单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7508 篇文献，本页显示第 7341 - 7360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7341 | 2024-08-05 |
scIALM: A method for sparse scRNA-seq expression matrix imputation using the Inexact Augmented Lagrange Multiplier with low error
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.027
PMID:38274995
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研究论文 | 提出了一种名为scIALM的方法，用于稀疏单细胞RNA表达矩阵的插补恢复 | 使用不准确的增广拉格朗日乘子法来恢复矩阵中的未知条目，表现出极低的错误率 | 未提供明显的样本量和数据特征的限制 | 旨在改善单细胞RNA测序数据中矩阵的格式，以增强下游分析的准确性 | 原始的稀疏单细胞RNA表达数据矩阵 | 数字路径学 | NA | NA | NA | 矩阵 | 四个数据集 |
| 7342 | 2024-08-07 |
Intracellular and extracellular synergistic therapy for restoring macrophage functions via anti-CD47 antibody-conjugated bifunctional nanoparticles in atherosclerosis
2024-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.024
PMID:38274294
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研究论文 | 本研究开发了一种双功能纳米粒子，通过抗CD47抗体偶联，实现对巨噬细胞功能的细胞内和细胞外协同治疗，用于治疗动脉粥样硬化 | 本研究创新性地使用了双功能纳米粒子，结合抗CD47抗体和NLRP3抑制剂CY-09，实现了对巨噬细胞内外信号的有效调控 | NA | 研究旨在通过调控巨噬细胞功能，有效减少动脉粥样硬化斑块的形成，从而降低心血管疾病的风险 | 研究对象为动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其功能 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 纳米技术 | NA | RNA序列 | 研究使用了Apoe小鼠模型 |
| 7343 | 2024-08-07 |
A multidimensional atlas of human glioblastoma-like organoids reveals highly coordinated molecular networks and effective drugs
2024-Jan-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00500-5
PMID:38273014
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研究论文 | 本研究利用先进的人类胶质母细胞瘤样类器官模型，通过单细胞转录组、DNA甲基化组、代谢组、脂质组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析，全面表征了这些模型，并发现了遗传异质性对功能异质性的影响，以及NF1突变驱动的间质特征。 | 首次全面表征了人类胶质母细胞瘤样类器官模型，并发现了甘油脂质重编程是胶质母细胞瘤的标志，同时基于这些模型提供了基因型基础的药物参考图谱。 | NA | 旨在提供新的人类胶质母细胞瘤模型，并为有效的胶质母细胞瘤治疗提供研究路径。 | 人类胶质母细胞瘤样类器官模型及其分子网络和有效药物。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组、DNA甲基化组、代谢组、脂质组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析 | NA | 多组学数据 | NA |
| 7344 | 2024-08-07 |
Single cell multi-omics of fibrotic kidney reveal epigenetic regulation of antioxidation and apoptosis within proximal tubule
2024-Jan-25, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05118-1
PMID:38270638
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术探讨了纤维化肾脏中近端小管的表观遗传调控机制 | 首次揭示了在纤维化过程中，近端小管中Sod1和Sod2 mRNA表达减少的表观遗传调控机制，并验证了Nfix转录因子促进Ifi27表达与细胞凋亡的关系 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索纤维化肾脏中近端小管的转录动态和表观遗传调控机制 | 纤维化肾脏中的近端小管细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO数据库的数据和人类活检样本 |
| 7345 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Landscape of Longissimus Dorsi in a Newborn Suhuai Pig
2024-Jan-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021204
PMID:38256277
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了新生苏淮猪背最长肌的细胞图谱，并分析了细胞间的相互作用及其在肌肉发育中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了新生苏淮猪背最长肌的细胞组成和细胞间相互作用，并探讨了成纤维脂肪前体细胞的异质性及其在肌肉发育中的潜在作用 | NA | 研究新生苏淮猪背最长肌的细胞组成和细胞间相互作用，以及这些细胞在肌肉发育和肉质控制中的分子特征 | 新生苏淮猪背最长肌的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 16,018个细胞 |
| 7346 | 2024-08-05 |
Harnessing the Stem Cell Niche in Regenerative Medicine: Innovative Avenue to Combat Neurodegenerative Diseases
2024-Jan-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020993
PMID:38256066
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综述 | 该文章探讨了干细胞微环境在再生医学中治疗神经退行性疾病的应用 | 文章整合了关于干细胞微环境的新见解，揭示了调节微环境功能的潜在治疗新方法 | 文章未提及具体的临床试验或数据支持 | 旨在理解干细胞微环境对神经再生和修复的影响 | 研究对象为内源性神经干细胞及其微环境 | 再生医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、类器官技术、微流控技术、人工智能、计算建模、转分化 | NA | NA | NA |
| 7347 | 2024-08-05 |
Establishment and Validation of Novel Prognostic Subtypes in Hepatocellular Carcinoma Based on Bile Acid Metabolism Gene Signatures Using Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020919
PMID:38255993
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研究论文 | 本研究基于胆汁酸代谢基因特征建立并验证了肝细胞癌的预后亚型 | 首次将胆汁酸代谢相关基因与肝细胞癌分类为四种亚型，并提出亚型C2a与更高生存几率相关 | 本研究为初步分析，尚需更多验证研究以阐明胆汁酸代谢与肝癌的具体机制 | 探索胆汁酸代谢在肝细胞癌发生发展中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌样本及其与胆汁酸代谢相关的基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种数据集的肝细胞癌样本 |
| 7348 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Development-Specific Networks at Distinct Synchronized Antral Follicle Sizes in Sheep Oocytes
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020910
PMID:38255985
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研究论文 | 该文章通过单细胞转录组分析揭示了羊卵母细胞不同同步的窦卵泡大小下的发育特异网络 | 为羊卵母细胞在窦卵泡发育过程中的转录组特征提供了全面的描绘，填补了羊卵子发生分子图谱的空白 | 未提及研究的具体限制 | 理解羊卵母细胞的成熟和卵泡发育 | 不同大小的羊卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 (SmartSeq2) | NA | 转录组数据 | 通过不同大小的羊卵母细胞进行分析 |
| 7349 | 2024-08-07 |
Metabolomics, Transcriptome and Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Metabolic Heterogeneity between Oral Cancer Stem Cells and Differentiated Cancer Cells
2024-Jan-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16020237
PMID:38254728
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研究论文 | 本研究通过代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序分析，探讨口腔癌干细胞与分化癌细胞之间的代谢异质性 | 首次综合运用代谢组学、转录组学和单细胞RNA测序技术，深入分析口腔癌干细胞与分化癌细胞的代谢差异 | 研究仅限于细胞系和多细胞肿瘤球体模型，未涉及更多临床样本 | 理解癌干细胞的独特代谢特征，以应对与之相关的临床挑战 | 口腔癌干细胞与分化癌细胞的代谢特征 | 数字病理学 | 口腔癌 | 代谢组学、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 代谢物、基因表达数据 | 使用CAL27和HSC3细胞系及六个口腔癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 7350 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Alterations in Patient Immune Cells with Pulmonary Long COVID-19 Complications
2024-Jan-02, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb46010029
PMID:38248331
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了患有长期COVID-19并发症患者的免疫细胞变化 | 首次详细分析了长期COVID-19患者免疫细胞的动态变化，特别是幼稚中性粒细胞和CD8+ NKT样细胞的增加 | 研究样本量较小，仅包括一名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入研究长期COVID-19患者的免疫景观 | 长期COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 一名71岁COVID-19患者及对照组 |
| 7351 | 2024-08-07 |
Correction to 'Probabilistic cell/domain-type assignment of spatial transcriptomics data with SpatialAnno'
2024-Jan-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1229
PMID:38109292
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7352 | 2024-08-07 |
InClust+: the deep generative framework with mask modules for multimodal data integration, imputation, and cross-modal generation
2024-Jan-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05656-2
PMID:38267858
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研究论文 | 本文介绍了inClust+，一个用于多组学数据整合、插补和跨模态生成的深度生成框架，该框架通过增加两个掩码模块来增强其处理多模态数据的能力 | inClust+框架引入了输入掩码模块和输出掩码模块，专门设计用于处理多模态数据，提高了数据整合和跨模态生成的效率 | NA | 开发一种能够有效整合和处理多模态数据的计算方法 | 单细胞技术产生的多组学数据，包括基因表达、染色质可及性和蛋白质丰度等 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 生成对抗网络（GAN） | 多模态数据 | 涉及多种类型的单细胞数据集，包括scRNA-seq、MERFISH和CITE-seq数据 |
| 7353 | 2024-08-05 |
A novel protein encoded by circKANSL1L regulates skeletal myogenesis via the Akt-FoxO3 signaling axis
2024-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.128609
PMID:38056741
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研究论文 | 该文章报道了一种新型蛋白质circKANSL1L在骨骼肌生成中的作用 | 发现了由circKANSL1L编码的新型蛋白质及其在肌生成中的潜在功能 | 研究主要集中在猪的肌肉，可能不适用于其他物种 | 探究circKANSL1L如何通过Akt-FoxO3信号通路调控骨骼肌生成 | Lantang和Landrace猪的长背肌肉样本 | 数字病理学 | NA | circRNAome-seq和Ribo-seq | NA | 代谢组学和单细胞转录组学数据 | 来自Lantang和Landrace小猪的长背肌肉样本 |
| 7354 | 2024-08-05 |
Cellular and molecular mechanisms of highly active mesenchymal stem cells in the treatment of senescence of rhesus monkey ovary
2024-01-08, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03631-x
PMID:38191526
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研究论文 | 这篇文章研究了高活性间充质干细胞在猴子卵巢抗衰老中的细胞和分子机制 | 这项研究首次揭示了高活性间充质干细胞对卵巢衰老的多种细胞和分子机制 | 该研究主要在猕猴卵巢进行，可能无法直接推广到人类 | 探讨高活性间充质干细胞在猴子卵巢衰老治疗中的作用机制 | 猕猴卵巢的老化细胞群和高活性间充质干细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单核转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了不说明数量的猕猴卵巢样本和高活性间充质干细胞 |
| 7355 | 2024-08-07 |
Comparative single-cell analysis reveals heterogeneous immune landscapes in adenocarcinoma of the esophagogastric junction and gastric adenocarcinoma
2024-01-05, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06388-6
PMID:38182569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了食管胃结合部腺癌（AEG）和胃腺癌（GAC）的肿瘤微环境（TME），揭示了AEG中异质性恶性细胞和肿瘤相关成纤维细胞（CAFs）的特征 | 首次全面解析了AEG的TME，识别了具有多样生物功能和内在恶性特性的异质性AEG恶性细胞，并揭示了AEG中T细胞的转录特征和TCR谱系 | NA | 旨在深入理解食管胃结合部腺癌（AEG）的肿瘤微环境（TME） | 食管胃结合部腺癌（AEG）和胃腺癌（GAC）的肿瘤和邻近正常组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 四名AEG患者和公开的GAC单细胞数据集 |
| 7356 | 2024-08-05 |
Time-resolved single-cell transcriptomics defines immune trajectories in glioblastoma
2024-01-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.11.032
PMID:38134933
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研究论文 | 此研究介绍了一种新技术Zman-seq，该技术记录了胶质母细胞瘤中免疫细胞的转录动态。 | Zman-seq技术引入时间戳以捕获单细胞转录组学动态，解决了当前缺乏能够记录细胞动态变化的体内基因组技术的问题 | NA | 本研究旨在揭示胶质母细胞瘤中的免疫适应过程中的细胞状态转变 | 研究对象为在胶质母细胞瘤微环境中变化的免疫细胞，特别是细胞毒性自然杀伤细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | Zman-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 7357 | 2024-08-07 |
CD317+ MSCs expanded with chemically defined media have enhanced immunological anti-inflammatory activities
2024-01-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03618-8
PMID:38169422
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研究论文 | 本研究探讨了使用化学定义培养基扩增的CD317+ MSCs在免疫抗炎活性方面的增强作用 | 发现CD317+ MSCs具有改善的分化能力和增强的免疫抑制活性，其抗炎功能增强与TSG6水平升高有关 | 研究主要集中在体外和体内实验，临床应用的实际效果和安全性需要进一步验证 | 探索MSCs在治疗免疫相关疾病中的应用潜力 | CD317+ MSCs及其在免疫抗炎活性中的作用 | 细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自脐带的MSCs样本 |
| 7358 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of peripheral blood mononuclear cells indicates impaired immune and inflammatory responses in alcohol-associated hepatitis
2024-Jan, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2023.110735
PMID:38040543
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研究论文 | 这篇文章探讨了酒精相关肝炎中外周血单核细胞的单细胞转录组学，揭示了免疫和炎症反应受损的情况 | 利用单细胞RNA测序技术，文章首次表明酒精相关肝炎患者PBMC的特定亚型在免疫和炎症反应中涉及不同机制 | 由于样本复杂性和异质性，可能无法完全揭示所有潜在的分子机制 | 旨在更好地理解酒精相关肝炎患者的系统免疫反应 | 研究对象为酒精相关肝炎患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 酒精相关肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 外周血单核细胞样本 |
| 7359 | 2024-08-07 |
Increased expression of CXCL6 in secretory cells drives fibroblast collagen synthesis and is associated with increased mortality in idiopathic pulmonary fibrosis
2024-01, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00088-2023
PMID:37918852
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研究论文 | 本研究探讨了在特发性肺纤维化（IPF）中，气道上皮细胞表达的趋化因子CXCL6对纤维母细胞胶原蛋白合成的影响及其与患者生存率的关系 | 发现CXCL6在IPF患者的远端肺部气道上皮细胞中表达增加，并与患者的不良生存率相关 | NA | 探究趋化因子CXCL6在特发性肺纤维化中的作用及其对患者生存率的影响 | 特发性肺纤维化患者的肺部组织和纤维母细胞 | NA | 肺纤维化 | 转录组学分析、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、蛋白质水平数据 | 179名特发性肺纤维化患者 |
| 7360 | 2024-08-07 |
Unraveling dedifferentiation and metastasis traces in pancreatic ductal adenocarcinoma ductal cells: Insights from single-cell RNA sequencing analysis of ITGB4 and C19orf33
2024-Jan, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2023.155012
PMID:38071887
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了胰腺导管腺癌（PDAC）中ITGB4和C19orf33基因的表达模式，揭示了这些基因在肿瘤发生和转移中的潜在作用 | 首次发现ITGB4和C19orf33在PDAC样本中具有差异表达，并且它们的表达模式与肿瘤的转移机制相关 | 研究仅限于特定的细胞系和化疗药物处理，可能需要进一步的临床样本验证 | 探讨胰腺导管腺癌中ITGB4和C19orf33基因的表达及其在肿瘤发生和转移中的作用 | 胰腺导管腺癌的导管细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及MIA PaCa-2和PANC-1两种胰腺导管腺癌细胞系，以及PDAC样本与邻近正常组织的比较 |