单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7637 篇文献，本页显示第 7481 - 7500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7481 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of mitochondrial dysfunction in the cardiogenic toxicity of perfluorooctane sulfonate in human embryonic stem cells
2024-Jan-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115945
PMID:38183750
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨了全氟辛烷磺酸（PFOS）对人类胚胎干细胞心肌分化的影响，并检测了细胞凋亡、线粒体膜电位和ATP水平。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PFOS通过干扰线粒体功能影响心肌分化的具体机制。 | 研究仅限于体外实验，未来需进一步验证在体内的效果和机制。 | 探讨PFOS对人类胚胎干细胞心肌分化的毒性作用及其机制。 | 人类胚胎干细胞的心肌分化过程。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 7482 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis to evaluate antimony exposure effects on cell-lineage communications within the Drosophila testicular niche
2024-Jan-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115948
PMID:38184976
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了锑暴露对果蝇睾丸微环境中细胞系通讯的影响 | 首次揭示了锑暴露通过表皮生长因子受体（EGFR）和WNT信号通路影响果蝇睾丸微环境中的细胞间通讯 | NA | 探究锑暴露对果蝇睾丸微环境中细胞系通讯的影响机制 | 果蝇睾丸中的细胞系通讯 | 数字病理学 | 生殖健康 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7483 | 2024-08-07 |
SUV39H1 Ablation Enhances Long-term CAR T Function in Solid Tumors
2024-01-12, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-1350
PMID:37934001
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研究论文 | 本文研究了通过表观遗传学调控组蛋白3赖氨酸9三甲基化（H3K9me3）途径，增强基于41BB（BBz）的嵌合抗原受体（CAR）T细胞在实体瘤中的长期功能 | 通过失活H3K9三甲基转移酶SUV39H1，增强了BBz-CAR T细胞的长期持久性，保护小鼠免受肿瘤复发和再挑战 | NA | 优化BBz-CAR T细胞的长期功能持久性，减少肿瘤复发 | BBz-CAR T细胞在实体瘤中的长期功能 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质分析 | NA | 单细胞转录组数据，染色质开放数据 | 涉及小鼠模型中的肿瘤浸润CAR T细胞 |
| 7484 | 2024-08-07 |
An inappropriate decline in ribosome levels drives a diverse set of neurodevelopmental disorders
2024-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.09.574708
PMID:38260472
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研究论文 | 本文探讨了核糖体水平下降如何导致多种神经发育障碍，并发现了一种新的机制，即核糖体水平的改变与早期大脑发育中细胞命运指定的时间有关。 | 发现了核糖体水平变化与早期大脑发育中细胞命运指定时间之间的未被重视的机制，并提出了通过增强mTOR活性来改善与智力障碍相关的发育缺陷的治疗方法。 | NA | 揭示蛋白质合成缺陷相关的人类大脑发育障碍的细胞和分子起源。 | 核糖体生物发生因子的新等位变异及其在神经发育障碍中的作用。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 蛋白质组学分析，单细胞转录组分析，单个类器官的翻译组分析 | NA | 蛋白质组，转录组 | 多个发育阶段的人类大脑类器官 |
| 7485 | 2024-08-05 |
ABCA7-dependent Neuropeptide-Y signalling is a resilience mechanism required for synaptic integrity in Alzheimer's disease
2024-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.02.573893
PMID:38260408
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研究论文 | 本文探讨了ABCA7依赖的神经肽Y信号传导在阿尔茨海默病中维持突触完整性的重要性 | 通过CRISPR/Cas9基因编辑建立了一个与人类阿尔茨海默病风险基因同源的敲除模型，揭示了基因变异如何影响突触完整性 | 当前研究主要基于动物模型，临床应用及其在复杂人类环境中的适用性尚不明确 | 深入理解与阿尔茨海默病相关的遗传变异机制及其影响突触健康的作用 | 使用斑马鱼模型研究ABCA7基因的敲除对神经元和胶质细胞的影响 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组学 | 斑马鱼模型和临床人类数据的结合研究 |
| 7486 | 2024-08-05 |
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2024-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573739
PMID:38260586
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研究论文 | 提出了一种名为SORBET的深度学习框架，用于分析空间转录组学或蛋白质组学数据以分类样本 | 利用图神经网络的最新进展，开发了一种新的自动化细胞邻域分析方法 | 在技术上仍然面临与空间信息、复合标记和观察到的表型相关的分析挑战 | 研究空间转录组学和蛋白质组学数据在生物表型分类中的应用 | 聚焦于不同疾病过程和技术下的组织表型预测，如对免疫治疗的反应 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 图神经网络 (GNN) | 空间转录组学和蛋白质组学数据 | NA |
| 7487 | 2024-08-07 |
[Future Perspectives of Single-Cell RNA Sequencing in Cancer Research]
2024-Jan, Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy
PMID:38247085
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在癌症研究中的进展和应用 | scRNA-seq技术使得能够在单细胞水平上分析动态基因表达特性，从而在癌症研究中取得了显著进展 | NA | 探讨scRNA-seq技术在理解癌症病理生物学中的应用 | 癌症及其相关的基因表达变化 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 7488 | 2024-08-07 |
G-protein signaling of oxytocin receptor as a potential target for cabazitaxel-resistant prostate cancer
2024-Jan, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae002
PMID:38250514
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞，发现催产素受体信号通路的激活，并验证了氯哌斯汀作为克服卡巴他赛耐药性的候选药物。 | 首次揭示了卡巴他赛耐药前列腺癌中催产素受体信号通路的激活，并发现氯哌斯汀可能通过抑制该通路来克服耐药性。 | 研究仅限于少数病例，需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性。 | 旨在识别卡巴他赛耐药前列腺癌的潜在机制和治疗靶点。 | 卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自卡巴他赛耐药前列腺癌患者的循环肿瘤细胞 |
| 7489 | 2024-08-05 |
The gut microbiota and its biogeography
2024-Feb, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-023-00969-0
PMID:37740073
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综述 | 本文探讨了肠道微生物群的生物地理学及其在生态系统中的重要性 | 文章介绍了更高分辨率的测序和单细胞数据在理解肠道微生物多样性方面的重要性 | 缺乏针对微观交互的系统长期研究 | 研究肠道微生物群的分布和多样性以及与宿主的关系 | 肠道微生物群落及其空间异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7490 | 2024-08-05 |
Multi-omics data integration shines a light on the renal medulla
2024-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.11.014
PMID:38245213
|
研究论文 | 该文章研究了肾髓质在肾功能中的作用，并构建了肾髓质标记基因的参考集 | 创新点在于利用多组学数据整合来定义肾髓质的分子程序 | 获取高质量组织的挑战限制了对调控髓质的分子程序的表征 | 研究肾髓质在维持盐和水平衡中的作用 | 研究标记基因以定义肾髓质在肾功能中的角色 | 数字病理学 | NA | 基因表达、染色质可及性、长程染色体相互作用和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 7491 | 2024-08-07 |
Specialized Retinal Endothelial Cells Modulate Blood-Retina Barrier in Diabetic Retinopathy
2024-Feb-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0368
PMID:37976214
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了视网膜内皮细胞的异质性和功能多样性，特别是在糖尿病视网膜病变中的作用 | 发现了一种新的糖尿病特异性视网膜内皮细胞群，并通过上调ACER2表达来减少神经酰胺含量和内皮细胞功能障碍的负反馈调节途径 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示视网膜内皮细胞的异质性和功能多样性，特别是在糖尿病视网膜病变中的作用 | 视网膜内皮细胞及其在糖尿病视网膜病变中的作用 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括非增生性糖尿病视网膜病变（NPDR）伴有或不伴有糖尿病黄斑水肿（DME/NDME）和活动性增生性DR（PDR）患者的血浆样本，以及糖尿病小鼠模型 |
| 7492 | 2024-08-07 |
Changes in cuproptosis-related gene expression in periodontitis: An integrated bioinformatic analysis
2024-Feb-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2023.122388
PMID:38181851
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了牙周炎中铜死亡相关基因（CRGs）的表达变化及其生物学功能 | 首次全面分析了不同表达的CRGs（DE-CRGs）在牙周炎中的综合效应，并探讨了其与免疫浸润、免疫因子、线粒体功能障碍、诊断效能及预测药物的相关性 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有限 | 探讨牙周炎中铜死亡相关基因的表达变化及其在疾病发生和治疗中的作用 | 牙周炎中的铜死亡相关基因及其生物学功能 | NA | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了正常和牙周炎牙龈样本，具体数量未详细说明 |
| 7493 | 2024-08-07 |
Tenascin-C expressing touch dome keratinocytes exhibit characteristics of all epidermal lineages
2024-Jan-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi5791
PMID:38241368
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研究论文 | 本研究探讨了触觉圆顶（TD）角质形成细胞的分子特征及其在表皮中的作用 | 首次揭示了TD角质形成细胞具有多种表皮细胞系的分子特征，并能在损伤后产生Merkel细胞 | 尚未完全阐明TD角质形成细胞在稳态下的维持机制 | 研究TD角质形成细胞的分子特征及其在表皮中的作用 | 触觉圆顶角质形成细胞及其在表皮中的作用 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 7494 | 2024-08-05 |
Exploring the mechanism of Celastrol in the treatment of rheumatoid arthritis based on systems pharmacology and multi-omics
2024-01-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48248-5
PMID:38238321
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研究论文 | 本研究探索了Celastrol在类风湿关节炎治疗中的分子网络机制 | 提出了一种新的策略，将系统药理学、蛋白质组学、转录组学和单细胞转录组学相结合 | NA | 揭示Celastrol在类风湿关节炎治疗中的作用机制 | 类风湿关节炎相关基因和Celastrol的潜在靶标 | 系统药理学 | 类风湿关节炎 | 系统药理学、转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 195个靶标、2068个差异基因、294个差异蛋白 |
| 7495 | 2024-08-05 |
PROST: quantitative identification of spatially variable genes and domain detection in spatial transcriptomics
2024-Jan-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44835-w
PMID:38238417
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研究论文 | 本文提出了一个框架（PROST），用于定量识别空间转录组中的空间变异基因和组织域 | 提出了PROST Index，可以有效定量表征基因表达的空间变异，并通过自注意力机制进行空间域的无监督聚类 | 现有方法在均匀量化空间变异基因方面存在不足，且大部分方法在技术上将空间变异基因和空间域的描绘割裂开 | 研究空间转录组数据的定量识别和分析 | 针对空间表达模式的基因和组织域进行定量识别 | 数字病理学 | NA | 空间转录组测序 | 自注意力机制 | 基因表达数据 | 不同空间分辨率的样本，包括多细胞和细胞级别的数据 |
| 7496 | 2024-08-05 |
Anoikis related genes may be novel markers associated with prognosis for ovarian cancer
2024-01-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52117-0
PMID:38238592
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研究论文 | 本研究旨在确定与凋亡相关基因在卵巢癌中的预后意义，并基于ARG表达开发预后标志。 | 本研究首次提出ARG可能在卵巢癌预后中发挥新颖作用，并建立了基于ARG表达的预后签名。 | 需要进一步研究来验证结果并探索潜在机制。 | 探讨凋亡相关基因在卵巢癌预后中的作用。 | 卵巢癌患者的临床数据和单细胞测序数据的分析。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA），非负矩阵分解（NMF），LASSO | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA |
| 7497 | 2024-08-07 |
Immune characteristics of kidney transplant recipients with acute respiratory distress syndrome induced by COVID-19 at single-cell resolution
2024-Jan-18, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02682-9
PMID:38238762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，构建了肾移植受者（KTRs）和健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs）的单细胞免疫图谱，以探讨COVID-19诱导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）在KTRs中的免疫微环境异质性 | 本研究首次在单细胞分辨率下探讨了COVID-19诱导的ARDS在肾移植受者中的免疫特征，揭示了KTRs在病毒感染和免疫抑制双重影响下的免疫微环境异质性 | 研究样本量较小，仅包括八名COVID-19诱导的ARDS患者和五名KTRs，可能影响结果的普遍性 | 旨在深入理解COVID-19诱导的ARDS在肾移植受者中的免疫特征 | 肾移植受者（KTRs）和健康个体的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 八名COVID-19诱导的ARDS患者，五名KTRs，五名健康个体 |
| 7498 | 2024-08-05 |
Multipotent progenitors instruct ontogeny of the superior colliculus
2024-Jan-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.009
PMID:38096816
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研究论文 | 这篇文章探讨了哺乳动物上丘的多能前体细胞如何指导细胞类型的多样性生成 | 首次建立了单细胞水平上哺乳动物上丘发育的新框架 | 目前尚不清楚其他因素如何进一步影响上丘细胞的多样性 | 研究上丘细胞类型多样性的生成原理 | 主要研究了上丘的放射胶质前体细胞的多能性 | 数字病理学 | NA | 基因马赛克分析和单细胞测序 | NA | 细胞谱系数据 | 使用了多个标记的遗传马赛克小鼠 |
| 7499 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.07.574209
PMID:38249519
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研究论文 | 本文应用空间转录组学和蛋白质组学选择胰腺癌表面受体靶点进行分子成像和治疗诊断。 | 创新点在于提议了紧密连接蛋白claudin-4作为胰腺癌的新治疗诊断靶点，且其在癌组织中的表达量明显增加。 | 本研究的局限性在于尚未进行临床验证和长期效果评估。 | 研究旨在通过数据驱动的方法选择用于胰腺癌的分子靶点。 | 研究对象为胰腺癌的表面受体标记和相关免疫细胞或成纤维细胞标记。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学 | NA | RNA和蛋白质数据 | NA |
| 7500 | 2024-08-05 |
Towards high-throughput parallel imaging and single-cell transcriptomics of microbial eukaryotic plankton
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0296672
PMID:38241213
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研究论文 | 该文章探讨了微生物真核浮游生物的单细胞转录组学，应用了一种新技术用于高通量成像。 | 首次将微阵列单细胞测序技术应用于微生物真核生物，并展示了其在不同细胞结构的微生物群体中的应用潜力。 | 在研究较小的硅藻细胞时，无法有效分离单细胞转录组与背景噪音，信噪比尚需提高。 | 探索微生物真核生物的转录组特征并揭示其对生态系统的影响。 | 研究三种重要浮游生物：纤毛虫Tetrahymena thermophila、硅藻Phaeodactylum tricornutum和甲藻Heterocapsa sp。 | 数字病理学 | NA | 微阵列单细胞测序技术 (MASC-seq) | NA | 图像和转录组数据 | 三种浮游生物物种的多个单细胞样本 |