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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2026-06-02 |
CopyMix: Mixture model based single-cell clustering and copy number profiling using variational inference
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出CopyMix模型，通过变分推断同时进行单细胞聚类和拷贝数变异分析，以研究肿瘤异质性 | 首次通过变分推断联合推断细胞聚类及其拷贝数谱，避免了传统分步处理中引入的人为聚类伪影 | 未明确说明局限性 | 开发一种能同时进行单细胞聚类和拷贝数谱推断的方法，以更好地研究肿瘤异质性 | 肿瘤细胞亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞DNA测序 | 混合隐马尔可夫模型 | 拷贝数数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 782 | 2026-06-02 |
Deconvolution of cell-type-associated markers predictive of response to neoadjuvant radiotherapy
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据，对直肠癌新辅助放疗前样本进行细胞类型解卷积，识别预测放疗反应的细胞类型相关标记 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据，系统解析了直肠癌新辅助放疗响应的细胞类型特异性标记及其相互作用网络 | 未明确说明具体局限性 | 揭示直肠癌放疗后耐药和复发的细胞来源分子标记及治疗靶点 | 直肠癌患者新辅助放疗前的肿瘤样本 | 数字病理学, 机器学习 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 三个独立数据集（GSE119409、GSE35452、GSE45404） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 783 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals myeloid and T cell co-stimulation mediated by IL-7 anti-cancer immunotherapy
2024-05, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02617-7
PMID:38424167
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示IL-7抗癌免疫疗法介导的髓系细胞和T细胞共刺激作用 | 首次发现IL-7受体在T细胞、巨噬细胞和树突状细胞上的多效性表达，并证明重组IL-7疗法通过激活T细胞和促炎性髓系细胞诱导抗肿瘤免疫 | 检查点抑制剂的靶点缺乏表达和免疫抑制细胞的持续存在限制了其普遍疗效 | 探索IL-7疗法作为替代方法共刺激T细胞和免疫微环境以克服检查点抑制剂的局限性 | 多种人类癌症和鼠肿瘤移植模型的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种人类癌症样本和鼠肿瘤移植模型样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 784 | 2026-06-02 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-05-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序表征小鼠肾淋巴内皮细胞在静息和顺铂损伤肾中的反应，首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的分子通路 | 首次描述肾淋巴内皮细胞异质性并揭示其调节AKI局部免疫反应的新分子通路，为AKI治疗提供潜在靶点 | 仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；仅分析了顺铂损伤后72小时时间点，未涵盖AKI全病程 | 探究肾淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的反应及其免疫调节作用 | 小鼠肾淋巴内皮细胞（顺铂损伤和缺血再灌注损伤模型）及体外培养人淋巴内皮细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏样本（顺铂损伤组和对照组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 785 | 2026-06-02 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
|
综述 | 本综述通过空间组织分析技术探讨了组织微环境与免疫病理学的关系，强调了多组学组织学和空间转录组学在研究免疫反应中的重要性 | 综合讨论了空间组织分析技术相较于传统组织病理学研究的优势，并指出了其在疾病诊断和治疗中的革命性潜力 | 承认了空间组织分析技术存在挑战和局限性 | 探讨空间组织分析技术如何揭示组织微环境调控区域免疫的机制，及其在组织免疫病理学中的相关性 | 组织微环境、免疫反应、空间组织分析技术 | 计算机视觉, 机器学习 | 癌症, 自身免疫性疾病, 感染性疾病 | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学, 多重组织学 | NA | NA |
| 786 | 2026-06-02 |
Distinct immune escape and microenvironment between RG-like and pri-OPC-like glioma revealed by single-cell RNA-seq analysis
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1017-7
PMID:37955814
|
研究论文 | 通过单细胞RNA-seq分析揭示RG样和pri-OPC样胶质瘤之间不同的免疫逃逸和微环境特征 | 首次将胶质瘤分为原始少突胶质前体细胞样和放射状胶质样亚型，并发现它们在免疫逃逸机制上的显著差异，尤其是pri-OPC样肿瘤中MHC-I基因下调以及肿瘤浸润淋巴细胞中特定基因表达与免疫检查点和不良预后的关联 | 样本量较小，仅基于26例胶质瘤的单细胞RNA-seq分析，且结论主要依赖公共数据库验证，可能缺乏广泛的临床代表性 | 研究神经发生和胶质发生与胶质瘤的关系，揭示不同胶质瘤亚型的免疫逃逸机制 | 26例胶质瘤样本及其肿瘤浸润淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组表达数据 | 26例胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 787 | 2026-06-02 |
Tumor-derived exosomes induce initial activation by exosomal CD19 antigen but impair the function of CD19-specific CAR T-cells via TGF-β signaling
2024-Feb, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-023-1010-1
PMID:37870681
|
研究论文 | 研究了肿瘤来源外泌体通过外泌体CD19抗原诱导初始激活，但通过TGF-β信号损害CD19特异性CAR-T细胞功能 | 首次揭示了B细胞淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞的双重作用：初始激活与后续抑制，并发现TGF-β抑制剂可逆转抑制作用 | 未明确外泌体诱导CAR-T细胞凋亡和功能损害的具体分子机制细节 | 探究淋巴瘤来源外泌体对CD19-CAR T细胞功能的影响及其机制 | B细胞淋巴瘤来源外泌体、CD19-CAR T细胞、淋巴瘤患者血浆外泌体 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究对象包括来自淋巴瘤患者的血浆外泌体及CD19-CAR T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 788 | 2026-06-02 |
Underrepresentation of activating KIR gene expression in single-cell RNA-seq data is due to KIR gene misassignment
2024-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350590
PMID:37944995
|
研究论文 | 研究指出标准单细胞RNA测序比对流程易将杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIR）转录本错误分配，导致活化型KIR基因表达被低估 | 首次揭示单细胞RNA-seq数据中KIR基因错误分配是导致激活型KIR表达被低估的根本原因 | 未提供具体解决方案或替代比对算法来纠正KIR基因错误分配问题 | 阐明单细胞RNA-seq数据中KIR基因表达低估的机制原因 | KIR基因转录本及单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 789 | 2026-06-02 |
Macrophage heterogeneity in atherosclerosis: A matter of context
2024-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350464
PMID:37943053
|
综述 | 探讨动脉粥样硬化中巨噬细胞的异质性与功能特化及其与微环境的关系 | 强调巨噬细胞在动脉粥样硬化中具有高度异质性和功能特化，并指出传统炎症/抗炎范式不足以解释其复杂致病机制，提出空间多组学方法的重要性 | 对局部微环境在动脉粥样硬化中塑造巨噬细胞表型和功能的作用仍大多未被描述 | 综述巨噬细胞在动脉粥样硬化中的起源、功能特化、表型多样性及微环境的影响 | 巨噬细胞亚群（小鼠和人类动脉粥样硬化模型中的斑块巨噬细胞） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3' |
| 790 | 2026-06-01 |
Airway-derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD
2024-Dec, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02071-2023
PMID:39147413
|
研究论文 | 发现了一种位于肺泡远端囊泡中的特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），该细胞在COPD中表现出再生潜力受损，并可能成为新的治疗靶点 | 首次发现并描述了一种同时表达肺泡标记物表面活性蛋白C和club细胞标记物SCGB3A2的肺气肿特异性ATII细胞亚群（asATII细胞），并在小鼠模型中证实其来源于club细胞 | 未提及具体研究局限，但基于摘要可推断可能包括：研究主要在体外类器官模型中进行，缺乏体内功能验证；样本量及临床相关性有待进一步确认 | 探究COPD肺气肿中组织再生受损的驱动因素，特别是肺上皮祖细胞异常 | COPD患者和健康对照的肺泡II型（ATII）细胞及气道club细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、谱系标记 | NA | 基因表达数据 | 人及小鼠样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 791 | 2026-06-01 |
Graph attention automatic encoder based on contrastive learning for domain recognition of spatial transcriptomics
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07037-0
PMID:39424696
|
研究论文 | 提出了一种基于图注意力自动编码器和对比学习的空间转录组数据域识别方法GAAEST | 引入自监督对比学习从局部、全局和上下文三个层次捕捉空间信息，显著提升空间域识别性能 | 未明确讨论方法的计算开销或对大规模数据集的扩展性 | 从空间转录组数据中准确识别空间域 | 空间转录组数据的空间域识别 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力自动编码器 (GAAEST) | 基因表达数据，空间位置信息 | 基于多个数据集进行实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 792 | 2026-06-01 |
Insights into the molecular characteristics of embryonic cranial neural crest cells and their derived mesenchymal cell pools
2024-10-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07056-x
PMID:39424998
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示胚胎颅神经嵴细胞及其衍生间充质细胞池的分子特征 | 首次发现鹿茸源性祖细胞与牙髓间充质细胞在转录组特征上的惊人相似性，并揭示全基因组DNA甲基化分析中再生性鹿茸骨膜中CNCC衍生特征基因的低甲基化现象 | 未明确提及 | 研究颅神经嵴细胞衍生间充质细胞的分子特征及其再生潜力 | 鹿的牙齿和鹿茸组织中的颅神经嵴衍生间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、全基因组DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据、DNA甲基化数据 | 未明确说明样本数量，涉及鹿的牙齿和鹿茸组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 793 | 2026-06-01 |
scRNA-Explorer: An End-user Online Tool for Single Cell RNA-seq Data Analysis Featuring Gene Correlation and Data Filtering
2024-09-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168654
PMID:39237193
|
研究论文 | 提出了面向最终用户的单细胞RNA-seq数据在线分析工具scRNA-Explorer，支持基因相关性分析和数据过滤 | 开发了交互式在线工具，整合基因相关性分析、生物学重要性评估和基因富集分析，简化了单细胞RNA-seq数据的下游分析 | NA | 简化单细胞RNA-seq数据分析流程，提供面向非专业用户的交互式在线分析工具 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 794 | 2026-06-01 |
Loss of cell junctional components and matrix alterations drive cell desquamation and fibrotic changes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.17.599411
PMID:38948715
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和空间蛋白质组学分析，揭示了特发性肺纤维化中细胞连接成分丢失和基质改变导致上皮脱屑和纤维化变化 | 首次鉴定了IPF中远端细支气管上皮脱屑现象，并揭示了细胞连接丢失与基质失调之间的相互作用机制 | NA | 探究特发性肺纤维化中上皮脱屑的分子机制 | IPF患者和健康对照的远端细支气管上皮细胞和基底膜 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | IPF患者和健康对照的肺组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 795 | 2026-06-01 |
Progress of single-cell RNA sequencing combined with spatial transcriptomics in tumour microenvironment and treatment of pancreatic cancer
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05307-3
PMID:38867230
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序结合空间转录组学在胰腺癌肿瘤微环境和治疗中的研究进展 | 系统阐述了scRNA-seq与ST联合分析在揭示肿瘤异质性和细胞间相互作用中的互补优势，特别是在胰腺癌治疗中的新见解 | 单细胞RNA测序无法获取细胞的空间位置信息，需依赖空间转录组学进行补充 | 总结单细胞RNA测序与空间转录组学在胰腺癌肿瘤微环境和治疗中的应用进展 | 胰腺癌的肿瘤微环境及治疗相关研究 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | 转录组数据， 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 796 | 2026-06-01 |
Lysine acetyltransferase 14 mediates TGF-β-induced fibrosis in ovarian endometrioma via co-operation with serum response factor
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05243-2
PMID:38867256
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研究论文 | 研究揭示了赖氨酸乙酰转移酶14通过与血清响应因子协同作用，介导TGF-β诱导的卵巢子宫内膜瘤纤维化 | 首次发现KAT14通过与SRF相互作用，增强组蛋白H4乙酰化，促进α-SMA表达，从而驱动TGF-β诱导的纤维化进程，并验证了KAT14/SRF复合物在子宫内膜瘤纤维化中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 阐明KAT14在TGF-β诱导的卵巢子宫内膜瘤纤维化中的分子机制 | 卵巢子宫内膜瘤患者的异位病灶、永生化人子宫内膜间质细胞、原代异位子宫内膜间质细胞、小鼠子宫内膜异位症模型 | 数字病理学 | 卵巢子宫内膜瘤 | 基因过表达、敲除、敲低、腺相关病毒介导的基因沉默、单细胞转录组测序 | NA | 图像 | 子宫内膜瘤患者和健康对照者的子宫内膜活检样本、已发表的子宫内膜异位症单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 797 | 2026-06-01 |
Macrophage and fibroblast trajectory inference and crosstalk analysis during myocardial infarction using integrated single-cell transcriptomic datasets
2024-06-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05353-x
PMID:38867219
|
research paper | 通过整合单细胞转录组数据集，分析心肌梗死后巨噬细胞和成纤维细胞的轨迹及其相互作用 | 首次利用多个单细胞RNA测序数据集的综合分析，揭示了心肌梗死后ECM生成成纤维细胞亚群（修复性心脏成纤维细胞和基质成纤维细胞）的动态变化和转录特征，并发现了SPP1hi巨噬细胞与成纤维细胞在胶原沉积和瘢痕形成中的特定相互作用 | 仅基于公开数据集进行二次分析，缺乏大样本前瞻性验证；动物模型和体外实验的验证范围有限，可能无法完全反映人类疾病复杂性 | 阐明心肌梗死后巨噬细胞和成纤维细胞亚群的异质性、分化轨迹及细胞间相互作用 | 心肌梗死后的心脏组织样本（人类和小鼠）中的巨噬细胞和成纤维细胞 | machine learning | cardiovascular disease | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, scVelo, PAGA, Slingshot, CellphoneDB, NicheNet, immunofluorescence staining | NA | gene expression data | 12个不同研究的单细胞和单核RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq | NA | NA |
| 798 | 2026-06-01 |
Unveiling novel cell clusters and biomarkers in glioblastoma and its peritumoral microenvironment at the single-cell perspective
2024-06-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05313-5
PMID:38851695
|
研究论文 | 从单细胞视角揭示胶质母细胞瘤及其瘤周微环境中的新型细胞群和生物标志物 | 首次在单细胞水平上描绘了胶质母细胞瘤不同区域（肿瘤与瘤周）的细胞景观，发现了具有线粒体基因高表达的增殖性少突胶质细胞群以及两种不同表型的髓系细胞群，并识别出XIST、KCNH7、SYT1和DIAPH3作为潜在恶性细胞增殖相关因子 | 研究样本量较小，仅来自4名患者，可能无法完全代表胶质母细胞瘤的异质性；此外，研究结果尚需在更大样本和临床环境中验证 | 从单细胞视角揭示胶质母细胞瘤及其瘤周微环境的细胞组成和异质性，为精准治疗提供理论基础 | 4名胶质母细胞瘤患者的8个组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 10x单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名患者的8个组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞转录组测序 |
| 799 | 2026-06-01 |
Decoding the universal human chromatin landscape through teratoma-based profiling
2024-04-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae021
PMID:38281248
|
研究论文 | 本研究通过畸胎瘤分析，整合人类胚胎干细胞来源畸胎瘤的表观基因组和转录组，构建表观遗传特征矩阵，并利用单细胞多组学图谱揭示组织异质性 | 首次构建基于畸胎瘤的全人类染色质图谱，整合单细胞多组学（RNA-Seq和ATAC-Seq）与组织学数字染色工具，实现细胞类型注释和表观遗传景观量化 | 未提及，可能涉及畸胎瘤模型的生理相关性或样本规模限制 | 解析人类畸胎瘤的表观基因组和转录组景观，建立通用性染色质状态模型 | 人类胚胎干细胞来源的畸胎瘤组织及其细胞类型 | 数字病理学, 单细胞组学 | NA | RNA-seq, scRNA-seq, scATAC-seq, 组织学数字染色 | CNN, 特征矩阵模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 组织学图像 | 基于畸胎瘤样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞多组学平台用于scRNA-Seq和scATAC-Seq分析 |
| 800 | 2026-06-01 |
q-Diffusion leverages the full dimensionality of gene coexpression in single-cell transcriptomics
2024-04-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06104-w
PMID:38565955
|
研究论文 | 提出q-diffusion框架，利用单细胞转录组中基因共表达的完整维度，提升数据分析效果 | 首次提出能捕获整个基因库共表达结构的q-diffusion框架，在统计显著性、分类精度和聚类效果上超越现有方法 | 未明确说明局限 | 开发一种能充分利用单细胞RNA测序数据全维度信息的方法，以增强细胞生物学理解 | 转移性结直肠癌患者、外周血单个核细胞（PBMC）、人类皮层组织 | 机器学习 | 转移性结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | q-diffusion | 基因表达数据 | CALGB/SWOG 80405临床试验样本、体外PBMC数据集、Tabula Sapiens人类图谱、空间scRNAseq人皮层组织数据 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |