单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7521 篇文献，本页显示第 7241 - 7260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7241 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the pig cecum at various developmental stages
2024-Jan-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对不同发育阶段的猪盲肠细胞进行了全面的转录组分析 | 首次揭示了猪盲肠在不同发育阶段的单细胞基因表达图谱，并发现了多种细胞类型及其特异性基因和转录因子 | NA | 探究猪盲肠在不同发育阶段的细胞异质性和功能 | 猪盲肠在不同发育阶段的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 45,572个细胞，来自7个不同发育阶段的猪盲肠样本 |
| 7242 | 2024-08-05 |
Construction and validation of a mitochondria-associated genes prognostic signature and immune microenvironment characteristic of sepsis
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111275
PMID:37995567
|
研究论文 | 本文研究了与脓毒症相关的线粒体基因预后模型及其免疫微环境特征 | 建立了脓毒症的线粒体预后模型，并探讨了其与免疫微环境的关系 | 尚未明确线粒体与脓毒症免疫微环境之间的所有交互机制 | 旨在构建线粒体相关基因的预后模型来预测脓毒症患者的预后 | 研究对象为脓毒症患者的临床血样和线粒体相关基因 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序 | NA | 临床血样 | 5个与脓毒症相关的线粒体基因 |
| 7243 | 2024-08-05 |
Identifying the critical oncogenic mechanism of LDHA based on a prognostic model of T-cell synthetic drivers
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111265
PMID:38000233
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研究论文 | 本研究揭示了与T细胞合成驱动因子相关的预后模型在肺腺癌中的重要性 | 首次展示了LDHA在肺腺癌恶性进展中的关键作用，并开发了一个相关的预后模型 | 缺乏对其他类型肿瘤的综合分析，可能对广泛应用有所限制 | 改善肺腺癌的免疫疗法效果 | 关注肺腺癌患者的T细胞合成驱动因子 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | Lasso Cox回归模型 | 临床数据 | NA |
| 7244 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing indicates cordycepin remodels the tumor immune microenvironment to enhance TIGIT blockade's anti-tumor effect in colon cancer
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111268
PMID:37992442
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果及其对肿瘤免疫微环境的重组作用 | 发现虫草素治疗能显著增强Cd226基因的表达，从而提高TIGIT阻断疗法的效果，并通过单细胞RNA测序证实了这一联合疗法在肿瘤免疫微环境中对NK细胞和CD8 T细胞的积极影响 | NA | 研究虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果 | 结肠癌肿瘤模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了MC38肿瘤模型中的免疫细胞进行分析 |
| 7245 | 2024-08-07 |
Transcriptomic and genomic profiling of multiple primary colorectal cancers reveals intratumor heterogeneity and a distinct immune microenvironment
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111276
PMID:38016348
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研究论文 | 本研究报告了单一患者多发性原发性结直肠癌（MPCC）不同肿瘤病变的肿瘤内基因组和免疫学异质性 | 首次通过全外显子测序和单细胞RNA测序揭示了MPCC中肿瘤病变的分子和微环境特征，特别是发现了横结肠肿瘤病变中黏膜相关不变T细胞（MAIT）的富集 | 研究样本量较小，仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性 | 探索MPCC患者不同原发部位肿瘤病变的分子和微环境特征 | 来自同一72岁男性MPCC患者的三个肿瘤病变，分别位于横结肠肝曲、乙状结肠和直肠 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、转录组数据 | 三个肿瘤样本 |
| 7246 | 2024-08-07 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing in double-hit lymphoma: IMPDH2 induces the progression of lymphoma by activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway" [Int. Immunopharmacol. 125(Part A) (2023) 111125]
2024-Jan-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.111292
PMID:38042635
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7247 | 2024-08-07 |
Inferring Gene Regulatory Networks and Predicting the Effect of Gene Perturbations via IQCELL
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2022_465
PMID:36790623
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研究论文 | IQCELL平台从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络，并模拟正常和扰动条件下的网络行为 | 开发了IQCELL平台，能够从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络，并模拟其在正常和扰动条件下的行为 | NA | 提供使用IQCELL平台从原始数据集推断基因调控网络的详细指南 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 布尔网络 | RNA测序数据 | NA |
| 7248 | 2024-08-07 |
Single-Cell mRNA-sncRNA Co-sequencing of Preimplantation Embryos
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_487
PMID:37278916
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研究论文 | 本文介绍了一种方法，通过在同一胚胎细胞上同时进行单细胞RNA测序（Smart-Seq2）和单细胞小非编码RNA测序（Small-Seq），来阐明胚胎的细胞动力学 | 本文创新地结合了单细胞RNA测序和小非编码RNA测序技术，以更全面地研究胚胎细胞的多样性和异质性 | NA | 研究胚胎细胞的分子机制和细胞动力学 | 胚胎细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（Smart-Seq2）和小非编码RNA测序（Small-Seq） | NA | RNA | NA |
| 7249 | 2024-08-07 |
Evaluation of Stem-Cell Embryo Models by Integration with a Human Embryo Single-Cell Transcriptome Atlas
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2023_492
PMID:37351839
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研究论文 | 本文通过整合人类胚胎单细胞转录组图谱，评估了干细胞胚胎模型的转录组景观 | 利用单细胞RNA测序技术，实现了对早期胚胎分子过程的深入理解，并提供了评估早期胚胎细胞组成的手段 | 不同实验室和不同技术获取的单细胞数据集之间的比较存在挑战 | 通过比较分析胚胎的转录组景观，以更好地理解和改进基于干细胞的胚胎模型 | 人类囊胚模型（blastoids）与人类胚胎数据集及二维体外早期发育模型系统的整合分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 7250 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics is revolutionizing the improvement of plant biotechnology research: recent advances and future opportunities
2024-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2165900
PMID:36775666
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评论 | 单细胞转录组学的现代进展促进了植物生物技术研究 | 提供了单细胞转录组学在植物中的最新进展，并探讨了其未来研究的潜力 | 分析了单细胞技术面临的各种技术障碍和固有限制 | 探讨单细胞转录组学在植物生物技术中的应用和发展 | 植物的单细胞转录组数据 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 7251 | 2024-08-05 |
Skin single-cell transcriptomics reveals a core of sebaceous gland-relevant genes shared by mice and humans
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10008-8
PMID:38310227
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠和人类皮肤中与皮脂腺相关的基因的核心。 | 首次通过单细胞转录组学方法比较了小鼠和人类皮脂腺相关基因的表达差异，发现种间间存在显著差异。 | 研究中观察到在小鼠和人类样本中，皮脂腺特有转录本的重叠极少，可能限制了其跨物种的比较分析。 | 探索并比较小鼠和人类皮脂腺中特有的基因表达模式。 | 小鼠和人类的皮肤样本，通过单细胞RNA测序进行分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠与人类皮肤样本 |
| 7252 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analyses reveal critical regulators of spermatogonial stem cell fate transitions
2024-Feb-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10072-0
PMID:38310206
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了精原干细胞命运转变的关键调控因子 | 本研究首次描述了静止状态的精原干细胞亚群，即Eomes+精原细胞，并提供了精原干细胞命运决定的动态转录图谱 | NA | 探索未分化精原细胞亚群的分子特征和关键调控因子 | 精原干细胞及其前体细胞的命运转变 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 从小鼠中分离的未分化精原细胞 |
| 7253 | 2024-08-05 |
Comparison of preparation methods of rat kidney single-cell suspensions
2024-02-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53270-2
PMID:38307992
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研究论文 | 本文探讨了一种名为逐步酶消化（StE）的方法以制备大鼠整个肾脏组织的单细胞悬液。 | StE方法在收获率、单细胞率和细胞活性方面优于传统的机械研磨法和简单酶消化法。 | 文章没有提到本文方法的临床应用或长期效果的评估。 | 研究旨在提高大鼠肾脏单细胞悬液的制备效率与质量。 | 研究对象为大鼠的整个肾脏组织。 | 数字病理学 | NA | 酶消化 | NA | NA | NA |
| 7254 | 2024-08-05 |
Analysis of brain and blood single-cell transcriptomics in acute and subacute phases after experimental stroke
2024-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01711-x
PMID:38177281
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研究论文 | 本研究探讨了缺血性中风后脑部和血液单细胞转录组学的变化 | 首次揭示了缺血性中风后微胶质细胞、单核细胞来源的巨噬细胞和中性粒细胞的时间动态和多样性 | 对外周白细胞和脑内常驻细胞的具体动态变化尚不够了解 | 研究缺血性中风后脑细胞和血细胞的转录组动态 | 小鼠在缺血性中风后2天和14天的脑和血液细胞 | 数字病理学 | 脑卒中 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠样本，具体数量未提供 |
| 7255 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics analysis of cellular heterogeneity and immune mechanisms in neurodegenerative diseases
2024-Feb, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16242
PMID:38221677
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综述 | 本文章主要分析了单细胞转录组学在神经退行性疾病中的细胞异质性和免疫机制方面的应用 | 强调了单细胞转录组技术在揭示神经退行性疾病中细胞异质性和免疫机制方面的重要性 | 未明确提及具体的实验研究或数据支持 | 探讨神经退行性疾病的发病机制及开发新的治疗方法 | 神经退行性疾病中的单细胞转录组和免疫细胞 | 数字病理 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 7256 | 2024-08-07 |
Association of HBsAg levels with differential gene expression in NK, CD8 T, and memory B cells in treated patients with chronic HBV
2024-Feb, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100980
PMID:38314025
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研究论文 | 本研究探讨了在慢性HBV感染治疗过程中，循环HBsAg水平对NK、CD8 T和记忆B细胞基因表达的影响。 | 首次发现HBsAg对NK、CD8 T和记忆B细胞亚群在血液和肝脏中有特定影响。 | 研究样本量较小，且仅限于接受NUC治疗的慢性HBV感染患者。 | 旨在研究高和低循环HBsAg水平对免疫调节的影响，以增进对HBV免疫反应的理解。 | 慢性HBV感染治疗中的NK、CD8 T和记忆B细胞。 | 免疫学 | 肝炎 | 10x Genomics单细胞RNA测序 | NA | RNA | 18名接受tenofovir/entecavir治疗的慢性HBV感染患者 |
| 7257 | 2024-08-05 |
The molecular mechanism of "Dahuang-Shengjiang-Banxia decoction" in the treatment of diabetic kidney disease was verified based on network pharmacology and molecular docking
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24776
PMID:38312712
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研究论文 | 探索大黄生姜半夏汤在糖尿病肾病中的分子机制 | 利用网络药理学和分子对接技术，揭示了大黄生姜半夏汤对糖尿病肾病的多成分、多途径和多靶点效应 | 未提及具体的临床试验数据支持所述结果 | 研究大黄生姜半夏汤治疗糖尿病肾病的分子机制 | 大黄生姜半夏汤及其在糖尿病肾病中的有效成分和靶点 | 数字药理学 | 糖尿病肾病 | 网络药理学、分子对接 | NA | 靶点数据、成分数据 | 共筛选出177种大黄生姜半夏汤成分和2906种糖尿病肾病靶点 |
| 7258 | 2024-08-07 |
Taste receptor type 1 member 3 is required for the fertility of male mice
2024-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24577
PMID:38312691
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research paper | 本文研究了味觉受体类型1成员3（TAS1R3）在雄性小鼠生育中的作用 | 首次揭示了TAS1R3通过PKA/CREB/StAR信号通路在雄性生育中的关键作用 | NA | 探究TAS1R3对雄性小鼠生殖功能的影响 | 野生型和敲除（KO）小鼠 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 野生型和敲除小鼠 |
| 7259 | 2024-08-05 |
Cebp1 and Cebpβ transcriptional axis controls eosinophilopoiesis in zebrafish
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45029-0
PMID:38280871
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研究论文 | 本研究分析了斑马鱼中嗜酸性粒细胞的分化、分布和调节 | 建立了一个特异性标记嗜酸性粒细胞谱系的斑马鱼报告线，并揭示了Cebp1和Cebpβ转录轴在嗜酸性粒细胞分化中的作用 | 未明确提到本研究的限制 | 研究嗜酸性粒细胞的发育模式和调节机制 | 斑马鱼嗜酸性粒细胞谱系及其发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了特异性标记的嗜酸性粒细胞谱系细胞 |
| 7260 | 2024-08-05 |
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) deletion in myeloid cells augments cholestatic liver injury
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52710-3
PMID:38273071
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体(TRAIL)在骨髓细胞中的缺失如何加重胆汁淤积性肝损伤。 | 研究发现TRAIL源自招募的巨噬细胞，并抑制DR细胞扩展，从而限制胆汁淤积性肝损伤。 | 本文并未涉及湿剂量的不同或不同动物模型的比较，可能限制了其结果的广泛适用性。 | 研究TRAIL在骨髓细胞中的作用及其在胆汁淤积性肝损伤中的影响。 | 涉及Wild type (WT)、Trail和骨髓特异性Trail缺失的小鼠模型。 | 数字病理学 | 肝病 | 高维量子显微技术，空间转录组分析 | 小鼠模型 | 生物样本 | 包括Wild type、Trail和Trail缺失小鼠的多组小鼠 |