单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7637 篇文献，本页显示第 7361 - 7380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7361 | 2024-08-07 |
A single cell RNAseq benchmark experiment embedding "controlled" cancer heterogeneity
2024-Feb-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03002-y
PMID:38307867
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研究论文 | 本文介绍了一个基于10X Genomics平台的单细胞RNA测序实验，通过使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系，创建了一个受控的癌症异质性环境 | 本研究提供了一个全面的框架，用于开发和验证通过单细胞RNA测序分析癌症异质性的方法 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战，特别是细胞注释和肿瘤亚群识别 | 肺癌细胞系，表达七种不同驱动基因（EGFR, ALK, MET, ERBB2, KRAS, BRAF, ROS1） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系 |
| 7362 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03850-x
PMID:38087072
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研究论文 | 本文使用空间转录组学技术研究了养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色局部肌肉变化的细胞异质性 | 研究揭示了红色和黑色肌肉变色中的相似分子机制，并展示了不同样本类型中基因的独特表达模式 | 本研究未提及具体样本量和实验条件的限制 | 研究养殖大西洋鲑鱼肌肉的病理条件和细胞异质性 | 养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色肌肉局部变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7363 | 2024-08-07 |
Correction to: Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03856-5
PMID:38158442
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7364 | 2024-08-07 |
Vitamin D3 reverses immune tolerance and enhances the cytotoxicity of effector T cells in coal pneumoconiosis
2024-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115972
PMID:38218105
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研究论文 | 本研究探讨了维生素D3在煤工尘肺病中调节淋巴细胞功能的作用机制 | 首次揭示了维生素D3通过调节CD4+ T细胞分化和减少调节性T细胞数量，增强CD8+效应T细胞的细胞毒性，从而减轻肺纤维化和症状 | NA | 阐明维生素D3在煤工尘肺病中调节免疫状态的机制 | 煤工尘肺病中的淋巴细胞 | NA | 职业病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 7365 | 2024-08-05 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
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研究论文 | 本研究探讨了果蝇中全新基因的起源、进化和蛋白质结构的变化 | 结合高品质的全基因组比对和计算结构建模方法，识别出555个果蝇特有的全新基因候选者 | 对果蝇中特定族群的研究可能不适用于其他物种 | 研究果蝇中全新基因的起源和结构演变 | 果蝇D. melanogaster的全新基因候选者 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列 | 555个全新基因候选者 |
| 7366 | 2024-08-07 |
Integrative genomic analyses reveal putative cell type-specific targets of the Drosophila ets transcription factor Pointed
2024-Jan-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10017-7
PMID:38262913
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组单细胞和批量数据，识别了果蝇Ets转录因子Pointed的细胞类型特异性潜在靶点 | 首次通过结合染色质免疫沉淀与高通量测序（ChIP-seq）和单细胞基因组学数据（scRNA-seq和snATAC-seq），揭示了157个潜在的细胞类型特异性Pointed靶点及其功能增强子 | NA | 识别果蝇Ets转录因子Pointed的细胞类型特异性潜在靶点，以深入理解由表皮生长因子受体（Egfr）信号调控的复杂发育过程 | 果蝇Ets转录因子Pointed及其在眼盘发育中的作用 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因组数据 | 6,941个基因 |
| 7367 | 2024-08-05 |
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568157
PMID:38045273
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research paper | 该文章研究了肾单位祖细胞在肾脏分支形态发生过程中的自我更新和分化之间的节律性交替 | 创新点在于揭示了肾单位祖细胞的分化与更新之间的节律性模式以及与分支生长的同步关系 | 局限性在于研究主要基于小鼠模型，可能与人类有差异 | 研究肾单位祖细胞在肾脏发育中的动态变化与分支形态发生的关系 | 肾单位祖细胞及其在肾脏发育过程中的角色 | 数字病理 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠和人类干细胞来源的肾单位祖细胞类器官进行实验 |
| 7368 | 2024-08-07 |
FGL2 promotes tumour growth and attenuates infiltration of activated immune cells in melanoma and ovarian cancer models
2024-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-51217-1
PMID:38191799
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研究论文 | 本文研究了FGL2蛋白在黑色素瘤和卵巢癌模型中的作用，发现FGL2抑制免疫细胞的浸润并促进肿瘤生长 | 首次证明了FGL2缺失能增强肿瘤微环境中自然杀伤细胞的活性，并延长生存期 | 研究仅限于两种小鼠癌症模型，未来需在更多癌症类型中验证FGL2的作用 | 探讨FGL2在肿瘤微环境中的作用及其作为癌症治疗靶点的潜力 | FGL2蛋白在黑色素瘤和卵巢癌中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了Fgl2敲除小鼠进行实验 |
| 7369 | 2024-08-05 |
Single Cell Sequencing Technology and Its Application in Alzheimer's Disease
2024, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-230861
PMID:38217599
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综述 | 本文概述了单细胞测序技术及其在阿尔茨海默病中的应用 | 强调了单细胞测序技术在研究阿尔茨海默病复杂性方面的独特优势 | 没有详细探讨具体应用案例和实证数据 | 审视单细胞测序技术在阿尔茨海默病研究中的应用前景 | 单细胞测序技术及其在阿尔茨海默病中的应用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 7370 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of head and neck carcinoma: Transcriptional landscape and prognostic model based on malignant epithelial cell features
2024-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301287RR
PMID:38085162
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析头颈部鳞状细胞癌的转录组特征及预后模型 | 首次揭示头颈部鳞状细胞癌中恶性上皮细胞特征与肿瘤微环境的相互作用，并开发了一种基于六个基因的预后模型 | 研究样本量较小，仅涉及七名患者及其相邻正常组织，可能影响结果的普适性 | 深入理解头颈部鳞状细胞癌肿瘤细胞及其微环境，以改善预后预测 | 七名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及一份相邻正常组织 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 七名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及一份相邻正常组织 |
| 7371 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of epithelial cell and fibroblast cells from non- to metastatic lymph node OTSCC
2024-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301724R
PMID:38169064
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从非转移性到转移性淋巴结的口腔舌鳞状细胞癌（OTSCC）中的上皮细胞和成纤维细胞的异质性 | 发现了四种不同亚型的癌症相关成纤维细胞（CAFs），并确认了GAS和PTN通路在肿瘤转移进展中的作用 | NA | 旨在全面分析癌症相关成纤维细胞和上皮肿瘤细胞亚群在淋巴结转移性OTSCC中的作用 | 口腔舌鳞状细胞癌（OTSCC）中的上皮细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7372 | 2024-08-05 |
Effect of aging on the human myometrium at single-cell resolution
2024-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45143-z
PMID:38296945
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research paper | 本研究构建了来自186,120个细胞的人类子宫肌层老化细胞图谱 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示年龄对人类子宫肌层的影响 | 研究仅限于20名围绝经期和绝经后女性的样本 | 研究衰老对人类子宫肌层功能的影响及其对妊娠和分娩的潜在影响 | 针对围绝经期和绝经后女性的人类子宫肌层细胞进行分析 | NA | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 细胞 | 20名围绝经期和绝经后女性的186,120个细胞 |
| 7373 | 2024-08-07 |
A cell atlas of the larval Aedes aegypti ventral nerve cord
2024-Jan-31, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-023-00178-8
PMID:38297398
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，全面展示了埃及伊蚊幼虫腹神经索（VNC）的细胞组成 | 首次详细描述了埃及伊蚊幼虫VNC中的35种以上细胞类型，并探讨了单胺能和肽能神经元的多样性 | NA | 深入理解影响蚊子宿主寻找行为和病原体传播的发育事件 | 埃及伊蚊幼虫的腹神经索（VNC） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 超过35种VNC细胞类型 |
| 7374 | 2024-08-05 |
scMMT: a multi-use deep learning approach for cell annotation, protein prediction and embedding in single-cell RNA-seq data
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad523
PMID:38300515
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研究论文 | 本文提出了一种名为scMMT的监督学习方法，旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞类型的注释和蛋白质预测的准确性 | 创新点在于开发了一种新的特征提取技术和多任务学习框架，以增强对免疫细胞的识别并减少标签噪声的影响 | 文章未提及具体的样本数量限制或数据集局限性 | 研究旨在提高单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释精度 | 研究对象为单细胞RNA测序数据中的细胞类型和蛋白质表达 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 多任务学习框架 | 公共数据集 | NA |
| 7375 | 2024-08-07 |
NADase CD38 is a key determinant of ovarian aging
2024-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00532-9
PMID:38129670
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研究论文 | 本文通过分析年轻和中老年小鼠不同器官的转录组景观，揭示了卵巢早衰的机制，特别是NADase CD38表达增加和NAD水平下降对卵巢衰老的影响。 | 首次揭示了CD38在卵巢早衰中的关键作用，并提供了通过抑制CD38来改善中老年雌性小鼠生育能力的潜在治疗方法。 | NA | 探讨卵巢早衰的机制并寻找潜在的治疗方法。 | 小鼠的卵巢和其他器官。 | NA | 卵巢早衰 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和中老年小鼠的多个器官 |
| 7376 | 2024-08-05 |
Hyperhomocysteinemia may aggravate abdominal aortic aneurysm formation by up-regulating RASSF2
2024-Mar-10, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.148036
PMID:38036076
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研究论文 | 本研究探讨了高同型半胱氨酸血症通过上调RASSF2可能加重腹主动脉瘤形成的机制 | 揭示了RASSF2和IL-1β作为HHcy介导的腹主动脉瘤形成的潜在靶基因 | 研究主要集中在分子机制的探索，缺乏临床干预的研究 | 阐明高同型半胱氨酸血症加重腹主动脉瘤形成的潜在分子机制 | 腹主动脉瘤及其相关的内皮细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序 | 单细胞RNA测序 | 基因表达数据 | 分析了多组腹主动脉瘤和对照组织样本数据 |
| 7377 | 2024-08-07 |
Network Activity Evaluation Reveals Significant Gene Regulatory Architectures during SARS-CoV-2 Viral Infection from Dynamic scRNA-seq Data
2024-Jan-31, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3360529
PMID:38294926
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研究论文 | 本文提出了一种名为scNAE的单细胞网络活性评估框架，用于评估基因调控网络（GRN）与基因表达谱的一致性，特别是在SARS-CoV-2病毒感染期间的动态scRNA-seq数据 | scNAE框架通过构建带有正则化惩罚项的损失函数和快速收敛的交替方向乘子法，有效解决了GRN推断问题，并能通过排列统计测试程序得出经验P值 | NA | 揭示SARS-CoV-2病毒感染期间的基因活动，特别是在分子水平上的基因调控网络活性 | SARS-CoV-2病毒感染期间的单细胞基因表达数据 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | ODE模型 | 基因表达数据 | NA |
| 7378 | 2024-08-07 |
Multi-omics analysis reveals NNMT as a master metabolic regulator of metastasis in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Jan-30, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00509-w
PMID:38291241
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）淋巴结转移中代谢重编程的关键调控因子NNMT | 首次发现NNMT在ESCC淋巴结转移中的重要作用，并揭示了其通过影响表观遗传修饰调控细胞代谢的机制 | NA | 探索食管鳞状细胞癌淋巴结转移中的代谢变化及其调控机制 | 食管鳞状细胞癌及其淋巴结转移 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、代谢组学 | NA | RNA、代谢物 | ESCC肿瘤组织和淋巴结样本 |
| 7379 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of epithelial, immune, and stromal signatures and interactions in human ovarian cancer
2024-01-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-05826-1
PMID:38278958
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研究论文 | 本文通过分析来自84名卵巢癌患者的超过50万个单细胞转录组数据，研究了卵巢癌中的上皮细胞、免疫细胞和基质细胞及其相互作用 | 发现了具有功能变异的上皮细胞临床亚型特征，以及在IC2阶段显著增加的特定T细胞亚型和具有肿瘤进展相关功能的癌症相关成纤维细胞 | NA | 深入理解卵巢癌进展，并为更好的诊断和治疗开发提供依据 | 卵巢癌中的上皮细胞、免疫细胞和基质细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 84名卵巢癌患者 |
| 7380 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of conventional central chondrosarcoma reveals the role of endoplasmic reticulum stress in malignant transformation
2024-01-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-05790-w
PMID:38267611
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了11个原发性软骨肿瘤及对照组，构建了传统中央型软骨肉瘤的单细胞图谱，揭示了内质网应激在恶性转化中的作用 | 首次通过单细胞图谱揭示了内质网应激在传统中央型软骨肉瘤恶性转化中的作用，并发现NF-κB通路减轻了内质网应激诱导的凋亡 | 研究样本量较小，且仅限于传统中央型软骨肉瘤，可能限制了结果的普遍性 | 探讨软骨肉瘤恶性转化的机制，寻找潜在的诊断标志物和治疗策略 | 传统中央型软骨肉瘤及其恶性转化过程 | 数字病理学 | 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11个原发性软骨肿瘤及对照组 |