单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7750 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2024-12-05 |
Inferring disease progressive stages in single-cell transcriptomics using a weakly-supervised deep learning approach
2024-Dec-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.278812.123
PMID:39622637
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scIDST的弱监督深度学习方法，用于推断单细胞转录组学中的疾病进展阶段 | 提出了一种新的深度学习方法scIDST，能够在弱监督框架下推断单细胞的疾病进展水平，并展示了其在多个独立数据资源中的适用性 | NA | 旨在解决单细胞转录组学中细胞异质性问题，推断疾病进展阶段 | 单细胞转录组数据中的疾病进展阶段 | 机器学习 | NA | 单细胞/核基因组测序 | 深度学习 | 转录组数据 | NA |
| 982 | 2024-12-05 |
Fibroblast Activation Protein-α Expression in Cancer-Associated Fibroblasts Shows the Poor Survival of Colorectal Cancer via Immune-Mediated Pathways : Implications of FAP in Cancer-Associated Fibroblasts Link Immune Dysregulation to Adverse Survival in Colorectal Cancer
2024-Dec-02, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-024-16593-y
PMID:39623187
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研究论文 | 研究探讨了纤维母细胞激活蛋白-α（FAP）在结直肠癌（CRC）相关成纤维细胞中的表达及其对患者生存和肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示了FAP表达与CRC患者生存率降低以及肿瘤浸润淋巴细胞分布减少之间的关联，并发现FAP阳性成纤维细胞中与免疫抑制相关的基因表达上调 | 研究样本量较小，且仅限于特定医院的数据，可能影响结果的普适性 | 探讨FAP在CRC相关成纤维细胞中的表达及其对患者生存和肿瘤免疫微环境的影响 | 结直肠癌患者及其肿瘤相关成纤维细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化染色（IHC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 病理切片和基因表达数据 | 178名结直肠癌患者和10名未经治疗的CRC患者 |
| 983 | 2024-12-05 |
Generation and long-term culture of human cerebellar organoids from pluripotent stem cells
2024-Dec-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01093-w
PMID:39623220
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研究论文 | 本文描述了一种从人类多能干细胞生成和长期培养人小脑类器官（hCerO）的协议 | 该协议成功复制了胎儿小脑的细胞多样性和一些独特的细胞结构特征，并能长期培养小脑的主要细胞类型 | NA | 探索小脑发育和疾病 | 人小脑类器官（hCerO） | 发育神经生物学 | NA | 细胞培养 | NA | 细胞 | NA |
| 984 | 2024-12-05 |
Nicotinamide N-methyltransferase negatively regulates metastasis-promoting property of cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma
2024-Dec-02, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12633
PMID:39623600
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研究论文 | 研究探讨了尼古丁胺N-甲基转移酶（NNMT）在肺腺癌（LUAD）中对癌症相关成纤维细胞（CAFs）促转移特性的负调控作用 | 首次揭示了NNMT在CAFs中的代谢和表观遗传调控功能，扩展了对LUAD转移调控机制的理解 | NA | 探索LUAD复发和转移的机制，特别是NNMT在其中的作用 | 肺腺癌（LUAD）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序（RNA-seq）、染色质免疫沉淀-PCR（ChIP-PCR）、多重免疫荧光分析 | NA | RNA | NA |
| 985 | 2024-12-05 |
Exploring the tumor microenvironment of colorectal cancer patients post renal transplantation by single-cell analysis
2024-Dec-02, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16409
PMID:39623744
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肾移植后结直肠癌患者的肿瘤微环境 | 揭示了肾移植后结直肠癌患者肿瘤免疫微环境的显著变化，特别是CD8效应T细胞的细胞毒性和肿瘤新抗原识别能力的下降，以及CD4FOXP3调节性T细胞的免疫抑制潜力增强 | 研究样本量较小，仅包括四名患者，可能影响结果的普适性 | 探讨肾移植后结直肠癌患者的肿瘤免疫微环境变化及其机制 | 肾移植后结直肠癌患者的肿瘤和正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四名肾移植后结直肠癌患者和23名非移植结直肠癌患者的肿瘤和正常组织 |
| 986 | 2024-12-05 |
Spatially Aware Domain Adaptation Enables Cell Type Deconvolution from Multi-Modal Spatially Resolved Transcriptomics
2024-Dec-02, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401163
PMID:39623794
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaDA的新型空间感知域适应方法，用于从多模态空间解析转录组学数据中进行细胞类型解卷积 | SpaDA方法结合了多模态数据（转录组学、组织学图像和空间位置），并利用自表达变分自编码器和深度空间分布对齐技术，实现了细胞类型注释信息在两个相似图之间的转移，提高了细胞类型组成的预测准确性 | NA | 开发一种新的方法来解决多模态空间解析转录组学数据中细胞类型解卷积的问题 | 多模态空间解析转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 空间解析转录组学 | 变分自编码器 | 多模态数据（转录组学、图像、空间位置） | 高分辨率小鼠小脑空间解析转录组学数据 |
| 987 | 2024-12-05 |
Spatial transcriptomics deciphers the immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer with tumour thrombus
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70112
PMID:39617739
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 988 | 2024-12-05 |
Modeling metabolic-associated steatohepatitis with human pluripotent stem cell-derived liver organoids
2024-Dec-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000585
PMID:39621053
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研究论文 | 研究使用人类多能干细胞衍生的肝脏类器官模型来模拟代谢相关脂肪性肝炎（MASH） | 本研究改进了现有的肝脏类器官模型，通过详细分子特征分析和功能验证，提供了一个更精确的MASH疾病模型 | 研究中使用的类器官模型仍需进一步优化，以完全模拟人类MASH的复杂性 | 开发和验证一个改进的肝脏类器官模型，用于研究代谢相关脂肪性肝炎（MASH）的发病机制和治疗方法 | 人类多能干细胞衍生的肝脏类器官，以及MASH的分子和功能特征 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 989 | 2024-12-05 |
Gonadal sex reversal at single-cell resolution in Znrf3-deficient mice
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202707
PMID:39629665
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研究论文 | 研究了Znrf3缺陷小鼠在性决定期单细胞分辨率下的性逆转现象 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了Znrf3缺陷小鼠性逆转的转录组和细胞异质性 | NA | 进一步研究Znrf3缺陷小鼠的性逆转现象 | Znrf3缺陷小鼠的性腺 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组 | XY Znrf3缺陷小鼠的性腺细胞 |
| 990 | 2024-12-05 |
Microarray integrated spatial transcriptomics (MIST) for affordable and robust digital pathology
2024-Nov-30, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00462-1
PMID:39616155
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研究论文 | 提出了一种名为MIST的新型空间转录组学方法，结合了传统的组织微阵列与Visium技术，通过激光切割和3D打印提高载玻片通量，旨在降低成本并提高数字病理学的鲁棒性 | MIST方法通过结合组织微阵列与Visium技术，利用激光切割和3D打印技术，显著提高了载玻片通量，降低了成本，并提供了独立复制和定制化的能力 | NA | 开发一种成本效益高且鲁棒性强的空间转录组学方法，以解决现有方法高成本和样本使用限制的问题 | 空间转录组学技术及其在数字病理学中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、激光切割、3D打印 | NA | 转录组数据 | NA |
| 991 | 2024-12-05 |
SenMayo transcriptomic senescence panel highlights glial cells in the ageing mouse and human retina
2024-Nov-30, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00187-9
PMID:39616175
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研究论文 | 研究使用SenMayo转录组衰老面板分析了不同年龄小鼠和人类视网膜中的衰老细胞，特别是胶质细胞 | 首次将SenMayo基因面板应用于视网膜衰老细胞的鉴定，并比较了不同年龄小鼠和人类视网膜胶质细胞的转录组特征 | 研究主要集中在视网膜胶质细胞，未涵盖其他类型的细胞 | 鉴定中枢神经系统和视网膜中的衰老细胞，并分析其转录组特征 | 不同年龄小鼠和人类的视网膜胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同年龄的小鼠和人类视网膜样本 |
| 992 | 2024-12-05 |
Single-cell transcriptomics reveals over-activated reactive oxygen species pathway in hepatocytes in the development of hepatocellular carcinoma
2024-11-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-81481-0
PMID:39616235
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肝细胞中活性氧通路在肝细胞癌发展中的过度激活 | 首次揭示了肝细胞癌中活性氧通路的异常激活及其与能量代谢相关通路的正相关性，并发现了与预后不良相关的GPX4+肝细胞亚群 | 研究基于GSE189175数据集，样本量有限，未来需要更大规模的研究验证 | 探讨活性氧通路在肝细胞癌发展中的作用及其分子机制 | 肝细胞癌组织及其邻近组织中的肝细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基于GSE189175数据集，具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 993 | 2024-12-05 |
Identification of the key targets for sepsis-associated acute kidney injury by RNA sequencing combined with bioinformatics methods
2024-Nov-30, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00673-5
PMID:39616313
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研究论文 | 本研究通过RNA测序结合生物信息学方法，识别脓毒症相关急性肾损伤的关键靶点 | 首次通过RNA测序和生物信息学分析，确定了CD74和IL32作为脓毒症相关急性肾损伤的早期诊断和预后评估的生物标志物 | 研究样本量较小，且仅限于脓毒症患者，结果的普适性有待进一步验证 | 提供脓毒症相关肾损伤的早期识别和预后研究的可靠靶点 | 脓毒症患者的肾损伤相关基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序 | NA | RNA | 10名健康个体和22名脓毒症患者的外周血样本 |
| 994 | 2024-12-05 |
CD22 blockade exacerbates neuroinflammation in Neuromyelitis optica spectrum disorder
2024-Nov-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03305-2
PMID:39616380
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研究论文 | 研究CD22在视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）中对神经炎症和中枢神经系统损伤的影响 | 揭示了CD22作为调控微胶质细胞和Gr-1+髓系细胞在NMOSD中负面效应的关键分子开关的新角色 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨CD22在NMOSD中的作用及其对微胶质细胞活性和神经炎症的影响 | CD22在NMOSD中的表达、功能及其对微胶质细胞和髓系细胞的影响 | 神经科学 | 神经疾病 | 单细胞测序、流式细胞术 | NA | 细胞 | 人类样本每组5个，小鼠样本每组8个 |
| 995 | 2024-12-05 |
Eosinophilic Esophagitis Drives Tissue Fibroblast Regenerative Programs Towards Pathologic Dysfunction
2024-Nov-29, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.028
PMID:39617290
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研究论文 | 研究探讨了嗜酸性食管炎（EoE）如何驱动组织成纤维细胞再生程序向病理性功能障碍转变 | 首次揭示了EoE中成纤维细胞的病理性再生和迁移功能障碍，并提出了通过调节CD73活性来恢复成纤维细胞功能的治疗策略 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序，缺乏体内长期疗效的验证 | 探讨嗜酸性食管炎（EoE）中成纤维细胞的病理性再生和迁移功能障碍的分子机制 | 嗜酸性食管炎（EoE）患者的食管成纤维细胞 | NA | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），荧光激活细胞分选分析 | NA | RNA | 涉及EoE患者和健康个体的食管成纤维细胞样本 |
| 996 | 2024-12-05 |
Exploring the Potential of BEND7 as an Immunomodulatory Biomarker in Sepsis through Integrative Genomic and Transcriptomic Analysis
2024-Nov-29, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002529
PMID:39617402
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研究论文 | 通过综合基因组和转录组分析，探索BEND7作为脓毒症免疫调节生物标志物的潜力 | 首次将BEND7鉴定为脓毒症中涉及免疫调节的特定血小板基因，并揭示了其在免疫细胞中的相互作用 | 研究主要基于数据整合和分析，缺乏直接的实验验证 | 识别脓毒症发病机制中的遗传因素，并探索潜在的治疗靶点 | BEND7基因及其在脓毒症中的免疫调节作用 | 基因组学 | 脓毒症 | 全基因组关联研究、表达数量性状位点数据、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 独立数据集用于验证，具体样本数量未明确提及 |
| 997 | 2024-12-05 |
[Hepatic T cell subtypes and functional analysis among alveolar echinococcosis patients using single-cell RNA sequencing]
2024-Nov-08, Zhongguo xue xi chong bing fang zhi za zhi = Chinese journal of schistosomiasis control
DOI:10.16250/j.32.1915.2024172
PMID:39623989
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研究论文 | 研究了泡型包虫病患者肝脏免疫微环境中T细胞亚型及其功能 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析泡型包虫病患者肝脏中T细胞亚型及其功能 | 样本量较小，仅包括四名患者 | 探讨泡型包虫病患者肝脏免疫微环境中T细胞亚型及其功能 | 泡型包虫病患者的肝脏T细胞亚型及其功能 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 四名泡型包虫病患者，共采集八份肝脏样本 |
| 998 | 2024-12-05 |
FSCN1 is a Potential Therapeutic Target for Atherosclerosis Revealed by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S480528
PMID:39618922
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序数据，研究了动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 发现FSCN1在动脉粥样硬化中的高表达，并验证了其在细胞凋亡和迁移中的作用，提示其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨动脉粥样硬化中的细胞表型、细胞间通讯和潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化中的细胞类型、FSCN1的表达及其在疾病发展中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、ELISA | NA | RNA测序数据 | 包括Apoeko小鼠和颈动脉内膜切除术患者的数据 |
| 999 | 2024-12-05 |
Corrigendum: Unraveling the ecological landscape of mast cells in esophageal cancer through single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522632
PMID:39620211
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correction | 对先前发表的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1000 | 2024-12-05 |
Cellular and molecular characterization of peripheral glia in the lung and other organs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0310303
PMID:39621665
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研究论文 | 系统分析了肺部及其他器官中外周胶质细胞的细胞和分子特征 | 利用单细胞RNA测序技术，首次全面描述了小鼠肺部Sox10+胶质细胞系的解剖、细胞和分子特征，并扩展到灵长类和其他器官 | 研究主要集中在小鼠、鼠狐猴和人类，其他物种的数据有限 | 揭示外周胶质细胞在肺部及其他器官中的分子差异和定位 | 小鼠、鼠狐猴和人类的外周胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约700个外周胶质细胞样本，来自小鼠、鼠狐猴和人类 |