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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-06 |
Uncover spatially informed variations for single-cell spatial transcriptomics with STew
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae064
PMID:38827413
|
研究论文 | 提出一种名为STew的空间转录组多视图表示学习方法，用于联合分析空间信息和基因表达 | 开发了首个空间转录组多视图表示学习方法，能够有效利用空间信息揭示与基因表达共享的变异 | NA | 解决空间转录组数据分析中有效利用空间信息的挑战 | 人类背外侧前额叶皮层、小鼠主嗅球和银屑病皮肤组织 | 空间转录组学 | 银屑病 | 空间转录组学 | 多视图表示学习 | 空间转录组数据 | 多个数据集，包含数千个空间位置 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium, Slide-seqV2 | 10x Visium空间转录组技术、Slide-seqV2技术、10x Xenium单细胞空间转录组技术 |
| 702 | 2025-10-06 |
Genetic and Functional Analyses of Cutibacterium Acnes Isolates Reveal the Association of a Linear Plasmid with Skin Inflammation
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.05.029
PMID:37478901
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研究论文 | 本研究通过遗传和功能分析揭示痤疮丙酸杆菌携带线性质粒与皮肤炎症的关联 | 发现线性质粒的存在与痤疮丙酸杆菌的促炎能力相关，表明菌株类型不足以预测炎症反应 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，需要进一步人体验证 | 探究不同痤疮丙酸杆菌菌株类型与皮肤炎症的关系 | 痤疮丙酸杆菌分离株 | 微生物学 | 痤疮 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 从健康受试者和痤疮患者皮肤拭子分离的痤疮丙酸杆菌菌株 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 703 | 2025-10-06 |
Aggressive high-grade NF2 mutant meningiomas downregulate oncogenic YAP signaling via the upregulation of VGLL4 and FAT3/4
2024 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae148
PMID:39380691
|
研究论文 | 本研究揭示侵袭性高级别NF2突变脑膜瘤通过上调VGLL4和FAT3/4下调致癌YAP信号通路 | 首次发现侵袭性NF2突变脑膜瘤中YAP1靶基因表达降低与VGLL4和FAT3/4表达升高相关 | 研究主要基于体外细胞系实验，需要更多体内实验验证 | 探究不同级别NF2突变脑膜瘤对YAP活性的依赖性差异 | 人类脑膜瘤组织和细胞系 | 肿瘤生物学 | 脑膜瘤 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大型人类脑膜瘤队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2025-10-06 |
Evaluating methods for integrating single-cell data and genetics to understand inflammatory disease complexity
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1454263
PMID:39703500
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研究论文 | 评估整合单细胞数据与遗传学数据以理解炎症疾病复杂性的方法 | 首次对三种整合GWAS和scRNA-seq的算法进行系统性基准测试，并评估非编码SNP整合方法 | 依赖现有单细胞技术，缺乏疾病特异性图谱时结果可能产生误导 | 开发评估整合遗传学和单细胞数据方法的框架，以识别炎症疾病中遗传相关的细胞状态和基因 | 类风湿性关节炎和溃疡性结肠炎患者 | 生物信息学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | scGWAS, scDRS, scPagwas, MAGMA | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据 | 单细胞数据：183,742和228,211个细胞；GWAS数据：97,173和45,975个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis drives PET imaging of tight junction protein expression in pancreatic cancer theranostics
2024-12-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54761-6
PMID:39737976
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析筛选胰腺癌分子成像靶点，并开发靶向claudin-4的PET成像探针 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学数据驱动筛选胰腺癌分子成像靶点，发现claudin-4作为高特异性成像靶标 | 研究基于人类手术样本，样本来源和数量可能存在限制 | 开发胰腺癌特异性分子成像靶点和成像探针 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者手术样本 | 空间转录组学 | 胰腺癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, PET成像 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 人类手术样本 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 706 | 2025-10-06 |
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.19.629499
PMID:39763713
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研究论文 | 本研究揭示了肺成纤维细胞在烟曲霉感染期间通过免疫调节和组织重塑增强肺部防御的新机制 | 首次发现肺成纤维细胞在真菌感染中具有保护性功能，通过获得新的免疫调节特性和增强ECM分泌能力来限制感染严重程度 | 研究主要关注periostin阳性成纤维细胞亚群，其他成纤维细胞亚群的功能尚未完全阐明 | 探究肺成纤维细胞在烟曲霉感染过程中的功能响应和防御机制 | 肺成纤维细胞，烟曲霉菌，免疫正常和免疫抑制宿主 | 免疫学，传染病学 | 侵袭性曲霉病，真菌性肺炎 | 细胞谱系追踪，靶向细胞消融，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 707 | 2025-10-06 |
Chemotherapy induces myeloid-driven spatially confined T cell exhaustion in ovarian cancer
2024-Dec-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.11.005
PMID:39658541
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了化疗诱导的骨髓细胞驱动T细胞耗竭在卵巢癌中的空间限制机制 | 发现了化疗诱导的骨髓细胞网络(Myelonets)通过NECTIN2-TIGIT相互作用导致CD8 T细胞耗竭的空间限制机制 | 样本量相对有限(117例)，且仅针对高级别浆液性卵巢癌 | 探究化疗对卵巢癌抗肿瘤免疫的适应性变化 | 117例高级别浆液性卵巢癌样本(化疗前后采集) | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞数据,空间转录组数据 | 117例HGSC样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 708 | 2025-10-06 |
Postischemic inactivation of HIF prolyl hydroxylases in endothelium promotes maladaptive kidney repair by inducing glycolysis
2024-Dec-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176207
PMID:39621585
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞氧感应PHD酶在缺血后肾脏修复中的关键作用，发现其失活通过诱导糖酵解促进肾脏不良修复 | 首次发现内皮细胞PHD1、PHD2和PHD3同时失活（而非仅PHD2）通过激活糖酵解/MCT4轴促进肾脏不良修复，并证明MCT4抑制剂可恢复适应性修复 | 机制研究主要基于小鼠模型，在人类中的直接验证仍需进一步研究 | 探究缺血性急性肾损伤向慢性肾病转变的内皮细胞机制 | 小鼠和人类肾脏内皮细胞 | 病理生理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 709 | 2025-10-06 |
VICTOR: Validation and inspection of cell type annotation through optimal regression
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.08.028
PMID:39296808
|
研究论文 | 介绍了一种名为VICTOR的新方法，用于评估单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的可靠性 | 通过弹性网络正则化回归结合最优阈值来评估细胞注释的置信度，在识别不准确注释方面表现优于现有方法 | NA | 开发评估单细胞数据细胞类型注释可靠性的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 弹性网络正则化回归 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 710 | 2025-10-06 |
A temporal cortex cell atlas highlights gene expression dynamics during human brain maturation
2024-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01990-6
PMID:39567748
|
研究论文 | 通过单核RNA测序构建人类颞叶皮层的儿科和成人联合细胞图谱，揭示大脑成熟过程中的基因表达动态 | 首次构建包含非洲裔样本的儿科和成人联合细胞图谱，发现与认知和突触可塑性相关的LTK和FREM兴奋性神经元亚型在儿科组织中表达升高 | 研究主要聚焦于颞叶皮层，可能无法完全代表其他脑区的发育特征 | 探索人类大脑成熟过程中的细胞类型特异性基因表达动态 | 人类颞叶组织样本，包含儿科和成人样本及非洲裔样本 | 单细胞基因组学 | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，但鉴定了75种细胞亚型 | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 711 | 2025-10-06 |
Tumor Expression of CD83 Reduces Glioma Progression and Is Associated with Reduced Immunosuppression
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0281
PMID:39601621
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胶质瘤中CD83+肿瘤细胞可抑制肿瘤进展并改善免疫抑制微环境 | 首次发现肿瘤细胞自身表达的CD83能够调节免疫微环境并增强抗肿瘤T细胞反应 | 需要进一步研究CD83表达是否能够增强免疫治疗效果 | 探究CD83在胶质瘤免疫抑制微环境中的作用机制 | 人类和小鼠胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2025-10-06 |
Physical inactivity exacerbates pathologic inflammatory signalling at the single cell level in patients with systemic lupus
2024-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105432
PMID:39531917
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现，系统性红斑狼疮患者的身体不活动会加剧免疫细胞的病理性炎症信号传导 | 首次在单细胞水平揭示身体不活动如何通过CD4+和CD8+T细胞加剧系统性红斑狼疮患者的病理性炎症信号传导 | 研究基于自我报告的身体活动数据，样本量相对有限（123例患者） | 探究身体活动对系统性红斑狼疮患者免疫细胞功能和炎症信号传导的影响机制 | 123名系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 123名系统性红斑狼疮患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 713 | 2025-10-06 |
Improved characterization of 3' single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae175
PMID:39703419
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研究论文 | 评估Element Aviti平台通过亲和碱基化学测序技术改进3'单细胞RNA-seq文库中polyA位点表征的能力 | 利用亲和碱基化学测序技术首次实现对胸腺嘧啶同聚物区域的准确测序，直接独立分配reads到polyA位点 | 与单端比对相比并未持续提高reads比对率，未排除其他新兴平台可能具有相似性能 | 改进3'单细胞RNA-seq文库的表征方法，特别是polyA位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库中的polyA位点 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti | Element Aviti平台采用亲和碱基化学测序技术 |
| 714 | 2025-10-06 |
Transiently increased coordination in gene regulation during cell phenotypic transitions
2024-Dec, PRX life
DOI:10.1103/prxlife.2.043009
PMID:40585428
|
研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序数据，研究细胞表型转变过程中基因调控网络的协调机制 | 首次在五种不同细胞转变过程中观察到基因调控网络社区间相互作用的共同模式：调控数量和强度先增加后减少 | 仅基于五种细胞转变过程的分析，需要更多系统验证 | 探索细胞表型转变过程中基因表达簇切换的协调机制 | 五种不同细胞转变过程中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 过渡路径理论 | 单细胞RNA测序数据 | 五种不同细胞转变过程的数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2025-10-06 |
OneSC: a computational platform for recapitulating cell state transitions
2024-11-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae703
PMID:39570626
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为OneSC的计算平台，用于模拟细胞状态转换过程 | 提出了一种基于随机微分方程系统和核心转录因子调控网络的细胞状态转换模拟方法，优先生成能够产生忠实细胞状态转换的布尔网络 | NA | 开发计算模型以在计算机中模拟细胞状态转换过程 | 小鼠骨髓祖细胞及其分化轨迹 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机微分方程系统、布尔网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 716 | 2025-10-06 |
Human single cell RNA-sequencing reveals a targetable CD8+ exhausted T cell population that maintains mouse low-grade glioma growth
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54569-4
PMID:39609412
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现CD8+耗竭T细胞在低级别胶质瘤中维持肿瘤生长的特殊功能 | 首次揭示CD8+耗竭T细胞在低级别胶质瘤中作为肿瘤生长调节因子的新功能，而非传统认知的细胞毒性效应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究低级别胶质瘤中T细胞的功能特性和免疫治疗机制 | 人类和小鼠的低级别胶质瘤组织样本 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2025-10-06 |
Endogenous antigens shape the transcriptome and TCR repertoire in an autoimmune arthritis model
2024-Nov-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI174647
PMID:39589811
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了内源性抗原如何影响自身免疫性关节炎模型中T细胞的转录组和TCR受体库 | 首次在Zap70信号缺陷的自身免疫性关节炎模型中，结合单细胞RNA测序和TCR测序，揭示了内源性逆转录病毒通过超抗原反应破坏外周耐受的新机制 | 研究仅使用SKG小鼠模型，结果在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究信号通路缺陷条件下致病性自身反应性CD4+ T细胞的发育和活化机制 | BALB/c-Zap70*W163C (SKG)小鼠中高度致关节炎的初始CD4+ T细胞亚群 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | bulk RNA-Seq, 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | SKG小鼠和野生型小鼠的CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 718 | 2025-10-06 |
Cell-specific priors rescue differential gene expression in spatial spot-based technologies
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae621
PMID:39679437
|
研究论文 | 本研究评估了传统差异表达基因分析方法在空间转录组数据中的适用性，并提出了一种基于细胞类型特异性先验知识的改进方案 | 开发了空间转录组数据模拟器验证传统DEG方法的局限性，并提出基于细胞特异性先验的简单基因选择方案，显著提高了DEG识别的准确性 | 研究主要基于计算机模拟数据，需要在实际生物样本中进一步验证方法的有效性 | 评估和改进空间转录组数据中差异表达基因的分析方法 | 空间转录组数据，特别是基于spot的技术平台如Visium产生的数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | 计算机模拟器，基因选择算法 | 基因表达数据，空间位置信息 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | 基于spot的空间转录组技术平台 |
| 719 | 2025-10-06 |
ETV2 transcriptionally activates Rig1 gene expression and promotes reprogramming of the endothelial lineage
2024-11-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-78115-w
PMID:39562637
|
研究论文 | 本研究揭示了ETV2通过直接激活Rig1基因表达促进成纤维细胞重编程为内皮细胞的分子机制 | 首次发现ETV2是Rig1基因的直接上游激活因子，并证明RIG1和NFκB1在ETV2介导的内皮细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠胚胎成纤维细胞，在人类细胞中的适用性需要进一步验证 | 阐明ETV2介导的细胞重编程分子机制 | 小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)和内皮细胞 | 细胞重编程 | 缺血性心脏病 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 电泳迁移率实验, 转录分析, shRNA敲低 | NA | 基因表达数据, 蛋白质-DNA相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 720 | 2025-10-06 |
PRMT5/WDR77 Enhances the Proliferation of Squamous Cell Carcinoma via the ΔNp63α-p21 Axis
2024-Nov-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16223789
PMID:39594744
|
研究论文 | 本研究揭示了PRMT5和WDR77通过ΔNp63α-p21轴协同促进鳞状细胞癌增殖的新机制 | 首次发现PRMT5和WDR77通过稳定ΔNp63α蛋白并抑制p21来协同促进鳞状细胞癌增殖 | 鳞状细胞癌中PRMT5的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究PRMT5在鳞状细胞癌增殖中的作用机制 | 鳞状细胞癌患者数据、细胞系和体内小鼠模型 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blot, MTT检测, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞增殖数据 | TCGA和DepMap数据库中的鳞状细胞癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |