单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7637 篇文献，本页显示第 7301 - 7320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7301 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell alternative splicing analyses reveal roles of TRA2B in myogenic differentiation
2024-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13545
PMID:37705195
|
研究论文 | 本研究采用Iso-seq和scRNA-seq技术分析在肌肉发生过程中TRA2B的作用及其选择性剪接的复杂性 | 本研究识别了61,146种全长异构体和38,022个选择性剪接事件，并发现了TRA2B在肌肉分化中的不同作用 | 未具体提到样本来源和数量的具体信息 | 探索肌肉发生过程中的选择性剪接模式及其调控机制 | 主要研究TRA2B在肌肉细胞中的选择性剪接调控 | 数字病理学 | NA | Iso-seq和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 7302 | 2024-08-07 |
Sequencing of Physically Interacting Cells in Human Kidney Allograft Rejection to Infer Contact-dependent Immune Cell Transcription
2024-Feb-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004762
PMID:37638864
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研究论文 | 本研究通过结合CD45阳性富集策略和基于测序的细胞表面蛋白定量方法，分析了11例人肾移植活检样本中的细胞间相互作用，并使用单细胞RNA测序技术推断接触依赖的免疫细胞转录情况。 | 本研究采用了一种新的计算方法来解析异型物理相互作用细胞的转录谱，这种方法补充了以往从单细胞RNA测序数据估计细胞间物理接触的方法。 | 由于空间信息的丢失，从单细胞RNA测序数据中推断细胞间相互作用的转录程序具有挑战性。 | 研究目的是推断人肾移植排斥反应中细胞间接触依赖的免疫细胞转录情况。 | 研究对象包括11例人肾移植活检样本中的免疫细胞及其相互作用。 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 11例人肾移植活检样本，生成了31,203个高质量的单细胞库 |
| 7303 | 2024-08-07 |
The efficient generation of functional human hepatocytes from chemically induced pluripotent stem cells
2024-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13540
PMID:37814474
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研究论文 | 本文开发了一种模拟肝母细胞两阶段发育的分化协议，从化学诱导的多能干细胞（hCiPSCs）高效生成肝前体细胞 | 首次通过模拟肝母细胞的两阶段发育过程，实现了从hCiPSCs高效生成肝前体细胞和肝细胞 | NA | 探索从多能干细胞中高效生成功能性人肝细胞的方法 | 化学诱导的多能干细胞（hCiPSCs）及其分化生成的肝前体细胞和肝细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 7304 | 2024-08-07 |
Origin and adult renewal of the gut lacteal musculature from villus myofibroblasts
2024-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.19.523242
PMID:36712064
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和定量谱系追踪技术，揭示了小肠绒毛平滑肌细胞的形成和分化机制 | 首次揭示了小肠绒毛平滑肌细胞的形成和分化机制，以及NOTCH3-DLL4信号轴在绒毛平滑肌与相邻乳糜管组装中的作用 | NA | 揭示小肠绒毛平滑肌细胞的形成、组装和生命周期中的修复机制 | 小肠绒毛平滑肌细胞及其与乳糜管的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠肠道样本 |
| 7305 | 2024-08-07 |
A comprehensive bioinformatics analysis identifies mitophagy biomarkers and potential Molecular mechanisms in hypertensive nephropathy
2024-Feb-09, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2024.2311344
PMID:38334110
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，在高血压肾病中识别了线粒体自噬相关的生物标志物和潜在分子机制 | 首次系统地研究了高血压肾病中线粒体自噬相关基因，并利用机器学习技术构建了诊断模型 | NA | 探讨线粒体自噬在高血压肾病中的作用及其相关基因和分子机制 | 高血压肾病中的线粒体自噬相关基因和分子机制 | 生物信息学 | 高血压肾病 | 转录组数据分析 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 7306 | 2024-08-07 |
An Analysis Regarding the Association Between DAZ Interacting Zinc Finger Protein 1 (DZIP1) and Colorectal Cancer (CRC)
2024-Feb-09, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01065-1
PMID:38334905
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研究论文 | 本研究探讨了DAZ相互作用锌指蛋白1（DZIP1）与结直肠癌（CRC）之间的关联 | 首次揭示了DZIP1在CRC中的作用，包括其在纤维母细胞恶性转化中的上调以及对上皮-间质转化（EMT）的促进作用 | 研究主要基于细胞和动物模型，需要在人体临床试验中进一步验证 | 揭示DZIP1在结直肠癌中的作用机制，为治疗提供新途径 | DZIP1在结直肠癌中的表达及其对纤维母细胞和肿瘤细胞的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scrna-seq | NA | 临床样本数据 | 涉及细胞和异种移植裸鼠模型 |
| 7307 | 2024-08-05 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain
2024-Feb-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323
PMID:38324639
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究小鼠缺血半球的分子和细胞结构 | 本研究首次揭示了缺血大脑中非神经元细胞的分子和空间特征，以及细胞类型间的相互作用 | 对缺血大脑中其他细胞类型的研究较为有限 | 研究缺血后小鼠大脑的分子和细胞架构 | 小鼠缺血半球及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 缺血性脑卒中 | 空间转录组学 | NA | 转录组 | 19777个点 |
| 7308 | 2024-08-05 |
The unfolded protein response pathway as a possible link in the pathogenesis of COVID-19 and sepsis
2024-Jan-08, Archives of virology
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s00705-023-05948-7
PMID:38191819
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研究论文 | 本研究揭示了在单细胞水平上COVID-19和脓毒症的发病机制中未折叠蛋白反应（UPR）通路的重要性 | 提供了COVID-19与脓毒症之间的共同发病机制的新分子视角 | 未在研究中提及具体的生物标志物或临床数据的长时间追踪 | 探讨COVID-19与脓毒症之间的潜在联系及其共同的发病机制 | COVID-19和脓毒症病例的单细胞RNA-seq数据及转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 7309 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfite-sequencing reveal insights into yak preimplantation embryogenesis
2024-Jan, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105562
PMID:38097189
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研究论文 | 本研究探讨了在牦牛胚胎发育过程中DNA甲基化和基因表达的变化 | 首次将单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸盐测序结合，揭示了牦牛胚前期发育中的表观遗传重编程 | 该研究的具体样本量和所用技术可能影响结果的普适性 | 探究牦牛胚胎发育期间DNA甲基化与基因表达的相互作用 | 以牦牛卵母细胞及不同发育阶段的胚胎为研究对象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸盐测序 | NA | 基因表达数据和DNA甲基化数据 | 不同发育阶段的牦牛卵母细胞和胚胎 |
| 7310 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24048
PMID:38133212
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了肺腺癌中的肿瘤内异质性，并开发了一个有效的预后指数。 | 本文首次在单细胞水平上分析了肺腺癌的肿瘤内异质性，并开发了一个跨多个队列的有效预后指数。 | NA | 探索肺腺癌的肿瘤内异质性，并开发个性化治疗策略。 | 肺腺癌的肿瘤内异质性及其对预后的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了1458个样本，包括TCGA-LUAD（503个），GSE68465（442个），GSE72094（398个）和GSE26939（115个）。 |
| 7311 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of mechanical loading on knee tibial cartilage in osteoarthritis
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111496
PMID:38224628
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了机械负荷对膝骨关节炎患者膝关节胫骨软骨中软骨细胞亚群的影响 | 首次识别出一种新的软骨细胞亚群HTC-C，并分析了其在不同机械负荷条件下的功能和细胞间相互作用 | 研究仅限于KOA患者的膝关节胫骨软骨，且样本量未具体说明 | 探究机械负荷对膝骨关节炎发展中软骨细胞亚群的影响及其分子机制 | 膝骨关节炎患者的膝关节胫骨软骨 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未提及 |
| 7312 | 2024-08-07 |
Elevated enteric putrescine suppresses differentiation of intestinal germinal center B cells
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111544
PMID:38266445
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研究论文 | 本研究探讨了外源性腐胺对肠道微环境中B细胞分化的影响 | 发现腐胺通过影响B细胞受体信号通路和脂肪酸氧化相关基因，抑制肠道B细胞分化，并揭示了腐胺在不同癌症中的免疫调节作用 | NA | 研究腐胺与B细胞成熟和代谢失调之间的因果关系及其机制 | 肠道微环境中的B细胞分化 | 免疫学 | NA | bulk RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7313 | 2024-08-07 |
Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve
2024-Feb-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.006
PMID:38198889
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和回顾性多色克隆分析，探讨了小鼠心脏二尖瓣起源的前体细胞的命运和行为 | 首次详细描述了二尖瓣前体细胞的代谢过程和其在阀叶形成中的特定贡献 | NA | 揭示小鼠心脏二尖瓣前体细胞的身份、命运决策及其在阀叶中的行为和分布 | 小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 涉及小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞样本 |
| 7314 | 2024-08-07 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
|
研究论文 | 本文通过结合体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体（TCR）测序，研究了Guillain-Barré综合征（GBS）中自身反应性T细胞的作用 | 首次鉴定出具有细胞毒性T辅助1（T1）样表型的自身反应性记忆CD4细胞和针对周围神经髓鞘抗原的稀有CD8 T细胞，并揭示了多克隆TCR谱系、短CDR3β长度、偏好HLA-DR限制和识别免疫优势表位 | NA | 揭示Guillain-Barré综合征中自身反应性T细胞的免疫机制 | Guillain-Barré综合征患者中的自身反应性T细胞 | NA | Guillain-Barré综合征 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | RNA | 超过1,000个自身反应性单T细胞克隆 |
| 7315 | 2024-08-07 |
The Gut Microbiome Controls Liver Tumors via the Vagus Nerve
2024-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576951
PMID:38328040
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研究论文 | 本文探讨了肠道微生物群通过迷走神经影响肝脏肿瘤的机制 | 首次揭示肠道微生物群通过迷走神经调节肝脏肿瘤的机制，并发现迷走神经通过乙酰胆碱影响CD8+ T细胞活性 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人体中验证 | 研究肠道微生物群与迷走神经在肝脏肿瘤发展中的相互作用 | 肝脏肿瘤、肠道微生物群、迷走神经、CD8+ T细胞 | NA | 肝脏肿瘤 | scRNA-seq | NA | 微生物群数据 | 涉及Rag1KO小鼠和无肿瘤小鼠 |
| 7316 | 2024-08-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576260
PMID:38328172
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞。 | 创新之处在于应用DEGAS工具，将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据上，以识别为2型糖尿病病理提供关键的β细胞亚群。 | 本研究没有涉及与其他潜在影响因素的交互作用。 | 本研究旨在优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好理解2型糖尿病的发病机制。 | 研究对象为与2型糖尿病和肥胖相关的不同β细胞亚群。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习模型 | 基因表达数据 | 涉及来自健康和2型糖尿病供体的人类胰腺切片 |
| 7317 | 2024-08-05 |
Molecular functional characterization of the setdb1 and its potential target gene sox5 illuminate the histone modification-mediated orchestration of gonadal development in Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis)
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148199
PMID:38253299
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研究论文 | 该研究揭示了setdb1在中国舌鳎性别分化和生殖细胞发育中的作用 | 首次在中国舌鳎中详细描述了setdb1及其潜在靶基因sox5在性别发育调控中的分子机制 | 缺乏对setdb1在其他发育阶段的功能研究 | 探讨setdb1如何通过调控sox5的转录影响性别分化和生殖细胞发育 | 中国舌鳎的setdb1基因及其靶基因sox5 | 数字病理学 | NA | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列, RNA数据 | NA |
| 7318 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics and the anatomical pathologist: Molecular meets morphology
2024-Mar, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.15093
PMID:37991396
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小型综述 | 本文概述了空间转录组学方法及其在解剖病理学实践中的应用 | 本研究强调了与福尔马林固定石蜡包埋组织（FFPE）兼容的空间转录组学技术的进展 | 目前这些技术仍主要在研究实验室中使用，对于在常规解剖病理学实践中的整合还需进一步发展 | 探讨空间转录组学在解剖病理学中的应用与潜力 | 空间转录组学技术及其与解剖病理学实践的关系 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7319 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the role of antigen presentation in liver metastatic breast cancer
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108896
PMID:38318373
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研究论文 | 这篇文章深入分析了11例晚期乳腺癌患者的肝转移转录组特征 | 揭示了肝转移相关的抗原呈递功能障碍与肿瘤浸润T细胞的关系 | 样本量较小，仅为11例，可能影响结果的普遍性 | 研究肝转移乳腺癌中抗原呈递的作用 | 11例患有继发性肝癌的乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11例 |
| 7320 | 2024-08-07 |
Compartmentalization and synergy of osteoblasts drive bone formation in the regenerating fin
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108841
PMID:38318374
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向成骨细胞消融和电子显微镜技术，探讨了斑马鱼再生鳍中表皮、成骨细胞和非成骨细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 | 研究揭示了再生鳍中成骨细胞的来源及其在再生过程中的分工和协同作用，以及再生受损时的检测和补偿机制 | NA | 探讨斑马鱼再生鳍中细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 | 斑马鱼再生鳍中的表皮细胞、成骨细胞和非成骨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向消融、电子显微镜 | NA | RNA | NA |