单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
7261	2024-08-04	LCP1 knockdown in monocyte-derived macrophages: mitigating ischemic brain injury and shaping immune cell signaling and metabolism 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.88678 PMID:38164159	研究论文	本研究探讨了LCP1在单核细胞来源的巨噬细胞中对缺血性脑损伤的影响	研究首次揭示了LCP1在缺血性脑损伤中的作用，并阐明了其对免疫细胞信号和代谢的调节机制	尚不清楚LCP1在缺血性中风中作用的完整机制以及临床应用的可行性	旨在深入理解LCP1在缺血性脑伤害和免疫反应中的功能	研究对象为单核细胞来源的巨噬细胞及其对缺血性脑损伤的影响	数字病理学	缺血性中风	CyTOF 技术	小鼠模型	单细胞测序数据	小鼠样本数量未知
7262	2024-08-04	Palmitoylation of PKCδ by ZDHHC5 in hypothalamic microglia presents as a therapeutic target for fatty liver disease 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.89602 PMID:38250049	研究论文	本研究发现PKCδ的棕榈酰化在下丘脑小胶质细胞中作为脂肪肝疾病的治疗靶点	首次揭示了抗疟药物阿莫西林通过抑制小胶质细胞的活化，改善脂质代谢，并确定了PKCδ作为直接靶 alvo	该研究主要在小鼠模型中进行，临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证	探讨下丘脑小胶质细胞中PKCδ的棕榈酰化在脂肪肝疾病中的作用	高脂饮食诱导的小鼠及人类脑组织样本	数字病理学	脂肪肝疾病	生物素标记化学探针	NA	组织样本	高脂饮食诱导的小鼠和人类脑组织样本
7263	2024-08-07	Reciprocal interactions between malignant cells and macrophages enhance cancer stemness and M2 polarization in HBV-associated hepatocellular carcinoma 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.87962 PMID:38169544	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV相关肝细胞癌患者的肿瘤微环境，揭示了恶性细胞与巨噬细胞之间的相互作用如何增强癌症干细胞特性和M2极化	首次详细描述了HBV相关肝细胞癌中恶性细胞与巨噬细胞之间的相互作用，以及这种作用如何影响癌症干细胞特性和M2极化	研究仅基于九名患者的样本，可能存在样本量较小的问题	探讨肿瘤微环境中恶性细胞与巨噬细胞的相互作用对癌症干细胞特性和M2极化的影响	HBV相关肝细胞癌患者的恶性细胞和巨噬细胞	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	九名HBV相关肝细胞癌患者
7264	2024-08-07	Exosomes derived from CD271+CD56+ bone marrow mesenchymal stem cell subpopoulation identified by single-cell RNA sequencing promote axon regeneration after spinal cord injury 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.89008 PMID:38169566	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现了一种特殊的骨髓间充质干细胞亚群，该亚群能够促进脊髓损伤后的轴突再生，并探讨了其治疗效果及机制	本研究首次通过单细胞RNA测序技术发现了一种能够促进脊髓损伤后轴突再生的骨髓间充质干细胞亚群，并开发了一种持续释放系统的治疗方法	NA	探索能够增强脊髓损伤后轴突再生的途径	骨髓间充质干细胞亚群及其衍生的外泌体在脊髓损伤后的治疗效果	数字病理学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
7265	2024-08-07	Comprehensive characterization of early-programmed tumor microenvironment by tumor-associated macrophages reveals galectin-1 as an immune modulatory target in breast cancer 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.88917 PMID:38169569	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在早期肿瘤发展中对肿瘤微环境（TME）的调控作用，并发现Galectin-1作为免疫调节靶点	首次揭示了TAMs在早期肿瘤发展中对TME的全面调控作用，并确定了Galectin-1作为关键分子因子	NA	研究TAMs在早期肿瘤发展中对TME的调控作用及关键分子因子	肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、肿瘤微环境（TME）、Galectin-1	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
7266	2024-08-07	Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomics develops a robust neuroendocrine cell-intrinsic signature to predict prostate cancer progression 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.92336 PMID:38250042	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量转录组学数据，开发了一种稳健的神经内分泌细胞内在特征，用于预测前列腺癌的进展	开发了一种集成分析流程，识别了762个高质量的神经内分泌标记物，并创建了一个名为NEPAL的R包，用于预测神经内分泌前列腺癌的风险评分	NA	精确识别神经内分泌前列腺癌细胞，为研究和临床应用提供重要意义	神经内分泌前列腺癌细胞及其在前列腺癌进展中的作用	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	共包含210,879个单细胞，包括66个肿瘤样本
7267	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing reveals S100a9hi macrophages promote the transition from acute inflammation to fibrotic remodeling after myocardial ischemia‒reperfusion 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.91180 PMID:38323308	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术探讨了心肌缺血再灌注后巨噬细胞亚型及其在炎症和纤维化过程中的作用	首次鉴定出一种独特的S100a9巨噬细胞亚型，该亚型参与急性炎症和纤维化过程，并揭示了其在心肌缺血再灌注后的作用机制	研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类中验证这些发现	探讨心肌缺血再灌注后巨噬细胞的异质性和转化机制	心肌缺血再灌注后的巨噬细胞及其在炎症和纤维化中的作用	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用S100a9小鼠建立心肌缺血再灌注模型，并进行了骨髓来源的巨噬细胞再灌注实验
7268	2024-08-07	Tumor cell senescence-induced macrophage CD73 expression is a critical metabolic immune checkpoint in the aging tumor microenvironment 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.91119 PMID:38323313	研究论文	本研究探讨了衰老细胞在肿瘤微环境中的代谢重塑作用，特别是肿瘤细胞诱导的肿瘤相关巨噬细胞CD73上调对腺苷积累的影响	首次揭示了衰老肿瘤微环境的代谢景观，特别是肿瘤细胞诱导的肿瘤相关巨噬细胞CD73上调对腺苷积累的影响	NA	探索从代谢角度增强衰老细胞诱导的抗肿瘤免疫的精确靶点	衰老细胞在肿瘤微环境中的代谢重塑作用	数字病理学	肺癌	流式细胞术, 免疫荧光染色, 单细胞转录组测序	NA	肿瘤间质液, 临床样本	使用8 Gy×3放射治疗或顺铂化疗诱导的衰老模型, 以及10 Gy照射或顺铂处理的模型
7269	2024-08-04	Integrating leiomyoma genetics, epigenomics, and single-cell transcriptomics reveals causal genetic variants, genes, and cell types 2024-Feb-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-45382-0 PMID:38326302	研究论文	本研究整合了基因组学、表观基因组学和单细胞转录组学，以揭示与子宫纤维瘤相关的遗传变异、基因和细胞类型	首次将多组学数据与特定位点的表观遗传编辑方法相结合，识别与疾病相关的基因和细胞类型	具体的遗传变异和基因靶点之间的因果关系仍然理解不足	探讨与子宫纤维瘤相关的遗传因素及其生物机制	与子宫纤维瘤相关的遗传变异和基因	数字病理学	NA	CRISPR	NA	基因组数据、转录组数据、单细胞基因表达数据	24个与子宫纤维瘤相关的风险位点，394个基因
7270	2024-08-07	The HSP90-MYC-CDK9 network drives therapeutic resistance in mantle cell lymphoma 2024-Feb-07, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1 DOI:10.1186/s40164-024-00484-9 PMID:38326887	研究论文	研究探讨了在套细胞淋巴瘤中，HSP90-MYC-CDK9网络如何驱动对Bruton酪氨酸激酶抑制剂和CAR-T疗法的抗药性	揭示了HSP90-MYC-CDK9网络是治疗抗性的主要驱动力，并提出了药物联合靶向HSP90和CDK9以减少MYC活性的策略	NA	解析套细胞淋巴瘤中对Bruton酪氨酸激酶抑制剂和CAR-T疗法的连续抗药性的潜在机制	套细胞淋巴瘤患者样本	数字病理学	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	66个样本来自25名患者
7271	2024-08-04	Single-cell transcriptomics reveals that glial cells integrate homeostatic and circadian processes to drive sleep-wake cycles 2024-Feb, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-023-01549-4 PMID:38263460	研究论文	本研究揭示了胶质细胞如何整合生理平衡和昼夜节律过程以驱动睡眠-觉醒周期	发现胶质细胞在睡眠生理平衡和昼夜节律之间的交互作用，以及其基因表达如何影响睡眠动态	研究限制在特定的果蝇模型，结果可能无法直接推广到其他物种	研究不同脑细胞群体中昼夜节律和睡眠生理过程的分子影响及其相互作用	成年人果蝇的大脑胶质细胞及其基因表达	数字病理学	NA	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	成年人果蝇的大脑样本
7272	2024-08-04	Increased heterogeneity in expression of genes associated with cancer progression and drug resistance 2024-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101879 PMID:38262110	研究论文	本文探讨了与癌症进展及药物耐受性相关的基因表达噪声的增加。	通过单细胞RNA测序数据，识别出37个在肺腺癌患者癌症进展过程中表现出表达噪声增加趋势的基因，揭示了线粒体在异质性生成中的重要作用。	该研究对实际癌症患者的表达噪声变化的探讨仍然不足，具体机制尚需进一步研究。	分析癌症进展过程中基因表达噪声的变化，以揭示肿瘤内部异质性的生成机制。	研究对象为不同阶段的肺腺癌患者的基因表达噪声。	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	不同阶段的肺腺癌患者的单细胞 RNA 数据
7273	2024-08-07	The role of tertiary lymphoid structure and B cells in nasopharyngeal carcinoma: Based on bioinformatics and experimental verification 2024-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.101885 PMID:38295746	研究论文	本研究探讨了鼻咽癌中三级淋巴结构（TLS）和浸润B细胞的转录组特征及预后作用	首次通过单细胞RNA测序分析揭示了鼻咽癌中不同B细胞亚群的转录特征，并验证了B细胞和TLS作为鼻咽癌患者生存预后标志物的可能性	NA	探究鼻咽癌中浸润B细胞和TLS的转录组特征及其临床相关性	鼻咽癌患者的转录组数据和临床样本	数字病理学	鼻咽癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	88名鼻咽癌患者
7274	2024-08-07	Newcastle disease virus infection remodels plasma phospholipid metabolism in chickens 2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.108962 PMID:38322989	研究论文	本文研究了新城疫病毒感染对鸡血浆磷脂代谢网络的影响	首次揭示了新城疫病毒感染如何重塑鸡血浆磷脂代谢网络	NA	探讨新城疫病毒感染对鸡血浆代谢网络的影响	鸡血浆磷脂代谢网络及肺组织细胞	NA	新城疫	代谢组学和脂质组学分析，单细胞RNA测序	NA	代谢数据，RNA序列数据	具体样本数量未提及
7275	2024-08-07	A single cell atlas of circulating immune cells involved in diabetic retinopathy 2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.109003 PMID:38327792	研究论文	本研究聚焦于探讨循环免疫细胞在糖尿病视网膜病变（DR）发展中的确切作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了健康对照组、非糖尿病视网膜病变患者和糖尿病视网膜病变患者循环免疫细胞中独特的差异表达基因和通路，并发现JUND在糖尿病视网膜病变患者PBMCs中的上调	NA	研究循环免疫细胞在糖尿病视网膜病变发展中的作用	糖尿病视网膜病变患者的循环免疫细胞和视网膜微血管内皮细胞	数字病理学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
7276	2024-08-04	Spatial and single-cell analyses uncover links between ALKBH1 and tumor-associated macrophages in gastric cancer 2024-Feb-06, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-024-03232-5 PMID:38317214	研究论文	这项研究揭示了ALKBH1与胃癌肿瘤相关巨噬细胞之间的联系	本研究通过多组学方法确认ALKBH1作为胃腺癌的潜在诊断生物标志物，并探讨了其在肿瘤免疫微环境中的作用	本研究的数据来源于公共数据库，可能受限于样本选择的代表性和数据的完整性	探讨ALKBH1在胃腺癌的临床和病理相关性及其在精准肿瘤学中的潜力	研究对象为60例胃腺癌患者样本及相关的公共基因组数据	数字病理学	胃癌	空间转录组学，单细胞RNA测序	NA	基因组数据，转录组数据	60例胃腺癌患者样本
7277	2024-08-04	Smith-specific regulatory T cells halt the progression of lupus nephritis 2024-Feb-06, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-45056-x PMID:38321013	研究论文	这篇文章研究了Smith特异性调节性T细胞在狼疮性肾炎进展中的作用	通过生物物理亲和力结合测定识别了HLA-DR15限制的免疫优势Sm T细胞表位，并利用高通量单细胞测序识别了高亲和力的Sm特异性T细胞受体	研究主要集中在特定的Sm T细胞受体，可能缺乏对其他自体反应性的考虑	探讨Sm特异性调节性T细胞在系统性红斑狼疮中的治疗潜力	对来自有抗Sm和HLA-DR15阳性的系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞进行研究	数字病理学	狼疮性肾炎	单细胞测序	人源化小鼠模型	细胞数据	来自系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞
7278	2024-08-07	A clinically applicable connectivity signature for glioblastoma includes the tumor network driver CHI3L1 2024-Feb-06, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-45067-8 PMID:38320988	研究论文	本文通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和染料摄取方法建立了一种适用于临床的胶质母细胞瘤（GB）连接性特征，并通过细胞钙信号记录和临床相关性进行了验证	首次建立了基于单细胞RNA测序的胶质母细胞瘤连接性特征，并验证了其在患者预后中的应用	NA	研究胶质母细胞瘤的肿瘤微管（TM）连接性对肿瘤进展和治疗抵抗的影响	胶质母细胞瘤细胞及其连接性特征	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）	NA	RNA	包括来自患者的大量胶质母细胞瘤样本
7279	2024-08-07	Integrated bioinformatics analysis of SEMA3C in tongue squamous cell carcinoma using machine-learning strategies 2024-Feb-06, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-024-03247-y PMID:38321460	研究论文	本研究通过生物信息学分析和机器学习策略，识别并验证了舌鳞状细胞癌（TSCC）中的关键生物标志物SEMA3C	首次报道SEMA3C在舌鳞状细胞癌中的作用，表明其上调可能成为未来预测诊断、预防、预后评估和个性化医疗服务的关键潜在生物标志物	NA	旨在通过生物信息学分析识别和验证舌鳞状细胞癌的潜在生物标志物	舌鳞状细胞癌（TSCC）及其生物标志物SEMA3C	机器学习	口腔癌	单细胞RNA测序（ScRNA-seq）	NA	RNA表达数据	涉及来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的舌鳞状细胞癌患者的临床和RNA表达信息
7280	2024-08-07	Single-cell analysis reveals alterations in cellular composition and cell-cell communication associated with airway inflammation and remodeling in asthma 2024-Feb-05, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-024-02706-4 PMID:38317239	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了哮喘中气道炎症和重塑相关的细胞组成变化和细胞间通讯机制	首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了哮喘模型中细胞组成和细胞间通讯的变化，特别是GdT17细胞和巨噬细胞在炎症和重塑中的作用	研究仅使用了小鼠模型，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性和可靠性	确定哮喘中的关键细胞类型及其病理机制	哮喘中的细胞组成和细胞间通讯	数字病理学	哮喘	单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	基因表达数据	16周龄的尘螨诱导哮喘小鼠模型3只和对照组3只