本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the immune landscape of breast cancer patients with brain metastasis
2024-03, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15243
PMID:38316626
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺癌脑转移患者脑脊液中的免疫细胞,揭示肿瘤免疫微环境特征 | 首次利用脑脊液单细胞测序非侵入性地描绘乳腺癌脑转移的免疫微环境景观 | 样本量有限,脑脊液可能无法完全代表肿瘤组织内的免疫微环境 | 解析乳腺癌脑转移患者的肿瘤免疫微环境特征 | 乳腺癌脑转移患者的脑脊液免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 902 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the links between the metabolic heterogeneity and cell identity in NBM and AML
2024-03, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19233
PMID:38009537
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 903 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment of small cell lung cancer-associated malignant pleural effusion
2024-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15145
PMID:38010064
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示小细胞肺癌相关恶性胸腔积液的肿瘤免疫微环境特征 | 首次在SCLC-MPE中应用单细胞转录组测序分析肿瘤免疫微环境 | 仅基于单一样本分析,样本量有限 | 揭示小细胞肺癌恶性胸腔积液的免疫微环境特征 | 小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8008个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
| 904 | 2025-10-06 |
Neutralization of the autophagy-repressive tissue hormone DBI/ACBP (diazepam binding inhibitor, acyl-CoA binding protein) enhances anticancer immunosurveillance
2024-12, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2024.2411854
PMID:39419485
|
研究论文 | 研究通过中和自噬抑制因子DBI/ACBP来增强抗癌免疫监视 | 首次发现DBI/ACBP可作为自噬检查点,其中和能增强效应T细胞浸润并改善癌症控制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探索DBI/ACBP在癌症免疫监视中的作用机制 | 癌症患者血浆样本和小鼠癌症模型 | 癌症免疫学 | 乳腺癌、非小细胞肺癌、肉瘤 | 单细胞RNA测序、单克隆抗体中和 | NA | 血浆样本、基因表达数据 | 癌症易感综合征患者和普通癌症患者群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 905 | 2025-10-06 |
The G4 resolvase Dhx36 modulates cardiomyocyte differentiation and ventricular conduction system development
2024-10-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52809-1
PMID:39366945
|
研究论文 | 本研究揭示了Dhx36解旋酶通过调控启动子G-四链体结构在心肌细胞分化和心室传导系统发育中的关键作用 | 首次发现Dhx36通过解析启动子G-四链体结构调控关键心脏基因网络,影响心室传导系统发育和心肌细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究Dhx36在心脏传导系统发育和心肌细胞分化中的分子机制 | 胚胎期和新生期小鼠心脏组织 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确样本数量 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 906 | 2025-10-06 |
Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state
2024-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614841
PMID:39386468
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术识别了果蝇侧角亮氨酸激肽神经元中整合睡眠与代谢状态的关键基因 | 首次在单神经元水平揭示饥饿状态下睡眠-代谢相互作用的转录调控机制 | 研究仅聚焦于果蝇特定神经元类型,结果在其他物种中的普适性有待验证 | 探究睡眠与代谢状态相互作用的细胞分子机制 | 果蝇侧角亮氨酸激肽神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, Patch-seq, CEL-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 果蝇LHLK神经元(饱食与24小时饥饿状态对比) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 907 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in pediatric research: Focusing on differentiation trajectories and immune microenvironment of neuroblastoma
2024-Sep, Pediatric discovery..
DOI:10.1002/pdi3.61
PMID:40625458
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在神经母细胞瘤研究中的应用,重点关注分化轨迹和肿瘤免疫微环境 | 系统总结了单细胞测序技术在神经母细胞瘤研究中揭示肿瘤分化轨迹、异质性和免疫微环境的新发现 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在儿科神经母细胞瘤研究中的应用价值 | 神经母细胞瘤 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 908 | 2025-10-06 |
Poor clinical outcomes and immunoevasive contexture in CD161+CD8+ T cells barren human pancreatic cancer
2024-03-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008694
PMID:38531664
|
研究论文 | 本研究探讨了CD161+CD8+ T细胞在胰腺导管腺癌中的预后价值和分子特征 | 首次系统评估CD161+CD8+ T细胞在PDAC中的临床意义,发现其与生存期和治疗反应的相关性,并鉴定其为具有细胞毒性和免疫检查点分子特征的特殊T细胞亚型 | 需要进一步研究验证其在风险分层和治疗策略优化中的作用 | 阐明CD161+CD8+ T细胞在胰腺导管腺癌中的预后价值和分子特征 | 186例经根治性切除的胰腺导管腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、临床数据、分子数据 | 186例PDAC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 909 | 2025-10-06 |
Maximum Likelihood Inference of Time-scaled Cell Lineage Trees with Mixed-type Missing Data
2024-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.05.583638
PMID:38496496
|
研究论文 | 提出一种用于动态谱系追踪数据的最大似然推断方法,能够从CRISPR诱导的突变中准确推断细胞谱系树 | 开发了概率混合型缺失(PMM)模型和LAML算法,专门处理CRISPR谱系追踪数据的三个独特特征:基因组位置的单次编辑、突变率随时间衰减、高比例的可遗传和非可遗传缺失数据 | 在存在可遗传缺失数据的情况下需要采用块坐标上升方法,计算效率可能受限 | 解决动态谱系追踪中的细胞谱系树推断问题 | 细胞谱系树、CRISPR诱导的突变数据 | 计算生物学 | 肺腺癌 | CRISPR基因组编辑、单细胞测序 | 概率混合型缺失(PMM)模型、期望最大化(EM)算法 | 基因突变数据、基因表达数据 | 小鼠肺腺癌模型数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 910 | 2025-10-06 |
Molecular assessment of intratumoral immune cell subsets and potential mechanisms of resistance to odronextamab, a CD20×CD3 bispecific antibody, in patients with relapsed/refractory B-cell non-Hodgkin lymphoma
2024-03-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008338
PMID:38519055
|
研究论文 | 评估肿瘤内免疫细胞亚群特征及odronextamab耐药机制的研究 | 首次系统分析CD20×CD3双特异性抗体odronextamab在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的分子作用机制和耐药性 | 样本量有限,主要基于观察性数据 | 探索odronextamab在复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的生物标志物和耐药机制 | 复发/难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 | 肿瘤免疫学 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 免疫组织化学,流式细胞术,单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | 分子生物学数据,临床数据 | ELM-1研究中的患者队列 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 911 | 2025-10-06 |
Mefloquine enhances the efficacy of anti-PD-1 immunotherapy via IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3-induced ferroptosis in tumors
2024-03-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008554
PMID:38471712
|
研究论文 | 本研究揭示甲氟喹通过IFN-γ-STAT1-IRF1-LPCAT3信号通路诱导铁死亡,增强抗PD-1免疫疗法对黑色素瘤和肺癌的疗效 | 首次发现甲氟喹通过激活IFN-γ-STAT1-IRF1信号通路上调LPCAT3表达诱导铁死亡,并证实LPCAT3表达与抗PD-1免疫疗法疗效正相关 | 研究主要聚焦于黑色素瘤和肺癌,未涉及其他肿瘤类型;机制研究主要在细胞和动物模型中进行 | 探究甲氟喹增强抗PD-1免疫疗法疗效的分子机制 | 黑色素瘤和肺癌细胞系及动物模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤,肺癌 | RNA测序,实时定量PCR,蛋白质印迹,染色质免疫沉淀,流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 | 细胞系实验和动物模型,包含临床患者转录组和单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 912 | 2025-10-06 |
Endocrine islet β-cell subtypes with differential function are derived from biochemically distinct embryonic endocrine islet progenitors that are regulated by maternal nutrients
2024-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946483/v1
PMID:38496675
|
研究论文 | 本研究通过细胞谱系追踪和单细胞分析揭示了胚胎内分泌胰岛前体细胞如何产生功能不同的β细胞亚型 | 首次发现胚胎胰岛前体细胞具有不同的基因表达和DNA甲基化特征,这些特征决定了成年后β细胞的功能差异和稳定性 | 研究主要在小鼠模型中进行,人类样本验证相对有限 | 探索胰岛β细胞异质性形成机制及其与糖尿病发生的关系 | 小鼠胚胎胰岛前体细胞和成年β细胞,以及人类胰岛细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 组合细胞谱系追踪,单细胞RNA测序,DNA甲基化分析 | NA | 单细胞转录组数据,DNA甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 913 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing of facial adipose tissue unveils FKBP5 as a therapeutic target for facial infiltrating lipomatosis
2024-07-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03835-9
PMID:39020442
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示面部浸润性脂肪增多症中FKBP5作为治疗靶点的作用机制 | 首次在单细胞水平解析面部脂肪组织的细胞图谱,发现FIL患者FAP细胞中FKBP5特异性高表达并证实其通过PI3K-AKT通路调控脂肪生成 | 样本量有限,具体PIK3CA变异与FKBP5表达关联的分子机制仍需深入探索 | 探究面部浸润性脂肪增多症的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 面部脂肪组织中的基质血管组分(SVF)和纤维脂肪生成前体细胞(FAPs) | 单细胞生物学 | 面部浸润性脂肪增多症 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | FIL患者和非FIL个体的面部脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 914 | 2025-10-06 |
Decoding cellular plasticity and niche regulation of limbal stem cells during corneal wound healing
2024-07-06, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03816-y
PMID:38971839
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了角膜缘干细胞在角膜伤口愈合过程中的分子特征和细胞命运 | 首次在单细胞水平定义了LSCs的分子特征,发现了转录因子Creb5在损伤反应中的关键作用,并鉴定出Arg1+巨噬细胞通过分泌OSM促进伤口愈合的新机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类组织中验证 | 探索角膜缘干细胞及其微环境细胞在角膜损伤修复中的分子和功能响应机制 | 正常小鼠和角膜上皮缺损模型小鼠的角膜组织 | 单细胞生物学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,基因敲低实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠角膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 915 | 2025-10-06 |
DPSCs regulate epithelial-T cell interactions in oral submucous fibrosis
2024-04-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03720-5
PMID:38650025
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示口腔黏膜下纤维化中上皮细胞与T细胞的相互作用机制,并探索牙髓干细胞治疗潜力 | 发现具有促炎促纤维化功能的独特上皮细胞亚群Epi1.2,揭示MIF-CD74和CXCR4介导的上皮-T细胞相互作用机制,首次系统评估DPSCs治疗OSF的效果 | OSF致病机制尚未完全阐明,DPSCs临床应用效果需进一步验证 | 探索口腔黏膜下纤维化的致病机制并开发新的治疗策略 | 口腔黏膜组织、牙髓干细胞、动物模型 | 单细胞生物学 | 口腔黏膜下纤维化 | 单细胞RNA测序、组织染色、免疫组化、扫描电镜、原子力显微镜 | 动物模型 | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 916 | 2025-10-06 |
An integrated toolkit for human microglia functional genomics
2024-04-10, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03700-9
PMID:38600587
|
研究论文 | 开发用于人类小胶质细胞功能基因组学的集成工具包,包括优化的iPSC分化方案和多组学分析平台 | 建立简化的两步20天分化流程,整合CRISPR-ON/OFF时序控制系统,并提供在线多组学数据比较平台 | 未提及与现有方法的直接比较数据,长期功能稳定性需要进一步验证 | 开发高效的人类小胶质细胞功能基因组学研究工具 | 人类iPSC衍生的小胶质细胞(iMG) | 功能基因组学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, ATAC-Seq, 蛋白质组学, CRISPR-Cas9 | CRISPR-ON/OFF系统 | 转录组, 表观基因组, 蛋白质组, 功能测试数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 多组学分析 | NA | 在线可搜索平台(https://sherlab.shinyapps.io/IPSC-derived-Microglia/) |
| 917 | 2025-10-06 |
Improved therapeutic consistency and efficacy of CD317+ MSCs through stabilizing TSG6 by PTX3
2024-03-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03706-3
PMID:38539221
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CD317+ MSC亚群具有增强的免疫抑制活性,其比例与MSC治疗效果一致性密切相关 | 首次揭示CD317+ MSC亚群通过PTX3稳定TSG6蛋白的机制改善治疗一致性 | 未明确PTX3稳定TSG6的具体分子机制 | 研究MSC异质性和治疗不一致性的原因及解决方案 | 人间充质干细胞(MSCs)及其CD317+亚群 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同批次培养基扩增的MSCs | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 918 | 2025-10-06 |
Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells
2024-03-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03670-y
PMID:38475896
|
研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单细胞RNA测序发现人类表皮干细胞具有较短的细胞周期持续时间 | 挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点,发现表皮干细胞比更分化的祖细胞具有更短的细胞周期 | 研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞,未涉及体内环境验证 | 探究人类表皮干细胞的细胞周期特征和增殖行为 | 人类角质形成细胞,包括干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 活细胞成像,单细胞RNA测序 | NA | 图像数据,基因表达数据 | 原代培养的人类角质形成细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 919 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-Feb-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1
PMID:38463959
|
研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过调节骨髓血管和基质微环境促进造血系统恢复以缓解急性放射综合征的机制 | 首次阐明TPOm通过调控骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞再生的作用机制,并发现其能提升VEGF-C水平和增强间充质干细胞胶原蛋白表达 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究血小板生成素模拟物在急性放射综合征治疗中对骨髓微环境的调节作用 | C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞、血管内皮细胞和间充质基质细胞 | 放射医学 | 急性放射综合征 | 流式细胞术、全组织块共聚焦显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据、生存数据 | 9-14周龄C57BL/6J小鼠,在多个时间点(第4、7、10、14、18、21天)采集骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 920 | 2025-10-06 |
B-cell-directed CAR T-cell therapy activates CD8+ cytotoxic CARneg bystander T cells in patients and nonhuman primates
2024-07-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022717
PMID:38558106
|
研究论文 | 本研究首次全面鉴定并分析了B细胞靶向CAR T细胞治疗后CD8+ CARneg旁观者T细胞的激活机制及其抗白血病作用 | 首次发现CAR T细胞治疗可激活CD8+ CARneg旁观者T细胞,并揭示其通过T细胞受体非依赖性机制杀伤白血病细胞 | 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探究B细胞靶向CAR T细胞治疗中旁观者T细胞的激活机制及其在抗肿瘤反应中的作用 | 非人灵长类动物和患者来源的T细胞 | 免疫治疗 | B细胞恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 非人灵长类模型和临床试验NCT03369353患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |