单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7508 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-09-01 |
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.07.622523
PMID:39605581
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研究论文 | 提出DBiTplus方法，整合基于测序和成像的空间组学技术，在同一组织切片上实现转录组和蛋白质组的空间映射 | 开发了结合空间转录组测序和高通量蛋白质成像的统一工作流程，首次实现同一组织切片的单细胞分辨率多模态空间组学分析 | NA | 开发整合多模态空间组学技术的方法，以促进对异质性细胞过程的理解 | 小鼠胚胎、正常人淋巴结、人类淋巴瘤FFPE组织 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间转录组测序、CODEX蛋白质成像、微流控DNA寡核苷酸递送 | NA | 空间转录组数据、蛋白质成像数据 | 多种组织类型（包括小鼠胚胎、人淋巴结和淋巴瘤组织） |
| 82 | 2025-09-01 |
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.21.619529
PMID:39484491
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学和谱系追踪技术，揭示肺腺癌模型中肿瘤生长、可塑性和转移与微环境重塑的协同演化 | 结合高分辨率空间转录组学与动态谱系追踪技术，首次在时空维度解析肿瘤亚克隆与微环境的共进化关系 | 研究基于小鼠模型，人类肿瘤的适用性需进一步验证 | 阐明肿瘤细胞状态与微环境结构如何协同促进肿瘤进展 | Kras驱动的肺腺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 谱系追踪 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠模型样本（具体数量未明确说明） |
| 83 | 2025-09-01 |
Monocyte Single-Cell Multimodal Profiling in Cardiovascular Disease Risk States
2024-Aug-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324457
PMID:39105287
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研究论文 | 通过单细胞多模态分析揭示心血管疾病风险状态下单核细胞的异质性和功能亚群 | 首次结合CITE-seq和scRNA-seq技术对超过43万单核细胞进行高维多模态分析，识别出多个功能独特的亚群并验证其存在 | NA | 解析单核细胞在心血管疾病风险状态下的转录组和表型景观 | 人类和小鼠模型的单核细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | CITE-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 表型数据 | 437,126个单核细胞 |
| 84 | 2025-08-31 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-Aug-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | 提出一种整合细胞形态和空间转录组学的端到端框架METI，用于深度分析肿瘤生态系统 | 首次将空间转录组学、细胞形态学和基因特征整合，无需匹配单细胞RNA测序数据即可分析肿瘤微环境 | NA | 开发能够增强对肿瘤微环境中分子景观和细胞相互作用理解的分析工具 | 胃癌、肺癌、膀胱癌等肿瘤组织及癌前组织 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 端到端框架 | 空间转录组数据、细胞形态数据 | 多种肿瘤组织样本（包括胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前组织） |
| 85 | 2025-08-30 |
Decoding the mosaic of inflammatory bowel disease: Illuminating insights with single-cell RNA technology
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.07.011
PMID:39421242
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的进展与应用 | 整合单细胞转录组、蛋白质组、T细胞受体谱和表观遗传分析，提供IBD发病机制的全面视角 | 缺乏纵向研究数据，多技术整合仍存挑战，微生物单细胞RNA测序潜力待挖掘 | 增强对炎症性肠病发病机制的理解并推动精准医疗 | 炎症性肠病（IBD）患者及相关细胞群体 | 生物医学 | 炎症性肠病 | scRNA-seq, 单细胞蛋白质组学, T细胞受体分析, 表观遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 86 | 2025-08-30 |
Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues
2024-May-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66850
PMID:38767376
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研究论文 | 本文提出了一种处理骨组织样本以生成高质量空间转录组数据的方法 | 开发了针对硬骨组织的特殊处理方法，解决了传统方法在RNA保存和组织形态学维持上的难题，并扩展了该方法至石蜡包埋样本 | NA | 实现骨组织的空间转录组分析 | 骨组织样本，包括新鲜样本和石蜡包埋样本 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据，组织形态学数据 | 骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本（具体数量未明确说明） |
| 87 | 2025-08-30 |
Integrating single-cell and spatial analysis reveals MUC1-mediated cellular crosstalk in mucinous colorectal adenocarcinoma
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1701
PMID:38778448
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间分析技术，揭示了黏液性结直肠腺癌中MUC1介导的细胞间相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学系统解析MCA肿瘤微环境，发现MUC1+恶性细胞与ZEB1+内皮细胞的关键互作 | 研究样本量有限，需进一步扩大队列验证发现 | 深入理解黏液性结直肠腺癌的细胞水平转录动态，以开发特异性治疗策略 | 黏液性结直肠腺癌患者的肿瘤微环境中的基质细胞和免疫细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 3D生物打印, 免疫荧光染色 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 队列数据（具体数量未明确说明） |
| 88 | 2025-08-30 |
Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1720
PMID:38778457
|
综述 | 本文全面概述了皮肤黑色素细胞干细胞（MSCs）的起源、生物学特性、稳态维持及治疗潜力 | 重点突出了单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实用模型在MSCs研究中的最新进展与应用价值 | NA | 探讨MSCs在皮肤色素性疾病和再生医学中的临床应用潜力 | 哺乳动物毛囊、表皮或汗腺中的黑色素细胞干细胞 | 再生医学 | 皮肤色素性疾病（如白发、白癜风、黑色素瘤） | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA |
| 89 | 2025-08-30 |
Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders
2024-05, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1699
PMID:38783408
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HIV感染者肠道黏膜免疫细胞，揭示了免疫无应答者中滤泡或记忆B细胞向浆细胞分化的缺陷 | 首次在单细胞水平描绘HIV感染者肠道黏膜免疫细胞图谱，并发现免疫无应答者中IGKC+IgA+浆细胞亚群减少及B细胞分化障碍 | 样本量较小（仅17例参与者），且仅为观察性研究无法确定因果关系 | 探究HIV感染者抗逆转录病毒治疗后肠道黏膜免疫细胞在免疫恢复中的作用 | HIV阴性对照者、免疫应答者及免疫无应答者的肠道黏膜免疫细胞 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序、免疫组化、16S rRNA基因测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、微生物组数据、流式细胞数据 | 5名HIV阴性对照、9名免疫应答者、3名免疫无应答者（共54,475个免疫细胞） |
| 90 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment
2024-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1668
PMID:38649737
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2025-08-30 |
Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche
2024-01-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152
PMID:38181095
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研究论文 | 本研究揭示皮肤中调节性T细胞（Treg）通过高亲和力IL-2受体介导的细胞外机制，保护毛囊干细胞巢免受自身免疫攻击 | 开发了皮肤特异性Treg基因重组技术，首次证明非淋巴器官中存在局部免疫耐受机制，并发现IL-2信号通路在毛囊干细胞保护中的关键作用 | 人类脱发症样本仅涉及罕见类型，模型可能无法完全代表所有自身免疫性脱发病理 | 探究皮肤组织中自身免疫耐受的维持机制及其对毛囊干细胞的保护作用 | 小鼠皮肤调节性T细胞、毛囊干细胞巢、人类脱发症病理样本 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 空间转录组学、遗传重组技术 | NA | 基因表达数据、组织病理数据 | 小鼠模型及人类罕见脱发症样本（具体数量未明确说明） |
| 92 | 2025-08-29 |
Contributions of T Cell Signaling for Wound Healing
2024-11-14, Journal of burn care & research : official publication of the American Burn Association
IF:1.5Q3
DOI:10.1093/jbcr/irae151
PMID:39110034
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研究论文 | 本研究利用scRNA-seq和免疫荧光成像技术，揭示了T细胞在伤口愈合炎症阶段的不同亚群及其信号贡献 | 首次发现并验证了伤口愈合过程中存在耗竭T细胞，并解析了不同T细胞亚群的特异性信号功能 | 耗竭T细胞的分子机制和对伤口愈合的具体贡献仍需未来深入研究 | 探究T细胞在伤口愈合过程中的信号传导机制 | 伤口愈合过程中的T细胞亚群（活化T细胞、细胞毒性T细胞、耗竭T细胞、调节性T细胞） | 免疫学 | 伤口愈合障碍 | scRNA-seq, 免疫荧光成像 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA |
| 93 | 2025-08-29 |
The unveiled mosaic of intra-tumor heterogeneity in ovarian cancer through spatial transcriptomic technologies: A systematic review
2024-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.08.001
PMID:39111726
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系统综述 | 本文系统综述了空间转录组技术在揭示卵巢癌肿瘤内异质性及其微环境组成方面的应用与发现 | 聚焦空间转录组技术揭示卵巢癌中基因表达的空间分布模式及其对治疗反应和预后的影响 | NA | 总结空间转录组技术如何增进对卵巢癌肿瘤异质性和微环境的理解 | 卵巢癌肿瘤组织及其微环境中的细胞类型、状态和相互作用 | 数字病理 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，空间分布数据 | NA |
| 94 | 2025-08-29 |
Perivascular NOTCH3+ Stem Cells Drive Meningioma Tumorigenesis and Resistance to Radiotherapy
2024-Oct-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1459
PMID:38742767
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研究论文 | 研究发现血管周围NOTCH3+干细胞驱动脑膜瘤发生和放疗抵抗，并验证靶向NOTCH3的治疗策略 | 首次鉴定NOTCH3+干细胞作为脑膜瘤发生和放疗抵抗的关键驱动因素，并开发靶向NOTCH3的抗体治疗 | NA | 探究脑膜瘤发生和放疗抵抗的细胞类型与信号机制 | 人类、犬类和鼠类脑膜瘤样本 | 肿瘤生物学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪、成像技术、基因工程小鼠模型、异种移植 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 跨物种（人、犬、鼠）脑膜瘤样本 |
| 95 | 2025-08-29 |
DC-derived CXCL10 promotes CTL activation to suppress ovarian cancer
2024-10, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2024.05.013
PMID:38823437
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研究论文 | 本研究探讨树突状细胞（DCs）及其CXCL10标记基因在卵巢癌微环境中激活细胞毒性T淋巴细胞（CTLs）的作用及其对疾病进展的影响 | 首次通过scRNA-seq和免疫浸润分析明确DC来源的CXCL10作为调控CTL激活的关键因子，并证实其抑制卵巢癌生长和转移的机制 | NA | 阐明DC来源的CXCL10在卵巢癌免疫微环境中的功能及治疗潜力 | 卵巢癌微环境中的树突状细胞和细胞毒性T淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | scRNA-seq, 免疫浸润分析, 体外实验, 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | NA |
| 96 | 2025-08-29 |
WITHDRAWN: Single-cell RNA Sequencing Revealing that MMP12+ Macrophages are Associated with Cancer Liver Metastasis
2024-09-12, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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撤稿声明 | 作者要求撤回一篇关于MMP12+巨噬细胞与癌症肝转移关系的单细胞RNA测序研究论文 | NA | NA | NA | NA | NA | 癌症肝转移 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 97 | 2025-08-29 |
Integration of single-cell RNA sequencing of endothelial cells and proteomics to unravel the role of ICAM1-PTGS2 communication in apical periodontitis: A laboratory investigation
2024-09, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.14080
PMID:38713190
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术，探讨ICAM1-PTGS2信号通路在根尖周炎内皮细胞中的作用机制 | 首次结合scRNA-seq和蛋白质组学分析根尖周炎内皮细胞异质性，并揭示ICAM1通过调控铁死亡相关蛋白PTGS2影响炎症微环境的新机制 | 样本量较小（5例CAP样本），且主要基于体外细胞实验（HUVECs和THP-1巨噬细胞），临床直接证据有限 | 阐明根尖周炎中内皮细胞的多样性及ICAM1-PTGS2通讯在炎症调控中的作用 | 慢性根尖周炎患者组织样本、人脐静脉内皮细胞（HUVECs）、THP-1来源的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 根尖周炎 | scRNA-seq, 蛋白质组学, 实时PCR, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 5例CAP样本（GSE181688和GSE197680数据集），另含体外细胞实验 |
| 98 | 2025-08-29 |
Inhalable Stem Cell Exosomes Promote Heart Repair After Myocardial Infarction
2024-Aug-27, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种通过吸入方式递送干细胞外泌体的非侵入性方法（SCENT），用于促进心肌梗死后的心脏修复 | 首次提出吸入式外泌体递送方法，并发现内皮细胞CD36敲除通过调节能量代谢改善心脏功能的新机制 | 研究主要基于动物模型（小鼠和猪），尚未进行人体临床试验 | 开发一种非侵入性、可重复的心脏修复治疗方法，并探索其作用机制 | 心肌梗死模型小鼠（C57BL/6）和猪 | 再生医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、心脏磁共振成像、超声心动图 | 动物疾病模型（小鼠和猪心肌梗死模型） | 影像数据、测序数据、组织学数据 | 小鼠和猪心肌梗死模型，治疗组连续7天接受外泌体吸入治疗 |
| 99 | 2025-08-29 |
A single-cell transcriptomic map of the developing Atoh1 lineage identifies neural fate decisions and neuronal diversity in the hindbrain
2024-08-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.007
PMID:39106860
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠后脑Atoh1谱系神经元的命运决定机制和多样性 | 首次提供了Atoh1谱系神经元的高分辨率转录组图谱，发现了增殖性单极刷细胞前体细胞群，并证实了其在髓母细胞瘤亚型起源中的潜在作用 | 研究仅限于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证 | 解析Atoh1转录因子在后脑神经元发育中的命运决定机制和细胞多样性 | 发育中小鼠后脑的Atoh1谱系神经元 | 单细胞组学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), ATOH1 DNA结合分析 | NA | 单细胞转录组数据, DNA结合数据 | 小鼠后脑Atoh1谱系神经元单细胞样本 |
| 100 | 2025-08-29 |
Disease-associated astrocyte epigenetic memory promotes CNS pathology
2024-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07187-5
PMID:38509377
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研究论文 | 本研究识别了一种表观遗传控制的记忆性星形胶质细胞亚群，其在再次刺激时表现出加剧的促炎反应，并促进中枢神经系统病理 | 首次揭示了星形胶质细胞通过ACLY-p300表观遗传机制形成免疫记忆，并证实其在多发性硬化症病理中的关键作用 | 主要基于EAE动物模型，人类数据主要来自体外实验和组织样本分析，需要更多临床验证 | 探究疾病相关星形胶质细胞的稳定性及其对过去刺激事件的整合能力 | 星形胶质细胞亚群，特别是在多发性硬化症和实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型中的细胞 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序，ATAC-seq，ChIP-seq，FIND-seq，体内CRISPR-Cas9基因扰动 | NA | 基因组学数据，表观遗传学数据，免疫组织化学数据 | EAE急性和慢性模型动物，人类星形胶质细胞体外培养，多发性硬化症病变组织样本 |