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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-06 |
Single-cell multi-omic analysis of the vestibular schwannoma ecosystem uncovers a nerve injury-like state
2024-01-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-42762-w
PMID:38216553
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示了前庭神经鞘瘤生态系统中的神经损伤样状态 | 首次描绘了前庭神经鞘瘤的细胞异质性和肿瘤微环境景观,发现了修复样和MHC-II抗原呈递施万细胞与髓系细胞浸润的关联,提出了神经损伤样过程的机制 | 样本量有限,且单细胞ATAC-seq和全外显子组测序的配对样本较少 | 探究前庭神经鞘瘤的细胞异质性和肿瘤微环境如何影响其发病机制 | 前庭神经鞘瘤肿瘤组织及其中的施万细胞、基质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 全外显子组测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 外显子组数据 | 15个前庭神经鞘瘤样本,其中6个有配对单细胞ATAC-seq数据,12个有全外显子组测序数据,另有175个肿瘤的RNA表达数据用于去卷积分析 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-05-06 |
Investigating cellular similarities and differences between upper tract urothelial carcinoma and bladder urothelial carcinoma using single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1298087
PMID:38903524
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研究论文 | 利用单细胞测序探究上尿路尿路上皮癌与膀胱尿路上皮癌的细胞相似性和差异 | 首次利用单细胞RNA测序综合分析上尿路尿路上皮癌与膀胱尿路上皮癌微环境中不同细胞亚群的转录差异,揭示两者在免疫景观和细胞功能表型上的显著差异,并发现MARCKS促进上尿路尿路上皮癌进展 | 样本量较小(仅3例上尿路尿路上皮癌和4例正常输尿管组织),且依赖公开数据集进行比较,可能影响结果的普适性 | 探索上尿路尿路上皮癌的分子过程,并鉴定其与膀胱尿路上皮癌之间的生物学差异 | 上尿路尿路上皮癌和膀胱尿路上皮癌的肿瘤组织及正常输尿管组织 | 数字病理学 | 泌尿系统癌症 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 转录组数据, 图像 | 3例上尿路尿路上皮癌和4例正常输尿管组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-05-06 |
Screening and validation of atherosclerosis PAN-apoptotic immune-related genes based on single-cell sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1297298
PMID:38736872
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研究论文 | 基于单细胞测序筛选并验证动脉粥样硬化PAN-凋亡免疫相关基因 | 首次在单细胞水平筛选出与颈动脉粥样硬化(CAS)相关的PAN-凋亡小体诊断基因,并构建诊断模型 | 未提及明确局限性 | 筛选与颈动脉粥样硬化相关的PAN-凋亡小体诊断基因 | 颈动脉粥样硬化患者样本及正常对照样本 | 机器学习 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序, RT-qPCR | LASSO回归, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞核测序数据 | 未明确说明具体样本量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞核测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-05-06 |
Single-cell RNA sequencing and AlphaFold 3 insights into cytokine signaling and its role in uveal melanoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458041
PMID:39916959
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和AlphaFold 3分析细胞因子信号在葡萄膜黑色素瘤中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序与AlphaFold 3蛋白质结构预测,系统解析了葡萄膜黑色素瘤的细胞异质性和细胞因子信号网络 | 未提及 | 阐明葡萄膜黑色素瘤的细胞异质性并鉴定预后生物标志物 | 葡萄膜黑色素瘤原发和转移性肿瘤样本 | 单细胞组学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO回归, ROC曲线分析, AlphaFold 3, 伪时间轨迹分析, CRISPR-Cas9筛选分析 | LASSO回归 | 单细胞RNA测序数据 | 原发性和转移性葡萄膜黑色素瘤样本, TCGA-UVM和GSE84976队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-05-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dysfunctional characteristics of PBMCs in patients with type 2 diabetes mellitus
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1501660
PMID:39916961
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示2型糖尿病患者外周血单个核细胞的失能特征 | 首次通过单细胞RNA测序全面描绘2型糖尿病患者外周血单个核细胞的转录图谱,发现TNFRSF1A是T细胞网络互作的核心基因 | 样本量较小(仅3例患者和3例健康对照),可能限制结论的普适性 | 探索2型糖尿病外周血免疫细胞功能失调的分子机制 | 2型糖尿病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例(3例健康对照,3例2型糖尿病患者)共13,591个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | Ficoll密度梯度离心法分离PBMCs后行scRNA-seq |
| 86 | 2026-05-06 |
Deciphering the role of metal ion transport-related genes in T2D pathogenesis and immune cell infiltration via scRNA-seq and machine learning
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1479166
PMID:39926598
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和机器学习方法研究金属离子转运相关基因在2型糖尿病发病机制及免疫细胞浸润中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、多种机器学习算法和AlphaFold 3蛋白质结构预测,系统性分析金属离子转运相关基因在2型糖尿病中的功能及免疫细胞相互作用 | 研究仅基于公开数据集,未进行体外或体内功能验证;预测的蛋白质结构需进一步实验确认 | 探索2型糖尿病发病机制中金属离子转运相关基因的作用及其与免疫细胞浸润的关联 | 2型糖尿病和非糖尿病患者的胰岛细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | Stepglm[backward] + GBM 组合模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 未明确说明 | 单细胞RNA测序 | 未明确说明 | 未明确说明 |
| 87 | 2026-05-06 |
Single-cell sequencing uncovers the mechanistic role of DAPK1 in glioma and its diagnostic and prognostic implications
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1463747
PMID:39926603
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研究论文 | 利用单细胞测序揭示DAPK1在胶质瘤中的机制作用及其诊断和预后意义 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析揭示DAPK1作为终末亚群标志基因与胶质瘤不良预后的关联,并基于此构建预后模型 | DAPK1在胶质瘤中的精确作用和潜在机制仍不完全清楚 | 解析DAPK1在胶质瘤中的机制作用,并开发基于DAPK1的预后标志物以预测患者结局 | 胶质瘤患者的单细胞分化数据、RNA-seq和微阵列数据集 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 微阵列分析 | LASSO, 逐步回归 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-05-06 |
Single-cell RNA sequencing revealed PPARG promoted osteosarcoma progression: based on osteoclast proliferation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506225
PMID:39936154
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示PPARG通过促进破骨细胞增殖推动骨肉瘤进展的机制 | 首次在单细胞水平鉴定出骨肉瘤中高特异性C2MKI67+破骨细胞亚群,并发现PPARG作为关键转录因子通过调控破骨细胞增殖促进肿瘤进展,为骨肉瘤治疗提供新靶点 | 研究主要基于单细胞测序数据分析和体外实验验证,缺乏体内动物模型验证及更大样本量的临床验证 | 探索骨肉瘤中破骨细胞在单细胞水平的作用机制,寻找新的治疗靶点以阻止肿瘤进展和局部扩散 | 骨肉瘤患者的破骨细胞及其亚群 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 骨肉瘤患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-05-06 |
Serum and tear autoantibodies from NOD and NOR mice as potential diagnostic indicators of local and systemic inflammation in Sjögren's disease
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1516330
PMID:39936155
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研究论文 | 本研究通过分析NOD和NOR小鼠模型中的血清和泪液自身抗体,探索其在干燥综合征局部和全身炎症中的诊断潜力 | 首次系统比较干燥综合征小鼠模型泪液与血清中自身抗体谱差异,特别是发现泪液IgA同型自身抗体多样性高于IgG,并证实泪腺三级淋巴结构是泪液自身抗体的可能来源 | 仅使用两种雄性小鼠模型(NOD和NOR),未涵盖SjD所有表型;泪液自身抗体临床转化价值有待人体验证 | 评估泪液和血清自身抗体作为干燥综合征相关自身免疫性泪腺炎生物标志物的诊断价值 | NOD和NOR小鼠(干燥综合征相关泪腺炎模型)及健康对照BALB/c小鼠 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 自身抗体微阵列、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 免疫荧光图像、自身抗体阵列数据、单细胞转录组数据 | 两种SjD小鼠模型(NOD和NOR)及健康对照BALB/c小鼠的血清和泪液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 利用GSE132420数据集的10x Chromium单细胞RNA测序分析泪腺免疫细胞 |
| 90 | 2026-05-06 |
The cancer-associated fibroblasts interact with malignant T cells in mycosis fungoides and promote the disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1474564
PMID:39963655
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究蕈样肉芽肿中癌症相关成纤维细胞与恶性T细胞的相互作用及其促进疾病进展的机制 | 首次揭示蕈样肉芽肿中恶性T细胞从组织驻留记忆T细胞向中央记忆T细胞表型转化的双表型特征,并发现炎性癌症相关成纤维细胞与恶性T细胞通过IL-6/JAK2/STAT3/SOX4或IL-6/HIF-1α/SOX4通路形成正反馈环路,SOX4可能成为关键干预靶点 | 样本量可能有限,且具体样本数量未在摘要中明确;主要基于单细胞测序数据,需进一步功能性验证 | 阐明蕈样肉芽肿的发病机制及肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞的作用 | 晚期蕈样肉芽肿患者的肿瘤组织、邻近正常组织和外周血单个核细胞,以及健康对照 | 数字病理学 | 蕈样肉芽肿(皮肤T细胞淋巴瘤) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但包括晚期MF患者和健康对照的多个样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 91 | 2026-05-06 |
Single-cell RNA sequencing highlights the influence of innate and adaptive immune response mechanisms in psoriatic arthritis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1490051
PMID:40084238
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者的外周血单个核细胞,揭示先天性和适应性免疫反应机制对疾病异质性的影响 | 首次在单细胞水平上比较无皮肤银屑病的银屑病关节炎患者与伴有皮肤银屑病的银屑病关节炎患者的基因表达差异,揭示临床表型与免疫机制之间的关联 | 直接比较两组患者未发现差异表达基因,且样本量有限 | 探索银屑病关节炎患者临床异质性与免疫机制的关联,区分不同临床表型在免疫细胞水平上的差异 | 70名银屑病关节炎患者(包括无皮肤银屑病和伴有皮肤银屑病两种表型)和10名健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 70名银屑病关节炎患者和10名健康对照者的外周血单个核细胞 | BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | BD Rhapsody™ 单细胞分析系统 |
| 92 | 2026-05-05 |
Single-cell analysis revealing the metabolic landscape of prostate cancer
2024-09-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja20243
PMID:38657119
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示前列腺癌的代谢景观 | 利用计算流程进行单细胞RNA测序,首次描绘了前列腺癌中上皮细胞与基质细胞的代谢活性差异,并发现神经内分泌细胞具有高代谢率,可能解释神经内分泌前列腺癌的高营养和能量需求 | 仅基于计算和部分实验验证,未进行大规模临床样本验证 | 通过单细胞水平分析揭示前列腺癌的代谢异质性和疾病进展机制 | 前列腺癌细胞及其微环境中的上皮细胞、基质细胞和神经内分泌细胞 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2026-05-05 |
Graph Fourier transform for spatial omics representation and analyses of complex organs
2024-08-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51590-5
PMID:39209833
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研究论文 | 介绍Spatial Graph Fourier Transform (SpaGFT)方法,利用图信号处理技术对空间组学数据进行表征分析,支持复杂器官的空间生物学研究 | 提出基于图傅里叶变换的空间组学表征方法,可解释性强,能识别空间可变基因和稀有亚细胞结构,并提升多种机器学习任务的准确性 | NA | 开发一种可解释的图表示方法用于空间组学数据的表征和分析 | 人类和小鼠的空间转录组数据、人类淋巴结Visium数据、人类扁桃体CODEX数据、高分辨率空间蛋白组学数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学、空间蛋白组学、图信号处理 | 图傅里叶变换 | 空间组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 94 | 2026-05-05 |
High-resolution diffusion magnetic resonance imaging and spatial-transcriptomic in developing mouse brain
2024-08-15, NeuroImage
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120734
PMID:39032791
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研究论文 | 该研究获取了小鼠发育大脑的32微米各向同性分辨率多壳扩散磁共振成像数据集,并整合艾伦发育小鼠脑图谱的空间转录组学数据,探究脑组织微观结构变化 | 首次提供了包括DTI、DKI和NODDI模型的高分辨率dMRI来追踪小鼠出生后大脑白质和灰质的微观结构变化,并强调了空间转录组学与dMRI的基因型-表型相关性 | 未见明确说明 | 利用高分辨率扩散磁共振成像和空间转录组学探究发育中小鼠大脑的微观结构变化及其分子基础 | 出生后不同天数的小鼠大脑 | 机器学习 | NA | 高分辨率扩散磁共振成像,空间转录组学 | NA | 图像 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2026-05-05 |
Single-cell RNA sequencing to explore cancer-associated fibroblasts heterogeneity: "Single" vision for "heterogeneous" environment
2024-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13592
PMID:38158643
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综述 | 综述单细胞RNA测序技术在揭示癌症相关成纤维细胞异质性中的应用 | 从单细胞RNA测序视角系统综述癌症相关成纤维细胞异质性,并探讨多模态单细胞平台整合策略 | 未提供具体实验验证或定量分析结果 | 探讨单细胞RNA测序在理解癌症相关成纤维细胞异质性中的应用及临床转化潜力 | 癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2026-05-04 |
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07797-z
PMID:39112713
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研究论文 | 通过体内外模型研究致癌RAS剂量滴定如何改变衰老状态并影响肿瘤起始 | 首次开发RAS剂量递增模型,揭示低剂量RAS驱动的非连续性下游表型,并发现NRAS(G12V)水平降低可导致肝细胞免疫逃逸与肿瘤形成 | 未明确说明局限性 | 探究致癌RAS剂量变化对衰老表型及肿瘤起始的影响 | 肝细胞衰老模型中的小鼠肝细胞及肿瘤 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝细胞样本及肿瘤样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2026-05-04 |
Osteostaticytes: A novel osteoclast subset couples bone resorption and bone formation
2024-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.06.010
PMID:39027343
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人皮质骨细胞图谱,发现一种新型破骨细胞亚群——骨静细胞(OSCs),其具有高趋化活性,可招募间充质干细胞,参与骨重塑中的逆转阶段 | 首次鉴定出IDO1高表达/CCL3高表达/CCL4高表达的破骨细胞前体亚群(骨静细胞),并证明其在骨重塑逆转期具有最强的间充质干细胞趋化能力,揭示了破骨细胞系早期阶段与骨形成偶联的新机制 | 该研究主要基于单细胞转录组数据和体外共培养实验,骨静细胞在体内骨重塑中的具体功能及其作为治疗靶点的可行性仍需进一步验证 | 阐明骨髓炎后骨重塑失败的细胞和分子机制,探索破骨细胞系在骨形成与骨吸收偶联中的作用 | 人皮质骨(正常、感染和重建状态)样本,以及正常小鼠胫骨骨折模型和骨髓炎相关胫骨骨折模型 | 数字病理学, 机器学习 | 骨髓炎, 骨延迟愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞转录组)、图像(免疫荧光、生物发光成像) | 人皮质骨样本(具体数量未提及,包含正常、感染和重建三种状态),小鼠模型样本(正常骨折和骨髓炎骨折模型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-05-04 |
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468875
PMID:39742274
|
研究论文 | 通过机器学习选择骨肉瘤免疫细胞标志物,构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 | 利用多算法计算框架结合20种机器学习算法构建基于肿瘤浸润免疫细胞的预后模型,并发现CLK1作为潜在癌基因促进骨肉瘤细胞增殖和迁移 | 未提及具体的局限性 | 提高对骨肉瘤肿瘤微环境的理解,开发预后模型并识别新的治疗靶点 | 骨肉瘤患者临床和RNA表达数据、单细胞RNA测序数据以及人骨肉瘤细胞系MG63和U2OS | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 11例骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-05-03 |
Aging-induced immune microenvironment remodeling fosters melanoma in male mice via γδ17-Neutrophil-CD8 axis
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55164-3
PMID:39738047
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科研论文 | 通过单细胞RNA测序揭示雄性小鼠中衰老诱导的免疫微环境重塑通过γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进黑色素瘤转移 | 首次发现衰老通过下调S1pr1驱动γδ17细胞扩增,进而招募促肿瘤中性粒细胞抑制CD8+T细胞功能,形成γδ17-中性粒细胞-CD8轴促进肿瘤转移 | 研究主要基于小鼠模型,其结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究衰老免疫系统如何促进肿瘤转移的机制 | 年轻与年老雄性小鼠的肺免疫微环境 | 单细胞转录组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及年轻和年老雄性小鼠的肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 100 | 2026-05-03 |
Spatial Biology of Breast Cancer
2024-05-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041335
PMID:38110242
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综述 | 该文章综述了空间生物学方法(包括空间转录组学和蛋白质组学)如何促进对乳腺癌进展和治疗的理解,并探讨了新兴多重成像技术的影响 | 强调了空间生物学方法在揭示乳腺癌空间关系中的创新性应用,以及多重成像技术如何推动该领域未来发展 | 未明确提及具体局限性,但作为综述,可能依赖于现有研究并缺乏新实验数据 | 总结空间生物学方法在乳腺癌研究中的贡献,并展望未来研究方向 | 乳腺癌的空间生物学 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,蛋白质组学 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |