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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-10-06 |
Protocol for isolating immune cells from human gastric muscularis propria for single-cell analysis
2024-09-20, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103258
PMID:39133613
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研究论文 | 本文提供了一种从人胃肌层分离免疫细胞进行单细胞分析的详细实验方案 | 开发了专门针对人胃肌层组织免疫细胞分离的单细胞分析方案 | NA | 建立人胃肌层免疫细胞分离和单细胞分析的标准实验流程 | 人胃肌层组织中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 胃肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 722 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing illuminates the ontogeny, conservation and diversification of cartilaginous and bony fish lymphocytes
2024-09-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51761-4
PMID:39227568
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示软骨鱼和硬骨鱼淋巴细胞的个体发育、保守性和多样性 | 首次构建软骨鱼和硬骨鱼的免疫细胞单细胞图谱,发现软骨鱼中存在共表达T、B细胞标志的T细胞亚群和具有吞噬功能的B细胞群体 | 研究仅涵盖三种代表性鱼类物种,可能需要更多物种验证普遍性 | 阐明有颌类脊椎动物免疫系统的起源和进化特征 | 软骨鱼(白斑竹鲨)和硬骨鱼(斑马鱼和半滑舌鳎)的免疫细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种鱼类物种的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 723 | 2025-10-06 |
Discovery of an unconventional lamprey lymphocyte lineage highlights divergent features in vertebrate adaptive immune system evolution
2024-09-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51763-2
PMID:39227584
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示七鳃鳗中一种表达MPL-L受体的独特T样细胞亚型 | 首次在无颌类脊椎动物中发现表达MPL样受体的新型T样淋巴细胞亚型 | 研究仅针对七鳃鳗单一物种,需在更多无颌类脊椎动物中验证 | 探究无颌类脊椎动物适应性免疫系统的细胞多样性 | 七鳃鳗(Lampetra morii)的鳃、肠道和血液组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 七鳃鳗多个组织(鳃、肠、血液、肝脏、肾脏、皮肤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq reveals novel immune-suppressive T cells and investigates CMV-TCR-T cells cytotoxicity against GBM
2024-04-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-008967
PMID:38688579
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质母细胞瘤中新型免疫抑制性T细胞,并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 首次在CMV感染的胶质母细胞瘤中发现双阳性CD68+SOX2+肿瘤相关巨噬细胞和FXYD6+ T细胞两种新型免疫细胞亚群,并证实FXYD6+ T细胞是一类新型免疫抑制性T细胞 | NA | 探究巨细胞病毒感染对胶质母细胞瘤免疫微环境的影响,并开发靶向CMV的TCR-T细胞疗法 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤组织、CMV感染的胶质母细胞瘤免疫微环境 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR/BCR测序,免疫电镜,免疫荧光,微滴数字PCR,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 725 | 2025-10-06 |
Dysregulation of CD4+ and CD8+ resident memory T, myeloid, and stromal cells in steroid-experienced, checkpoint inhibitor colitis
2024-04-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008628
PMID:38642938
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析免疫检查点抑制剂相关结肠炎的细胞机制,重点关注类固醇治疗患者的免疫细胞和基质细胞变化 | 首次在类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者中系统分析CD4+和CD8+组织驻留记忆T细胞、髓系细胞和基质细胞的失调机制 | 样本主要来自类固醇治疗过的患者,可能影响对疾病原始机制的解读 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制,特别是在类固醇治疗背景下的细胞变化 | 免疫检查点抑制剂相关结肠炎患者的结肠活检组织和血液样本 | 单细胞组学 | 免疫相关结肠炎 | 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, T细胞受体测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 主要来自类固醇治疗过的免疫检查点抑制剂结肠炎患者的结肠活检和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 726 | 2025-10-06 |
Supermultipotency and unpredictability in the developing superior colliculus
2024-04, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2024.03.001
PMID:38514350
|
研究论文 | 通过谱系追踪与单细胞RNA测序技术研究上丘发育过程中祖细胞的多能性和定位模式 | 发现上丘发育过程中存在极端多能性的单个祖细胞,能够生成所有类型的神经元和胶质细胞,且细胞定位呈现非预定模式 | NA | 探索上丘发育过程中祖细胞的分化潜能和细胞定位规律 | 发育中的上丘组织 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 727 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic reduces mouse lung inflammation and fibrosis after radiation by attenuating activated endothelial phenotypes
2024-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181330
PMID:39513364
|
研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过抑制内皮细胞活化减轻辐射诱导的小鼠肺损伤 | 首次发现血小板生成素模拟物能通过调节毛细血管内皮细胞表型减轻辐射诱导的肺损伤 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证 | 评估血小板生成素模拟物对辐射诱导肺损伤的保护作用及机制 | 小鼠肺组织和原代肺微血管内皮细胞 | 病理生理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | 小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 728 | 2025-10-06 |
[Identification of prognostic genes in prostate cancer by single-cell sequencing combined with Mendelian randomization]
2024-Nov, Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology
PMID:40783865
|
研究论文 | 通过单细胞测序结合孟德尔随机化方法识别前列腺癌预后相关基因 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化方法相结合识别前列腺癌预后基因 | 样本量较小(仅4例前列腺癌单细胞数据),需要更大样本验证 | 识别前列腺癌发展和预后的关键基因 | 前列腺癌患者组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化, 差异表达分析, 富集分析 | 单变量COX回归 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 4例前列腺癌单细胞数据 + TCGA和GEO数据库前列腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2025-10-06 |
Single Cell Profiling in the Sox10 Dom/+ Hirschsprung Mouse Implicates Hoxa6 in Enteric Neuron Lineage Allocation
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613729
PMID:39345473
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Sox10 Dom/+小鼠模型,揭示了Hoxa6在肠神经系统神经元谱系分配中的作用 | 首次报道Hox基因参与肠神经元谱系多样化,发现Sox10 Dom/+突变导致新的祖细胞簇和神经元轨迹改变 | 研究仅限于小鼠模型,人类肠神经系统的直接适用性需要进一步验证 | 探究Sox10缺陷如何改变肠神经元亚型比例及其分子机制 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 | 单细胞生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 杂交链式反应(HCR) | NA | 单细胞转录组数据 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2025-10-06 |
Cellular dynamics in pig-to-human kidney xenotransplantation
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.05.003
PMID:38776915
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和纵向RNA测序分析猪到人肾脏异种移植中的细胞动态变化和免疫反应 | 首次在猪到人肾脏异种移植中应用纵向单细胞转录组分析,揭示了时间分辨的细胞动态变化和免疫反应 | 仅分析了两例异种移植案例,样本量有限 | 研究异种移植过程中移植肾脏与受体之间的相互作用和免疫反应 | 猪肾脏异种移植受体和移植肾脏组织 | 单细胞生物学 | 器官移植 | 单细胞RNA测序, 纵向RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | 2例猪到人肾脏异种移植案例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 731 | 2025-10-06 |
B cells expressing mutated IGHV1-69-encoded antigen receptors related to virus neutralization show lymphoma-like transcriptomes in patients with chronic HCV infection
2024-08-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000503
PMID:39082968
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研究论文 | 本研究通过分析慢性HCV感染患者的B细胞受体库和单细胞转录组,揭示了表达病毒中和性抗原受体的B细胞具有淋巴瘤样转录组特征 | 首次发现表达IGHV1-69编码的HCV中和性抗原受体的B细胞在慢性HCV感染患者中表现出持续的致癌转录组特征,即使病毒清除后仍长期存在 | 研究样本量有限,体外信号传导实验可能无法完全反映体内复杂环境 | 探究慢性HCV感染与B细胞异常增殖及淋巴瘤风险增加的机制关联 | 慢性HCV感染患者和经直接抗病毒治疗获得持续病毒学应答的患者 | 免疫学 | 丙型肝炎病毒感染 | B细胞受体测序,单细胞RNA测序,体外信号传导实验 | TKO模型 | 基因组测序数据,转录组数据 | 慢性HCV感染患者和HCV SVR患者的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 732 | 2025-10-06 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-12, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
|
综述 | 探讨单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的应用与优势 | 首次系统评述单细胞和空间转录组学在植物-微生物共生研究中的创新应用,突破了传统RNA-seq技术的细胞分辨率限制 | 当前技术难以在同一细胞中同时捕获植物和微生物的转录本 | 研究植物与微生物之间的共生关系建立机制 | 植物-微生物共生体系 | 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 733 | 2025-10-06 |
Lost in space: what single-cell RNA sequencing cannot tell you
2024-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.03.010
PMID:38570278
|
综述 | 探讨单细胞RNA测序技术因丢失空间信息而存在的局限性,并提出整合空间转录组学数据的解决方案 | 提出通过空间信息指导单细胞分析的新思路,强调多技术整合的协同价值 | 当前单细胞分析流程无法完全恢复空间信息 | 分析单细胞RNA测序技术的局限性并探索空间信息整合方法 | 植物细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA原位杂交 | NA | RNA测序数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 734 | 2025-10-06 |
Epsins oversee smooth muscle cell reprograming by influencing master regulators KLF4 and OCT4
2024-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.08.574714
PMID:39131381
|
研究论文 | 本研究揭示了Epsins通过调控主调控因子KLF4和OCT4来监督平滑肌细胞重编程的机制 | 首次发现Epsins通过不同方式调控OCT4和KLF4来引导平滑肌细胞向有益细胞类型重编程 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Epsins在平滑肌细胞重编程中的作用及其与冠状动脉疾病的关系 | 小鼠和人体的平滑肌细胞 | 细胞生物学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 735 | 2025-10-06 |
Multiplexed single-cell characterization of alternative polyadenylation regulators
2024-Aug-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.06.005
PMID:38925112
|
研究论文 | 本研究通过开发CPA-Perturb-seq多路复用单细胞扰动筛选技术,系统解析了42种切割加尾调控因子对多聚腺苷酸化位点选择的调控机制 | 首次将多路复用单细胞扰动筛选与3'单细胞RNA测序相结合,开发了APARENT-Perturb深度神经网络模型解析串联多聚腺苷酸化位点的顺式调控机制 | 研究仅针对42种已知的CPA调控因子,可能未涵盖所有相关调控因子 | 深入理解切割加尾机制调控多聚腺苷酸化位点选择的分子机制 | 哺乳动物基因的多聚腺苷酸化位点及其调控因子 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 多路复用扰动筛选, 深度神经网络 | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | 42种CPA调控因子的扰动数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 3' scRNA-seq | NA | 3'单细胞RNA测序 |
| 736 | 2025-10-06 |
Harnessing spatial transcriptomics for advancing plant regeneration research
2024-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.02.004
PMID:38418271
|
研究论文 | 利用空间转录组学研究番茄愈伤组织芽再生过程中不同细胞的分子特征 | 首次应用空间转录组学技术研究植物芽再生过程,揭示不同细胞类型的分子特征 | NA | 提高对植物芽再生机制的理解 | 番茄愈伤组织中的芽原基和绿色组织细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 737 | 2025-10-06 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582629
PMID:38464041
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研究论文 | 本研究揭示了胰岛素信号通过调控R2逆转座子表达来维持跨代核糖体DNA拷贝数稳定的机制 | 首次发现胰岛素受体作为R2逆转座子的主要抑制因子,并阐明其通过整合rDNA拷贝数监测与环境感知来调控生殖系基因组稳定性 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的保守性尚需验证 | 探究生殖系rDNA拷贝数维持的调控机制 | 果蝇雄性生殖干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 738 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2024-Jan-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.01.18.24301478
PMID:38410450
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研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组数据,揭示精神疾病与特定脑细胞类型和脑区的关联 | 首次利用成人全脑单细胞图谱将精神疾病基因组结果与特定脑细胞类型和脑区连接,并验证功能连接性 | 依赖人类脑图谱数据的完整性,需进一步实验验证具体机制 | 解析精神疾病的时空脑区定位和细胞类型基础 | 精神疾病(精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症)及相关认知特征 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究(GWAS),单细胞RNA测序 | 富集分析,功能连接分析 | 基因组数据,转录组数据,fMRI影像数据 | 精神疾病患者与神经典型对照组的fMRI数据 | NA | 单细胞RNA-seq,功能磁共振成像 | NA | 成人全脑单细胞图谱 |
| 739 | 2025-10-06 |
Identifying immune signatures of sepsis to increase diagnostic accuracy in very preterm babies
2024-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44387-5
PMID:38195661
|
研究论文 | 通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和血浆分析识别极早产儿败血症的免疫特征 | 发现双调蛋白在败血症期间白细胞群体中的上调,可作为即使C反应蛋白正常时仍与疾病临床体征相关的血浆分析物 | 研究样本仅限于极早产儿(<32周妊娠),样本量相对有限 | 提高极早产儿败血症诊断准确性 | 极早产儿(<32周妊娠)的血液样本 | 数字病理学 | 败血症 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,血浆分析 | NA | 流式细胞数据,单细胞RNA测序数据,血浆分析数据 | 极早产儿血液样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 740 | 2025-10-06 |
Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition
2024-Dec-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07408-7
PMID:39730911
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研究论文 | 通过基因组尺度代谢建模识别上皮-间质转化过程中的动态代谢脆弱性 | 整合时间序列转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据,结合机制性计算模型揭示EMT过程中的时间动态代谢依赖关系 | 研究基于TGF-β刺激的细胞培养模型,可能无法完全反映体内EMT过程的复杂性 | 探索上皮-间质转化过程中的代谢网络重编程机制 | 上皮-间质转化过程中的细胞代谢变化 | 计算生物学 | 肺癌 | 基因组尺度代谢建模,时间序列转录组学,时间序列蛋白质组学,单细胞转录组学,CRISPR-Cas9筛选 | 机制性计算模型 | 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞数据 | 多个细胞培养模型的EMT数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |