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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-01-16 |
Computational methods for allele-specific expression in single cells
2024-11, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.07.003
PMID:39127549
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综述 | 本文综述了单细胞等位基因特异性表达（ASE）数据的计算处理方法，包括从原始读取到统计分析的完整流程 | 系统总结了单细胞ASE分析的计算方法，并强调了集成优化生物信息学流程和统计方法进一步发展的需求 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或算法，主要基于现有文献进行归纳 | 综述单细胞等位基因特异性表达的计算分析方法及其在生物学问题中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的等位基因特异性表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-01-16 |
Unveiling contact-mediated cellular crosstalk
2024-10, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.05.010
PMID:38906738
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综述 | 本文探讨了细胞间相互作用在复杂生物功能中的作用，并综述了单细胞测序、空间转录组学等前沿技术如何革新我们对细胞间通讯的理解 | 整合了单细胞测序、空间转录组学与生物工程工具，提供了分析细胞接触介导基因表达变化的新视角 | 作为综述文章，未涉及具体实验数据或方法验证 | 解析细胞间接触如何调控细胞反应网络 | 多细胞生物中的细胞间相互作用 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 63 | 2026-01-16 |
APOE ε4-associated downregulation of the IL-7/IL-7R pathway in effector memory T cells: Implications for Alzheimer's disease
2024-09, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14173
PMID:39129310
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研究论文 | 本研究探讨了APOE ε4等位基因通过下调IL-7/IL-7R通路影响效应记忆T细胞，从而加剧阿尔茨海默病中海马萎缩的机制 | 首次揭示了APOE ε4等位基因与IL-7/IL-7R通路下调在效应记忆T细胞中的关联，并建立了血浆IL-7水平与海马萎缩程度的负相关关系 | 样本量较小（仅54名患者），且为横断面研究，无法确定因果关系 | 探究APOE ε4等位基因影响外周炎症和神经炎症的潜在机制 | 晚发性阿尔茨海默病患者（包括APOE ε4携带者和非携带者） | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 54名患者（28名APOE ε4携带者，26名非携带者） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-01-16 |
Discovering mechanisms of human genetic variation and controlling cell states at scale
2024-07, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.03.010
PMID:38658256
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评论 | 本文探讨了单细胞测序在揭示人类遗传变异机制和控制细胞状态方面的潜力 | 提出将单细胞测序用于大规模构建变异效应表型图谱，并将遗传变异解释方法应用于工程化治疗性细胞状态 | NA | 加速人类遗传变异机制发现并推动基因组医学发展 | 人类遗传变异和细胞状态 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-01-16 |
Single-cell phylotranscriptomics of developmental and cell type evolution
2024-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.02.005
PMID:38490933
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综述 | 本文总结了单细胞系统转录组学在揭示发育和细胞类型进化分子机制中的应用 | 利用单细胞系统转录组学分析，揭示了发育过程中谱系和细胞类型间转录组年龄的异质性，并识别了驱动整体生物钟形模式的谱系和组织 | NA | 探讨单细胞系统转录组学在理解发育进化模式和细胞类型进化史中的作用 | 发育过程中的谱系、细胞类型和组织 | 计算生物学 | NA | 单细胞系统转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-01-16 |
The Transpeptidase Sortase A Binds Nucleic Acids and Mediates Mammalian Cell Labeling
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305605
PMID:38581131
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研究论文 | 本文发现金黄色葡萄球菌的转肽酶Sortase A能与核酸结合，并基于此开发了CellID技术用于单细胞RNA测序中的样本多重标记 | 首次揭示了Sortase A与核酸的未知相互作用，并利用这一特性开发了新的细胞标记技术CellID | 未详细探讨Sortase A与核酸结合的具体分子机制，且技术应用潜力尚未完全验证 | 探索Sortase A的非经典功能及其在生物技术中的应用 | 金黄色葡萄球菌Sortase A蛋白、哺乳动物细胞、核酸寡核苷酸 | 生物技术 | NA | CRISPR筛选、scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-01-15 |
Single-cell spatial transcriptomics of fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.11.623014
PMID:39605355
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研究论文 | 本研究开发并优化了一种基于成像的单细胞空间转录组学框架，用于分析存档的福尔马林固定石蜡包埋活检样本，以揭示结肠炎相关的细胞网络 | 首次对三种能够分析FFPE样本的单细胞空间转录组学平台进行全面基准比较，并开发了一个统一的处理流程，成功应用于长达5年历史的临床存档样本 | 研究样本量相对有限（n=57），且仅针对炎症性肠病，可能限制了结果的普遍适用性 | 开发一个稳健的框架，将基于成像的单细胞空间转录组学应用于存档的临床FFPE黏膜活检样本，以研究炎症性肠病的细胞网络 | 来自非IBD对照和溃疡性结肠炎患者的FFPE黏膜活检样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 57例FFPE黏膜活检样本（包括9例非IBD对照和11例溃疡性结肠炎患者） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | 自定义290-plex Xenium基因面板 |
| 68 | 2026-01-15 |
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-27, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4536158/v1
PMID:38978567
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TACIT的无监督算法，用于空间生物学中的细胞类型和状态注释，无需训练数据，并在多个数据集中验证了其准确性和可扩展性 | 开发了TACIT算法，这是一种无监督方法，利用预定义签名进行细胞注释，无需训练数据，并通过无偏阈值处理区分阳性细胞与背景，专注于相关标记以识别多组学检测中的模糊细胞 | 未明确说明算法的计算资源需求或处理大规模数据时的潜在限制 | 解决空间生物学中细胞类型和状态识别的时间消耗和易错挑战，提高注释的准确性和可扩展性 | 细胞类型和细胞状态，涉及大脑、肠道和腺体三个生态位 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学和空间蛋白质组学 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 五个数据集，总计5,000,000个细胞，涉及51种细胞类型 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 69 | 2026-01-15 |
Spatial Deconvolution of Cell Types and Cell States at Scale Utilizing TACIT
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596861
PMID:38895230
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TACIT的无监督算法，用于空间生物学中的细胞类型和状态注释，无需训练数据，通过预定义签名和阈值区分细胞，并在多个数据集中验证其准确性和可扩展性 | 开发了TACIT算法，这是一种无监督方法，利用预定义签名和阈值区分细胞，无需训练数据，能处理细胞、邻域和生态位层面的变异性，在多组学分析中识别模糊细胞 | NA | 解决空间生物学中细胞类型和状态注释的耗时和易错挑战，提高注释的准确性和可扩展性 | 细胞类型和状态，包括来自大脑、肠道和腺体等生态位的细胞 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学和蛋白质组学 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 5个数据集，涉及5,000,000个细胞和51种细胞类型 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 70 | 2026-01-15 |
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals Heterogeneity of Early Pig Skin Development and a Subpopulation with Hair Placode Formation
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306703
PMID:38561967
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了早期猪皮肤发育的异质性，并识别出一个与毛囊形成相关的细胞亚群 | 首次构建了胚胎皮肤的整合时空转录组图谱，并通过跨物种比较发现猪表皮比小鼠更接近人类，同时识别出毛囊起始结构的新前体细胞 | 研究主要基于猪模型，虽然与人类有较高保守性，但直接应用于人类皮肤疾病仍需进一步验证 | 研究早期皮肤发育的细胞异性和毛囊形成机制，为人类皮肤疾病研究提供参考图谱 | 正常和无毛胎猪的皮肤样本，覆盖四个发育时期 | 数字病理学 | 皮肤相关疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 正常和无毛胎猪皮肤样本，涵盖四个发育时期 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2026-01-15 |
scmFormer Integrates Large-Scale Single-Cell Proteomics and Transcriptomics Data by Multi-Task Transformer
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307835
PMID:38483032
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研究论文 | 本文提出了一种名为scmFormer的新型单细胞多模态/多任务Transformer模型，用于整合大规模单细胞蛋白质组学与转录组学数据 | scmFormer是首个能够整合单细胞蛋白质组学与其他组学数据的Transformer模型，在整合大规模单细胞多模态数据和异质多批次配对多组学数据方面表现优异 | NA | 开发一个强大的工具来整合和分析单细胞多组学数据 | 单细胞多组学数据，特别是蛋白质组学和转录组学数据 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞多组学 | Transformer | 单细胞蛋白质组学和转录组学数据 | 超过148万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 72 | 2026-01-15 |
Characterization of the Nucleus Pulposus Progenitor Cells via Spatial Transcriptomics
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303752
PMID:38311573
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，首次建立了小鼠椎间盘的空间转录组图谱，揭示了核髓祖细胞（NPPCs）的分布和分化序列 | 首次生成小鼠椎间盘的空间转录组图谱，通过空间分辨率识别核髓祖细胞标记物（如Ctsk）的分布，并推翻了Tie2作为NPPCs标记物的传统观点 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；空间转录组学技术可能受限于分辨率，无法完全捕获所有细胞类型 | 探究椎间盘核髓祖细胞的分化序列和标记物，以理解椎间盘退变的细胞机制 | 小鼠椎间盘组织，特别是核髓（NP）区域 | 空间转录组学 | 椎间盘退变 | 空间转录组学，原位测序（ISS），细胞谱系追踪 | NA | 空间转录组数据，原位测序数据 | 小鼠椎间盘组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium平台用于生成空间分辨的转录组图谱 |
| 73 | 2026-01-15 |
Integration Analysis of Single-Cell Multi-Omics Reveals Prostate Cancer Heterogeneity
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305724
PMID:38483933
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学数据，揭示了前列腺癌的异质性及其在肿瘤微环境中的细胞生态系统 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量ATAC测序，系统描绘了前列腺癌阶段特异性微环境中的细胞异质性，并识别了SOX9AR标记的俱乐部细胞干细胞亚群以及CD8CXCR6 T细胞亚群的变化 | 研究样本量有限，且主要基于观察性数据，需要进一步功能实验验证发现的细胞亚群和相互作用机制 | 探究前列腺癌的细胞异质性及其在肿瘤微环境中的形成机制，以促进疾病诊断和治疗 | 前列腺癌患者和健康对照者的组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量ATAC测序 | 机器学习, 计算智能 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 表观基因组数据 | 一系列前列腺癌患者和健康对照者（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量ATAC-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-01-15 |
Bioengineered Hydrogels Recapitulate Fibroblast Heterogeneity in Cancer
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307129
PMID:38493497
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研究论文 | 本研究利用头颈部鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据，预测调控癌症相关成纤维细胞亚群的微环境和细胞特征，并通过可调谐的透明质酸水凝胶系统在体外培养患者来源的CAFs，以模拟其异质性 | 通过结合单细胞RNA测序数据与可调谐水凝胶系统，首次在体外成功模拟了癌症相关成纤维细胞的异质性，并识别了微管动力学作为CAF可塑性的关键介质 | 研究主要基于头颈部鳞状细胞癌数据，可能不适用于其他癌症类型；水凝胶系统虽能模拟异质性，但可能无法完全复制体内复杂的肿瘤微环境 | 开发能反映癌症相关成纤维细胞异质性的体外模型，以促进CAF生物学理解和靶向治疗策略的评估 | 癌症相关成纤维细胞，特别是头颈部鳞状细胞癌中的CAF亚群 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-01-14 |
Human-Mouse Chimeric Brain Models to Study Human Glial-Neuronal and Macroglial-Microglial Interactions
2024-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.03.601990
PMID:39005270
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研究论文 | 本文介绍了一种通过共移植人类诱导多能干细胞衍生的神经细胞构建人鼠嵌合脑模型的方法，用于在体内研究人类神经胶质细胞与神经元之间的相互作用 | 创新性地开发了人鼠嵌合脑模型，通过共移植人类诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞和原始巨噬细胞祖细胞，首次在体内同时模拟人类小胶质细胞、大胶质细胞和神经元的相互作用 | 模型基于小鼠脑环境，可能无法完全复制人类脑的复杂生理条件，且移植细胞的长期行为和功能稳定性需进一步验证 | 研究人类神经胶质细胞与神经元在体内的相互作用机制，以揭示脑功能复杂性并为神经系统疾病治疗提供新见解 | 人类诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞、原始巨噬细胞祖细胞及其在鼠脑中的共移植模型 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、超分辨率成像、3D重建技术 | 人鼠嵌合脑模型 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-01-14 |
Wnt 3a-Modified Scaffolds Improve Nerve Regeneration by Boosting Schwann Cell Function
2024-11-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c15013
PMID:39520323
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现Wnt信号通路可促进修复型雪旺细胞转化，并开发了一种负载Wnt3a蛋白的聚合物支架，在大鼠坐骨神经缺损模型中验证了其优异的神经修复效果 | 首次结合单细胞测序技术阐明Wnt通路在周围神经再生中的作用机制，并创新性地将Wnt3a蛋白整合到电纺纤维支架表面 | 研究仅在大鼠动物模型中进行验证，尚未开展临床转化研究 | 探索通过调控雪旺细胞功能促进周围神经再生的新策略 | 雪旺细胞、大鼠坐骨神经缺损模型 | 组织工程与再生医学 | 周围神经损伤 | 单细胞测序、电纺丝技术、动物模型实验 | NA | 测序数据、组织学数据、电生理数据 | 大鼠坐骨神经缺损模型（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-01-14 |
Actin Dysregulation Induces Neuroendocrine Plasticity and Immune Evasion: A Vulnerability of Small Cell Lung Cancer
2024-Nov-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528365
PMID:36824957
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研究论文 | 本研究揭示了CRACD作为肿瘤抑制因子，通过调控肌动蛋白聚合来限制小细胞肺癌的神经内分泌可塑性和免疫逃逸，并提出EZH2阻断作为潜在治疗策略 | 首次将CRACD与SCLC的神经内分泌可塑性和免疫逃逸机制联系起来，并通过单细胞转录组学验证了其在患者肿瘤中的临床相关性 | 研究主要基于基因敲除模型和体外实验，临床样本验证和体内治疗效果的长期数据可能有限 | 探究小细胞肺癌中肿瘤细胞可塑性和免疫逃逸的分子机制 | 小细胞肺癌肿瘤细胞、CRACD基因、NOTCH1信号通路、EZH2介导的组蛋白修饰 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞转录组学、基因敲除、药理学阻断 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-01-14 |
A prognostic matrix gene expression signature defines functional glioblastoma phenotypes and niches
2024-Jun-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4541464/v1
PMID:38947019
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研究论文 | 本研究通过计算基因组学和蛋白质组学方法，分析胶质母细胞瘤中细胞外核心基质蛋白表达的功能和临床相关性，并开发了一个17基因的基质组表达特征用于患者分层 | 识别了基质蛋白表达特征，将胶质母细胞瘤分为高表达和低表达组，并发现该特征与患者生存、致癌改变、间充质状态及免疫检查点基因表达相关，且比MGMT启动子甲基化状态和经典亚型具有更强的预后价值 | 未明确说明样本量或数据来源的具体限制，可能依赖于现有数据库的覆盖范围和准确性 | 探究胶质母细胞瘤中细胞外核心基质蛋白表达的功能和临床意义，以改善患者分层和治疗策略优化 | 胶质母细胞瘤肿瘤组织 | 计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | 计算基因组学，蛋白质组学，单细胞转录组分析，空间解剖分析 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据，单细胞转录组数据，空间解剖数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 79 | 2026-01-14 |
Mapping Somatosensory Afferent Circuitry to Bone Identifies Neurotrophic Signals Required for Fracture Healing
2024-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.06.597786
PMID:38895367
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研究论文 | 本研究通过绘制骨组织的体感传入神经回路，揭示了骨折愈合过程中神经源性营养信号的关键作用 | 首次系统性地绘制了长骨体感传入神经的神经解剖学回路，并发现神经元来源的FGF9是骨折修复的重要调节因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证；单细胞测序样本量相对有限 | 阐明骨骼伤害感受和再生过程中的精确神经解剖学回路及神经源性信号机制 | 小鼠长骨的体感背根神经节（DRG）传入神经元 | 单细胞转录组学 | 骨折 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），逆向标记技术，多组织相互作用分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 6,648个DRG神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-01-14 |
Shared and Compartment-Specific Processes in Nucleus Pulposus and Annulus Fibrosus During Intervertebral Disc Degeneration
2024-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309032
PMID:38403470
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康和病变人类椎间盘中的纤维环和髓核细胞，揭示了椎间盘退变过程中共享和特异性的细胞变化 | 首次在单细胞水平上同时比较了纤维环和髓核在椎间盘退变中的细胞变化，并识别出新的疾病相关细胞亚群及其调控网络 | 样本数量有限，且仅基于手术分离的组织，可能无法完全代表早期退变阶段 | 阐明椎间盘退变的细胞机制，为精准治疗提供靶点 | 人类椎间盘的纤维环和髓核组织 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 纤维环：19,978和26,983个细胞；髓核：20,884和24,489个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |