单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7637 篇文献，本页显示第 7341 - 7360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7341 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal critical regulators of spermatogonial stem cell fate transitions
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10072-0
PMID:38310206
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了精原干细胞命运转变的关键调控因子 | 本研究首次描述了静止状态的精原干细胞亚群，即Eomes+精原细胞，并提供了精原干细胞命运决定的动态转录图谱 | NA | 探索未分化精原细胞亚群的分子特征和关键调控因子 | 精原干细胞及其前体细胞的命运转变 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 从小鼠中分离的未分化精原细胞 |
| 7342 | 2024-08-05 |
Comparison of preparation methods of rat kidney single-cell suspensions
2024-02-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53270-2
PMID:38307992
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研究论文 | 本文探讨了一种名为逐步酶消化（StE）的方法以制备大鼠整个肾脏组织的单细胞悬液。 | StE方法在收获率、单细胞率和细胞活性方面优于传统的机械研磨法和简单酶消化法。 | 文章没有提到本文方法的临床应用或长期效果的评估。 | 研究旨在提高大鼠肾脏单细胞悬液的制备效率与质量。 | 研究对象为大鼠的整个肾脏组织。 | 数字病理学 | NA | 酶消化 | NA | NA | NA |
| 7343 | 2024-08-05 |
Analysis of brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2024-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01711-x
PMID:38177281
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研究论文 | 本研究探讨了缺血性中风后脑部和血液单细胞转录组学的变化 | 首次揭示了缺血性中风后微胶质细胞、单核细胞来源的巨噬细胞和中性粒细胞的时间动态和多样性 | 对外周白细胞和脑内常驻细胞的具体动态变化尚不够了解 | 研究缺血性中风后脑细胞和血细胞的转录组动态 | 小鼠在缺血性中风后2天和14天的脑和血液细胞 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本，具体数量未提供 |
| 7344 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of cellular heterogeneity and immune mechanisms in neurodegenerative diseases
2024-Feb, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16242
PMID:38221677
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综述 | 本文章主要分析了单细胞转录组学在神经退行性疾病中的细胞异质性和免疫机制方面的应用 | 强调了单细胞转录组技术在揭示神经退行性疾病中细胞异质性和免疫机制方面的重要性 | 未明确提及具体的实验研究或数据支持 | 探讨神经退行性疾病的发病机制及开发新的治疗方法 | 神经退行性疾病中的单细胞转录组和免疫细胞 | 数字病理 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7345 | 2024-08-07 |
Partners in Crime: Inferring Cell-to-cell Interactions in Kidney Allograft Rejection From Single-cell RNA Sequencing
2024-Feb-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004763
PMID:37638872
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7346 | 2024-08-07 |
Association of HBsAg levels with differential gene expression in NK, CD8 T, and memory B cells in treated patients with chronic HBV
2024-Feb, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100980
PMID:38314025
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研究论文 | 本研究探讨了在慢性HBV感染治疗过程中，循环HBsAg水平对NK、CD8 T和记忆B细胞基因表达的影响。 | 首次发现HBsAg对NK、CD8 T和记忆B细胞亚群在血液和肝脏中有特定影响。 | 研究样本量较小，且仅限于接受NUC治疗的慢性HBV感染患者。 | 旨在研究高和低循环HBsAg水平对免疫调节的影响，以增进对HBV免疫反应的理解。 | 慢性HBV感染治疗中的NK、CD8 T和记忆B细胞。 | 免疫学 | 肝炎 | 10x Genomics单细胞RNA测序 | NA | RNA | 18名接受tenofovir/entecavir治疗的慢性HBV感染患者 |
| 7347 | 2024-08-05 |
The molecular mechanism of "Dahuang-Shengjiang-Banxia decoction" in the treatment of diabetic kidney disease was verified based on network pharmacology and molecular docking
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24776
PMID:38312712
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研究论文 | 探索大黄生姜半夏汤在糖尿病肾病中的分子机制 | 利用网络药理学和分子对接技术，揭示了大黄生姜半夏汤对糖尿病肾病的多成分、多途径和多靶点效应 | 未提及具体的临床试验数据支持所述结果 | 研究大黄生姜半夏汤治疗糖尿病肾病的分子机制 | 大黄生姜半夏汤及其在糖尿病肾病中的有效成分和靶点 | 数字药理学 | 糖尿病肾病 | 网络药理学、分子对接 | NA | 靶点数据、成分数据 | 共筛选出177种大黄生姜半夏汤成分和2906种糖尿病肾病靶点 |
| 7348 | 2024-08-07 |
Taste receptor type 1 member 3 is required for the fertility of male mice
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24577
PMID:38312691
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research paper | 本文研究了味觉受体类型1成员3（TAS1R3）在雄性小鼠生育中的作用 | 首次揭示了TAS1R3通过PKA/CREB/StAR信号通路在雄性生育中的关键作用 | NA | 探究TAS1R3对雄性小鼠生殖功能的影响 | 野生型和敲除（KO）小鼠 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型和敲除小鼠 |
| 7349 | 2024-08-07 |
Integrated scRNAseq analyses of mouse cochlear supporting cells reveal the involvement of Ezh2 in hair cell regeneration
2024-Jan-28, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-023-09173-y
PMID:38281217
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研究论文 | 本研究通过综合分析小鼠耳蜗支持细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了Ezh2在毛细胞再生中的作用 | 本研究首次揭示了Ezh2在小鼠耳蜗毛细胞再生中的潜在作用，并通过基因集富集分析确定了Notch信号通路基因在出生后阶段的下调 | NA | 旨在更好地理解小鼠耳蜗毛细胞再生的分子基础 | 小鼠耳蜗的支持细胞和毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从E14到P33的小鼠耳蜗单细胞RNA测序数据 |
| 7350 | 2024-08-05 |
Cebp1 and Cebpβ transcriptional axis controls eosinophilopoiesis in zebrafish
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45029-0
PMID:38280871
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研究论文 | 本研究分析了斑马鱼中嗜酸性粒细胞的分化、分布和调节 | 建立了一个特异性标记嗜酸性粒细胞谱系的斑马鱼报告线，并揭示了Cebp1和Cebpβ转录轴在嗜酸性粒细胞分化中的作用 | 未明确提到本研究的限制 | 研究嗜酸性粒细胞的发育模式和调节机制 | 斑马鱼嗜酸性粒细胞谱系及其发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了特异性标记的嗜酸性粒细胞谱系细胞 |
| 7351 | 2024-08-05 |
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) deletion in myeloid cells augments cholestatic liver injury
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52710-3
PMID:38273071
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体(TRAIL)在骨髓细胞中的缺失如何加重胆汁淤积性肝损伤。 | 研究发现TRAIL源自招募的巨噬细胞，并抑制DR细胞扩展，从而限制胆汁淤积性肝损伤。 | 本文并未涉及湿剂量的不同或不同动物模型的比较，可能限制了其结果的广泛适用性。 | 研究TRAIL在骨髓细胞中的作用及其在胆汁淤积性肝损伤中的影响。 | 涉及Wild type (WT)、Trail和骨髓特异性Trail缺失的小鼠模型。 | 数字病理学 | 肝病 | 高维量子显微技术，空间转录组分析 | 小鼠模型 | 生物样本 | 包括Wild type、Trail和Trail缺失小鼠的多组小鼠 |
| 7352 | 2024-08-05 |
scCAN: Clustering With Adaptive Neighbor-Based Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data
2024 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3337231
PMID:38285569
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研究论文 | 提出了一种新的适应性邻域聚类基础的缺失值插补方法scCAN，用于单细胞RNA测序数据 | 本研究创新性地设计了一个方法，通过不断更新细胞相似性信息来改善缺失值的插补 | 未提及具体的局限性 | 研究单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 使用模拟和真实单细胞RNA测序数据进行研究 | 计算机视觉 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 四个模拟和八个真实的单细胞RNA-seq数据 |
| 7353 | 2024-08-05 |
Presence of onco-fetal neighborhoods in hepatocellular carcinoma is associated with relapse and response to immunotherapy
2024-Jan, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00672-2
PMID:38168935
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中的肿瘤生态系统的癌胎编程及其与免疫治疗反应和复发的关系 | 首次提出POSTN外源性基质癌相关成纤维细胞作为关键的癌胎相互作用中心，并探讨其在肝细胞癌复发和免疫治疗反应中的影响 | 未明确阐述样本量与研究设计的具体限制 | 研究肝细胞癌中的癌胎邻域与复发及免疫治疗反应的关系 | 研究特定细胞亚群，包括POSTN CAFs、FOLR2巨噬细胞和PLVAP内皮细胞在肝细胞癌复发和免疫治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、整体RNA测序 | NA | NA | NA |
| 7354 | 2024-08-05 |
An emerging biomarker for the diagnosis and treatment of esophageal squamous cell carcinoma - Aurora A
2024-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107759
PMID:38043467
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研究论文 | 研究表明Aurora A在食管鳞状细胞癌中是一种潜在的预后和治疗生物标志物 | 本研究首次揭示了Aurora A在食管鳞状细胞癌中的作用及其对细胞增殖和药物敏感性的影响 | 本研究仅基于公共数据库的数据，可能存在数据集的局限性 | 探讨Aurora A在食管鳞状细胞癌中的分子机制及其作为生物标志物的潜力 | 研究对象为食管鳞状细胞癌患者的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA-seq | NA | 文本 | 来自公共数据库的RNA-seq数据集，具体样本量未明确提供 |
| 7355 | 2024-08-07 |
Genetic variants in BCL-2 family genes influence the risk of non-syndromic cleft lip with or without cleft palate
2024-Jan, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2288
PMID:38108593
|
研究论文 | 本研究探讨了BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险之间的关联 | 发现了位于增强子区域的rs3943258与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂的风险相关，并表现出BCL2的eQTL效应 | NA | 研究BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险之间的关联 | BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险 | 遗传学 | 口腔疾病 | 多标记基因组注释的多标记分析（Multi-marker Analysis of GenoMic Annotation）、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因组数据、RNA测序数据 | 第一阶段队列包括565例病例和1269例对照，候选SNPs通过额外的dbGaP病例-父母三联体进行复制 |
| 7356 | 2024-08-07 |
Gclc as a Marker for Injured Distal Nephron in Ischemia-Reperfusion Induced Acute Kidney Injury
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S451402
PMID:38313210
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转录组学分析，探讨了缺血-再灌注诱导的急性肾损伤中远端肾小管的作用，并验证了Gclc作为损伤远端肾小管的潜在标志物。 | 首次识别了LOH-Inj和DCT-Inj亚型，并发现Gclc在多种急性肾损伤模型中的高表达，特别是在损伤的远端肾小管中。 | NA | 理解远端肾小管在急性肾损伤中的作用，并识别损伤远端肾小管的标志物，以揭示肾脏损伤机制并寻找新的治疗靶点。 | 远端肾小管在急性肾损伤中的作用及损伤标志物Gclc。 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了缺血-再灌注、单侧输尿管阻塞、顺铂、草酸钠和脂多糖诱导的AKI小鼠模型及肾脏转录组样本。 |
| 7357 | 2024-08-07 |
Bulk RNA-sequencing, single-cell RNA-sequencing analysis, and experimental validation reveal iron metabolism-related genes CISD2 and CYP17A1 are potential diagnostic markers for recurrent pregnancy loss
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148168
PMID:38244949
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，结合实验验证，发现铁代谢相关基因CISD2和CYP17A1可能是复发性流产的潜在诊断标志物 | 首次揭示CISD2和CYP17A1基因在复发性流产中的作用，并验证了它们作为诊断和治疗标志物的潜力 | NA | 探索复发性流产的潜在诊断和治疗标志物 | 复发性流产患者的铁代谢相关基因 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及520个铁代谢相关基因，具体样本数量未详细说明 |
| 7358 | 2024-08-05 |
Can uric acid affect the immune microenvironment in bladder cancer? A single-center multi-omics study
2024-Mar, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23664
PMID:38018692
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研究论文 | 本研究探讨尿酸在膀胱癌免疫微环境中的作用 | 建立了与尿酸相关的11基因特征，并开发了用于预测膀胱癌患者生存率的命名图 | 仅在单中心进行研究，样本量有限 | 探索尿酸在膀胱癌代谢和免疫治疗中的影响 | 39名接受PD-1治疗的膀胱癌患者和169名接受根治性膀胱切除术的患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，流式细胞术 | 小鼠模型 | 基因组数据，免疫细胞数据 | 39名膀胱癌患者和169名接受根治性膀胱切除术的患者 |
| 7359 | 2024-08-07 |
Revealing PPP1R12B and COL1A1 as piRNA pathway genes contributing to abdominal aortic aneurysm through integrated analysis and experimental validation
2024-Mar-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.148068
PMID:38070790
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学方法发现并验证了piRNA通路基因PPP1R12B和COL1A1作为腹主动脉瘤的生物标志物，并探讨了其可能的分子机制 | 首次揭示了piRNA通路基因在腹主动脉瘤中的作用，并验证了PPP1R12B和COL1A1作为诊断标志物的潜力 | 需要进一步的临床试验来验证这些基因作为诊断标志物的有效性 | 探索piRNA通路基因在腹主动脉瘤中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 腹主动脉瘤及其相关piRNA通路基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 蛋白质印迹, scRNA-seq | 多因素逻辑回归, 极端梯度提升, 人工神经网络 | 基因表达数据 | 涉及腹主动脉瘤和正常血管组织的样本，以及小鼠腹主动脉瘤模型 |
| 7360 | 2024-08-07 |
T-cell infiltration and its regulatory mechanisms in cancers: insights at single-cell resolution
2024-Feb-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02960-w
PMID:38303018
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究肿瘤浸润T细胞及其调控机制的最新进展 | 采用单细胞RNA测序技术进行高分辨率分析，揭示了不同表型免疫细胞及其微环境因素的精确组成 | NA | 探讨影响T细胞浸润的因素，以理解肿瘤免疫并提高癌症免疫治疗的效果 | 肿瘤浸润T细胞及其调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |