单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
881 2024-12-08
Identification of key biomarkers related to fibrocartilage chondrocytes for osteoarthritis based on bulk, single-cell transcriptomic data
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过分析单细胞RNA测序和微阵列数据,探索了纤维软骨细胞在骨关节炎进展中的作用,并识别了与纤维软骨细胞相关的关键生物标志物 本研究首次通过多组学方法识别了六个与纤维软骨细胞相关的骨关节炎生物标志物,并构建了一个探索性的风险模型 本研究仅在有限的样本中验证了生物标志物的蛋白质表达水平,未来需要在更大规模的样本中进行验证 探索纤维软骨细胞在骨关节炎进展中的作用,并识别相关的关键生物标志物 纤维软骨细胞及其在骨关节炎中的生物标志物 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 风险模型 基因表达数据 骨关节炎和正常软骨样本
882 2024-12-08
Human placental cells are resistant to SARS-CoV-2 infection and replication
2024, Wellcome open research
研究论文 研究了人类胎盘细胞对SARS-CoV-2感染和复制的抵抗力 首次量化了胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性,并确定了它们是否支持病毒释放 研究主要基于体外实验,可能无法完全反映体内情况 探讨SARS-CoV-2在妊娠期间的感染和传播机制 人类胎盘细胞及其对SARS-CoV-2的感染和复制能力 NA NA 单细胞RNA测序(scRNAseq)和共聚焦显微镜 NA RNA 包括第一孕期和足月胎盘细胞,以及多种胎盘衍生细胞系
883 2024-12-08
The role of epigenetic regulation in pancreatic ductal adenocarcinoma progression and drug response: an integrative genomic and pharmacological prognostic prediction model
2024, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)进展和药物反应中的表观遗传调控作用,并构建了一个综合的基因组和药理学预测模型 首次在单细胞分辨率下全面描绘了PDAC中的表观遗传调控图谱,并构建了一个基于表观遗传特征的预测模型,该模型在预测1年、3年和5年生存率方面表现优于现有模型 研究主要基于公共数据库的数据,可能存在数据偏差和样本量不足的问题 探讨表观遗传调控在胰腺导管腺癌进展和药物反应中的作用,并构建一个预测模型 胰腺导管腺癌(PDAC)的表观遗传调控、细胞异质性、突变模式、免疫微环境和药物敏感性 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、加权基因共表达网络分析(WGCNA) 机器学习模型(Lasso和随机生存森林) 基因组数据、临床数据 多个公共数据库的数据
884 2024-12-07
Stem cell expressed CXCR4 regulates tissue composition in the vomeronasal organ
2024-Dec-06, Journal of cell science IF:3.3Q3
研究论文 研究CXCR4在犁鼻器组织组成中的调控作用 首次揭示CXCR4在犁鼻器中对干细胞和基底神经元谱系的调控作用 NA 探讨CXCR4在犁鼻器组织组成中的作用 犁鼻器中的干细胞和神经元谱系 NA NA 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、谱系追踪 NA 基因表达数据 NA
885 2024-12-07
The quality of SIV-specific fCD8 T cells limits SIV RNA production in Tfh cells during antiretroviral therapy
2024-Dec-06, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 研究了在抗逆转录病毒治疗期间,SIV特异性fCD8 T细胞对Tfh细胞中SIV RNA产量的限制作用 揭示了在抗逆转录病毒治疗期间,SIV特异性fCD8 T细胞与Tfh细胞中SIV RNA产量之间的负相关关系,并发现治疗组和自然控制组中fCD8 T细胞的基因表达模式不同 研究仅限于cynomolgus猕猴模型,可能无法完全代表人类HIV感染的情况 探讨在抗逆转录病毒治疗期间,SIV特异性fCD8 T细胞对Tfh细胞中SIV RNA产量的影响 SIV感染的cynomolgus猕猴、Tfh细胞和fCD8 T细胞 免疫学 HIV/SIV感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 15只cynomolgus猕猴,其中8只为进展者,7只为自然控制者
886 2024-12-07
Single-cell RNA-seq reveals diverse molecular signatures associated with Methotrexate resistance in primary central nervous system lymphoma cells
2024-Dec-05, Journal of neuro-oncology IF:3.2Q2
研究论文 研究通过单细胞RNA测序揭示了与甲氨蝶呤耐药性相关的分子特征 利用单细胞测序技术识别了与甲氨蝶呤耐药性相关的关键基因和信号通路 研究仅限于培养的PCNSL细胞,未涉及临床样本 探索甲氨蝶呤耐药性的分子机制,寻找新的治疗策略 原发性中枢神经系统淋巴瘤细胞及其对甲氨蝶呤的耐药性 数字病理学 中枢神经系统淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及HKBML和TK两个数据集的细胞样本
887 2024-12-07
Schwann Cell-Mediated M2-Like Macrophage Polarization in Rhabdomyosarcoma
2024-Dec-05, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 研究了头颈部横纹肌肉瘤(RMS)微环境的细胞成分和免疫学特征 发现RMS样本中施万细胞浸润与M2样巨噬细胞浸润增加相关,并鉴定了施万细胞与M2样巨噬细胞之间的受体-配体对 NA 探讨头颈部横纹肌肉瘤(RMS)微环境的细胞成分和免疫学特征 头颈部横纹肌肉瘤(RMS)微环境中的细胞成分和免疫学特征 数字病理学 横纹肌肉瘤 单细胞转录组学、CellChat、CIBERSORT、流式细胞术、免疫组化 NA 转录组数据 NA
888 2024-12-07
Single-cell transcriptomics of human organoid-derived enteroendocrine cell populations from the small intestine
2024-Dec-05, The Journal of physiology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术对人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞群体进行了图谱绘制 首次通过CRISPR-Cas9技术对人类小肠类器官进行基因修饰,并利用单细胞RNA测序技术详细分析了肠内分泌细胞的基因表达特征 研究主要集中在小肠类器官,未涉及大肠和其他器官的肠内分泌细胞 通过单细胞RNA测序技术绘制人类肠内分泌细胞的图谱,以促进针对肠内分泌轴的药物开发 人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自人类十二指肠和回肠的类器官样本
889 2024-12-07
Cancer-associated fibroblast-derived MMP11 promotes tumor progression in pancreatic cancer
2024-Dec-05, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAFs)分泌的MMP11在胰腺癌进展中的作用 首次揭示了MMP11在胰腺导管腺癌(PDAC)中的表达模式及其通过TGF-β1介导的CAF激活促进肿瘤进展的机制 研究主要集中在体外和动物模型中,尚未在临床样本中验证MMP11抑制对患者生存的影响 探讨MMP11在胰腺癌中的表达及其对肿瘤进展的影响 胰腺导管腺癌(PDAC)组织、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、胰腺癌细胞 NA 胰腺癌 单细胞RNA测序、共免疫荧光染色 NA RNA 涉及AsPC-1和BxPC-3细胞以及裸鼠模型
890 2024-12-07
Elevated Shear Stress Modulates Heterogenous Cellular Subpopulations to Induce Vascular Remodeling
2024-Dec, Tissue engineering. Part A
研究论文 研究探讨了高剪切应力对血管重塑过程中异质细胞亚群的调节作用 首次在单细胞分辨率下全面研究高剪切应力诱导血管重塑的分子机制 研究仅限于动物模型,尚未在人体中验证 探讨高剪切应力对血管重塑的影响及其分子机制 血管内皮细胞和巨噬细胞 心血管疾病 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用大鼠隐静脉构建动静脉环路模型
891 2024-12-07
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
研究论文 本文介绍了一种利用微孔微针集成CAR-TREM2-巨噬细胞的策略,通过调节纤维化微环境来管理瘢痕 开发了CAR-TREM2-巨噬细胞,能够靶向DPP4成纤维细胞并调节瘢痕微环境中的内皮细胞亚型,有效预防瘢痕形成 NA 研究通过多因素调节瘢痕微环境来抑制瘢痕形成的有效策略 DPP4阳性成纤维细胞、内皮细胞、TREM2巨噬细胞 数字病理学 皮肤损伤 单细胞转录组测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
892 2024-12-07
Investigating TCR-pMHC interactions for TCRs without identified epitopes by constructing a computational pipeline
2024-Dec, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本文提出了一种计算流程,结合结构信息和单细胞测序数据,研究未识别表位的TCR的表位识别机制 通过抗原特异性聚类,将已知表位和未知表位的TCR进行表位序列映射,并使用分子动力学模拟揭示表位识别机制 NA 研究TCR与pMHC相互作用的分子机制,以激活T细胞免疫反应并合理设计基于TCR的治疗方法 未识别表位的TCR的表位识别机制 生物信息学 NA 单细胞测序 分子动力学模拟 序列数据 614个T细胞(TCR-614)和204个T细胞(TCR-204)
893 2024-12-07
Splicing the Difference: Harnessing the Complexity of the Transcriptome in Hematopoiesis
2024-Dec, Experimental hematology IF:2.5Q3
综述 本文综述了剪接变异在造血过程中的复杂性和重要性,并介绍了相关的新技术和研究进展 本文介绍了多色流式细胞分选与批量和单细胞测序相结合的新技术,以及剪接因子突变在血液系统恶性肿瘤中的作用 NA 更新听众对造血过程中剪接变异的新技术和研究进展的了解 造血过程中的剪接变异及其在血液系统疾病中的作用 NA 血液系统疾病 多色流式细胞分选、批量测序、单细胞测序 NA NA NA
894 2024-12-01
Cellular diversity of human inner ear organoids revealed by single-cell transcriptomics
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本文通过单细胞转录组学揭示了人类内耳类器官的细胞多样性 本文讨论了通过单细胞转录组学分析提供的新见解,有助于定义理解内耳发育的新研究路径 目前尚不清楚这些类器官在多大程度上模拟了体内人类内耳的发育和细胞组成 研究人类内耳类器官的细胞多样性及其在发育、听力损失和眩晕相关突变以及新疗法中的应用 人类内耳类器官及其细胞类型 NA NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
895 2024-12-07
Single-cell analysis of human peripheral blood reveals high immune response activity in successful ageing individuals
2024-Nov-30, Mechanisms of ageing and development IF:5.3Q1
研究论文 研究通过单细胞RNA测序分析人类外周血中的免疫细胞,揭示了长寿个体(百岁老人和超级百岁老人)中免疫系统的重塑机制 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了百岁老人和超级百岁老人中免疫系统的动态调节机制,并发现了与健康衰老相关的免疫重塑标志物 研究样本量较小,且仅限于外周血单核细胞,可能无法全面反映整个免疫系统的变化 探讨长寿个体中免疫系统的动态调节机制及其分子基础 百岁老人、超级百岁老人和老年对照组的外周血单核细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 87,215个外周血单核细胞,来自7名超级百岁老人、3名百岁老人和4名老年对照组
896 2024-12-07
Mechanistic study of the regulation of mitochondrial function by the GPNMB/Nrf2/NF-κB signaling pathway mediated by Quzhi Tang to alleviate chondrocyte senescence
2024-Nov-29, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 研究了曲志汤通过GPNMB/Nrf2/NF-κB信号通路调节线粒体功能以减轻软骨细胞衰老的机制 首次揭示了曲志汤通过调节GPNMB/Nrf2/NF-κB信号通路来修复线粒体损伤并减轻软骨细胞衰老 研究主要基于小鼠模型,临床相关性需进一步验证 探讨曲志汤治疗膝骨关节炎的潜在药物机制 软骨细胞衰老及相关信号通路 NA 骨关节炎 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 小鼠软骨组织样本
897 2024-12-07
Qingfei Yin alleviates Streptococcus pneumoniae pneumonia by promoting complete autophagy to suppress necroptosis
2024-Nov-29, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 研究清肺饮通过促进完全自噬抑制坏死性凋亡来缓解肺炎链球菌肺炎的机制 首次揭示了清肺饮通过下调p62表达促进完全自噬,从而减轻肺炎链球菌诱导的肺上皮细胞坏死性凋亡 仅在动物模型和细胞实验中验证了清肺饮的作用机制,尚未进行临床试验 探讨清肺饮治疗肺炎链球菌肺炎的机制 肺炎链球菌诱导的肺炎及肺上皮细胞 NA 肺炎 单细胞转录组学、HE染色、免疫荧光、AO染色、PI染色、Western blot NA 细胞、组织 113,353个细胞、小鼠模型、TC-1细胞模型
898 2024-12-07
Alpha-2-macroglobulin mitigates glucocorticoid-induced osteonecrosis via Keap1/Nrf2 pathway activation
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
研究论文 研究探讨了α-2-巨球蛋白通过激活Keap1/Nrf2信号通路减轻糖皮质激素诱导的股骨头坏死的作用 首次揭示了α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其通过Keap1/Nrf2通路减轻症状的机制 研究主要基于动物模型和患者样本的转录组和蛋白质组分析,缺乏更大规模的人体临床试验验证 探讨α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其机制 糖皮质激素诱导的股骨头坏死及其相关生物标志物 NA 股骨头坏死 转录组分析、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质数据 患者样本和糖皮质激素诱导的股骨头坏死大鼠模型
899 2024-12-07
Taurine ameliorates radiation-induced oxidative stress in bone marrow mesenchymal stromal cells and promotes osteogenesis
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
研究论文 研究探讨了牛磺酸对辐射诱导的骨髓间充质干细胞氧化应激的影响及其促进成骨的作用 首次揭示了牛磺酸代谢在辐射后下颌骨间充质细胞中的激活,并通过补充牛磺酸显著改善了辐射小鼠的生存率和下颌骨成骨 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类患者中进行验证 探讨牛磺酸在辐射诱导的下颌骨坏死中的作用及其潜在的治疗价值 骨髓间充质干细胞和辐射小鼠 NA NA scRNA-Seq 和代谢组学 NA NA 辐射和未辐射的骨髓间充质干细胞,以及辐射和未辐射的小鼠
900 2024-12-07
[Revealing research progress for immunological characteristics of chronic hepatitis B applying single-cell RNA sequencing technology]
2024-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
研究论文 本文总结了单细胞RNA测序技术在慢性乙型肝炎免疫特征研究中的进展 利用单细胞RNA测序技术揭示慢性乙型肝炎中免疫细胞转录组微小变化,为探索免疫发病机制和潜在治疗靶点提供技术支持 NA 探讨慢性乙型肝炎的免疫机制和潜在治疗靶点 慢性乙型肝炎患者的免疫细胞 数字病理学 肝炎 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
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