单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7750 篇文献，本页显示第 7721 - 7740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7721 | 2024-08-05 |
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
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研究论文 | 本文章提出了一种新方法，通过整合空间转录组学和组织病理图像数据，以捕捉患者数据中的生物学意义模式 | 整合空间转录组学与组织病理图像数据的新方法，强调了图像感知深度学习在肿瘤分析中的应用 | 没有提到具体的局限性 | 研究如何使用深度学习技术更好地分析空间转录组学数据 | 针对高度侵袭性的癌症类型，如胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤，三阴性乳腺癌 | 深度学习 | ResNet | 图像，基因表达数据 | 未提及样本量 |
| 7722 | 2024-08-07 |
Diverse contribution of amniogenic somatopleural cells to cardiovascular development: With special reference to thyroid vasculature
2024-Jan, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.532
PMID:36038963
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研究论文 | 本文通过鹌鹑-鸡嵌合体分析，展示了胚胎内ASC细胞分化为多种细胞类型，包括心肌细胞、平滑肌细胞、心脏间质细胞和血管内皮细胞，并特别关注了其在甲状腺血管形成中的作用。 | 本研究揭示了ASC细胞在心脏和甲状腺发育中的新角色，特别是其在甲状腺内血管形成中的作用。 | 文中提到的胚胎内ASC细胞的分化过程和最终分布的详细情况仍大部分未知。 | 研究ASC细胞在心血管发育中的作用，特别是其在甲状腺血管形成中的作用。 | 研究对象包括ASC细胞的分化过程及其在胚胎内的分布，特别是其在心脏和甲状腺发育中的作用。 | 心血管疾病 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 鹌鹑-鸡嵌合体 |
| 7723 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the pulmonary inflammation induced by inhalation of subway fine particles
2024-02-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132896
PMID:37951166
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研究论文 | 本研究揭示了地铁细颗粒物如何引起肺部炎症。 | 首次实验研究地铁PM引起的肺部炎症损伤 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类 | 探索地铁细颗粒物对肺部炎症的影响及其机制 | 小鼠及其免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和生物液体 | 小鼠样本，具体数量未提及 |
| 7724 | 2024-08-07 |
Isolation and functional identification of immune cells in hemolymph of blood clams Tegillarca granosa
2024-Jan, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109320
PMID:38122950
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，对血蛤Tegillarca granosa的血液细胞进行了分子层面的分类和功能鉴定 | 首次报道了血蛤Tegillarca granosa免疫细胞的分离和鉴定，为理解其免疫防御机制提供了新视角 | NA | 旨在深入研究红血软体动物的先天免疫系统 | 血蛤Tegillarca granosa的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 7725 | 2024-08-07 |
Immune cell profiling of preeclamptic pregnant and postpartum women by single-cell RNA sequencing
2024, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2022.2144291
PMID:36369864
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了早发型先兆子痫孕妇和产后妇女的外周血单个核细胞（PBMCs）的免疫细胞组成和异质性 | 首次在单细胞水平上揭示了先兆子痫患者在孕期和产后阶段的免疫细胞组成和活性变化 | 样本量较小，仅包括三名早发型先兆子痫孕妇和两名健康对照 | 探究先兆子痫患者在孕期和产后阶段的免疫系统变化 | 早发型先兆子痫孕妇和产后妇女的PBMCs | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共获取了80,429个单细胞转录组数据，来自三名早发型先兆子痫孕妇和两名健康对照 |
| 7726 | 2024-08-07 |
Profiling joint tissues at single-cell resolution: advances and insights
2024-Jan, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-023-01052-x
PMID:38057475
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞分辨率下对人类关节组织进行分析的进展及其对健康和疾病中这些组织的结构和功能的洞察 | 通过单细胞RNA测序和时间飞行流式细胞术等技术，识别了构成关节组织的不同亚群，并构建了关节组织的单细胞图谱 | NA | 旨在揭示关节组织在健康和疾病中的组织和功能，并探索潜在的治疗靶点 | 关节组织，包括软骨、骨和滑膜 | 数字病理学 | 骨关节炎，类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序，时间飞行流式细胞术 | NA | 单细胞数据 | 具体样本数量未提及 |
| 7727 | 2024-08-07 |
PANoptosis signaling enables broad immune response in psoriasis: From pathogenesis to new therapeutic strategies
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.049
PMID:38125299
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研究论文 | 本文探讨了PANoptosis信号在银屑病中的作用及其作为潜在治疗策略的可能性 | 首次揭示了PANoptosis在银屑病中的作用，并通过多转录组分析和实验验证确定了PANoptosis信号及其相关基因 | NA | 揭示PANoptosis在银屑病中的作用，探索新的治疗策略 | 银屑病患者中的PANoptosis信号及其对免疫细胞浸润的影响 | NA | 银屑病 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 7728 | 2024-08-07 |
SCInter: A comprehensive single-cell transcriptome integration database for human and mouse
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.11.024
PMID:38125297
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研究论文 | 本文开发了一个全面的单细胞转录组整合数据库SCInter，用于人类和小鼠的基因表达数据 | SCInter数据库提供了手动 curated 的基因表达数据，支持跨不同细胞类型的样本级别分析，并包含多种分析工具 | NA | 旨在支持单细胞RNA测序数据的综合和有效注释与分析 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 115个整合数据集和1016个样本，覆盖近150个组织/细胞系，包含8016,646个细胞标记 |
| 7729 | 2024-08-05 |
Translatome Profiling of Tissue-Resident Macrophages Using the RiboTag Approach
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3437-0_17
PMID:37639128
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研究论文 | 本文讨论了一种新的方法RiboTag，用于从粗糙的组织提取物中获取组织驻留巨噬细胞的转录组。 | 提出了RiboTag方法，可以避免传统细胞分离中的偏差和伪影 | 只集中于脑巨噬细胞的研究，没有涉及其他类型的组织巨噬细胞 | 探索RiboTag方法在组织驻留巨噬细胞研究中的应用 | 脑巨噬细胞，包括小胶质细胞和边界相关细胞 | 数字病理学 | NA | RiboTag | NA | 转录组 | NA |
| 7730 | 2024-08-07 |
Hemocyte Nuclei Isolation from Adult Drosophila melanogaster for snRNA-seq
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3437-0_4
PMID:37639115
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研究论文 | 本文提供了一种从成年果蝇中分离血细胞核用于单核RNA测序（snRNA-seq）的详细方案 | 首次提供了从成年果蝇血细胞中分离核用于snRNA-seq的具体方法 | NA | 研究果蝇血细胞在不同实验条件下的功能和特性 | 成年果蝇的血细胞核 | NA | NA | snRNA-seq | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 7731 | 2024-08-05 |
Computational immunogenomic approaches to predict response to cancer immunotherapies
2024-Jan, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-023-00830-6
PMID:37907723
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综述 | 本文综述了用于分析癌症免疫治疗反应的计算免疫基因组方法 | 提出了新颖的计算方法和机器学习算法，以从基因组和转录组测序数据中提取临床有用的信息 | 未能充分探讨计算方法和测序技术在改善癌症患者管理中的真实潜力和局限性 | 研究计算免疫基因组方法在癌症免疫疗法中的应用与影响 | 主要研究肿瘤、基质及免疫细胞的基因组和转录组数据 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞转录组测序和多组学方法 | 机器学习算法 | 基因组和转录组数据 | 涉及多种癌症类型的大规模基因组数据 |
| 7732 | 2024-08-07 |
Genomic insights and prognostic significance of novel biomarkers in pancreatic ductal adenocarcinoma: A comprehensive analysis
2024-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2023.101580
PMID:38107664
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研究论文 | 本研究通过综合分析公共数据库，筛选与胰腺导管腺癌（PDAC）预后相关的基因，并构建预测模型 | 本研究首次鉴定了六个与PDAC预后强相关的基因，并构建了基于这些基因的临床预后模型 | 研究主要基于公共数据库，需要进一步的临床验证 | 探索胰腺导管腺癌的基因标记和分子靶点，以提高诊断和治疗策略 | 胰腺导管腺癌的预后相关基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基因差异分析，单变量Cox回归分析，LASSO回归，多变量Cox回归分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因数据，单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 7733 | 2024-08-07 |
The role of NF-κB signaling pathway in reactive astrocytes among neurodegeneration after methamphetamine exposure by integrated bioinformatics
2024-Feb-08, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2023.110909
PMID:38061485
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研究论文 | 本研究探讨了甲基苯丙胺暴露后神经退行性疾病中反应性星形胶质细胞的作用，通过综合生物信息学方法分析了RNA测序数据和免疫浸润情况。 | 本研究首次通过综合生物信息学方法探讨了甲基苯丙胺暴露后反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的作用及其与神经元间的交叉对话。 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏直接的细胞和动物实验验证。 | 探讨甲基苯丙胺暴露后反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的作用及其与神经元间的交叉对话。 | 甲基苯丙胺暴露后的反应性星形胶质细胞及其在神经退行性疾病中的作用。 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA测序 | 随机森林算法 | RNA测序数据 | 使用了来自GEO数据库的METH批量RNA测序数据（GSE107015和GSE98793）和单细胞RNA测序数据（GSE119861），以及PD芯片数据（GSE99039和GSE72267）。 |
| 7734 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling Indicates a Proinflammatory Role of Meningeal Ectopic Lymphoid Tissue in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2024-Jan, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200185
PMID:38100739
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，比较了脑膜异位淋巴组织（mELT）与次级淋巴器官（SLOs）在自发性慢性实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的基因表达谱，揭示了mELT在多发性硬化症进展中的关键作用 | 首次揭示了脑膜异位淋巴组织（mELT）在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的促炎作用，并提出了mELT可能是中枢神经系统炎症的关键驱动因素 | 研究仅限于动物模型，尚未在人类多发性硬化症患者中验证 | 探究多发性硬化症进展的机制及如何预防 | 脑膜异位淋巴组织（mELT）与次级淋巴器官（SLOs）中的免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7735 | 2024-08-05 |
Glycolysis regulation in tumor-associated macrophages: Its role in tumor development and cancer treatment
2024-Feb-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34711
PMID:37688376
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研究论文 | 本文回顾了肿瘤相关巨噬细胞中糖代谢的现状，并总结了不同亚型的代谢特征 | 从单细胞组学的角度对肿瘤相关巨噬细胞的代谢特征进行了综合总结，探讨了糖酵解在肿瘤发展及治疗中的作用 | 对肿瘤相关巨噬细胞代谢特征的总结还不够全面，尚未深入探讨糖流对肿瘤进展的具体影响 | 研究肿瘤相关巨噬细胞中的糖代谢对肿瘤发展及癌症治疗的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞及其不同亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7736 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 receptor ACE2 is upregulated by fatty acids in human MASH
2024-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100936
PMID:38074511
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研究论文 | 本文研究了代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中SARS-CoV-2受体ACE2的表达及其细胞来源 | 首次揭示了脂肪酸在人类MASLD中上调ACE2表达的现象 | NA | 探讨MASLD患者中SARS-CoV-2受体ACE2的表达水平及其细胞来源 | 人类MASLD患者的肝脏组织 | NA | 脂肪性肝病 | 转录组学, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 图像 | 243个MASLD样本, 161个纤维炎症性肝病样本, 9个脂肪肝样本, 7个对照样本, 5个肝硬化样本, 14个正常肝脏样本, 745个初级细胞样本 |
| 7737 | 2024-08-05 |
TTC22 as a potential prognostic marker and therapeutic target in pancreatic cancer: Insights into immune infiltration and epithelial‑mesenchymal transition
2024-Jan, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2023.14143
PMID:38034483
|
研究论文 | 本文探讨了TTC22在胰腺癌中的潜在预后标志物和治疗靶点的作用 | 首次揭示了TTC22在胰腺癌中的表达与临床参数及免疫浸润的负相关性 | 尚需进一步研究以明确TTC22在胰腺癌中的确切作用 | 研究TTC22在胰腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 主要研究胰腺癌及其相关细胞系中的TTC22表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 临床数据和细胞系数据 | NA |
| 7738 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals SATB2/NOTCH1 signaling promotes the progression of malignancy of epithelial cells from papillary thyroid cancer
2024-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23631
PMID:37877736
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研究论文 | 这篇文章揭示了SATB2/NOTCH1信号通路促进乳头状甲状腺癌上皮细胞恶性进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SATB2与NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌中的作用及其与恶性转变的关系 | 样本量仅限于五名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨SATB2和NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌进展中的作用 | 四名乳头状甲状腺癌患者和一名良性甲状腺肿瘤患者的样本 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 五名患者（包括两名乳头状甲状腺微癌患者、两名侵袭性Advanced PTC患者和一名良性甲状腺肿瘤患者） |
| 7739 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy
2024-Jan, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412
PMID:37898037
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了糖尿病诱导认知障碍模型中海马细胞的异质性和突触可塑性变化 | 首次详细分析了长期高血糖状态下海马细胞群的异质性，并揭示了特定细胞亚群及其基因表达特征 | 研究仅限于db糖尿病小鼠模型，结果的普遍性和临床应用需进一步验证 | 探讨糖尿病诱导认知障碍中海马细胞的异质性和突触可塑性变化 | db糖尿病小鼠的海马细胞 | 神经科学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 认知障碍组21,379个细胞，对照组20,045个细胞 |
| 7740 | 2024-08-05 |
Rotenone impairs brain glial energetics and locomotor behavior in bumblebees
2024-Jan-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.167870
PMID:37865240
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研究论文 | 该文章研究了罗腾农对大黄蜂脑胶质细胞能量代谢和运动行为的影响 | 首次揭示了环境现实暴露水平的罗腾农如何影响大黄蜂的胶质细胞能量代谢和运动能力 | 尚未明确罗腾农对大黄蜂神经元的具体损害机制 | 探讨罗腾农对大黄蜂的脑胶质细胞和运动行为的影响 | 大黄蜂的胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |