单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7619 篇文献，本页显示第 7561 - 7580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7561 | 2024-08-07 |
Transcriptomic landscape of endothelial cells: Key tumor microenvironment components indicating variable clinical outcomes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23881
PMID:37449672
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）中内皮细胞（ECs）的转录组图谱及其对临床结果的影响 | 本研究首次识别了PDAC中七种不同的内皮细胞簇，并探讨了它们在细胞通信、代谢变化和免疫相关分子表达方面的差异 | 研究仅基于24个PDAC肿瘤和11个正常胰腺的单细胞转录组数据，样本量相对较小 | 阐明PDAC中内皮细胞的多样性及其对临床结果的影响 | 胰腺导管腺癌中的内皮细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 24个PDAC肿瘤和11个正常胰腺 |
| 7562 | 2024-08-07 |
Single-cell combined with bulk-RNA data reveal a pattern related to angiogenesis in breast cancer patients: Individualized medicine
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23947
PMID:37647361
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据，揭示了与乳腺癌患者血管生成相关的模式，并构建了个性化治疗模型。 | 本研究首次综合单细胞和批量RNA测序数据，通过随机森林生存分析构建了预测模型，并在外部验证集中进行了验证。 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌患者，可能不适用于所有乳腺癌亚型。 | 揭示乳腺癌患者血管生成的相关模式，并构建个性化治疗模型。 | 乳腺癌患者的RNA测序数据和生存数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 随机森林 | RNA测序数据 | 1082名乳腺癌患者 |
| 7563 | 2024-08-07 |
Transcriptome characteristics of epithelial cells from advanced non-small cell lung cancer were revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23960
PMID:37676967
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了晚期非小细胞肺癌上皮细胞的转录组特征 | 首次发现TPI1作为LUAD的新型生物标志物，并揭示了MXD3和GATA4作为潜在的调控转录因子 | NA | 探索与LUAD患者免疫浸润和生存时间相关的差异表达基因，并预测转录因子以揭示LUAD的分子机制和个体化治疗 | 晚期非小细胞肺癌的上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16种上皮细胞类型 |
| 7564 | 2024-08-07 |
The single-cell evolution trajectory presented different hypoxia heterogeneity to reveal the carcinogenesis of genes in clear cell renal cell carcinoma: Based on multiple omics and real experimental verification
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24009
PMID:37886854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 本研究首次识别了ccRCC中多个与缺氧相关的肿瘤微环境（TME）亚群，并揭示了ANGPTL4在调控ccRCC增殖中的作用 | NA | 探讨透明细胞肾细胞癌中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其相关基因和细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq | UMAP, NMF | 单细胞RNA测序数据 | 使用了来自GSE159115数据集的scRNA-seq数据，以及ccRCC细胞系的786-O和Caki细胞 |
| 7565 | 2024-08-07 |
Adverse effects of gestational diabetes mellitus on fetal monocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108637
PMID:38188508
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康母亲和妊娠糖尿病（GDM）母亲胎儿脐带血单核细胞的转录组数据，揭示了GDM对胎儿单核细胞的不良影响。 | 首次揭示了GDM母亲胎儿脐带血中单核细胞的特征性变化，包括炎症相关通路下调和增殖相关通路上调，以及CXCL8+IL1B+亚群的扩增和功能增强。 | 研究仅限于脐带血单核细胞的分析，未涉及其他组织或细胞类型，可能需要进一步研究以全面理解GDM对胎儿的影响。 | 探讨妊娠糖尿病对胎儿单核细胞的影响及其潜在机制。 | 健康母亲和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞。 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括健康和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞，以及儿童和青少年外周血单核细胞和动脉粥样硬化斑块中的髓样细胞。 |
| 7566 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16487
PMID:37794835
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了豌豆芽发育及细胞类型特异性响应硼缺乏的情况 | 相较于传统的整体组织RNA测序分析，本研究能够捕捉到细胞类型特异性的响应，揭示了硼缺乏对植物生理响应的重要性 | NA | 旨在理解营养胁迫如何影响植物生长，并探索提高作物在营养限制条件下产量的方法 | 豌豆芽的发育及对硼缺乏的细胞类型特异性响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 豌豆芽的顶端细胞 |
| 7567 | 2024-08-07 |
Author Correction: Longitudinal scRNA-seq analysis in mouse and human informs optimization of rapid mouse astrocyte differentiation protocols
2024-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01531-0
PMID:37996532
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7568 | 2024-08-05 |
PLZF protein forms a complex with protein TET1 to target TCF7L2 in undifferentiated spermatogonia
2024-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本文探讨了PLZF蛋白作为表观遗传调节因子在不分化精原细胞中的作用 | 本研究建立了新的PLZF&TET1-H3K4me3-TCF7L2轴以及PLZF和EZH2之间的新关联 | NA | 研究PLZF在精原细胞自我更新及维持中的功能 | 不分化精原细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 7569 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of zebrafish brain reveals adverse effects of manganese on neurogenesis
2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.122908
PMID:37952916
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研究论文 | 本文探讨了锰对斑马鱼大脑神经发生的影响及其机制 | 本研究首次揭示了不同浓度锰暴露对斑马鱼大脑神经发生的促进与抑制作用 | 本研究仅在斑马鱼模型中进行，是否适用于其他物种尚未确定 | 研究锰暴露对神经发生影响的具体机制 | 斑马鱼大脑的神经细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 正常组和锰暴露组的斑马鱼大脑样本 |
| 7570 | 2024-08-05 |
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad933
PMID:37953328
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研究论文 | 这篇文章介绍了STOmicsDB，一个提供空间转录组数据共享、分析和可视化的综合数据库 | STOmicsDB集成了218个手动筛选的数据集，并提供了可定制的子数据库功能，以增强数据的可重用性和互操作性 | 尚未提及具体的限制 | 旨在促进空间转录组数据的共享和分析 | 规则和分析空间转录组数据集，以揭示细胞类型和空间区域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 数据集 | 包含218个数据集，代表17种物种 |
| 7571 | 2024-08-07 |
Author Correction: Spatial transcriptomics uncover sucrose post-phloem transport during maize kernel development
2024-Jan-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44536-w
PMID:38177159
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7572 | 2024-08-05 |
ITGB4 upregulation is associated with progression of lower grade glioma
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-49801-y
PMID:38172503
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研究论文 | 研究表明ITGB4在低级别神经胶质瘤中上调，并且能准确预测其预后 | ITGB4被发现是一个良好预测低级别神经胶质瘤预后的风险因素，并且与免疫相关基因密切相关 | 该研究未详细探讨ITGB4在神经胶质瘤中的具体机制 | 揭示ITGB4在低级别神经胶质瘤中的作用和其与预后的关系 | 研究对象为低级别神经胶质瘤患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 免疫组化分析、单细胞测序分析、非负矩阵分解聚类分析 | Cox回归模型 | 肿瘤组织样本 | 研究中涉及的样本数量未明确说明 |
| 7573 | 2024-08-07 |
Predicting cell types with supervised contrastive learning on cells and their types
2024-01-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50185-2
PMID:38172501
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研究论文 | 本文提出了一种基于监督对比学习的细胞类型注释新模型SCLSC，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型预测 | SCLSC模型采用实例-类型对的对比学习方法，不同于以往实例-实例对的对比学习，提高了细胞类型预测的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督对比学习 | 基因表达数据 | 大量细胞 |
| 7574 | 2024-08-05 |
Upregulated PPP1R14B is connected to cancer progression and immune infiltration in kidney renal clear cell carcinoma
2024-Jan, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03228-z
PMID:37261660
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研究论文 | 本研究探讨了PPP1R14B在肾透明细胞癌中的预后和发展作用 | 发现PPP1R14B在KIRC中上调并作为独立风险因素，与肿瘤浸润免疫细胞相关 | 研究仅基于TCGA和ICGC队列，未包括不同患者群体的样本 | 确定PPP1R14B是否可以作为KIRC的预后生物标志物 | 肾透明细胞癌(KIRC)患者的样本 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA-seq | NA | 生物样本 | 使用了TCGA和ICGC队列中的患者样本及我们的临床样本 |
| 7575 | 2024-08-07 |
Angiogenesis-on-a-chip coupled with single-cell RNA sequencing reveals spatially differential activations of autophagy along angiogenic sprouts
2024-Jan-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44427-0
PMID:38172108
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研究论文 | 本文利用血管生成芯片与单细胞RNA测序技术，揭示了血管生成芽中自噬在空间上的差异激活 | 首次使用血管生成芯片重建三维芽结构，并通过单细胞RNA测序揭示了自噬在不同内皮细胞群体中的高激活状态及其相关基因的互表达模式 | NA | 探索血管生成过程中自噬功能的空间异质性 | 内皮细胞在血管生成芽中的自噬活动 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个内皮细胞样本 |
| 7576 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq analysis decodes the kidney microenvironment induced by polystyrene microplastics in mice receiving a high-fat diet
2024-Jan-03, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-023-02266-7
PMID:38167034
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研究论文 | 本研究揭示了聚苯乙烯微塑料和高脂饮食诱导的小鼠肾脏微环境单细胞转录组特征 | 首次系统性揭示了聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏细胞和免疫细胞的分子变化 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 研究聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏发展的影响 | 聚苯乙烯微塑料和高脂饮食对小鼠肾脏微环境的影响 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35天的高脂饮食和继续暴露于聚苯乙烯微塑料的小鼠模型 |
| 7577 | 2024-08-07 |
HSV1 microRNAs in glioblastoma development: an in silico study
2024-01-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-45249-2
PMID:38167429
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研究论文 | 本研究通过计算方法探讨HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用 | 首次研究HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用，并揭示其在肿瘤抑制基因和致癌基因表达调控中的潜在影响 | 仅通过计算方法进行研究，未进行实验验证 | 探讨HSV1编码的microRNAs在胶质母细胞瘤发展中的作用及其对肿瘤抑制基因和致癌基因表达的影响 | HSV1编码的microRNAs及其在胶质母细胞瘤发展中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE158284、GSE153679和GSE182109数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 7578 | 2024-08-07 |
Transcriptome analysis reveals therapeutic potential of NAMPT in protecting against abdominal aortic aneurysm in human and mouse
2024-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.11.020
PMID:38173843
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了正常和腹主动脉瘤（AAA）腹主动脉的分子特征，发现AAA中细胞异质性增加，并揭示了NAMPT在保护AAA中的潜在治疗作用。 | 首次揭示了NAMPT在腹主动脉瘤中的下调及其通过外泌体补充NAMPT的潜在治疗作用。 | NA | 探索腹主动脉瘤的分子机制及其潜在治疗策略。 | 人类和小鼠的腹主动脉瘤。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7579 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals that the immunosuppression landscape induced by chronic stress promotes colorectal cancer metastasis
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23552
PMID:38169984
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研究论文 | 本研究通过建立慢性不可预测轻度应激（CUMS）和原位结直肠癌的复合小鼠模型，利用10✕Genomics单细胞转录组测序技术，揭示了慢性应激状态下肿瘤免疫细胞趋向于更抑制和耗竭的状态，并描述了整体炎症环境与免疫抑制景观之间的相互作用。 | 首次揭示了慢性应激诱导的免疫抑制环境促进结直肠癌转移的机制，并提供了针对伴有抑郁症的结直肠癌患者的免疫治疗新策略。 | NA | 研究慢性应激对结直肠癌免疫微环境的影响及其对肿瘤进展的作用。 | 慢性应激状态下的小鼠结直肠肿瘤样本。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 8只小鼠的肿瘤样本，近30,000个细胞 |
| 7580 | 2024-08-05 |
Exploring the relationship between immune heterogeneity characteristic genes of rheumatoid arthritis and acute myeloid leukemia
2024-Jan-02, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00852-7
PMID:38165493
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研究论文 | 本研究探讨了类风湿关节炎的免疫异质性特征基因与急性髓系白血病之间的关系 | 该文章揭示了类风湿关节炎特征基因与急性髓系白血病的关联，提供了肉芽肿标记物的新见解 | 研究可能受限于获取的数据样本和数据库的限制 | 旨在通过RA研究发现AML的骨髓生物标志物 | 研究对象包括类风湿关节炎患者的滑膜转录组数据和急性髓系白血病患者的骨髓测序数据 | 数字病理学 | 类风湿关节炎, 急性髓系白血病 | 单细胞测序, 转录组测序 | 随机森林分类器 | 基因组数据 | NA |