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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2026-05-20 |
TRPV4-Expressing Tissue-Resident Macrophages Regulate the Function of Collecting Lymphatic Vessels via Thromboxane A2 Receptors in Lymphatic Muscle Cells
2024-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.21.595189
PMID:38826322
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研究论文 | 该论文揭示了TRPV4通道在集合淋巴管功能调节中的作用,特别是通过表达TRPV4的组织驻留巨噬细胞产生血栓素A2(TXA2)来影响淋巴管平滑肌细胞的收缩功能 | 首次发现TRPV4通道在淋巴管系统中的作用,并确定其通过组织驻留巨噬细胞释放TXA2,激活淋巴管平滑肌细胞上的TXA2受体,导致淋巴管收缩功能障碍 | 未提及具体局限性 | 研究TRPV4通道在集合淋巴管中的表达及其对淋巴管收缩功能的调节机制 | 小鼠、大鼠和非人灵长类动物的收集淋巴管及其中表达的巨噬细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 淋巴水肿、脂肪水肿 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、压力肌电图 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠、大鼠和非人灵长类动物中解剖的完整集合淋巴管样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于生成受控且空间确定的scRNAseq数据 |
| 922 | 2026-05-20 |
Notch ligands are biomarkers of anti-TNF response in RA patients
2024-05, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09897-2
PMID:37796367
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研究论文 | 研究Notch配体在类风湿关节炎滑膜组织细胞中的表达及其对抗TNF治疗反应的影响 | 揭示JAG1、DLL4等Notch配体在RA髓系细胞中作为抗TNF治疗反应标志物的潜力,并通过单细胞RNA-seq分析不同细胞亚群的表达变化 | 未明确Notch配体作为抗TNF反应标志物的具体机制,且样本量和临床验证细节不足 | 探究Notch通路在RA滑膜组织细胞中的功能意义及其对抗RA治疗反应的影响 | RA患者滑膜组织细胞,包括巨噬细胞、成纤维样滑膜细胞和内皮细胞 | 自然语言处理 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | RA患者样本,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 923 | 2026-05-20 |
Identifying the NEAT1/miR-26b-5p/S100A2 axis as a regulator in Parkinson's disease based on the ferroptosis-related genes
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0316179
PMID:39739972
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研究论文 | 基于铁死亡相关基因识别帕金森病中的NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴作为调节因子 | 首次通过整合铁死亡相关基因与竞争性内源RNA网络,鉴定出NEAT1/miR-26b-5p/S100A2轴在帕金森病发病机制中的调控作用 | 未提及具体局限性,但结果需进一步在更大样本和临床环境中验证 | 识别铁死亡相关基因并构建竞争性内源RNA网络,以评估帕金森病的发病机制 | 帕金森病患者和对照组的97个黑质样本 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法(包括随机森林、支持向量机等) | 基因表达数据 | 97个黑质样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 924 | 2026-05-20 |
Characterization of NOD-like receptor-based molecular heterogeneity in glioma and its association with immune micro-environment and metabolism reprogramming
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1498583
PMID:39882240
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研究论文 | 揭示NOD样受体信号通路在高级胶质瘤中的分子异质性及其与免疫微环境和代谢重编程的关联 | 首次基于NLR基因表达谱将胶质母细胞瘤患者精确分为两种临床亚型,并开发了基于TRIP6基因的新型预后分子标志物 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性验证队列;单细胞分析样本量有限 | 探索NLR信号通路在胶质母细胞瘤临床异质性中的作用,并识别其关键调控基因 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | NMF聚类算法,LASSO回归,COX回归,随机森林算法,单细胞测序 | NMF, LASSO, COX, 随机森林 | 转录组数据,单细胞测序数据 | 496例胶质母细胞瘤患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 925 | 2026-05-20 |
Utilization of donor CLL-1 CAR-T cells for the treatment of relapsed of acute myeloid leukemia following allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491341
PMID:39896798
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research paper | 评估供体来源的CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的安全性和有效性 | 首次研究供体来源的CLL-1 CAR-T细胞在异基因HSCT后复发AML患者中的应用,并通过单细胞RNA测序揭示CAR-T细胞动态变化 | 样本量较小(12名患者),且2名患者因疾病快速进展退出研究 | 评估供体来源的CLL-1 CAR-T细胞治疗异基因造血干细胞移植后复发急性髓系白血病的疗效和安全性 | 14名异基因HSCT后复发的AML患者,其中12名接受CLL-1 CAR-T细胞治疗 | machine learning | 急性髓系白血病 | CAR-T细胞治疗,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 12名AML患者,1个患者样本用于单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于患者4的CAR-T细胞输注产品和扩增峰值期PBMCs的单细胞RNA测序 |
| 926 | 2026-05-20 |
Characterizing tumor biology and immune microenvironment in high-grade serous ovarian cancer via single-cell RNA sequencing: insights for targeted and personalized immunotherapy strategies
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1500153
PMID:39896800
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序表征高级别浆液性卵巢癌的肿瘤生物学和免疫微环境,为靶向和个性化免疫治疗策略提供见解 | 首次通过单细胞RNA测序系统解析高级别浆液性卵巢癌中C2 IGF2+肿瘤亚型及其与成纤维细胞通过MK信号通路的复杂互作,并基于该亚型构建预后模型结合免疫浸润和药物敏感性分析 | 未明确提及,可能包括样本量有限、功能验证范围及临床转化中的潜在挑战 | 利用单细胞RNA测序阐明高级别浆液性卵巢癌的分子机制、免疫景观和药物敏感性,以识别新治疗靶点并改善患者预后 | 高级别浆液性卵巢癌的肿瘤细胞亚型及其微环境 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的公共数据集,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 927 | 2026-05-19 |
Sex-specific effects of injury and beta-adrenergic activation on metabolic and inflammatory mediators in a murine model of post-traumatic osteoarthritis
2024-09, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.03.109
PMID:38527663
|
研究论文 | 研究损伤和β-肾上腺素能激活对小鼠创伤后骨关节炎代谢和炎症介质的性别特异性影响 | 首次揭示β-肾上腺素受体激动剂异丙肾上腺素在雌性而非雄性小鼠中抑制创伤后骨关节炎相关炎症,表明交感神经信号通路治疗存在性别差异 | 研究仅观察急性效应,未评估长期治疗结果;仅使用单一βAR激动剂,未测试其他激动剂或拮抗剂 | 探究关节内β-肾上腺素受体刺激对创伤后骨关节炎相关炎症的抑制作用及其性别差异 | 12周龄雄性和雌性小鼠的膝部损伤模型,特别是髌下脂肪垫和滑膜组织 | NA | 创伤后骨关节炎 | 多重基因表达分析、滑液代谢组学、单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据、代谢组学数据、组织学图像 | 12周龄雄性和雌性小鼠,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 分析已发表的单细胞RNA测序数据,未指定具体平台 |
| 928 | 2026-05-19 |
METI: deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morphology and spatial transcriptomics
2024-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51708-9
PMID:39181865
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研究论文 | METI通过整合细胞形态与空间转录组学,深度描绘肿瘤生态系统 | 提出了形态学增强空间转录组分析整合器(METI),弥补了现有工具未充分考虑组织学特征且依赖单细胞RNA测序数据的不足 | 文中未提及具体限制 | 开发一种整合细胞形态与空间转录组学的分析框架,以更深入地理解肿瘤微环境中的分子景观和细胞相互作用 | 多种肿瘤组织,包括胃癌、肺癌、膀胱癌及癌前病变组织 | 计算机视觉, 机器学习 | 肺癌, 胃癌, 膀胱癌 | 空间转录组学 | NA | 图像, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 929 | 2026-05-19 |
A brief history of somatostatin interneuron taxonomy or: how many somatostatin subtypes are there, really?
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1436915
PMID:39091993
|
评论 | 综述了生长抑素中间神经元分类的历史,重点讨论了基于单细胞RNA-seq的现代分类方法及其对实验神经科学的影响 | 提出将生长抑素中间神经元划分为约十个“超型”作为最实用的分类层级,批评基于细微基因表达差异的精细分类缺乏表型差异,对实验研究帮助有限 | 作者承认该综述具有主观偏见,未涵盖所有相关研究,且对基因表达差异的生物学意义评估可能不全面 | 探讨生长抑素中间神经元分类的演变历史,并建议适用于实验神经科学的实用分类策略 | 生长抑素中间神经元(somatostatin interneurons) | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA(综述文章,未涉及具体样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 930 | 2026-05-19 |
Histamine H4 receptor and TRPV1 mediate itch induced by cadaverine, a metabolite of the microbiome
2024 Jan-Dec, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069241272149
PMID:39079948
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研究论文 | 研究发现微生物代谢物尸胺通过组胺H4受体和TRPV1通路介导瘙痒反应 | 首次揭示尸胺作为一种新型内源性瘙痒原,通过结合H4R并激活TRPV1信号通路诱导瘙痒 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证,且未完全阐明肠道微生物产生尸胺与瘙痒之间的直接体内联系 | 探究尸胺是否调节疼痛或瘙痒及其分子机制 | 小鼠及DRG神经元 | 机器学习 | 瘙痒相关疾病 | 分子对接模拟、scRNA-Seq、钙成像、膜片钳 | NA | 序列数据、成像数据 | 实验小鼠及DRG神经元样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 931 | 2026-05-19 |
Nature and nurture in fruit fly hearing
2024, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2024.1503438
PMID:39568979
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综述 | 综述了果蝇听觉感知中先天性因素和学习性因素的研究进展 | 将单细胞转录组和脑连接组学数据与传统分子遗传学结合,研究果蝇听觉感知中的“先天与后天”交互作用 | 未提供 | 概述果蝇鸣声偏好的本质及其神经机制 | 果蝇 | 机器学习 | 未提供 | 单细胞转录组 | 未提供 | 转录组数据 | 未提供 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 932 | 2026-05-18 |
Accurate long-read transcript discovery and quantification at single-cell, pseudo-bulk and bulk resolution with Isosceles
2024-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51584-3
PMID:39183289
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研究论文 | 介绍Isosceles计算工具包,用于从纳米孔长读长测序数据中准确检测和定量mRNA异构体,涵盖单细胞、伪批量及批量分辨率 | Isosceles在异构体检测敏感性和定量准确性上优于现有方法,能提高单细胞转录组在异构体水平的定量保真度,并揭示神经元分化谱系内和谱系间的协调剪接 | 依赖纳米孔长读长测序技术,可能受制于该技术的噪声和误差 | 开发一种计算工具,提升从纳米孔长读长测序数据中检测和定量mRNA异构体的准确性,支持单细胞、伪批量及批量分辨率 | 纳米孔长读长测序数据中的mRNA异构体 | 自然语言处理, 计算机视觉 | NA | 纳米孔测序 | Isosceles | 测序数据 | 合成数据集和生物学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 933 | 2026-05-18 |
FASN-mediated fatty acid biosynthesis remodels immune environment in Clonorchis sinensis infection-related intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-08, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.03.016
PMID:38508240
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研究论文 | 通过多组学方法揭示华支睾吸虫感染相关肝内胆管癌中FASN介导的脂肪酸合成重塑免疫环境 | 首次综合运用单细胞RNA测序、全外显子组测序、RNA测序、代谢组学及空间转录组学分析华支睾吸虫相关肝内胆管癌的代谢重塑和免疫微环境,发现FASN抑制剂联合免疫治疗可逆转免疫抑制微环境 | 未明确指出具体局限性 | 研究华支睾吸虫感染相关肝内胆管癌的临床影响及潜在分子特征 | 251例肝内胆管癌患者(来自三个医学中心)及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, RNA测序, 代谢组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 基因组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 251例肝内胆管癌患者样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全外显子组测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学,Illumina NovaSeq用于全外显子组测序及RNA测序 |
| 934 | 2026-05-18 |
Salivary Gland Tissue Recombination Can Modify Cell Fate
2024-07, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241247484
PMID:38715201
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和成像分析,研究胚胎小鼠唾液腺组织重组对细胞命运决定的影响 | 首次全面、无偏倚地分子表征组织重组方法,揭示间充质和上皮双向诱导及细胞可塑性在细胞命运决定中的作用 | 未在摘要中明确提及 | 阐明组织相互作用在细胞分化中的作用,特别是间充质对上皮细胞命运特化的调控 | 胚胎小鼠腮腺和颌下腺的间充质与上皮组织重组体 | 生物信息学、单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种类型胚胎小鼠唾液腺(腮腺和颌下腺)的组织重组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 935 | 2026-05-18 |
Metabolic Landscape of Osteosarcoma: Reprogramming of Lactic Acid Metabolism and Metabolic Communication
2024-02-22, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902083
PMID:38420794
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研究论文 | 解码骨肉瘤中乳酸代谢重编程及其在肿瘤微环境中的作用,并鉴定NDUFAF6为预后生物标志物 | 首次通过单细胞基因表达数据揭示骨肉瘤中乳酸代谢高亚群,并发现其与其他亚群之间的独特代谢通讯模式 | 未提及具体局限性 | 探索骨肉瘤微环境中乳酸代谢的重编程及相关分子机制 | 骨肉瘤细胞的乳酸代谢模式和细胞间信号改变 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 936 | 2026-05-18 |
The Role of CD8A in the Immune Microenvironment of Breast Cancer
2024-02-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902073
PMID:38420798
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研究论文 | 本研究探讨了CD8A在三阴性乳腺癌免疫微环境中的作用,发现其在转移灶中下调与良好预后相关 | 首次利用单细胞RNA测序揭示CD8A在原发性和转移性乳腺癌病灶免疫微环境中的细胞特异性表达变化 | 未说明 | 寻找三阴性乳腺癌的新治疗靶点 | 乳腺癌患者样本及公共数据库数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE102818、GSE118389和GSE202695三个公共数据集及临床三阴性乳腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 937 | 2026-05-18 |
Immune Response Associated Gene Signatures in Aortic Dissection Compared to Aortic Aneurysm
2024-02-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902064
PMID:38420822
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research paper | 通过分析主动脉夹层与主动脉瘤患者的基因表达数据,识别与免疫反应相关的差异表达基因,并验证其作为潜在生物标志物的可能性 | 首次在主动脉夹层中识别出37个显著失调基因,其中24个此前未被报道与TAD相关;发现5个核心免疫相关基因(CCL2、RNASE2、HAVCR2、CXCL8、IL6R)在TAD中具有特异性表达 | 样本量较小(TAD n=4,TAA n=3),且未提供关于患者人口统计学特征和潜在混杂因素的详细信息 | 探究主动脉夹层与主动脉瘤在免疫反应相关基因表达上的差异,并寻找TAD特异性生物标志物 | 主动脉平滑肌细胞、TAD和TAA患者组织样本 | 机器学习和基因表达分析 | 主动脉夹层、主动脉瘤 | 微阵列技术、批量RNA测序、单细胞RNA测序、定量实时聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据 | TAD患者主动脉平滑肌细胞(n=4)、TAA患者(n=3)、对照组(n=3);公开批量RNA-seq研究(TAD n=23,对照 n=17);单细胞RNA-seq研究(TAA n=8,对照 n=3) | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 938 | 2026-05-18 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identified Core Genes and Transcription Factors in Mesenchymal Cell Differentiation during Liver Cirrhosis
2024-02-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902062
PMID:38420807
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝纤维化至肝硬化过程中间充质细胞分化的核心基因与转录因子 | 首次利用单细胞RNA测序构建肝脏间充质细胞从健康到肝硬化的进化轨迹,并结合批量RNA测序数据验证核心基因在肝星状细胞激活与逆转中的作用 | 小鼠模型与人类相比,细胞亚群逆转比例和进化轨迹存在差异,可能无法准确反映人类疾病进展 | 探究肝纤维化至肝硬化过程中间充质细胞的动态分化机制及潜在治疗靶点 | 人类肝硬化与健康肝脏组织样本、小鼠纤维化与健康肝脏组织中的间充质细胞(肝星状细胞、成纤维细胞、肌成纤维细胞、血管平滑肌细胞) | 自然语言处理 | 肝硬化,肝纤维化 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3例肝硬化和3例健康人类肝脏组织样本、2只纤维化和2只健康小鼠肝脏样本,超过50,000个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 939 | 2026-05-18 |
Discovery of optimal cell type classification marker genes from single cell RNA sequencing data
2024, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-024-00015-2
PMID:40893796
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研究论文 | 介绍NS-Forest v4.0算法,用于从单细胞RNA测序数据中发现最优细胞类型分类标记基因 | 引入On-Target Fraction指标量化标记基因的特异性,通过模块化决策树提升标记基因选择的效率和准确性 | 未明确说明局限性,但模拟研究和真实数据验证仍可能受限于数据集大小和细胞类型复杂性 | 开发可扩展的数据驱动方法,识别最小组合的必需且足够标记基因,以最大分类精度捕获细胞类型身份 | 人类器官(脑、肾、肺)的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 无特定疾病 | 单细胞RNA测序 | 随机森林 | 单细胞基因表达数据 | 包含数百万个人类细胞的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 940 | 2026-05-17 |
The proteomic landscape and temporal dynamics of mammalian gastruloid development
2024-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.609098
PMID:39282277
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研究论文 | 通过定量蛋白质组学分析人类和小鼠原肠胚模型在四个关键分化阶段的蛋白质景观与动态变化,揭示早期哺乳动物发育中翻译与翻译后调控的物种特异性特征 | 首次系统描绘哺乳动物原肠胚发育的蛋白质组学景观,整合蛋白质组、磷酸化组与转录组数据揭示翻译与翻译后调控的物种差异,并鉴定先天性疾病的保守蛋白网络 | 未明确说明局限性 | 利用定量蛋白质组学技术解析哺乳动物原肠胚发育过程中的蛋白质动态变化与调控机制 | 人类和小鼠的原肠胚模型(包括naïve ESC、primed ESC、早期原肠胚、晚期原肠胚) | 蛋白质组学 | 先天性遗传病 | 定量蛋白质组学、RNA-seq、磷酸化位点分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、磷酸化数据 | 未明确说明 | NA | NA | NA | NA |