单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2025-10-06 |
A sexually dimorphic hepatic cycle of periportal VLDL generation and subsequent pericentral VLDLR-mediated re-uptake
2024-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52751-2
PMID:39341814
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝脏功能在空间和时间上的性别二态性，特别是极低密度脂蛋白的生成与摄取循环 | 首次发现肝脏中存在性别二态性的门静脉周围VLDL生成和中央静脉周围VLDLR介导的再摄取循环 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 探究性别二态性如何影响肝脏功能的时空逻辑 | 小鼠肝脏和人类肝脏组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 962 | 2025-10-06 |
Hypoxia induces ROS-resistant memory upon reoxygenation in vivo promoting metastasis in part via MUC1-C
2024-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51995-2
PMID:39341835
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研究论文 | 本研究揭示缺氧通过诱导MUC1-C上调形成ROS抵抗性记忆，促进乳腺癌转移的机制 | 首次发现缺氧细胞在复氧后仍保持缺氧诱导基因表达，并鉴定MUC1-C在介导ROS抵抗和转移中的关键作用 | 主要基于动物模型和体外实验，临床验证仍需进一步研究 | 探究缺氧诱导肿瘤转移的分子机制 | 乳腺癌细胞、循环肿瘤细胞(CTCs)、患者来源异种移植模型 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学、基因敲除、药物抑制 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 963 | 2025-10-06 |
Introducing synthetic thermostable RNase inhibitors to single-cell RNA-seq
2024-09-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52717-4
PMID:39333520
|
研究论文 | 本研究在单细胞RNA测序中引入合成热稳定RNase抑制剂，证明其性能优于传统蛋白质类RNase抑制剂 | 首次将合成热稳定RNase抑制剂应用于单细胞RNA测序，可在热循环过程中保持RNase抑制活性 | 未明确说明样本规模和具体实验条件的局限性 | 改进单细胞RNA测序中的RNase抑制方法 | RNase抑制剂在单细胞RNA测序中的应用 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 964 | 2025-10-06 |
The chemokine receptor CXCR3 promotes CD8+ T cell-dependent lung pathology during influenza pathogenesis
2024-01-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1120
PMID:38170765
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了CXCR3在促进CD8+ T细胞依赖性流感肺部病理中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出调控CD8+ T细胞毒性反应的独特调控因子，并证明CXCR3阻断可减轻流感相关肺损伤而不影响病毒清除 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索CD8+ T细胞在流感控制与肺部病理中的双重作用及其特定亚群功能 | 流感感染小鼠肺组织中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 流感感染小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 965 | 2025-10-06 |
OrthologAL: A Shiny application for quality-aware humanization of non-human pre-clinical high-dimensional gene expression data
2024-Nov-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.25.625000
PMID:39651293
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研究论文 | 开发了一个名为OrthologAL的Shiny应用程序，用于将非临床前高维基因表达数据质量感知地转换为人类同源基因数据 | 利用BioMart数据库访问Ensembl中的不同基因集，无需用户编写代码即可实现非人类转录组向人类同源基因的转换 | NA | 促进药理学转录组学数据库在临床前研究模型中的应用，并促进非人类转录组的人类同源基因转换 | 单细胞、单核和空间转录组数据，包括髓母细胞瘤患者来源原位异种移植模型以及小鼠和大鼠脊髓损伤模型 | 生物信息学 | 髓母细胞瘤, 脊髓损伤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 966 | 2025-10-06 |
Chromosome-contiguous genome for the Haecon-5 strain of Haemonchus contortus reveals marked genetic variability and enables the discovery of essential gene candidates
2024-11, International journal for parasitology
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.ijpara.2024.08.003
PMID:39168434
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研究论文 | 本研究报道了澳大利亚Haemonchus contortus寄生虫Haecon-5菌株的高质量染色体水平基因组，并利用机器学习方法预测了潜在的关键基因 | 首次提供了Haecon-5菌株的染色体连续基因组，揭示了与英国ISE菌株的显著遗传差异，并采用跨物种机器学习方法预测了必需基因 | 研究主要基于计算预测，候选基因的功能验证需要后续实验研究 | 构建高质量基因组资源以支持捻转血矛线虫的基础研究和药物靶点发现 | Haemonchus contortus寄生虫Haecon-5菌株 | 基因组学 | 寄生虫感染 | 基因组测序, 转录组分析, 单细胞RNA-seq, 机器学习 | 机器学习 | 基因组序列, 转录组数据, 表观遗传数据 | 一个特定菌株(Haecon-5)的完整基因组分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组测序 | NA | NA |
| 967 | 2025-10-06 |
Matrisomics: Beyond the extracellular matrix for unveiling tumor microenvironment
2024-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2024.189178
PMID:39241895
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综述 | 本文系统回顾了肿瘤微环境中基质组的研究进展，涵盖多组学方法和新技术应用 | 首次整合多组学水平（表观基因组学、基因组学、转录组学、蛋白质组学）和新兴测序技术研究肿瘤基质组 | 肿瘤基质组的具体机制和临床应用尚未完全阐明 | 探索肿瘤微环境中基质组的表达模式和功能作用 | 肿瘤组织中的基质组蛋白及其相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 968 | 2025-10-06 |
Hematopoietic cells emerging from hemogenic endothelium exhibit lineage-specific oxidative stress responses
2024-11, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107815
PMID:39326495
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人类胚胎造血过程中不同血细胞谱系对缺氧和氧化应激的特异性反应 | 首次在单细胞水平描述不同造血谱系对缺氧的转录反应，发现红细胞对氧化应激的特殊敏感性及代谢途径差异 | 研究主要基于体外模型，体内验证仍需进一步研究 | 探究缺氧对人类内皮-造血转变及后续造血过程的影响 | 人造血内皮细胞衍生的不同血细胞谱系 | 单细胞生物学 | 血液发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 969 | 2025-10-06 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
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研究论文 | 本研究通过构建结核分枝杆菌单克隆抗体库并筛选具有限制细菌能力的抗体，揭示了抗体Fab和Fc区域在结核病免疫防御中的协同作用机制 | 首次系统性地通过Fc区域交换技术优化保护性抗体，并利用单细胞转录组学揭示了抗体介导的结核分枝杆菌限制依赖于中性粒细胞的早期激活 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；抗体作用机制仍需进一步深入探索 | 探究抗体介导的结核分枝杆菌限制机制 | 结核分枝杆菌单克隆抗体及其Fc变异体 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学，Fc区域交换技术，单克隆抗体筛选 | NA | 转录组数据，免疫学数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 970 | 2025-10-06 |
The frequency of CD38+ alveolar macrophages correlates with early control of M. tuberculosis in the murine lung
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52846-w
PMID:39358361
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CD38+肺泡巨噬细胞在控制结核分枝杆菌感染中的关键作用 | 首次发现CD38+肺泡巨噬细胞亚群在结核感染控制中的动态作用及其表观遗传预激活特征 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究肺泡巨噬细胞亚群在结核病控制中的作用机制 | 小鼠肺泡巨噬细胞亚群 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 971 | 2025-10-06 |
The estrogen response in fibroblasts promotes ovarian metastases of gastric cancer
2024-09-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52615-9
PMID:39349474
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了雌激素通过激活ER-MDK-LRP1信号轴促进胃癌卵巢转移的分子机制 | 首次在单细胞水平发现卵巢转移灶中成纤维细胞高表达雌激素受体和中期因子，并阐明雌激素-MDK-LRP1信号轴在胃癌卵巢转移中的关键作用 | 样本量相对有限（18例患者），需要更大规模研究验证 | 探究胃癌卵巢转移的分子机制，特别是雌激素在其中的作用 | 18例伴有卵巢转移的胃癌患者的45个肿瘤样本 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例患者的45个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 972 | 2025-10-06 |
CD38+ Alveolar macrophages mediate early control of M. tuberculosis proliferation in the lung
2024-Jul-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3934768/v1
PMID:39070650
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研究论文 | 通过多模态单细胞RNA测序分析揭示了CD38+肺泡巨噬细胞在结核分枝杆菌感染早期控制细菌增殖的关键作用 | 首次发现CD38+单核细胞来源的肺泡巨噬细胞和组织驻留肺泡巨噬细胞在结核感染过程中作为细菌生长的重要控制器，并揭示其表观遗传预激活特征 | 研究聚焦于特定感染时间点的巨噬细胞亚群分析，尚未完全阐明所有巨噬细胞亚型在结核控制中的具体机制 | 探究不同巨噬细胞亚群在结核分枝杆菌感染过程中的功能作用和动态变化 | 肺泡巨噬细胞亚群，包括CD38+单核细胞来源的肺泡巨噬细胞和组织驻留肺泡巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序，scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 973 | 2025-10-06 |
An inducible genetic tool to track and manipulate specific microglial states reveals their plasticity and roles in remyelination
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.005
PMID:38821054
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研究论文 | 开发了一种可诱导的遗传工具Clec7a-CreER，用于追踪和操纵特定小胶质细胞状态，揭示其可塑性及在髓鞘再生中的作用 | 创建了首个特异性靶向PAMs和DAMs小胶质细胞状态的可诱导Cre驱动工具，首次直接证明了小胶质细胞状态的可塑性及其在疾病恢复中的功能 | 未明确说明样本规模和技术重复次数，疾病模型范围有限 | 研究小胶质细胞状态的可塑性及其在神经系统发育和疾病中的功能 | 大脑实质中的增殖区域相关小胶质细胞(PAMs)和疾病相关小胶质细胞(DAMs) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，遗传谱系追踪，细胞特异性消融 | 遗传工程小鼠模型 | 基因表达数据，细胞追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 974 | 2025-10-06 |
Loss of function of male-specific lethal 3 (Msl3) does not affect spermatogenesis in rodents
2024-05, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.669
PMID:37847071
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研究论文 | 本研究探讨了Msl3基因在啮齿类动物精子发生中的作用 | 首次在哺乳动物中使用条件性基因敲除模型研究Msl3在减数分裂中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不适用于其他哺乳动物 | 探究Msl3基因在哺乳动物减数分裂进入中的作用 | 小鼠精子发生过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 975 | 2025-10-06 |
An individualized stemness-related signature to predict prognosis and immunotherapy responses for gastric cancer using single-cell and bulk tissue transcriptomes
2024-01, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6908
PMID:38168907
|
研究论文 | 开发基于胃癌干性特征的个体化签名用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次构建基于样本内基因相对表达排序的个体化干性特征签名，克服批次效应限制 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性临床验证 | 开发个体化胃癌预后和免疫治疗反应预测模型 | 胃癌患者样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 基于基因对相对表达排序的签名模型 | 基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 976 | 2025-10-06 |
A protocol for time-resolved transcriptomics through metabolic labeling and combinatorial indexing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103356
PMID:39356643
|
研究论文 | 提出一种通过代谢标记和组合索引进行时间分辨转录组学分析的优化实验方案 | 开发了自动化友好的代谢标记与单细胞RNA测序组合索引协议，能够捕获基因表达的时间动态信息 | NA | 解决单细胞转录组学在时间动态研究中的局限性 | RNA代谢标记和单细胞转录组分析 | 单细胞转录组学 | NA | 4-硫尿苷(4sU)代谢标记，组合索引单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 977 | 2025-10-06 |
Protocol for mapping T cell activation using single-cell RNA-seq
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103409
PMID:39427308
|
研究论文 | 本文提供了一个基于抗CD3/CD28磁珠刺激和单细胞RNA测序的T细胞激活研究方案 | 开发了结合抗CD3/CD28磁珠刺激与单细胞RNA测序的标准化T细胞激活研究流程 | NA | 建立研究T细胞激活的标准化实验方案 | 人类外周血单个核细胞和CD4 T细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 978 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating specific C. elegans neuron types for bulk and single-cell RNA sequencing
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103439
PMID:39514392
|
研究论文 | 本文介绍了一种分离特定秀丽隐杆线虫神经元类型用于基因表达分析的实验方案 | 开发了针对秀丽隐杆线虫特定神经元类型的分离方案，适用于批量RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 建立神经元特异性分离和基因表达分析的技术方案 | 秀丽隐杆线虫的特定神经元类型 | 单细胞测序技术 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 979 | 2025-10-06 |
A protocol for acquiring high-quality single-cell multi-omics data from human peripheral blood
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103430
PMID:39488839
|
研究论文 | 本文提出了一种从人外周血获取高质量单细胞多组学数据的实验方案 | 开发了改进的单细胞多组学样本处理方法，整合了单细胞测序、全基因组测序以及代谢组和蛋白质组分析 | NA | 建立获取高质量单细胞多组学数据的标准化实验流程 | 人外周血单个核细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞测序, 全基因组测序, 代谢组分析, 蛋白质组分析 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 980 | 2025-10-06 |
Protocol for Xenium spatial transcriptomics studies using fixed frozen mouse brain sections
2024-12-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103420
PMID:39535916
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研究论文 | 本文介绍了使用固定冷冻小鼠脑切片进行Xenium空间转录组学研究的实验方案 | 证明了除10x Genomics验证的FFPE和新鲜冷冻切片外，固定冷冻薄脑切片也与Xenium平台兼容，并提供优异的成像和定量结果 | NA | 开发适用于Xenium平台的空间转录组学实验方案 | 小鼠脑组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium分析仪 |