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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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7321 | 2024-08-07 |
Comparative transcriptomic analysis of bovine mesenchymal stromal cells reveals tissue-source and species-specific differences
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108886
PMID:38318381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞的转录组特征,并探讨了其与马和人类间充质干细胞的异同 | 首次系统比较了不同来源的牛间充质干细胞的转录组特征,并揭示了其与人类间充质干细胞的相似性,为牛作为非传统动物模型用于间充质干细胞研究提供了依据 | NA | 探讨牛间充质干细胞的转录组特征及其与人类和马间充质干细胞的异同 | 牛间充质干细胞及其与人类和马间充质干细胞的转录组特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞,以及来自相同组织的马间充质干细胞和人类及小鼠的骨髓间充质干细胞 |
7322 | 2024-08-07 |
Delivery of Interferon β-Encoding Plasmid via Lipid Nanoparticle Restores Interferon β Expression to Enhance Antitumor Immunity in Colon Cancer
2024-Feb-06, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c10972
PMID:38319978
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研究论文 | 本文研究通过脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒,以恢复干扰素β表达并增强结直肠癌的抗肿瘤免疫 | 利用脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒,增强肿瘤免疫原性和T细胞效应功能,抑制结直肠癌生长 | NA | 测试通过阳离子脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒至肿瘤,恢复干扰素β表达以抑制肿瘤免疫逃逸的效果 | 结直肠癌细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | RNA | 涉及人类结直肠肿瘤组织和细胞,以及小鼠模型 |
7323 | 2024-08-05 |
Gut microbiota-derived LCA mediates the protective effect of PEDV infection in piglets
2024-Feb-05, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01734-4
PMID:38317217
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物群与仔猪对PEDV感染的抵抗力之间的关系 | 发现LCA在炎症中发挥保护作用,并通过影响肠道T细胞群体来增强抗病毒效果 | 实验主要集中在猪的模型上,缺乏对其他动物或人类的广泛适用性研究 | 调查肠道微生物群在猪仔对PEDV感染抵抗力中的作用 | 猪仔的肠道微生物群及其对猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学,16S扩增子测序,宏基因组学,非靶向代谢组学 | NA | NA | NA |
7324 | 2024-08-05 |
Multi-omic analysis of human kidney tissue identified medulla-specific gene expression patterns
2024-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.10.024
PMID:37995909
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研究论文 | 研究了人类肾脏髓质中特特有的基因表达模式。 | 首次详细描述了成人肾脏髓质的基线基因表达和表观基因组特征 | 样本量只限于五名男性患者,可能影响结果的广泛适用性 | 探索肾脏髓质的基因表达特征及其在肾脏功能和疾病中的作用 | 成人男性肾脏样本,特别关注髓质与皮质的比较 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, Hi-C, 空间转录组 | NA | 基因表达数据, 表观基因组数据 | 五名男性患者的肾脏样本 |
7325 | 2024-08-07 |
Method for Collecting Single Epithelial Cells from the Mouse Larynx
2024-Feb, The Laryngoscope
DOI:10.1002/lary.30970
PMID:37602769
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研究论文 | 本文开发了一种从老鼠喉部采集单个上皮细胞的方法 | 本文首次提出了一种可靠的方法,用于从老鼠喉部采集单个上皮细胞,同时最小化来自非喉部和非上皮喉部细胞的污染 | NA | 开发一种从老鼠喉部采集单个上皮细胞的方法 | 老鼠喉部的上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 从单个喉部收集6000-8000个细胞,从三个组织的刷取中收集35000-40000个细胞 |
7326 | 2024-08-07 |
Cellular Senescence Contributes to the Progression of Hyperoxic Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Feb, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0038OC
PMID:37874230
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研究论文 | 本文研究了细胞衰老在超氧环境下支气管肺发育不良(BPD)进展中的作用 | 首次提出细胞衰老在BPD进展中的重要作用,并探讨了减少髓过氧化物酶毒性氧化物产生、内质网应激和减轻细胞衰老作为潜在治疗策略的可能性 | NA | 探讨细胞衰老在超氧环境下支气管肺发育不良进展中的作用及其潜在治疗策略 | 人类肺部解剖样本和Sprague-Dawley大鼠幼崽 | NA | 支气管肺发育不良 | NA | NA | 组织学、转录组学和免疫印迹数据 | 人类肺部解剖样本和大鼠幼崽 |
7327 | 2024-08-05 |
Timing and precision of rattlesnake spinal motoneurons are determined by the KV72/3 potassium channel
2024-01-22, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.11.062
PMID:38157862
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研究论文 | 该文章探讨了响尾蛇运动神经元的生理特性及其对新型行为的影响 | 研究表明,响尾蛇体部和尾部的运动神经元具有根本不同的生理特性,这对于超快速肌肉的高时间精度控制是至关重要的 | 单细胞RNA测序未能揭示KV7通道表达的差异,可能限制了对其在生理学影响中的理解 | 探讨响尾蛇运动模式发生改变的生物机制 | 响尾蛇的运动神经元及其在体部和尾部的不同特性 | 数字病理学 | NA | 补丁钳记录电生理学 | NA | NA | NA |
7328 | 2024-08-07 |
YAP and TAZ couple osteoblast precursor mobilization to angiogenesis and mechanoregulation in murine bone development
2024-Jan-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.11.029
PMID:38141609
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研究论文 | 本文研究了Yes相关蛋白(YAP)和转录共激活因子与PDZ结合基序(TAZ)在胚胎小鼠骨骼发育中,如何将成骨细胞前体的动员与血管生成和机械调控相结合 | 首次揭示了YAP和TAZ在胚胎发育过程中调控成骨细胞前体动员和响应机械刺激的机制 | NA | 探讨YAP和TAZ在胚胎小鼠骨骼发育中的作用及其机制 | 成骨细胞前体、血管生成和机械调控 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
7329 | 2024-08-05 |
Preparation of a Single-Cell Suspension from Mouse Carotid Arteries for Single-Cell Sequencing
2024-Jan-19, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/65863
PMID:38314826
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研究论文 | 本研究提出了一种从小鼠颈动脉制备单细胞悬液的新方法 | 开发了一种两步骤消化法,用于制备可用于单细胞测序的高活性细胞悬液 | 当前方法可能需要根据其他组织进行适当修改,尚未广泛验证 | 研究颈动脉单细胞组成,以便为颈动脉粥样硬化的治疗提供帮助 | 小鼠颈动脉的单细胞组成和活性 | 数字病理学 | 颈动脉粥样硬化 | 双酶消化法和双荧光计数 | NA | 转录组数据 | 每个颈动脉细胞检测到约2500个转录本 |
7330 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the pig cecum at various developmental stages
2024-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对不同发育阶段的猪盲肠细胞进行了全面的转录组分析 | 首次揭示了猪盲肠在不同发育阶段的单细胞基因表达图谱,并发现了多种细胞类型及其特异性基因和转录因子 | NA | 探究猪盲肠在不同发育阶段的细胞异质性和功能 | 猪盲肠在不同发育阶段的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 45,572个细胞,来自7个不同发育阶段的猪盲肠样本 |
7331 | 2024-08-05 |
Construction and validation of a mitochondria-associated genes prognostic signature and immune microenvironment characteristic of sepsis
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111275
PMID:37995567
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研究论文 | 本文研究了与脓毒症相关的线粒体基因预后模型及其免疫微环境特征 | 建立了脓毒症的线粒体预后模型,并探讨了其与免疫微环境的关系 | 尚未明确线粒体与脓毒症免疫微环境之间的所有交互机制 | 旨在构建线粒体相关基因的预后模型来预测脓毒症患者的预后 | 研究对象为脓毒症患者的临床血样和线粒体相关基因 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序 | NA | 临床血样 | 5个与脓毒症相关的线粒体基因 |
7332 | 2024-08-05 |
Identifying the critical oncogenic mechanism of LDHA based on a prognostic model of T-cell synthetic drivers
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111265
PMID:38000233
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研究论文 | 本研究揭示了与T细胞合成驱动因子相关的预后模型在肺腺癌中的重要性 | 首次展示了LDHA在肺腺癌恶性进展中的关键作用,并开发了一个相关的预后模型 | 缺乏对其他类型肿瘤的综合分析,可能对广泛应用有所限制 | 改善肺腺癌的免疫疗法效果 | 关注肺腺癌患者的T细胞合成驱动因子 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | Lasso Cox回归模型 | 临床数据 | NA |
7333 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing indicates cordycepin remodels the tumor immune microenvironment to enhance TIGIT blockade's anti-tumor effect in colon cancer
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111268
PMID:37992442
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果及其对肿瘤免疫微环境的重组作用 | 发现虫草素治疗能显著增强Cd226基因的表达,从而提高TIGIT阻断疗法的效果,并通过单细胞RNA测序证实了这一联合疗法在肿瘤免疫微环境中对NK细胞和CD8 T细胞的积极影响 | NA | 研究虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果 | 结肠癌肿瘤模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了MC38肿瘤模型中的免疫细胞进行分析 |
7334 | 2024-08-07 |
Transcriptomic and genomic profiling of multiple primary colorectal cancers reveals intratumor heterogeneity and a distinct immune microenvironment
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111276
PMID:38016348
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研究论文 | 本研究报告了单一患者多发性原发性结直肠癌(MPCC)不同肿瘤病变的肿瘤内基因组和免疫学异质性 | 首次通过全外显子测序和单细胞RNA测序揭示了MPCC中肿瘤病变的分子和微环境特征,特别是发现了横结肠肿瘤病变中黏膜相关不变T细胞(MAIT)的富集 | 研究样本量较小,仅基于单一患者的数据,可能限制了结果的普遍性 | 探索MPCC患者不同原发部位肿瘤病变的分子和微环境特征 | 来自同一72岁男性MPCC患者的三个肿瘤病变,分别位于横结肠肝曲、乙状结肠和直肠 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 全外显子测序(WES)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据、转录组数据 | 三个肿瘤样本 |
7335 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing in double-hit lymphoma: IMPDH2 induces the progression of lymphoma by activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway" [Int. Immunopharmacol. 125(Part A) (2023) 111125]
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111292
PMID:38042635
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
7336 | 2024-08-07 |
Inferring Gene Regulatory Networks and Predicting the Effect of Gene Perturbations via IQCELL
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2022_465
PMID:36790623
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研究论文 | IQCELL平台从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络,并模拟正常和扰动条件下的网络行为 | 开发了IQCELL平台,能够从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络,并模拟其在正常和扰动条件下的行为 | NA | 提供使用IQCELL平台从原始数据集推断基因调控网络的详细指南 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | RNA测序数据 | NA |
7337 | 2024-08-07 |
Single-Cell mRNA-sncRNA Co-sequencing of Preimplantation Embryos
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_487
PMID:37278916
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研究论文 | 本文介绍了一种方法,通过在同一胚胎细胞上同时进行单细胞RNA测序(Smart-Seq2)和单细胞小非编码RNA测序(Small-Seq),来阐明胚胎的细胞动力学 | 本文创新地结合了单细胞RNA测序和小非编码RNA测序技术,以更全面地研究胚胎细胞的多样性和异质性 | NA | 研究胚胎细胞的分子机制和细胞动力学 | 胚胎细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(Smart-Seq2)和小非编码RNA测序(Small-Seq) | NA | RNA | NA |
7338 | 2024-08-07 |
Evaluation of Stem-Cell Embryo Models by Integration with a Human Embryo Single-Cell Transcriptome Atlas
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_492
PMID:37351839
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研究论文 | 本文通过整合人类胚胎单细胞转录组图谱,评估了干细胞胚胎模型的转录组景观 | 利用单细胞RNA测序技术,实现了对早期胚胎分子过程的深入理解,并提供了评估早期胚胎细胞组成的手段 | 不同实验室和不同技术获取的单细胞数据集之间的比较存在挑战 | 通过比较分析胚胎的转录组景观,以更好地理解和改进基于干细胞的胚胎模型 | 人类囊胚模型(blastoids)与人类胚胎数据集及二维体外早期发育模型系统的整合分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
7339 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics is revolutionizing the improvement of plant biotechnology research: recent advances and future opportunities
2024-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2165900
PMID:36775666
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评论 | 单细胞转录组学的现代进展促进了植物生物技术研究 | 提供了单细胞转录组学在植物中的最新进展,并探讨了其未来研究的潜力 | 分析了单细胞技术面临的各种技术障碍和固有限制 | 探讨单细胞转录组学在植物生物技术中的应用和发展 | 植物的单细胞转录组数据 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
7340 | 2024-08-05 |
Skin single-cell transcriptomics reveals a core of sebaceous gland-relevant genes shared by mice and humans
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10008-8
PMID:38310227
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠和人类皮肤中与皮脂腺相关的基因的核心。 | 首次通过单细胞转录组学方法比较了小鼠和人类皮脂腺相关基因的表达差异,发现种间间存在显著差异。 | 研究中观察到在小鼠和人类样本中,皮脂腺特有转录本的重叠极少,可能限制了其跨物种的比较分析。 | 探索并比较小鼠和人类皮脂腺中特有的基因表达模式。 | 小鼠和人类的皮肤样本,通过单细胞RNA测序进行分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠与人类皮肤样本 |