单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7524 篇文献，本页显示第 7341 - 7360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7341 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the underlying mechanism of folliculotropism in folliculotropic mycosis fungoides
2024-Jan, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14992
PMID:38284188
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7342 | 2024-08-07 |
Bioengineered hydrogels enhance ex vivo preservation of patient-derived tumor explants for drug evaluation
2024-Mar, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文展示了生物工程水凝胶如何通过识别关键的基质参数，显著提高患者来源肿瘤组织切片（PDTS）的体外存活率，并维持肿瘤微环境中的细胞间通讯网络。 | 利用生物工程水凝胶增强PDTS的存活率，并维持肿瘤微环境中的细胞组成和细胞间通讯网络。 | NA | 研究如何通过生物工程水凝胶提高患者来源肿瘤组织切片在体外培养中的存活率，并维持其生物学特性。 | 患者来源的肿瘤组织切片（PDTS）及其在体外培养中的存活率和生物学特性。 | 生物工程 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，高维流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 7343 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals keratinocyte subpopulations contributing to psoriasis in corneum and granular layer
2024-Feb, Skin research and technology : official journal of International Society for Bioengineering and the Skin (ISBS) [and] International Society for Digital Imaging of Skin (ISDIS) [and] International Society for Skin Imaging (ISSI)
IF:2.0Q3
DOI:10.1111/srt.13572
PMID:38279596
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了角质形成细胞亚群在银屑病发病中的作用及其分子机制 | 首次详细描述了角质形成细胞在银屑病中的特定亚群及其相关的信号通路 | NA | 揭示与银屑病相关的角质形成细胞亚群及其分子机制 | 正常和银屑病皮肤组织中的角质形成细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 正常和银屑病皮肤组织的单细胞转录组数据 |
| 7344 | 2024-08-07 |
The activator protein-1 complex governs a vascular degenerative transcriptional programme in smooth muscle cells to trigger aortic dissection and rupture
2024-Jan-27, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehad534
PMID:37992083
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研究论文 | 本文研究了激活蛋白-1复合体在平滑肌细胞中调控血管退行性转录程序，从而触发主动脉夹层和破裂的机制 | 首次揭示了激活蛋白-1复合体在主动脉夹层发展中的动态作用，并提出了通过调节肿瘤坏死因子-氧化磷酸化-激活蛋白-1轴来干预主动脉重塑的新策略 | 研究主要基于单细胞RNA测序和动物模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨激活蛋白-1复合体在主动脉夹层中的作用机制，并寻找潜在的治疗干预策略 | 主动脉夹层患者和心脏移植患者的升主动脉组织，以及平滑肌细胞 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组 | 9名升主动脉置换患者和5名心脏移植患者的升主动脉组织，以及93,397个细胞 |
| 7345 | 2024-08-05 |
Glomerular spatial transcriptomics of IgA nephropathy according to the presence of mesangial proliferation
2024-01-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52581-8
PMID:38278877
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研究论文 | 本研究探讨了根据系膜增生的存在，IgA肾病（IgAN）肾小球的基因表达谱 | 使用空间特异性转录组分析，揭示了M1-IgAN与对照之间基因表达的显著差异 | 研究仅涵盖了12个病例，且各病例仅分析了三个肾小球 | 研究IgAN中系膜增生对肾小球基因表达的影响 | IgAN患者及供体控制样本的肾小球组织 | 数字病理学 | 肾病 | GeoMx数字空间分析 | NA | 基因表达数据 | 12个病例，分析每个病例的3个肾小球 |
| 7346 | 2024-08-07 |
Multi-omics reveals the role of ENO1 in bladder cancer and constructs an epithelial-related prognostic model to predict prognosis and efficacy
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52573-8
PMID:38273010
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研究论文 | 研究探讨ENO1在膀胱癌中的作用，并通过多组学分析构建了一个与上皮细胞相关的预测模型，用于预测膀胱癌的预后和治疗反应 | 通过多组学分析揭示了ENO1在膀胱癌中的高表达及其与不良预后、CD8+ T细胞耗竭和上皮异质性的关联，并构建了一个新的预测模型 | NA | 探索ENO1在膀胱癌中的作用，并构建一个预测膀胱癌预后和治疗反应的模型 | ENO1在膀胱癌中的表达及其对预后和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | IHC, RNA-seq, scRNA-seq | LASSO分析 | 组织样本, 细胞样本 | 249个关键基因 |
| 7347 | 2024-08-07 |
Identification of gene signatures and molecular mechanisms underlying the mutual exclusion between psoriasis and leprosy
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52783-0
PMID:38273053
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研究论文 | 本研究旨在揭示牛皮癣和麻风病相互排斥的分子机制，通过分析差异表达基因和富集分析，识别出关键的相互排斥基因并探讨其与免疫细胞浸润的关系。 | 本研究首次识别出APOE, CYP27A1, 和SOAT1作为牛皮癣和麻风病相互排斥的关键基因，并通过胆固醇代谢途径解释了两者之间的负相关机制。 | 本研究主要基于数据库中的数据进行分析，未来需要更多的实验验证和临床数据支持。 | 揭示牛皮癣和麻风病相互排斥的分子机制 | 牛皮癣和麻风病的差异表达基因及相互排斥机制 | NA | 牛皮癣, 麻风病 | DEseq2, 单样本基因集富集分析 (ssGSEA) | 蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络 | 基因表达数据 | 1098个差异表达基因在麻风病数据集中，3839个差异表达基因在牛皮癣数据集中 |
| 7348 | 2024-08-07 |
Exploring Immune Cell Diversity in the Lacrimal Glands of Healthy Mice: A Single-Cell RNA-Sequencing Atlas
2024-Jan-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021208
PMID:38279208
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学分析，探索了正常小鼠泪腺中的免疫细胞多样性及其分子特征 | 首次详细描述了泪腺中18种不同细胞簇和26种免疫细胞亚群的多样性及其细胞间相互作用 | NA | 深入了解泪腺中的免疫系统及其与相关疾病的关系 | 小鼠泪腺中的免疫细胞及其分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类 | 细胞 | 34,891个细胞 |
| 7349 | 2024-08-05 |
Application of Single-Cell Sequencing Technology in Research on Colorectal Cancer
2024-Jan-18, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm14010108
PMID:38248808
|
综述 | 本文概述了单细胞测序技术在结直肠癌研究中的应用 | 文章聚焦于单细胞测序在揭示肿瘤异质性和新药靶点方面的创新应用 | NA | 加强对结直肠癌发展和肿瘤微环境的理解 | 结直肠癌的肿瘤异质性、循环肿瘤细胞及新药靶点 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和表观遗传数据 | NA |
| 7350 | 2024-08-05 |
Integrating TCGA and Single-Cell Sequencing Data for Hepatocellular Carcinoma: A Novel Glycosylation (GLY)/Tumor Microenvironment (TME) Classifier to Predict Prognosis and Immunotherapy Response
2024-Jan-13, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14010051
PMID:38248854
|
研究论文 | 该研究开发了一种基于糖基化相关基因和肿瘤微环境评分的分类器，用于改善肝细胞癌的预后预测和免疫治疗反应 | 提出了一个新的糖基化/肿瘤微环境分类器，能够更好地预测临床结果 | 对驱动肿瘤微环境中免疫细胞变异的分子途径了解不足 | 旨在通过开发GLY/TME分类器来改善肝细胞癌的预后预测 | 研究肝细胞癌中的糖基化相关基因与肿瘤微环境的关系 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | 分类器 | 基因表达数据 | NA |
| 7351 | 2024-08-05 |
Single-cell data revealed CD14-type and FCGR3A-type macrophages and relevant prognostic factors for predicting immunotherapy and prognosis in stomach adenocarcinoma
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16776
PMID:38274323
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序技术识别了胃腺癌中的关键细胞类型和相关预后因子 | 研究首次构建了用于预测胃腺癌患者免疫疗法反应和预后的单细胞图谱及风险评分模型 | 研究结果基于单细胞数据和公共数据库，可能存在样本偏倚和外部验证不足 | 探讨胃腺癌中的细胞异质性及其与免疫疗法和预后的相关性 | 胃腺癌患者的单细胞数据及免疫微环境中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO COX模型 | 基因表达数据 | 涉及的样本数量在700个以上的巨噬细胞亚群和其他细胞类型 |
| 7352 | 2024-08-05 |
scSID: A lightweight algorithm for identifying rare cell types by capturing differential expression from single-cell sequencing data
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.043
PMID:38274993
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研究论文 | 提出了一种单细胞相似性划分算法(scSID)用于识别稀有细胞类型 | scSID通过分析细胞间和细胞内的相似性，捕捉稀有细胞类型的相似性差异 | 未提及具体的局限性 | 识别稀有细胞类型并改善现有识别方法 | 稀有细胞类型的识别 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 数据集 | 多个数据集，包括68K PBMC和肠道样本 |
| 7353 | 2024-08-05 |
scIALM: A method for sparse scRNA-seq expression matrix imputation using the Inexact Augmented Lagrange Multiplier with low error
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.12.027
PMID:38274995
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研究论文 | 提出了一种名为scIALM的方法，用于稀疏单细胞RNA表达矩阵的插补恢复 | 使用不准确的增广拉格朗日乘子法来恢复矩阵中的未知条目，表现出极低的错误率 | 未提供明显的样本量和数据特征的限制 | 旨在改善单细胞RNA测序数据中矩阵的格式，以增强下游分析的准确性 | 原始的稀疏单细胞RNA表达数据矩阵 | 数字路径学 | NA | NA | NA | 矩阵 | 四个数据集 |
| 7354 | 2024-08-07 |
Intracellular and extracellular synergistic therapy for restoring macrophage functions via anti-CD47 antibody-conjugated bifunctional nanoparticles in atherosclerosis
2024-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.12.024
PMID:38274294
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研究论文 | 本研究开发了一种双功能纳米粒子，通过抗CD47抗体偶联，实现对巨噬细胞功能的细胞内和细胞外协同治疗，用于治疗动脉粥样硬化 | 本研究创新性地使用了双功能纳米粒子，结合抗CD47抗体和NLRP3抑制剂CY-09，实现了对巨噬细胞内外信号的有效调控 | NA | 研究旨在通过调控巨噬细胞功能，有效减少动脉粥样硬化斑块的形成，从而降低心血管疾病的风险 | 研究对象为动脉粥样硬化中的巨噬细胞及其功能 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 纳米技术 | NA | RNA序列 | 研究使用了Apoe小鼠模型 |
| 7355 | 2024-08-07 |
A multidimensional atlas of human glioblastoma-like organoids reveals highly coordinated molecular networks and effective drugs
2024-Jan-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00500-5
PMID:38273014
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研究论文 | 本研究利用先进的人类胶质母细胞瘤样类器官模型，通过单细胞转录组、DNA甲基化组、代谢组、脂质组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析，全面表征了这些模型，并发现了遗传异质性对功能异质性的影响，以及NF1突变驱动的间质特征。 | 首次全面表征了人类胶质母细胞瘤样类器官模型，并发现了甘油脂质重编程是胶质母细胞瘤的标志，同时基于这些模型提供了基因型基础的药物参考图谱。 | NA | 旨在提供新的人类胶质母细胞瘤模型，并为有效的胶质母细胞瘤治疗提供研究路径。 | 人类胶质母细胞瘤样类器官模型及其分子网络和有效药物。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组、DNA甲基化组、代谢组、脂质组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析 | NA | 多组学数据 | NA |
| 7356 | 2024-08-07 |
Single cell multi-omics of fibrotic kidney reveal epigenetic regulation of antioxidation and apoptosis within proximal tubule
2024-Jan-25, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05118-1
PMID:38270638
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术探讨了纤维化肾脏中近端小管的表观遗传调控机制 | 首次揭示了在纤维化过程中，近端小管中Sod1和Sod2 mRNA表达减少的表观遗传调控机制，并验证了Nfix转录因子促进Ifi27表达与细胞凋亡的关系 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索纤维化肾脏中近端小管的转录动态和表观遗传调控机制 | 纤维化肾脏中的近端小管细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用来自GEO数据库的数据和人类活检样本 |
| 7357 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Landscape of Longissimus Dorsi in a Newborn Suhuai Pig
2024-Jan-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021204
PMID:38256277
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了新生苏淮猪背最长肌的细胞图谱，并分析了细胞间的相互作用及其在肌肉发育中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了新生苏淮猪背最长肌的细胞组成和细胞间相互作用，并探讨了成纤维脂肪前体细胞的异质性及其在肌肉发育中的潜在作用 | NA | 研究新生苏淮猪背最长肌的细胞组成和细胞间相互作用，以及这些细胞在肌肉发育和肉质控制中的分子特征 | 新生苏淮猪背最长肌的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 16,018个细胞 |
| 7358 | 2024-08-05 |
Harnessing the Stem Cell Niche in Regenerative Medicine: Innovative Avenue to Combat Neurodegenerative Diseases
2024-Jan-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020993
PMID:38256066
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综述 | 该文章探讨了干细胞微环境在再生医学中治疗神经退行性疾病的应用 | 文章整合了关于干细胞微环境的新见解，揭示了调节微环境功能的潜在治疗新方法 | 文章未提及具体的临床试验或数据支持 | 旨在理解干细胞微环境对神经再生和修复的影响 | 研究对象为内源性神经干细胞及其微环境 | 再生医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、类器官技术、微流控技术、人工智能、计算建模、转分化 | NA | NA | NA |
| 7359 | 2024-08-05 |
Establishment and Validation of Novel Prognostic Subtypes in Hepatocellular Carcinoma Based on Bile Acid Metabolism Gene Signatures Using Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020919
PMID:38255993
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研究论文 | 本研究基于胆汁酸代谢基因特征建立并验证了肝细胞癌的预后亚型 | 首次将胆汁酸代谢相关基因与肝细胞癌分类为四种亚型，并提出亚型C2a与更高生存几率相关 | 本研究为初步分析，尚需更多验证研究以阐明胆汁酸代谢与肝癌的具体机制 | 探索胆汁酸代谢在肝细胞癌发生发展中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌样本及其与胆汁酸代谢相关的基因 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含多种数据集的肝细胞癌样本 |
| 7360 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Development-Specific Networks at Distinct Synchronized Antral Follicle Sizes in Sheep Oocytes
2024-Jan-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25020910
PMID:38255985
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研究论文 | 该文章通过单细胞转录组分析揭示了羊卵母细胞不同同步的窦卵泡大小下的发育特异网络 | 为羊卵母细胞在窦卵泡发育过程中的转录组特征提供了全面的描绘，填补了羊卵子发生分子图谱的空白 | 未提及研究的具体限制 | 理解羊卵母细胞的成熟和卵泡发育 | 不同大小的羊卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 (SmartSeq2) | NA | 转录组数据 | 通过不同大小的羊卵母细胞进行分析 |