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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing highlights epithelial and microenvironmental heterogeneity in malignant progression of pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216607
PMID:38246225
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析胰腺导管腺癌恶性进展过程中的上皮细胞和微环境异质性 | 首次在单细胞水平揭示IPMN向PDAC进展过程中上皮细胞和肿瘤微环境的异质性变化,发现SPP1-CD44通路在PDAC中显著增强 | 样本量相对有限(仅5个手术切除样本),需要更大队列验证发现 | 解析胰腺导管腺癌恶性进展的细胞分子机制 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)和胰腺导管腺癌(PDAC)患者手术样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 35,693个细胞,来自3个高级别IPMN和2个IPMN来源的PDAC | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞测序技术 |
| 782 | 2025-10-06 |
Advanced insights on tumor-associated macrophages revealed by single-cell RNA sequencing: The intratumor heterogeneity, functional phenotypes, and cellular interactions
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216610
PMID:38244910
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示肿瘤相关巨噬细胞异质性、功能表型和细胞相互作用方面的最新研究进展 | 从发育角度系统总结TAM表型和功能变化,深入理解TAM在肿瘤微环境中的意义 | NA | 探讨单细胞RNA测序在肿瘤相关巨噬细胞研究中的应用和意义 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 783 | 2024-09-25 |
Unveiling Molecular Diversity in Cerebral Thrombi via Spatial Transcriptomics
2024-10, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.047907
PMID:39206540
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 784 | 2025-10-06 |
COPD basal cells are primed towards secretory to multiciliated cell imbalance driving increased resilience to environmental stressors
2024-05-20, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thorax-2022-219958
PMID:38286613
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研究论文 | 本研究揭示了COPD患者基底细胞向分泌型细胞分化失衡的分子机制及其对环境应激的增强耐受性 | 首次发现COPD-IV期基底细胞存在独特的分子特征,包括KRT5和LAMB3表达上调及Wnt/Notch信号通路激活,驱动分泌型与多纤毛细胞失衡 | 样本量较小(COPD-IV n=4,COPD-II n=3,健康对照n=4),且仅针对特定环境纳米颗粒进行研究 | 阐明环境污染物作用下COPD患者支气管上皮细胞的耐受机制 | 原发性人支气管上皮细胞(pHBECs) | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞转录组测序,功能分析,蛋白质分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 11例人支气管上皮细胞样本(4例COPD-IV期,3例COPD-II期,4例健康对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 785 | 2025-10-06 |
Identifying ADGRG1 as a specific marker for tumor-reactive T cells in acute myeloid leukemia
2024-Sep-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00560-0
PMID:39243082
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术鉴定ADGRG1作为急性髓系白血病中肿瘤反应性T细胞的特异性标志物 | 首次发现ADGRG1可作为CD8+肿瘤反应性T细胞的特定标志物,并通过小鼠模型和CAR-T系统验证其功能 | 研究样本仅限于RUNX1::RUNX1T1融合基因的AML患者,需要更广泛的患者群体验证 | 探索急性髓系白血病中肿瘤反应性T细胞的特征和特异性标志物 | 新诊断AML患者的骨髓T细胞和Runx1; Mx1-Cre小鼠模型 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | STARTRAC-like算法 | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 新诊断RUNX1::RUNX1T1融合基因AML患者的骨髓T细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | NA | NA |
| 786 | 2025-10-06 |
Recent developments and new directions in the use of natural products for the treatment of inflammatory bowel disease
2024-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.155812
PMID:38905845
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综述 | 系统回顾天然产物治疗炎症性肠病的最新研究进展 | 整合现代技术(如宏基因组学、单细胞测序、靶点识别和药物递送系统)推动天然产物在IBD治疗中的应用 | 天然产物在临床转化和药物开发方面仍面临挑战 | 探索天然产物治疗炎症性肠病的新方向 | 多酚、生物碱、萜类、醌类等天然产物 | NA | 炎症性肠病 | 宏基因组学, 单细胞测序, 靶点识别技术, 药物递送系统 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 787 | 2025-10-06 |
RAS/RAF landscape in monoclonal plasma cell conditions
2024-07-11, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023022295
PMID:38643494
|
研究论文 | 通过分析10,000多名浆细胞疾病患者的RAS/RAF基因突变情况,揭示了该通路在多发性骨髓瘤等疾病中的突变特征 | 首次在如此大规模浆细胞疾病队列中系统描述RAS/RAF突变谱,并通过单细胞测序证实突变发生在不同亚克隆中 | 研究基于常规测序面板,可能未覆盖所有相关突变 | 描述浆细胞疾病中RAS/RAF通路的突变特征和临床意义 | 10,000多名不同浆细胞疾病患者 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 二代测序,单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | >10,000名患者,其中29名患者进行了单细胞测序 | NA | 单细胞测序,二代测序 | NA | NA |
| 788 | 2025-10-06 |
MatriCom: a scRNA-Seq data mining tool to infer ECM-ECM and cell-ECM communication systems
2024-Dec-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627834
PMID:39763937
|
研究论文 | 开发了一个名为MatriCom的scRNA-Seq数据挖掘工具,用于推断ECM-ECM和细胞-ECM通讯系统 | 基于独特的MatriComDB数据库(包含25,000多个经过整理的相互作用),专门针对基质组蛋白相互作用设计,能考虑ECM蛋白相互作用的特定规则 | NA | 开发工具以挖掘scRNA-Seq数据并推断ECM组分之间以及不同细胞群体与ECM之间的通讯 | 哺乳动物基质组基因(约1,000个基因中的80%)及其相互作用 | 生物信息学 | 癌症或纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 整合了46个scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 789 | 2025-10-06 |
Evaluating the role of IER3+ macrophages in the prognosis of liver fibrosis by bulk and single-cell transcriptional analyses
2024-Dec, ILIVER..
DOI:10.1016/j.iliver.2024.100132
PMID:40635861
|
研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,建立肝纤维化预后模型并研究IER3+巨噬细胞在肝纤维化中的作用 | 首次建立包含IER3、AKR1B10、ADCY1和PGM1四个基因的肝纤维化巨噬细胞相关预后特征模型,并通过单细胞分析发现IER3在髓系细胞中的特异性表达 | 研究依赖于公共数据库数据,样本量有限,需要进一步实验验证 | 探索肝纤维化的复杂发病机制并识别能够预测肝纤维化预后的关键遗传标志物 | 肝纤维化患者样本和健康对照 | 生物信息学 | 肝纤维化 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的三个数据集(GSE84044、GSE130970、GSE15654) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 790 | 2025-10-06 |
The generation of stable microvessels in ischemia is mediated by endothelial cell derived TRAIL
2024-10-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn8760
PMID:39365855
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞来源的TRAIL在介导缺血条件下稳定微血管生成中的关键作用 | 首次发现内皮细胞来源的TRAIL在促进新生血管形成和血管稳定中的新功能,并证明TRAIL-R2激动剂在治疗缺血中的潜力 | 研究主要基于动物模型和体外实验,临床转化仍需进一步验证 | 探究TRAIL在缺血条件下介导新生血管形成和血管稳定的分子机制 | 内皮细胞、周细胞、小鼠模型、患者动脉样本 | 血管生物学 | 外周动脉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 791 | 2025-10-06 |
Loss of synovial tissue macrophage homeostasis precedes rheumatoid arthritis clinical onset
2024-09-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj1252
PMID:39321281
|
研究论文 | 本研究深入探讨了类风湿关节炎患者、风险人群和健康对照者滑膜组织的髓系细胞景观 | 首次在RA临床发病前发现CD40表达巨噬细胞群的富集,识别了早期致病性髓系特征 | 样本量相对有限,需要进一步验证这些发现 | 研究类风湿关节炎发病前的滑膜组织巨噬细胞稳态变化 | 类风湿关节炎患者、风险人群和健康对照者的滑膜组织细胞 | 单细胞生物学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术,RNA测序,代谢分析,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | 67,908个RA和HC滑膜组织细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 792 | 2025-10-06 |
Skewed epithelial cell differentiation and premature aging of the thymus in the absence of vitamin D signaling
2024-09-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9582
PMID:39321290
|
研究论文 | 研究维生素D信号缺失对胸腺上皮细胞分化和胸腺早衰的影响 | 首次揭示维生素D信号通过调控Aire表达影响胸腺上皮细胞分化,并发现其缺失导致胸腺早衰 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究维生素D信号在胸腺上皮细胞分化和胸腺衰老中的作用机制 | Cyp27b1基因敲除小鼠的胸腺组织 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 793 | 2025-10-06 |
A Paradoxical Tumor Antigen Specific Response in the Liver
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.19.614002
PMID:39372792
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研究论文 | 本研究探讨了肝脏肿瘤中CD8+ T细胞功能异常及其在肝转移形成中的作用机制 | 发现肝脏肿瘤中肿瘤特异性CD8+ T细胞数量丰富但功能耗竭,并鉴定出SPP1+巨噬细胞与CD8+ T细胞在促纤维化区域的相互作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者数据,需要更大样本验证 | 阐明肝脏肿瘤微环境中免疫细胞功能异常的机制 | 小鼠肿瘤模型和人类结肠癌肝转移患者 | 免疫学 | 结肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学CODEX, 多组学分析 | 差异伪时间轨迹推断分析 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 多个小鼠肿瘤模型和患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 794 | 2025-10-06 |
Origin, structure, and composition of the spider major ampullate silk fiber revealed by genomics, proteomics, and single-cell and spatial transcriptomics
2024-08-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn0597
PMID:39141739
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研究论文 | 通过多组学方法揭示蜘蛛大壶腹丝纤维的起源、结构和组成 | 首次识别出18种构成蜘蛛最强丝纤维的蛋白质,并通过单细胞和空间转录组学发现丝腺分泌上皮存在六种细胞类型,这些细胞类型局限于三个不同的腺体区域 | NA | 理解蜘蛛丝纤维的生物加工过程和组成成分 | 蜘蛛大壶腹丝腺及其产生的丝纤维 | 生物信息学 | NA | 基因组学,蛋白质组学,单细胞RNA测序,空间转录组学,图像分析 | NA | 基因组数据,蛋白质数据,单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 795 | 2025-10-06 |
Nanos2 marks precursors of somatic lineages and is required for germline formation in the sea anemone Nematostella vectensis
2024-08-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado0424
PMID:39151009
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研究论文 | 本研究通过转基因报告基因和单细胞转录组学技术,在海葵中鉴定表达生殖系相关标记的细胞群体,并证明Nanos2对生殖系形成不可或缺 | 首次在刺胞动物中证明Nanos2在体细胞和生殖系干细胞中的保守作用,揭示了刺胞动物干细胞系统的共同进化起源 | 研究仅聚焦于海葵这一特定物种,需要更多刺胞动物物种验证结果的普适性 | 表征海葵中保守的干细胞标记基因,探索刺胞动物干细胞系统的进化起源 | 海葵Nematostella vectensis的干细胞群体 | 发育生物学 | NA | 转基因报告基因,单细胞转录组学,基因敲除 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 796 | 2025-10-06 |
Exploring the immune landscape and drug prediction of an M2 tumor-associated macrophage-related gene signature in EGFR-negative lung adenocarcinoma
2024-07, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15375
PMID:38886907
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,构建了M2肿瘤相关巨噬细胞相关基因特征,用于探索EGFR阴性肺腺癌的免疫景观并预测免疫治疗反应 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建M2-TAM相关基因特征,用于EGFR阴性肺腺癌的免疫治疗预测 | 研究基于回顾性数据分析,需要进一步实验验证 | 改善EGFR阴性肺腺癌患者的免疫治疗效果 | EGFR阴性肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 797 | 2025-10-06 |
Unleashed monocytic engagement in Sézary syndrome during the combination of anti-CCR4 antibody with type I interferon
2024-05-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010043
PMID:38489234
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示Sézary综合征中恶性CD4+ T细胞的免疫学转变及单核细胞功能障碍机制 | 发现I型干扰素联合抗CCR4抗体可激活单核细胞吞噬功能并清除Sézary细胞 | 疾病发病机制理解仍存在局限性 | 探索Sézary综合征的发病机制及优化联合治疗方案 | Sézary综合征患者样本中的恶性CD4+ T细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组分析, 高通量T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 798 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis with childhood and adult systemic lupus erythematosus
2024-12, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2023.2281228
PMID:38347676
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童和成人系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞的组成和转录特征差异 | 首次在单细胞水平比较儿童和成人系统性红斑狼疮患者的PBMC组成和转录特征,识别出潜在治疗靶点和生物标志物 | 发病机制仍不明确,样本量未明确说明 | 比较儿童和成人系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞的组成和转录特征差异 | 儿童和成人系统性红斑狼疮患者及匹配的健康捐赠者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 799 | 2025-10-06 |
Understanding disease-associated metabolic changes in human colon epithelial cells using i ColonEpithelium metabolic reconstruction
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619644
PMID:39484551
|
研究论文 | 本研究构建了首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium,用于探索炎症性肠病相关的代谢变化 | 开发了首个人类结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型,包含独特的转运反应区室用于模拟与肠道微生物组的代谢相互作用 | 模型基于稳态假设,可能无法完全反映体内动态代谢过程 | 解析人类结肠上皮细胞的代谢活动,识别炎症性肠病相关的代谢特征 | 人类结肠上皮细胞 | 代谢组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,基因组尺度代谢模型 | 基因组尺度代谢模型 | 基因表达数据 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎患者样本及健康对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 800 | 2025-10-06 |
Metabolic coordination between skin epithelium and type 17 immunity sustains chronic skin inflammation
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.022
PMID:38772365
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研究论文 | 本研究揭示了皮肤炎症中上皮细胞与免疫细胞通过代谢协调维持慢性炎症的机制 | 发现HIF1α驱动的糖酵解代谢通路在上皮细胞和γδ T17细胞间建立代谢层级协调,共同维持皮肤炎症 | 研究主要基于小鼠模型和离体人类病变组织,在体人类验证尚需进一步研究 | 探究皮肤炎症疾病中上皮细胞与免疫细胞代谢协调的分子机制 | 银屑病皮肤病变组织、小鼠皮肤炎症模型 | 空间转录组学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,免疫荧光 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据,蛋白质定位数据 | 人类银屑病病变组织和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |