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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2026-05-24 |
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173337
PMID:38358826
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人神经母细胞瘤转移性骨髓,揭示微环境重塑和转移特征 | 首次通过单细胞水平比较分析有和无转移患者的骨髓微环境,揭示免疫细胞群体重塑、基因表达重编程及预后标志物 | 未提及具体限制 | 阐明神经母细胞瘤骨髓转移的细胞和分子机制,为开发新疗法提供依据 | 神经母细胞瘤患者的转移性骨髓样本 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个患者样本,包括有和无转移的神经母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 882 | 2026-05-24 |
Immunological characterization and comparison of children with COVID-19 from their adult counterparts at single-cell resolution
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1358725
PMID:39148728
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较儿童与成人COVID-19患者的免疫特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较儿童和成人COVID-19患者的免疫细胞差异,揭示儿童更强的NK细胞毒性和较少的炎症反应 | 初步研究,样本量较小(15名儿童和18名成人) | 阐明儿童COVID-19患者免于重症的免疫保护机制 | COVID-19儿童和成人患者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15名儿童(8名患者)和18名成人(13名患者) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 883 | 2026-05-24 |
Altered immune cell in human severe acute pancreatitis revealed by single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1354926
PMID:39372399
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示重症急性胰腺炎患者中免疫细胞的变化 | 首次构建了重症急性胰腺炎患者外周血单核细胞的单细胞转录组图谱,并发现了一种高表达PPBP和PF4的新型单核细胞亚群 | 样本量较小,仅7名未经治疗的重症急性胰腺炎患者,且健康对照数据来自公共数据库 | 了解重症急性胰腺炎中特定免疫细胞亚型的变化及其作用机制,并识别预测急性胰腺炎严重程度的潜在生物标志物 | 重症急性胰腺炎患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 重症急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 7名未治疗的重症急性胰腺炎患者,6名健康对照(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 884 | 2026-05-23 |
Single-cell profiling of the peripheral blood immune landscape during mid- and late-stage pregnancy
2024-12-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析中晚期妊娠外周血免疫细胞图谱 | 首次揭示了HOPX+ CD4+ T细胞、ZNF683+CD8+ T细胞和KLRB1+CD8+ T细胞在妊娠中晚期显著差异,并发现了罕见XIST+ T细胞亚型在妊娠中可能参与免疫相关基因转录翻译调控和胰岛素信号通路 | 样本量较小,仅纳入3例中期和3例晚期妊娠女性,且未涉及早期妊娠对比或妊娠相关疾病研究 | 建立中晚期妊娠女性外周血单个核细胞免疫谱,为研究妊娠相关疾病提供基础 | 中晚期妊娠女性的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例妊娠女性(中期3例,晚期3例) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 885 | 2026-05-23 |
Understanding the heterogeneity of natural killer cells at the maternal-fetal interface: implications for pregnancy health and disease
2024-11-14, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae040
PMID:39570646
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综述 | 综述了母胎界面自然杀伤细胞的异质性及其在妊娠健康与疾病中的意义 | 通过总结基于表面标志物、功能分子、发育阶段的传统分类和单细胞RNA测序聚类方法,全面分析了子宫NK细胞亚群的异质性,并探讨了子宫内膜NK细胞向蜕膜NK细胞分化及不同dNK亚群的分化路径 | 综述中未提及具体实验验证或定量分析,可能存在文献选择性偏倚 | 理解母胎界面自然杀伤细胞的异质性,探讨其在妊娠健康与疾病中的作用 | 子宫自然杀伤细胞亚群,包括基于表面标志物、功能分子、发育阶段的传统分类和单细胞RNA测序聚类方法,以及妊娠相关疾病中NK细胞亚群的变化 | 机器学习和数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 886 | 2026-05-23 |
KLHL21 suppresses gastric tumourigenesis via maintaining STAT3 signalling equilibrium in stomach homoeostasis
2024-10-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331111
PMID:38969490
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研究论文 | KLHL21通过维持STAT3信号平衡抑制胃肿瘤发生,其缺失促进PIK3CB mRNA翻译并激活STAT3,靶向STAT3可逆转癌前化生 | 发现KLHL21缺失通过稳定PABPC1-eIF4G复合物促进PIK3CB mRNA翻译,进而激活STAT3信号,首次揭示KLHL21在胃稳态中调控核糖体翻译的机制 | 未提及研究的具体局限性 | 探究KLHL21在胃黏膜化生向不典型增生转化过程中的分子机制及其对肿瘤发生的影响 | 胃组织标本、Mist1+细胞、KLHL21条件性敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、质谱蛋白质组学、核糖体测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、核糖体测序数据 | 胃癌患者组织样本(具体数量未提及)及小鼠模型样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序、核糖体测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序平台,Illumina NovaSeq进行核糖体测序 |
| 887 | 2026-05-23 |
Multicellular 3D bioprinted human gallbladder carcinoma forin vitromimicry of tumor microenvironment and intratumoral heterogeneity
2024-08-22, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad6d8c
PMID:39121870
|
research paper | 本研究利用三维生物打印技术构建多细胞人胆囊癌模型,模拟肿瘤微环境和肿瘤内异质性 | 首次使用同心圆柱四培养模型重建胆囊癌组织中细胞的空间分布,并通过单细胞RNA测序揭示模型内存在两种不同的胆囊癌细胞亚型,验证了肿瘤内异质性的模拟 | 未提及具体局限性 | 构建高保真多细胞三维胆囊癌模型以模拟肿瘤微环境和肿瘤内异质性 | 人胆囊癌细胞、内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞 | digital pathology | 胆囊癌 | 三维生物打印, 单细胞RNA测序 | 三维共培养模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 888 | 2026-05-23 |
ITGB6 modulates resistance to anti-CD276 therapy in head and neck cancer by promoting PF4+ macrophage infiltration
2024-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51096-0
PMID:39152118
|
研究论文 | 本研究揭示ITGB6通过促进PF4+巨噬细胞浸润调控头颈癌对anti-CD276治疗的抵抗机制 | 首次发现ITGB6通过调控CX3CL1-CX3CR1轴介导PF4+巨噬细胞招募,进而影响anti-CD276治疗效果,并阐明其在anti-PD1治疗抵抗中的逆转作用 | 研究主要基于小鼠模型,结论在人类患者中的验证尚需进一步研究 | 探究头颈鳞癌对anti-CD276治疗产生抵抗的机制及潜在干预靶点 | 头颈鳞状细胞癌小鼠模型 | 机器学习 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序,基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 化学诱导和原位癌小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 889 | 2024-08-07 |
Unraveling the dynamics of myometrial remodeling: insights from single-cell and spatial transcriptomics in term pregnancy
2024-08-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 890 | 2026-05-23 |
Optimization of mouse kidney digestion protocols for single-cell applications
2024-07-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过比较三种小鼠肾脏单细胞消化方案,评估其对细胞异质性的影响,为单细胞研究提供方案选择指导 | 首次系统评估已发表的单细胞悬液制备方案,并比较其在小鼠肾脏细胞产量和异质性方面的差异 | 仅检测了三种方案,且未涉及其他可能影响消化效率的因素(如酶浓度、孵育时间),未进行体内验证 | 优化小鼠肾脏单细胞消化方案,为单细胞技术(如流式细胞术、单细胞RNA测序)提供高质量细胞悬液 | 小鼠肾脏细胞(包括白细胞、血管细胞、肾单位上皮细胞、足细胞、成纤维细胞) | 单细胞生物学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自雄性和雌性C57BL/6小鼠的肾脏样本 | Miltenyi Biotec | 单细胞RNA测序 | Miltenyi Biotec多组织消化试剂盒 | 三种方案:scRNAseq方案、Miltenyi Biotec多组织消化试剂盒、实验室自建方案 |
| 891 | 2026-05-23 |
Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium
2024-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过转录组测序研究高脂饮食对脂肪和肠系膜内皮细胞线粒体基因表达的影响及其在肥胖中表型趋同的机制 | 首次揭示肥胖通过下调PPAR-γ导致脂肪动脉和毛细血管内皮细胞氧化磷酸化基因表达减少,进而使肠系膜与脂肪内皮细胞发生表型趋同 | NA | 探究肥胖如何影响内皮细胞代谢表型,特别是线粒体基因表达 | 小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞,以及人类内脏脂肪组织 | 数字病理学 | 肥胖 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | 测序数据 | 小鼠(正常饮食组和高脂饮食组)及人类内脏脂肪组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | NA |
| 892 | 2026-05-23 |
Collagen induction of immune cells in the mammary glands during pregnancy
2024-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据,评估了妊娠-泌乳周期中乳腺脂肪垫的胶原动力学,发现免疫细胞异位表达胶原并参与细胞间相互作用 | 首次揭示妊娠阶段免疫细胞(包括淋巴系和髓系细胞)能异位产生I型和III型胶原,并显著增强细胞间胶原相互作用,为免疫细胞参与乳腺细胞外基质调控提供新证据 | 仅基于已有scRNA-Seq数据的二次分析,缺乏体内功能验证实验 | 探究妊娠-泌乳周期中乳腺胶原动态变化及免疫细胞在其中的作用 | 妊娠-泌乳周期中的乳腺脂肪垫组织及免疫细胞(淋巴系和髓系细胞) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,基于公开scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 893 | 2026-05-23 |
Exploring myometrial microenvironment changes at the single-cell level from nonpregnant to term pregnant states
2024-01-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建非孕期和足月孕期女性子宫肌层的单细胞转录组图谱,揭示细胞微环境变化 | 首次在单细胞水平上揭示非孕期与足月孕期子宫肌层的微环境变化,特别是平滑肌细胞亚群比例改变和M2巨噬细胞增加 | 未提及具体局限性信息 | 探索人类子宫肌层从非孕期到足月孕期在单细胞水平上的微环境变化 | 非孕期和足月孕期女性的子宫肌层组织 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 12个人类子宫肌层组织样本,87,845个高质量单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间转录组学平台 |
| 894 | 2026-05-23 |
The functional role of L-fucose on dendritic cell function and polarization
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1353570
PMID:38646527
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研究论文 | 揭示L-岩藻糖对树突状细胞功能和极化的促进作用,及其在肿瘤免疫治疗中的潜在应用 | 首次发现膳食糖L-岩藻糖能增强树突状细胞的免疫刺激活性,促进其抗原摄取和加工,并调节T细胞活化 | 尚未明确L-岩藻糖增强DC功能的具体分子机制和信号通路 | 探索L-岩藻糖增强树突状细胞功能以提升抗肿瘤免疫应答的潜力 | 小鼠树突状细胞及黑色素瘤和乳腺癌模型中的瘤内树突状细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 单细胞转录组数据 | 黑色素瘤和乳腺癌荷瘤小鼠模型的样本 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 895 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-01, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16487
PMID:37794835
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析硼缺乏条件下豌豆芽发育及细胞类型特异性响应 | 首次在单细胞水平揭示豌豆茎尖不同细胞类型对硼缺乏的差异化响应机制,并构建茎尖分生组织发育轨迹及其转录因子互作网络 | 本研究仅关注硼缺乏单一胁迫条件,未涉及其他营养胁迫或联合胁迫效应 | 探究营养胁迫(硼缺乏)如何影响植物生长发育的分子机制 | 豌豆(Pisum sativum)茎尖分生组织细胞 | 数字病理学 | 植物营养胁迫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15个细胞簇,来源为硼缺乏条件下生长的豌豆茎尖 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 896 | 2026-05-22 |
The contribution of the sphingosine 1-phosphate signaling pathway to chronic kidney diseases: recent findings and new perspectives
2024-12, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-024-03029-5
PMID:39384640
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综述 | 本文综述了鞘氨醇-1-磷酸信号通路在慢性肾病和肾纤维化中的最新发现和研究前景 | 系统总结了S1P信号在多种特定慢性肾病(如糖尿病肾病、狼疮性肾炎、局灶节段性肾小球硬化症、法布里病和IgA肾病)中的作用,并探讨了S1P作为疾病进展生物标志物的潜力以及空间转录组学等先进技术的应用 | 文章未提及自身局限性,但作为综述,可能受限于现有研究的数量和质量 | 分析S1P信号通路在慢性肾病发病机制和肾纤维化中的最新研究进展,并探讨其作为治疗靶点和生物标志物的潜力 | 慢性肾病,包括糖尿病肾病、狼疮性肾炎、局灶节段性肾小球硬化症、法布里病和IgA肾病 | 机器学习 | 慢性肾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 897 | 2026-05-22 |
Host-pathogen interactions in the Plasmodium-infected mouse liver at spatial and single-cell resolution
2024-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51418-2
PMID:39160174
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研究论文 | 结合空间转录组学与单核RNA测序,解析疟原虫感染小鼠肝脏中的宿主-病原体互作 | 首次在空间和单细胞分辨率下揭示疟疾感染小鼠肝脏中的宿主-病原体互作,发现了感染相关脂质代谢变化、不同肝小叶区域的炎症程序差异以及‘炎症热点’区域 | 研究未提供具体局限性信息 | 探索疟原虫感染过程中宿主反应在复杂肝组织中的协调机制 | 伯氏疟原虫感染的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | 疟疾 | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 基因表达数据(空间转录组和单核RNA测序) | 多时间点的小鼠肝脏组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学,单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组,10x Chromium用于单核RNA测序 |
| 898 | 2026-05-22 |
Deciphering cell-cell communication at single-cell resolution for spatial transcriptomics with subgraph-based graph attention network
2024-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51329-2
PMID:39155292
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研究论文 | 提出DeepTalk方法,利用子图图注意力网络整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,在单细胞分辨率下推断细胞间通讯 | 首次将子图图注意力网络应用于空间转录组学,实现单细胞分辨率的细胞间通讯推断,并能在多平台数据集上表现优异 | 未提及具体局限性,但依赖于scRNA-seq和ST数据的整合质量,可能对数据噪声敏感 | 开发一种通用方法,在单细胞分辨率下准确推断空间细胞间通讯 | 细胞间通讯、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 图注意力网络 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 多个跨平台数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 899 | 2026-05-22 |
Synergistic activation by Glass and Pointed promotes neuronal identity in the Drosophila eye disc
2024-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51429-z
PMID:39154080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和靶向DamID技术,揭示Glass和Pointed转录因子协同激活果蝇眼盘中的神经元身份 | 首次发现Glass和Pointed在基因组中共享许多结合位点,并通过中间转录因子Scratch和Scrape协同激活多层转录网络,诱导神经元分化 | 研究仅限于果蝇模型,未在哺乳动物系统中验证该机制的保守性 | 阐明EGFR信号通过转录因子Pointed与眼特异性转录因子Glass协同作用,促进果蝇眼盘光感受器神经元分化的机制 | 果蝇眼盘和翅盘中的发育中光感受器细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 靶向DamID, 转录组学 | 不适用 | 基因表达数据 | 果蝇眼盘和翅盘组织(具体样本量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 900 | 2026-05-22 |
Pharmacology of Hydrogen Sulfide and Its Donors in Cardiometabolic Diseases
2024-08-15, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1124/pharmrev.123.000928
PMID:38866561
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综述 | 综述硫化氢及其供体在心脏代谢疾病中的生理和药理作用,并探讨多组学、肠道菌群分析、类器官和单细胞测序等新技术在该领域的应用前景 | 系统总结了硫化氢通过过硫化修饰调控蛋白质的新机制,并强调了多组学、肠道菌群分析、类器官和单细胞测序等新兴技术在硫化氢药理学研究中的应用潜力 | 未明确提及具体局限性,但隐含指出硫化氢在心脏代谢疾病中的作用机制仍需进一步阐明,且相关技术仍面临挑战 | 探讨内源性硫化氢的生理作用及各种硫化氢供体在心脏代谢疾病中的药理角色,并评估新兴技术在该领域的应用前景 | 心脏代谢疾病,包括其细胞、动物和临床研究层面 | 机器学习 | 心血管疾病 | 多组学、肠道菌群分析、类器官分析、单细胞测序 | NA | 文本, 图像, 序列数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 多组学, 肠道菌群分析, 类器官分析 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 用于单细胞测序和基于测序的多组学分析 |