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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-10-05 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to regulate cortical excitability in TDP-43 related neurodegeneration
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.30.601396
PMID:39005475
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研究论文 | 本研究揭示了杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用调节TDP-43相关神经退行性疾病中皮层兴奋性的神经保护机制 | 首次发现具有独特形态和转录特征的杆状小胶质细胞亚群,并证明其通过调节兴奋性突触输入来抑制运动皮层过度活跃 | 研究仅限于TDP-43神经退行性疾病小鼠模型,尚未在人类或其他神经退行性疾病模型中验证 | 探究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性疾病运动皮层回路过度兴奋中的调控作用 | TDP-43神经退行性疾病小鼠模型(rNLS8)的运动皮层神经元和小胶质细胞 | 神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症(ALS) | 多通道探针记录、纵向钙成像、空间转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 电生理信号、钙成像数据、转录组数据 | rNLS8转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 762 | 2025-10-05 |
Preventive Treatment with a CD73 Small Molecule Inhibitor Enhances Immune Surveillance in K-Ras Mutant Pancreatic Intraepithelial Neoplasia
2024-Oct-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-24-0200
PMID:39099209
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研究论文 | 本研究探讨CD73小分子抑制剂AB-680在K-Ras突变胰腺上皮内瘤变(PanIN)中的免疫预防作用 | 首次证明CD73抑制剂可通过增强免疫监视机制预防PanIN进展,并发现其能扩增TCR和BCR独特克隆型 | 研究仅使用基因工程小鼠模型,尚未在人体验证;观察时间有限(3个月治疗期) | 评估CD73抑制剂在胰腺癌前病变中的免疫预防效果 | KrasG12D; PdxCre1 (KC)基因工程小鼠模型的胰腺组织 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | KC基因工程小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 763 | 2025-10-05 |
Impeller: a path-based heterogeneous graph learning method for spatial transcriptomic data imputation
2024-06-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae339
PMID:38806165
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研究论文 | 提出一种基于路径的异质图学习方法Impeller,用于空间转录组数据插补 | 构建包含空间邻近性和表达相似性两种边的异质图,通过可学习路径算子避免传统拉普拉斯矩阵的过平滑问题,同时建模短程和长程细胞间相互作用 | NA | 解决空间转录组数据中过度缺失值的问题,提高数据完整性和可解释性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | GNN(图神经网络) | 空间基因表达数据 | 来自三个流行平台和两个物种的多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 764 | 2025-10-05 |
Molecular cascades and cell type-specific signatures in ASD revealed by single-cell genomics
2024-05-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adh2602
PMID:38781372
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研究论文 | 通过单细胞基因组学技术揭示自闭症谱系障碍中细胞类型特异的分子级联反应和特征 | 首次结合单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学技术,系统揭示自闭症中细胞类型特异性基因调控网络的失调 | 研究基于死后脑组织样本,可能无法完全反映活体状态下的分子变化 | 探索自闭症谱系障碍的分子机制和遗传易感性 | 自闭症患者死后脑组织 | 单细胞基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 765 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of 5-aminolevulinic acid intraoperative labeling specificity for glioblastoma
2024-04-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2023.7.JNS23122
PMID:37773782
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析评估5-氨基乙酰丙酸在胶质母细胞瘤术中标记的特异性 | 首次在单细胞水平验证5-ALA标记胶质瘤细胞的特异性,发现其标记并非仅针对肿瘤细胞 | 需要进一步系统比较5-ALA与其他荧光引导手术替代方案的性能 | 确定5-ALA在胶质母细胞瘤中标记不同细胞类型的特异性 | 人类胶质母细胞瘤手术标本、胶质瘤细胞培养模型、小鼠胶质瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞光学表型与表达测序(SCOPE-seq2)、单细胞RNA测序、细胞培养 | NA | 图像、RNA测序数据 | 人类胶质母细胞瘤手术标本、细胞培养模型、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | SCOPE-seq2(配对单细胞成像和RNA测序方法) |
| 766 | 2025-10-05 |
Inducible pluripotent stem cells to study human mast cell trajectories
2024-Oct, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.07.003
PMID:39038754
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研究论文 | 本研究开发了一种从诱导多能干细胞分化人类肥大细胞的体外模型,用于研究人类肥大细胞的分化轨迹 | 首次建立了基于iPSC的人类肥大细胞分化模型,通过单细胞RNA测序揭示了肥大细胞前体亚型和成熟状态的转录特征 | 研究仅限于体外模型系统,可能无法完全模拟体内肥大细胞发育的复杂性 | 研究人类肥大细胞的分化轨迹和亚型特征 | 人类诱导多能干细胞分化的肥大细胞及其前体细胞 | 细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 细胞学分析 | 体外细胞分化模型 | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 2050个单细胞(来自第4周MCFC培养物) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 767 | 2025-10-05 |
Identification of Regulatory RNA-Binding Proteins Associated with Immune Infiltration in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
2024-08-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300498
PMID:38912837
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研究论文 | 通过分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别与喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的调控性RNA结合蛋白和可变剪接事件 | 首次系统鉴定与喉鳞状细胞癌免疫浸润相关的RNA结合蛋白及其调控的可变剪接事件,发现RBM47在髓系细胞中上调并与预后显著相关 | 样本量有限(20对癌与癌旁组织),仅使用公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索RNA结合蛋白和可变剪接事件在喉鳞状细胞癌免疫浸润中的作用机制 | 喉鳞状细胞癌组织和免疫细胞 | 生物信息学 | 喉癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,可变剪接分析 | edgeR差异表达分析,科学反卷积算法 | RNA测序数据,单细胞RNA测序数据 | 20对喉癌和癌旁组织,117个喉癌样本,2个单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 768 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies WARS1+ Mesenchymal Stem Cells with Enhanced Immunomodulatory Capacity and Improved Therapeutic Efficacy
2024-08-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300752
PMID:38856632
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定具有增强免疫调节能力的WARS1+间充质干细胞,并验证其在银屑病治疗中的疗效提升 | 首次发现WARS1是增强脐带间充质干细胞免疫调节能力的关键调控因子,并阐明其通过RhoA-Akt轴发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 提高脐带间充质干细胞对银屑病的治疗效果 | 脐带来源的间充质干细胞和银屑病小鼠模型 | 单细胞测序 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 769 | 2025-10-05 |
Single-cell landscape of functionally cured chronic hepatitis B patients reveals activation of innate and altered CD4-CTL-driven adaptive immunity
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.017
PMID:38423478
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了功能性治愈慢性乙型肝炎患者的免疫病理特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了慢性乙型肝炎与功能性治愈患者的肝内组织和外周血免疫细胞状态,发现了CD4细胞毒性T淋巴细胞和天然免疫细胞激活等新机制 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探索慢性乙型肝炎功能性治愈的免疫病理机制和生物标志物 | 慢性乙型肝炎患者和功能性治愈患者的肝内组织及匹配的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 | 慢性乙型肝炎和功能性治愈患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 770 | 2025-10-05 |
Lupus dermal fibroblasts are proinflammatory and exhibit a profibrotic phenotype in scarring skin disease
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173437
PMID:38358820
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研究论文 | 本研究探讨狼疮皮肤成纤维细胞的炎症反应特征及其在瘢痕形成中的作用机制 | 首次揭示系统性红斑狼疮成纤维细胞对炎症的过度反应特性,并发现瘢痕与非瘢痕患者存在差异性的TGF-β反应通路 | 样本量有限(56例),仅针对皮肤成纤维细胞进行研究 | 探究皮肤狼疮患者瘢痕形成的细胞机制 | 系统性红斑狼疮和皮肤狼疮患者的真皮成纤维细胞 | 细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序,细胞因子刺激实验 | NA | 基因表达数据 | 22例狼疮患者和34例健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 771 | 2025-10-05 |
Single-cell analyses of metastatic bone marrow in human neuroblastoma reveals microenvironmental remodeling and metastatic signature
2024-02-15, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.173337
PMID:38358826
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析神经母细胞瘤骨转移骨髓微环境,揭示免疫细胞重塑和转移特征 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘神经母细胞瘤骨转移微环境的细胞组成和转录重编程特征 | 样本量相对有限,需要更大队列验证发现 | 探究神经母细胞瘤骨转移的微环境机制和开发新治疗策略 | 神经母细胞瘤患者的骨髓样本 | 单细胞组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包含转移和非转移患者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 772 | 2025-10-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576260
PMID:38328172
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研究论文 | 本研究应用深度迁移学习工具DEGAS识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 首次使用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据中,识别出特定的β细胞亚群 | 研究样本量有限,未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群以更好理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq, 免疫染色 | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据, 批量表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis defines LGALS1+ fibroblasts that promote proliferation and migration of intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-11-25, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae023
PMID:38862197
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肝内胆管癌肿瘤微环境,鉴定出促进肿瘤恶性表型的LGALS1+成纤维细胞亚群 | 首次在肝内胆管癌中鉴定出特异性表达LGALS1的成纤维细胞亚群,并阐明其通过调控CCR2、ADAM15和β-整合素促进肿瘤进展的机制 | 样本量较小(14例患者),需更大规模研究验证 | 探究肝内胆管癌肿瘤异质性及成纤维细胞在肿瘤微环境中的作用 | 14例初治肝内胆管癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 单细胞测序分析 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2025-10-05 |
Decoding Functional and Developmental Trajectories of Tissue-Resident Uterine Dendritic Cells Through Integrative Omics
2024-Nov-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5424920/v1
PMID:39606471
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研究论文 | 通过整合多组学方法解析子宫驻留树突状细胞的功能和发育轨迹 | 首次系统鉴定人类子宫内膜中子宫树突状细胞的亚型及其发育轨迹,并揭示不同亚型在胚胎植入前后的特异性功能 | 研究样本数量有限,且主要关注早期妊娠阶段 | 阐明子宫树突状细胞的起源、分子特征及其在子宫内膜功能和胚胎植入过程中的作用 | 人类子宫内膜组织中的子宫树突状细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据,表面蛋白表达数据 | 不同月经周期和早期妊娠阶段的子宫组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
| 775 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing reveals the impact of endothelial cell PIEZO1 expression on thoracic aortic aneurysm
2024-06, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.04.015
PMID:38718563
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示内皮细胞PIEZO1表达对胸主动脉瘤的影响 | 首次发现PIEZO1在胸主动脉瘤中表达降低,并证实其激动剂Yoda1可通过干预巨噬细胞浸润、细胞外基质降解和新血管形成抑制动脉瘤形成 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究PIEZO1在胸主动脉瘤发病机制中的作用 | 胸主动脉瘤患者样本和基因工程小鼠模型 | 单细胞生物学 | 胸主动脉瘤 | 单细胞测序,基因敲除模型,体内外药理学干预 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 776 | 2025-10-05 |
Syngeneic murine models with distinct immune microenvironments represent subsets of human intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-06, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.008
PMID:38458319
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研究论文 | 本研究开发并表征了具有不同遗传驱动因素的免疫活性小鼠肝内胆管癌模型,揭示了肿瘤基因型与免疫微环境表型之间的相关性 | 首次开发了Fbxw7ΔF/Akt驱动的肝内胆管癌遗传小鼠模型,并系统比较了三种不同基因型模型的肿瘤免疫微环境特征和免疫治疗反应差异 | 研究基于小鼠模型,其临床转化价值需要进一步验证;样本规模相对有限 | 阐明胆管癌肿瘤免疫微环境特征,测试新型免疫治疗策略 | 肝内胆管癌小鼠模型和人类胆管癌患者队列 | 肿瘤免疫学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序,CITE-seq,全外显子测序,批量RNA测序 | 小鼠遗传模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | 三种不同基因型的小鼠胆管癌模型 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 777 | 2024-08-07 |
Correction to 'Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno'
2024-Jan-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1229
PMID:38109292
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 778 | 2025-10-05 |
Fate (or state) of CA2 neurons in a mineralocorticoid receptor knockout
2024-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.29.626110
PMID:39651204
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法探究盐皮质激素受体敲除后海马CA2区神经元的命运变化 | 首次发现MR敲除导致CA2神经元获得CA1样分子表型,揭示了MR在控制CA2神经元发育状态中的关键作用 | 研究主要关注分子表型变化,对行为功能影响的直接证据不足 | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2区神经元命运的影响 | 小鼠海马CA2区神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 条件性基因敲除模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 779 | 2025-10-05 |
Linking transcriptome and morphology in bone cells at cellular resolution with generative AI
2024-Dec-31, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjae151
PMID:39303095
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观点文章 | 探讨生成式AI在骨细胞转录组与形态学关联分析中的应用前景与挑战 | 首次系统提出将生成式AI应用于骨细胞多模态数据整合分析,实现细胞分辨率下的转录组与形态学关联研究 | 骨单细胞数据集存在技术偏差、重要骨细胞类型缺乏分析、空间信息不足等问题 | 推动生成式AI在骨细胞生物学研究中的应用,揭示细胞水平的复杂生物过程 | 骨细胞 | 计算机视觉,自然语言处理,机器学习 | 骨科疾病 | 单细胞测序,空间转录组学 | 生成式AI | 组织学图像,单细胞分子数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 780 | 2025-10-05 |
Substrate Stiffness Dictates Unique Doxorubicin-induced Senescence-associated Secretory Phenotypes and Transcriptomic Signatures in Human Pulmonary Fibroblasts
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.623471
PMID:39605579
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研究论文 | 研究机械张力通过基质刚度调控人肺成纤维细胞衰老相关分泌表型和转录组特征 | 首次揭示基质刚度特异性影响多柔比星诱导的细胞衰老和SASP表型,并发现高刚度驱动的胶原蛋白富集特征 | 研究主要基于体外细胞模型,体内验证相对有限 | 探究机械力刺激对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响机制 | 人原代肺成纤维细胞(IMR-90)和小鼠肺纤维化模型 | 细胞生物学 | 肺纤维化 | 质谱分析、转录组测序、单细胞RNA测序、计算元分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 人原代肺成纤维细胞在不同刚度基质上的培养模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |