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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-10-06 |
Characterization of the distinct immune microenvironments between hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216799
PMID:38479553
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统比较了肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤免疫微环境差异 | 首次通过整合41个单细胞RNA测序样本系统比较两种主要原发性肝癌的免疫微环境,并发现HCC中EGR1巨噬细胞的特异性富集 | 样本数量相对有限,仅包含41个样本 | 系统评估肝细胞癌和肝内胆管癌肿瘤免疫微环境的异同 | 肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤组织样本 | 单细胞基因组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 41个单细胞RNA测序样本,涵盖两种恶性肿瘤的四种不同组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 762 | 2025-10-06 |
Association of preoperative aspartate aminotransferase to platelet ratio index with outcomes and tumour microenvironment among colorectal cancer with liver metastases
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216778
PMID:38458593
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研究论文 | 探讨术前APRI指标对结直肠癌肝转移患者预后及肿瘤微环境的预测价值 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组化揭示APRI与肿瘤微环境的关联机制 | 回顾性多中心研究,需前瞻性研究进一步验证 | 寻找改善结直肠癌肝转移患者预后预测的可靠生物标志物 | 1323例接受同步切除的结直肠癌肝转移患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化/免疫荧光 | Cox风险回归模型 | 血液检测数据, 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 1323例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 多重免疫组化 | NA | NA |
| 763 | 2025-10-06 |
CD63+ cancer-associated fibroblasts confer CDK4/6 inhibitor resistance to breast cancer cells by exosomal miR-20
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216747
PMID:38403110
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研究论文 | 本研究揭示CD63+癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-20介导乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂产生耐药性 | 首次发现CD63+癌症相关成纤维细胞亚群在CDK4/6抑制剂耐药肿瘤组织中富集,并阐明其通过外泌体miR-20靶向RB1 mRNA的耐药机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和肿瘤异种移植模型,临床验证尚需进一步研究 | 探究乳腺癌对CDK4/6抑制剂产生耐药性的机制及潜在治疗策略 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤异种移植模型 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 外泌体分析, 纳米颗粒合成 | 肿瘤异种移植模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 764 | 2025-10-06 |
Comparable CD8+ T-cell responses to SARS-CoV-2 vaccination in single-cell transcriptomics of recently allogeneic transplanted patients and healthy individuals
2024-03, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29539
PMID:38516755
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学比较了异基因造血干细胞移植患者与健康个体对SARS-CoV-2疫苗的CD8+ T细胞应答 | 首次在ASCT患者中结合单细胞RNA测序与TCR/BCR谱分析,揭示疫苗诱导的CD8 T细胞应答特征 | 样本量有限,仅40%患者产生保护性抗体滴度 | 评估ASCT患者对SARS-CoV-2疫苗的免疫应答特征 | 异基因造血干细胞移植患者和健康疫苗接种者 | 单细胞转录组学 | 免疫缺陷状态 | 单细胞RNA测序,TCR/BCR谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,血清学数据 | ASCT患者队列与公开健康疫苗接种者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 765 | 2025-10-06 |
CCDC66 mutations are associated with high myopia through affected cell mitosis
2024-02-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109434
PMID:37852749
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研究论文 | 本研究通过外显子测序发现CCDC66基因突变与高度近视相关,并探讨了其通过影响细胞有丝分裂导致高度近视的机制 | 首次发现CCDC66基因无义突变(c.C172T, p.Q58X)与高度近视表型共分离,并证明CCDC66缺陷会通过影响微管聚合和细胞有丝分裂过程导致视网膜发育异常 | 样本量相对有限(一个家系和200例散发病例),功能研究主要在HEK293和Hela细胞系中进行,未在视网膜原代细胞中验证 | 鉴定高度近视的致病基因并探索其致病机制 | 高度近视患者家系和散发病例,人类和小鼠胚胎视网膜,HEK293和Hela细胞系 | 遗传学 | 高度近视 | 外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因敲除,免疫荧光染色,免疫印迹 | NA | 基因组数据,转录组数据,细胞图像数据 | 1个高度近视家系和200例散发性高度近视患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 766 | 2025-10-06 |
CRISPR-Cas9 Genome Editing Allows Generation of the Mouse Lung in a Rat
2024-07-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0964OC
PMID:38507610
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9基因编辑和囊胚互补技术,首次在大鼠体内成功生成了小鼠肺组织 | 首次实现跨物种(小鼠-大鼠)肺组织生成,胚胎干细胞对肺组织贡献率达到近99% | 研究仅限于小鼠和大鼠模型,尚未在大型动物或人类中验证 | 探索利用大型动物作为生物反应器生成人类肺器官的可能性 | 小鼠胚胎干细胞和大鼠胚胎 | 发育生物学 | 肺发育不全 | CRISPR-Cas9基因编辑,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,免疫染色图像,流式细胞术数据 | 基因编辑大鼠胚胎和鼠-大鼠嵌合体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 767 | 2025-10-06 |
Immune Response following FLASH and Conventional Radiation in Diffuse Midline Glioma
2024-Jul-15, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.01.219
PMID:38364947
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了FLASH和常规放疗对弥漫中线胶质瘤肿瘤免疫微环境的影响 | 首次以单细胞分辨率绘制了常规和FLASH放疗对DMG肿瘤免疫微环境的免疫改变图谱 | 研究样本量有限,仅使用小鼠模型,时间点观察有限(仅第4天和第10天) | 探索FLASH和常规放疗对弥漫中线胶质瘤肿瘤免疫微环境的影响差异 | 原位同系小鼠脑干弥漫中线胶质瘤模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 弥漫中线胶质瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠脑干DMG模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 768 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-04-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216723
PMID:38342234
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示食管鳞状细胞癌上皮间质转化的分子异质性景观 | 首次在单细胞水平系统描绘ESCC中EMT的分子异质性,发现SERPINH1作为新的EMT标志物,并验证靶向EMT的潜在药物 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探究食管鳞状细胞癌中上皮间质转化的分子异质性及其临床意义 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,TCGA数据 | 44名患者的39个肿瘤样本和16个癌旁样本,共209,231个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 769 | 2025-10-06 |
Up-regulation of RAN by MYBL2 maintains osteosarcoma cancer stem-like cells population during heterogeneous tumor generation
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216708
PMID:38336287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤癌症干细胞通过MYBL2-RAN通路维持异质性肿瘤的分子机制 | 首次发现MYBL2转录上调RAN并通过增强MYC蛋白核积累促进癌症干细胞自我更新的正反馈机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索骨肉瘤癌症干细胞维持肿瘤异质性的调控机制 | 骨肉瘤癌症干细胞及其分化的异质性细胞群体 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床骨肉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 770 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATM promotes PD-L1 expression by activating JNK/c-Jun/TNF-α signaling axis in triple-negative breast cancer
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216642
PMID:38278470
|
研究论文 | 本研究揭示ATM通过抑制JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负向调控PD-L1表达的新机制 | 首次发现ATM通过JNK/c-Jun/TNF-α信号通路负向调控PD-L1表达的分子机制 | 样本量有限(4例scRNA-seq,86例免疫组化),需更大规模研究验证 | 探索ATM调控PD-L1表达的分子机制及其在TNBC免疫治疗中的意义 | 三阴性乳腺癌细胞系、动物模型和临床标本 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化染色,细胞因子阵列分析,Western blot,荧光素酶报告基因检测 | 基因敲低稳定细胞系,动物模型 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床病理数据 | 4例scRNA-seq临床标本,86例免疫组化TNBC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 771 | 2025-10-06 |
Single-cell characterization of infiltrating T cells identifies novel targets for gallbladder cancer immunotherapy
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216675
PMID:38280478
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建胆囊癌浸润T细胞图谱并建立分子分型标准 | 首次基于T细胞特征建立胆囊癌分子分型标准,识别了12种T细胞亚型及其与肿瘤微环境的关系 | 未提及样本量大小和研究队列的局限性 | 探索胆囊癌中T细胞的异质性并开发免疫治疗新靶点 | 胆囊癌患者的浸润T细胞 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 772 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant chemotherapy-induced remodeling of human hormonal receptor-positive breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03-31, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216656
PMID:38266804
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示新辅助化疗对人类激素受体阳性乳腺癌的免疫微环境重塑作用 | 首次在单细胞水平系统揭示HR乳腺癌化疗前后免疫细胞组成变化,发现新的免疫细胞亚群与化疗敏感性相关 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 探索激素受体阳性乳腺癌化疗耐药机制及化疗对肿瘤微环境的重塑作用 | 激素受体阳性乳腺癌患者配对的化疗前后肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 配对的化疗前后HR乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 773 | 2025-10-06 |
scRNA-seq of colorectal cancer shows regional immune atlas with the function of CD20+ B cells
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216664
PMID:38253219
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌不同区域的免疫图谱,揭示CD20+ B细胞的功能 | 首次系统描绘结直肠癌不同解剖区域的免疫特征,发现CD20+ B细胞在右半和左半结直肠癌中具有不同的发育轨迹并与预后相关 | 样本量相对有限(19个样本),需要在更大队列中验证 | 表征结直肠癌不同区域的免疫景观并寻找潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者肿瘤组织和配对正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19个样本(来自4个区域),共39,484个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 774 | 2025-10-06 |
Updates in Skin Cancer in Transplant Recipients and Immunosuppressed Patients: Review of the 2022-2023 Scientific Symposium of the International Immunosuppression and Transplant Skin Cancer Collaborative
2024, Transplant international : official journal of the European Society for Organ Transplantation
IF:2.7Q2
DOI:10.3389/ti.2024.12387
PMID:38562207
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综述 | 总结2022年国际免疫抑制与移植皮肤癌协作组科学研讨会关于移植受者和免疫抑制患者皮肤癌的最新研究进展 | 汇集了皮肤癌在免疫抑制人群中的最新研究成果,包括化学预防、免疫抑制方案、免疫治疗和空间转录组学等前沿领域 | NA | 回顾和总结移植受者和长期免疫抑制患者皮肤癌研究领域的最新科学进展 | 实体器官移植受者和其他形式长期免疫抑制患者 | NA | 皮肤癌 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 775 | 2025-10-06 |
Airway epithelial cell response to RSV is mostly impaired in goblet and multiciliated cells in asthma
2024-08-19, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thorax-2023-220230
PMID:38373824
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了哮喘患者和健康捐赠者支气管上皮细胞对呼吸道合胞病毒(RSV)感染的转录反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示了哮喘患者杯状细胞和多纤毛细胞对RSV感染的应答受损 | 样本量较小(哮喘患者n=8,健康捐赠者n=8),需要更大规模研究验证 | 探究哮喘患者支气管上皮细胞对RSV感染的分子应答机制 | 原代支气管上皮细胞(pBECs) | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16例(8例哮喘患者,8例健康捐赠者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 776 | 2025-10-06 |
scGPT: toward building a foundation model for single-cell multi-omics using generative AI
2024-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02201-0
PMID:38409223
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研究论文 | 开发基于生成式预训练变换器的单细胞多组学基础模型scGPT | 首次将生成式预训练模型应用于单细胞生物学领域,构建了包含3300多万个细胞的跨组学基础模型 | NA | 探索基础模型在细胞生物学和遗传研究中的适用性 | 单细胞测序数据中的基因和细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 生成式预训练变换器 | 单细胞多组学数据 | 超过3300万个细胞 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 777 | 2025-10-06 |
Genomic and single-cell characterization of patient-derived tumor organoid models of head and neck squamous cell carcinoma
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601068
PMID:39005427
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研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官模型,揭示了肿瘤异质性特征及其与顺铂治疗反应的关系 | 首次在头颈部鳞癌类器官模型中系统表征基因组特征和单细胞异质性,发现混合上皮-间质转化状态与顺铂耐药的相关性 | 样本量相对有限(31例患者),需要更大规模验证研究结果 | 建立头颈部鳞癌患者来源肿瘤类器官模型,研究肿瘤异质性与治疗反应机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官 | 数字病理 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 患者来源肿瘤类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 31例头颈部鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 778 | 2025-10-06 |
Early Developmental Origins of Cortical Disorders Modeled in Human Neural Stem Cells
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598925
PMID:38915580
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研究论文 | 通过人类神经干细胞研究早期端脑发育阶段与皮质障碍病因的关联 | 首次在人类神经干细胞中模拟皮质障碍的早期发育起源,揭示了疾病特异性关键阶段和跨疾病的汇聚信号通路 | 研究主要基于体外模型,需要进一步验证在完整生物系统中的适用性 | 探索人类端脑早期发育阶段在皮质障碍病因中的作用机制 | 人类神经干细胞、自闭症患者来源的神经干细胞 | 发育神经生物学 | 皮质障碍、自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 779 | 2025-10-06 |
Prognostic gene landscapes and therapeutic insights in sepsis-induced coagulopathy
2024-05, Thrombosis research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.thromres.2024.03.011
PMID:38513536
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研究论文 | 本研究通过分析脓毒症患者的转录组数据,识别了与凝血相关的关键基因,并开发了预后模型和列线图来预测患者生存 | 首次通过单细胞测序揭示脓毒症中血小板与免疫细胞间的通讯改变,并发现FYN基因在凝血功能障碍中的核心作用 | 研究样本量有限,机制研究主要在动物模型中进行,需要进一步临床验证 | 探索脓毒症诱导凝血病(SIC)的预后基因标志物和治疗靶点 | 脓毒症患者和脓毒症大鼠模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞测序, 实时定量PCR | 预后模型, 列线图, 共识聚类 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 脓毒症患者全血转录组数据,脓毒症大鼠模型 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 780 | 2025-10-06 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2024-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.15.589676
PMID:38659941
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研究论文 | 研究发现小分子抑制剂RMC-113通过双重抑制PIP4K2C和PIKfyve脂质激酶,逆转SARS-CoV-2诱导的自噬流损伤,发挥广谱抗病毒作用 | 首次揭示PIP4K2C在SARS-CoV-2进入、RNA复制和组装/释放过程中的作用,并发现其与病毒非结构蛋白6结合调控自噬流 | NA | 开发广谱抗病毒药物并阐明其作用机制 | 人类肺类器官和多种RNA病毒包括SARS-CoV-2 | 病毒学 | COVID-19 | 脂质组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、功能测定 | NA | 分子数据、转录组数据、功能测定数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |