | 建立高质量小鼠肺组织空间转录组数据的获取方法 | 小鼠肺组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1025 | 2025-10-06 |
An optimized protocol for isolation of murine pancreatic single cells with high yield and purity
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102836
PMID:38219150
|
研究论文 | 介绍一种从小鼠胰腺快速分离高质量单细胞的优化方案 | 通过优化解剖顺序、酶组成和操作流程,显著减少消化酶对胰腺外分泌细胞的损伤 | NA | 开发高效的小鼠胰腺单细胞分离方法 | 小鼠胰腺组织 | 单细胞技术 | NA | 单细胞分离技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1026 | 2025-10-06 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
|
研究论文 | 开发了一种用于人和小鼠脂肪组织单核RNA测序的流程,整合流式细胞术进行质量控制 | 结合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池分配,可直接加载到10x Chromium控制器 | NA | 解决脂肪组织单细胞RNA测序中脂肪细胞大小、易碎性和商业试剂盒成本高的问题 | 人和小鼠的脂肪组织 | 单细胞测序 | NA | 单核RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单核RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |
| 1027 | 2025-10-06 |
Protocol for inferring epithelial-to-mesenchymal transition trajectories from single-cell RNA sequencing data using R
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102819
PMID:38183653
|
研究论文 | 介绍了一个名为COMET的R软件包,用于从单细胞RNA测序数据推断上皮-间质转化轨迹和状态间转换率 | 开发了首个专门用于推断EMT轨迹和计算状态间转换率的R软件包 | NA | 开发计算工具来研究上皮-间质转化过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 连续时间马尔可夫链 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1028 | 2025-10-06 |
Establishing a 3D culture system for early organogenesis of monkey embryos ex vivo and single-cell transcriptome analysis of cultured embryos
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102835
PMID:38224493
|
研究论文 | 建立食蟹猴胚胎体外3D培养系统并进行单细胞转录组分析 | 开发了能够在体外培养猴胚胎至受精后25天的3D培养系统,揭示了原肠胚形成和早期器官发生的关键发育事件 | NA | 建立灵长类胚胎体外培养平台以研究早期胚胎发育 | 食蟹猴胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1029 | 2025-10-06 |
Protocol for optimized dissociation of human scalp tissue for hair follicle transcriptomics by scRNA-seq
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102848
PMID:38319786
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化的人头皮组织解离方案,用于通过单细胞RNA测序研究毛囊转录组学 | 开发了针对人类头皮组织的高质量单细胞悬液制备优化方案 | NA | 优化人类头皮组织解离方法以获得高质量单细胞悬液 | 人类头皮组织和毛囊 | 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1030 | 2025-10-06 |
Protocol for functional profiling of patient-derived organoids for precision oncology
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102887
PMID:38367233
|
研究论文 | 本文提出了一套用于功能精准肿瘤学的患者来源类器官功能分析方案 | 开发了涵盖患者来源结直肠类器官生成培养、肿瘤浸润淋巴细胞扩增和外周血单核细胞分离培养的完整实验流程 | NA | 建立用于精准肿瘤治疗的功能分析实验方案 | 结直肠癌患者来源的类器官、肿瘤浸润淋巴细胞和外周血单核细胞 | 精准医学 | 结直肠癌 | RNA测序、全外显子组测序、单细胞RNA测序、磷酸化蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1031 | 2025-10-06 |
BATF2 inhibits the stem cell-like properties and chemoresistance of gastric cancer cells through PTEN/AKT/β-catenin pathway
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.98389
PMID:39629124
|
研究论文 | 本研究探讨BATF2通过PTEN/AKT/β-catenin通路抑制胃癌干细胞特性和化疗耐药性的机制 | 首次揭示BATF2通过调控PTEN/AKT/ABCG2通路影响胃癌干细胞特性和化疗敏感性的新机制 | 样本量相对有限(9例胃癌样本),需在更大队列中验证 | 阐明BATF2在胃癌干细胞特性和化疗耐药性中的调控作用 | 胃癌细胞、肿瘤细胞球体、类器官和小鼠模型 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,细胞培养,肿瘤球体形成,类器官培养,免疫组化,免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据,体外实验数据,体内实验数据 | 9例胃癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1032 | 2025-10-06 |
Deciphering the effects of radiopharmaceutical therapy in the tumor microenvironment of prostate cancer: an in-silico exploration with spatial transcriptomics
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.99516
PMID:39629134
|
研究论文 | 结合空间转录组学和计算模型探索放射性药物治疗对前列腺癌肿瘤微环境的影响 | 首次将空间转录组学与计算建模相结合,系统评估不同靶向放射性药物治疗在前列腺癌肿瘤微环境中的剂量分布和疗效差异 | 仅基于两名患者的三组空间转录组学数据集,样本量有限;假设所有配体具有相似的药代动力学参数可能不够准确 | 探索放射性药物治疗在前列腺癌肿瘤微环境中的剂量学和生物学效应 | 前列腺癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 计算建模, 偏微分方程求解, 生理药代动力学模型 | 对流-反应-扩散模型, 线性二次模型, MIRD剂量学形式体系 | 空间转录组学数据 | 2名前列腺癌患者的3个空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1033 | 2025-10-06 |
Phosphoglycerate mutase 1-mediated dephosphorylation and degradation of Dusp1 disrupt mitochondrial quality control and exacerbate endotoxemia-induced myocardial dysfunction
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.102647
PMID:39659576
|
研究论文 | 本研究揭示了Pgam1通过介导Dusp1去磷酸化和降解破坏线粒体质量控制,加剧内毒素血症诱导的心肌功能障碍的分子机制 | 首次发现Dusp1是内毒素血症诱导心肌功能障碍的新型生物标志物,并阐明Pgam1-Dusp1轴在调节线粒体质量控制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究Dusp1和Pgam1在内毒素血症诱导心肌功能障碍中的作用机制 | 心肌细胞特异性基因敲除和转基因小鼠、LPS诱导的内毒素血症模型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、qPCR、Seahorse分析、分子对接、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、功能成像数据 | 基因工程小鼠模型,人类样本数据库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1034 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals aberrant skin-resident cell populations and identifies fibroblasts as a determinant in rosacea
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52946-7
PMID:39384741
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示酒渣鼻患者皮肤中异常细胞群,并发现成纤维细胞是疾病发展的关键决定因素 | 首次构建酒渣鼻面部皮肤单细胞图谱,识别出特征性IFNγ介导的角质形成细胞亚群,并证实成纤维细胞是产生促炎和血管舒张信号的主要细胞类型 | 研究仅针对女性患者,样本来源局限于面部皮肤 | 解析酒渣鼻的细胞和分子机制 | 女性酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本 | 单细胞组学 | 酒渣鼻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1035 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis
2024-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53104-9
PMID:39375367
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示原发性胆汁性胆管炎中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用 | 首次在PBC患者和鼠类模型中鉴定出具有JAK-STAT通路活化的肝脏驻留Th1样细胞群,并证明阻断该通路可缓解肝脏炎症 | 传统检测方法的局限性导致对PBC局部肝脏免疫发病机制的认识不完整 | 解析原发性胆汁性胆管炎的免疫细胞图谱和分子机制 | 原发性胆汁性胆管炎患者和鼠类PBC模型 | 单细胞组学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PBC患者和鼠类PBC模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1036 | 2025-10-06 |
Distinctive CD39+CD9+ lung interstitial macrophages suppress IL-23/Th17-mediated neutrophilic asthma by inhibiting NETosis
2024-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53038-2
PMID:39366998
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD39+CD9+肺间质巨噬细胞亚群可通过抑制NETosis和Th17细胞活化来抑制中性粒细胞性哮喘 | 首次发现CD39+CD9+肺间质巨噬细胞亚群通过CD9依赖性附着和CD39依赖性ATP清除机制抑制NETosis和中性粒细胞炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索抑制中性粒细胞性哮喘的潜在通路和治疗靶点 | 肺间质巨噬细胞、中性粒细胞、Th17细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 哮喘患者样本和小鼠NDA模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1037 | 2024-09-04 |
Hydatidiform mole identification using non-invasive single-cell sequencing of fetal circulating extravillous trophoblasts isolated from maternal blood
2024-09, Ultrasound in obstetrics & gynecology : the official journal of the International Society of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/uog.27615
PMID:38354218
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1038 | 2025-10-06 |
CYBB-Mediated Ferroptosis Associated with Immunosuppression in Mycobacterium leprae-Infected Monocyte-Derived Macrophages
2024-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.10.012
PMID:37925067
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示麻风分枝杆菌感染通过CYBB介导的铁死亡促进巨噬细胞M2极化,导致免疫逃逸的机制 | 首次发现CYBB介导的铁死亡在麻风分枝杆菌感染中促进巨噬细胞M2极化的新机制 | 研究样本量较小(4名健康个体),主要在体外实验验证 | 探究麻风分枝杆菌感染巨噬细胞后触发M2极化的分子机制 | 人单核细胞来源的巨噬细胞和麻风分枝杆菌 | 单细胞测序分析 | 麻风病 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | 4名健康个体的单核细胞来源巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1039 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07011-6
PMID:38326616
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学揭示了基底外侧杏仁核在长期记忆形成中神经元与星形胶质细胞的协同作用 | 首次结合单细胞RNA测序和单分子空间转录组学技术,在完整脑切片中绘制了长期记忆痕迹的空间图谱,发现特定神经元亚群与邻近星形胶质细胞的相互作用对长期记忆编码至关重要 | NA | 阐明基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子结构 | 小鼠基底外侧杏仁核的神经元和星形胶质细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单分子空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1040 | 2025-10-06 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson Syndrome and Toxic epidermal necrolysis
2024-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.26.568771
PMID:38405793
|
研究论文 | 本研究通过多组学单细胞测序技术分析Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症的组织特异性免疫反应 | 首次在SJS/TEN中同时进行单细胞转录组、表面蛋白质组和TCR测序,建立了多组学数据库 | 样本量相对有限(17例患者),为罕见疾病研究 | 阐明SJS/TEN的细胞免疫发病机制 | SJS/TEN患者的未受累皮肤、受累皮肤和水疱液 | 单细胞多组学 | Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、TCR测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 17例SJS/TEN患者,共119,784个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |