单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 7161 - 7180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7161 | 2024-08-04 |
Biomarkers and prognostic factors of PD-1/PD-L1 inhibitor-based therapy in patients with advanced hepatocellular carcinoma
2024-Feb-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00535-z
PMID:38355603
|
综述 | 本文总结了PD-1/PD-L1抑制剂在晚期肝细胞癌患者中的生物标志物和预后因素。 | 首次通过评估单细胞测序和空间转录组学的最新进展，揭示肿瘤异质性以及其生物标志物与预后的关系 | 可能缺乏关于某些预后因素和生物标志物的具体临床应用示例 | 探讨晚期肝细胞癌患者中使用PD-1/PD-L1抑制剂的生物标志物与预后因素 | 晚期肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的相关标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 生物标志物分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7162 | 2024-08-07 |
Glycosylation-related genes mediated prognostic signature contribute to prognostic prediction and treatment options in ovarian cancer: based on bulk and single‑cell RNA sequencing data
2024-Feb-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11908-4
PMID:38355446
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，识别与卵巢癌相关的糖基化相关基因，构建预测预后和免疫治疗的基因签名 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据构建糖基化相关基因签名，用于卵巢癌的预后预测和治疗策略 | NA | 识别卵巢癌中的主要糖基化相关基因，并构建有效的基因签名以预测预后和免疫治疗 | 卵巢癌患者的糖基化相关基因及其在预后和免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | COX回归, LASSO回归 | RNA测序数据 | 1187个糖基化相关基因, 16个基因签名 | NA | NA | NA | NA |
| 7163 | 2024-08-07 |
Fine particulate matter 2.5 induces susceptibility to Pseudomonas aeruginosa infection via expansion of PD-L1high neutrophils in mice
2024-Feb-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02640-x
PMID:38355515
|
研究论文 | 本研究探讨了细颗粒物PM2.5暴露如何通过扩张表达PD-L1的高中性粒细胞导致小鼠对铜绿假单胞菌感染的易感性增加 | 首次揭示了PM2.5暴露通过扩张PD-L1高表达的中性粒细胞，影响其吞噬功能，从而增加对铜绿假单胞菌感染的易感性 | 研究主要在动物模型中进行，未来需在人体中验证相关发现 | 探讨PM2.5暴露对呼吸系统健康的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的中性粒细胞和铜绿假单胞菌感染 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 7164 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomics uncovers an enhanced association between the prion protein gene expression and vesicle dynamics signatures in glioblastomas
2024-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11914-6
PMID:38347462
|
研究论文 | 本研究揭示了朊蛋白基因表达与胶质母细胞瘤中的囊泡动力学特征之间增强的关联。 | 本研究首次展示了PrPC作为胶质母细胞瘤中囊泡生物学调节因子的潜在角色，并且引入了一种新的研究工具GBMdiscovery。 | 本研究主要依赖于公开的RNA测序数据，可能存在数据偏倚和适用性限制。 | 研究PRNP/PrPC在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其分子机制。 | 以患者来源的胶质母细胞瘤为研究对象，分析其RNA测序数据。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及来自四项独立研究的患者来源胶质母细胞瘤的公开RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 7165 | 2024-08-07 |
Sstr2 Defines the Cone Differentiation-Competent Late-Stage Retinal Progenitor Cells in the Developing Mouse Retina
2024-Jan-12, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad073
PMID:37935630
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了C57BL/6J小鼠发育中视网膜的转录组，发现生长抑素受体2（Sstr2）在具有光感受器分化潜能的晚期视网膜祖细胞（RPCs）中特异性表达，并验证了Sstr2+细胞在体内分化为视锥细胞、无长突细胞和水平细胞的能力。 | 首次揭示了Sstr2在晚期RPCs中的特异性表达，并证明了Sstr2+细胞具有分化为视锥细胞的能力，为视网膜退行性疾病的治疗提供了新的生物标志物。 | NA | 旨在识别和富集能够分化为视锥细胞的视网膜祖细胞，以用于视网膜退行性疾病的干细胞治疗。 | C57BL/6J小鼠的发育中视网膜及其祖细胞。 | NA | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7166 | 2024-08-07 |
High migratory activity of dermal sheath cup cells associated with the clinical efficacy of autologous cell-based therapy for pattern hair loss
2024-Jan, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.11.003
PMID:38016881
|
研究论文 | 本文研究了真皮鞘杯细胞（DSC）在自体细胞疗法中治疗男性及女性脱发的效果及其机制 | 首次揭示了ITGA6阳性DSC细胞的高迁移活性可能通过促进细胞迁移到附近的毛囊来增强细胞疗法的效果 | NA | 探究DSC细胞在细胞疗法中的有效性及其作用机制 | DSC细胞的基因表达及其在细胞疗法中的效果 | NA | 脱发 | bulk转录组分析、定量聚合酶链反应、单细胞转录组分析、活细胞成像结合免疫染色 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7167 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals alterations in perivascular macrophage lipid metabolism in the onset of Wooden Breast myopathy in broiler chickens
2024-02-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53904-5
PMID:38342952
|
研究论文 | 本研究旨在利用空间转录组学特征化与木胸肌病微观特征相关的细胞类型特异性表达谱 | 揭示了在木胸肌病早期阶段中周围血管巨噬细胞脂质代谢的改变 | 样本量较小，仅使用了三只鸡的肌肉样本 | 研究木胸肌病早期的细胞互作和基因表达模式 | 23天大肉鸡的右胸大肌的肌肉样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 肌肉样本 | 3只肉鸡 | NA | NA | NA | NA |
| 7168 | 2024-08-07 |
CD40 is expressed in the subsets of endothelial cells undergoing partial endothelial-mesenchymal transition in tumor microenvironment
2024-Feb, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16045
PMID:38111334
|
研究论文 | 本文研究了肿瘤微环境中部分内皮-间质转化过程中表达CD40的特定内皮细胞亚群 | 建立了新的EndoMT报告细胞系统EMRECs，并鉴定了CD40作为部分EndoMT特异性标记物 | NA | 深入理解TGF-β诱导的EndoMT机制，并促进针对EndoMT驱动的癌症进展和转移的新治疗策略的开发 | 内皮细胞在部分内皮-间质转化过程中的基因表达和CD40的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类肿瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7169 | 2024-08-07 |
A Data-Distribution and Successive Spline Points based discretization approach for evolving gene regulatory networks from scRNA-Seq time-series data using Cartesian Genetic Programming
2024-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105126
PMID:38278505
|
研究论文 | 本文提出了一种基于数据分布和连续样条点的离散化方法，用于从scRNA-Seq时间序列数据中进化基因调控网络，使用笛卡尔遗传编程 | 本文提出的分布和连续样条点离散化（DSSPD）方法考虑了数据分布和适当的预处理步骤，改进了基因调控网络的推断结果 | NA | 推断基因调控网络 | scRNA-Seq时间序列数据 | 系统生物学 | NA | scRNA-Seq | 笛卡尔遗传编程（CGP） | 时间序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7170 | 2024-08-07 |
Widespread monoclonal IgE antibody convergence to an immunodominant, proanaphylactic Ara h 2 epitope in peanut allergy
2024-01, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.08.035
PMID:37748654
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了花生过敏中人类单克隆IgE抗体的序列、亲和力、克隆性和功能特性 | 发现了IgE单克隆抗体的显著趋同进化现象，并揭示了主要过敏原蛋白上的免疫优势表位 | NA | 定义花生过敏中人类单克隆IgE抗体的序列、亲和力、克隆性和功能特性 | 花生过敏患者的单克隆IgE抗体 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自不同年龄、性别、种族和地理位置的过敏个体样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7171 | 2024-08-07 |
LINC00960 affects osteosarcoma treatment and prognosis by regulating the tumor immune microenvironment
2024-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24990
PMID:38352756
|
研究论文 | 本研究探讨了LINC00960在骨肉瘤中的表达及其对肿瘤免疫微环境的调控作用，评估了其在骨肉瘤治疗和预后中的价值 | 发现LINC00960在骨肉瘤中的高表达与转移和不良预后相关，并可能作为新的生物标志物用于预测骨肉瘤患者的总体生存 | NA | 评估LINC00960在骨肉瘤中的预后和治疗价值，并分析其作用机制 | 骨肉瘤患者的LINC00960表达及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 85例骨肉瘤样本及6例骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 7172 | 2024-08-07 |
A Novel Approach for Pancreas Transcriptomics Reveals the Cellular Landscape in Homeostasis and Acute Pancreatitis
2024-Feb-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.043
PMID:38325760
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FixNCut的单细胞RNA测序方法，用于研究胰腺在稳态和急性胰腺炎中的细胞景观 | FixNCut方法通过可逆固定组织，提高了对胰腺细胞，特别是腺泡细胞和免疫细胞的定义，为研究胰腺生物学和疾病提供了一个广泛适用的方法和参考图谱 | NA | 创新一种方法，克服现有单细胞RNA测序研究中腺泡细胞代表性不足的问题，加速对胰腺在健康和疾病状态下的研究 | 胰腺在稳态和急性胰腺炎中的细胞景观 | 数字病理学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用已建立的小鼠急性胰腺炎模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 7173 | 2024-08-07 |
Cuproptosis/OXPHOS tendency prediction of prognosis and immune microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma: Bioinformatics analysis and experimental validation
2024-Apr-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148156
PMID:38211899
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了氧化磷酸化（OXPHOS）与铜死亡（cuproptosis）在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的关联及其对预后的影响 | 首次揭示了OXPHOS与ESCC中铜死亡倾向的关系，并构建了铜死亡-OXPHOS预后标志物 | NA | 研究OXPHOS与ESCC中铜死亡倾向的关系及其对预后的影响 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的铜死亡和氧化磷酸化 | 生物信息学 | 食管癌 | scRNA-seq | CNN | 单细胞数据 | 10种核心细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 7174 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-sequencing data generated from mouse adipose tissue during the development of obesity
2024-Apr, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2024.110119
PMID:38348326
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠附睾脂肪组织在肥胖发展过程中免疫微环境的变化及其细胞类型和基因的变化 | 首次探讨了肥胖早期阶段脂肪组织是否释放促炎细胞因子的问题，并分析了肥胖发展过程中脂肪组织免疫微环境的变化 | NA | 研究肥胖发展过程中脂肪组织的免疫微环境和细胞类型及基因的变化 | 小鼠附睾脂肪组织在肥胖发展过程中的免疫微环境 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7175 | 2024-08-04 |
Microfluidic platform for omics analysis on single cells with diverse morphology and size: A review
2024-Mar-15, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.342217
PMID:38336406
|
综述 | 本文综述了基于微流体的单细胞组学分析及其在形态学和大小多样性上的应用 | 本文的创新之处在于全面概述了基于微流体的单细胞组学最新成就，强调了不同微流体平台的整合及其在以细胞形态为基础的分离中的意义 | 当前缺乏对复杂形态和尺寸细胞的组学信息的综合分析 | 探讨最佳平台技术以解码复杂形态和尺寸细胞的组学数据 | 研究微流体技术在植物和动物单细胞分离中的应用 | 数字病理学 | NA | 微流体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7176 | 2024-08-07 |
Induction of lung progenitor cell-like organoids by porcine pluripotent stem cells
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302402R
PMID:38334430
|
研究论文 | 本研究通过猪多能干细胞诱导生成肺祖细胞样类器官，并探讨了猪肺发育过程中的细胞类型和信号通路 | 首次报道了猪肺细胞的生成和发展，并确定了NKX2.1和FOXA2作为猪肺发育的关键核心转录因子 | NA | 研究猪肺发育和再生 | 猪多能干细胞诱导的肺祖细胞样类器官 | 数字病理学 | 肺部疾病 | scRNA-seq | Monocle算法 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7177 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of aging mouse liver
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302282R
PMID:38334462
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了衰老小鼠肝脏的分子和细胞过程 | 首次全面分析了衰老过程中肝脏的单细胞转录组变化，揭示了衰老相关的细胞组成和基因表达变化 | NA | 探究衰老对小鼠肝脏的分子和细胞影响 | 衰老小鼠肝脏的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7178 | 2024-08-07 |
Integrated Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Kidney Endothelial Cells
2024-Feb-14, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000320
PMID:38351505
|
研究论文 | 本文通过重新处理和整合7个关于人类肾脏控制单细胞/单核RNA测序数据集，构建了一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱 | 首次系统地描述了人类肾脏内皮细胞的异质性，并发现了7个具有不同分子特征和生理功能的内皮细胞亚群 | NA | 构建一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱，以理解这些细胞在疾病、衰老和物种间的变化 | 人类肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞/单核RNA测序 (sc/snRNAseq) | NA | 转录组数据 | 超过200,000个肾脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7179 | 2024-08-04 |
vissE: a versatile tool to identify and visualise higher-order molecular phenotypes from functional enrichment analysis
2024-Feb-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05676-y
PMID:38331751
|
研究论文 | vissE是一个灵活的网络分析和可视化工具，用于从功能富集分析中识别和可视化高阶分子表型 | 本研究提出的vissE工具通过组织信息和提供多种可视化模块，克服了路径分析中结果冗余的问题 | 未提及具体的限制信息 | 旨在增强分子发现过程中的基因集富集和路径分析工作流程 | 应用vissE于三种不同技术的功能分析，包括乳腺癌的空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7180 | 2024-08-07 |
UPP1 promotes lung adenocarcinoma progression through the induction of an immunosuppressive microenvironment
2024-Feb-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45340-w
PMID:38331898
|
研究论文 | 本研究通过综合单细胞RNA测序数据分析，揭示了UPP1通过诱导免疫抑制微环境促进肺腺癌进展的机制 | 首次发现UPP1肿瘤细胞与免疫抑制微环境的关联，并通过多种技术手段验证了UPP1在肺腺癌中的免疫抑制作用 | NA | 深入了解肺腺癌进展的分子机制 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 377,574个细胞来自117名肺腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |