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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2025-10-06 |
ST-GEARS: Advancing 3D downstream research through accurate spatial information recovery
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51935-0
PMID:39242563
|
研究论文 | 提出ST-GEARS系统通过精确空间信息恢复推进3D空间转录组学研究 | 引入分布式约束优化方案和数学证明的双截面场应用，实现跨截面锚点的超精确连接和原始空间谱系恢复 | 未明确说明系统在不同组织类型或复杂变形场景下的适用性限制 | 解决3D空间转录组学中空间信息丢失和实验变形导致的下游分析不可靠问题 | 三维空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 优化模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 3D空间转录组学 | NA | NA |
| 922 | 2025-10-06 |
Intracellular spatial transcriptomic analysis toolkit (InSTAnT)
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49457-w
PMID:39242579
|
研究论文 | 开发了一种用于细胞内空间转录组数据分析的计算工具包InSTAnT | 首个专门用于单分子分辨率空间转录组数据分析的工具包，能够检测基因对和模块在细胞内及细胞间的共定位模式 | NA | 开发计算工具以解锁空间转录组数据在发现亚细胞生物模式方面的潜力 | 五个不同数据集，代表两种细胞系、两个脑结构、两个物种和三种不同技术 | 空间转录组学 | NA | 多重误差稳健荧光原位杂交(MERFISH)，空间转录组学 | 统计检验和算法 | 空间转录组数据 | 五个数据集 | NA | 空间转录组学，单分子分辨率成像 | NA | NA |
| 923 | 2025-10-06 |
Cellular origin and clonal evolution of human dedifferentiated liposarcoma
2024-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52067-1
PMID:39266532
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术揭示了人去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化机制 | 首次鉴定出肿瘤脂肪干细胞作为DDLPS的细胞起源，并证明其具有多能性特征 | 研究样本仅来自原发肿瘤，未涉及转移性病灶 | 探究去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化过程 | 人原发去分化脂肪肉瘤的成对分化良好和去分化组分 | 数字病理学 | 脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序, DNA测序, 原位多重免疫荧光, 功能分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 图像数据 | 原发DDLPS肿瘤的成对WD和DD组分 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 924 | 2025-10-06 |
Maf expression in B cells restricts reactive plasmablast and germinal center B cell expansion
2024-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52224-6
PMID:39266537
|
研究论文 | 本研究揭示了Maf在B细胞中作为晚期B细胞分化、浆母细胞增殖和生发中心B细胞形成的负调控因子 | 首次证明Maf在B细胞中通过调控细胞代谢、转运活性和线粒体蛋白来限制浆母细胞和生发中心B细胞的扩张 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类B细胞中验证 | 探究Maf在B细胞分化和免疫应答中的调控作用 | B细胞特异性Maf缺失小鼠的B细胞亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Maf缺陷小鼠和野生型对照小鼠的脾脏B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 925 | 2025-10-06 |
3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification
2024-06-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.028
PMID:38593801
|
研究论文 | 本研究通过分析小鼠耳蜗单细胞RNA测序数据，重建了耳蜗三维结构并揭示了形态发生素在耳蜗顶-基轴特异性形成中的机制 | 首次从单细胞RNA测序数据重建小鼠耳蜗三维结构，发现视黄酸和hedgehog通路形成相反的顶-基轴梯度并共同调控耳蜗纵向轴特化 | 研究仅基于E12.5和E14.5两个时间点的数据，未覆盖耳蜗发育全过程 | 探索小鼠耳蜗顶-基轴特异性基因表达的分子调控机制 | 小鼠耳蜗发育过程中的细胞 | 单细胞转录组学 | 听觉系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | E12.5和E14.5两个发育时间点的小鼠耳蜗细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 926 | 2025-10-06 |
Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7506
PMID:38578993
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研究论文 | 通过形态学引导的空间转录组学和单细胞测序构建人类卵巢细胞图谱 | 结合空间转录组学和单细胞测序技术，首次系统揭示卵巢细胞的空间分布特征和功能特性 | 样本量有限（仅5名供体），仅包含绝经前女性 | 解析卵巢细胞的空间组织和功能特征 | 人类卵巢组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 5名供体（2名用于空间转录组学，3名用于单细胞测序），257个区域，21,198个细胞 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 927 | 2025-10-06 |
col1a2+ fibroblasts/muscle progenitors finetune xanthophore countershading by differentially expressing csf1a/1b in embryonic zebrafish
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9637
PMID:38578990
|
研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼胚胎中成纤维细胞和肌肉祖细胞通过差异表达csf1a/1b调控黄色素细胞反荫蔽色素模式的机制 | 首次发现col1a2+成纤维细胞和肌肉祖细胞通过空间差异表达csf1a和csf1b来精细调控黄色素细胞的反荫蔽色素模式 | NA | 探究斑马鱼胚胎中反荫蔽色素模式形成的调控机制 | 斑马鱼胚胎的黄色素细胞和col1a2+细胞群体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因突变,细胞消融,异位表达 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 928 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics identifies candidate stromal drivers of benign prostatic hyperplasia
2024-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176479
PMID:37971878
|
研究论文 | 通过空间转录组学识别良性前列腺增生中潜在的基质驱动因子 | 首次结合激光显微切割与空间转录组学技术定位BPH基质中的关键分泌因子，验证了IGF1和CXCL13在基质-上皮相互作用中的功能 | 研究仅部分支持历史假说，未完全阐明所有驱动BPH的分子机制 | 探究良性前列腺增生的基质驱动机制 | 良性前列腺增生患者的前列腺组织及体外培养的BPH-1细胞球体和患者来源类器官 | 空间转录组学 | 前列腺增生 | 激光显微切割，空间转录组学，RNA原位杂交，3D细胞培养 | NA | 空间转录组数据，RNA表达数据，组织图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 929 | 2025-10-06 |
Integrin β1-rich extracellular vesicles of kidney recruit Fn1+ macrophages to aggravate ischemia-reperfusion-induced inflammation
2024-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169885
PMID:38258908
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示肾脏缺血再灌注损伤中近端肾小管细胞通过整合素β1丰富的细胞外囊泡招募Fn1+巨噬细胞加剧炎症反应的分子机制 | 首次系统分析IRI微环境中EV携带蛋白介导的细胞间通讯，发现整合素β1富集的EV在招募Fn1+巨噬细胞和放大炎症反应中的关键作用 | 缺乏对EV分泌阻断剂GW4869作用机制的深入探讨，研究主要聚焦早期IRI阶段的细胞通讯 | 阐明肾脏缺血再灌注损伤中近端肾小管细胞与单核吞噬细胞间的细胞通讯机制 | 小鼠肾脏组织、近端肾小管细胞、单核吞噬细胞（特别是Fn1+巨噬细胞） | 分子生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 蛋白质谱分析, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 930 | 2025-10-06 |
Multiomics characterization of breast angiosarcoma from an Asian cohort reveals enrichment for angiogenesis signaling pathway and tumor-infiltrating macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1515935
PMID:39872529
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法对亚洲人群乳腺血管肉瘤进行分子特征分析，揭示了血管生成信号通路和肿瘤浸润巨噬细胞的富集 | 首次在亚洲人群中系统描述乳腺血管肉瘤的分子特征，并通过空间转录组学揭示肿瘤微环境中免疫细胞分布 | 样本量较小（16例乳腺血管肉瘤），且为单中心研究 | 阐明亚洲人群乳腺血管肉瘤的临床特征和分子机制 | 176例血管肉瘤患者，其中16例乳腺血管肉瘤和104例头颈部血管肉瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序, 基因表达谱分析, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 基因表达数据, 空间转录组数据 | 176例血管肉瘤患者（16例乳腺血管肉瘤，104例头颈部血管肉瘤） | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学, 基因表达谱分析 | 10x Visium, NanoString nCounter | 10x Visium空间转录组技术，NanoString基因表达分析系统 |
| 931 | 2025-10-06 |
Spatial diversity of in vivo tissue immunity
2024-12-26, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxae051
PMID:39177484
|
综述 | 本文探讨了免疫系统在活体组织中的空间多样性及其功能意义 | 通过前沿空间分析技术揭示免疫细胞与非免疫细胞在特定营养和氧气环境中形成功能性免疫生态位 | NA | 理解组织内免疫细胞的空间分布规律及其与微环境的相互作用机制 | 肝脏、肾脏、肠道和肺等器官中的免疫细胞及组织微环境 | 空间转录组学 | 炎症性疾病 | 活体成像、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、活体成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 932 | 2025-10-06 |
Endothelial response to blood-brain barrier disruption in the human brain
2024-Dec-26, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187328
PMID:39724015
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和透射电子显微镜分析，揭示了人类脑内皮细胞对超声介导血脑屏障破坏的急性反应机制 | 首次在人类临床试验中直接观察脑内皮细胞对血脑屏障破坏的转录组和超微结构响应 | 样本量有限，仅针对复发性胶质母细胞瘤患者进行研究 | 探究人类脑内皮细胞对血脑屏障破坏的分子和结构响应机制 | 复发性胶质母细胞瘤患者的脑内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | I期临床试验患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 933 | 2025-10-06 |
Detecting Rhythmic Gene Expression in Single-cell Transcriptomics
2024-12, Journal of biological rhythms
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/07487304241273182
PMID:39377613
|
研究论文 | 评估常用节律检测方法在单细胞RNA测序数据中的可靠性，并提出适用于单细胞数据的昼夜节律基因检测策略 | 首次系统评估昼夜节律检测方法在单细胞转录组数据中的应用效果，并提出结合子采样和谐波回归的新策略 | 未明确说明使用的具体数据集规模和验证方法 | 开发适用于单细胞RNA测序数据的昼夜节律基因检测方法 | 单细胞转录组数据中的节律性基因表达 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 谐波回归 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 934 | 2025-10-06 |
Polybacterial Intracellular Macromolecules Shape Single-Cell Epikine Profiles in Upper Airway Mucosa
2024-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617279
PMID:39416216
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了上呼吸道黏膜上皮细胞中多菌种胞内大分子(PIMs)的存在及其对细胞因子表达和药物反应的影响 | 首次在单细胞水平发现多菌种胞内大分子(PIMs)持续存在于黏膜上皮细胞中，并线性驱动效应细胞因子表达 | 研究主要关注口腔黏膜，结果在其他黏膜部位的普适性需要进一步验证 | 探究宿主-微生物相互作用在黏膜上皮细胞类型中的机制 | 人类口腔黏膜上皮细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 慢性炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 人类口腔黏膜单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 935 | 2025-10-06 |
Immune profiling-based targeting of pathogenic T cells with ustekinumab in ANCA-associated glomerulonephritis
2024-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52525-w
PMID:39300109
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组分析识别ANCA相关性肾小球肾炎中的致病性T细胞，并验证ustekinumab靶向治疗的潜力 | 首次通过空间和单细胞转录组分析揭示ANCA-GN中致病性T细胞的分子特征，并应用数字药理学方法识别ustekinumab作为潜在治疗药物 | 样本量较小（34例分析样本，4例治疗病例），随访时间较短（26周），需要更大规模的临床试验验证 | 开发针对ANCA相关性肾小球肾炎的精准免疫治疗方法 | ANCA相关性血管炎患者的肾脏组织和外周血样本 | 数字病理学 | ANCA相关性血管炎/肾小球肾炎 | 空间转录组分析,单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据,临床数据 | 34例ANCA-GN患者肾脏样本，4例复发患者接受治疗 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 936 | 2025-10-06 |
Detecting anomalous anatomic regions in spatial transcriptomics with STANDS
2024-09-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52445-9
PMID:39300113
|
研究论文 | 提出基于生成对抗网络的STANDS框架，用于从多样本空间转录组数据中检测和对齐异常组织区域 | 首个能够从多样本空间转录组数据中进行从头异常组织区域检测与解析的方法，整合了多模态学习、迁移学习和风格迁移技术 | 需要正常空间转录组数据集进行对比分析，但这些数据集通常稀缺 | 开发空间转录组数据分析方法，检测和解析异常组织区域 | 多样本空间转录组数据中的异常组织区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | GAN | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 937 | 2025-10-06 |
PRDM3/16 regulate chromatin accessibility required for NKX2-1 mediated alveolar epithelial differentiation and function
2024-09-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52154-3
PMID:39284798
|
研究论文 | 本研究揭示了PRDM3和PRDM16通过调控染色质可及性介导NKX2-1依赖的肺泡上皮细胞分化机制 | 首次发现PRDM3/PRDM16组蛋白甲基转移酶通过调控染色质可及性影响NKX2-1转录靶点，从而介导肺泡上皮细胞分化 | 研究主要关注围产期肺泡上皮细胞分化，对其他发育阶段的影响尚未明确 | 探究PRDM3和PRDM16在肺泡上皮细胞分化和功能中的调控机制 | 小鼠肺内胚层细胞和AT2肺泡上皮细胞 | 表观遗传学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CUT&RUN | 基因敲除小鼠模型 | 基因组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq | NA | NA |
| 938 | 2025-10-06 |
Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2024-Jun-26, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4559348/v1
PMID:38978578
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序监督细胞类型识别的目标导向参考构建方法 | 首次提出针对目标数据集选择和构建参考数据的方法，缓解参考数据与目标数据之间数据分布和细胞类型组成的差异 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中监督细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 模拟数据和真实数据分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 939 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Uncovers Striking Cellular Heterogeneity of Lung-Infiltrating Regulatory T Cells during Eosinophilic versus Neutrophilic Allergic Airway Inflammation
2024-Jun-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300646
PMID:38647384
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了嗜酸性粒细胞与中性粒细胞过敏性气道炎症中肺部浸润调节性T细胞的显著异质性 | 首次发现不同类型过敏性气道炎症会塑造表型不同的肺部常驻调节性T细胞，揭示了炎症信号通过组织适应机制塑造浸润Treg组成的新机制 | Treg特异性ST2缺陷不影响嗜酸性过敏性炎症的发展或肺部常驻Treg的生成，具体调控机制仍需进一步研究 | 探究不同类型过敏性气道炎症对肺部浸润调节性T细胞异质性和组织驻留特性的影响 | 小鼠肺部浸润的Foxp3+调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 过敏性气道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 嗜酸性和中性粒细胞过敏性气道炎症模型中的肺部浸润Treg细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 940 | 2025-10-06 |
Identification of epigenetic silencing of the SFRP2 gene in colorectal cancer as a clinical biomarker and molecular significance
2024-05-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05329-x
PMID:38802858
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中SFRP2基因表现遗传沉默作为临床生物标志物的潜力 | 首次在大型生物样本队列中系统评估SFRP2甲基化水平，并发现其在血液中可作为癌症分期、淋巴结侵袭和复发的预测指标 | 样本量相对有限（健康参与者110例，CRC患者85例），需要更大规模研究验证 | 研究SFRP2基因甲基化在结直肠癌中的诊断价值和临床意义 | 结直肠癌患者和健康参与者的血液、脂肪和结肠组织样本 | 分子生物学 | 结直肠癌 | qPCR, 450K DNA阵列, DNA焦磷酸测序, scRNA-Seq | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 单细胞RNA测序数据 | 健康参与者110例（男48/女62），CRC患者85例（男61/女24） | Illumina | DNA甲基化阵列, 单细胞RNA测序 | 450K DNA阵列 | Illumina 450K DNA甲基化阵列 |