单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202401-202412] [清除筛选条件]
当前共找到 7466 篇文献,本页显示第 841 - 860 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
841 2026-05-29
Single-cell and spatial transcriptomics reveals that PTPRG activates the m6A methyltransferase VIRMA to block mitophagy-mediated neuronal death in Alzheimer's disease
2024-03, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示PTPRG通过激活m6A甲基转移酶VIRMA阻断线粒体自噬介导的阿尔茨海默病神经元死亡 首次发现PTPRG通过结合并上调m6A甲基转移酶VIRMA抑制PRKN mRNA翻译,从而阻断线粒体自噬导致神经元死亡的信号通路,并阐明小胶质细胞亚群Mic_PTPRG与特定神经元亚群的通讯机制 未提及但可能包括:动物模型与人类AD的差异、实验验证范围有限、样本来源的地理和人口多样性不足 阐明阿尔茨海默病中神经元死亡的起始机制,探索潜在治疗靶点 阿尔茨海默病相关脑区和外周血 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 85个AD样本和83个对照样本,6只App AD小鼠和6只对照C57Bl/6J小鼠 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
842 2026-05-29
Allosteric inhibitor of SHP2 enhances macrophage endocytosis and bacteria elimination by increasing caveolae activation and protects against bacterial sepsis
2024-03, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 SHP2变构抑制剂通过增强小窝蛋白活化促进巨噬细胞胞吞和细菌清除,保护小鼠免受细菌性脓毒症侵害 首次揭示SHP2变构抑制剂通过维持Cav-1磷酸化增强巨噬细胞胞吞功能以清除细菌,并提出其与抗生素联用可完全保护小鼠免于死亡 未明确说明本研究的局限性 研究巨噬细胞在脓毒症中胞吞功能受损的分子机制,并评估SHP2变构抑制剂作为治疗脓毒症的潜力 脓毒症小鼠和巨噬细胞 机器学习 感染性疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型(大肠杆菌感染或盲肠结扎穿刺诱导脓毒症) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒用于单细胞RNA测序;Illumina NovaSeq用于批量RNA测序
843 2026-05-29
MMP14high macrophages orchestrate progressive pulmonary fibrosis in SR-Ag-induced hypersensitivity pneumonitis
2024-02, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析,发现MMP14高表达的巨噬细胞在SR-Ag诱导的过敏性肺炎中驱动进行性肺纤维化 首次鉴定出MMP14高表达的巨噬细胞亚群在纤维化过敏性肺炎中的作用,并揭示其通过外泌体MMP14调控成纤维细胞向肌成纤维细胞转化的机制 研究主要基于小鼠模型,尚未完全阐明人类纤维化过敏性肺炎中MMP14巨噬细胞的具体作用机制及临床转化潜力 探究MMP14高表达巨噬细胞在SR-Ag诱导的纤维化过敏性肺炎中的作用及机制 纤维化过敏性肺炎小鼠模型中的肺巨噬细胞 数字病理学 肺部疾病 单细胞RNA测序 决策树模型 基因表达数据 未明确提及样本量 未明确提及 单细胞RNA测序 未明确提及 未明确提及
844 2026-05-29
Effect of aging on the human myometrium at single-cell resolution
2024-01-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用单细胞/单核RNA测序和空间转录组学,构建了衰老子宫肌层的细胞图谱,揭示了与衰老相关的细胞变化 首次在单细胞分辨率下研究人类子宫肌层衰老,鉴定了23个细胞亚群,并发现了衰老导致的细胞间通讯改变和25条信号通路丧失 样本量有限(20名围绝经期和绝经后女性),可能无法完全代表所有年龄段的女性,且功能性验证不足 研究衰老对人类子宫肌层在单细胞水平的影响 围绝经期和绝经后女性的子宫肌层组织 单细胞生物学 妊娠并发症、分娩并发症 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组学 NA 转录组数据、空间转录组数据 20名围绝经期和绝经后女性的186,120个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Gene Expression
845 2026-05-29
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2024-01-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出scDisInFact框架,用于多批次多条件单细胞RNA测序数据的解耦学习,同时实现批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测 首次通过解耦学习同时处理批次效应和条件效应,实现三个任务的统一框架 未提及具体局限性,但可能依赖数据质量且真实场景中复杂条件效应可能难以完全解耦 开发一种能够同时处理多批次单细胞RNA测序数据中技术批次效应和生物条件效应的深度学习方法 多批次多条件下的单细胞RNA测序数据,包括不同人口统计组、疾病阶段和药物处理的样本 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习框架(解耦学习) 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
846 2026-05-29
A proteome-wide screen identifies the calcium binding proteins, S100A8/S100A9, as clinically relevant therapeutic targets in aortic dissection
2024-01, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 通过蛋白质组学筛选发现S100A8/S100A9是主动脉夹层的临床相关治疗靶点 首次通过蛋白质组学筛选鉴定S100A8/A9为主动脉夹层的新治疗靶点,并验证其通过调节平滑肌细胞表型转换和炎症反应发挥作用的机制 未提及具体局限性 发现主动脉夹层的新型治疗靶点 主动脉夹层患者和对照者的升主动脉样本、小鼠主动脉夹层模型 机器学习 心血管疾病 蛋白质组学分析、ELISA、单细胞RNA测序 NA 蛋白质组学数据、循环蛋白水平、单细胞转录组数据 主动脉夹层患者与对照者样本、小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
847 2026-05-28
B cell heterogeneity in cancer comes of age
2024-Oct-14, Cancer cell IF:48.8Q1
评论 本文评论了三项最新研究,这些研究利用单细胞RNA测序技术描绘了肿瘤浸润B细胞亚群的泛癌图谱,为理解B细胞依赖性抗肿瘤免疫的深层机制铺平了道路 综合多项研究,首次定义了泛癌层面肿瘤浸润B细胞亚群的异质性,揭示了B细胞在癌症免疫中的潜在新功能 仅基于现有研究成果进行评述,未提供新的实验数据或验证结果 总结并强调近期关于B细胞异质性在癌症中作用的研究进展 肿瘤浸润B细胞亚群 机器学习和数字病理学交叉领域 癌症(泛癌) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个研究中的肿瘤样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
848 2026-05-28
Low protein diet protects the liver from Salmonella Typhimurium-mediated injury by modulating the mTOR/autophagy axis in macrophages
2024-09-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 研究低蛋白饮食对小鼠肝脏抵抗鼠伤寒沙门氏菌感染的保护作用及其机制 首次揭示低蛋白饮食通过调控巨噬细胞中mTOR/自噬轴来保护肝脏免受细菌感染损伤 NA 探究低蛋白饮食对先天免疫系统的影响及其在肝脏细菌感染中的保护机制 小鼠肝脏细胞及人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 NA 感染性疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 小鼠肝脏细胞及人外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
849 2026-05-28
Full-length single-cell BCR sequencing paired with RNA sequencing reveals convergent responses to pneumococcal vaccination
2024-09-28, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 提出一种从3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长配对BCR可变区序列的方法,并应用于分析肺炎球菌疫苗诱导的B细胞应答 首次实现从广泛使用的3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长配对BCR可变区序列,能够同时获取转录组和BCR信息,并揭示疫苗诱导的趋同应答 方法在婴儿恒河猴模型中验证,尚需在更大样本和更广泛疫苗接种场景中进一步验证 开发并验证从3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长BCR序列的方法,以解析疫苗诱导的B细胞应答特征 5只婴儿恒河猴的B细胞(针对肺炎球菌血清型3荚膜多糖的糖缀合疫苗应答) 单细胞测序、免疫学 肺炎球菌感染 单细胞RNA测序、BCR测序 NA 单细胞转录组数据、BCR序列数据 5只婴儿恒河猴 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 3'条形码单细胞RNA测序文库(具体版本未提及)
850 2026-05-28
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-06-15, Development (Cambridge, England)
评论 本文总结了2023年EMBO研讨会“发育代谢:能量、物质和信息的流动”中的关键讨论,强调了现代发育生物学面临的挑战和机遇 提出了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算建模等新技术在发育代谢领域中的应用,为探索细胞和组织特异性代谢网络、器官间代谢通信以及基因与代谢物在时空上的交互作用提供了新机会 本文为研讨会总结,未提供具体实验数据或验证,属于观点性文章 总结发育代谢领域的最新进展和未来研究方向 发育代谢中的代谢网络、器官间通信和基因-代谢物相互作用 其他 NA 代谢组学, 单细胞RNA测序, 计算建模 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
851 2026-05-28
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-05-01, Development (Cambridge, England)
综述 探讨新技术如何促进细胞类型进化研究,强调发育同源性在识别同源细胞中的重要性,并总结单细胞转录组学在细胞类型进化研究中的最新发现和未来方向 结合基因编辑和单细胞基因组学等技术突破,系统分析细胞类型进化研究的新方法,并特别关注发育同源性对鉴定同源细胞的意义 未涉及实际实验数据或模型验证,仅基于文献综述提出观点,对同源性判断的潜在误区缺乏系统性量化分析 综述细胞类型进化研究的当前进展,指出关键问题和未来探索领域 细胞类型及其进化机制,涵盖多种研究生物体的同源细胞比较 机器学习 NA 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
852 2026-05-28
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-05-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 通过Fgf18CreER谱系追踪小鼠、单细胞RNA测序等技术,鉴定新生小鼠肺部肌成纤维细胞分化程序及其在肺泡发育中的作用 首次利用Fgf18CreER谱系追踪小鼠结合单细胞RNA测序,揭示新生肺间充质细胞中一个不成熟祖细胞向成熟肌成纤维细胞分化的独特程序,并发现内源性ROSA26位点可作为肌成纤维细胞成熟的敏感报告基因 未详细说明 探究肺泡发育过程中间充质细胞亚型及其分化机制 新生小鼠肺部间充质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, Fgf18CreER谱系追踪, 细胞分选, 原代细胞培养 NA 单细胞转录组数据 新生小鼠(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
853 2026-05-28
Semi-supervised integration of single-cell transcriptomics data
2024-01-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种名为STACAS的半监督单细胞转录组数据整合方法,利用先验细胞类型知识在批量校正中保留生物变异性 首次将先验细胞类型信息纳入单细胞数据的半监督批量效应校正,在开放基准测试中优于现有无监督和完全监督方法 对不完整或不精确的输入细胞类型标签具有一定鲁棒性,但极端情况下的性能边界未明确讨论 开发一种能保留生物变异性的半监督单细胞RNA-seq批量效应校正方法 单细胞RNA-seq数据中的批量效应和细胞类型标签 机器学习 NA scRNA-seq STACAS(基于先验细胞类型的半监督整合模型) 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
854 2026-05-28
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2024-01-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用稳态、新生和单细胞RNA测序策略全面表征雄性生殖细胞群体的基因表达,揭示RNA聚合酶II暂停在精子发生和减数分裂中的关键作用 首次发现RNA聚合酶II暂停在精子分化早期建立基因活性景观的必要性,并揭示其在减数分裂中调控双链断裂形成和修复的新功能 未提供具体实验限制信息 解析雄性生殖细胞发育中基因表达的调控机制,为男性不育症治疗提供新见解 雄性小鼠生殖细胞群体 机器学习和基因组学 男性不育症 RNA-seq NA RNA表达数据(稳态、新生和单细胞) NA NA RNA-seq NA NA
855 2026-05-28
Cebp1 and Cebpβ transcriptional axis controls eosinophilopoiesis in zebrafish
2024-01-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用斑马鱼模型研究嗜酸性粒细胞的发育模式与调控机制 首次鉴定eslec为嗜酸性粒细胞谱系特异性标志物,建立Tg(eslec:eGFP)报告品系;通过单细胞RNA测序揭示嗜酸性粒细胞从祖细胞到成熟细胞的发育轨迹;发现Cebp1-Cebpβ转录轴调控嗜酸性粒细胞谱系决定和分化,并证明斑马鱼Cebp1是人C/EBPε的功能直系同源物 主要基于斑马鱼模型,结论向哺乳动物和人类的推广需进一步验证 解析嗜酸性粒细胞的发育模式、分布及转录调控机制 斑马鱼嗜酸性粒细胞谱系细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
856 2026-05-28
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-01-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究结合高质量全基因组比对和计算结构建模,分析了果蝇中新生基因的起源、进化及蛋白质结构变化,鉴定出555个新生基因候选。 首次系统性结合全基因组比对与计算结构建模,揭示果蝇亚科特异性新生基因的起源与蛋白质结构演化,并发现早期精原细胞在新生基因起源中的潜在重要角色 可能受限于基因组比对质量和结构预测准确性,部分候选基因的结构变化未充分捕捉 研究新生基因的起源、进化及蛋白质结构变化 果蝇(D. melanogaster)中果蝇亚科特异性新生基因 计算生物学, 基因组学 NA 全基因组比对, 计算结构建模, 祖先序列重建, 单细胞RNA-seq 计算结构模型 基因组序列, 蛋白质结构数据, 单细胞转录组数据 果蝇属多个物种的基因组比对数据及果蝇睾丸单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
857 2026-05-28
Trajectory inference across multiple conditions with condiments
2024-01-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出condiments方法,用于跨多个条件的单细胞RNA测序数据轨迹推断与比较 首次提出一种统一框架,整合多条件下细胞轨迹的推断、比较及基因表达差异分析,支持大规模发育进程变化及细微基因行为改变的检测 NA 开发一种跨多个生物条件(如野生型与基因敲除)进行单细胞RNA测序轨迹推断与比较的方法 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹,特别是干细胞分化过程中的细胞状态连续体 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
858 2026-05-28
A potential defensive role of TIM-3 on T lymphocytes in the inflammatory involvement of diabetic kidney disease
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 探讨T淋巴细胞上TIM-3分子在糖尿病肾病炎症发展中的潜在保护作用 首次发现外周血CD3+TIM-3+ T细胞比例与糖尿病肾病严重间质单核细胞浸润呈显著负相关,提示TIM-3可能具有保护性免疫调节功能 未明确TIM-3保护作用的具体分子机制,且研究仅基于糖尿病患者和动物模型数据,缺乏干预实验验证 阐明TIM-3在T淋巴细胞上对糖尿病肾病炎症进展的调控作用及其作为生物标志物的潜力 糖尿病肾病患者及糖尿病肾病小鼠模型 免疫学 糖尿病肾病 流式细胞术、免疫荧光染色、单细胞测序 NA 外周血样本、肾组织样本、单细胞测序数据 360例成人糖尿病肾病患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
859 2026-05-28
Single-cell RNA-seq reveals T cell exhaustion and immune response landscape in osteosarcoma
2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤中T细胞耗竭和免疫反应景观 首次系统性地利用单细胞RNA-seq数据分析骨肉瘤微环境中CD8+ T细胞的耗竭情况,并基于三个耗竭相关基因(RAD23A, SAC3D1, PSIP1)构建预后模型,该模型在多个数据集中验证了其预测骨肉瘤预后的能力 研究主要依赖公共数据库数据,可能受限于数据质量和样本代表性,且T细胞耗竭模型需在更大规模前瞻性队列中进一步验证 探究骨肉瘤中T细胞耗竭与免疫抑制及肿瘤进展的关系,并构建预后模型 骨肉瘤患者肿瘤微环境中的CD8+ T细胞及其耗竭相关基因 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序 机器学习算法 基因表达数据 GEO数据库中的骨肉瘤单细胞RNA-seq数据,以及TARGETs和Meta队列 NA 单细胞RNA-seq NA 来自GEO数据库的单细胞RNA-seq数据
860 2026-05-28
Cell-Specific Targeting of the Endothelium in the Cardiorenal Syndrome
2024, Cardiorenal medicine IF:2.4Q2
综述 本文探讨了心肾综合征中血管内皮的细胞特异性靶向策略,包括基于基因、细胞和纳米技术的新型疗法,以及空间转录组学等技术在靶向治疗中的应用 提出通过细胞特异性内皮靶向的病毒载体进行基因治疗,可避免脱靶效应并改善治疗耐药性 未提及具体实验数据或临床验证,缺乏对靶向技术实际应用中的安全性及长期效果的深入讨论 阐述心肾综合征中内皮细胞作为治疗靶点的潜力,并介绍新兴的靶向治疗方法 血管内皮细胞及心肾疾病模型 机器学习 心血管疾病, 肾脏疾病 测序, 空间转录组学 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
回到顶部