单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2025-10-06 |
Protocol for using scCURE to construct an immunotherapy outcome prediction model
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103476
PMID:39661506
|
研究论文 | 介绍使用scCURE构建免疫治疗结果预测模型的协议 | 开发了基于单细胞RNA测序的scCURE方法，通过识别免疫治疗期间变化和未变化的细胞来构建预测模型 | NA | 构建免疫治疗结果预测模型 | 癌症患者 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | scCURE | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 982 | 2025-10-06 |
Profiling low-mRNA content cells in complex human tissues using BD Rhapsody single-cell analysis
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103475
PMID:39661509
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研究论文 | 本文介绍了一种使用BD Rhapsody单细胞分析平台高效回收低mRNA含量免疫细胞的实验方案 | 开发了针对前列腺、肺和肝组织的优化组织解离方案，结合Sample Tag抗体标记技术，显著提高了低mRNA含量免疫细胞的回收效率 | 仅针对特定组织类型（前列腺、肺、肝）进行了验证，未涉及其他组织类型 | 解决单细胞RNA测序中低mRNA含量免疫细胞难以成功回收的技术难题 | 人类前列腺、肺和肝组织中的低mRNA含量免疫细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | BD Biosciences | single-cell RNA-seq | BD Rhapsody | BD Rhapsody单细胞分析系统，采用微孔板单细胞捕获技术 |
| 983 | 2025-10-06 |
SRSF2 is essential for maintaining pancreatic beta-cell identity and regulating glucose homeostasis in mice
2024-12, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119845
PMID:39265887
|
研究论文 | 本研究揭示了剪接因子SRSF2在维持小鼠胰腺β细胞特性和调节葡萄糖稳态中的关键作用 | 首次发现SRSF2缺失会导致β细胞从适应性阶段向适应不良阶段转变，并丧失细胞特性 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究SRSF2对胰腺β细胞存活和葡萄糖稳态的影响 | 小鼠胰腺β细胞和Min6细胞系 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 10月龄SRSF2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 984 | 2025-10-06 |
Concerted transcriptional regulation of the morphogenesis of hypothalamic neurons by ONECUT3
2024-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52762-z
PMID:39366958
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子ONECUT3通过调控NAV2基因影响下丘脑神经元极化和形态发生的分子机制 | 首次发现ONECUT3在脊椎动物下丘脑神经元分化中的作用，并证明其通过NAV2调控神经元形态发生的保守机制 | 研究主要聚焦于特定神经元亚型，机制在其他神经元类型中的普适性需要进一步验证 | 探究ONECUT3转录因子在下丘脑神经元形态发生中的调控作用 | 脊椎动物下丘脑神经元、C. elegans神经系统 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 功能获得实验, siRNA敲低, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | 新生小鼠, C. elegans模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 985 | 2025-10-06 |
The lncRNA SNHG26 drives the inflammatory-to-proliferative state transition of keratinocyte progenitor cells during wound healing
2024-10-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52783-8
PMID:39366968
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA SNHG26在皮肤伤口愈合过程中驱动角质形成细胞前体细胞从炎症状态向增殖状态转变的关键作用 | 首次发现SNHG26通过调控转录因子ILF2的基因组定位，促进角质形成细胞前体细胞的炎症-增殖状态转换 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人类临床验证方面仍需进一步研究 | 探索皮肤伤口愈合过程中炎症相向增殖相转变的分子机制 | 角质形成细胞前体细胞 | 分子生物学 | 皮肤创伤 | 单细胞转录组分析、功能获得和功能缺失实验 | NA | 转录组数据 | Snhg26缺陷小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 986 | 2025-10-06 |
Trophoblast Side-Population Markers are Dysregulated in Preeclampsia and Fetal Growth Restriction
2024-10, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10764-w
PMID:39028417
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研究论文 | 本研究表征了人类胎盘中滋养细胞侧群标志物在先兆子痫和胎儿生长受限中的表达特征 | 首次在胎盘功能不全疾病中系统表征了8个滋养细胞侧群标志物的表达模式及其在滋养细胞分化过程中的动态变化 | 样本量相对有限，部分标志物在体外分化模型中表达水平较低或无法检测 | 探讨滋养细胞侧群标志物在胎盘功能不全疾病中的表达异常及其病理意义 | 人类胎盘组织、滋养细胞干细胞分化模型 | 发育生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组测序、免疫组织化学、实时荧光定量PCR | NA | 基因表达数据、组织切片图像 | 胎盘组织切片n=3，体外分化实验n=5，临床胎盘样本n=126（先兆子痫78例，FGR 30例，对照组18例） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 987 | 2025-10-06 |
Suppression of GATA3 promotes epithelial-mesenchymal transition and simultaneous cellular senescence in human extravillous trophoblasts
2024-10, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119768
PMID:38838858
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研究论文 | 本研究探讨转录因子GATA3在早期妊娠胎盘绒毛外滋养细胞分化成熟过程中的调控机制及其与妊娠疾病的关系 | 首次揭示GATA3在调控上皮-间质转化和细胞衰老中的双重作用，并发现复发性流产患者中GATA3定位异常 | 研究主要基于细胞系模型，需要更多原代细胞和体内实验验证 | 阐明GATA3在绒毛外滋养细胞分化成熟过程中的调控机制 | 人类绒毛外滋养细胞、JEG3和HTR8/SVneo细胞系、胎盘类器官模型 | 单细胞生物学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种细胞模型和胎盘组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 988 | 2025-10-06 |
Protocol for optimized nasal mucosa sample processing to obtain high-quality scRNA-seq and scATAC-seq data
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103298
PMID:39244757
|
研究论文 | 提出优化的人类鼻黏膜样本处理流程，用于同时获取高质量单细胞转录组和表观基因组数据 | 开发了能够同时获得高质量scRNA-seq和scATAC-seq数据的鼻黏膜样本处理协议 | NA | 优化鼻黏膜样本处理流程以提高单细胞测序数据质量 | 人类鼻黏膜组织 | 单细胞测序技术 | 鼻腔疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 989 | 2025-10-06 |
Single-cell Profiling of Reprogrammed Human Neural Stem Cells Unveils High Similarity to Neural Progenitors in the Developing Central Nervous System
2024-07, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10698-3
PMID:38519702
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示重编程人类神经干细胞与发育早期中枢神经系统神经祖细胞的高度相似性 | 首次在单细胞水平系统比较重编程iNSCs与生理状态下神经祖细胞的转录组特征 | 研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限 | 评估直接重编程的人类iNSCs与生理神经祖细胞的相似性 | 重编程的人类神经干细胞(iNSCs) | 单细胞生物学 | 神经系统发育 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 990 | 2025-10-06 |
Olfactory neuroblastoma mimics molecular heterogeneity and lineage trajectories of small-cell lung cancer
2024-Jun-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.05.003
PMID:38788720
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研究论文 | 本研究通过建立遗传工程小鼠模型，揭示了嗅觉神经母细胞瘤与正常嗅觉上皮发育轨迹相似的细胞命运异质性，及其与小细胞肺癌在分子特征上的保守相似性 | 首次建立高级别转移性嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型，发现其细胞命运异质性模拟正常球状基底细胞发育轨迹，并揭示与小细胞肺癌相似的分子异质性特征 | 研究基于小鼠模型，人类肿瘤的验证仍需进一步临床研究 | 探究嗅觉神经母细胞瘤的细胞起源和分子异质性特征 | 嗅觉神经母细胞瘤小鼠模型和人类肿瘤样本 | 癌症生物学 | 嗅觉神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序,基于条形码的谱系追踪 | 遗传工程小鼠模型 | 转录组数据 | 小鼠模型和人类肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 991 | 2025-10-06 |
CACIMAR: cross-species analysis of cell identities, markers, regulations, and interactions using single-cell RNA sequencing data
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae283
PMID:38856169
|
研究论文 | 开发了名为CACIMAR的工具，用于跨物种分析单细胞RNA测序数据中的细胞身份、标记基因、调控网络和细胞间相互作用 | 基于保守特征的加权和模型开发了多种保守性评分，能够同时分析细胞类型、调控网络和细胞间相互作用的保守性 | NA | 开发跨物种单细胞RNA测序数据分析工具，揭示细胞和分子层面的进化保守性 | 小鼠、斑马鱼和鸡的视网膜再生单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权和模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 992 | 2025-10-06 |
Generation of a fluorescent hESC reporter line (Kle033-A-1) for the isolation of distinct midbrain progenitor cell types
2024-12, Stem cell research
IF:0.8Q4
DOI:10.1016/j.scr.2024.103523
PMID:39383604
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了荧光标记的人胚胎干细胞报告系，用于分离中脑多巴胺能前体细胞 | 首次利用CRISPR/Cas9技术构建特异性荧光报告细胞系，实现两种中脑多巴胺能前体细胞（Rgl1和ProgM）的分离 | NA | 开发帕金森病细胞替代疗法的精确策略 | 人胚胎干细胞、中脑多巴胺能前体细胞 | 干细胞研究 | 帕金森病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 993 | 2025-10-06 |
Multi-sample non-negative spatial factorization
2024-Nov-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.01.599554
PMID:39005356
|
研究论文 | 提出多样本非负空间因子分解(mNSF)框架，用于分析多样本空间转录组数据 | 将单样本空间因子分解(NSF)扩展到多样本数据集，无需空间对齐，包含样本特异性空间相关性建模 | 未明确说明具体的数据规模限制和计算复杂度 | 开发多样本空间转录组数据分析方法 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非负空间因子分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 994 | 2025-10-06 |
VisualZoneR: A computational protocol to identify compartmental zones from single-cell spatial transcriptomics using R
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103196
PMID:39067026
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研究论文 | 介绍一种基于R语言的VisualZoneR计算协议，用于从单细胞空间转录组数据中识别区室化区域 | 开发了专门用于分析Visium和Visium HD空间转录组数据的R语言工具，能够识别从健康组织到转移区域的不同区室 | NA | 建立从单细胞空间转录组数据中识别区室化区域的计算方法 | 肝脏组织，包括健康肝组织和转移区域 | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium, Visium HD | 10x Visium空间转录组技术 |
| 995 | 2025-10-06 |
Protocol for analysis of single-cell sequencing data by Seqtometry
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103209
PMID:39096493
|
研究论文 | 介绍用于单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据分析的Seqtometry分析平台协议 | 提出基于基因特征高级评分的Seqtometry分析平台，可直接通过生物学可解释维度识别和表征特定细胞 | NA | 开发单细胞测序数据分析协议 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 996 | 2025-10-06 |
Protocol to achieve high-resolution single-cell transcriptomics of cardiomyocytes in multiple species
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103194
PMID:39096494
|
研究论文 | 提供从多种物种中获取心肌细胞高分辨率单细胞转录组测序的详细实验方案 | 开发了适用于稀有心肌细胞群体（如再生/分裂细胞）的scRNA-seq方案，支持跨物种应用 | NA | 建立高质量单细胞转录组测序的实验流程 | 小鼠和斑马鱼心脏以及诱导多能干细胞中的心肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 997 | 2025-10-06 |
Protocol to study the immune profile of syngeneic mouse tumor models
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103139
PMID:38878286
|
研究论文 | 本文提供了一个用于研究同源小鼠肿瘤模型免疫特征的实验方案 | 整合了流式细胞术和单细胞RNA测序等多种技术来全面表征肿瘤微环境的免疫特征 | NA | 建立标准化流程来研究小鼠肿瘤模型的免疫特征 | 荷瘤小鼠的肿瘤组织和免疫相关器官 | 数字病理学 | 肿瘤 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 单细胞悬液制备 | NA | 单细胞数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 998 | 2025-10-06 |
Protocol for preparing mammalian skin samples encompassing hair follicles for spatial transcriptomics
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103254
PMID:39146191
|
方法论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学的哺乳动物皮肤样本制备方案，特别关注包含毛囊的样本 | 针对皮肤组织空间转录组学分析的挑战，开发了专门的样本制备流程 | 仅提供实验方案，未包含实际应用数据验证 | 建立适用于皮肤组织空间转录组学分析的标准化样本制备方法 | 哺乳动物皮肤组织样本，特别是包含毛囊的区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 999 | 2025-10-06 |
Somatic epigenetic drift during shoot branching: a cell lineage-based model
2024-Aug-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae091
PMID:38809088
|
研究论文 | 提出基于细胞谱系的模型研究植物分枝过程中的体细胞表观遗传漂变 | 首次形式化分离分生组织模型中细胞随机采样过程，揭示分枝过程中细胞谱系混合现象 | 理论模型需要实验验证，未考虑环境因素对表观遗传的影响 | 研究植物分枝过程中体细胞表观遗传变异的积累机制 | 植物顶端分生组织细胞 | 计算生物学 | NA | 理论建模 | 细胞谱系模型 | 理论模拟数据 | NA | NA | 单细胞测序，批量测序 | NA | NA |
| 1000 | 2025-10-06 |
Sample collection protocol for single-cell RNA sequencing of functionally identified neuronal populations in vivo
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103135
PMID:38875113
|
研究论文 | 介绍一种在体功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序样本收集协议 | 结合病毒传递的活性依赖性标记工具(CaMPARI2)和虚拟现实环境，实现在体功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序 | NA | 开发功能鉴定神经元群体的单细胞RNA测序样本收集方法 | 小鼠神经元群体 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选(FACS) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |