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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2025-10-06 |
Tumor suppressor FRMD3 controls mammary epithelial cell fate determination via notch signaling pathway
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8958
PMID:38959315
|
研究论文 | 本研究揭示肿瘤抑制因子FRMD3通过调控Notch信号通路决定乳腺上皮细胞命运 | 首次发现FRMD3通过破坏Dvl2与去泛素化酶USP9x的相互作用促进其降解,并中断Dvl2与CK1、FOXK1/2和NICD的相互作用 | NA | 探究乳腺上皮细胞管腔-基底转化机制及FRMD3的肿瘤抑制功能 | 乳腺上皮细胞(MECs)和三阴性乳腺癌 | 分子生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 882 | 2025-10-06 |
Development of a nanoparticle-based tendon-targeting drug delivery system to pharmacologically modulate tendon healing
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn2332
PMID:38896625
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研究论文 | 开发了一种基于纳米颗粒的肌腱靶向药物递送系统,用于药理学调节肌腱愈合 | 首次发现肌腱愈合过程中的TRAP活性,并利用TRAP结合肽功能化纳米颗粒实现肌腱特异性药物递送 | 仅在小鼠模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发改善肌腱愈合的药理学治疗方法 | 急性肌腱损伤的愈合过程 | 生物医学工程 | 肌腱损伤 | 空间转录组学、纳米颗粒药物递送系统 | NA | 基因表达数据、生物力学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 883 | 2025-10-06 |
Structure and dynamics of enterovirus genotype networks
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1693
PMID:38896609
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示肠道病毒种群通过突变网络维持与多个适应性基因型连接的进化动态 | 开发SEARCHLIGHT方法实现单细胞水平同时获取病毒单倍型和宿主转录组信息,首次在单细胞分辨率揭示病毒种群结构复杂性 | NA | 解析肠道病毒基因型网络的结构和动态,理解病毒种群如何适应选择性环境变化 | 肠道病毒种群 | 基因组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、病毒单倍型数据 | 数百个受感染的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | SEARCHLIGHT(scRNA-seq-enabled acquisition of mRNA and consensus haplotypes linking individual genotypes and host transcriptomes) |
| 884 | 2025-10-06 |
Expansion of learning capacity elicited by interspecific hybridization
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3409
PMID:38896617
|
研究论文 | 本研究通过种间杂交培育F1杂交鸣禽,探索了物种特异性学习能力的神经遗传机制 | 首次发现杂交鸣禽具有扩展的学习能力,能模仿双亲物种及其他异种鸣叫,并揭示这与发声运动投射神经元的特异性转录特征相关 | 尽管发现神经回路大小和神经元数量保守,但具体分子机制仍需进一步验证 | 探索物种特异性鸣叫学习的神经遗传机制 | F1杂交鸣禽及其亲本物种 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | F1杂交鸣禽个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 885 | 2025-10-06 |
MOXD1 is a lineage-specific gene and a tumor suppressor in neuroblastoma
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado1583
PMID:38905335
|
研究论文 | 本研究通过分析神经母细胞瘤样本的RNA测序数据,发现MOXD1基因是神经母细胞瘤中的谱系特异性肿瘤抑制基因 | 首次将MOXD1鉴定为神经母细胞瘤中的谱系限制性肿瘤抑制基因,并揭示了其在肿瘤发展中的决定性作用 | 缺乏适当的早期肿瘤驱动事件研究模型 | 探索神经母细胞瘤的胚胎起源和早期肿瘤驱动事件 | 人类神经母细胞瘤样本、人类神经母细胞瘤细胞、胎儿肾上腺、斑马鱼、小鸡和小鼠模型 | 癌症生物学 | 神经母细胞瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类神经母细胞瘤样本和多种动物模型 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 886 | 2025-10-06 |
Noninvasive assessment of the lung inflammation-fibrosis axis by targeted imaging of CMKLR1
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9817
PMID:38896611
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研究论文 | 本研究验证了CMKLR1作为肺部炎症-纤维化轴成像生物标志物的潜力 | 首次将CMKLR1确定为单核细胞源性巨噬细胞的瞬时标志物,并开发了CMKLR1靶向PET成像技术用于肺部炎症和纤维化的无创评估 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证仍需进一步开展 | 开发用于纤维化肺疾病风险分层和治疗监测的可靠生物标志物 | 特发性肺纤维化患者和小鼠肺纤维化模型 | 数字病理 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序,正电子发射断层扫描 | NA | 基因表达数据,影像数据 | 特发性肺纤维化患者队列和博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 887 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9173
PMID:38905344
|
研究论文 | 构建了跨物种三叉神经节和背根神经节的统一细胞图谱,促进不同物种和研究间的细胞类型比较 | 创建了首个涵盖6个物种、31个数据集的统一感觉神经节细胞图谱,改进了稀疏神经元亚型的注释 | 研究主要基于转录组数据,可能未完全捕捉蛋白质水平和功能特性的差异 | 比较不同物种感觉神经节的细胞类型多样性并建立统一注释标准 | 三叉神经节和背根神经节的感觉神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 6个物种、31个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 888 | 2025-10-06 |
Integration mapping of cardiac fibroblast single-cell transcriptomes elucidates cellular principles of fibrosis in diverse pathologies
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adk8501
PMID:38905342
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据构建心脏纤维化的综合参考图谱 | 建立了首个全面的心脏纤维化单细胞转录组整合图谱,揭示了不同病理模型中成纤维细胞的相似性动态变化 | NA | 阐明不同病理条件下心脏纤维化的细胞学原理 | 心脏成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类健康及患病心脏样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 889 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals segregation of tumor cell states in glioblastoma and marked immunosuppression within the perinecrotic niche
2024-04-22, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01769-0
PMID:38650010
|
研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤细胞状态的空间分离模式以及坏死周围区域的免疫抑制特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,系统揭示了胶质母细胞瘤中不同肿瘤细胞状态的空间分布规律及坏死周围区域的免疫抑制微环境 | 研究仅包含3例患者样本,样本量较小,可能限制结果的普适性 | 探究胶质母细胞瘤微环境中细胞类型和肿瘤细胞状态的空间分布特征 | 胶质母细胞瘤患者组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 3例胶质母细胞瘤患者 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序, 10x Visium空间转录组学平台 |
| 890 | 2025-10-06 |
FABP5+ macrophages contribute to lipid metabolism dysregulation in type A aortic dissection
2024-Dec-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113438
PMID:39447410
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了FABP5+巨噬细胞在A型主动脉夹层脂质代谢失调中的关键作用 | 首次系统评估主动脉夹层中非免疫细胞与免疫细胞间的相互作用及其对代谢的影响,并发现FABP5+巨噬细胞的新亚群 | 研究结果仍需在更大样本中进一步验证,机制研究尚待深入 | 阐明A型主动脉夹层的脂质代谢景观及其病理机制 | A型主动脉夹层患者和模型小鼠 | 多组学分析 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 脂质代谢组学 | NA | RNA序列数据, 代谢组学数据 | TAAD模型小鼠和TAAD患者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 脂质代谢组学 | NA | NA |
| 891 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing data analysis utilizing multi-type graph neural networks
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108921
PMID:39059210
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研究论文 | 提出一种利用多类型图神经网络和去噪自编码器的单细胞RNA测序数据分析模型 | 将零膨胀负二项模型与去噪自编码器结合,并集成多类型图神经网络处理单细胞数据 | NA | 解决单细胞RNA测序数据降维、去噪和聚类分析的技术难题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 去噪自编码器, 图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 892 | 2025-10-06 |
Identification of miRNA signature in cancer-associated fibroblast to predict recurrent prostate cancer
2024-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108989
PMID:39142223
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,建立了癌症相关成纤维细胞miRNA特征模型来预测前列腺癌复发 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据构建CAFs相关miRNA预后模型,并鉴定出miR-106b-5p作为潜在治疗靶点 | 研究样本量相对有限,需要更大规模验证 | 建立CAFs相关miRNA模型以评估前列腺癌预后差异、肿瘤微环境和抗癌药物筛选 | 前列腺癌患者样本和成纤维细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, CCK8, 伤口愈合实验, 克隆形成实验, 细胞迁移实验 | Lasso, 随机森林, 支持向量机 | RNA测序数据 | 34例前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 893 | 2025-10-06 |
APOE Christchurch enhances a disease-associated microglial response to plaque but suppresses response to tau pathology
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597211
PMID:38895362
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研究论文 | 本研究探讨APOE Christchurch突变在不同阿尔茨海默病小鼠模型中对小胶质细胞反应的调节作用 | 首次系统研究APOE Christchurch突变在淀粉样斑块和tau蛋白病变两种不同病理模型中的差异性调节作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证;样本量相对有限 | 阐明APOE Christchurch突变对阿尔茨海默病病理发展的保护机制 | 携带ApoeCh突变的5xFAD淀粉样病变小鼠模型和PS19 tau病变小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 免疫组织化学分析、生化分析、单细胞空间转录组学、蛋白质组学 | 小鼠疾病模型 | 图像数据、转录组数据、蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 894 | 2025-10-06 |
Single-cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2024-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579846
PMID:38370670
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次发现FABP4/5在肺动脉高压中调控内皮细胞代谢重编程和动脉分化的新功能 | 研究主要基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步深入 | 探究肺动脉高压发病的细胞分子机制并寻找新的治疗靶点 | 肺动脉内皮细胞、肺动脉高压动物模型和IPAH患者样本 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 特发性PAH患者、肺动脉高压大鼠和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 895 | 2025-10-06 |
scHD4E: Novel ensemble learning-based differential expression analysis method for single-cell RNA-sequencing data
2024-08, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.108769
PMID:38897145
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研究论文 | 提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scHD4E | 仅使用四种性能最佳的差异表达分析方法进行集成学习,相比现有方法scDEA使用的12种方法更为精简高效 | 方法性能评估主要基于有限的六个真实数据集和一个模拟数据集 | 开发更准确稳定的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | 六个真实数据集和一个模拟数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 896 | 2025-10-06 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-Jun-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
|
综述 | 本文总结了2023年EMBO研讨会关于发育代谢领域的关键讨论,重点探讨了该领域面临的挑战与新兴机遇 | 强调了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算模型等技术革命为发育代谢研究带来的全新探索维度 | NA | 探讨发育代谢领域的历史障碍和新兴机遇 | 细胞特异性代谢网络、组织间代谢通讯、基因-代谢物时空相互作用 | 发育生物学 | NA | 代谢组学, 小分子传感器, 单细胞RNA测序, 计算建模 | 计算模型 | 代谢数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 897 | 2025-10-06 |
Functional profiling of murine glioma models highlights targetable immune evasion phenotypes
2024-11-27, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-024-02831-w
PMID:39592459
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研究论文 | 通过功能遗传筛选、单细胞转录组学和机器学习方法,系统性评估小鼠胶质瘤模型作为人类胶质母细胞瘤临床前模型的价值 | 首次通过CRISPR全基因组共培养杀伤筛选鉴定出胶质瘤三种关键免疫逃逸机制,并利用机器学习识别出与临床相关的免疫逃逸基因程序 | 研究基于小鼠模型,虽然部分重现了人类GBM特征,但仍存在物种差异 | 探索胶质瘤免疫逃逸机制并建立临床前模型与人类疾病的桥梁 | 小鼠胶质瘤模型(GL261和CT2A)及人类胶质母细胞瘤 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR全基因组筛选、单细胞转录组学、机器学习 | 机器学习方法 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 两个小鼠胶质瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 898 | 2025-10-06 |
In vivo CRISPRi screen identified lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.16.618774
PMID:39464078
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研究论文 | 通过CRISPRi筛选和单细胞测序分析鉴定出调控皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长的关键lncRNA组合 | 首次通过整合单细胞测序分析和体内外CRISPRi筛选系统鉴定lncRNA在cSCC中的功能,发现LINC00704和LINC01116等新型调控因子 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,需要在更多临床样本中验证 | 探索长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌发生发展中的作用机制 | 人类正常和cSCC皮肤组织、角质形成细胞亚群、cSCC癌细胞系 | 功能基因组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序、CRISPR干扰筛选、假性批量分析、异种移植模型 | CRISPRi、xenograft | 单细胞测序数据、功能验证数据 | 正常和cSCC人类皮肤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 899 | 2025-10-06 |
Transcriptional profiling in microglia across physiological and pathological states identifies a transcriptional module associated with neurodegeneration
2024-09-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06684-7
PMID:39294270
|
研究论文 | 通过整合分析人类小胶质细胞的转录组数据,识别出在神经退行性疾病中共享的转录特征 | 整合多个神经退行性疾病的单细胞RNA-seq数据集,发现跨疾病共享的小胶质细胞转录特征,并将遗传变异与转录特征相关联 | 基于公开数据集进行二次分析,可能受原始数据质量和样本来源限制 | 识别小胶质细胞在生理和病理状态下的转录特征,探索其在神经退行性疾病中的作用 | 人类小胶质细胞 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 基因组关联分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 基因组数据 | 多个公开数据集,涵盖阿尔茨海默病、多发性硬化症和帕金森病 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 900 | 2025-10-06 |
SPRR1B+ keratinocytes prime oral mucosa for rapid wound healing via STAT3 activation
2024-09-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06864-5
PMID:39300285
|
研究论文 | 本研究通过整合分析口腔黏膜和皮肤伤口愈合过程中的单细胞测序数据,揭示了STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在促进口腔黏膜快速愈合中的关键作用 | 首次发现STAT3激活的SPRR1B+角质形成细胞在正常口腔黏膜中固有存在,而在正常皮肤中缺失,这一细胞亚群通过促进角质形成细胞迁移来加速伤口愈合 | 研究主要基于小鼠模型验证,在人类临床样本中的验证仍需进一步深入 | 探究口腔黏膜快速伤口愈合的细胞机制 | 口腔黏膜和皮肤伤口愈合过程中的角质形成细胞 | 单细胞生物学 | 伤口愈合障碍 | bulk mRNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 小鼠模型和人类口腔/皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |