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当前共找到 7460 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic-informed deconvolution of bulk data identifies immune checkpoint blockade resistance in urothelial cancer
2024-Jun-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109928
PMID:38812546
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研究论文 | 开发了一种名为ProM的单细胞转录组信息反卷积方法，用于从批量数据中识别膀胱尿路上皮癌免疫检查点阻断耐药性 | 提出ProM方法能够同时检测主要和次要细胞类型，在配对的单细胞和批量RNA测序数据评估中优于现有方法 | 未明确说明样本量的具体限制或方法在其他癌症类型中的适用性 | 开发计算反卷积方法以整合单细胞和批量RNA测序数据，获得临床相关见解 | 人类膀胱尿路上皮癌样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 计算反卷积 | ProM反卷积算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2025-10-06 |
GoT-Splice protocol for multi-omics profiling of gene expression, cell-surface proteins, mutational status, and RNA splicing in human cells
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102966
PMID:38512867
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GoT-Splice的多组学分析协议，用于同时分析人类细胞的基因表达、细胞表面蛋白、突变状态和RNA剪接 | 将Genotyping of Transcriptomes (GoT)与增强的长读长单细胞转录组和细胞表面蛋白质组分析相结合，克服了传统方法在区分野生型和突变细胞以及从短读长数据重建剪接信号方面的局限性 | NA | 开发一种能够准确研究RNA剪接因子突变的多组学分析方案 | 人类细胞 | 单细胞多组学 | NA | 长读长测序, 单细胞转录组测序, 细胞表面蛋白质组分析, 基因分型 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 突变数据, RNA剪接数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 长读长测序 | NA | NA |
| 703 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2024-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.20.594719
PMID:38826447
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术绘制小鼠卵巢排卵过程的时空图谱 | 首次在单细胞分辨率下详细描述排卵过程的精确时间窗口，并识别排卵依赖性细胞状态的基因标记 | 研究仅针对小鼠模型，未涉及其他物种 | 解析排卵过程中卵巢细胞类型的时空动态变化 | 小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 配对小鼠卵巢样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 704 | 2025-10-06 |
Effects of SPI1-mediated transcriptome remodeling on Alzheimer's disease-related phenotypes in mouse models of Aβ amyloidosis
2024-May-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48484-x
PMID:38734693
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研究论文 | 本研究通过调控SPI1表达水平探究其对阿尔茨海默病相关病理表型的影响 | 首次在Aβ淀粉样变性小鼠模型中系统验证SPI1下调与过表达对AD病理的相反作用，并揭示其通过免疫反应和补体系统等通路发挥作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究SPI1表达水平调控对阿尔茨海默病发病机制的影响 | Spi1基因敲除和过表达的小鼠模型 | 转录组学 | 阿尔茨海默病 | 靶向转录组学，单细胞转录组学 | 基因敲除模型，基因过表达模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 705 | 2025-10-06 |
Characterization of the responses of brain macrophages to focused ultrasound-mediated blood-brain barrier opening
2024-May, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-023-01107-0
PMID:37857722
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了聚焦超声开放血脑屏障后脑巨噬细胞的免疫重塑机制 | 首次在单细胞水平系统表征聚焦超声开放血脑屏障后小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞的动态响应 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究聚焦超声介导的血脑屏障开放对脑巨噬细胞的影响机制 | 小鼠脑组织中的小胶质细胞和中枢神经系统相关巨噬细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2025-10-06 |
High-Dimensional Single-Cell Multimodal Landscape of Human Carotid Atherosclerosis
2024-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320524
PMID:38385291
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术绘制人类颈动脉粥样硬化的高维细胞图谱 | 首次结合转录组和表位测序技术系统鉴定动脉粥样硬化病变中的25种细胞群体，发现新型平滑肌细胞来源的泡沫细胞亚群 | 样本量相对有限（n=21），仅针对颈动脉病变进行研究 | 全面解析人类颈动脉粥样硬化的细胞组成和临床病理关联 | 人类颈动脉粥样硬化病变组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,细胞转录组和表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据,表位数据 | 21例颈动脉病变样本（13例有症状） | 10x Genomics | 单细胞多组学,单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 细胞转录组和表位索引测序技术 |
| 707 | 2025-10-06 |
Single-cell epigenomic dysregulation of Systemic Sclerosis fibroblasts via CREB1/EGR1 axis in self-assembled human skin equivalents
2024-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.22.586316
PMID:38585776
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和表观基因组分析系统性硬化症3D皮肤模型中的成纤维细胞亚群 | 首次在自组装人类皮肤等效物中通过单细胞多组学分析揭示CREB1/EGR1轴在系统性硬化症成纤维细胞表观遗传失调中的作用 | 研究基于体外3D皮肤模型，可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究系统性硬化症皮肤纤维化的单细胞表观遗传机制 | 系统性硬化症患者和健康对照的自体成纤维细胞、巨噬细胞和血浆构建的3D皮肤组织 | 单细胞多组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 3D皮肤等效物模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 系统性硬化症患者和健康对照捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 708 | 2025-10-06 |
Inositol phosphatase INPP4B sustains ILC1s and intratumoral NK cells through an AKT-driven pathway
2024-Mar-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230124
PMID:38197946
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现INPP4B是组织驻留ILC1和肿瘤内NK细胞的标志性特征，并揭示其通过AKT通路维持这些细胞稳态和抗肿瘤功能 | 首次鉴定INPP4B作为组织驻留ILC1和肿瘤内NK细胞的新型调节因子，揭示其通过AKT驱动的生存通路发挥作用 | 研究主要关注稳态和肿瘤环境，其他病理状态下INPP4B的功能尚未探索 | 探究INPP4B在先天淋巴细胞亚群特别是ILC1和NK细胞中的功能作用 | 先天淋巴细胞（ILC）、自然杀伤细胞（NK）、1型先天淋巴细胞（ILC1） | 免疫学 | 肿瘤免疫 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 709 | 2025-10-06 |
Retinal microglia express more MHC class I and promote greater T-cell-driven inflammation than brain microglia
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1399989
PMID:38799448
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了视网膜和脑部小胶质细胞的转录组差异 | 首次发现视网膜小胶质细胞比脑部小胶质细胞表达更多MHC I类分子，并具有更强的促进T细胞驱动炎症的能力 | 研究仅使用小鼠模型，样本量有限（20只眼和3个脑组织） | 探究视网膜和脑部小胶质细胞因微环境差异导致的转录组和功能差异 | 2-4月龄野生型小鼠的视网膜和脑部小胶质细胞 | 单细胞生物学 | 病毒感染和自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，多参数流式细胞术，淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒感染模型 | NA | 单细胞基因表达数据，流式细胞数据 | 20只眼睛和3个脑组织来自2-4月龄野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2025-10-06 |
Gradient boosting reveals spatially diverse cholesterol gene signatures in colon cancer
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1410353
PMID:39678375
|
研究论文 | 本研究通过梯度提升模型识别结肠癌中与胆固醇代谢相关的空间多样化基因特征 | 首次将XGBoost模型应用于胆固醇代谢基因分析，并发现关键基因ADCY5和SLC2A1在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 研究样本仅限于TCGA数据库，缺乏外部验证队列 | 评估胆固醇代谢与结肠癌预后的关系并识别关键预后基因 | 结肠腺癌患者的肿瘤和癌旁正常组织样本 | 生物信息学 | 结肠癌 | 差异基因分析，KEGG通路分析，空间转录组学，免疫组织化学 | XGBoost，Cox比例风险模型，随机森林，Lasso回归 | 基因表达数据，空间转录组数据，蛋白质表达数据 | TCGA结肠腺癌项目的配对肿瘤和癌旁样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 711 | 2025-10-06 |
sc-SPLASH provides ultra-efficient reference-free discovery in barcoded single-cell sequencing
2024-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630263
PMID:39763839
|
研究论文 | 开发了sc-SPLASH流程，用于无参考基因组的单细胞RNA测序数据分析 | 将SPLASH框架扩展到条形码单细胞RNA测序和空间转录组学，提供无需参考基因组的统计优先发现方法 | NA | 探索转录组多样性，包括剪接、V(D)J重组和参考基因组中缺失的序列 | 人类、海鞘和海绵的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台，10x Visium空间转录组平台 |
| 712 | 2025-10-06 |
Chondroitin sulfate proteoglycan 4 increases invasion of recessive dystrophic epidermolysis bullosa-associated cutaneous squamous cell carcinoma by modifying transforming growth factor-β signalling
2024-Dec-23, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae295
PMID:39018437
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研究论文 | 本研究探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4在隐性营养不良性大疱性表皮松解症相关皮肤鳞状细胞癌中通过调节TGF-β信号通路增强肿瘤侵袭性的机制 | 首次揭示CSPG4通过调节SMAD3磷酸化增强TGF-β信号通路，从而促进RDEB cSCC肿瘤侵袭的新机制 | 研究主要基于体外细胞系和肿瘤模型，缺乏体内动物实验验证 | 评估CSPG4在RDEB cSCC中的表达和功能作用 | RDEB cSCC细胞系、RDEB cSCC肿瘤组织、非RDEB cSCC肿瘤组织 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 体外全层肿瘤模型 | 基因表达数据、组织病理学图像 | 多个RDEB cSCC细胞系、已发表的scRNA-Seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 713 | 2025-10-06 |
CFTR represses a PDX1 axis to govern pancreatic ductal cell fate
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111393
PMID:39687022
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了CFTR蛋白通过调控PDX1轴决定胰腺导管细胞命运的机制 | 发现CFTR蛋白水平（而非通道功能）通过维持PTEN和GSK3β活性来抑制PDX1表达，调控胰腺细胞命运 | 研究基于CF雪貂模型，在人类中的直接适用性需进一步验证 | 探究CFTR缺失导致胰腺重塑的分子机制 | 囊性纤维化雪貂模型的胰腺组织 | 分子生物学 | 囊性纤维化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, ATAC-seq | NA | 转录组数据，表观基因组数据 | CF雪貂模型 | NA | 单细胞RNA测序，转座酶可及染色质测序 | NA | NA |
| 714 | 2025-10-06 |
Cycling alpha cells in regenerative drug-treated human pancreatic islets may serve as key beta cell progenitors
2024-Dec-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101832
PMID:39626675
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现人类胰岛中循环α细胞可能是β细胞再生的关键前体细胞 | 首次揭示DYRK1A抑制剂通过靶向循环α细胞促进其转分化为β细胞的机制 | 作用机制尚未完全阐明，需要进一步验证 | 探索DYRK1A抑制剂促进β细胞再生的分子机制 | 人类胰岛细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 谱系轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2025-10-06 |
Elucidating Sex-Specific Immune Profiles in a Breast Cancer Model
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313113
PMID:39684829
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序等技术揭示乳腺癌模型中性别特异性免疫特征差异 | 首次在雌雄ER+乳腺癌转基因小鼠模型中系统比较性别相关的激素和免疫景观差异 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明乳腺癌中性别特异性免疫反应特征 | MMTV-PyMT转基因小鼠模型的雌雄ER+乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 全片免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 图像数据, 细胞计数数据 | 转基因小鼠乳腺肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 716 | 2025-10-06 |
Sex-specific regulatory architecture of pancreatic islets from subjects with and without type 2 diabetes
2024-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00313-z
PMID:39567827
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单核ATAC测序技术，结合激素分泌和生物能量学分析，揭示了2型糖尿病患者胰岛细胞中性别特异性调控机制 | 首次在人类胰岛中系统揭示2型糖尿病性别差异的表观遗传调控机制，发现性别染色体和常染色体在疾病状态下的不同调控模式 | 样本量相对有限（52名供体），且为观察性研究，无法确定因果关系 | 探究2型糖尿病患者胰岛细胞中性别特异性调控机制及其与疾病发生的关系 | 人类胰腺胰岛细胞（来自52名2型糖尿病患者和非糖尿病供体） | 单细胞多组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 激素分泌测定, 生物能量学分析, GWAS | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 生理功能数据 | 52名人类供体（包括2型糖尿病患者和非糖尿病对照） | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | NA |
| 717 | 2025-10-06 |
Collapsible tree: interactive web app to present collapsible hierarchies
2024-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae645
PMID:39460943
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研究论文 | 开发了一个名为Collapsible Tree的交互式网络应用程序，用于展示可折叠的层次结构数据可视化 | 提出了一个JavaScript框架和交互式网络应用，能够在单一层次图中同时展示细胞状态和基因表达数据，克服了t-SNE和UMAP需要分开展示且无法捕捉层次结构的局限性 | NA | 开发交互式数据可视化工具，用于展示层次结构数据 | 单细胞转录组学数据中的细胞谱系结构和基因表达模式 | 数据可视化 | NA | 单细胞转录组学 | JavaScript框架 | 基因表达数据、层次结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 718 | 2025-10-06 |
Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2024-10-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52990-3
PMID:39379371
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研究论文 | 通过单细胞多组学测序技术分析Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症患者的组织特异性免疫反应 | 首次对SJS/TEN患者进行单细胞转录组、表面蛋白质组和T细胞受体测序的综合分析，识别出组织特异性细胞亚群和致病机制 | 样本量相对较小（15例患者），为罕见疾病研究 | 阐明SJS/TEN疾病的细胞免疫发病机制 | 15名SJS/TEN患者的未受累皮肤、受累皮肤和水疱液 | 单细胞多组学 | Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、T细胞受体测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 15例患者，共109,888个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 719 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of LGALS2: insights into tertiary lymphoid structure-associated dendritic cell activation and immunotherapeutic potential in breast cancer patients
2024-Sep-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02126-4
PMID:39350165
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研究论文 | 通过整合分析乳腺癌转录组数据，发现LGALS2是三级淋巴结构中的关键标志物，并揭示其在树突状细胞激活和免疫治疗中的潜力 | 首次通过生物网络计算策略和机器学习方法识别LGALS2作为三级淋巴结构的关键标志物，并阐明其在树突状细胞激活中的作用机制 | NA | 探索LGALS2在乳腺癌三级淋巴结构中的作用及其免疫治疗潜力 | 乳腺癌患者样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学,免疫组织化学,HE染色 | 机器学习 | 转录组数据 | 超过6000个乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 720 | 2025-10-06 |
Permethrin exposure primes neuroinflammatory stress response to drive depression-like behavior through microglial activation in a mouse model of Gulf War Illness
2024-Sep-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03215-3
PMID:39272155
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研究论文 | 本研究通过建立海湾战争疾病小鼠模型，探讨了氯菊酯暴露如何通过小胶质细胞激活引发神经炎症应激反应并导致抑郁样行为 | 首次揭示氯菊酯暴露可通过启动小胶质细胞的炎症激活状态，在心理应激触发下导致抑郁样行为和神经可塑性改变 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 评估氯菊酯暴露是否能够启动神经炎症应激反应并引发与海湾战争疾病相关的精神症状 | 海湾战争疾病小鼠模型 | 神经科学 | 海湾战争疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据 | 21,566个从小鼠海马体收集的单细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |