单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7524 篇文献，本页显示第 7261 - 7280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7261 | 2024-08-07 |
Taste receptor type 1 member 3 is required for the fertility of male mice
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24577
PMID:38312691
|
research paper | 本文研究了味觉受体类型1成员3（TAS1R3）在雄性小鼠生育中的作用 | 首次揭示了TAS1R3通过PKA/CREB/StAR信号通路在雄性生育中的关键作用 | NA | 探究TAS1R3对雄性小鼠生殖功能的影响 | 野生型和敲除（KO）小鼠 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型和敲除小鼠 |
| 7262 | 2024-08-05 |
Cebp1 and Cebpβ transcriptional axis controls eosinophilopoiesis in zebrafish
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45029-0
PMID:38280871
|
研究论文 | 本研究分析了斑马鱼中嗜酸性粒细胞的分化、分布和调节 | 建立了一个特异性标记嗜酸性粒细胞谱系的斑马鱼报告线，并揭示了Cebp1和Cebpβ转录轴在嗜酸性粒细胞分化中的作用 | 未明确提到本研究的限制 | 研究嗜酸性粒细胞的发育模式和调节机制 | 斑马鱼嗜酸性粒细胞谱系及其发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了特异性标记的嗜酸性粒细胞谱系细胞 |
| 7263 | 2024-08-05 |
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) deletion in myeloid cells augments cholestatic liver injury
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52710-3
PMID:38273071
|
研究论文 | 本文探讨了肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体(TRAIL)在骨髓细胞中的缺失如何加重胆汁淤积性肝损伤。 | 研究发现TRAIL源自招募的巨噬细胞，并抑制DR细胞扩展，从而限制胆汁淤积性肝损伤。 | 本文并未涉及湿剂量的不同或不同动物模型的比较，可能限制了其结果的广泛适用性。 | 研究TRAIL在骨髓细胞中的作用及其在胆汁淤积性肝损伤中的影响。 | 涉及Wild type (WT)、Trail和骨髓特异性Trail缺失的小鼠模型。 | 数字病理学 | 肝病 | 高维量子显微技术，空间转录组分析 | 小鼠模型 | 生物样本 | 包括Wild type、Trail和Trail缺失小鼠的多组小鼠 |
| 7264 | 2024-08-05 |
scCAN: Clustering With Adaptive Neighbor-Based Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data
2024 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3337231
PMID:38285569
|
研究论文 | 提出了一种新的适应性邻域聚类基础的缺失值插补方法scCAN，用于单细胞RNA测序数据 | 本研究创新性地设计了一个方法，通过不断更新细胞相似性信息来改善缺失值的插补 | 未提及具体的局限性 | 研究单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 使用模拟和真实单细胞RNA测序数据进行研究 | 计算机视觉 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 四个模拟和八个真实的单细胞RNA-seq数据 |
| 7265 | 2024-08-05 |
Presence of onco-fetal neighborhoods in hepatocellular carcinoma is associated with relapse and response to immunotherapy
2024-Jan, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00672-2
PMID:38168935
|
研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中的肿瘤生态系统的癌胎编程及其与免疫治疗反应和复发的关系 | 首次提出POSTN外源性基质癌相关成纤维细胞作为关键的癌胎相互作用中心，并探讨其在肝细胞癌复发和免疫治疗反应中的影响 | 未明确阐述样本量与研究设计的具体限制 | 研究肝细胞癌中的癌胎邻域与复发及免疫治疗反应的关系 | 研究特定细胞亚群，包括POSTN CAFs、FOLR2巨噬细胞和PLVAP内皮细胞在肝细胞癌复发和免疫治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、整体RNA测序 | NA | NA | NA |
| 7266 | 2024-08-05 |
An emerging biomarker for the diagnosis and treatment of esophageal squamous cell carcinoma - Aurora A
2024-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107759
PMID:38043467
|
研究论文 | 研究表明Aurora A在食管鳞状细胞癌中是一种潜在的预后和治疗生物标志物 | 本研究首次揭示了Aurora A在食管鳞状细胞癌中的作用及其对细胞增殖和药物敏感性的影响 | 本研究仅基于公共数据库的数据，可能存在数据集的局限性 | 探讨Aurora A在食管鳞状细胞癌中的分子机制及其作为生物标志物的潜力 | 研究对象为食管鳞状细胞癌患者的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA-seq | NA | 文本 | 来自公共数据库的RNA-seq数据集，具体样本量未明确提供 |
| 7267 | 2024-08-07 |
Genetic variants in BCL-2 family genes influence the risk of non-syndromic cleft lip with or without cleft palate
2024-Jan, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2288
PMID:38108593
|
研究论文 | 本研究探讨了BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险之间的关联 | 发现了位于增强子区域的rs3943258与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂的风险相关，并表现出BCL2的eQTL效应 | NA | 研究BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险之间的关联 | BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险 | 遗传学 | 口腔疾病 | 多标记基因组注释的多标记分析（Multi-marker Analysis of GenoMic Annotation）、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因组数据、RNA测序数据 | 第一阶段队列包括565例病例和1269例对照，候选SNPs通过额外的dbGaP病例-父母三联体进行复制 |
| 7268 | 2024-08-07 |
Gclc as a Marker for Injured Distal Nephron in Ischemia-Reperfusion Induced Acute Kidney Injury
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S451402
PMID:38313210
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转录组学分析，探讨了缺血-再灌注诱导的急性肾损伤中远端肾小管的作用，并验证了Gclc作为损伤远端肾小管的潜在标志物。 | 首次识别了LOH-Inj和DCT-Inj亚型，并发现Gclc在多种急性肾损伤模型中的高表达，特别是在损伤的远端肾小管中。 | NA | 理解远端肾小管在急性肾损伤中的作用，并识别损伤远端肾小管的标志物，以揭示肾脏损伤机制并寻找新的治疗靶点。 | 远端肾小管在急性肾损伤中的作用及损伤标志物Gclc。 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了缺血-再灌注、单侧输尿管阻塞、顺铂、草酸钠和脂多糖诱导的AKI小鼠模型及肾脏转录组样本。 |
| 7269 | 2024-08-07 |
Bulk RNA-sequencing, single-cell RNA-sequencing analysis, and experimental validation reveal iron metabolism-related genes CISD2 and CYP17A1 are potential diagnostic markers for recurrent pregnancy loss
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148168
PMID:38244949
|
研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，结合实验验证，发现铁代谢相关基因CISD2和CYP17A1可能是复发性流产的潜在诊断标志物 | 首次揭示CISD2和CYP17A1基因在复发性流产中的作用，并验证了它们作为诊断和治疗标志物的潜力 | NA | 探索复发性流产的潜在诊断和治疗标志物 | 复发性流产患者的铁代谢相关基因 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及520个铁代谢相关基因，具体样本数量未详细说明 |
| 7270 | 2024-08-05 |
Can uric acid affect the immune microenvironment in bladder cancer? A single-center multi-omics study
2024-Mar, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23664
PMID:38018692
|
研究论文 | 本研究探讨尿酸在膀胱癌免疫微环境中的作用 | 建立了与尿酸相关的11基因特征，并开发了用于预测膀胱癌患者生存率的命名图 | 仅在单中心进行研究，样本量有限 | 探索尿酸在膀胱癌代谢和免疫治疗中的影响 | 39名接受PD-1治疗的膀胱癌患者和169名接受根治性膀胱切除术的患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，流式细胞术 | 小鼠模型 | 基因组数据，免疫细胞数据 | 39名膀胱癌患者和169名接受根治性膀胱切除术的患者 |
| 7271 | 2024-08-07 |
Revealing PPP1R12B and COL1A1 as piRNA pathway genes contributing to abdominal aortic aneurysm through integrated analysis and experimental validation
2024-Mar-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.148068
PMID:38070790
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学方法发现并验证了piRNA通路基因PPP1R12B和COL1A1作为腹主动脉瘤的生物标志物，并探讨了其可能的分子机制 | 首次揭示了piRNA通路基因在腹主动脉瘤中的作用，并验证了PPP1R12B和COL1A1作为诊断标志物的潜力 | 需要进一步的临床试验来验证这些基因作为诊断标志物的有效性 | 探索piRNA通路基因在腹主动脉瘤中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 腹主动脉瘤及其相关piRNA通路基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 蛋白质印迹, scRNA-seq | 多因素逻辑回归, 极端梯度提升, 人工神经网络 | 基因表达数据 | 涉及腹主动脉瘤和正常血管组织的样本，以及小鼠腹主动脉瘤模型 |
| 7272 | 2024-08-07 |
T-cell infiltration and its regulatory mechanisms in cancers: insights at single-cell resolution
2024-Feb-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02960-w
PMID:38303018
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究肿瘤浸润T细胞及其调控机制的最新进展 | 采用单细胞RNA测序技术进行高分辨率分析，揭示了不同表型免疫细胞及其微环境因素的精确组成 | NA | 探讨影响T细胞浸润的因素，以理解肿瘤免疫并提高癌症免疫治疗的效果 | 肿瘤浸润T细胞及其调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 7273 | 2024-08-07 |
A single cell RNAseq benchmark experiment embedding "controlled" cancer heterogeneity
2024-Feb-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03002-y
PMID:38307867
|
研究论文 | 本文介绍了一个基于10X Genomics平台的单细胞RNA测序实验，通过使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系，创建了一个受控的癌症异质性环境 | 本研究提供了一个全面的框架，用于开发和验证通过单细胞RNA测序分析癌症异质性的方法 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战，特别是细胞注释和肿瘤亚群识别 | 肺癌细胞系，表达七种不同驱动基因（EGFR, ALK, MET, ERBB2, KRAS, BRAF, ROS1） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系 |
| 7274 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03850-x
PMID:38087072
|
研究论文 | 本文使用空间转录组学技术研究了养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色局部肌肉变化的细胞异质性 | 研究揭示了红色和黑色肌肉变色中的相似分子机制，并展示了不同样本类型中基因的独特表达模式 | 本研究未提及具体样本量和实验条件的限制 | 研究养殖大西洋鲑鱼肌肉的病理条件和细胞异质性 | 养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色肌肉局部变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7275 | 2024-08-07 |
Correction to: Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03856-5
PMID:38158442
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7276 | 2024-08-07 |
Vitamin D3 reverses immune tolerance and enhances the cytotoxicity of effector T cells in coal pneumoconiosis
2024-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115972
PMID:38218105
|
研究论文 | 本研究探讨了维生素D3在煤工尘肺病中调节淋巴细胞功能的作用机制 | 首次揭示了维生素D3通过调节CD4+ T细胞分化和减少调节性T细胞数量，增强CD8+效应T细胞的细胞毒性，从而减轻肺纤维化和症状 | NA | 阐明维生素D3在煤工尘肺病中调节免疫状态的机制 | 煤工尘肺病中的淋巴细胞 | NA | 职业病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 7277 | 2024-08-05 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
|
研究论文 | 本研究探讨了果蝇中全新基因的起源、进化和蛋白质结构的变化 | 结合高品质的全基因组比对和计算结构建模方法，识别出555个果蝇特有的全新基因候选者 | 对果蝇中特定族群的研究可能不适用于其他物种 | 研究果蝇中全新基因的起源和结构演变 | 果蝇D. melanogaster的全新基因候选者 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列 | 555个全新基因候选者 |
| 7278 | 2024-08-07 |
Integrative genomic analyses reveal putative cell type-specific targets of the Drosophila ets transcription factor Pointed
2024-Jan-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10017-7
PMID:38262913
|
研究论文 | 本研究通过整合全基因组单细胞和批量数据，识别了果蝇Ets转录因子Pointed的细胞类型特异性潜在靶点 | 首次通过结合染色质免疫沉淀与高通量测序（ChIP-seq）和单细胞基因组学数据（scRNA-seq和snATAC-seq），揭示了157个潜在的细胞类型特异性Pointed靶点及其功能增强子 | NA | 识别果蝇Ets转录因子Pointed的细胞类型特异性潜在靶点，以深入理解由表皮生长因子受体（Egfr）信号调控的复杂发育过程 | 果蝇Ets转录因子Pointed及其在眼盘发育中的作用 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因组数据 | 6,941个基因 |
| 7279 | 2024-08-05 |
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568157
PMID:38045273
|
research paper | 该文章研究了肾单位祖细胞在肾脏分支形态发生过程中的自我更新和分化之间的节律性交替 | 创新点在于揭示了肾单位祖细胞的分化与更新之间的节律性模式以及与分支生长的同步关系 | 局限性在于研究主要基于小鼠模型，可能与人类有差异 | 研究肾单位祖细胞在肾脏发育中的动态变化与分支形态发生的关系 | 肾单位祖细胞及其在肾脏发育过程中的角色 | 数字病理 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠和人类干细胞来源的肾单位祖细胞类器官进行实验 |
| 7280 | 2024-08-07 |
FGL2 promotes tumour growth and attenuates infiltration of activated immune cells in melanoma and ovarian cancer models
2024-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-51217-1
PMID:38191799
|
研究论文 | 本文研究了FGL2蛋白在黑色素瘤和卵巢癌模型中的作用，发现FGL2抑制免疫细胞的浸润并促进肿瘤生长 | 首次证明了FGL2缺失能增强肿瘤微环境中自然杀伤细胞的活性，并延长生存期 | 研究仅限于两种小鼠癌症模型，未来需在更多癌症类型中验证FGL2的作用 | 探讨FGL2在肿瘤微环境中的作用及其作为癌症治疗靶点的潜力 | FGL2蛋白在黑色素瘤和卵巢癌中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了Fgl2敲除小鼠进行实验 |