单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7524 篇文献，本页显示第 7461 - 7480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7461 | 2024-08-07 |
Single-Cell Mapping of Brain Myeloid Cell Subsets Reveals Key Transcriptomic Changes Favoring Neuroplasticity after Ischemic Stroke
2024-Jan, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-023-01109-7
PMID:37755676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，描绘了脑缺血后梗死周边区域的免疫细胞组成和转录特征，揭示了微胶质细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在促进神经再生中的作用 | 首次详细描述了脑缺血后梗死周边区域免疫细胞的单细胞转录组特征，特别是微胶质细胞和单核细胞衍生巨噬细胞在神经再生中的作用 | NA | 探究脑缺血后免疫细胞在促进神经可塑性和神经再生中的作用 | 脑缺血后梗死周边区域的免疫细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 7462 | 2024-08-07 |
Immunocompetent mouse models revealed that S100A4+ monocytes/macrophages facilitate long-term Zika virus infection in the testes
2024-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2023.2300466
PMID:38164719
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研究论文 | 本研究通过使用抗IFNAR抗体阻断的C57BL/6雄性小鼠和hSTAT2敲入雄性小鼠，建立了免疫活性小鼠模型，揭示了S100A4+单核细胞/巨噬细胞在睾丸中促进寨卡病毒长期感染的作用。 | 本研究首次使用免疫活性小鼠模型，揭示了S100A4+单核细胞/巨噬细胞在寨卡病毒睾丸感染中的关键作用，并提出了寨卡病毒在男性生殖系统中长期感染的新机制。 | NA | 研究寨卡病毒如何在男性生殖系统中侵入和持续存在。 | 寨卡病毒在男性生殖系统中的感染机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用抗IFNAR抗体阻断的C57BL/6雄性小鼠和hSTAT2敲入雄性小鼠 |
| 7463 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Sequencing (scRNA-seq): Advances and Challenges for Cardiovascular Diseases (CVDs)
2024-Feb, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2023.102202
PMID:37967800
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心血管疾病（CVDs）研究中的应用及其带来的挑战 | scRNA-seq技术揭示了心脏和血管系统中先前未知的细胞类型及其在不同疾病病理中的相关性 | NA | 深入理解心血管疾病的基本机制，改进治疗策略和患者风险评估 | 心血管疾病及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 7464 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of necroptosis related gene signature to predict clinical outcomes, immune status and drug sensitivity in lower grade Glioma
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23947
PMID:38192784
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研究论文 | 本研究开发了一种可靠的坏死性凋亡相关基因特征，以预测低级别胶质瘤患者的预后 | 首次建立了基于坏死性凋亡相关基因的风险评分模型，揭示了其在低级别胶质瘤中的作用 | 未详细探讨坏死性凋亡在所有低级别胶质瘤中的作用机制 | 研究坏死性凋亡相关基因在低级别胶质瘤中的预后和免疫状态的影响 | 低级别胶质瘤患者 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 基因表达分析、功能富集分析、共识聚类分析、单细胞测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 七个预后机械基因的样本 |
| 7465 | 2024-08-07 |
StemDriver: a knowledgebase of gene functions for hematopoietic stem cell fate determination
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1063
PMID:37953308
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研究论文 | StemDriver是一个专注于血液干细胞命运决定中基因功能注释的综合知识库 | 利用单细胞RNA测序数据成功构建了从血液干细胞初始形成到成熟细胞的全面谱系图，并进行了广泛的基因表达特征探索和表征 | NA | 构建一个全面的知识库，用于血液干细胞命运决定中基因功能的注释 | 血液干细胞命运决定中的基因功能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涵盖42项研究，包括从胚胎期到成年的14种组织类型，评估了23,839个人类样本基因和29,533个鼠样本基因 |
| 7466 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals ferrimagnetic vortex iron oxide nanoring-mediated mild magnetic hyperthermia exerts antitumor effects by alleviating macrophage suppression in breast cancer
2024-Jan, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.115954
PMID:38039753
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研究论文 | 该文章探讨了铁氧体旋涡铁氧化物纳米环介导的温和磁热疗法（FVIO-MHT）对乳腺癌肿瘤微环境的影响 | 本研究利用单细胞转录组测序揭示FVIO-MHT通过改善巨噬细胞的抑制作用来增强抗肿瘤效果 | 研究未明确揭示FVIO-MHT在其他类型肿瘤微环境中的影响 | 研究FVIO-MHT在乳腺癌治疗中的潜力及其对肿瘤微环境的影响 | 主要集中在乳腺癌的肿瘤微环境及巨噬细胞的变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | NA |
| 7467 | 2024-08-07 |
Patch-seq: Multimodal Profiling of Single-Cell Morphology, Electrophysiology, and Gene Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3621-3_15
PMID:38194038
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研究论文 | 本文介绍了Patch-seq技术，该技术结合了全细胞膜片钳记录、免疫组织化学和单细胞RNA测序，用于全面分析单细胞的形态学、电生理学和转录组学特征 | Patch-seq技术首次实现了对单细胞多模态特征的综合分析，包括形态学、电生理学和基因表达模式 | NA | 探索细胞间丰富的多维表型变异，并在单细胞水平上直接关联基因表达与表型 | 单细胞的形态学、电生理学和基因表达模式 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 形态学、电生理学和转录组数据 | 单个细胞 |
| 7468 | 2024-08-07 |
Resistance to PRMT5-targeted therapy in mantle cell lymphoma
2024-Jan-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2023010554
PMID:38193716
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研究论文 | 研究了蛋白精氨酸甲基转移酶5（PRMT5）靶向治疗在套细胞淋巴瘤（MCL）中的抗药性问题 | 发现mTOR信号通路的激活是PRMT5抑制剂抗药性的关键因素，并验证了mTORC1抑制剂temsirolimus在克服PRMT5抑制剂抗药性中的疗效 | 研究主要基于细胞系和患者来源的异种移植（PDX）模型，需要进一步的临床试验验证 | 探讨PRMT5靶向治疗在MCL中的抗药性机制及潜在的克服策略 | 套细胞淋巴瘤细胞系和患者来源的异种移植模型 | NA | 淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 敏感细胞系4个，初级抗性细胞系4个，抗性PDX模型若干 |
| 7469 | 2024-08-07 |
Enhanced bone regeneration via endochondral ossification using Exendin-4-modified mesenchymal stem cells
2024-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.007
PMID:38186959
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研究论文 | 本文介绍了一种通过Exendin-4修饰的间充质干细胞促进骨再生的策略 | 提出了过表达Exendin-4的间充质干细胞在骨重塑中的自分泌和旁分泌功能的作用 | 未提及具体的临床数据支持 | 研究通过内软骨骨化促进骨再生的潜力 | 过表达Exendin-4的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞测序数据 | 在大鼠颅骨缺损模型中使用 |
| 7470 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell sequencing and weighted co-expression network identifies a novel signature based on cellular senescence-related genes to predict prognosis in glioblastoma
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23921
PMID:37565732
|
研究论文 | 该文章探讨了细胞衰老相关基因在预后预测中的应用，特别是在胶质母细胞瘤中 | 本研究通过整合单细胞测序和加权共同表达网络分析，识别出一种新的与细胞衰老相关的基因签名，用于预测胶质母细胞瘤的预后 | 研究限制在于样本可能存在的偏倚及未完全考虑的潜在影响因素 | 本研究旨在揭示细胞衰老对胶质母细胞瘤患者预后的影响 | 研究对象为胶质母细胞瘤患者的基因表达和临床数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 总计选取了150个差异表达基因 |
| 7471 | 2024-08-05 |
Multidimensional progressive single-cell sequencing reveals cell microenvironment composition and cancer heterogeneity in lung cancer
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24018
PMID:37956258
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研究论文 | 该文章通过多维逐渐单细胞测序揭示了肺癌的细胞微环境成分和肿瘤异质性。 | 通过单细胞RNA测序区分了八种不同的细胞类型，揭示了肿瘤微环境的显著肿瘤内异质性，并发现了潜在的预测生物标志物。 | 文章中未提及具体的研究限制。 | 研究肺癌细胞微环境的组成和肿瘤异质性。 | 研究对象为19个不同的肺癌肿瘤样本，分析其细胞类型和基因表达模式。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 19个肺癌肿瘤样本 |
| 7472 | 2024-08-07 |
Single-cell combined with bulk-RNA data reveal a pattern related to angiogenesis in breast cancer patients: Individualized medicine
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23947
PMID:37647361
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据，揭示了与乳腺癌患者血管生成相关的模式，并构建了个性化治疗模型。 | 本研究首次综合单细胞和批量RNA测序数据，通过随机森林生存分析构建了预测模型，并在外部验证集中进行了验证。 | 研究主要集中在三阴性乳腺癌患者，可能不适用于所有乳腺癌亚型。 | 揭示乳腺癌患者血管生成的相关模式，并构建个性化治疗模型。 | 乳腺癌患者的RNA测序数据和生存数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | 随机森林 | RNA测序数据 | 1082名乳腺癌患者 |
| 7473 | 2024-08-07 |
Transcriptome characteristics of epithelial cells from advanced non-small cell lung cancer were revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.23960
PMID:37676967
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了晚期非小细胞肺癌上皮细胞的转录组特征 | 首次发现TPI1作为LUAD的新型生物标志物，并揭示了MXD3和GATA4作为潜在的调控转录因子 | NA | 探索与LUAD患者免疫浸润和生存时间相关的差异表达基因，并预测转录因子以揭示LUAD的分子机制和个体化治疗 | 晚期非小细胞肺癌的上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16种上皮细胞类型 |
| 7474 | 2024-08-07 |
The single-cell evolution trajectory presented different hypoxia heterogeneity to reveal the carcinogenesis of genes in clear cell renal cell carcinoma: Based on multiple omics and real experimental verification
2024-Feb, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24009
PMID:37886854
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 本研究首次识别了ccRCC中多个与缺氧相关的肿瘤微环境（TME）亚群，并揭示了ANGPTL4在调控ccRCC增殖中的作用 | NA | 探讨透明细胞肾细胞癌中基因的癌变机制及其与缺氧异质性的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其相关基因和细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-seq | UMAP, NMF | 单细胞RNA测序数据 | 使用了来自GSE159115数据集的scRNA-seq数据，以及ccRCC细胞系的786-O和Caki细胞 |
| 7475 | 2024-08-07 |
Adverse effects of gestational diabetes mellitus on fetal monocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108637
PMID:38188508
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康母亲和妊娠糖尿病（GDM）母亲胎儿脐带血单核细胞的转录组数据，揭示了GDM对胎儿单核细胞的不良影响。 | 首次揭示了GDM母亲胎儿脐带血中单核细胞的特征性变化，包括炎症相关通路下调和增殖相关通路上调，以及CXCL8+IL1B+亚群的扩增和功能增强。 | 研究仅限于脐带血单核细胞的分析，未涉及其他组织或细胞类型，可能需要进一步研究以全面理解GDM对胎儿的影响。 | 探讨妊娠糖尿病对胎儿单核细胞的影响及其潜在机制。 | 健康母亲和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞。 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括健康和GDM母亲胎儿的脐带血单核细胞，以及儿童和青少年外周血单核细胞和动脉粥样硬化斑块中的髓样细胞。 |
| 7476 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16487
PMID:37794835
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了豌豆芽发育及细胞类型特异性响应硼缺乏的情况 | 相较于传统的整体组织RNA测序分析，本研究能够捕捉到细胞类型特异性的响应，揭示了硼缺乏对植物生理响应的重要性 | NA | 旨在理解营养胁迫如何影响植物生长，并探索提高作物在营养限制条件下产量的方法 | 豌豆芽的发育及对硼缺乏的细胞类型特异性响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 豌豆芽的顶端细胞 |
| 7477 | 2024-08-07 |
Author Correction: Longitudinal scRNA-seq analysis in mouse and human informs optimization of rapid mouse astrocyte differentiation protocols
2024-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01531-0
PMID:37996532
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7478 | 2024-08-05 |
PLZF protein forms a complex with protein TET1 to target TCF7L2 in undifferentiated spermatogonia
2024-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本文探讨了PLZF蛋白作为表观遗传调节因子在不分化精原细胞中的作用 | 本研究建立了新的PLZF&TET1-H3K4me3-TCF7L2轴以及PLZF和EZH2之间的新关联 | NA | 研究PLZF在精原细胞自我更新及维持中的功能 | 不分化精原细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 7479 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of zebrafish brain reveals adverse effects of manganese on neurogenesis
2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.122908
PMID:37952916
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研究论文 | 本文探讨了锰对斑马鱼大脑神经发生的影响及其机制 | 本研究首次揭示了不同浓度锰暴露对斑马鱼大脑神经发生的促进与抑制作用 | 本研究仅在斑马鱼模型中进行，是否适用于其他物种尚未确定 | 研究锰暴露对神经发生影响的具体机制 | 斑马鱼大脑的神经细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 正常组和锰暴露组的斑马鱼大脑样本 |
| 7480 | 2024-08-05 |
STOmicsDB: a comprehensive database for spatial transcriptomics data sharing, analysis and visualization
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad933
PMID:37953328
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研究论文 | 这篇文章介绍了STOmicsDB，一个提供空间转录组数据共享、分析和可视化的综合数据库 | STOmicsDB集成了218个手动筛选的数据集，并提供了可定制的子数据库功能，以增强数据的可重用性和互操作性 | 尚未提及具体的限制 | 旨在促进空间转录组数据的共享和分析 | 规则和分析空间转录组数据集，以揭示细胞类型和空间区域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 数据集 | 包含218个数据集，代表17种物种 |