单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7637 篇文献，本页显示第 7501 - 7520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7501 | 2024-08-05 |
Cross-species single-cell landscape of vertebrate pineal gland
2024-Jan, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12927
PMID:38018267
|
研究论文 | 本研究详细分析了从鱼类到哺乳动物的松果体进化过程 | 揭示了松果体细胞在不同物种间的独特转录变化和配体-受体相互作用 | 研究样本主要局限于斑马鱼、老鼠和猴子，结果的普遍性需进一步验证 | 探讨松果体从鱼类到哺乳动物的进化及其功能多样性 | 斑马鱼、老鼠和猴子的松果体单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共计22,431个细胞 |
| 7502 | 2024-08-07 |
Multi-omics analyses reveal bacteria and catalase associated with keloid disease
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104904
PMID:38061241
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了瘢痕疙瘩疾病与细菌及过氧化氢酶之间的关联 | 首次通过多组学分析方法探讨了细菌在瘢痕疙瘩病理中的作用，并发现过氧化氢酶在瘢痕疙瘩纤维母细胞中的表达差异 | NA | 探讨细菌在瘢痕疙瘩疾病中的作用及过氧化氢酶的表达差异 | 瘢痕疙瘩疾病及其相关细菌和过氧化氢酶 | NA | 瘢痕疙瘩 | 多组学分析（微生物组、元蛋白质组、代谢组、单细胞转录组）、16S rRNA测序、蛋白质质谱 | NA | 微生物数据、蛋白质数据、代谢数据、转录组数据 | 涉及瘢痕疙瘩和健康皮肤的样本，具体数量未详述 |
| 7503 | 2024-08-07 |
A longitudinal molecular and cellular lung atlas of lethal SARS-CoV-2 infection in K18-hACE2 transgenic mice
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104932
PMID:38118400
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了K18-hACE2转基因小鼠在SARS-CoV-2感染后的肺组织分子和细胞反应 | 本研究首次详细描述了SARS-CoV-2感染后肺组织的分子和细胞反应，并识别了SPP1+巨噬细胞和失调的TGFβ信号通路 | NA | 深入理解SARS-CoV-2在肺组织中的发病机制，并为COVID-19的诊断和治疗提供新的靶点 | K18-hACE2转基因小鼠在SARS-CoV-2感染后的肺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 涉及36种不同类型的细胞 |
| 7504 | 2024-08-07 |
sc2MeNetDrug: A computational tool to uncover inter-cell signaling targets and identify relevant drugs based on single cell RNA-seq data
2024-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011785
PMID:38181047
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研究论文 | 开发了一种名为sc2MeNetDrug的计算工具，用于基于单细胞RNA测序数据揭示细胞间信号传导目标并识别相关药物 | sc2MeNetDrug工具专门设计用于识别疾病微环境中的细胞类型，揭示单个细胞类型内的功能障碍信号通路及不同细胞类型间的相互作用，并预测可能破坏细胞间信号传导的有效药物 | NA | 开发一种新的计算工具，帮助研究人员基于单细胞RNA测序数据发现新的细胞间信号传导和治疗方案 | 单细胞RNA测序数据中的细胞间信号传导和相关药物 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7505 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of the cellular landscape of vulvar melanoma provides new insight for immunotherapy administration
2024-Jan-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11839-0
PMID:38233802
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了外阴黑色素瘤的细胞景观，为免疫治疗提供了新的见解 | 发现了CD8+ T细胞激活在外阴黑色素瘤中的作用，以及抗原呈递分子功能在黑色素瘤转移中的参与 | 研究样本仅来自一位68岁女性患者，可能影响结果的普遍性 | 阐明外阴黑色素瘤中紊乱的免疫微环境在癌症进展中的作用 | 外阴黑色素瘤的细胞景观及其在免疫治疗中的潜在应用 | 数字病理学 | 外阴黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 12,243个单细胞 |
| 7506 | 2024-08-07 |
Splenic monocytes drive pathogenic subretinal inflammation in age-related macular degeneration
2024-Jan-17, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03011-z
PMID:38233865
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研究论文 | 本文研究了年龄相关性黄斑变性（AMD）中脾脏单核细胞在病理性视网膜下炎症中的作用 | 首次展示了血管紧张素II能够动员ATR1脾脏单核细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了其转录特征，这些细胞在功能上与骨髓单核细胞不同 | NA | 探讨脾脏单核细胞在年龄相关性黄斑变性中的作用及其潜在的治疗策略 | 年龄相关性黄斑变性中的脾脏单核细胞 | NA | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7507 | 2024-08-07 |
Heterogeneous Expression Patterns of the Minichromosome Maintenance Complex Members in Retinoblastoma Unveil Its Clinical Significance
2024-Jan-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.1.31
PMID:38231525
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研究论文 | 研究探讨了微染色体维持（MCM）复合体成员在视网膜母细胞瘤（RB）中的表达模式及其临床意义 | 首次在单细胞水平上整合了来自正常视网膜、眼内和眼外RB样本的单细胞RNA测序数据，以表征MCM复合体成员的表达模式 | NA | 探索MCM复合体成员在视网膜母细胞瘤中的表达模式及其临床意义 | MCM复合体成员在视网膜母细胞瘤中的表达 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五个正常视网膜样本、六个眼内RB样本和五个眼外RB样本 |
| 7508 | 2024-08-07 |
scQA: A dual-perspective cell type identification model for single cell transcriptome data
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.021
PMID:38235363
|
研究论文 | 介绍了一种名为scQA的新方法，该方法能够从定性和定量两个角度同时识别细胞类型和细胞类型特异性关键基因 | scQA方法不仅识别细胞类型，还提取与这些细胞类型相关的关键基因，实现双向聚类，并采用创新的标签传播策略进行细胞聚类 | NA | 开发一种新的算法，用于从单细胞转录组数据中识别细胞类型和关键基因 | 单细胞转录组数据中的细胞类型和关键基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双向聚类模型 | 转录组数据 | 20个公开可用的单细胞转录组数据集 |
| 7509 | 2024-08-07 |
Microgel-based carriers enhance skeletal stem cell reprogramming towards immunomodulatory phenotype in osteoarthritic therapy
2024-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.022
PMID:38235309
|
研究论文 | 本研究探讨了微凝胶载体在骨关节炎治疗中对骨骼干细胞向免疫调节表型重编程的影响 | 首次揭示了微凝胶载体通过促进YAP蛋白核转位，增强骨骼干细胞的免疫调节能力，从而有效治疗骨关节炎 | 研究主要集中在实验室条件下，未来需进一步验证在临床环境中的效果 | 探索微凝胶载体在骨骼干细胞治疗骨关节炎中的作用机制 | 骨骼干细胞及其在骨关节炎治疗中的应用 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及骨关节炎大鼠模型 |
| 7510 | 2024-08-07 |
EMP3 as a prognostic biomarker correlates with EMT in GBM
2024-Jan-17, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11796-0
PMID:38229014
|
研究论文 | 本文研究了EMP3作为GBM中的预后生物标志物与EMT的相关性 | EMP3被发现是与EMT相关的基因，可作为诊断胶质瘤患者的特异性生物标志物，并作为胶质瘤患者总体生存的独立预后因子 | NA | 探索EMP3促进GBM生长的可能机制，对GBM治疗具有重要意义 | EMP3在GBM中的作用及其与EMT的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 5个单细胞RNA测序数据集，EMP3沉默的U87和U251细胞系 |
| 7511 | 2024-08-07 |
Extraocular muscle stem cells exhibit distinct cellular properties associated with non-muscle molecular signatures
2024-Jan-17, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202144
PMID:38240380
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研究论文 | 本研究通过克隆分析、活体成像和单细胞RNA测序，揭示了眼外肌干细胞与肢体肌肉干细胞在细胞特性和分子标志上的差异 | 首次发现眼外肌干细胞具有不同于传统肌肉细胞的分子特征，这些特征与非肌肉细胞的分子标志相关 | 研究主要集中在体外激活的眼外肌干细胞，对体内环境的影响尚未深入探讨 | 探究眼外肌干细胞与肢体肌肉干细胞在功能异质性上的机制 | 眼外肌干细胞与肢体肌肉干细胞的细胞特性和分子标志 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 7512 | 2024-08-07 |
Quercetin inhibits caspase-1-dependent macrophage pyroptosis in experimental folic acid nephropathy
2024-Jan-16, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-024-00885-2
PMID:38229085
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研究论文 | 本研究探讨了槲皮素在实验性叶酸肾病中抑制依赖于caspase-1的巨噬细胞焦亡的作用 | 首次验证了槲皮素通过下调巨噬细胞中的caspase-1来保护细胞免受焦亡的影响 | NA | 验证焦亡在实验性叶酸肾病中的重要性，并探索槲皮素对焦亡的保护作用 | 槲皮素对巨噬细胞焦亡的影响及其在叶酸肾病中的作用 | NA | 肾病 | 基因集富集分析（GSEA），加权基因共表达网络分析（WGCNA），分子对接，单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据，细胞数据 | 动物模型和RAW264.7细胞系 |
| 7513 | 2024-08-05 |
CellSTAR: a comprehensive resource for single-cell transcriptomic annotation
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad874
PMID:37855686
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为CellSTAR的综合单细胞转录组注释资源数据库 | 首次提供全面专家注释的参考数据，可用于注释数百种细胞类型，并结合数万个标记基因 | NA | 探讨细胞异质性和准确注释细胞类型的重要性 | 单细胞转录组信息和细胞类型的注释 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 包含数百种细胞类型的参考数据和数万个标记基因 |
| 7514 | 2024-08-07 |
CellCommuNet: an atlas of cell-cell communication networks from single-cell RNA sequencing of human and mouse tissues in normal and disease states
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad906
PMID:37850657
|
research paper | 介绍了一个名为CellCommuNet的综合数据资源，用于探索人类和小鼠组织在正常和疾病状态下基于单细胞RNA测序数据的细胞间通信网络 | CellCommuNet提供了一个全面的平台，用于分析和比较健康与疾病状态下的细胞间通信强度和相关信号通路 | NA | 研究细胞间通信在维持细胞、器官和整个生物体生物功能及微环境稳态中的作用 | 人类和小鼠组织在正常和疾病状态下的细胞间通信网络 | digital pathology | cancer | scRNA-seq | NA | scRNA-seq data | 376个单数据集，118个疾病与正常样本的比较数据集 |
| 7515 | 2024-08-05 |
Tumor immune microenvironment-based therapies in pancreatic ductal adenocarcinoma: time to update the concept
2024-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02935-3
PMID:38167055
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综述 | 本文探讨了肿瘤免疫微环境在胰腺导管腺癌中的疗法及其最新研究进展 | 提出了通过单细胞测序技术对胰腺导管腺癌的免疫表型进行更全面的分类 | 未详细说明特定治疗对不同免疫表型患者的效果和适应性 | 增强对胰腺导管腺癌治疗中肿瘤免疫微环境的理解 | 肿瘤细胞、免疫细胞、癌症相关成纤维细胞（CAF）及细胞外基质（ECM） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7516 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of liver immune microenvironment changes induced by microplastics in mice with non-alcoholic fatty liver
2024-Feb-20, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.168308
PMID:37977403
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了微塑料暴露下非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫微环境的改变 | 首次揭示了微塑料暴露对非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫细胞亚群的影响及其分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人体中验证相关发现 | 探究微塑料暴露对非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫微环境的影响 | 非酒精性脂肪肝小鼠肝脏免疫细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 43,480个细胞 |
| 7517 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomes and Immune Repertoires Reveal the Cell State and Molecular Changes in Pemphigus Vulgaris
2024-Feb-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300312
PMID:38117802
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和V(D)J富集技术，分析了寻常型天疱疮（PV）患者口腔黏膜病变和外周血样本的细胞状态和分子变化，以及皮质类固醇治疗后的影响 | 首次揭示了IL-1α信号通路、髓系APCs、炎症性CD8+记忆T细胞和功能障碍的CD4+调节T细胞在PV发病机制中的作用，并探讨了皮质类固醇对特定细胞类型的影响 | 研究主要集中在黏膜主导型的PV，可能不适用于所有PV患者；部分结果需要进一步的验证 | 探究寻常型天疱疮的病因和发病机制，以及皮质类固醇治疗的影响 | 寻常型天疱疮患者的口腔黏膜病变和外周血样本 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，V(D)J富集 | NA | 转录组数据 | 治疗前和口服泼尼松治疗后的寻常型天疱疮患者样本 |
| 7518 | 2024-08-07 |
Saa3 promotes pro-inflammatory macrophage differentiation and contributes to sepsis-induced AKI
2024-Jan-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111417
PMID:38134592
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据，探讨了脓毒症诱导的急性肾损伤中免疫反应的复杂机制，特别是识别了Saa3基因在促进炎症性巨噬细胞分化中的作用。 | 本研究首次揭示了Saa3在脓毒症诱导的急性肾损伤中的重要作用，并提出其可能作为预测标记。 | 需要进一步探索人类同源基因以验证Saa3作为预测标记的潜力。 | 探讨脓毒症诱导的急性肾损伤中免疫细胞失调的机制。 | 脓毒症诱导的急性肾损伤中的免疫反应和巨噬细胞的作用。 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 利用公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 7519 | 2024-08-07 |
PD-1 and TIGIT coexpressing CD8 + CD103 + tissue-resident memory cells in endometrial cancer as potential targets for immunotherapy
2024-Jan-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111381
PMID:38150880
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研究论文 | 本研究探讨了程序性细胞死亡蛋白1基因（PD-1）和T细胞免疫球蛋白和ITIM结构域基因（TIGIT）共表达的组织驻留记忆细胞在子宫内膜癌中的潜在免疫治疗靶点 | 本研究发现PD-1和TIGIT在组织驻留记忆细胞中共表达，并通过双重阻断PD-1和TIGIT更有效地恢复T细胞功能，增强了治疗潜力 | NA | 探索PD-1和TIGIT共表达的组织驻留记忆细胞在子宫内膜癌中的潜在免疫治疗靶点 | 子宫内膜癌中的组织驻留记忆细胞 | 免疫学 | 子宫内膜癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 7520 | 2024-08-07 |
Artesunate attenuates serum amyloid A-induced M1 macrophage differentiation through the promotion of PHGDH
2024-Jan-25, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111462
PMID:38159553
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研究论文 | 研究探讨了青蒿琥酯通过促进PHGDH表达减轻血清淀粉样蛋白A诱导的M1巨噬细胞分化 | 发现青蒿琥酯通过上调PHGDH表达抑制M1巨噬细胞分化和促炎细胞因子水平，从而减轻系统性红斑狼疮的疾病活动 | NA | 阐明血清淀粉样蛋白A与系统性红斑狼疮中特定免疫细胞类型的关系 | 血清淀粉样蛋白A、M1巨噬细胞、系统性红斑狼疮 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用GEO数据库中的单细胞RNA测序数据和MRL/lpr模型中的脾脏巨噬细胞 |