本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-10-06 |
Improved therapeutic consistency and efficacy of CD317+ MSCs through stabilizing TSG6 by PTX3
2024-03-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03706-3
PMID:38539221
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CD317+ MSC亚群具有增强的免疫抑制活性,其比例与MSC治疗效果一致性密切相关 | 首次揭示CD317+ MSC亚群通过PTX3稳定TSG6蛋白的机制改善治疗一致性 | 未明确PTX3稳定TSG6的具体分子机制 | 研究MSC异质性和治疗不一致性的原因及解决方案 | 人间充质干细胞(MSCs)及其CD317+亚群 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同批次培养基扩增的MSCs | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 822 | 2025-10-06 |
Short cell cycle duration is a phenotype of human epidermal stem cells
2024-03-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-03670-y
PMID:38475896
|
研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单细胞RNA测序发现人类表皮干细胞具有较短的细胞周期持续时间 | 挑战了干细胞分裂缓慢的传统观点,发现表皮干细胞比更分化的祖细胞具有更短的细胞周期 | 研究仅限于体外培养的人类角质形成细胞,未涉及体内环境验证 | 探究人类表皮干细胞的细胞周期特征和增殖行为 | 人类角质形成细胞,包括干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 活细胞成像,单细胞RNA测序 | NA | 图像数据,基因表达数据 | 原代培养的人类角质形成细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 823 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic stimulates bone marrow vascular and stromal niches to mitigate acute radiation syndrome
2024-Feb-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3946910/v1
PMID:38463959
|
研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过调节骨髓血管和基质微环境促进造血系统恢复以缓解急性放射综合征的机制 | 首次阐明TPOm通过调控骨髓血管和基质微环境支持造血干细胞再生的作用机制,并发现其能提升VEGF-C水平和增强间充质干细胞胶原蛋白表达 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 研究血小板生成素模拟物在急性放射综合征治疗中对骨髓微环境的调节作用 | C57BL/6J小鼠的骨髓造血干细胞、血管内皮细胞和间充质基质细胞 | 放射医学 | 急性放射综合征 | 流式细胞术、全组织块共聚焦显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据、生存数据 | 9-14周龄C57BL/6J小鼠,在多个时间点(第4、7、10、14、18、21天)采集骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 824 | 2025-10-06 |
B-cell-directed CAR T-cell therapy activates CD8+ cytotoxic CARneg bystander T cells in patients and nonhuman primates
2024-07-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022717
PMID:38558106
|
研究论文 | 本研究首次全面鉴定并分析了B细胞靶向CAR T细胞治疗后CD8+ CARneg旁观者T细胞的激活机制及其抗白血病作用 | 首次发现CAR T细胞治疗可激活CD8+ CARneg旁观者T细胞,并揭示其通过T细胞受体非依赖性机制杀伤白血病细胞 | 样本量有限,机制研究仍需进一步验证 | 探究B细胞靶向CAR T细胞治疗中旁观者T细胞的激活机制及其在抗肿瘤反应中的作用 | 非人灵长类动物和患者来源的T细胞 | 免疫治疗 | B细胞恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 非人灵长类模型和临床试验NCT03369353患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 825 | 2025-10-06 |
Identification of a novel de novo mutation in SOX4 for syndromic tooth agenesis
2024-04-30, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-024-05659-6
PMID:38684576
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序在Coffin-Siris综合征患者中发现了一个新的SOX4基因从头突变,并探索了其在综合征性牙齿缺失中的作用机制 | 首次报道SOX4错义突变导致综合征性牙齿缺失,通过单细胞RNA测序和WGCNA分析验证了SOX4在牙齿发育中的关键作用 | 研究仅基于单个患者病例,样本量有限,需要更多病例验证 | 识别导致综合征性牙齿缺失的致病突变并探索其调控机制 | Coffin-Siris综合征患者和小鼠牙齿发育模型 | 遗传学 | Coffin-Siris综合征 | 全外显子测序, Sanger测序, 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, WGCNA分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | 1名中国CSS患者和小鼠牙齿发育样本 | NA | 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 826 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics link gene expression signatures to clinicopathological features of gonadotroph and lactotroph PitNET
2024-Nov-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05821-4
PMID:39548496
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析揭示促性腺激素细胞和泌乳素细胞垂体神经内分泌肿瘤的基因表达特征与临床病理特征的关联 | 首次在单细胞水平系统比较促性腺激素细胞和泌乳素细胞PitNET的肿瘤微环境差异,发现SPP1+巨噬细胞和增殖性淋巴细胞等新型细胞亚群与肿瘤侵袭性的关联 | 样本量相对有限(7例促性腺激素细胞和3例泌乳素细胞肿瘤),需更大规模验证 | 探究垂体神经内分泌肿瘤微环境细胞组成与肿瘤侵袭行为的关系 | 促性腺激素细胞和泌乳素细胞垂体神经内分泌肿瘤患者 | 单细胞转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,免疫组织化学染色 | 差异表达分析,基因表达程序识别 | 单细胞转录组数据,批量转录组数据,组织切片图像 | 10例单细胞测序样本(7例促性腺激素细胞+3例泌乳素细胞),134例批量RNA-seq验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 827 | 2025-10-06 |
The novel potential therapeutic target PSMP/MSMP promotes acute kidney injury via CCR2
2024-Jul-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.05.028
PMID:38796708
|
研究论文 | 研究发现PSMP/MSMP通过CCR2促进急性肾损伤,可能成为治疗新靶点 | 首次揭示PSMP在急性肾损伤中的关键作用机制,证明其通过CCR2介导巨噬细胞浸润和M1极化 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究PSMP在急性肾损伤中的作用机制及治疗潜力 | 急性肾损伤患者样本和AKI小鼠模型 | 生物医学研究 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肾组织、尿液和血浆样本,多种AKI小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 828 | 2025-10-06 |
S100A8/A9hi neutrophils induce mitochondrial dysfunction and PANoptosis in endothelial cells via mitochondrial complex I deficiency during sepsis
2024-06-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06849-6
PMID:38942784
|
研究论文 | 本研究揭示了S100A8/A9高表达中性粒细胞通过线粒体复合物I缺陷诱导内皮细胞线粒体功能障碍和PANoptosis的机制 | 首次阐明S100A8/A9通过下调Nrf1抑制线粒体复合物I组分Ndufa3表达,进而导致线粒体功能障碍并激活ZBP1介导的PANoptosis | 机制研究主要在细胞水平进行,需要更多体内实验验证 | 探讨S100A8/A9在脓毒症中诱导内皮功能障碍的分子机制 | 中性粒细胞和内皮细胞 | 细胞生物学 | 脓毒症 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 829 | 2025-10-06 |
Multiomics integration-based immunological characterizations of adamantinomatous craniopharyngioma in relation to keratinization
2024-06-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06840-1
PMID:38906852
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学对牙釉质型颅咽管瘤进行多组学整合分析,揭示其免疫微环境特征 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术系统解析ACP免疫微环境,发现GPNMB高表达的非小胶质细胞来源TAM与RHCG上皮细胞的共定位关系 | 样本数量有限,需要更大队列验证研究结果 | 阐明牙釉质型颅咽管瘤的免疫微环境特征及其与角质化的关系 | 牙釉质型颅咽管瘤标本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学, asmFISH | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 58,081个细胞核 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 830 | 2025-10-06 |
CSTF3 contributes to platinum resistance in ovarian cancer through alternative polyadenylation of lncRNA NEAT1 and generating the short isoform NEAT1_1
2024-06-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06816-1
PMID:38898019
|
研究论文 | 本研究揭示了CSTF3通过调控lncRNA NEAT1的可变多聚腺苷酸化促进卵巢癌铂类耐药的新机制 | 首次发现CSTF3通过调控NEAT1的可变多聚腺苷化生成短异构体NEAT1_1,从而促进卵巢癌铂类耐药 | 研究主要基于公共数据库的单细胞RNA测序数据和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索卵巢癌铂类耐药的分子机制,寻找潜在生物标志物和治疗策略 | 卵巢癌患者的铂类耐药和敏感组织,卵巢癌细胞系 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,基因敲低,基因过表达 | 细胞系模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的卵巢癌患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 831 | 2025-10-06 |
CXCR7 activation evokes the anti-PD-L1 antibody against glioblastoma by remodeling CXCL12-mediated immunity
2024-06-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06784-6
PMID:38898023
|
研究论文 | 本研究通过激活CXCR7受体重塑CXCL12介导的免疫反应,增强抗PD-L1抗体对胶质母细胞瘤的疗效 | 首次发现CXCR7作为CXCL12的非典型受体可负调控CXCL12表达,并证实选择性CXCR7激动剂VUF11207能逆转GAMs诱导的免疫抑制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证 | 探索通过靶向肿瘤-巨噬细胞相互作用来增强胶质母细胞瘤免疫治疗效果的机制 | 胶质母细胞瘤细胞、胶质母细胞瘤相关巨噬细胞(GAMs)、CD8 T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序、转录组分析、体外共培养系统 | 小鼠胶质母细胞瘤模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 未明确样本数量,包括复发胶质母细胞瘤标本、公共数据库数据集和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 832 | 2025-10-06 |
Chemerin attracts neutrophil reverse migration by interacting with C-C motif chemokine receptor-like 2
2024-06-18, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06820-5
PMID:38890311
|
研究论文 | 本研究揭示了趋化因子chemerin通过与其受体CCRL2相互作用吸引中性粒细胞反向迁移的机制 | 首次发现中性粒细胞反向迁移过程中CCRL2表达上调,并证实chemerin-CCRL2轴在此过程中的关键作用 | 研究主要基于动物模型,人类临床相关性有待验证;反向迁移的生理病理意义需进一步探索 | 探索中性粒细胞反向迁移的分子机制 | 中性粒细胞及其反向迁移现象 | 免疫学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序,体内细胞追踪 | NA | 基因表达数据,细胞追踪数据 | 急性肺损伤模型和气囊模型中的白细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 833 | 2025-10-06 |
The Mohawk homeobox gene represents a marker and osteo-inhibitory factor in calvarial suture osteoprogenitor cells
2024-06-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06813-4
PMID:38886383
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现Mohawk同源盒基因是颅骨缝间充质祖细胞的标记物,并作为骨生成抑制因子调控骨修复过程 | 首次发现Mkx基因在成年颅骨缝中标记具有肌腱/韧带相关基因表达的祖细胞群,并揭示其作为力学响应基因抑制骨分化的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的功能验证尚需进一步研究 | 探索颅骨缝间充质祖细胞的分子标记及其在骨修复中的调控机制 | 小鼠颅骨缝细胞 | 单细胞生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 834 | 2025-10-06 |
Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma
2024-06-17, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06699-2
PMID:38886351
|
研究论文 | 本研究开发了一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略,通过调控SAMD4B-APOA2-PD-L1轴增强抗肿瘤免疫 | 首次提出基于三种常用抗肿瘤药物的协同免疫化疗方案,并揭示了通过SAMD4B介导的2'-O-甲基化修饰调控APOA2-PD-L1轴的免疫调节新机制 | 研究主要在PDX小鼠模型中进行,临床验证样本有限 | 开发有效的肝细胞癌协同免疫化疗策略并阐明其作用机制 | 肝细胞癌患者和PDX小鼠模型 | 癌症免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 2'-O-甲基化修饰, 多重免疫荧光染色 | PDX小鼠模型 | 基因表达数据, 免疫染色图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 835 | 2025-10-06 |
MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing
2024-06-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06775-7
PMID:38866777
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现MAL2在肝内胆管癌中特异性富集并通过EGFR/SREBP-1通路重编程脂质代谢 | 首次揭示MAL2通过稳定EGFR膜定位激活PI3K/AKT/SREBP-1轴促进脂质积累的机制,并筛选出小分子抑制剂sarizotan | 未明确说明样本量大小及临床验证的局限性 | 探究MAL2在肝内胆管癌发生发展中的作用机制及治疗潜力 | 肝内胆管癌细胞及构建的类器官模型 | 单细胞测序 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、代谢组学、分子对接、Co-IP | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 836 | 2025-10-06 |
Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration
2024-Mar-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1
PMID:38585871
|
研究论文 | 本研究通过时序单细胞测序分析揭示了表达GPNMB的巨噬细胞在促进肌肉再生中的关键作用 | 首次通过时序单细胞RNA测序识别了表达GPNMB的独特巨噬细胞亚群,并证明其在肌肉再生中的直接功能作用 | 巨噬细胞表型多样性和特化亚群向消退期巨噬细胞转化的机制仍需进一步研究 | 探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能作用 | 骨骼肌损伤模型中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肌肉损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同时间点的骨骼肌单个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 837 | 2025-10-06 |
Tppp3 is a novel molecule for retinal ganglion cell identification and optic nerve regeneration
2024-12-29, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01917-6
PMID:39734233
|
研究论文 | 本研究探索Tppp3分子在视网膜神经节细胞识别和视神经再生中的作用 | 首次揭示Tppp3在哺乳动物视网膜神经节细胞中的表达及其促进轴突再生的功能 | 研究仅限于啮齿类动物模型,尚未在更高等的哺乳动物中进行验证 | 探索促进中枢神经系统轴突再生的分子调控机制 | 视网膜神经节细胞(RGCs) | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠、猕猴和人类视网膜神经节细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 838 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics in focal cortical dysplasia type IIb
2024-11-30, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-024-01897-7
PMID:39614299
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术探索了局灶性皮质发育不良IIb型中畸形神经元和气球细胞区域的转录组变化 | 首次在FCD IIb患者新鲜冷冻脑样本中应用空间转录组学技术,构建了畸形神经元和气球细胞区域的空间转录图谱 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大样本验证研究结果 | 研究FCD IIb病变中关键细胞区域的转录组特征及其在癫痫发生中的作用 | 局灶性皮质发育不良IIb型患者的脑组织样本 | 空间转录组学 | 癫痫 | 空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据,蛋白质表达数据 | 3例FCD IIb患者的新鲜冷冻脑样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 839 | 2025-10-06 |
TLR8 agonist selgantolimod regulates Kupffer cell differentiation status and impairs HBV entry into hepatocytes via an IL-6-dependent mechanism
2024-Nov-11, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2023-331396
PMID:38697771
|
研究论文 | 本研究揭示了TLR8激动剂selgantolimod通过调节Kupffer细胞分化状态和IL-6依赖机制抑制HBV进入肝细胞的作用机制 | 首次发现SLGN通过Kupffer细胞介导的IL-6依赖性机制下调肝细胞NTCP表达并抑制HBV进入 | 研究主要基于体外实验和公共数据库分析,需要进一步体内验证 | 表征SLGN在肝脏微环境中诱导的转录组变化和细胞间通讯事件 | 人类肝脏Kupffer细胞和肝细胞 | 免疫学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 细胞因子分析 | NA | 转录组数据, 细胞因子数据 | 使用公共单细胞RNA-seq数据和HBV感染患者转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 840 | 2025-10-06 |
Validation of an organ mapping antibody panel for cyclical immunofluorescence microscopy on normal human kidneys
2024-Jul-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00426.2023
PMID:38721662
|
研究论文 | 验证用于正常人肾脏循环免疫荧光显微镜检查的器官定位抗体组合 | 开发标准化抗体验证方法,建立可识别18种主要细胞类型和5种细胞外基质区室的器官定位抗体组合,实现无需专业仪器的多重成像 | NA | 解决抗体验证标准化问题,提高人类研究的可重复性 | 正常人肾脏组织 | 数字病理 | NA | 循环免疫荧光显微镜检查 | NA | 图像 | NA | NA | 免疫荧光显微镜,空间转录组学,成像质谱 | NA | 荧光显微镜和数字扫描仪 |