单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7700 篇文献，本页显示第 7681 - 7700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7681 | 2024-08-05 |
Computational immunogenomic approaches to predict response to cancer immunotherapies
2024-Jan, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-023-00830-6
PMID:37907723
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综述 | 本文综述了用于分析癌症免疫治疗反应的计算免疫基因组方法 | 提出了新颖的计算方法和机器学习算法，以从基因组和转录组测序数据中提取临床有用的信息 | 未能充分探讨计算方法和测序技术在改善癌症患者管理中的真实潜力和局限性 | 研究计算免疫基因组方法在癌症免疫疗法中的应用与影响 | 主要研究肿瘤、基质及免疫细胞的基因组和转录组数据 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞转录组测序和多组学方法 | 机器学习算法 | 基因组和转录组数据 | 涉及多种癌症类型的大规模基因组数据 |
| 7682 | 2024-08-07 |
Genomic insights and prognostic significance of novel biomarkers in pancreatic ductal adenocarcinoma: A comprehensive analysis
2024-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2023.101580
PMID:38107664
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研究论文 | 本研究通过综合分析公共数据库，筛选与胰腺导管腺癌（PDAC）预后相关的基因，并构建预测模型 | 本研究首次鉴定了六个与PDAC预后强相关的基因，并构建了基于这些基因的临床预后模型 | 研究主要基于公共数据库，需要进一步的临床验证 | 探索胰腺导管腺癌的基因标记和分子靶点，以提高诊断和治疗策略 | 胰腺导管腺癌的预后相关基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基因差异分析，单变量Cox回归分析，LASSO回归，多变量Cox回归分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因数据，单细胞数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 7683 | 2024-08-07 |
The role of NF-κB signaling pathway in reactive astrocytes among neurodegeneration after methamphetamine exposure by integrated bioinformatics
2024-Feb-08, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2023.110909
PMID:38061485
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研究论文 | 本研究探讨了甲基苯丙胺暴露后神经退行性疾病中反应性星形胶质细胞的作用，通过综合生物信息学方法分析了RNA测序数据和免疫浸润情况。 | 本研究首次通过综合生物信息学方法探讨了甲基苯丙胺暴露后反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的作用及其与神经元间的交叉对话。 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏直接的细胞和动物实验验证。 | 探讨甲基苯丙胺暴露后反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的作用及其与神经元间的交叉对话。 | 甲基苯丙胺暴露后的反应性星形胶质细胞及其在神经退行性疾病中的作用。 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA测序 | 随机森林算法 | RNA测序数据 | 使用了来自GEO数据库的METH批量RNA测序数据（GSE107015和GSE98793）和单细胞RNA测序数据（GSE119861），以及PD芯片数据（GSE99039和GSE72267）。 |
| 7684 | 2024-08-07 |
Single-Cell Profiling Indicates a Proinflammatory Role of Meningeal Ectopic Lymphoid Tissue in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2024-Jan, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200185
PMID:38100739
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，比较了脑膜异位淋巴组织（mELT）与次级淋巴器官（SLOs）在自发性慢性实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的基因表达谱，揭示了mELT在多发性硬化症进展中的关键作用 | 首次揭示了脑膜异位淋巴组织（mELT）在实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的促炎作用，并提出了mELT可能是中枢神经系统炎症的关键驱动因素 | 研究仅限于动物模型，尚未在人类多发性硬化症患者中验证 | 探究多发性硬化症进展的机制及如何预防 | 脑膜异位淋巴组织（mELT）与次级淋巴器官（SLOs）中的免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7685 | 2024-08-05 |
Glycolysis regulation in tumor-associated macrophages: Its role in tumor development and cancer treatment
2024-Feb-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34711
PMID:37688376
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研究论文 | 本文回顾了肿瘤相关巨噬细胞中糖代谢的现状，并总结了不同亚型的代谢特征 | 从单细胞组学的角度对肿瘤相关巨噬细胞的代谢特征进行了综合总结，探讨了糖酵解在肿瘤发展及治疗中的作用 | 对肿瘤相关巨噬细胞代谢特征的总结还不够全面，尚未深入探讨糖流对肿瘤进展的具体影响 | 研究肿瘤相关巨噬细胞中的糖代谢对肿瘤发展及癌症治疗的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞及其不同亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7686 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 receptor ACE2 is upregulated by fatty acids in human MASH
2024-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100936
PMID:38074511
|
研究论文 | 本文研究了代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）中SARS-CoV-2受体ACE2的表达及其细胞来源 | 首次揭示了脂肪酸在人类MASLD中上调ACE2表达的现象 | NA | 探讨MASLD患者中SARS-CoV-2受体ACE2的表达水平及其细胞来源 | 人类MASLD患者的肝脏组织 | NA | 脂肪性肝病 | 转录组学, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 图像 | 243个MASLD样本, 161个纤维炎症性肝病样本, 9个脂肪肝样本, 7个对照样本, 5个肝硬化样本, 14个正常肝脏样本, 745个初级细胞样本 |
| 7687 | 2024-08-05 |
TTC22 as a potential prognostic marker and therapeutic target in pancreatic cancer: Insights into immune infiltration and epithelial‑mesenchymal transition
2024-Jan, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2023.14143
PMID:38034483
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研究论文 | 本文探讨了TTC22在胰腺癌中的潜在预后标志物和治疗靶点的作用 | 首次揭示了TTC22在胰腺癌中的表达与临床参数及免疫浸润的负相关性 | 尚需进一步研究以明确TTC22在胰腺癌中的确切作用 | 研究TTC22在胰腺癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 主要研究胰腺癌及其相关细胞系中的TTC22表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 临床数据和细胞系数据 | NA |
| 7688 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals SATB2/NOTCH1 signaling promotes the progression of malignancy of epithelial cells from papillary thyroid cancer
2024-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23631
PMID:37877736
|
研究论文 | 这篇文章揭示了SATB2/NOTCH1信号通路促进乳头状甲状腺癌上皮细胞恶性进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了SATB2与NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌中的作用及其与恶性转变的关系 | 样本量仅限于五名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨SATB2和NOTCH1信号通路在乳头状甲状腺癌进展中的作用 | 四名乳头状甲状腺癌患者和一名良性甲状腺肿瘤患者的样本 | 数字病理学 | 乳头状甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 五名患者（包括两名乳头状甲状腺微癌患者、两名侵袭性Advanced PTC患者和一名良性甲状腺肿瘤患者） |
| 7689 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and synaptic plasticity analysis of hippocampus based on db-/- mice induced diabetic encephalopathy
2024-Jan, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2023.106412
PMID:37898037
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了糖尿病诱导认知障碍模型中海马细胞的异质性和突触可塑性变化 | 首次详细分析了长期高血糖状态下海马细胞群的异质性，并揭示了特定细胞亚群及其基因表达特征 | 研究仅限于db糖尿病小鼠模型，结果的普遍性和临床应用需进一步验证 | 探讨糖尿病诱导认知障碍中海马细胞的异质性和突触可塑性变化 | db糖尿病小鼠的海马细胞 | 神经科学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 认知障碍组21,379个细胞，对照组20,045个细胞 |
| 7690 | 2024-08-05 |
Rotenone impairs brain glial energetics and locomotor behavior in bumblebees
2024-Jan-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.167870
PMID:37865240
|
研究论文 | 该文章研究了罗腾农对大黄蜂脑胶质细胞能量代谢和运动行为的影响 | 首次揭示了环境现实暴露水平的罗腾农如何影响大黄蜂的胶质细胞能量代谢和运动能力 | 尚未明确罗腾农对大黄蜂神经元的具体损害机制 | 探讨罗腾农对大黄蜂的脑胶质细胞和运动行为的影响 | 大黄蜂的胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7691 | 2024-08-07 |
Combination of CRISPR-Cas9-RNP and Single-Cell RNAseq to Identify Cell State-Specific FOXJ1 Functions in the Human Airway Epithelium
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3507-0_1
PMID:37856015
|
研究论文 | 本研究结合CRISPR-Cas9-RNP技术和单细胞RNA测序，探讨了FOXJ1在人呼吸道上皮细胞中的细胞状态特异性功能 | 采用CRISPR-Cas9-RNP技术直接转染核糖核蛋白复合物，无需选择步骤，效率超过95% | 该方法生成的细胞群体包含异质性缺失，使得无效化效率评估困难 | 研究FOXJ1在人呼吸道上皮细胞中的功能及其对多纤毛细胞最终分化步骤的影响 | 人呼吸道上皮细胞中的FOXJ1基因 | 数字病理 | NA | CRISPR-Cas9-RNP, 单细胞RNA测序, Flongle测序(Nanopore) | NA | RNA | 来自鼻甲的基底细胞培养物 |
| 7692 | 2024-08-07 |
Worst-Case Discriminative Feature Learning via Max-Min Ratio Analysis
2024-Jan, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2023.3323453
PMID:37815977
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research paper | 本文提出了一种通过最大最小比率分析（MMRA）进行判别特征学习的新方法，专门解决长期存在的“最坏情况类别分离”问题 | 提出了一种新的判别特征学习标准，即最大最小比率分析（MMRA），专注于最大化类间散布与类内散布的最小比率值，以极端扩大重叠类别对的可分性 | 解决非平滑非凸的最大最小比率问题具有挑战性 | 开发新的判别特征学习模型，用于降维和度量学习，并解决相关的优化问题 | 判别特征学习方法及其在模式分类和图像检索中的应用 | machine learning | NA | NA | NA | NA | 涉及多个人工数据集和真实世界的ScRNA-seq数据集 |
| 7693 | 2024-08-07 |
Genome-Scale Analysis of the Structure and Function of RNA Pathways and Networks in Pseudomonas aeruginosa
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3473-8_13
PMID:37819523
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研究论文 | 本文通过RNA测序（RNA-seq）方法，全面分析了Pseudomonas aeruginosa中RNA途径和网络的结构与功能 | 本文介绍了基于RNA-seq的不同类型方法，这些方法有助于未来更好地理解P. aeruginosa中RNA生物学的动态 | 目前仅考虑了少数周围条件，研究仍处于初级阶段 | 旨在通过RNA-seq方法深入理解Pseudomonas aeruginosa中RNA生物学的动态 | Pseudomonas aeruginosa中的RNA途径和网络 | NA | NA | RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 7694 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing atlas of peripheral blood mononuclear cells from subjects with coronary artery disease
2024-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2023.119593
PMID:37730128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了冠状动脉疾病患者和对照组的外周血单个核细胞，揭示了细胞类型和基因表达的差异 | 首次在单细胞水平上详细描述了冠状动脉疾病患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 样本量较小，仅包括3名冠状动脉疾病患者和3名对照组 | 探索冠状动脉疾病发生发展过程中外周循环免疫细胞亚群的单细胞水平特征 | 冠状动脉疾病患者和对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 6名受试者（3名冠状动脉疾病患者和3名对照组） |
| 7695 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in juvenile idiopathic arthritis
2024-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.04.014
PMID:37692495
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序在幼年特发性关节炎（JIA）研究中的最新发现，并探讨了主要细胞亚群如何驱动JIA发病机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示JIA中细胞群体的生物学异质性和功能 | NA | 提供JIA诊断和治疗的新思路和潜在靶点 | 幼年特发性关节炎（JIA）及其发病机制 | digital pathology | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7696 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to unravel the molecular mechanisms underlying the immune microenvironment in the development of intestinal-type gastric cancer
2024-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166849
PMID:37591405
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序，探讨肠型胃癌发展过程中免疫微环境的分子机制 | 发现了IGC（肠型胃癌）的新型生物标志物，并阐明了免疫细胞之间的相互作用和肿瘤生长的机制 | 本研究依赖于已有数据库的数据，可能存在样本选择偏差 | 研究肠型胃癌发展的分子机制，特别是免疫微环境的作用 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的肠型胃癌相关样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，整体RNA测序 | Cox比例风险回归模型 | 转录组数据 | 使用了GEO和TCGA数据库中的IGC样本 |
| 7697 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals abnormal transcriptome signature of erythroid progenitors in pure red cell aplasia
2024-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.03.002
PMID:37588205
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7698 | 2024-08-07 |
Integrated bulk and single-cell transcriptome data identify clinically relevant cell populations in clear cell renal cell carcinoma
2024-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.03.007
PMID:37588222
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7699 | 2024-08-07 |
A Network Medical Framework based on Inflammatory Genes to Identify Drug Candidates for Abdominal Aortic Aneurysms
2024, Current molecular pharmacology
IF:2.4Q3
|
研究论文 | 本研究基于炎症基因构建网络医学框架，用于识别腹主动脉瘤的潜在药物候选 | 本研究首次通过网络医学方法，结合单细胞RNA测序和RNA测序数据，识别了腹主动脉瘤的关键治疗靶点和潜在药物 | 研究主要基于计算模拟和数据分析，尚未进行临床试验验证 | 旨在发现腹主动脉瘤的新治疗靶点和潜在药物 | 腹主动脉瘤的细胞类型、基因差异表达和药物靶点 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), RNA测序 | NA | 基因数据 | 10种细胞类型，327个差异表达基因 |
| 7700 | 2024-08-05 |
Lineage Tracing by Single-Cell Transcriptomics Decoding Dynamics of Lineage Commitment
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2022_476
PMID:36749487
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研究论文 | 本文介绍了一种通过单细胞转录组学进行谱系追踪的方法，以澄清谱系承诺的动态变化 | 提出了一种详细的协议，通过单细胞转录组学实现谱系追踪，填补了细胞命运追踪的研究空白 | 未提及具体的限制因素 | 探讨干细胞和癌症研究中的细胞命运追踪 | 个体细胞及其后代 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |