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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2025-10-06 |
iGTP: Learning interpretable cellular embedding for inferring biological mechanisms underlying single-cell transcriptomics
2024-Nov-25, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.03.29.24305092
PMID:39649598
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研究论文 | 提出了一种可解释的生成转录程序框架iGTP，用于从单细胞转录组数据中学习可解释的细胞嵌入表示 | 设计了结合转录程序空间和蛋白质-蛋白质相互作用的新型可解释生成框架，能够建模不同生物状态间的相互作用 | NA | 开发可解释的深度学习方法，从单细胞转录组数据推断潜在的生物学机制 | 单细胞转录组数据中的细胞状态和生物过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器, 图神经网络, 潜在扩散模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 862 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional mapping reveals genetic and non-genetic determinants of aberrant differentiation in AML
2024-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.26.573390
PMID:38234771
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建人类骨髓造血参考图谱，并分析AML中遗传和非遗传因素对异常分化的影响 | 构建了包含263,519个单细胞转录组的人类骨髓造血参考图谱，系统绘制了基因型与表型关联，揭示了AML中12种异常分化模式 | 依赖单细胞RNA测序数据，可能受技术偏差影响；样本来源有限 | 研究急性髓系白血病中遗传突变和非遗传因素对造血分化的影响机制 | 318例AML、混合表型急性白血病和急性红系白血病患者的120万个单细胞转录组 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 263,519个正常骨髓单细胞和120万个白血病单细胞，涵盖318个患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 863 | 2025-10-06 |
Identification of conserved and tissue-restricted transcriptional profiles for lipid associated macrophages (LAMs)
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614807
PMID:39386558
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了脂质相关巨噬细胞(LAMs)在多个组织和炎症条件下的保守性和组织特异性转录谱 | 首次系统性地比较了不同组织和炎症条件下LAMs的转录组特征，发现了保守性和组织特异性的基因程序 | 研究主要基于小鼠和人类的单细胞RNA测序数据，需要进一步的功能验证实验 | 探究脂质相关巨噬细胞在不同组织和炎症条件下的转录组特征及其在代谢性疾病中的作用 | 小鼠和人类多个组织中的脂质相关巨噬细胞(LAMs) | 单细胞转录组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织和疾病模型的小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 864 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic characterization of pathologic niches in IPF
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl5473
PMID:39121212
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术表征特发性肺纤维化中的病理生态位 | 首次通过空间转录组学结合单细胞RNA测序图谱，识别出IPF中三种具有独特细胞组成和定位的疾病相关生态位 | NA | 解析特发性肺纤维化的空间病理生态位特征 | IPF患者和对照组的肺组织 | 空间转录组学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 865 | 2025-10-06 |
3D chromatin architecture, BRD4, and Mediator have distinct roles in regulating genome-wide transcriptional bursting and gene network
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4893
PMID:39121214
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研究论文 | 本研究通过数学建模分析单细胞RNA测序数据，揭示了3D染色质结构、BRD4和Mediator在调控全基因组转录爆发和基因网络中的不同作用 | 首次系统比较了不同调控因子在转录爆发动力学中的特异性作用，发现MED26主要调控爆发频率，MYC调控爆发大小，而cohesin和BRD4可同时调控两者 | 研究基于数学建模推断，需要进一步实验验证具体分子机制 | 解析转录爆发的分子调控机制 | 基因转录爆发动力学 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，数学建模 | 数学建模 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 866 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis reveals mitochondrial calcium signaling as a modulator of endothelial-to-mesenchymal transition
2024-08-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6182
PMID:39121218
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现线粒体钙信号是内皮-间质转化的调节因子 | 首次识别线粒体钙摄取作为EndMT的关键驱动因素，并证明抑制MCU可阻止EndMT | 研究主要基于体外模型，临床样本有限 | 探索内皮-间质转化的分子机制及其在心血管疾病中的作用 | 内皮细胞、三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育、外周动脉疾病模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三个体外EndMT模型、胚胎心脏发育样本、外周动脉疾病模型、严重肢体缺血患者组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 867 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics at the brain-electrode interface in rat motor cortex and the relationship to recording quality
2024-07-31, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/ad5936
PMID:38885679
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析大鼠运动皮层中电极植入引起的基因表达变化及其与记录质量的关系 | 首次将空间转录组学应用于脑电极界面研究，识别出与记录质量相关的潜在生物标志物基因 | 研究仅在大鼠模型中进行，样本数量有限，需要进一步验证 | 探究脑部电极植入引起的组织反应及其对设备功能的影响 | 大鼠运动皮层中植入的密歇根式微电极阵列 | 空间转录组学 | 神经植入物相关组织反应 | 空间转录组学，免疫标记，电生理记录 | 回归分析 | 基因表达数据，电生理信号，免疫组织化学图像 | 大鼠脑组织切片，植入后24小时、1周和6周时间点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 868 | 2025-10-06 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics reveals tumor heterogeneity and intercellular networks in colorectal cancer
2024-05-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06598-6
PMID:38729966
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学技术，揭示了结直肠癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间相互作用网络 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学技术结合应用于结直肠癌研究，识别了恶性细胞亚型并发现了肿瘤-基质区域间的关键配体-受体相互作用 | 样本量相对较小（仅3对结直肠癌肿瘤-正常-血液样本），研究结果需要在更大队列中验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中的细胞异质性和细胞间通讯机制 | 结直肠癌患者的肿瘤组织、正常组织和血液样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 3对结直肠癌肿瘤-正常-血液样本，共41,700个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 869 | 2025-10-06 |
Modeling acute myocardial infarction and cardiac fibrosis using human induced pluripotent stem cell-derived multi-cellular heart organoids
2024-05-01, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06703-9
PMID:38693114
|
研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞开发了包含多种细胞类型的心脏类器官，用于模拟急性心肌梗死和心脏纤维化 | 首次开发了包含心肌细胞、成纤维细胞和内皮细胞的自组织心脏类器官，能够准确模拟成人心脏疾病状态 | 类器官模型仍无法完全复制体内心脏的复杂生理环境 | 建立临床相关的体外心脏疾病模型以替代动物实验 | 人诱导多能干细胞衍生的心脏类器官 | 干细胞与组织工程 | 心血管疾病 | 免疫组织化学、流式细胞术、q-PCR、单细胞RNA测序 | 心脏类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能测定数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 870 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct metabolic "microniches" and close host-symbiont interactions in deep-sea chemosynthetic tubeworm
2024-07-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3053
PMID:39047091
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示深海化能合成管虫体内代谢微环境及其与内共生菌的相互作用机制 | 首次在深海化能合成生态系统中应用原位单细胞固定技术，发现管虫通过控制化学合成气体和代谢物可用性在共生器官中维持两种不同的代谢微环境 | 研究仅针对一种冷泉管虫物种，尚未验证在其他化能合成生态系统中的普适性 | 阐明深海管虫与内共生菌之间的分子相互作用机制 | 冷泉管虫及其硫氧化γ-变形菌内共生体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 冷泉管虫共生器官组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深海原位单细胞固定技术 |
| 871 | 2025-10-06 |
Macrophage Dysfunction in Respiratory Disease
2024, Results and problems in cell differentiation
DOI:10.1007/978-3-031-65944-7_9
PMID:39406908
|
综述 | 本文探讨肺巨噬细胞在呼吸系统疾病中的功能障碍及其机制 | 整合谱系追踪和单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在肺部疾病中的代谢特征和线粒体活性变化 | 未涉及具体实验验证和临床干预研究 | 解析巨噬细胞功能障碍在呼吸系统疾病发病机制中的作用 | 肺巨噬细胞（包括肺泡巨噬细胞和组织驻留细胞） | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 872 | 2025-10-06 |
The brain microvasculature is a primary mediator of interferon-α neurotoxicity in human cerebral interferonopathies
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.05.017
PMID:38878770
|
研究论文 | 本研究揭示大脑微血管是干扰素-α神经毒性的主要介导者，为Aicardi-Goutières综合征提供了新的治疗靶点 | 首次证实大脑是神经毒性IFN-α的主要来源，并确定脑内皮细胞中的IFNAR信号通路是导致脑血管疾病的关键机制 | 动物模型与人类疾病存在差异，需要进一步验证治疗策略的临床适用性 | 探究Aicardi-Goutières综合征中神经毒性IFN-α的来源和作用机制 | Aicardi-Goutières综合征患者和小鼠模型 | 神经科学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 磁共振成像, 单分子ELISA | NA | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质检测数据 | 人类患者和小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 873 | 2025-10-06 |
THBS2 + cancer-associated fibroblasts promote EMT leading to oxaliplatin resistance via COL8A1-mediated PI3K/AKT activation in colorectal cancer
2024-Dec-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02180-y
PMID:39732719
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研究论文 | 本研究揭示THBS2+癌症相关成纤维细胞通过COL8A1介导的PI3K/AKT通路激活促进上皮间质转化，导致结直肠癌奥沙利铂耐药 | 首次发现THBS2+CAF亚群通过COL8A1-ITGB1相互作用激活PI3K/AKT通路促进EMT和奥沙利铂耐药的新机制 | NA | 探索特定CAF亚群促进结直肠癌奥沙利铂耐药的分子机制 | 结直肠癌细胞和癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 874 | 2025-10-06 |
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.21.614235
PMID:39386427
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研究论文 | 本研究揭示了中脑胆碱能神经元通过M1和M3毒蕈碱受体促进弥漫性中线胶质瘤生长的机制 | 首次发现胆碱能神经元活动通过长程投射和毒蕈碱信号通路特异性促进DMG生长，并揭示了与健康少突胶质前体细胞的平行增殖效应 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养系统，在人类患者中的直接验证仍需进一步研究 | 探究胆碱能神经元活动对弥漫性中线胶质瘤生长的影响及其分子机制 | 弥漫性中线胶质瘤细胞、中脑胆碱能神经元、少突胶质前体细胞 | 神经肿瘤学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 光遗传学刺激、单细胞RNA测序、体外共培养、药理学阻断 | 小鼠疾病模型、hiPSC衍生神经元模型 | 基因表达数据、细胞增殖数据、电生理数据 | 原发性患者DMG样本、小鼠模型、体外共培养系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 875 | 2025-10-06 |
Distinct tumor-TAM interactions in IDH-stratified glioma microenvironments unveiled by single-cell and spatial transcriptomics
2024-08-16, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01837-5
PMID:39148129
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示IDH分层胶质瘤微环境中肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞的独特相互作用 | 首次在IDH定义的胶质瘤类别中系统比较肿瘤-TAM相互作用，发现IDH-WT胶质母细胞瘤中两个间充质表型TAM亚群与患者预后不良相关，并鉴定SLAMF9受体作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于转录组学分析，需要进一步的功能实验验证发现的相互作用机制 | 阐明IDH分层胶质瘤微环境中肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用特征 | 胶质瘤患者肿瘤样本中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, RT-qPCR, 基因调控网络推断 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 876 | 2025-10-06 |
Spatial Proteomics towards cellular Resolution
2024-Dec-25, Expert review of proteomics
IF:3.8Q1
DOI:10.1080/14789450.2024.2445809
PMID:39710940
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综述 | 本文概述了基于非靶向质谱的空间蛋白质组学工作流程及其向细胞分辨率发展的最新进展 | 强调空间蛋白质组学向细胞分辨率发展的技术突破，包括组织解剖、样品处理、生物信息学和液相色谱-质谱技术的进步 | 需要进一步发展数据分析和开发细胞或亚细胞水平的自动化智能组织解剖技术 | 推动空间蛋白质组学向细胞分辨率发展，深化对组织微环境空间组织的理解 | 组织微环境中的蛋白质空间分布 | 空间生物学 | NA | 非靶向质谱、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学 | NA | 基于质谱的空间蛋白质组学工作流程 |
| 877 | 2025-10-06 |
Prostate luminal cell plasticity and cancer
2024-Dec-25, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217430
PMID:39730086
|
综述 | 本文综述了前列腺管腔细胞可塑性在癌症中的作用及其对治疗耐药性的影响 | 整合了单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术揭示前列腺癌进展中的细胞可塑性和克隆动态变化 | 表观遗传改变如何影响肿瘤免疫原性仍是待研究领域 | 探讨前列腺细胞可塑性在癌症发展和治疗耐药中的作用机制 | 前列腺癌细胞、小鼠模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 878 | 2025-10-06 |
Pulmonary osteoclast-like cells in silica induced pulmonary fibrosis
2024-07-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adl4913
PMID:38985878
|
研究论文 | 本研究探讨了二氧化硅诱导肺纤维化的机制，发现肺内破骨样细胞分化是导致肺损伤的关键因素 | 首次发现二氧化硅暴露可诱导肺泡巨噬细胞和单核细胞分化为肺内破骨样细胞，并证实抗RANKL抗体治疗可抑制此过程并减轻肺纤维化 | 研究样本量有限，机制研究主要基于动物模型，人类样本验证仍需扩大 | 探索矽肺发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 职业性二氧化硅暴露患者的肺组织样本和矽肺小鼠模型 | 病理生理学 | 矽肺 | 单细胞RNA测序，组织学分析，生化检测，生理功能评估 | NA | 基因表达数据，组织图像，生化指标，生理参数 | 人类职业暴露患者肺样本和纵向小鼠矽肺模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 全肺单细胞RNA测序 |
| 879 | 2025-10-06 |
Development of human pancreatic cancer avatars as a model for dynamic immune landscape profiling and personalized therapy
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9071
PMID:38968363
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研究论文 | 开发人胰腺癌avatar模型用于动态免疫景观分析和个性化治疗评估 | 创建个性化器官型avatar模型，能够对完整原位肿瘤微环境进行时空报告并反映临床反应 | 需要手术切除组织样本，模型维持时间有限（12天） | 建立胰腺癌临床前模型以促进治疗进展 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多重免疫荧光，空间转录组学 | 器官型avatar模型 | 图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 880 | 2025-10-06 |
Identification of intracellular bacteria from multiple single-cell RNA-seq platforms using CSI-Microbes
2024-07-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj7402
PMID:38959321
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研究论文 | 开发了CSI-Microbes计算流程，用于从单细胞RNA测序数据中识别微生物reads并分析类群差异丰度 | 首次系统评估多种单细胞RNA测序技术回收微生物UMI的效率，发现较新的10x化学方法最适合 | NA | 研究肿瘤微生物组及其与肿瘤微环境的相互作用 | 食管癌和结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 食管癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 计算流程(CSI-Microbes) | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 3' v3和5'化学方法 |