单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7706 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2024-12-10 |
Harnessing machine learning and multi-omics to explore tumor evolutionary characteristics and the role of AMOTL1 in prostate cancer
2024-Dec-04, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138402
PMID:39643184
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序和批量RNA测序，结合机器学习和多组学分析，开发并验证了肿瘤进化特征预测指标（TECPI），以探索前列腺癌中的肿瘤进化特性和AMOTL1的作用 | 本研究开发了TECPI，该指标在预测前列腺癌进展和指导治疗方面优于传统临床预测指标和其他已发表模型，并展示了其在泛癌中的通用性和适用性 | NA | 探索前列腺癌中的肿瘤进化特性和AMOTL1的作用，并开发新的预测指标以指导个性化精准治疗 | 前列腺癌的肿瘤细胞进化特征和AMOTL1在药物动力学中的作用 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞测序、批量RNA测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | NA |
| 722 | 2024-12-10 |
Unraveling plant-microbe symbioses using single-cell and spatial transcriptomics
2024-Dec, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2024.06.008
PMID:38991926
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研究论文 | 本文讨论了单细胞和空间转录组学技术在研究植物-微生物共生关系中的优势 | 利用单细胞和空间转录组学技术，能够以前所未有的细节水平研究共生相互作用 | 主要限制在于同时捕获植物和微生物转录本的技术挑战 | 探讨新型空间和单细胞转录组学技术在研究植物-微生物内共生关系中的应用 | 植物-微生物共生关系 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 723 | 2024-12-10 |
Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential
2024-Dec, Immunology letters
IF:3.3Q3
DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913
PMID:39233252
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研究论文 | 研究探讨了TRIM在系统性红斑狼疮（SLE）患者循环CD4+T细胞亚群中的表达、功能及其临床相关性 | 发现TRIM+T细胞在SLE患者中减少，并与异常的CD4+T细胞激活相关，具有潜在的临床诊断价值 | NA | 阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞中的表达、功能及其临床意义 | TRIM在人类和小鼠外周血单核细胞（PBMCs）及脾脏CD4+T细胞亚群中的表达 | NA | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 包括SLE患者、健康对照（HCs）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血单核细胞（PBMCs）及小鼠脾脏CD4+T细胞亚群 |
| 724 | 2024-12-10 |
AOPPs induces EMT and fibrosis by activating oxidative stress through ERK/p38 MAPK signaling pathway in endometriosis
2024-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2024.100950
PMID:39241657
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研究论文 | 研究探讨了高级氧化蛋白产物（AOPPs）通过激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导子宫内膜异位症（EMs）中的上皮-间质转化（EMT）和纤维化的机制 | 首次揭示了AOPPs在EMs中通过氧化应激激活ERK/p38 MAPK信号通路诱导EMT和纤维化的机制 | 研究主要基于临床样本、单细胞测序和体内外模型，缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨AOPPs在子宫内膜异位症中诱导EMT和纤维化的分子机制 | 子宫内膜异位症（EMs）中的上皮-间质转化（EMT）和纤维化 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序 | NA | 临床样本 | 使用正常大鼠进行慢性给药研究 |
| 725 | 2024-12-10 |
The relationship between Sjögren's syndrome and recurrent pregnancy loss: a bioinformatics analysis
2024-Dec, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104363
PMID:39299134
|
研究论文 | 研究Sjögren综合征与复发性流产之间的基因关联 | 首次揭示Sjögren综合征与复发性流产共享生物学途径，并鉴定出关键基因KCNN3 | NA | 探讨Sjögren综合征与复发性流产之间的基因关联 | Sjögren综合征和复发性流产的基因数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、limma分析、基因本体论和京都基因与基因组百科全书分析 | NA | 基因表达数据 | 从Gene Expression Omnibus数据库获取的基因数据 |
| 726 | 2024-12-10 |
ATN-161 alleviates caerulein-induced pancreatitis
2024-Dec, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.002
PMID:39396744
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研究论文 | 研究显示ATN-161通过阻断Integrin-α5信号减轻caerulein诱导的急性胰腺炎病理状况 | 首次揭示了ATN-161作为Integrin-α5拮抗剂在减轻急性胰腺炎症状中的治疗潜力 | NA | 探索减轻急性胰腺炎病理状况的药物干预方法 | ATN-161对caerulein诱导的急性胰腺炎的影响 | NA | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 727 | 2024-12-10 |
Targeting cancer-associated fibroblasts with pirfenidone: A novel approach for cancer therapy
2024-Dec, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102624
PMID:39581071
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研究论文 | 本文探讨了使用吡非尼酮靶向癌症相关成纤维细胞（CAFs）作为癌症治疗的新方法 | 本文提出了一种新的癌症治疗方法，通过吡非尼酮靶向CAFs，并结合化疗药物和纳米载体递送系统，以提高疗效和减少副作用 | 尽管吡非尼酮显示出抗肿瘤潜力，但其安全性和有效性仍需通过临床试验进一步验证 | 研究吡非尼酮在癌症治疗中的应用，特别是通过靶向CAFs来抑制癌症进展 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）及其在癌症进展中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 728 | 2024-12-10 |
Endothelial KDM5B Regulated by Piezo1 Contributes to Disturbed Flow Induced Atherosclerotic Plaque Formation
2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70237
PMID:39643939
|
研究论文 | 研究了Piezo1调控的内皮细胞KDM5B在扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的作用 | 首次揭示了Piezo1通过上调KDM5B表达促进动脉粥样硬化斑块形成的机制 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在人体中验证 | 探讨扰流诱导的动脉粥样硬化斑块形成中的表观遗传调控机制 | 内皮细胞中的KDM5B表达及其在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了HUVECs细胞和小鼠模型 |
| 729 | 2024-12-09 |
Statistical and computational methods for enabling the clinical and translational application of spatial transcriptomics
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70119
PMID:39644148
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 730 | 2024-12-10 |
M2 macrophage derived HMOX1 defines chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2024-Dec, Clinical and translational allergy
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/clt2.70014
PMID:39644500
|
研究论文 | 本研究旨在开发与慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）相关的巨噬细胞诊断特征 | 提出了基于M2巨噬细胞来源的HMOX1作为CRSwNP的创新诊断标志物 | NA | 开发与CRSwNP相关的巨噬细胞诊断特征 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者和健康对照组的转录组数据 | NA | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | 诊断模型 | 转录组数据 | 54名CRSwNP患者和37名健康对照组，以及29个验证样本 |
| 731 | 2024-12-10 |
Massively parallel flow-cytometry-based screening of hematopoietic lineage cell populations from up to 25 donors simultaneously
2024-Nov-27, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.014
PMID:39608688
|
研究论文 | 本研究开发了一种方法，能够对来自多达25个供体的造血系细胞群体进行高维度和技术一致性的表面标记筛选 | 本研究提出了一种新的方法，能够在技术一致的情况下对数百万个细胞进行数百个标记的筛选，从而识别和表征稀有群体的变化 | NA | 开发一种方法，能够对造血系细胞进行高维度和技术一致性的表面标记筛选 | 造血系细胞的表面标记 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术 | 机器学习算法 | 细胞 | 多达25个供体的造血系细胞群体 |
| 732 | 2024-12-10 |
Substrate Stiffness Dictates Unique Doxorubicin-induced Senescence-associated Secretory Phenotypes and Transcriptomic Signatures in Human Pulmonary Fibroblasts
2024-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.18.623471
PMID:39605579
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研究论文 | 研究了基质硬度对人类肺成纤维细胞中多柔比星诱导的衰老相关分泌表型和转录组特征的影响 | 首次揭示了基质硬度对细胞衰老和衰老相关分泌表型的影响，并识别了高硬度驱动的独特分泌蛋白谱和转录组特征 | 研究主要集中在体外实验和计算分析，缺乏体内实验验证 | 探讨基质硬度如何影响细胞衰老及其分泌表型 | 人类肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 质谱分析，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质，RNA | 使用了IMR-90细胞系，并在不同硬度的基质上培养，样本数量未明确提及 |
| 733 | 2024-12-10 |
Liver X receptor unlinks intestinal regeneration and tumorigenesis
2024-Nov-20, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08247-6
PMID:39567700
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研究论文 | 本文通过挖掘RNA测序数据和使用药理学、转录组学和遗传学工具，发现肝脏X受体（LXR）通路的激活在肠道损伤模型中调节肠道再生和肿瘤发生 | 首次揭示LXR通路在肠道再生和肿瘤发生之间的平衡作用，并证明LXR激活通过诱导Areg增强再生反应，同时抑制肿瘤生长 | 研究主要基于小鼠模型和人类结直肠癌样本，需要进一步验证在其他物种和癌症类型中的适用性 | 探讨LXR通路在肠道再生和肿瘤发生中的作用机制 | 肝脏X受体（LXR）通路在肠道上皮细胞中的功能及其对再生和肿瘤发生的影响 | 生物医学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA | 两个肠道损伤模型的小鼠样本和人类结直肠癌样本 |
| 734 | 2024-12-10 |
Decoding Functional and Developmental Trajectories of Tissue-Resident Uterine Dendritic Cells Through Integrative Omics
2024-Nov-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5424920/v1
PMID:39606471
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研究论文 | 本文通过综合组学方法解码了组织驻留的子宫树突状细胞的功能和发育轨迹 | 首次通过单细胞RNA测序和CITE-seq技术，揭示了子宫树突状细胞在不同月经周期和早期妊娠阶段的亚型及其功能角色 | 研究主要集中在子宫树突状细胞的功能和发育轨迹，未涉及其在疾病中的具体应用 | 揭示子宫树突状细胞的分子特征及其在人类子宫内膜中的特定作用 | 子宫树突状细胞及其在不同月经周期和早期妊娠阶段的亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | RNA | 涉及不同月经周期和早期妊娠阶段的子宫组织样本 |
| 735 | 2024-12-10 |
Single-cell spatial transcriptomics of fixed, paraffin-embedded biopsies reveals colitis-associated cell networks
2024-Nov-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.11.623014
PMID:39605355
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研究论文 | 本文开发了一种用于分析固定石蜡包埋（FFPE）组织样本的单细胞空间转录组学（iSCST）框架，并应用于炎症性肠病（IBD）患者的临床FFPE黏膜活检样本 | 本文首次将iSCST技术应用于FFPE组织样本，并展示了其在识别和量化不同细胞亚群及疾病状态中的差异表达基因方面的优势 | 本文仅分析了57个FFPE黏膜活检样本，样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 开发一种适用于FFPE组织样本的单细胞空间转录组学框架，并应用于炎症性肠病患者的临床样本分析 | 炎症性肠病（IBD）患者的FFPE黏膜活检样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学（iSCST） | NA | 转录组数据 | 57个FFPE黏膜活检样本，包括9个非IBD对照组和11个溃疡性结肠炎患者 |
| 736 | 2024-12-10 |
The Risk Genes S1PR5, CMC1, and ASAH1 as Potential Targets for the Diagnosis, Immunotherapy, and Treatment of Colon Adenocarcinoma by Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Analysis
2024-11-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞和批量RNA测序数据构建了一个新的免疫细胞功能风险模型，用于预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果 | 本研究首次提出了S1PR5、CMC1和ASAH1作为结肠腺癌的新型治疗靶点，并通过单细胞和批量RNA测序数据验证了其潜在的临床应用价值 | 本研究仅在特定的数据集和临床队列中验证了模型的有效性，未来需要在更多独立队列中进行验证 | 开发新的风险模型以预测结肠腺癌的预后和免疫治疗效果，并发现新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者的预后和免疫治疗效果 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Lasso回归分析 | RNA测序数据 | 使用了来自Tumour Immune Single Cell Hub数据库的COAD单细胞数据集GSE146771，并在多个独立队列中进行了验证 |
| 737 | 2024-12-10 |
Analysis of the heterogeneity and complexity of murine extraorbital lacrimal gland via single-cell RNA sequencing
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.06.005
PMID:38945476
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠眶外泪腺的细胞异质性和复杂性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了小鼠眶外泪腺的细胞多样性，并构建了细胞异质性的图谱 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠的眶外泪腺，未涉及其他物种或组织 | 研究小鼠眶外泪腺的细胞类型和异质性，以了解其对维持眼表健康的作用 | 小鼠眶外泪腺的细胞类型和异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 43,850个高质量细胞 |
| 738 | 2024-12-10 |
The effects of age and dysfunction on meibomian gland population dynamics
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.08.005
PMID:39122180
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研究论文 | 研究使用单细胞和空间转录组学技术探讨了两种小鼠模型中睑板腺功能障碍（MGD）的细胞组成、分化和基因表达变化 | 首次使用单细胞和空间转录组学技术研究睑板腺功能障碍的机制 | 仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 探讨睑板腺功能障碍的细胞和基因表达变化机制 | 野生型小鼠和Awat2敲除小鼠的睑板腺 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 年轻（6个月）和老年（22个月）野生型C57Bl/6小鼠，以及年轻（3个月）和老年（13个月）Awat2敲除小鼠 |
| 739 | 2024-12-10 |
Changes in conjunctival mononuclear phagocytes and suppressive activity of regulatory macrophages in desiccation induced dry eye
2024-Oct, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.09.003
PMID:39306240
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研究论文 | 评估干眼症对结膜免疫细胞数量和转录组特征的影响，特别是单核吞噬细胞 | 首次通过单细胞RNA测序和scATAC-seq技术分析了干眼症对结膜单核吞噬细胞基因表达的影响，并探讨了调节性巨噬细胞在其中的作用 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 研究干眼症对结膜免疫细胞的影响及其基因表达模式 | 结膜免疫细胞，特别是单核吞噬细胞 | NA | 干眼症 | 单细胞RNA测序，scATAC-seq | Monocle 3 | 基因表达数据 | 非应激和干眼症C57BL/6小鼠的结膜免疫细胞 |
| 740 | 2024-12-10 |
Cholinergic Neuronal Activity Promotes Diffuse Midline Glioma Growth through Muscarinic Signaling
2024-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.21.614235
PMID:39386427
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研究论文 | 本文探讨了胆碱能神经元活动通过毒蕈碱信号促进弥漫中线胶质瘤生长的机制 | 首次揭示了中脑胆碱能神经元的长程投射通过M1和M3毒蕈碱受体促进弥漫中线胶质瘤生长的机制 | NA | 研究胆碱能神经元活动对弥漫中线胶质瘤生长的影响及其机制 | 弥漫中线胶质瘤、健康少突胶质前体细胞及其恶性对应物 | NA | 脑瘤 | 光遗传学、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |