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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-10-06 |
Digital Spatial Profiling Identifies Distinct Molecular Signatures of Vascular Lesions in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202307-1310OC
PMID:38568479
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研究论文 | 本研究利用数字空间转录组技术识别肺动脉高压中血管病变的独特分子特征 | 首次在微观水平上系统比较IPAH不同类型血管病变的分子特征,发现丛状病变和IPAH外膜具有最显著的基因表达差异 | 样本量相对有限(IPAH=11,对照=5),仅分析了转录组水平的变化 | 验证IPAH血管病变表达独特分子谱的假设 | 特发性肺动脉高压患者的肺血管病变和对照肺动脉 | 数字病理 | 肺动脉高压 | 数字空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | IPAH肺组织11例,对照肺动脉5例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 782 | 2025-10-06 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 探讨利用系统生物学和单细胞测序技术识别候选基因,通过合成生物学方法协调植物生长、发育与环境响应的策略 | 提出整合系统生物学、单细胞测序与合成生物学来解析基因多效性,建立基因型-表型关系的新方法 | NA | 开发通过工程化植物激素信号传导来协调植物生长、发育与环境响应的育种和基因工程策略 | 植物基因网络和信号通路 | 合成生物学 | NA | 单细胞测序, 基因编辑(CRISPR), 合成生物学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 783 | 2025-10-06 |
Synovial 5-Lipoxygenase-Derived Oxylipins Define a Lympho-Myeloid-Enriched Synovium
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42848
PMID:38508862
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研究论文 | 本研究探讨滑膜组织中氧脂素与血浆氧脂素的相关性及其与滑膜组织学模式的关系 | 首次系统分析炎症关节中滑膜氧脂素与血浆氧脂素的相关性,并发现5-脂氧合酶衍生的氧脂素在淋巴-髓系富集滑膜中特异性高表达 | 样本量有限(32例滑膜组织和26例配对血浆样本),仅纳入类风湿关节炎和银屑病关节炎患者 | 确定炎症关节中滑膜氧脂素是否与血浆氧脂素及滑膜组织学模式相关 | 已确诊的类风湿关节炎和银屑病关节炎患者 | 生物医学研究 | 类风湿关节炎, 银屑病关节炎 | 液相色谱-串联质谱法, 单细胞RNA测序 | NA | 生物分子数据, 基因表达数据 | 32例滑膜组织样本和26例配对血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 784 | 2025-10-06 |
Molecular Changes Implicate Angiogenesis and Arterial Remodeling in Systemic Sclerosis-Associated and Idiopathic Pulmonary Hypertension
2024-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320005
PMID:38841857
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压患者肺组织中血管细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示肺动脉高压中三种疾病相关内皮细胞亚群的特征及其分子调控机制 | 样本量有限(特发性肺动脉高压组仅3例),且使用离体肺组织可能无法完全反映疾病早期变化 | 阐明系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压的血管病理生物学机制 | 系统性硬化症相关肺动脉高压患者(16例)、特发性肺动脉高压患者(3例)和健康对照者(15例)的离体肺组织 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 34例人类肺组织样本(16例SSc-PH,3例IPAH,15例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 785 | 2025-10-06 |
Expression of L1 Cell Adhesion Molecule, a Nephronal Principal Cell Marker, in Nephrogenic Adenoma
2024-Aug, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100540
PMID:38901674
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定L1CAM作为肾源性腺瘤的潜在生物标志物,并揭示了其与肾单位集合管主细胞的表达关联 | 首次利用单细胞RNA测序技术发现L1CAM可作为肾源性腺瘤的特异性生物标志物,并建立了肾单位特异性标志物组合 | 样本量有限(35例患者样本),需要更大规模研究验证标志物的临床适用性 | 探索肾源性腺瘤的细胞起源并开发特异性诊断标志物 | 肾源性腺瘤患者组织样本及正常尿路上皮、前列腺组织等对照样本 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, RNA原位杂交 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 35例肾源性腺瘤患者样本及多种对照组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 786 | 2025-10-06 |
Identification of novel compound heterozygous ZFP36L2 variants implicated in oocyte maturation defects and female infertility
2024-Aug, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-024-03154-1
PMID:38829516
|
研究论文 | 本研究通过鉴定ZFP36L2新型复合杂合变异并揭示其在卵母细胞成熟缺陷和女性不孕中的作用机制 | 首次发现ZFP36L2复合杂合变异与人类卵母细胞转录组改变的直接关联,并系统阐明其通过影响ZFP36L2-CNOT6L复合物功能和mRNA降解导致卵母细胞成熟缺陷的分子机制 | 研究样本量有限,功能验证主要在HeLa细胞和小鼠卵母细胞中进行,人类卵母细胞数据相对较少 | 探索卵母细胞成熟缺陷的发病机制 | 携带卵母细胞成熟缺陷的患者及其家系成员,HeLa细胞,小鼠和人类卵母细胞 | 生殖医学 | 女性不孕症 | 全外显子组测序,Sanger测序,实时RT-PCR,单细胞RNA测序,瞬时转染 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质相互作用数据 | 1名患者及其家系成员,HeLa细胞系,小鼠和人类卵母细胞样本 | NA | 全外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 787 | 2024-08-07 |
Lung Single-Cell Transcriptomics in Alpha-1 Antitrypsin Deficiency
2024-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0064LE
PMID:39087828
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 788 | 2025-10-06 |
Analyzing Single Cell RNA Sequencing with Topological Nonnegative Matrix Factorization
2024-Aug-01, Journal of computational and applied mathematics
IF:2.1Q1
DOI:10.1016/j.cam.2024.115842
PMID:38464901
|
研究论文 | 本文提出了两种基于持久拉普拉斯正则化的非负矩阵分解方法,用于分析单细胞RNA测序数据 | 引入了拓扑非负矩阵分解(TNMF)和鲁棒拓扑非负矩阵分解(rTNMF),解决了传统NMF方法缺乏多尺度分析的问题 | NA | 开发新的计算方法以更好地分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF), 拓扑非负矩阵分解(TNMF), 鲁棒拓扑非负矩阵分解(rTNMF) | 基因表达数据 | 12个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 789 | 2025-10-06 |
Dissecting the Implications of Calumenin in Malignancy and Heterogeneity of the Microenvironment of Clear Cell Renal Cell Carcinoma Using Multi-Omics Data
2024-Aug, Phenomics (Cham, Switzerland)
DOI:10.1007/s43657-024-00169-7
PMID:39583311
|
研究论文 | 通过多组学数据研究Calumenin在透明细胞肾细胞癌恶性进展和肿瘤微环境异质性中的作用 | 首次系统揭示CALU在ccRCC中的表达特征及其与肿瘤微环境免疫细胞组成的关联,并发现CALU表达影响化疗药物敏感性 | 研究样本量未明确说明,机制研究仍需深入验证 | 探讨Calumenin在透明细胞肾细胞癌发生发展中的作用机制 | 透明细胞肾细胞癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 多组学数据分析,单细胞测序,分子生物学实验 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多组学整合分析 | NA | NA |
| 790 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analyses Offer Insights into the Different Remodeling Programs of Arteries and Veins
2024-05-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13100793
PMID:38786017
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研究论文 | 通过单细胞分析比较人类外周动脉和静脉的细胞组成差异,揭示血管重塑机制 | 首次在单细胞水平系统对比动脉和静脉的细胞图谱,发现静脉成纤维细胞在胶原产生和血管重塑中的独特作用 | 样本量相对有限(30例器官捐献者),主要关注上肢血管 | 探究动脉和静脉在闭塞性疾病和损伤反应中差异的生物学基础 | 人类外周动脉(肱动脉)和静脉(贵要静脉/头静脉) | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术, 组织学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据, 组织图像 | 30例器官捐献者的动脉和静脉样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 791 | 2025-10-06 |
NFĸB signaling drives myocardial injury via CCR2+ macrophages in a preclinical model of arrhythmogenic cardiomyopathy
2024-Apr-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172014
PMID:38564300
|
研究论文 | 本研究通过遗传学方法和单细胞RNA测序揭示了NFκB信号在致心律失常性心肌病中通过CCR2+巨噬细胞驱动心肌损伤的机制 | 首次证明心肌细胞中NFκB信号通过招募CCR2+巨噬细胞介导心肌损伤和心律失常,并揭示了心脏细胞间的免疫调节串扰 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明致心律失常性心肌病中免疫信号在心肌细胞和巨噬细胞中的贡献机制 | Dsg2mut/mut小鼠模型(致心律失常性心肌病模型) | 单细胞组学 | 致心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, CITE-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 792 | 2025-10-06 |
The intricate cellular ecosystem of human peripheral veins as revealed by single-cell transcriptomic analysis
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0296264
PMID:38206912
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示人类外周静脉中复杂的细胞生态系统 | 首次在单细胞水平系统解析人类外周静脉的微解剖结构,发现静脉内皮细胞、平滑肌细胞和成纤维细胞的新型功能表型 | 样本量较小(仅4个非病变静脉),仅关注上肢静脉,缺乏疾病状态对照 | 解析人类外周静脉在单细胞水平的微解剖结构及其与血管壁结构、重塑过程和炎症反应的关系 | 来自器官捐献者的4个非病变人类上肢静脉(3个头静脉,1个贵要静脉) | 单细胞生物学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,组织学分析 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据,组织学图像数据 | 4个人类静脉样本,20,006个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 793 | 2025-10-06 |
Brca1 haploinsufficiency promotes early tumor onset and epigenetic alterations in a mouse model of hereditary breast cancer
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01958-6
PMID:39528827
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研究论文 | 本研究通过新型基因工程小鼠模型揭示了Brca1单倍体不足通过表观遗传改变加速遗传性乳腺癌发生的机制 | 发现Brca1杂合状态本身存在固有的促肿瘤表观遗传改变,挑战了传统的'二次打击'假说 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究Brca1杂合性如何促进乳腺癌早期发生 | Brca1杂合基因工程小鼠的乳腺上皮细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 794 | 2025-10-06 |
Characteristics of blood-brain barrier heterogeneity between brain regions revealed by profiling vascular and perivascular cells
2024-Oct, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01743-y
PMID:39210068
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示不同脑区血脑屏障异质性的分子特征 | 首次系统比较具有天然渗漏血管的脑区与正常脑区的血脑屏障分子差异,发现内皮细胞与周细胞相互作用的区域特异性 | 研究仅针对小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究不同脑区血脑屏障功能异质性的形成机制 | 小鼠正中隆起和大脑皮层区域的血管内皮细胞和周细胞 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 电子显微镜, 组织透明化技术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 显微图像 | 小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 795 | 2025-10-06 |
cytoKernel: Robust kernel embeddings for assessing differential expression of single cell data
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.16.608287
PMID:39229233
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研究论文 | 提出一种基于核嵌入的稳健方法cytoKernel,用于评估单细胞数据的差异表达 | 使用基于核的评分检验,能够检测单细胞数据中常被忽视的多模态特征变化 | NA | 开发评估单细胞数据差异表达的稳健方法 | 单细胞RNA测序数据和高维流式或质谱流式数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式技术 | 核嵌入方法,基于核的评分检验 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,质谱流式技术 | NA | NA |
| 796 | 2025-10-06 |
Tertiary lymphoid structures sustain cutaneous B cell activity in hidradenitis suppurativa
2024-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169870
PMID:38113104
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研究论文 | 本研究通过组织学分析、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了化脓性汗腺炎皮损中三级淋巴结构的存在及其对B细胞活性的维持作用 | 首次在化脓性汗腺炎皮损中发现三级淋巴结构,并证明这些结构支持B细胞的持续活化和成熟过程 | 研究样本数量有限,且主要关注皮损局部微环境,未涉及全身免疫反应 | 探究化脓性汗腺炎皮损中B细胞的动态变化和微环境相互作用 | 化脓性汗腺炎患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 组织学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 797 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals variations in monocytes and Tregs between gout flare and remission
2024-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179067
PMID:38329132
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 798 | 2025-10-06 |
The BCL-2 inhibitor APG-2575 resets tumor-associated macrophages toward the M1 phenotype, promoting a favorable response to anti-PD-1 therapy via NLRP3 activation
2024-01, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-023-01112-y
PMID:38062129
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研究论文 | 本研究揭示BCL-2抑制剂APG-2575通过激活NLRP3信号通路将肿瘤相关巨噬细胞重编程为M1表型,从而增强抗PD-1疗法的疗效 | 首次发现APG-2575能直接结合NF-κB p65激活NLRP3信号通路,介导巨噬细胞表型转化并增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证数据有限,需进一步人体试验确认 | 探索BCL-2抑制剂与免疫检查点抑制剂联合治疗的协同作用机制 | 同系和人源化CD34+小鼠模型及患者肿瘤样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠模型和患者样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 799 | 2025-10-06 |
Pax3/7 gene function in Oikopleura dioica supports a neuroepithelial-like origin for its house-making Fol territory
2024-12, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.08.012
PMID:39181419
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9突变株和单细胞RNA测序分析,探讨了Oikopleura dioica中pax37A和pax37B基因在房室制造滤器区域发育中的功能 | 首次揭示pax37B(而非pax37A)对房室滤器细胞分化的特异性调控作用,并提出滤器区域分泌上皮细胞可能保留或进化了神经上皮特征的新假说 | 研究仅针对特定海洋生物模型,其结论在其他生物中的普适性仍需验证 | 探究Pax3/7基因在尾索动物房室制造上皮发育中的功能机制 | Oikopleura dioica(尾索动物)的房室制造上皮及其滤器细胞 | 发育生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 野生型和突变型Oikopleura dioica个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 800 | 2025-10-06 |
Joint representation and visualization of derailed cell states with Decipher
2024-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.11.566719
PMID:38014231
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研究论文 | 本文提出了一种名为Decipher的深度生成模型,用于整合单细胞基因组学数据并表征细胞状态从正常到异常的转变 | 开发了能够联合建模和可视化正常与扰动条件下单细胞RNA-seq数据的深度生成模型,揭示共享和破坏的细胞动态 | NA | 开发计算工具以整合跨条件的单细胞基因组学数据并表征异常细胞状态轨迹 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胰腺炎、急性髓系白血病、胃癌 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |