单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2025-10-06 |
Vaccines combining slow delivery and follicle targeting of antigens increase germinal center B cell clonal diversity and clonal expansion
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.19.608655
PMID:39229011
|
研究论文 | 本研究分析了结合磷酸丝氨酸标记抗原与铝佐剂及皂苷纳米颗粒佐剂的联合佐剂策略对生发中心B细胞反应的影响 | 首次证明两种作用机制互补的佐剂（缓释抗原递送和改变淋巴结摄取的佐剂）可协同增强生发中心B细胞克隆多样性和克隆扩增 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 探索联合佐剂策略增强体液免疫应答的机制 | 小鼠模型中的生发中心B细胞和HIV Env三聚体抗原 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | 单细胞测序数据, 抗原分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 902 | 2025-10-06 |
Enhanced microglial dynamics and a paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contribute to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2024-08-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02775-1
PMID:39102080
|
研究论文 | 本研究探讨无症状阿尔茨海默病患者大脑中淀粉样斑块微环境特征及其对认知韧性的保护机制 | 发现无症状AD患者斑块微环境中存在增强的小胶质细胞动态活动和减少的tau蛋白播种活性 | 基于死后脑组织研究，无法观察动态过程；样本量有限 | 揭示阿尔茨海默病病理条件下认知韧性的神经保护机制 | 无症状阿尔茨海默病患者和典型AD患者的死后脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 脑组织样本，转录组数据 | 一组无症状AD受试者队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 903 | 2025-10-06 |
Dominant dystrophic epidermolysis bullosa is associated with glycolytically active GATA3+ T helper 2 cells which may contribute to pruritus in lesional skin
2024-07-16, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae110
PMID:38477474
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示显性营养不良性大疱性表皮松解症瘙痒与糖酵解活性GATA3+ Th2细胞的关联 | 首次在DDEB病变皮肤中发现糖酵解活性增强的GATA3+ Th2细胞亚群，为理解疾病瘙痒机制提供新视角 | 样本量较小（6例患者），且仅针对瘙痒亚型患者进行研究 | 鉴定DDEB皮肤转录组特征以寻找减轻瘙痒的治疗靶点 | 显性营养不良性大疱性表皮松解症患者皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | 转录组数据 | 6例DDEB患者（瘙痒亚型）和4例健康个体，共13个皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 904 | 2025-10-06 |
Somatic mutations associate with clonal expansion of CD8+ T cells
2024-06-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj0787
PMID:38848368
|
研究论文 | 本研究通过分析90名血液和免疫疾病患者的CD4和CD8 T细胞，揭示了体细胞突变与CD8+T细胞克隆扩增的关联 | 首次在非恶性T细胞中系统研究体细胞突变谱，发现CD8+T细胞突变负荷更高且非同义突变具有非随机性特征 | 样本仅来自血液和免疫疾病患者，未包含健康对照组 | 探究体细胞突变在T细胞中的分布特征及其与克隆扩增的关系 | 90名血液和免疫疾病患者的CD4和CD8 T细胞 | 免疫基因组学 | 血液和免疫疾病 | T细胞受体测序, 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据, 单细胞测序数据 | 90名患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 905 | 2025-10-06 |
Gene regulatory landscape of cerebral cortex folding
2024-06-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn1640
PMID:38838158
|
研究论文 | 本研究揭示了大脑皮层折叠的基因调控机制，通过表征雪貂大脑发育过程中的基因表达和表观遗传动态 | 首次揭示了H3K27ac表观遗传景观在定义大脑皮层折叠模式中的关键作用，并证明通过操纵转录因子表达可改变皮层折叠模式 | 研究仅限于雪貂模型，未在其他哺乳动物中进行验证 | 探索大脑皮层折叠模式的基因调控机制 | 雪貂大脑皮层发育过程中的基因表达和表观遗传变化 | 发育神经生物学 | 神经系统发育障碍 | 单细胞RNA测序，H3K27ac染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据，表观遗传数据 | 雪貂胚胎发育不同阶段的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 906 | 2025-10-06 |
Gene representation bias in spatial transcriptomics
2024-06, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720024500070
PMID:39036848
|
研究论文 | 本研究通过比较Visium空间转录组和bulk RNA-seq数据，识别在Visium中频繁低检测的基因并探索其潜在机制 | 首次系统性地发现空间转录组数据中存在基因表示偏倚，并揭示poly(T)基序可能通过形成发夹结构影响mRNA捕获效率 | 样本量相对有限（28个人类样本和19个小鼠样本），需要更多实验验证poly(T)基序形成发夹结构的假设 | 识别空间转录组数据中频繁低检测的基因并探究其潜在分子机制 | 人类和小鼠组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序，bulk RNA-seq，基序分析 | NA | 基因-点计数矩阵，序列数据 | 28个人类样本和19个小鼠样本，涵盖多种组织来源 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组技术 |
| 907 | 2025-10-06 |
NDMNN: A novel deep residual network based MNN method to remove batch effects from scRNA-seq data
2024-06, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S021972002450015X
PMID:39036845
|
研究论文 | 提出一种基于深度残差网络的NDMNN方法，用于消除单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 将密集深度残差网络(NDnetwork)与MNN方法相结合，设计出新的批次效应校正方法 | NA | 开发更有效的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度残差网络 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 908 | 2025-10-06 |
Rejuvenation of peripheral immune cells attenuates Alzheimer's disease-like pathologies and behavioral deficits in a mouse model
2024-05-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl1123
PMID:38809977
|
研究论文 | 本研究通过年轻骨髓移植 rejuvenate 老年小鼠免疫系统，探索其对阿尔茨海默病病理和行为缺陷的改善作用 | 首次证明通过年轻骨髓移植 rejuvenate 外周免疫细胞可改善阿尔茨海默病样病理和行为缺陷 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索免疫 rejuvenation 作为阿尔茨海默病治疗策略的潜力 | 老年小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，年轻骨髓移植 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，行为数据，病理数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 909 | 2025-10-06 |
Distinct Inflammatory Programs Underlie the Intramuscular Lipid Nanoparticle Response
2024-12-03, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c08490
PMID:39563529
|
研究论文 | 本研究通过分析肌肉注射脂质纳米颗粒(LNP)后的免疫反应，揭示了两种不同的炎症基因表达程序 | 首次发现不同化学组成的LNP会诱导截然不同的炎症反应程序，并证明mRNA与LNP协同作用提供有效疫苗接种所需的先天免疫刺激 | 研究仅针对9种LNP进行评估，可能未涵盖所有可能的LNP类型 | 评估mRNA/LNP技术的免疫原性机制 | 脂质纳米颗粒(LNP)及其在肌肉组织中的免疫反应 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9种不同化学组成的LNP | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 910 | 2025-10-06 |
Unraveling the spatial organization and development of human thymocytes through integration of spatial transcriptomics and single-cell multi-omics profiling
2024-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51767-y
PMID:39237503
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据解析人类胸腺细胞的空间组织和发育过程 | 开发了TSO-his工具整合多模态数据，首次在单细胞分辨率重建胸腺空间结构，发现CD8αα与记忆B细胞和单核细胞的新共定位关系 | NA | 解析人类胸腺的空间组织和T细胞发育机制 | 人类胸腺细胞 | 空间生物学 | 免疫系统疾病 | 空间转录组学,单细胞多组学测序,VDJ测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞多组学数据,VDJ序列数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞多组学,VDJ测序 | NA | NA |
| 911 | 2025-10-06 |
Symbiotic symphony: Understanding host-microbiota dialogues in a spatial context
2024 Sep-Oct, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2024.03.001
PMID:38564842
|
综述 | 探讨在空间背景下研究宿主与微生物群对话的重要性及方法 | 强调空间转录组学技术在解析宿主-微生物相互作用中的创新应用，突破传统分离研究的局限 | 早期生命微生物研究中生物量有限，需在低生物量框架下进行分析 | 全面理解宿主与微生物群在空间背景下的相互作用机制 | 人类宿主与相关微生物群 | 空间转录组学 | 局部感染和炎症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 912 | 2025-10-06 |
CilioGenics: an integrated method and database for predicting novel ciliary genes
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae554
PMID:38989623
|
研究论文 | 开发了一种名为CilioGenics的整合方法，用于预测新型纤毛基因并建立了相关数据库 | 首次整合单细胞RNA测序、蛋白质相互作用、比较基因组学、转录因子网络分析和文本挖掘等多种方法预测纤毛基因 | 方法中约30%的基因仍为候选基因，需要进一步实验验证 | 预测人类纤毛基因以促进纤毛病诊断 | 人类基因组的全部基因 | 生物信息学 | 纤毛病 | 单细胞RNA测序,蛋白质相互作用分析,比较基因组学,转录因子网络分析,文本挖掘 | 整合预测模型 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质相互作用数据,文献数据 | 全人类基因组基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 913 | 2025-10-06 |
N-MYC impairs innate immune signaling in high-grade serous ovarian carcinoma
2024-05-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj5428
PMID:38748789
|
研究论文 | 本研究揭示N-MYC通过抑制STING和RIG-I样受体信号通路，削弱高级别浆液性卵巢癌的先天免疫应答 | 首次发现N-MYC通过抑制STING寡聚化和MAVS线粒体定位，双重抑制I型干扰素信号通路 | 研究主要基于细胞系和单细胞测序数据，需要更多体内实验验证 | 探究N-MYC在高级别浆液性卵巢癌免疫抑制中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌细胞系和临床样本 | 癌症免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类临床HGSC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 914 | 2025-10-06 |
Toolkit for mapping the clonal landscape of tumor-infiltrating B cells
2024-03, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2024.101864
PMID:38301345
|
综述 | 本文概述了用于绘制肿瘤浸润B细胞克隆景观的工具包，包括现有技术总结及其在B细胞研究中的应用 | 首次系统整合单细胞多组学、B细胞特异性鉴定和B细胞受体深度分析技术，提出综合研究肿瘤微环境中B细胞克隆功能的新范式 | 主要基于现有技术综述，缺乏原始实验数据验证 | 提升对肿瘤微环境中B细胞行为的理解和管理能力 | 肿瘤浸润B细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学、基因组学、蛋白质组学、B细胞受体谱分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 915 | 2025-10-06 |
Diverse contribution of amniogenic somatopleural cells to cardiovascular development: With special reference to thyroid vasculature
2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.532
PMID:36038963
|
研究论文 | 本研究探讨了羊膜生成体壁细胞在心血管发育中的多样化贡献，特别关注甲状腺血管系统的形成 | 首次发现羊膜生成体壁细胞不仅形成羊膜，还迁移入胚胎分化为多种心血管细胞类型，并揭示其在甲状腺血管形成中的特异性作用 | iASCs的详细分化过程和最终分布仍不完全清楚 | 阐明羊膜生成体壁细胞在心血管发育中的作用机制 | 鹌鹑-鸡嵌合体胚胎中的羊膜生成体壁细胞 | 发育生物学 | 心血管发育异常 | 单细胞转录组分析, 嵌合体分析, 外植体培养 | NA | 基因表达数据, 细胞分布数据 | 鹌鹑-鸡嵌合体胚胎样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 916 | 2025-10-06 |
Circulating KLRG1+ long-lived effector memory T cells retain the flexibility to become tissue resident
2024-06-28, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adj8356
PMID:38941479
|
研究论文 | 本研究揭示KLRG1+长效效应记忆T细胞在继发感染时能进入非淋巴组织并建立组织驻留记忆 | 发现长效效应细胞虽不能分化为其他循环记忆亚群，但仍保留进入组织建立驻留记忆的灵活性 | 研究主要基于小鼠病毒感染模型，人类相关性需进一步验证 | 探究KLRG1+记忆T细胞在继发感染中的分化潜力和组织驻留能力 | 小鼠感染模型中的KLRG1+ CD8 T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 917 | 2025-10-06 |
Glutamatergic neuronal activity regulates angiogenesis and blood-retinal barrier maturation via Norrin/β-catenin signaling
2024-Jun-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.03.011
PMID:38599212
|
研究论文 | 本研究揭示了谷氨酸能神经元活动通过调节内皮细胞Norrin/β-catenin信号通路调控视网膜血管生成和血-视网膜屏障成熟的新机制 | 首次发现谷氨酸能神经元活动通过Norrin/β-catenin信号通路调控视网膜深层血管丛生成和血-视网膜屏障成熟 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类视网膜中验证 | 探究谷氨酸能神经元活动如何调控视网膜血管生成和血-视网膜屏障成熟 | 小鼠视网膜的神经元-血管相互作用 | 神经血管生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序, 体内遗传学研究, 功能验证 | 基因修饰小鼠模型(Vglut1和Gnat1) | 基因表达数据, 功能表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 918 | 2025-10-06 |
Integration of Machine Learning and Experimental Validation to Identify Anoikis-Related Prognostic Signature for Predicting the Breast Cancer Tumor Microenvironment and Treatment Response
2024-Nov-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15111458
PMID:39596658
|
研究论文 | 通过整合机器学习与实验验证，开发了失巢凋亡相关预后特征用于预测乳腺癌肿瘤微环境和治疗反应 | 首次构建了包含5个失巢凋亡相关基因的预后特征，并系统评估其与肿瘤微环境、药物敏感性和免疫治疗的关系 | 需要更大样本量的前瞻性研究进一步验证预后特征的临床适用性 | 探索失巢凋亡相关基因在乳腺癌预后预测和治疗指导中的价值 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | RT-PCR, Western blot, ELISA, 单细胞分析, 空间转录组学 | 多种机器学习方法 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 919 | 2025-10-06 |
Genomic and immune heterogeneity of multiple synchronous lung adenocarcinoma at different developmental stages
2024-09-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52139-2
PMID:39256403
|
研究论文 | 本研究通过多组学技术分析多发性同步肺癌在不同发展阶段的基因组和免疫异质性 | 首次在单细胞分辨率揭示多发性同步肺癌从癌前病变到浸润性腺癌演变过程中的克隆独立性、趋同进化和免疫微环境动态变化 | 样本量较小（8例患者16个肿瘤），需要更大队列验证发现 | 探索多发性同步肺癌不同病理阶段的基因组和免疫异质性 | 8例多发性同步肺癌患者的16个肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序,全外显子组测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,免疫组库数据 | 8例患者的16个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞TCR测序,全外显子组测序 | NA | NA |
| 920 | 2025-10-06 |
Glioblastoma cells increase expression of notch signaling and synaptic genes within infiltrated brain tissue
2024-09-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52167-y
PMID:39251578
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析胶质母细胞瘤恶性细胞在肿瘤核心区和浸润脑组织中的基因表达差异 | 首次揭示浸润脑组织中的恶性细胞表现出神经发育通路和胶质细胞分化相关基因表达增加的空间特征 | 样本量较小(n=11)，且浸润脑组织的特征描述仍不够全面 | 探索胶质母细胞瘤恶性细胞在肿瘤核心区和浸润脑组织中的空间基因表达差异 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织和浸润脑组织中的恶性细胞 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 11例样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |