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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-11-03 |
Hepatocellular carcinoma-specific epigenetic checkpoints bidirectionally regulate the antitumor immunity of CD4 + T cells
2024-Nov, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01215-0
PMID:39300319
|
研究论文 | 本研究揭示了MATR3作为肝细胞癌特异性表观遗传检查点，双向调节CD4+T细胞的抗肿瘤免疫 | 首次发现MATR3在肝细胞癌中作为表观遗传检查点，通过招募SWI/SNF复合物调节TOX启动子区域染色质状态，双向调控Tconv细胞的抗肿瘤免疫功能 | NA | 探索肝细胞癌中CD4+T细胞的表观遗传调控机制及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肝细胞癌浸润的常规CD4+T细胞（Tconvs） | 表观遗传学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，体内外实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2025-11-03 |
Localized ablative immunotherapy enhances antitumor immunity by modulating the transcriptome of tumor-infiltrating Gamma delta T cells
2024-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217267
PMID:39307410
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析激光消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞转录组的调控作用 | 首次揭示LAIT疗法通过调节γδT细胞转录组增强抗肿瘤免疫的机制，发现LAIT独特地增加IL17-producing γδT细胞比例 | 研究仅在小鼠乳腺癌模型中进行，尚未在人体直接验证 | 探究激光消融免疫疗法对肿瘤浸润γδT细胞功能动态的影响 | 小鼠乳腺癌模型中的肿瘤浸润γδT细胞 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组、PTT组、GC组和LAIT组的小鼠肿瘤样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 703 | 2025-11-03 |
Therapeutic single-cell landscape: methotrexate exacerbates interstitial lung disease by compromising the stemness of alveolar epithelial cells under systemic inflammation
2024-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105339
PMID:39303666
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示甲氨蝶呤在系统性炎症下通过损害肺泡上皮细胞干性加重间质性肺病 | 首次在单细胞水平揭示甲氨蝶呤通过损害肺泡上皮细胞干性加重肺纤维化的机制 | 基于小鼠模型的研究结果需在人类患者中进一步验证 | 探究甲氨蝶呤和TNF抑制剂对类风湿关节炎相关间质性肺病的影响 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | 单细胞转录组学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | SKG小鼠模型和人类RA-ILD队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 704 | 2025-11-02 |
Method of moments framework for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.044
PMID:39454576
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据差异表达分析的矩量法框架工具Memento | 开发了可同时分析均值表达、变异性和基因相关性的稳健高效差异分析工具，可扩展至数百万细胞和数千样本 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中区分生物和技术变异源、评估细胞组间定量比较统计显著性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 矩量法框架 | 基因表达数据 | 70,000气管上皮细胞、160,000 CRISPR-Cas9扰动T细胞、120万外周血单核细胞、5000万细胞CELLxGENE数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 705 | 2025-10-31 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable genes from spatial transcriptomic data
2024-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592851
PMID:38765956
|
研究论文 | 开发了一个名为scBSP的快速准确工具，用于从空间转录组数据中识别空间可变基因 | 实现了稀疏矩阵运算，显著提高了计算效率和内存使用，能在10秒内处理包含19,950个基因和181,367个点的高清空间转录组数据 | NA | 开发高效识别空间可变基因的计算工具 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 稀疏矩阵运算 | 空间转录组数据 | 19,950个基因，181,367个点，可达数百万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 706 | 2025-10-30 |
Identifying patterns differing between high-dimensional datasets with generalized contrastive PCA
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.08.607264
PMID:39149388
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研究论文 | 开发了一种无需超参数调优的广义对比主成分分析方法，用于比较高维数据集间的差异模式 | 提出了超参数自由的广义对比PCA方法，解决了传统对比PCA需要手动调参且无法对称比较两个实验条件的问题 | 论文未明确说明方法在极端高维情况下的计算效率限制或对特定数据分布的适用性限制 | 开发一种能够对称比较两个高维数据集的降维方法，提取条件特异性模式 | 高维生物数据，包括神经生理记录和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | II型糖尿病 | 单细胞RNA测序，神经生理记录分析 | 广义对比PCA | 高维生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 707 | 2025-10-27 |
Visualizing Immune Checkpoint Inhibitors Derived Inflammation in Atherosclerosis
2024-Oct-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.324260
PMID:39328090
|
研究论文 | 本研究使用CCR2靶向放射性示踪剂和PET成像技术，可视化免疫检查点抑制剂引起的动脉粥样硬化炎症反应 | 首次开发非侵入性方法检测ICI治疗引起的动脉粥样硬化炎症，揭示IFNγ信号在其中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体验证 | 探索免疫检查点抑制剂引起动脉粥样硬化的机制并开发可视化检测方法 | Apoe-/-和Ldlr-/-基因敲除小鼠 | 分子影像学 | 心血管疾病 | PET成像、单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术 | NA | 影像数据、分子数据、单细胞测序数据 | Apoe-/-和Ldlr-/-小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,PET成像 | NA | 64Cu-DOTA-ECL1i PET示踪剂 |
| 708 | 2025-10-27 |
Single-cell transcriptomics of peripheral blood mononuclear cells indicates impaired immune and inflammatory responses in alcohol-associated hepatitis
2024-Jan, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2023.110735
PMID:38040543
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示酒精性肝炎患者外周血单个核细胞的免疫和炎症反应受损机制 | 首次结合单细胞转录组、细胞表面蛋白和淋巴细胞抗原受体分析，系统揭示AH患者PBMC中各细胞亚型的协同免疫应答异常 | 样本量有限，未包含不同疾病阶段的纵向数据 | 探究酒精性肝炎中免疫失调和炎症反应的分子机制 | 酒精性肝炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 酒精性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、抗原受体数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 709 | 2025-10-23 |
Integrated transcriptomics of human blood vessels defines a spatially controlled niche for early mesenchymal progenitor cells
2024-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.015
PMID:39025061
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学揭示了人类血管壁中早期间充质祖细胞的分布特征和功能特性 | 首次详细描绘了人类血管外膜干细胞微环境，发现CD201(PROCR)高表达定义了更原始的间充质祖细胞亚群 | NA | 表征人类血管周围祖细胞的表型、潜能和微解剖分布 | 人类血管组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2025-10-21 |
FixNCut: A Practical Guide to Sample Preservation by Reversible Fixation for Single Cell Assays
2024-Sep-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5063
PMID:39315321
|
研究论文 | 本文提供了FixNCut可逆固定方案的优化实用指南，用于单细胞分析中的样本保存 | 开发了可逆固定策略，将样本采集与下游应用分离，避免应激或坏死相关伪影 | NA | 建立可逆固定方案以改善单细胞分析中的样本保存 | 生物样本（组织和细胞悬液） | 单细胞分析 | NA | 可逆固定技术 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 711 | 2025-10-19 |
Smyd3-mediated immuno-modulation in HPV-negative head and neck squamous cell carcinoma mouse models
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110854
PMID:39310755
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Smyd3 ASOs治疗的小鼠口腔癌模型，揭示Smyd3在HPV阴性头颈鳞癌中的免疫调节功能及联合治疗耐药机制 | 首次在体内模型中证明Smyd3通过表观遗传调控I型IFN反应基因影响肿瘤免疫微环境，并系统解析了Smyd3 ASOs与抗PD-1联合治疗的耐药机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类患者中验证；耐药机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究Smyd3在HPV阴性头颈鳞癌免疫调节中的作用及联合治疗耐药机制 | 小鼠口腔癌模型MOC1肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，反义寡核苷酸技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 712 | 2025-10-18 |
Dysregulation of cell state dynamics during early stages of serous endometrial carcinogenesis
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.15.585274
PMID:38562813
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了浆液性子宫内膜癌发生早期阶段的细胞状态动态失调机制 | 首次在SEC小鼠模型中系统描述了正常、癌前和发育异常子宫内膜的细胞类型和状态变化，发现了44个潜在早期诊断标志基因 | 研究基于小鼠模型，在人类中的临床验证仍需进一步研究 | 探索浆液性子宫内膜癌发生早期的分子和细胞动力学机制 | 小鼠子宫内膜组织（正常、癌前和发育异常阶段） | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 713 | 2025-10-17 |
YAP1 Status Defines Two Intrinsic Subtypes of LCNEC with Distinct Molecular Features and Therapeutic Vulnerabilities
2024-Oct-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0361
PMID:39150543
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研究论文 | 本研究通过YAP1状态将大细胞神经内分泌癌分为两个具有不同分子特征和治疗脆弱性的亚型 | 首次发现YAP1状态可定义LCNEC的两个内在亚型，并揭示了各自独特的分子特征和治疗脆弱性 | 研究样本量有限，主要基于细胞系和核心针活检样本 | 阐明大细胞神经内分泌癌的生物学特征并探索个性化治疗策略 | LCNEC细胞系、患者基因组数据和临床前模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、图像、序列数据 | LCNEC患者核心针活检样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 714 | 2025-10-17 |
A call for a unified and multimodal definition of cellular identity in the enteric nervous system
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.15.575794
PMID:38293133
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评论 | 本文呼吁建立统一的多模态细胞身份定义方法以研究肠神经系统 | 强调整合多组学数据和创新技术来重新定义肠神经系统细胞身份 | 当前研究过度依赖转录组数据且缺乏组织验证 | 建立肠神经系统细胞身份的统一定义标准 | 小鼠和人类肠神经系统数据集 | 单细胞生物学 | 肠神经病变 | 单细胞转录组测序, 多重成像, 电生理学, 空间转录组学, 表观基因组分析, 蛋白质组学, 代谢组学 | 差异基因表达分析, 模块评分, 共表达分析, 层次聚类, 数据整合, 标签转移 | 单细胞转录组数据, 多组学数据 | 多个独立报告的ENS数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 715 | 2025-10-16 |
Distinct tumor architectures and microenvironments for the initiation of breast cancer metastasis in the brain
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.08.015
PMID:39270646
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研究论文 | 本研究揭示了不同类型乳腺癌脑转移的独特肿瘤结构和微环境特征 | 发现TNBC和HER2+乳腺癌在脑转移过程中形成不同的肿瘤结构，并引发差异性的阿尔茨海默病相关小胶质细胞反应 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类组织样本，需要更大规模临床验证 | 理解乳腺癌脑转移的早期定植机制 | 三阴性乳腺癌和HER2+乳腺癌的脑转移过程 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织样本数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 716 | 2025-10-16 |
scEMB: Learning context representation of genes based on large-scale single-cell transcriptomics
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.24.614685
PMID:39386549
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研究论文 | 开发了一种基于Transformer的深度学习模型scEMB，用于从大规模单细胞转录组数据中学习基因的上下文表示 | 提出创新的分箱策略整合多平台数据，同时保留基因表达层次和细胞类型特异性，在批次整合、聚类和细胞类型注释等下游任务中表现优于现有模型 | NA | 从大规模单细胞转录组数据中挖掘复杂的基因-基因关系 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 单细胞转录组数据 | 超过3000万个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 717 | 2025-10-16 |
Cortical somatostatin long-range projection neurons and interneurons exhibit divergent developmental trajectories
2024-Feb-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.11.013
PMID:38086373
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了小鼠大脑皮层中表达生长抑素的抑制性神经元在发育过程中的分化轨迹 | 首次发现SST+抑制性神经元在胚胎阶段就分为长程投射神经元和两种中间神经元类型，并遵循不同的发育轨迹 | 研究仅针对小鼠模型，且中间神经元的多样性可能在出生后早期继续完善 | 探究大脑皮层抑制性神经元的发育多样性和分化机制 | 小鼠大脑皮层中表达生长抑素(SST+)的抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 718 | 2025-10-15 |
FlyBase: updates to the Drosophila genes and genomes database
2024-05-07, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyad211
PMID:38301657
|
研究论文 | 介绍果蝇数据库FlyBase的最新开发进展和功能更新 | 新增单细胞RNA测序数据、改进功能信息展示、更新直系同源分析流程、新增化学报告功能以及加强科普资源 | NA | 维护和更新果蝇基因组数据库资源 | 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)基因和基因组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、功能注释数据、化学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 719 | 2025-10-12 |
CITEViz: interactively classify cell populations in CITE-Seq via a flow cytometry-like gating workflow using R-Shiny
2024-Apr-02, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05762-1
PMID:38566005
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研究论文 | 开发了一个名为CITEViz的R-Shiny应用，用于通过流式细胞术样门控工作流程交互式分类CITE-Seq数据中的细胞群体 | 首个能够处理多组学测序数据集并允许用户交互式门控细胞的工具，无需编写冗余代码指定门边界 | 仅适用于经过Seurat处理的CITE-Seq数据，功能相对基础 | 简化CITE-Seq数据中的细胞群体分类流程 | 外周血单个核细胞CITE-Seq数据集 | 生物信息学 | NA | CITE-Seq, 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学, CITE-Seq | NA | NA |
| 720 | 2025-10-12 |
Programmed Death Ligand 1-Expressing Macrophages and Their Protective Role in the Joint During Arthritis
2024-Apr, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42749
PMID:37997621
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研究论文 | 本研究探讨了表达程序性死亡配体1的巨噬细胞在关节炎中对关节的保护作用 | 首次揭示PD-L1+巨噬细胞通过表达MerTK和IL-10在关节炎中发挥保护作用，并在人类和小鼠滑膜中得到验证 | 研究主要基于胶原诱导性关节炎小鼠模型，人类样本验证仍需扩展 | 研究PD-L1在滑膜中的保护作用及其在关节炎中的机制 | 小鼠模型和人类滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 流式细胞术, 逆转录聚合酶链反应, 单细胞RNA测序 | 胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠模型和人类滑膜样本（健康个体和类风湿关节炎患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |