单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7852 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2024-12-16 |
Integration of spatial and single-cell data across modalities with weakly linked features
2024-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01935-0
PMID:37679544
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MaxFuse的跨模态数据整合方法，通过迭代共嵌入、数据平滑和细胞匹配，能够在特征弱关联的情况下实现高质量的跨模态数据整合 | MaxFuse方法在特征弱关联的情况下表现出高鲁棒性和准确性，相较于现有方法在关键评估指标上实现了20~70%的相对改进 | NA | 开发一种能够在特征弱关联的情况下实现高质量跨模态数据整合的方法 | 跨模态的单细胞和空间数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞和空间测序 | NA | 多模态数据 | NA |
| 762 | 2024-12-16 |
Integration of Pan-Cancer Cell Line and Single-Cell Transcriptomic Profiles Enables Inference of Therapeutic Vulnerabilities in Heterogeneous Tumors
2024-06-14, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3005
PMID:38581448
|
研究论文 | 本文开发了一种名为scIDUC的计算框架，通过整合单细胞转录组数据和泛癌细胞系筛选数据，预测个体细胞的药物疗效 | 提出了scIDUC框架，能够高效地将单细胞转录组数据转化为个体细胞的药物反应预测，为异质性肿瘤的治疗提供了新工具 | 需要进一步验证该框架在更多疾病类型和更大样本量中的适用性和准确性 | 开发一种能够预测异质性肿瘤中个体细胞药物反应的计算工具 | 单细胞转录组数据和泛癌细胞系筛选数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及横纹肌肉瘤、胰腺导管腺癌和去势抵抗性前列腺癌三种不同疾病的细胞系 |
| 763 | 2024-12-16 |
Charting the cellular landscape of pulmonary arterial hypertension through single-cell omics
2024-May-03, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02823-0
PMID:38702687
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术，特别是单细胞RNA测序（scRNAseq），如何增强我们对肺动脉高压（PAH）的理解 | scRNAseq提供了更精细的视角，详细描述了PAH中的细胞多样性，识别了独特的细胞亚群、基因网络和驱动疾病的分子通路 | 本文主要讨论了现有研究的结果，未涉及具体的实验数据或方法 | 探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用及其对疾病理解的影响 | 肺动脉高压（PAH）的细胞病理学 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 涉及人类、大鼠和小鼠模型 |
| 764 | 2024-12-16 |
CXCR6-positive circulating mucosal-associated invariant T cells can identify patients with non-small cell lung cancer responding to anti-PD-1 immunotherapy
2024-May-03, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03046-3
PMID:38698468
|
研究论文 | 研究探讨了黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）在非小细胞肺癌（NSCLC）中的免疫特征及其与抗PD-1免疫治疗疗效的相关性 | 首次揭示了CXCR6阳性CD8+MAIT细胞在预测NSCLC患者对PD-1免疫治疗反应中的潜在作用 | 研究样本量较小，需要进一步验证结果的普适性 | 探讨MAIT细胞在NSCLC中的免疫特征及其与免疫检查点抑制剂治疗疗效的相关性 | 非小细胞肺癌患者及其对PD-1免疫治疗的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、多重免疫荧光检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、免疫荧光数据 | 转移性非小细胞肺癌患者的血液和肺组织样本 |
| 765 | 2024-12-16 |
Molecular mechanisms reconstruction from single-cell multi-omics data with HuMMuS
2024-05-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae143
PMID:38460192
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为HuMMuS的新方法，用于从单细胞多组学数据中推断调控机制 | HuMMuS能够捕捉生物大分子之间的合作，并可以轻松包含额外的分子调控层，这是与现有技术的主要区别 | NA | 开发一种新方法来推断单细胞多组学数据中的调控机制 | 单细胞多组学数据中的调控机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 多组学数据 | 小鼠大脑皮层的snmC-seq、scATAC-seq和scRNA-seq数据 |
| 766 | 2024-12-16 |
Analyzing scRNA-seq data by CCP-assisted UMAP and tSNE
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0311791
PMID:39671349
|
研究论文 | 本文研究了如何通过CCP辅助的UMAP和tSNE方法分析scRNA-seq数据，以提高可视化和准确性 | 本文引入了CCP方法作为UMAP和tSNE的初始化工具，显著提高了这两种降维技术的可视化和准确性 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的准确性和可视化效果 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 21个公开数据集 |
| 767 | 2024-12-15 |
Dynamic changes in serum adenosine and the adenosine metabolism-based signature for prognosis in HER2-positive metastatic breast cancer patients
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39545
PMID:39669152
|
研究论文 | 研究探讨了HER2阳性转移性乳腺癌患者中血清腺苷及其代谢相关标志物在预后中的作用 | 首次动态监测HER2阳性转移性乳腺癌患者的血清腺苷水平，并验证了其在曲妥珠单抗治疗中的预测价值 | 研究样本量较小，且仅限于HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 探索腺苷在HER2阳性转移性乳腺癌中的预后意义及其在曲妥珠单抗治疗中的预测作用 | HER2阳性转移性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | DESeq2 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 109名HER2阳性转移性乳腺癌患者 |
| 768 | 2024-12-15 |
Cancer specific up-regulated lactate genes associated with immunotherapy resistance in a pan-cancer analysis
2024-Dec-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39491
PMID:39669156
|
研究论文 | 本文通过比较TCGA队列中的恶性组织和正常组织，定义了一个泛癌上调乳酸评分，并评估了其在非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤中的免疫治疗效果 | 首次识别出癌症内在的乳酸特征，并揭示了其与免疫检查点抑制剂抵抗的相关性 | 研究主要基于TCGA和CPTAC数据集，可能存在数据偏倚；验证性研究仅限于NSCLC队列 | 识别与免疫治疗抵抗相关的癌症特异性上调乳酸基因，并探讨其潜在机制 | 非小细胞肺癌、转移性肾癌、膀胱癌和黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 转录组学和蛋白质组学数据 | 涉及TCGA、CPTAC以及内部NSCLC队列的多个样本 |
| 769 | 2024-12-15 |
O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner
2024-Dec-13, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae268
PMID:39671515
|
研究论文 | 本文研究了O-GlcNAcylation稳定WTAP通过N6-甲基腺苷依赖的方式促进胶质母细胞瘤恶性进展的机制 | 首次揭示了WTAP通过O-GlcNAcylation和去泛素化协同增强其蛋白稳定性，进而通过m6A修饰促进LOXL2 mRNA稳定性和蛋白分泌，从而调控胶质母细胞瘤干细胞和巨噬细胞的相互作用 | 实验主要在体外和体内模型中进行，缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨WTAP在胶质母细胞瘤恶性进展中的作用及其机制，并评估其作为免疫治疗靶点的潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞、巨噬细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、质谱、RNA免疫沉淀、共免疫沉淀 | NA | RNA | 涉及单细胞和bulk RNA测序数据，具体样本数量未明确 |
| 770 | 2024-12-15 |
Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases
2024-Dec-13, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae688
PMID:39672802
|
研究论文 | 研究系统性硬化症（SSc）和其他风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型，揭示其激活、信号通路和治疗反应的机制 | 首次揭示了FcγR表达的巨噬细胞在SSc中的促吞噬和促炎作用，并提出了尼达尼布可能的治疗潜力 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内实验验证 | 揭示驱动系统性硬化症和其他风湿性疾病中巨噬细胞增强吞噬作用的机制 | 系统性硬化症（SSc）、类风湿性关节炎（RA）、银屑病关节炎（PsA）和轴性脊柱炎（axSpA）患者的巨噬细胞 | NA | 风湿性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、RT-qPCR、Western blot | NA | RNA | 健康对照和SSc患者的皮肤和肺巨噬细胞，以及来自健康对照、SSc、RA、PsA和axSpA患者的单核细胞衍生的巨噬细胞 |
| 771 | 2024-12-15 |
Methionine-driven YTHDF1 expression facilitates bladder cancer progression by attenuating RIG-I-modulated immune responses and enhancing the eIF5B-PD-L1 axis
2024-Dec-13, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01434-y
PMID:39672819
|
研究论文 | 本研究探讨了蛋氨酸对膀胱癌免疫治疗的影响，发现蛋氨酸通过上调YTHDF1表达，抑制RIG-I介导的I型干扰素通路，并增强eIF5B-PD-L1轴，从而促进膀胱癌进展 | 首次揭示了蛋氨酸通过YTHDF1调控RIG-I和eIF5B-PD-L1轴，抑制膀胱癌免疫治疗的机制，并提出了靶向蛋氨酸 depletion 的治疗策略 | 研究主要基于体外实验和动物模型，需进一步验证在人体中的有效性和安全性 | 探讨蛋氨酸对膀胱癌免疫治疗的影响及其分子机制 | 膀胱癌及其免疫治疗 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫沉淀、质谱分析 | NA | RNA | 包括MB49小鼠肿瘤模型和膀胱癌免疫治疗患者样本 |
| 772 | 2024-12-15 |
Author Correction: Dissection of artifactual and confounding glial signatures by single-cell sequencing of mouse and human brain
2024-Dec-13, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01855-5
PMID:39672966
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 773 | 2024-12-15 |
iFlpMosaics enable the multispectral barcoding and high-throughput comparative analysis of mutant and wild-type cells
2024-Dec-13, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02534-w
PMID:39672980
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为iFlpMosaics的工具包，用于多光谱条码标记和高通量比较分析突变细胞和野生型细胞 | iFlpMosaics工具包包含了一系列新的遗传工具和老鼠品系，能够实现重组酶依赖的比例诱导和单细胞克隆追踪，并在相同的组织微环境中进行多色荧光标记的野生型和Cre突变细胞的追踪 | NA | 研究基因功能，比较突变细胞和正常细胞的差异 | 突变细胞和野生型细胞 | NA | NA | 多光谱成像、荧光激活流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA | NA |
| 774 | 2024-12-15 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Dec-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92091
PMID:39665620
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经元再生的化合物 | 利用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子 profiling，筛选并验证了两种促进体内神经发生的化合物 | 目前该过程的效率有限 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经元再生能力 | 小鼠Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 |
| 775 | 2024-12-15 |
Multiparameter imaging reveals clinically relevant cancer cell-stroma interaction dynamics in head and neck cancer
2024-Dec-12, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.046
PMID:39471809
|
研究论文 | 本文报道了一种通过多参数成像量化头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中癌细胞与基质相互作用动态的方法 | 首次结合细胞状态标记与形态特征，以单细胞分辨率量化HNSCC的表型多样性，并揭示了部分上皮-间充质转化（pEMT）对疾病预后的影响 | NA | 研究癌细胞与基质相互作用对头颈部鳞状细胞癌表型多样性和临床特征的影响 | 头颈部鳞状细胞癌中的癌细胞与基质相互作用 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 多参数成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 776 | 2024-12-15 |
Cell type and dynamic state govern genetic regulation of gene expression in heterogeneous differentiating cultures
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100701
PMID:39626676
|
研究论文 | 研究探讨了在异质性分化培养物中，细胞类型和动态状态如何调控基因表达的遗传机制 | 利用异质性分化培养物系统，研究了53个人类供体的单细胞RNA测序数据，揭示了与发育和疾病相关基因的新型调控变异 | 研究主要集中在体外系统，可能无法完全反映体内复杂的调控机制 | 探讨人类遗传变异在不同细胞环境中的分子效应，以理解与疾病相关位点的机制 | 异质性分化培养物中的细胞类型和发育阶段 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 53个人类供体的900,000多个细胞 |
| 777 | 2024-12-15 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Pseudo-temporal Dynamic Evolution Characteristics of ADSCs to Neuronal Differentiation
2024-Dec-11, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-024-01524-y
PMID:39661257
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的伪时间动态进化特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脂肪来源基质细胞向神经元分化的基因表达变化 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内实验验证 | 揭示脂肪来源基质细胞向神经元分化的基因表达变化 | 脂肪来源基质细胞及其向神经元分化的过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 共收集了38,453个细胞，分为0-13个簇 |
| 778 | 2024-12-15 |
Identification of core immune-related genes CTSK, C3, and IFITM1 for diagnosing Helicobacter pylori infection-associated gastric cancer through transcriptomic analysis
2024-Dec-10, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138645
PMID:39667460
|
研究论文 | 通过转录组分析识别与幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因CTSK、C3和IFITM1 | 首次通过转录组分析识别出CTSK、C3和IFITM1作为幽门螺杆菌感染相关胃癌的关键免疫相关诊断基因，并构建了随机森林模型评估其诊断性能 | 研究主要基于GEO数据库的基因表达数据，缺乏临床样本的验证 | 识别与幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因及其机制 | 幽门螺杆菌感染相关胃癌的诊断基因 | 基因表达分析 | 胃癌 | 差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、随机森林模型、单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | 基因表达数据 | GEO数据库中的基因表达数据 |
| 779 | 2024-12-15 |
Itaconate Ameliorates Experimental Autoimmune Uveitis by Modulating Teff/Treg Cell Imbalance Via the DNAJA1/CDC45 Axis
2024-Dec-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.23
PMID:39661355
|
研究论文 | 本研究探讨了衣康酸（ITA）对实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）的影响及其潜在机制，并确定了潜在的治疗靶点 | 本研究首次揭示了衣康酸通过调节DNAJA1/CDC45轴来改善Teff/Treg细胞失衡，从而减轻EAU的炎症反应 | 本研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证其疗效和安全性 | 阐明衣康酸对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响及其潜在机制，并确定潜在的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）及其相关细胞和分子机制 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型和葡萄膜炎患者样本 |
| 780 | 2024-12-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals the CRTAC1+ population actively contributes to the pathogenesis of spinal ligament degeneration by SPP1+ macrophage
2024-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14320
PMID:39158018
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CRTAC1+细胞群通过SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的致病作用 | 首次揭示了CRTAC1+软骨细胞样细胞和SPP1+巨噬细胞在脊柱韧带退行性变中的关键作用，并发现了ATF3作为调控CRTAC1软骨细胞样细胞致病性的关键转录因子 | 研究仅限于特定类型的韧带样本，未来需要进一步验证这些发现是否适用于其他类型的韧带或更广泛的退行性疾病 | 建立韧带组织的综合转录组图谱，识别韧带退行性变的治疗靶点 | 脊柱韧带退行性变中的细胞异质性和关键致病机制 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6个退行性韧带和3个创伤性韧带样本，共32,014个细胞 |