单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7637 篇文献，本页显示第 7441 - 7460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7441 | 2024-08-07 |
Identification of gene signatures and molecular mechanisms underlying the mutual exclusion between psoriasis and leprosy
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52783-0
PMID:38273053
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研究论文 | 本研究旨在揭示牛皮癣和麻风病相互排斥的分子机制，通过分析差异表达基因和富集分析，识别出关键的相互排斥基因并探讨其与免疫细胞浸润的关系。 | 本研究首次识别出APOE, CYP27A1, 和SOAT1作为牛皮癣和麻风病相互排斥的关键基因，并通过胆固醇代谢途径解释了两者之间的负相关机制。 | 本研究主要基于数据库中的数据进行分析，未来需要更多的实验验证和临床数据支持。 | 揭示牛皮癣和麻风病相互排斥的分子机制 | 牛皮癣和麻风病的差异表达基因及相互排斥机制 | NA | 牛皮癣, 麻风病 | DEseq2, 单样本基因集富集分析 (ssGSEA) | 蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络 | 基因表达数据 | 1098个差异表达基因在麻风病数据集中，3839个差异表达基因在牛皮癣数据集中 |
| 7442 | 2024-08-07 |
The Role of Zuo Jin Wan in Modulating the Tumor Microenvironment of Colorectal Cancer
2024-Jan-25, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 研究中药左金丸在调节结直肠癌肿瘤微环境中的作用 | 首次探讨了左金丸在结直肠癌免疫调节中的作用，可能改善现有免疫治疗策略的抗肿瘤效果 | NA | 探索左金丸在结直肠癌免疫调节中的作用 | 左金丸中的活性化合物及其对结直肠癌微环境中细胞的调节作用 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7443 | 2024-08-05 |
SPANN: annotating single-cell resolution spatial transcriptome data with scRNA-seq data
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad533
PMID:38279647
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研究论文 | 本文提出了一种名为SPANN的空间转录组数据注释方法 | SPANN能够自动检测新型细胞并在已知细胞类型上保持高注释准确性 | 目前尚未提及该方法在特定情况下的局限性 | 研究目的是开发一种有效的空间转录组数据注释工具 | 研究对象是单细胞级别的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据 | 综合实验使用了来自各种空间平台的数据集 |
| 7444 | 2024-08-07 |
Exploring Immune Cell Diversity in the Lacrimal Glands of Healthy Mice: A Single-Cell RNA-Sequencing Atlas
2024-Jan-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021208
PMID:38279208
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学分析，探索了正常小鼠泪腺中的免疫细胞多样性及其分子特征 | 首次详细描述了泪腺中18种不同细胞簇和26种免疫细胞亚群的多样性及其细胞间相互作用 | NA | 深入了解泪腺中的免疫系统及其与相关疾病的关系 | 小鼠泪腺中的免疫细胞及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类 | 细胞 | 34,891个细胞 |
| 7445 | 2024-08-05 |
Application of Single-Cell Sequencing Technology in Research on Colorectal Cancer
2024-Jan-18, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm14010108
PMID:38248808
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综述 | 本文概述了单细胞测序技术在结直肠癌研究中的应用 | 文章聚焦于单细胞测序在揭示肿瘤异质性和新药靶点方面的创新应用 | NA | 加强对结直肠癌发展和肿瘤微环境的理解 | 结直肠癌的肿瘤异质性、循环肿瘤细胞及新药靶点 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和表观遗传数据 | NA |
| 7446 | 2024-08-05 |
Integrating TCGA and Single-Cell Sequencing Data for Hepatocellular Carcinoma: A Novel Glycosylation (GLY)/Tumor Microenvironment (TME) Classifier to Predict Prognosis and Immunotherapy Response
2024-Jan-13, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14010051
PMID:38248854
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研究论文 | 该研究开发了一种基于糖基化相关基因和肿瘤微环境评分的分类器，用于改善肝细胞癌的预后预测和免疫治疗反应 | 提出了一个新的糖基化/肿瘤微环境分类器，能够更好地预测临床结果 | 对驱动肿瘤微环境中免疫细胞变异的分子途径了解不足 | 旨在通过开发GLY/TME分类器来改善肝细胞癌的预后预测 | 研究肝细胞癌中的糖基化相关基因与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 分类器 | 基因表达数据 | NA |
| 7447 | 2024-08-05 |
Single-cell data revealed CD14-type and FCGR3A-type macrophages and relevant prognostic factors for predicting immunotherapy and prognosis in stomach adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16776
PMID:38274323
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序技术识别了胃腺癌中的关键细胞类型和相关预后因子 | 研究首次构建了用于预测胃腺癌患者免疫疗法反应和预后的单细胞图谱及风险评分模型 | 研究结果基于单细胞数据和公共数据库，可能存在样本偏倚和外部验证不足 | 探讨胃腺癌中的细胞异质性及其与免疫疗法和预后的相关性 | 胃腺癌患者的单细胞数据及免疫微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO COX模型 | 基因表达数据 | 涉及的样本数量在700个以上的巨噬细胞亚群和其他细胞类型 |
| 7448 | 2024-08-05 |
scSID: A lightweight algorithm for identifying rare cell types by capturing differential expression from single-cell sequencing data
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.043
PMID:38274993
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研究论文 | 提出了一种单细胞相似性划分算法(scSID)用于识别稀有细胞类型 | scSID通过分析细胞间和细胞内的相似性，捕捉稀有细胞类型的相似性差异 | 未提及具体的局限性 | 识别稀有细胞类型并改善现有识别方法 | 稀有细胞类型的识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 数据集 | 多个数据集，包括68K PBMC和肠道样本 |
| 7449 | 2024-08-05 |
scIALM: A method for sparse scRNA-seq expression matrix imputation using the Inexact Augmented Lagrange Multiplier with low error
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.027
PMID:38274995
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研究论文 | 提出了一种名为scIALM的方法，用于稀疏单细胞RNA表达矩阵的插补恢复 | 使用不准确的增广拉格朗日乘子法来恢复矩阵中的未知条目，表现出极低的错误率 | 未提供明显的样本量和数据特征的限制 | 旨在改善单细胞RNA测序数据中矩阵的格式，以增强下游分析的准确性 | 原始的稀疏单细胞RNA表达数据矩阵 | 数字路径学 | NA | NA | NA | 矩阵 | 四个数据集 |
| 7450 | 2024-08-07 |
Intracellular and extracellular synergistic therapy for restoring macrophage functions via anti-CD47 antibody-conjugated bifunctional nanoparticles in atherosclerosis
2024-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.024
PMID:38274294
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研究论文 | 本研究开发了一种双功能纳米粒子，通过抗CD47抗体偶联，实现对巨噬细胞功能的细胞内和细胞外协同治疗，用于治疗动脉粥样硬化 | 本研究创新性地使用了双功能纳米粒子，结合抗CD47抗体和NLRP3抑制剂CY-09，实现了对巨噬细胞内外信号的有效调控 | NA | 研究旨在通过调控巨噬细胞功能，有效减少动脉粥样硬化斑块的形成，从而降低心血管疾病的风险 | 研究对象为动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其功能 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 纳米技术 | NA | RNA序列 | 研究使用了Apoe小鼠模型 |
| 7451 | 2024-08-07 |
A multidimensional atlas of human glioblastoma-like organoids reveals highly coordinated molecular networks and effective drugs
2024-Jan-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00500-5
PMID:38273014
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研究论文 | 本研究利用先进的人类胶质母细胞瘤样类器官模型，通过单细胞转录组、DNA甲基化组、代谢组、脂质组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析，全面表征了这些模型，并发现了遗传异质性对功能异质性的影响，以及NF1突变驱动的间质特征。 | 首次全面表征了人类胶质母细胞瘤样类器官模型，并发现了甘油脂质重编程是胶质母细胞瘤的标志，同时基于这些模型提供了基因型基础的药物参考图谱。 | NA | 旨在提供新的人类胶质母细胞瘤模型，并为有效的胶质母细胞瘤治疗提供研究路径。 | 人类胶质母细胞瘤样类器官模型及其分子网络和有效药物。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组、DNA甲基化组、代谢组、脂质组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析 | NA | 多组学数据 | NA |
| 7452 | 2024-08-07 |
Single cell multi-omics of fibrotic kidney reveal epigenetic regulation of antioxidation and apoptosis within proximal tubule
2024-Jan-25, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05118-1
PMID:38270638
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术探讨了纤维化肾脏中近端小管的表观遗传调控机制 | 首次揭示了在纤维化过程中，近端小管中Sod1和Sod2 mRNA表达减少的表观遗传调控机制，并验证了Nfix转录因子促进Ifi27表达与细胞凋亡的关系 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索纤维化肾脏中近端小管的转录动态和表观遗传调控机制 | 纤维化肾脏中的近端小管细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO数据库的数据和人类活检样本 |
| 7453 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Landscape of Longissimus Dorsi in a Newborn Suhuai Pig
2024-Jan-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021204
PMID:38256277
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了新生苏淮猪背最长肌的细胞图谱，并分析了细胞间的相互作用及其在肌肉发育中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了新生苏淮猪背最长肌的细胞组成和细胞间相互作用，并探讨了成纤维脂肪前体细胞的异质性及其在肌肉发育中的潜在作用 | NA | 研究新生苏淮猪背最长肌的细胞组成和细胞间相互作用，以及这些细胞在肌肉发育和肉质控制中的分子特征 | 新生苏淮猪背最长肌的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 16,018个细胞 |
| 7454 | 2024-08-05 |
Harnessing the Stem Cell Niche in Regenerative Medicine: Innovative Avenue to Combat Neurodegenerative Diseases
2024-Jan-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020993
PMID:38256066
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综述 | 该文章探讨了干细胞微环境在再生医学中治疗神经退行性疾病的应用 | 文章整合了关于干细胞微环境的新见解，揭示了调节微环境功能的潜在治疗新方法 | 文章未提及具体的临床试验或数据支持 | 旨在理解干细胞微环境对神经再生和修复的影响 | 研究对象为内源性神经干细胞及其微环境 | 再生医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、类器官技术、微流控技术、人工智能、计算建模、转分化 | NA | NA | NA |
| 7455 | 2024-08-05 |
Establishment and Validation of Novel Prognostic Subtypes in Hepatocellular Carcinoma Based on Bile Acid Metabolism Gene Signatures Using Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020919
PMID:38255993
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研究论文 | 本研究基于胆汁酸代谢基因特征建立并验证了肝细胞癌的预后亚型 | 首次将胆汁酸代谢相关基因与肝细胞癌分类为四种亚型，并提出亚型C2a与更高生存几率相关 | 本研究为初步分析，尚需更多验证研究以阐明胆汁酸代谢与肝癌的具体机制 | 探索胆汁酸代谢在肝细胞癌发生发展中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌样本及其与胆汁酸代谢相关的基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种数据集的肝细胞癌样本 |
| 7456 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Development-Specific Networks at Distinct Synchronized Antral Follicle Sizes in Sheep Oocytes
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020910
PMID:38255985
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研究论文 | 该文章通过单细胞转录组分析揭示了羊卵母细胞不同同步的窦卵泡大小下的发育特异网络 | 为羊卵母细胞在窦卵泡发育过程中的转录组特征提供了全面的描绘，填补了羊卵子发生分子图谱的空白 | 未提及研究的具体限制 | 理解羊卵母细胞的成熟和卵泡发育 | 不同大小的羊卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 (SmartSeq2) | NA | 转录组数据 | 通过不同大小的羊卵母细胞进行分析 |
| 7457 | 2024-08-07 |
Metabolomics, Transcriptome and Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Metabolic Heterogeneity between Oral Cancer Stem Cells and Differentiated Cancer Cells
2024-Jan-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16020237
PMID:38254728
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研究论文 | 本研究通过代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序分析，探讨口腔癌干细胞与分化癌细胞之间的代谢异质性 | 首次综合运用代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序技术，深入分析口腔癌干细胞与分化癌细胞的代谢差异 | 研究仅限于细胞系和多细胞肿瘤球体模型，未涉及更多临床样本 | 理解癌干细胞的独特代谢特征，以应对与之相关的临床挑战 | 口腔癌干细胞与分化癌细胞的代谢特征 | 数字病理学 | 口腔癌 | 代谢组学、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 代谢物、基因表达数据 | 使用CAL27和HSC3细胞系及六个口腔癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 7458 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alterations in Patient Immune Cells with Pulmonary Long COVID-19 Complications
2024-Jan-02, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46010029
PMID:38248331
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了患有长期COVID-19并发症患者的免疫细胞变化 | 首次详细分析了长期COVID-19患者免疫细胞的动态变化，特别是幼稚中性粒细胞和CD8+ NKT样细胞的增加 | 研究样本量较小，仅包括一名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入研究长期COVID-19患者的免疫景观 | 长期COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 一名71岁COVID-19患者及对照组 |
| 7459 | 2024-08-07 |
Correction to 'Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno'
2024-Jan-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1229
PMID:38109292
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7460 | 2024-08-07 |
InClust+: the deep generative framework with mask modules for multimodal data integration, imputation, and cross-modal generation
2024-Jan-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05656-2
PMID:38267858
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研究论文 | 本文介绍了inClust+，一个用于多组学数据整合、插补和跨模态生成的深度生成框架，该框架通过增加两个掩码模块来增强其处理多模态数据的能力 | inClust+框架引入了输入掩码模块和输出掩码模块，专门设计用于处理多模态数据，提高了数据整合和跨模态生成的效率 | NA | 开发一种能够有效整合和处理多模态数据的计算方法 | 单细胞技术产生的多组学数据，包括基因表达、染色质可及性和蛋白质丰度等 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 生成对抗网络（GAN） | 多模态数据 | 涉及多种类型的单细胞数据集，包括scRNA-seq、MERFISH和CITE-seq数据 |