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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2026-06-15 |
Glucose deprivation-induced disulfidptosis in human nucleus pulposus cells: a novel pathological mechanism of intervertebral disc degeneration
2024-09-12, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00528-4
PMID:39267140
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研究论文 | 发现葡萄糖剥夺诱导的人髓核细胞二硫下垂是椎间盘退变的新病理机制 | 首次证实髓核细胞中二硫下垂的存在并鉴定出新的二硫下垂相关细胞亚群,揭示了营养不良与椎间盘退变的新联系 | 仅使用一个正常样本和一个椎间盘退变样本进行单细胞RNA测序分析,样本量有限 | 探究营养剥夺诱导的细胞死亡(特别是二硫下垂)在椎间盘退变中的作用 | 人髓核细胞、软骨细胞亚群、椎间盘退变组织 | 自然语言处理 | 椎间盘退变 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组DNA甲基化测序, 机器学习 | 预测模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据 | 一个正常样本和一个椎间盘退变样本(用于单细胞RNA测序) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 762 | 2026-06-15 |
Integrative genomics unveils basement membrane-related diagnostic markers and therapeutic targets in esophageal squamous cell carcinoma
2024-09-11, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00529-3
PMID:39256753
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研究论文 | 利用整合基因组学揭示食管鳞状细胞癌中基底膜相关的诊断标志物和治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序数据结合多种机器学习算法,鉴定出七个基底膜相关基因(BGN、LAMB3、SPARC、MMP1、LUM、COL4A1和NELL2)作为ESCC诊断标志物,并发现BGN作为潜在药物靶点 | 当前对基底膜相关基因在ESCC诊断中的研究仍较稀疏 | 识别基底膜相关诊断标志物并构建ESCC诊断模型,探索潜在治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌(ESCC) | 机器学习 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO、随机森林、SVM-RFE | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的食管鳞状细胞癌样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序数据来源GEO数据库 |
| 763 | 2026-06-15 |
Myelin-associated oligodendrocytic basic protein-dependent myelin repair confers the long-lasting antidepressant effect of ketamine
2024-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02288-5
PMID:37848708
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研究论文 | 使用空间转录组学揭示氯胺酮通过髓鞘相关少突胶质细胞碱性蛋白依赖的髓鞘修复实现长效抗抑郁作用 | 首次发现氯胺酮通过促进少突胶质前体细胞分化成熟、恢复受损髓鞘来产生长效抗抑郁效应,并阐明(R)-氯胺酮与(S)-氯胺酮在髓鞘修复效应上的差异 | 未明确提及,但可能包括动物模型与人类的差异及机制验证的局限性 | 阐明氯胺酮长效抗抑郁作用的髓鞘修复机制及其与立体异构体差异的关系 | 经受慢性社交挫败应激的小鼠 | 机器学习 | 抑郁症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠脑组织样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 764 | 2026-06-15 |
Analyses of the autism-associated neuroligin-3 R451C mutation in human neurons reveal a gain-of-function synaptic mechanism
2024-06, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-022-01834-x
PMID:36280753
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研究论文 | 分析自闭症相关NLGN3 R451C突变在人神经元中的功能增益突触机制 | 首次在人类神经元中研究NLGN3 R451C突变的影响,发现其增强兴奋性突触强度而不影响抑制性突触,并通过体内移植实验证实 | 文中未明确提及局限性 | 探究NLGN3 R451C突变对人类神经元突触功能的影响及其在自闭症发病机制中的作用 | 人类NLGN3 R451C敲入和NLGN3敲除神经元 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 765 | 2026-06-15 |
Single-cell transcriptome atlas in C57BL/6 mice encodes morphological phenotypes in the aging kidneys
2024-04-19, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03514-0
PMID:38641839
|
研究论文 | 构建C57BL/6小鼠不同发育阶段肾脏的单细胞转录组图谱,并关联形态表型 | 首次全面描绘C57BL/6小鼠从胚胎期到衰老期的肾脏形态和单细胞转录组图谱,并揭示肾小球基底膜结节的年龄相关形成机制 | 仅使用C57BL/6单一品系小鼠,可能无法完全代表其他品系或人类肾脏衰老特征 | 提供C57BL/6小鼠肾脏发育的参考标准,并探究衰老相关的形态表型及分子机制 | C57BL/6小鼠肾脏组织(从胚胎18.5天到30月龄) | 数字病理学 | 衰老相关肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 8个年龄组,每组5-6只小鼠,共约48只 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 766 | 2026-06-15 |
A distinct tumor microenvironment makes anaplastic thyroid cancer more lethal but immunotherapy sensitive than papillary thyroid cancer
2024-03-07, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173712
PMID:38478516
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序绘制甲状腺癌单细胞图谱,揭示间变性甲状腺癌(ATC)与乳头状甲状腺癌(PTC)肿瘤微环境差异,解释ATC预后更差但免疫治疗更敏感的原因 | 首次通过单细胞测序全面比较ATC和PTC的肿瘤微环境差异,发现CXCL13+ T淋巴细胞富集于ATC且可能促进早期三级淋巴结构(TLS)形成,为ATC免疫治疗敏感性提供新机制解释 | 研究主要基于有限样本和动物模型,需要更大规模队列验证;TLS形成与免疫治疗响应的因果关系尚需进一步实验证实 | 探索间变性甲状腺癌和乳头状甲状腺癌肿瘤微环境差异,解释两者预后和免疫治疗响应性不同的机制 | 间变性甲状腺癌和乳头状甲状腺癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 序列数据 | 甲状腺癌患者肿瘤样本及治疗患者肿瘤样本各一个(未明确具体数量) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 767 | 2026-06-15 |
Rapid anti-myeloma activity by T cells expressing an anti-BCMA CAR with a human heavy-chain-only antigen-binding domain
2024-02-07, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2023.12.018
PMID:38155568
|
研究论文 | 开发了一种全人源抗BCMA嵌合抗原受体T细胞疗法FHVH-T,并在复发多发性骨髓瘤患者中进行了首次人体临床试验,显示出快速、持久且强大的抗肿瘤活性 | 首次使用仅含重链抗原识别域的全人源抗BCMA CAR,结合4-1BB和CD3ζ结构域,设计为FHVH33-CD8BBZ,并在25例患者中验证了其高严格完全缓解率和良好的安全性 | 部分患者(4/12)产生了抗CAR抗体反应,且细胞因子释放综合征3级发生率为25%,需进一步优化降低免疫原性和毒性 | 评估全人源抗BCMA CAR T细胞疗法(FHVH-T)在复发多发性骨髓瘤中的安全性和疗效 | 25例复发多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 25例患者(其中24例可评估) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 768 | 2026-06-15 |
Galectin-3 aggravates microglial activation and tau transmission in tauopathy
2024-01-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165523
PMID:37988169
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研究论文 | 揭示了半乳糖凝集素-3在tau蛋白病中加剧小胶质细胞活化和tau蛋白传播的机制 | 首次发现Gal3在tau蛋白病小鼠和人类的小胶质细胞中上调,并阐明其通过细胞外囊泡和游离形式促进致病性tau蛋白积累和纤维化,以及单细胞RNA-seq揭示Gal3相关小胶质细胞亚群 | 未明确提及具体局限性,但可能包括对THY-Tau22小鼠模型的依赖性以及人体验证的进一步需求 | 探究Galectin-3在tau蛋白病中的作用及其机制 | 人诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞、THY-Tau22小鼠模型、tau蛋白病患者样本 | 机器学习 | 阿尔茨海默病,tau蛋白病 | 单细胞RNA测序,蛋白质相互作用分析 | NA | 单细胞基因表达数据,蛋白质数据 | THY-Tau22小鼠模型及人类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium用于单细胞RNA-Seq分析小鼠海马组织 |
| 769 | 2026-06-15 |
Age-related loss of Notch3 underlies brain vascular contractility deficiencies, glymphatic dysfunction, and neurodegeneration in mice
2024-01-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI166134
PMID:38015629
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研究论文 | 研究揭示年龄相关的Notch3信号缺失导致小鼠脑血管收缩功能缺陷、脑淋巴功能障碍和神经退行性变 | 首次证明年龄相关的Notch3缺失通过影响血管收缩功能和细胞外基质积累,直接导致脑淋巴流动障碍和神经退行性变,并发现与CADASIL病理特征相似 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,部分机制仍需进一步探索 | 阐明年龄如何影响脑血管系统及其分子机制,特别是Notch3信号通路的作用 | 小鼠和人脑血管组织 | 机器学习 | 血管性痴呆、神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、MRI | NA | 单细胞转录组数据、MRI成像数据 | 小鼠模型和人类脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 770 | 2026-06-07 |
SCTC: inference of developmental potential from single-cell transcriptional complexity
2024-06-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae340
PMID:38709881
|
论文 | 提出一种基于经济复杂性理论的新型指标SCTC,用于从单细胞转录组数据推断发育潜能和伪时间 | 首次将经济复杂性理论应用于单细胞转录组分析,提出比传统指标SCTD更准确的发育潜能度量标准 | 基于特定假设(基因表达在发育过程中非单调下降),可能不适用于所有生物系统 | 准确推断单细胞发育潜能和重建细胞发育伪时间路径 | 单细胞转录组数据中的细胞和基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督算法 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 771 | 2026-06-07 |
Senescence of human pancreatic beta cells enhances functional maturation through chromatin reorganization and promotes interferon responsiveness
2024-06-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae313
PMID:38682582
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研究论文 | 研究人类胰腺β细胞衰老通过染色质重组增强功能成熟并促进干扰素反应 | 首次揭示人类胰腺β细胞衰老通过染色质重组激活功能成熟基因增强子,并提高干扰素反应能力,而不产生典型的衰老相关分泌表型 | 未明确说明,但基于摘要可能缺乏体内功能验证或大规模临床样本验证 | 探究人类胰腺β细胞衰老状态及其对胰岛素分泌和干扰素反应的影响机制 | 人类胰腺β细胞(包括p16阳性衰老细胞) | machine learning | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成人胰腺β细胞数据集(单细胞转录组) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 772 | 2026-06-07 |
ImmunoPET imaging of Trop2 expression in solid tumors with nanobody tracers
2024-01, European journal of nuclear medicine and molecular imaging
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s00259-023-06454-3
PMID:37792026
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研究论文 | 开发针对Trop2的纳米抗体免疫PET探针,并在胰腺癌和胃癌临床前模型中评估其诊断能力 | 首次构建两种靶向Trop2的纳米抗体免疫PET探针([68Ga]Ga-NOTA-RTD98和[68Ga]Ga-NOTA-RTD01),在临床前模型中展示出优于[18F]-FDG的诊断性能 | 仅限临床前模型验证,尚未在人体中进行评估 | 研究跨膜糖蛋白Trop2在实体瘤中的表达,并开发特异性免疫PET探针用于肿瘤诊断 | 胰腺癌和胃癌细胞系及患者来源模型 | 计算机视觉 | 胰腺癌, 胃癌 | 免疫PET成像, 单细胞测序, 免疫组化, 流式细胞术 | NA | 图像, 测序数据, 组织微阵列 | 胰腺癌组织微阵列及多种胰腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 773 | 2026-06-07 |
Infiltrating lipid-rich macrophage subpopulations identified as a regulator of increasing prostate size in human benign prostatic hyperplasia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494476
PMID:39867899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现,在良性前列腺增生中,富含脂质的巨噬细胞亚群(TREM2高表达和MARCO高表达)可调节前列腺体积增大 | 首次定义了两个新的良性前列腺增生免疫亚群(TREM2高表达和MARCO高表达巨噬细胞),并揭示了脂质丰富的巨噬细胞可能加剧大前列腺患者的下尿路症状 | 需要进一步研究评估靶向这些细胞在良性前列腺增生中的治疗益处 | 探究巨噬细胞表型转变及其代谢改变在良性前列腺增生导致前列腺体积增大中的作用 | 来自10个大前列腺(>90克)和10个小前列腺(<40克)的CD45+过渡区白细胞 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 20个前列腺组织样本(10个大前列腺和10个小前列腺) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2026-06-07 |
Single-cell transcriptome analysis of medaka lymphocytes reveals absence of fully mature T cells in the thymus and the T-lineage commitment in the kidney
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1517467
PMID:39867910
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研究论文 | 通过对青鳉淋巴细胞进行单细胞转录组分析,揭示了胸腺中缺乏完全成熟的T细胞以及肾脏中T谱系定向分化的特征 | 首次利用scRNA-seq分析青鳉淋巴细胞发育,发现与斑马鱼不同的种属特异性特征,包括胸腺中缺乏成熟SP T细胞及肾脏中存在T谱系定向淋巴细胞前体 | 仅分析了胸腺和肾脏两个器官,未覆盖其他淋巴组织;研究基于单一突变体模型,可能无法完全反映正常发育过程 | 理解青鳉淋巴细胞发育的分子和细胞机制,并与斑马鱼进行比较以揭示硬骨鱼类的共性和种属特异性 | 青鳉淋巴细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 包含突变体和野生型青鳉的胸腺和肾脏淋巴细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 775 | 2026-06-07 |
ScRNA-seq unveils the functional characteristics of glioma-associated macrophages and the regulatory effects of chlorogenic acid on the immune microenvironment-a study based on mouse models and clinical practice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494806
PMID:39867913
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示胶质瘤相关巨噬细胞的功能特性及绿原酸对免疫微环境的调控作用 | 首次通过单细胞转录组学解析绿原酸对骨髓来源单核巨噬细胞和小胶质细胞分化轨迹及功能的调控机制,并验证其与STAT1的高亲和力 | 仅基于小鼠模型和单例临床患者数据,缺乏大规模临床验证 | 揭示胶质瘤相关巨噬细胞亚群与功能特征,探索绿原酸对免疫微环境的调控作用及临床应用潜力 | 胶质瘤模型小鼠、一例胶质瘤患者 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, PPI蛋白互作网络, 分子对接 | NA | 单细胞转录组数据 | 胶质瘤模型小鼠及1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 776 | 2026-06-07 |
Identification and validation of BATF as a prognostic biomarker and regulator of immune cell infiltration in acute myeloid leukemia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1429855
PMID:39872530
|
研究论文 | 鉴定并验证BATF在急性髓系白血病中作为预后生物标志物和免疫细胞浸润调节因子的作用 | 首次系统研究BATF在AML中的表达与预后关联、免疫调节作用及药物敏感性影响,结合生物信息学分析与实验验证 | 未提及具体局限性,可能包括样本量有限或机制研究深度不足 | 探索BATF在急性髓系白血病中的表达、预后价值及免疫调节机制 | 急性髓系白血病患者和细胞系(C1498小鼠模型) | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting, 流式细胞术, 单细胞测序, EdU试验, 集落形成试验, CCK-8试验 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞数据 | 来自TCGA和GEO数据库的AML患者数据,以及C1498小鼠模型 | NA | 单细胞测序, RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2026-06-07 |
Single-cell RNA-seq reveals immune cell heterogeneity and increased Th17 cells in human fibrotic skin diseases
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522076
PMID:39872534
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研究论文 | 本研究利用荧光激活细胞分选富集CD45+免疫细胞并进行单细胞RNA测序,构建了纤维化皮肤病的免疫细胞图谱,发现Th17细胞在瘢痕疙瘩中显著增加并促进成纤维细胞增殖、迁移和胶原表达 | 首次通过富集免疫细胞进行单细胞RNA测序,揭示了纤维化皮肤病中免疫细胞的精细图谱,并发现Th17细胞通过IL-17A促进成纤维细胞功能的广泛机制 | 未提及研究的具体局限性 | 探究纤维化皮肤病(以瘢痕疙瘩为代表)中免疫细胞的复杂细胞图谱及其在疾病发展中的作用 | 纤维化皮肤病(瘢痕疙瘩、增生性瘢痕和硬皮病)中的免疫细胞和成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | 纤维化皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 778 | 2026-06-07 |
The immune landscape of fetal chorionic villous tissue in term placenta
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1506305
PMID:39872537
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研究论文 | 该研究利用流式细胞术、单细胞RNA测序及染色质可及性分析,揭示了足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的表型与功能多样性,并探讨了孕前肥胖对胎儿免疫及神经发育的影响 | 首次在足月期对胎盘绒毛免疫细胞进行深度表型分析,并整合转录组与染色质可及性数据,同时探索孕前肥胖对绒毛髓系细胞及胎儿小胶质细胞的影响 | 样本量可能有限,且研究仅聚焦于无并发症的足月妊娠,未涉及病理妊娠状态 | 阐明足月胎盘绒毛组织中免疫细胞的组成、功能状态及其随妊娠期的变化,并评估孕前肥胖对免疫适应及胎儿神经发育的影响 | 足月胎盘绒毛组织中的免疫细胞(包括胎儿Hofbauer细胞和母体来源的巨噬细胞)及体外模型中的脐血源性小胶质细胞 | 机器学习和生物信息学 | 无特定疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CITE-seq、单核ATAC测序(snATAC-seq)、流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据 | 人类足月妊娠胎盘绒毛组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单核ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq和CITE-seq;10x Chromium用于snATAC-seq |
| 779 | 2026-06-02 |
Single-cell RNA sequencing offers opportunities to explore the depth of physiology, adaptation, and biochemistry in non-model organisms exposed to pollution
2024-12, Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics
DOI:10.1016/j.cbd.2024.101339
PMID:39393164
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综述 | 本短篇综述强调了单细胞RNA测序在揭示基因型-表型关系中的关键作用,特别是在非模式生物对环境污染反应中的应用潜力 | 将单细胞RNA测序的应用范围从典型疾病研究扩展到非模式生物对环境污染物的反应,提供了对细胞异质性的全面理解 | 未详细讨论单细胞RNA测序在非模式生物中应用的技术挑战或数据分析难点 | 通过分析已发表文章,说明单细胞RNA测序在生物学领域的最新进展,并探讨其在非模式生物对环境污染反应研究中的潜力 | 单细胞RNA测序应用相关的已发表文章 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 780 | 2026-06-02 |
Batch effects correction in scRNA-seq based on biological-noise decoupling autoencoder and central-cross loss
2024-12, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 提出基于生物噪声解耦自编码器和中心交叉损失的BDACL模型,用于消除单细胞RNA测序数据的批次效应 | 通过自编码器重构数据和层次聚类树逐步合并小簇,引入中心交叉损失以无监督方式消除批次效应,同时保留稀有细胞类型 | 未提及具体局限性 | 解决单细胞RNA测序数据中批次效应导致稀有细胞类型信息丢失的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |