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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7181 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immune microenvironment landscape of osteosarcoma before and after chemotherapy
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23601
PMID:38332885
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了化疗前后骨肉瘤患者的免疫微环境变化 | 首次详细描述了化疗对骨肉瘤免疫微环境的具体影响,包括免疫细胞组成的变化及其功能调整 | 研究样本量较小,且仅包括化疗前后的骨肉瘤组织,可能影响结果的普遍性 | 探讨化疗对骨肉瘤免疫微环境的影响及其机制 | 骨肉瘤患者的免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名未接受化疗的骨肉瘤患者和7名接受化疗的骨肉瘤患者的组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7182 | 2024-08-07 |
Multiscale spatial mapping of cell populations across anatomical sites in healthy human skin and basal cell carcinoma
2024-Jan-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313326120
PMID:38165934
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研究论文 | 本文创建了一个多尺度的健康皮肤和基底细胞癌(BCC)空间图谱,结合了光学相干断层扫描、单细胞RNA测序、空间全局转录组分析和原位测序技术,揭示了不同细胞群在特定组织环境中的定位。 | 本文首次通过多尺度空间图谱揭示了健康皮肤和基底细胞癌中细胞群的定位及其与组织环境的关系,特别是发现了与毛囊相关的细胞群在癌症中的扩张。 | NA | 旨在深入理解人体皮肤细胞在不同解剖部位和肿瘤形成中的差异。 | 健康人体皮肤和基底细胞癌中的细胞群及其空间分布。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 光学相干断层扫描、单细胞RNA测序、空间全局转录组分析、原位测序 | NA | 图像、基因序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 7183 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of ovarian cancer
2024-01-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05733-x
PMID:38182756
|
研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌微环境中的基质动态和肿瘤特异性特征 | 通过单细胞转录组学分析,识别了高基质和低基质肿瘤中免疫细胞和非免疫细胞的独特转录组景观 | 样本量较小,仅包括20个数据集 | 研究高级别浆液性卵巢癌微环境中基质细胞的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 卵巢癌(HGSOC)的微环境中的基质细胞亚型及其相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 20个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7184 | 2024-08-04 |
Pan-cancer and single-cell analysis reveal THRAP3 as a prognostic and immunological biomarker for multiple cancer types
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1277541
PMID:38333620
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研究论文 | 本研究揭示了THRAP3在多种癌症中的预后和免疫学标志物的潜力 | 首次全面分析了THRAP3在泛癌症中的作用,并验证了其在肺癌中的表达水平 | THRAP3的低表达在肺鳞状细胞癌中未得到详细探讨 | 探讨THRAP3在多种癌症中的生物学活性及其作为预后标志物的有效性 | 研究了THRAP3在肺癌及其他多种癌症中的表达和预后关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化(IHC)和单细胞测序(ScRNA-seq) | NA | 生物信息学数据库数据 | 在研究中利用了多种癌症类型的样本,具体样本数量未明示 | NA | NA | NA | NA |
| 7185 | 2024-08-04 |
The use of single-cell RNA-seq to study heterogeneity at varying levels of virus-host interactions
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011898
PMID:38236826
|
综述 | 本研究描述了利用单细胞RNA测序技术研究病毒感染异质性的方法。 | 提出使用单细胞RNA测序技术来研究病毒与宿主相互作用中存在的复杂性和细胞异质性。 | 强调了在不同尺度上分析单细胞RNA测序数据时的一些关键实验限制和方法选择。 | 研究病毒感染过程中的异质性及感染细胞人群的动态变化。 | 研究对象包括个别病毒粒子和感染个体之间的免疫反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成千上万的个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7186 | 2024-08-07 |
BHLHE40 drives protective polyfunctional CD4 T cell differentiation in the female reproductive tract against Chlamydia
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011983
PMID:38271477
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 首次揭示了Bhlhe40在调节CD4 T细胞分化和多功能反应中的关键作用,对抗沙眼衣原体感染 | NA | 研究Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应 | 免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序结合TCR分析 | NA | RNA | Bhlhe40缺陷小鼠和野生型小鼠的CD4 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7187 | 2024-08-07 |
MAPK-activated protein kinase 2 is associated with poor prognosis of glioma patients and immune inhibition in glioma
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1307992
PMID:38322416
|
研究论文 | 本研究探讨了MAPK激活蛋白激酶2(MAPKAPK2)在胶质瘤中的表达及其对患者预后和免疫抑制的影响 | 首次揭示了MAPKAPK2在胶质瘤中的临床意义和分子功能,特别是在细胞增殖、迁移、DNA损伤修复和免疫调节中的作用 | NA | 研究MAPKAPK2在胶质瘤中的临床意义和分子功能 | MAPKAPK2在胶质瘤组织中的表达及其对患者预后和免疫抑制的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组织化学、转录组测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 组织样本、RNA序列 | 使用了来自TCGA和CGGA的数据,具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 7188 | 2024-08-07 |
Development and Validation of a Novel Nomogram Integrated with Hypoxic and Lactate Metabolic Characteristics for Prognosis Prediction in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S446313
PMID:38333220
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种新型诺模图,该诺模图整合了缺氧和乳酸代谢特征,用于预测肝细胞癌的预后 | 本研究创新性地构建了一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型(HLPM),并开发了一个整合HLPM和临床特征的诺模图,用于肝细胞癌的预后预测 | NA | 旨在构建一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型,以评估肝细胞癌患者的生存和治疗反应,并开发一个整合这些特征的诺模图用于预后预测 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 诺模图 | 组织样本 | 14对组织样本和单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 7189 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell alternative splicing analyses reveal roles of TRA2B in myogenic differentiation
2024-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13545
PMID:37705195
|
研究论文 | 本研究采用Iso-seq和scRNA-seq技术分析在肌肉发生过程中TRA2B的作用及其选择性剪接的复杂性 | 本研究识别了61,146种全长异构体和38,022个选择性剪接事件,并发现了TRA2B在肌肉分化中的不同作用 | 未具体提到样本来源和数量的具体信息 | 探索肌肉发生过程中的选择性剪接模式及其调控机制 | 主要研究TRA2B在肌肉细胞中的选择性剪接调控 | 数字病理学 | NA | Iso-seq和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7190 | 2024-08-07 |
The efficient generation of functional human hepatocytes from chemically induced pluripotent stem cells
2024-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13540
PMID:37814474
|
研究论文 | 本文开发了一种模拟肝母细胞两阶段发育的分化协议,从化学诱导的多能干细胞(hCiPSCs)高效生成肝前体细胞 | 首次通过模拟肝母细胞的两阶段发育过程,实现了从hCiPSCs高效生成肝前体细胞和肝细胞 | NA | 探索从多能干细胞中高效生成功能性人肝细胞的方法 | 化学诱导的多能干细胞(hCiPSCs)及其分化生成的肝前体细胞和肝细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7191 | 2024-08-05 |
The unfolded protein response pathway as a possible link in the pathogenesis of COVID-19 and sepsis
2024-Jan-08, Archives of virology
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s00705-023-05948-7
PMID:38191819
|
研究论文 | 本研究揭示了在单细胞水平上COVID-19和脓毒症的发病机制中未折叠蛋白反应(UPR)通路的重要性 | 提供了COVID-19与脓毒症之间的共同发病机制的新分子视角 | 未在研究中提及具体的生物标志物或临床数据的长时间追踪 | 探讨COVID-19与脓毒症之间的潜在联系及其共同的发病机制 | COVID-19和脓毒症病例的单细胞RNA-seq数据及转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7192 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of mechanical loading on knee tibial cartilage in osteoarthritis
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111496
PMID:38224628
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了机械负荷对膝骨关节炎患者膝关节胫骨软骨中软骨细胞亚群的影响 | 首次识别出一种新的软骨细胞亚群HTC-C,并分析了其在不同机械负荷条件下的功能和细胞间相互作用 | 研究仅限于KOA患者的膝关节胫骨软骨,且样本量未具体说明 | 探究机械负荷对膝骨关节炎发展中软骨细胞亚群的影响及其分子机制 | 膝骨关节炎患者的膝关节胫骨软骨 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 7193 | 2024-08-07 |
Elevated enteric putrescine suppresses differentiation of intestinal germinal center B cells
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111544
PMID:38266445
|
研究论文 | 本研究探讨了外源性腐胺对肠道微环境中B细胞分化的影响 | 发现腐胺通过影响B细胞受体信号通路和脂肪酸氧化相关基因,抑制肠道B细胞分化,并揭示了腐胺在不同癌症中的免疫调节作用 | NA | 研究腐胺与B细胞成熟和代谢失调之间的因果关系及其机制 | 肠道微环境中的B细胞分化 | 免疫学 | NA | bulk RNA测序和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7194 | 2024-08-07 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
|
研究论文 | 本文通过结合体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体(TCR)测序,研究了Guillain-Barré综合征(GBS)中自身反应性T细胞的作用 | 首次鉴定出具有细胞毒性T辅助1(T1)样表型的自身反应性记忆CD4细胞和针对周围神经髓鞘抗原的稀有CD8 T细胞,并揭示了多克隆TCR谱系、短CDR3β长度、偏好HLA-DR限制和识别免疫优势表位 | NA | 揭示Guillain-Barré综合征中自身反应性T细胞的免疫机制 | Guillain-Barré综合征患者中的自身反应性T细胞 | NA | Guillain-Barré综合征 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | RNA | 超过1,000个自身反应性单T细胞克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 7195 | 2024-08-07 |
The Gut Microbiome Controls Liver Tumors via the Vagus Nerve
2024-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576951
PMID:38328040
|
研究论文 | 本文探讨了肠道微生物群通过迷走神经影响肝脏肿瘤的机制 | 首次揭示肠道微生物群通过迷走神经调节肝脏肿瘤的机制,并发现迷走神经通过乙酰胆碱影响CD8+ T细胞活性 | 研究主要集中在小鼠模型上,需要进一步在人体中验证 | 研究肠道微生物群与迷走神经在肝脏肿瘤发展中的相互作用 | 肝脏肿瘤、肠道微生物群、迷走神经、CD8+ T细胞 | NA | 肝脏肿瘤 | scRNA-seq | NA | 微生物群数据 | 涉及Rag1KO小鼠和无肿瘤小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 7196 | 2024-08-05 |
Molecular functional characterization of the setdb1 and its potential target gene sox5 illuminate the histone modification-mediated orchestration of gonadal development in Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis)
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148199
PMID:38253299
|
研究论文 | 该研究揭示了setdb1在中国舌鳎性别分化和生殖细胞发育中的作用 | 首次在中国舌鳎中详细描述了setdb1及其潜在靶基因sox5在性别发育调控中的分子机制 | 缺乏对setdb1在其他发育阶段的功能研究 | 探讨setdb1如何通过调控sox5的转录影响性别分化和生殖细胞发育 | 中国舌鳎的setdb1基因及其靶基因sox5 | 数字病理学 | NA | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列, RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7197 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics and the anatomical pathologist: Molecular meets morphology
2024-Mar, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.15093
PMID:37991396
|
小型综述 | 本文概述了空间转录组学方法及其在解剖病理学实践中的应用 | 本研究强调了与福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPE)兼容的空间转录组学技术的进展 | 目前这些技术仍主要在研究实验室中使用,对于在常规解剖病理学实践中的整合还需进一步发展 | 探讨空间转录组学在解剖病理学中的应用与潜力 | 空间转录组学技术及其与解剖病理学实践的关系 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7198 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the role of antigen presentation in liver metastatic breast cancer
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108896
PMID:38318373
|
研究论文 | 这篇文章深入分析了11例晚期乳腺癌患者的肝转移转录组特征 | 揭示了肝转移相关的抗原呈递功能障碍与肿瘤浸润T细胞的关系 | 样本量较小,仅为11例,可能影响结果的普遍性 | 研究肝转移乳腺癌中抗原呈递的作用 | 11例患有继发性肝癌的乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11例 | NA | NA | NA | NA |
| 7199 | 2024-08-07 |
Compartmentalization and synergy of osteoblasts drive bone formation in the regenerating fin
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108841
PMID:38318374
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向成骨细胞消融和电子显微镜技术,探讨了斑马鱼再生鳍中表皮、成骨细胞和非成骨细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 | 研究揭示了再生鳍中成骨细胞的来源及其在再生过程中的分工和协同作用,以及再生受损时的检测和补偿机制 | NA | 探讨斑马鱼再生鳍中细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 | 斑马鱼再生鳍中的表皮细胞、成骨细胞和非成骨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向消融、电子显微镜 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7200 | 2024-08-07 |
Comparative transcriptomic analysis of bovine mesenchymal stromal cells reveals tissue-source and species-specific differences
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108886
PMID:38318381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞的转录组特征,并探讨了其与马和人类间充质干细胞的异同 | 首次系统比较了不同来源的牛间充质干细胞的转录组特征,并揭示了其与人类间充质干细胞的相似性,为牛作为非传统动物模型用于间充质干细胞研究提供了依据 | NA | 探讨牛间充质干细胞的转录组特征及其与人类和马间充质干细胞的异同 | 牛间充质干细胞及其与人类和马间充质干细胞的转录组特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞,以及来自相同组织的马间充质干细胞和人类及小鼠的骨髓间充质干细胞 | NA | NA | NA | NA |