单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2025-10-06 |
Distinct immune microenvironment of venous tumor thrombus in hepatocellular carcinoma at single-cell resolution
2024-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001182
PMID:39656099
|
研究论文 | 通过单细胞分辨率技术揭示肝细胞癌中静脉肿瘤血栓的独特免疫微环境特征 | 首次在单细胞水平系统揭示PVTT中C5aR+TAMs的免疫抑制功能及其临床意义 | 样本量有限，机制研究主要基于细胞系实验 | 探索肝细胞癌中门静脉肿瘤血栓的免疫微环境特征 | 肝细胞癌患者的门静脉肿瘤血栓、原发肿瘤和血液样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 飞行时间质谱流式技术, 单细胞RNA测序, 多重荧光免疫组化染色 | NA | 单细胞数据, 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | NA |
| 942 | 2025-10-06 |
Transcription Factor Activity Regulating Macrophage Heterogeneity during Skin Wound Healing
2024-Aug-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2400172
PMID:38940624
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，揭示了转录因子在皮肤伤口愈合过程中调控巨噬细胞异质性的机制 | 改进了贝叶斯推断TF活性模型，首次结合scRNA-seq和scATAC-seq数据推断伤口愈合过程中Mos/Mϕs的转录因子活性，并验证了NR4A1在炎症调控中的关键作用 | 转录因子活性与mRNA或蛋白表达并不总是相关，可能存在其他调控机制未被充分探索 | 研究皮肤伤口愈合过程中单核细胞/巨噬细胞异质性的转录因子调控机制 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的单核细胞和巨噬细胞 | 单细胞多组学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 基因敲除 | 贝叶斯推断模型, 网络分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | Nr4a1基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 943 | 2025-10-06 |
Neutrophil Heterogeneity Is Modified during Acute Lung Inflammation in Apoa1-/- Mice
2024-Aug-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300459
PMID:38912868
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析载脂蛋白A-I缺失对急性肺部炎症中中性粒细胞异质性的影响 | 首次揭示Apoa1缺失通过改变中性粒细胞和巨噬细胞亚群分布及促炎基因表达来调控急性气道炎症 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探讨载脂蛋白A-I调节急性气道炎症的分子机制 | Apoa1-/-和Apoa1+/+小鼠的支气管肺泡灌洗液细胞 | 单细胞转录组学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析，轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | Apoa1-/-和Apoa1+/+小鼠经LPS+屋尘螨诱导的炎症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 944 | 2025-10-06 |
Single-Cell Profiling Reveals Immune Aberrations in Progressive Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Aug-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0979OC
PMID:38717443
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示特发性肺纤维化患者外周免疫系统的异常变化 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘IPF患者外周免疫细胞图谱，发现经典单核细胞和调节性T细胞的预后预测价值 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证发现 | 构建特发性肺纤维化患者外周免疫系统的单细胞图谱 | 特发性肺纤维化患者和对照受试者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，蛋白质浓度测量 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据，蛋白质浓度数据 | 38个PBMC样本（25名IPF患者，13名对照受试者），共149,564个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 5'单细胞RNA测序 |
| 945 | 2025-10-06 |
Scalable genetic screening for regulatory circuits using compressed Perturb-seq
2024-Aug, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01964-9
PMID:37872410
|
研究论文 | 本研究开发了一种压缩Perturb-seq方法，通过算法优化显著降低了单细胞CRISPR筛选技术的成本 | 将压缩感知算法应用于Perturb-seq技术设计，实现了在单个细胞或液滴中测量多个随机扰动 | NA | 开发可扩展的基因调控回路筛选方法 | 598个与细菌脂多糖免疫反应相关的基因 | 功能基因组学 | 免疫疾病 | 单细胞RNA测序，CRISPR筛选 | 压缩感知算法 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Perturb-seq（CRISPR扰动与单细胞RNA测序结合技术） |
| 946 | 2025-10-06 |
Identification of a clinically efficacious CAR T cell subset in diffuse large B cell lymphoma by dynamic multidimensional single-cell profiling
2024-Jul, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00768-3
PMID:38750245
|
研究论文 | 通过动态多维单细胞分析鉴定弥漫性大B细胞淋巴瘤中具有临床疗效的CAR T细胞亚群 | 整合时间推移成像显微镜、亚细胞分析和单细胞RNA测序技术，首次鉴定出具有多重功能的CD8-fit T细胞亚群 | 研究样本仅限于大B细胞淋巴瘤患者，需要进一步验证在其他恶性肿瘤中的适用性 | 鉴定CAR T细胞治疗中具有优越临床活性的T细胞亚群 | 大B细胞淋巴瘤患者的CAR T细胞输注产品 | 单细胞分析 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 时间推移成像显微镜, 亚细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 显微镜图像数据 | 大B细胞淋巴瘤患者的CAR T细胞输注产品 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 947 | 2025-10-06 |
Enhancing radiotherapy response via intratumoral injection of a TLR9 agonist in autochthonous murine sarcomas
2024-Jun-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.178767
PMID:39133651
|
研究论文 | 本研究探讨了TLR9激动剂CpG联合放疗在自体小鼠肉瘤模型中的免疫增强机制 | 首次在自体发生的高肿瘤突变负荷肉瘤模型中证实CpG联合放疗通过CD8+T细胞依赖性机制增强抗肿瘤免疫应答 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明TLR9激动剂增强放疗疗效的免疫机制 | 自体发生的小鼠软组织肉瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 软组织肉瘤 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, TCR克隆性分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 自体发生小鼠肉瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 948 | 2025-10-06 |
Cross-modality mapping using image varifolds to align tissue-scale atlases to molecular-scale measures with application to 2D brain sections
2024-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47883-4
PMID:38664422
|
研究论文 | 开发了一种使用图像变差形式将组织尺度图谱与分子尺度测量对齐的跨模态映射方法 | 提出将空间转录组数据表示为编码位置和高维特征（基因、细胞类型）身份的广义函数，通过LDDMM同时求解坐标的最小化测地线微分同胚和潜在特征密度 | NA | 建立分子尺度转录组学与组织尺度图谱之间的对应关系 | 小鼠脑图谱、基因和细胞转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | LDDMM | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | MERFISH, BARseq | NA |
| 949 | 2025-10-06 |
CD36 restricts lipid-associated macrophages accumulation in white adipose tissues during atherogenesis
2024, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2024.1436865
PMID:39156133
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了CD36在动脉粥样硬化过程中调控白色脂肪组织中脂质相关巨噬细胞积累的新机制 | 首次在动脉粥样硬化模型中定义了白色脂肪组织中'不健康巨噬细胞'亚群，并发现CD36缺失通过促进LAM积累来平衡脂质代谢与炎症 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证；单细胞测序样本量有限 | 探究CD36在动脉粥样硬化过程中对白色脂肪组织巨噬细胞异质性和功能的调控作用 | 饮食诱导的动脉粥样硬化小鼠模型及其白色脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 细胞代谢分析, 功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 动脉粥样硬化小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 950 | 2025-10-06 |
Microglia regulate GABAergic neurogenesis in prenatal human brain through IGF1
2024-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.19.619180
PMID:39464051
|
研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞通过分泌IGF1调控人类胚胎期大脑中GABA能神经元的生成 | 首次发现小胶质细胞通过IGF1信号通路调控人类胚胎期GABA能神经前体细胞的持续增殖 | 研究主要基于体外类器官模型，需进一步验证在体情况 | 探索人类大脑中GABA能神经元扩展发育的机制 | 人类胚胎期大脑内侧神经节隆起(hMGE)的GABA能神经元前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序, 生物信息学分析, 组织学分析 | 神经免疫hMGE类器官模型 | 单细胞RNA测序数据, 组织学图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 951 | 2025-10-06 |
IMPLICATIONS OF YWHAH GENE EXPRESSION IN THE EARLY DETECTION OF SEPSIS
2024-09-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002409
PMID:38904460
|
研究论文 | 本研究探讨YWHAH基因表达在脓毒症早期检测中的潜在价值 | 首次发现YWHAH基因表达在感染与脓毒症患者之间存在差异 | NA | 探索YWHAH基因表达与脓毒症发展的关联性 | 感染患者和脓毒症患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞转录组测序,实时聚合酶链反应,加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 952 | 2025-10-06 |
Single-cell, single-nucleus, and spatial transcriptomics characterization of the immunological landscape in the healthy and PSC human liver
2024-05, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.12.023
PMID:38199298
|
研究论文 | 本研究通过单细胞、单核和空间转录组学技术，全面表征了健康人和原发性硬化性胆管炎患者肝脏的免疫景观 | 首次结合单细胞RNA测序、单核RNA测序和空间转录组学技术，系统构建了PSC肝脏的细胞图谱，并发现胆管细胞样肝细胞群体和髓系细胞耗竭样表型 | 样本量相对有限，主要关注晚期PSC病变，缺乏早期疾病阶段的分析 | 构建原发性硬化性胆管炎肝脏的全面细胞图谱，揭示疾病发病机制 | 人类肝脏组织（10例PSC患者、24例神经性死亡供体肝脏、3例PBC患者） | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 空间定位数据, 蛋白质功能数据 | 47,156个细胞和23,000个细胞核（PSC），107,542个细胞（健康对照），18,240个细胞和20,202个细胞核（PBC） | 10x Genomics, Nanostring | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium, Nanostring GeoMx DSP | 10x Visium空间转录组技术, Nanostring GeoMx数字空间分析技术 |
| 953 | 2025-10-06 |
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-05, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.010
PMID:38360439
|
综述 | 本文总结了非小细胞肺癌中肿瘤相关中性粒细胞的异质性研究，并提出超越传统N1/N2二分法的新分类框架 | 通过整合不同癌症实体的转录组数据，建立了具有明确表型特征的中性粒细胞亚群分类体系，突破了传统的二元分类模式 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证，分类体系需要进一步实验确认 | 探索中性粒细胞在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的异质性及其治疗应用潜力 | 肿瘤相关中性粒细胞(TANs) | 单细胞生物学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 954 | 2025-10-06 |
Respiratory viral infection promotes the awakening and outgrowth of dormant metastatic breast cancer cells in lungs
2024-Apr-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4210090/v1
PMID:38645169
|
研究论文 | 本研究揭示呼吸道病毒感染通过IL-6依赖机制唤醒肺内休眠乳腺癌细胞并促进转移灶形成 | 首次证实呼吸道病毒可通过改变肿瘤微环境唤醒休眠癌细胞，并发现CD4 T细胞在维持转移负荷中的新作用 | 主要基于小鼠模型，人类观察数据仅为相关性证据 | 探究呼吸道病毒感染对休眠乳腺癌细胞激活和转移的影响机制 | 小鼠模型中的休眠乳腺癌细胞和人类癌症幸存者 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床观察数据 | 小鼠实验模型及人类癌症幸存者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 955 | 2025-10-06 |
AMPK signaling inhibits the differentiation of myofibroblasts: impact on age-related tissue fibrosis and degeneration
2024-02, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-023-10072-9
PMID:37917219
|
研究论文 | 本文探讨AMPK信号通路通过抑制肌成纤维细胞分化对年龄相关组织纤维化和退化的影响 | 揭示了AMPK信号通路作为肌成纤维细胞分化的有效抑制剂，并阐明其通过抑制TGF-β、NF-κB、STAT3和YAP/TAZ等信号通路发挥作用 | NA | 研究AMPK信号通路在年龄相关组织纤维化和退化中的作用机制 | 组织成纤维细胞、肌成纤维细胞及间充质细胞和髓系细胞 | 细胞生物学 | 年龄相关疾病 | 单细胞转录组研究 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 956 | 2025-10-06 |
BIOINFORMATICS APPLICATIONS UNDER CONDITION CONTROL: HIGH DIAGNOSTIC VALUE OF DDX47 IN REAL MEDICAL SETTINGS
2024-01-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002199
PMID:37553903
|
研究论文 | 本研究提出基于真实医疗场景的条件控制方法，发现DDX47基因在脓毒症诊断中具有重要价值 | 开发了基于真实医疗场景的条件控制方法，通过逐步放宽限制识别独特的差异基因 | 研究仅包含三个数据集，样本量有限，且缺乏标准诊断金标准 | 探索基因表达谱在脓毒症诊断中的应用价值 | 脓毒症和脓毒性休克患者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基因表达谱分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 三个数据集，包括GEO数据库数据和华西医院2020-2021年ICU患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 957 | 2025-10-06 |
SINGLE-CELL TRANSCRIPTOME ANALYSIS IN HEALTH AND DISEASE
2024-01-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002274
PMID:37962963
|
综述 | 本文概述了单细胞转录组分析在健康和疾病研究中的应用现状 | 全面总结了单细胞转录组分析的技术优势、平台多样性和计算分析方法的发展 | 未涉及具体实验数据或案例研究，仅为方法论概述 | 探讨单细胞转录组分析在揭示健康和疾病状态下组织细胞多样性与复杂性的应用 | 各类生物组织中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 958 | 2025-10-06 |
Proximity sequencing for the detection of mRNA, extracellular proteins and extracellular protein complexes in single cells
2024-12, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01030-x
PMID:39147984
|
研究论文 | 介绍一种能够同时检测单细胞中mRNA、细胞外蛋白和细胞外蛋白复合物的邻近测序方法 | 首次实现单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和数百种位于细胞外膜的蛋白复合物 | 需要基本的分子生物学和单细胞测序专业知识，实验过程需要数天时间完成 | 开发能够同时检测单细胞中多种生物分子的测序方法 | 单细胞中的mRNA、细胞外蛋白和细胞外蛋白复合物 | 单细胞测序 | NA | 邻近测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 959 | 2025-10-06 |
FIND-seq: high-throughput nucleic acid cytometry for rare single-cell transcriptomics
2024-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01021-y
PMID:39039320
|
研究论文 | 介绍FIND-seq高通量核酸流式技术及其在稀有单细胞转录组分析中的应用 | 开发了基于核酸序列检测的细胞分选平台，可基于RNA或DNA标记分离稀有细胞并进行转录组分析 | 需要微流体学、光学和分子生物学专业知识 | 建立稀有细胞分离和测序的技术平台 | 稀有细胞亚群，包括HIV感染细胞、具有特定DNA突变或转录特征的细胞 | 单细胞测序技术 | HIV感染 | 核酸流式技术，单细胞转录组测序 | NA | RNA，DNA，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，核酸检测 | FIND-seq | 基于微流体的核酸检测和测序平台，支持稀有细胞分离和全转录组测序 |
| 960 | 2025-10-06 |
The single-cell transcriptomic landscape of the topological differences in mammalian auditory receptors
2024-11, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2672-1
PMID:39083201
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示哺乳动物听觉受体拓扑差异的转录组景观 | 首次在单细胞水平系统揭示毛细胞拓扑分子梯度，发现Ptn、Rxra和Nfe2l2等新型音位分布相关基因，并预测调控这些梯度的转录因子 | NA | 探索哺乳动物耳蜗毛细胞音位分布图的分子组织机制 | 哺乳动物内毛细胞和外毛细胞 | 单细胞转录组学 | 听觉系统疾病 | 单细胞RNA测序 | SCENIC算法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |