单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7524 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-07-03 |
Molecular heterogeneity of quiescent melanocyte stem cells revealed by single-cell RNA-sequencing
2024-07, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13169
PMID:38613320
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示静止黑色素细胞干细胞的分子异质性 | 确认了静止黑色素细胞干细胞(qMcSCs)的现有分子特征，并发现了新的qMcSC亚群，其中两个亚群差异调节其免疫特权状态 | 研究仅基于成年雌性C57BL/6J小鼠的皮肤样本，可能不适用于其他物种或性别 | 探究静止黑色素细胞干细胞的分子异质性 | 成年雌性C57BL/6J小鼠的静止黑色素细胞干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 来自成年雌性C57BL/6J小鼠的KIT+/CD45-细胞 |
| 82 | 2025-07-03 |
Enhanced prostatic Esr1+ luminal epithelial cells in the absence of SRD5A2
2024-07, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6283
PMID:38606616
|
研究论文 | 研究探讨了SRD5A2缺失对前列腺细胞异质性的影响，特别是对雌激素受体1（ESR1）阳性管腔上皮细胞的影响 | 发现SRD5A2缺失导致ESR1阳性管腔上皮细胞比例增加和增殖表型增强，揭示了5α还原酶抑制剂（5ARI）耐药机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析较少，可能限制结果的普适性 | 探索SRD5A2缺失对前列腺细胞异质性的影响及其在良性前列腺增生（BPH）治疗中的作用 | 小鼠模型和人类前列腺活检样本 | 病理学 | 前列腺增生 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据和临床活检数据 | NA |
| 83 | 2024-08-07 |
Comment on Hu et al. Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy. Diabetes 2022;71:762-773
2024-Jul-01, Diabetes..
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0041
PMID:38900953
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2025-07-03 |
Positionally distinct interferon stimulated dermal immune acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet's syndrome
2024-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.24.600500
PMID:38979312
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研究论文 | 本文通过单核和批量转录组学分析Sweet综合征的皮肤样本，揭示了干扰素信号在Sweet综合征中的作用，并发现不同位置的免疫活性成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的功能 | 首次在Sweet综合征中识别出位置不同的免疫活性成纤维细胞亚群，并阐明了它们通过识别I型干扰素在疾病发病机制中的作用 | 研究基于临床存档样本和体外培养的成纤维细胞，可能无法完全反映体内复杂环境 | 阐明Sweet综合征中中性粒细胞浸润的分子机制 | Sweet综合征患者的皮肤样本和体外培养的原代人皮肤成纤维细胞 | 皮肤病理学 | Sweet综合征 | 单核转录组学、批量转录组学、单分子分辨率空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 临床存档的Sweet综合征皮肤样本和体外培养的原代人皮肤成纤维细胞 |
| 85 | 2025-07-03 |
Sex differences and immune correlates of Long COVID development, persistence, and resolution
2024-Jun-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.18.599612
PMID:38948732
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研究论文 | 本研究探讨了性别差异与长新冠（LC）发展、持续和消退的免疫相关性 | 揭示了性别特异性的免疫失调在长新冠发病机制中的作用，并识别了与长新冠相关的多种先天和适应性免疫特征 | 样本量较小（45名患者），且仅基于血液样本分析 | 研究长新冠的免疫学基础及其性别差异 | 45名发展为长新冠或康复的新冠患者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、血浆蛋白质组学 | NA | 血液样本 | 45名患者 |
| 86 | 2025-07-03 |
Anti-PD-1 cancer immunotherapy induces central nervous system immune-related adverse events by microglia activation
2024-06-12, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adj9672
PMID:38865481
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研究论文 | 本文研究了抗PD-1免疫疗法在癌症治疗中引起的中枢神经系统免疫相关不良事件（CNS-irAEs）及其与小胶质细胞激活的关系 | 揭示了小胶质细胞在抗PD-1免疫疗法诱导的CNS-irAEs中的关键作用，并提出了基于脾酪氨酸激酶（Syk）抑制的治疗方法 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者数据有限，需要进一步验证 | 探究抗PD-1免疫疗法引起的中枢神经系统免疫相关不良事件的机制 | 小鼠模型和接受抗PD-1治疗的患者中枢神经系统组织 | 免疫疗法 | 癌症 | 单细胞RNA测序、成像质谱流式细胞术、蛋白质组学方法 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、影像数据 | 小鼠模型和一组接受抗PD-1治疗的患者组织样本 |
| 87 | 2025-07-02 |
Integrated Mendelian randomization and single-cell RNA-sequencing analyses identified OAS1 as a novel therapeutic target for erectile dysfunction via targeting fibroblasts
2024-Dec-24, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00587-7
PMID:39716299
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析，确定了OAS1作为通过靶向成纤维细胞治疗勃起功能障碍的新治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析与表达数量性状位点和蛋白质数量性状位点数据，寻找勃起功能障碍的新治疗靶点 | 需要进一步的实验和临床研究来验证OAS1在勃起功能障碍病理中的功能作用和治疗相关性 | 识别勃起功能障碍的新治疗靶点 | 勃起功能障碍患者 | 生物医学研究 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 孟德尔随机化(MR), 表达数量性状位点(eQTL), 蛋白质数量性状位点(pQTL) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 88 | 2025-07-02 |
MAIT cell plasticity enables functional adaptation that drives antibacterial immune protection
2024-12-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adp9841
PMID:39642244
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研究论文 | 本文探讨了黏膜相关不变T细胞（MAIT细胞）的可塑性及其在抗菌免疫保护中的功能适应 | 定义了MAIT1和MAIT17细胞亚群在体内的可塑性，揭示了MAIT17细胞向MAIT1/17和MAIT1细胞的表型和功能转换 | 未提及具体样本量或实验设计的局限性 | 理解MAIT细胞在抗感染中的作用及其在疫苗开发中的潜在应用 | MAIT细胞及其亚群（MAIT1和MAIT17细胞） | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 89 | 2025-07-02 |
Multinucleated giant cells are hallmarks of ovarian aging with unique immune and degradation-associated molecular signatures
2024-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626649
PMID:39677686
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研究论文 | 本研究通过先进成像技术和转录组分析，揭示了卵巢衰老过程中多核巨细胞（MNGCs）的独特免疫和降解相关分子特征 | 首次系统描述了卵巢衰老过程中MNGCs的分子特征及其与免疫细胞（如T细胞）的相互作用 | MNGCs的大尺寸限制了其通过单细胞RNA测序等技术的分离和分析 | 探究卵巢衰老过程中MNGCs的功能和分子特征 | 小鼠和非人灵长类动物的卵巢组织 | 生殖生物学 | 卵巢衰老 | 激光捕获显微切割和转录组分析 | NA | 图像和转录组数据 | 跨年龄和跨物种的卵巢组织样本 |
| 90 | 2025-07-02 |
iGTP: Learning interpretable cellular embedding for inferring biological mechanisms underlying single-cell transcriptomics
2024-Nov-25, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.03.29.24305092
PMID:39649598
|
research paper | 本文提出了一种名为iGTP的新型可解释生成转录程序框架，用于从单细胞转录组数据中推断生物学机制 | iGTP框架首次整合了转录程序空间和蛋白质-蛋白质相互作用网络，能够建模不同生物状态间的相互作用 | NA | 开发可解释的深度学习模型来揭示单细胞转录组数据背后的生物学机制 | 单细胞转录组数据 | bioinformatics | NA | single-cell transcriptomics | Variational AutoEncoder, graph neural network, latent diffusion model | gene expression data | NA |
| 91 | 2025-07-02 |
Single-cell transcriptional mapping reveals genetic and non-genetic determinants of aberrant differentiation in AML
2024-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.26.573390
PMID:38234771
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序技术，研究急性髓系白血病(AML)中遗传和非遗传因素对异常分化的影响 | 构建了一个包含263,519个单细胞转录组的人类骨髓造血参考图谱，并利用该图谱分析了超过120万个AML、MPAL和AEL样本的单细胞转录组，揭示了12种AML异常分化的常见模式 | 正常造血过程的参考图谱不够精确，患者队列样本量较小 | 研究AML中遗传和非遗传因素对异常分化的影响 | 急性髓系白血病(AML)、混合表型急性白血病(MPAL)和急性红系白血病(AEL)患者样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 263,519个正常造血单细胞转录组和1,200,000个AML、MPAL和AEL样本单细胞转录组 |
| 92 | 2025-07-02 |
Cytokine-induced reprogramming of human macrophages toward Alzheimer's disease-relevant molecular and cellular phenotypes in vitro
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.619910
PMID:39554174
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研究论文 | 本研究探讨了细胞因子混合物对人类THP-1巨噬细胞的重新编程能力，使其表现出与阿尔茨海默病相关的分子和细胞表型 | 首次使用IL4、CSF1/MCSF、IL34和TGFβ的细胞因子混合物诱导人类巨噬细胞向疾病相关小胶质细胞(DAM)和脂质相关巨噬细胞(LAM)的转录状态转变 | 研究仅在体外THP-1巨噬细胞系中进行，未在体内或原代细胞中验证 | 探索细胞因子诱导的人类巨噬细胞重编程在神经退行性疾病中的作用机制 | 人类THP-1巨噬细胞系 | 神经退行性疾病研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、功能测定 | 体外细胞模型 | 基因表达数据、功能测定数据 | THP-1巨噬细胞系 |
| 93 | 2025-07-02 |
Proximity-dependent labeling identifies dendritic cells that drive the tumor-specific CD4+ T cell response
2024-10-04, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adq8843
PMID:39365874
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研究论文 | 通过邻近依赖性标记技术识别驱动肿瘤特异性CD4+ T细胞反应的树突状细胞 | 使用LIPSTIC技术进行单细胞转录组学分析，识别出在肿瘤引流淋巴结和肿瘤微环境中能够向CD4 T细胞呈递抗原的树突状细胞 | 研究仅关注了树突状细胞与CD4 T细胞的相互作用，未涉及其他免疫细胞类型 | 研究树突状细胞在肿瘤免疫反应中的作用及其与检查点阻断免疫疗法的关系 | 树突状细胞和CD4+ T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | LIPSTIC (Labeling Immune Partnerships by SorTagging Intercellular Contacts), 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 94 | 2025-07-02 |
Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages (LAMs)
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614807
PMID:39386558
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在小鼠和人类中分析了多种组织和无菌炎症条件下的脂质相关巨噬细胞（LAMs）的转录组特征 | 揭示了LAMs在多种组织和炎症条件下共享的保守转录特征以及组织特异性的基因程序，并与人类慢性炎症环境中的LAM群体高度保守 | 研究主要基于小鼠和人类的scRNA-seq数据，可能无法完全反映LAMs在活体中的全部功能特性 | 探究脂质相关巨噬细胞（LAMs）在不同组织和炎症条件下的转录特征及其在代谢和慢性炎症疾病中的作用 | 小鼠和人类中的脂质相关巨噬细胞（LAMs） | 免疫学 | 代谢相关疾病（如动脉粥样硬化、肥胖、非酒精性脂肪肝病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 多种小鼠和人类组织样本 |
| 95 | 2025-07-02 |
Spatial transcriptomic characterization of pathologic niches in IPF
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl5473
PMID:39121212
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术对特发性肺纤维化（IPF）和对照患者的肺组织进行了分析，结合单细胞RNA测序数据，识别了三种与疾病相关的微环境 | 首次通过空间转录组学技术揭示了IPF中三种具有独特细胞组成和定位的疾病相关微环境，包括纤维化微环境、气道巨噬细胞微环境和免疫微环境 | 研究样本量未明确说明，可能限制结果的普遍性 | 揭示特发性肺纤维化（IPF）的病理微环境特征，以促进药物靶点的识别和相关体外模型的开发 | 特发性肺纤维化（IPF）患者和对照患者的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 96 | 2025-07-02 |
3D chromatin architecture, BRD4, and Mediator have distinct roles in regulating genome-wide transcriptional bursting and gene network
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4893
PMID:39121214
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研究论文 | 本文通过数学模型和单细胞RNA测序数据，研究了转录爆发的调控机制及其在全基因组范围内的动态变化 | 揭示了MED26、MYC、cohesin和BRD4在转录爆发调控中的不同作用，并发现MED26的急性缺失对基因调控网络影响最大 | 研究主要基于数学模型和单细胞RNA测序数据，可能缺乏实验验证 | 探究转录爆发的调控机制及其在全基因组范围内的动态变化 | 基因调控网络和转录爆发动态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模型 | RNA测序数据 | NA |
| 97 | 2025-07-02 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals mitochondrial calcium signaling as a modulator of endothelial-to-mesenchymal transition
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6182
PMID:39121218
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析揭示了线粒体钙信号作为内皮细胞向间充质细胞转化（EndMT）的调节因子 | 首次发现线粒体钙摄取是EndMT的关键驱动因素，并验证了线粒体钙单向转运蛋白（MCU）在EndMT中的调节作用 | 研究主要基于体外模型和小鼠实验，人类患者样本验证有限 | 探索内皮细胞向间充质细胞转化（EndMT）的分子机制及其在心血管疾病中的作用 | 内皮细胞（ECs）及其向间充质细胞的转化过程 | 单细胞测序分析 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 体外EndMT模型和小鼠肢体缺血模型 | 单细胞RNA测序数据 | 三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育样本、外周动脉疾病样本和严重肢体缺血患者组织样本 |
| 98 | 2025-07-02 |
Spatial transcriptomics at the brain-electrode interface in rat motor cortex and the relationship to recording quality
2024-07-31, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/ad5936
PMID:38885679
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术研究了大鼠运动皮层中电极植入后的基因表达变化，并与传统的胶质细胞反应、神经元损失和电生理记录质量指标进行了比较 | 首次将空间转录组学应用于脑电极界面的研究，识别出与电极植入相关的差异表达基因，并发现与记录质量相关的潜在生物标志物 | 研究仅限于大鼠模型，结果可能无法直接推广到人类 | 探索电极植入后脑组织的生理变化及其对设备功能和寿命的影响 | 大鼠运动皮层 | 神经科学 | NA | 空间转录组学(ST), 免疫标记 | NA | 基因表达数据, 电生理记录数据 | 植入功能性密歇根式微电极阵列的大鼠，在植入后24小时、1周和6周进行采样 |
| 99 | 2025-07-02 |
Gene Regulatory Programs that Specify Age-Related Differences during Thymocyte Development
2024-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599011
PMID:38948840
|
研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育程序的转录和表观遗传图谱，揭示了不同基因调控程序的个体发育及其与年龄相关表型和功能差异的联系 | 识别了一个从发育最早阶段就随年龄分化的基因模块，揭示了新生小鼠在早期胸腺细胞发育过程中具有更开放的染色质状态，并利用CRISPR扰动方法结合单细胞RNA测序发现了一个保守的转录调控因子 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控程序 | 新生和成年小鼠的T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR扰动 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 新生和成年小鼠的T细胞样本 |
| 100 | 2025-07-02 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594719
PMID:38826447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描绘了小鼠卵巢排卵过程中的时空细胞图谱 | 首次在单细胞分辨率下详细描绘了排卵过程的精确时间窗口，并鉴定了排卵依赖的细胞状态基因标记 | 研究仅针对小鼠模型，人类卵巢排卵过程可能存在差异 | 解析排卵过程中卵巢细胞类型的时空动态变化 | 小鼠卵巢细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 配对小鼠卵巢样本（具体数量未明确说明） |