单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7670 篇文献，本页显示第 7221 - 7240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7221 | 2024-08-07 |
Spatiotemporal modulation of growth factors directs the generation of multilineage mouse embryonic stem cell-derived mammary organoids
2024-Jan-22, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.003
PMID:38159568
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研究论文 | 本文通过定向分化小鼠胚胎干细胞（mESCs），报道了多谱系ESC衍生乳腺类器官（MEMOs）的生成 | 首次通过序列激活骨形态发生蛋白4（BMP4）和甲状旁腺激素相关蛋白（PTHrP）以及抑制hedgehog（HH）信号通路，诱导真皮间充质转化为乳腺特异性间充质，生成多谱系ESC衍生乳腺类器官 | NA | 研究外胚层附属物的发育，并为再生医学和疾病建模提供基础 | 小鼠胚胎干细胞衍生乳腺类器官的生成及其功能 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7222 | 2024-08-04 |
An aging-related immune landscape in the hematopoietic immune system
2024-Jan-02, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00403-2
PMID:38169405
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研究论文 | 本文描述了年轻和老年小鼠的脾脏和骨髓的造血免疫图谱 | 研究揭示了老化过程中造血干细胞的功能和组成发生了重大变化 | 未提及具体的样本数量和多样性 | 探讨老龄化对造血免疫系统的整体影响 | 年轻和老年小鼠的造血免疫系统 | 数字病理 | 老年疾病 | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 7223 | 2024-08-07 |
leptin b and its regeneration enhancer illustrate the regenerative features of zebrafish hearts
2024-Jan, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.556
PMID:36495292
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研究论文 | 本研究利用leptin b及其组织再生增强子元素（TREE）分析了斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞（CMs）的异质性 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析，揭示了损伤后内皮/心内膜（EC）的激活及其在再生过程中的作用 | NA | 探讨斑马鱼心脏再生过程中的细胞类型和因子 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞（CMs） | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7224 | 2024-08-07 |
GAS6 attenuates sepsis-induced cardiac dysfunction through NLRP3 inflammasome-dependent mechanism
2024-01, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究探讨了GAS6在脓毒症引起的心脏功能障碍中的心肌调节作用及其通过NLRP3炎症小体的机制 | 首次揭示了GAS6通过调节NLRP3炎症小体减轻脓毒症引起的心脏功能障碍 | NA | 研究GAS6在脓毒症中的心肌保护作用及其机制 | GAS6在脓毒症中的作用及其对心脏功能的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括脓毒症患者和脓毒症小鼠模型 |
| 7225 | 2024-08-07 |
A deep learning adversarial autoencoder with dynamic batching displays high performance in denoising and ordering scRNA-seq data
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109027
PMID:38361616
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研究论文 | 本文提出了一种动态批量对抗自编码器（DB-AAE），用于提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的去噪效果和生物信号保留 | DB-AAE能够直接从输入数据中捕获最优特征，并增强特征保留，包括细胞类型特异性基因表达模式 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的质量和可靠性 | scRNA-seq数据的去噪和生物信号保留 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 对抗自编码器（AAE） | 基因表达数据 | NA |
| 7226 | 2024-08-04 |
Biomarkers and prognostic factors of PD-1/PD-L1 inhibitor-based therapy in patients with advanced hepatocellular carcinoma
2024-Feb-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00535-z
PMID:38355603
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综述 | 本文总结了PD-1/PD-L1抑制剂在晚期肝细胞癌患者中的生物标志物和预后因素。 | 首次通过评估单细胞测序和空间转录组学的最新进展，揭示肿瘤异质性以及其生物标志物与预后的关系 | 可能缺乏关于某些预后因素和生物标志物的具体临床应用示例 | 探讨晚期肝细胞癌患者中使用PD-1/PD-L1抑制剂的生物标志物与预后因素 | 晚期肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的相关标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 生物标志物分析 | NA |
| 7227 | 2024-08-07 |
Glycosylation-related genes mediated prognostic signature contribute to prognostic prediction and treatment options in ovarian cancer: based on bulk and single‑cell RNA sequencing data
2024-Feb-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11908-4
PMID:38355446
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，识别与卵巢癌相关的糖基化相关基因，构建预测预后和免疫治疗的基因签名 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据构建糖基化相关基因签名，用于卵巢癌的预后预测和治疗策略 | NA | 识别卵巢癌中的主要糖基化相关基因，并构建有效的基因签名以预测预后和免疫治疗 | 卵巢癌患者的糖基化相关基因及其在预后和免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | COX回归, LASSO回归 | RNA测序数据 | 1187个糖基化相关基因, 16个基因签名 |
| 7228 | 2024-08-07 |
Fine particulate matter 2.5 induces susceptibility to Pseudomonas aeruginosa infection via expansion of PD-L1high neutrophils in mice
2024-Feb-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02640-x
PMID:38355515
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研究论文 | 本研究探讨了细颗粒物PM2.5暴露如何通过扩张表达PD-L1的高中性粒细胞导致小鼠对铜绿假单胞菌感染的易感性增加 | 首次揭示了PM2.5暴露通过扩张PD-L1高表达的中性粒细胞，影响其吞噬功能，从而增加对铜绿假单胞菌感染的易感性 | 研究主要在动物模型中进行，未来需在人体中验证相关发现 | 探讨PM2.5暴露对呼吸系统健康的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的中性粒细胞和铜绿假单胞菌感染 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多只小鼠 |
| 7229 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomics uncovers an enhanced association between the prion protein gene expression and vesicle dynamics signatures in glioblastomas
2024-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11914-6
PMID:38347462
|
研究论文 | 本研究揭示了朊蛋白基因表达与胶质母细胞瘤中的囊泡动力学特征之间增强的关联。 | 本研究首次展示了PrPC作为胶质母细胞瘤中囊泡生物学调节因子的潜在角色，并且引入了一种新的研究工具GBMdiscovery。 | 本研究主要依赖于公开的RNA测序数据，可能存在数据偏倚和适用性限制。 | 研究PRNP/PrPC在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其分子机制。 | 以患者来源的胶质母细胞瘤为研究对象，分析其RNA测序数据。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及来自四项独立研究的患者来源胶质母细胞瘤的公开RNA测序数据 |
| 7230 | 2024-08-04 |
Residual ANTXR1+ myofibroblasts after chemotherapy inhibit anti-tumor immunity via YAP1 signaling pathway
2024-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45595-3
PMID:38346978
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研究论文 | 这篇文章探讨了化疗后残留的ANTXR1+肌成纤维细胞如何通过YAP1信号通路抑制抗肿瘤免疫。 | 首次揭示了高分级浆液性卵巢癌中化疗对CAF群体的影响及其与抗肿瘤免疫的关系，特别是YAP1信号通路的作用。 | 研究主要集中在高分级浆液性卵巢癌，可能不适用于其他类型的癌症。 | 研究化疗对癌症相关成纤维细胞群体的影响，并探讨其对抗肿瘤免疫的作用。 | 针对在高分级浆液性卵巢癌中发现的不同CAF群体进行研究，特别是CAF-S1群体。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞分析、空间转录组学和免疫组化 | NA | 生物组织样本 | NA |
| 7231 | 2024-08-04 |
Hypoblast from human pluripotent stem cells regulates epiblast development
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06871-2
PMID:38052228
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研究论文 | 本文报告了利用人类多能干细胞生成真实的原始膜细胞的方法及其在胚胎发育中的作用 | 提出了利用人类多能干细胞生成的原始膜细胞在体外自组织模型中的创新应用 | 受伦理和法律限制，后植入阶段的研究受到限制 | 研究人类胚胎发育过程中的原始膜细胞及其机制 | 人类多能干细胞及其衍生的原始膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 三维双层结构模型 | 细胞 | NA |
| 7232 | 2024-08-07 |
A New Graph Autoencoder-Based Consensus-Guided Model for scRNA-seq Cell Type Detection
2024-Feb, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2022.3190289
PMID:35857730
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研究论文 | 本文提出了一种基于图自编码器（GAE）的共识引导模型（scGAC），用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）细胞类型检测 | 该模型通过预处理数据生成多个顶级特征数据集，利用GAE进行特征学习，并通过距离融合方法进行相似性学习，最终迭代整合一致的相似性矩阵，提高了细胞类型识别的准确性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 基因组学 | NA | scRNA-seq | 图自编码器（GAE） | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 7233 | 2024-08-07 |
Sstr2 Defines the Cone Differentiation-Competent Late-Stage Retinal Progenitor Cells in the Developing Mouse Retina
2024-Jan-12, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad073
PMID:37935630
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了C57BL/6J小鼠发育中视网膜的转录组，发现生长抑素受体2（Sstr2）在具有光感受器分化潜能的晚期视网膜祖细胞（RPCs）中特异性表达，并验证了Sstr2+细胞在体内分化为视锥细胞、无长突细胞和水平细胞的能力。 | 首次揭示了Sstr2在晚期RPCs中的特异性表达，并证明了Sstr2+细胞具有分化为视锥细胞的能力，为视网膜退行性疾病的治疗提供了新的生物标志物。 | NA | 旨在识别和富集能够分化为视锥细胞的视网膜祖细胞，以用于视网膜退行性疾病的干细胞治疗。 | C57BL/6J小鼠的发育中视网膜及其祖细胞。 | NA | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7234 | 2024-08-07 |
High migratory activity of dermal sheath cup cells associated with the clinical efficacy of autologous cell-based therapy for pattern hair loss
2024-Jan, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.11.003
PMID:38016881
|
研究论文 | 本文研究了真皮鞘杯细胞（DSC）在自体细胞疗法中治疗男性及女性脱发的效果及其机制 | 首次揭示了ITGA6阳性DSC细胞的高迁移活性可能通过促进细胞迁移到附近的毛囊来增强细胞疗法的效果 | NA | 探究DSC细胞在细胞疗法中的有效性及其作用机制 | DSC细胞的基因表达及其在细胞疗法中的效果 | NA | 脱发 | bulk转录组分析、定量聚合酶链反应、单细胞转录组分析、活细胞成像结合免疫染色 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | NA |
| 7235 | 2024-08-07 |
Identification and Characterization of PrognosticMacrophage Subpopulations for HumanEsophagealCarcinoma
2024-Feb-14, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究旨在探讨巨噬细胞亚群与食管癌进展之间的关系，并分析巨噬细胞作为食管癌治疗新策略的潜力 | 本研究首次在单细胞水平上分析了食管癌组织中巨噬细胞的多样性、分布和分化轨迹，并鉴定出一种具有预后意义的巨噬细胞亚型（HSPA6+巨噬细胞） | 巨噬细胞的肿瘤内异质性限制了基于巨噬细胞的免疫疗法在食管癌患者中的临床应用 | 分析食管癌中巨噬细胞的多样性、分化轨迹和细胞间通讯，并探讨其预后意义 | 食管癌中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 在GSE154763数据集中，食管癌组织和癌旁组织中共鉴定出8种细胞类型，食管癌组织中的巨噬细胞进一步分为5个细胞簇 |
| 7236 | 2024-08-07 |
Construction of a New Ferroptosis-related Prognosis Model for Survival Prediction in Colorectal Cancer
2024-Feb-14, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究旨在构建一个新的铁死亡相关预后模型，用于结直肠癌（CRC）患者的生存预测，并探索该基因签名的分子功能潜力 | 本研究开发了一个基于铁死亡相关基因的预后签名，并验证了其在结直肠癌预后评估中的有效性 | NA | 开发一个铁死亡相关基因签名，用于指导结直肠癌的预后预测并探索其潜在的分子功能 | 结直肠癌（CRC）患者的预后预测 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），基因表达综合分析（ssGSEA），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的单细胞RNA测序数据GSE161277和转录组测序数据GSE17537及TCGA-CRC，共259个与铁死亡相关的基因 |
| 7237 | 2024-08-07 |
Author Correction: Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with CEFCON
2024-Feb-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45929-1
PMID:38351163
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7238 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of cervical exfoliated cells reveals potential biomarkers and cellular pathogenesis in cervical carcinogenesis
2024-Feb-12, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06522-y
PMID:38346944
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析宫颈脱落细胞，揭示了宫颈癌发生过程中的潜在生物标志物和细胞病理机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了宫颈病变进展中免疫细胞和上皮细胞的变化，并识别出脂质相关巨噬细胞作为促进肿瘤的元素 | 研究样本量相对较小，且未涉及更大范围的临床验证 | 探究宫颈癌发生过程中的多细胞生态系统，并识别早期检测的潜在生物标志物 | 宫颈脱落细胞，包括正常宫颈、低级别鳞状上皮内病变、高级别鳞状上皮内病变和恶性病变 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 56,173个宫颈脱落细胞，来自15个样本 |
| 7239 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals alterations in perivascular macrophage lipid metabolism in the onset of Wooden Breast myopathy in broiler chickens
2024-02-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53904-5
PMID:38342952
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研究论文 | 本研究旨在利用空间转录组学特征化与木胸肌病微观特征相关的细胞类型特异性表达谱 | 揭示了在木胸肌病早期阶段中周围血管巨噬细胞脂质代谢的改变 | 样本量较小，仅使用了三只鸡的肌肉样本 | 研究木胸肌病早期的细胞互作和基因表达模式 | 23天大肉鸡的右胸大肌的肌肉样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 肌肉样本 | 3只肉鸡 |
| 7240 | 2024-08-04 |
A call for a unified and multimodal definition of cellular identity in the enteric nervous system
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.15.575794
PMID:38293133
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研究论文 | 本研究呼吁在肠神经系统中建立统一和多模态的细胞身份定义 | 强调了技术和数据整合的重要性，并提出了使用多种先进技术以推动对肠神经元身份的全面理解 | 主要依赖转录组学数据，缺乏对组织的充分验证，导致在功能注释方面存在显著差异 | 旨在通过实施各种先进的技术和方法，以更全面地理解肠神经系统中的细胞身份 | 比较和分析小鼠与人类的肠神经系统数据集以及不同的研究结果 | 神经科学 | 肠道神经病 | 单细胞转录组技术，复合成像，电生理学，空间转录组学 | 人类多能干细胞（hPSC）模型 | 基因表达数据，组织样本数据 | NA |