单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7521 篇文献，本页显示第 7161 - 7180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7161 | 2024-08-07 |
MMP14high macrophages orchestrate progressive pulmonary fibrosis in SR-Ag-induced hypersensitivity pneumonitis
2024-Feb, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107070
PMID:38218353
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研究论文 | 本研究探讨了MMP14高表达的巨噬细胞在SR-Ag诱导的过敏性肺炎中促进肺纤维化的机制 | 通过单细胞RNA测序分析，首次鉴定出MMP14高表达的巨噬细胞亚群，并揭示了其在促进纤维母细胞向肌纤维母细胞转化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究MMP14高表达的巨噬细胞在过敏性肺炎中的作用及其潜在的治疗靶点 | MMP14高表达的巨噬细胞及其在肺纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | 决策树模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 7162 | 2024-08-07 |
All-potassium channel CRISPR screening reveals a lysine-specific pathway of insulin secretion
2024-Feb, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101885
PMID:38246588
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研究论文 | 本研究使用CRISPR-Cas9介导的钾通道敲除和单细胞RNA测序技术，在胰腺β细胞系中识别与胰岛素分泌相关的基因 | 首次揭示了赖氨酸特异性的胰岛素分泌途径，并确定了Kcnh6作为关键的钾通道 | 研究仅在特定的胰腺β细胞系中进行，可能需要进一步的体内研究以验证结果 | 识别与胰岛素分泌相关的基因，特别是影响钾通道功能的基因 | 胰腺β细胞中的钾通道及其对胰岛素分泌的影响 | NA | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 83个钾通道基因被敲除，使用了胰腺β细胞系 |
| 7163 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals colonic immune perturbations during amyloid-β driven Alzheimer's disease in mice
2024-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.27.573841
PMID:38352325
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研究论文 | 这篇论文揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中，肠道免疫扰动的单细胞转录组学研究 | 文章首次揭示了阿尔茨海默病与肠道免疫机制之间的关联，特别是CXCR4抗体分泌细胞的显著减少 | 该研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的免疫机制 | 研究肠-脑轴在阿尔茨海默病中的免疫机制 | 使用5XFAD阿米洛β小鼠模型研究肠道免疫活动 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用5XFAD小鼠模型进行实验，样本数量未具体说明 |
| 7164 | 2024-08-07 |
Toward the Identifiability of Comparative Deep Generative Models
2024-Jan-29, ArXiv
PMID:38351930
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研究论文 | 本文提出了一种针对比较深度生成模型（DGMs）的可识别性理论，通过扩展非线性独立成分分析领域的最新进展，展示了在混合函数为分段仿射（如由ReLU神经网络参数化）时模型的可识别性，并探讨了模型误指定的影响。 | 本文通过理论分析和实验验证，提出了一种新的方法来提高比较DGMs的可识别性，特别是在处理多个数据源时通过多目标优化和约束优化调整超参数。 | 文章指出，现有的比较DGMs方法通常依赖于没有理论基础的临时正则化方案，且在实际应用中，DGMs自然推断可解释和模块化的潜在表示是一个问题。 | 研究旨在提高比较深度生成模型的可识别性和实用性。 | 研究对象是比较深度生成模型及其在不同数据集比较中的应用。 | 机器学习 | NA | 深度生成模型（DGMs） | ReLU神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 文章未具体提及样本数量 |
| 7165 | 2024-08-04 |
scCorrector: a robust method for integrating multi-study single-cell data
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad525
PMID:38271483
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研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器的模型scCorrector，用于整合来自不同研究的单细胞数据 | scCorrector通过研究特异性自适应归一化来优化不同研究的单细胞数据整合，且在不同条件下表现出竞争力和稳健性 | 暂无明确提及的限制 | 旨在解决多研究单细胞数据整合过程中的技术噪声、样本异质性等挑战 | 整合来自不同研究的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 变分自编码器 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 7166 | 2024-08-07 |
Nasopharyngeal neutrophilic-retention signatures could predict disease progression in early SARS-CoV-2 infection
2024-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29328
PMID:38146903
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了COVID-19患者鼻咽拭子中的中性粒细胞相关基因表达，并发现与疾病严重程度相关的四个基因组成的NSAP可以作为早期诊断严重COVID-19的标志物 | 首次揭示了鼻咽部中性粒细胞的功能特征及其在预测COVID-19疾病进展中的作用，并识别出与疾病进展相关的四个基因组成的NSAP | NA | 探究鼻咽部中性粒细胞在COVID-19早期感染中的动态变化及其预测疾病进展的作用 | COVID-19患者的鼻咽拭子样本 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 包括轻度、中度、重度COVID-19患者及健康对照的鼻咽拭子样本 |
| 7167 | 2024-08-07 |
Ivabradine Alleviates Experimental Autoimmune Myocarditis-Mediated Myocardial Injury
2024, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-330
PMID:38296563
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研究论文 | 研究伊伐布雷定在实验性自身免疫性心肌炎模型中对心肌损伤的影响及其机制 | 首次探讨伊伐布雷定通过抑制HCNs通道在心肌炎中的抗炎作用 | 研究仅在动物模型中进行，需进一步在人体中验证 | 探究伊伐布雷定在心肌炎中的作用及其机制 | 实验性自身免疫性心肌炎大鼠模型 | 心血管疾病 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 32只Lewis大鼠 |
| 7168 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of single cell and bulk data develops a promising prognostic signature for improving immunotherapy responses in ovarian cancer
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298125
PMID:38346070
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量数据集成的优势，分析卵巢癌的肿瘤异质性，并开发了一种新的预后标志物，以改善卵巢癌患者的免疫治疗反应 | 首次综合利用单细胞和批量数据来解码卵巢癌的肿瘤异质性，并开发了一种稳定的细胞特征基因相关预后标志物（CCIS） | 研究基于公开数据集，可能存在样本选择偏倚；预后标志物的临床应用需要进一步的验证 | 探索卵巢癌的肿瘤异质性，并开发新的预后标志物以改善患者的免疫治疗反应 | 卵巢癌患者的肿瘤异质性及预后标志物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 包括E-MTAB-8107、TCGA-OV、GSE63885和GSE26193四个队列的公开数据集 |
| 7169 | 2024-08-07 |
Scrutinizing the human TEX genes in the context of human male infertility
2024-Mar, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13511
PMID:37594251
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研究论文 | 本文通过筛选1305名男性的外显子测序数据，包括1056名隐匿性和无精子症患者，以及分析睾丸特异性单细胞RNA测序数据，研究了人类TEX基因在男性不育中的作用，并验证了先前描述的疾病关联。 | 本文发现了TEX10、ZFAND3（TEX27）和TEX33作为新的潜在候选基因，这些基因可能与非阻塞性无精子症相关。 | NA | 旨在筛选人类TEX基因中的新型潜在候选基因，并验证先前描述的疾病关联。 | 人类TEX基因及其在男性不育中的作用。 | NA | 男性不育 | 外显子测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 1305名男性，包括1056名隐匿性和无精子症患者 |
| 7170 | 2024-08-07 |
ADAR1 Inhibits Macrophage Apoptosis and Alleviates Sepsis-induced Liver Injury Through miR-122/BCL2A1 Signaling
2024-Feb-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2023.00171
PMID:38343614
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过miR-122/BCL2A1信号通路抑制巨噬细胞凋亡并减轻脓毒症引起的肝损伤的作用机制 | 首次揭示了ADAR1通过miR-122/BCL2A1信号通路减轻脓毒症引起的肝损伤 | NA | 研究ADAR1在脓毒症引起肝损伤中的作用及其机制 | ADAR1在脓毒症中的作用及通过miR-122/BCL2A1信号通路的影响 | NA | 脓毒症 | 转录组和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括来自脓毒症患者的PBMCs和CLP诱导的脓毒症小鼠模型 |
| 7171 | 2024-08-04 |
Prior dengue virus serotype 3 infection modulates subsequent plasmablast responses to Zika virus infection in rhesus macaques
2024-Feb-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03160-23
PMID:38349142
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研究论文 | 本研究探讨了先前登革热病毒3型感染如何影响恒河猴对寨卡病毒的浆细胞响应 | 本研究揭示了先前登革热病毒感染对后续寨卡病毒感染的抗体反应质量的影响 | 样本量较小，仅包括4只恒河猴 | 理解先前的登革热病毒感染如何影响后续的寨卡病毒免疫反应 | 研究对象为感染过登革热病毒3型的恒河猴 | 免疫学 | 寨卡病毒感染 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 4只恒河猴 |
| 7172 | 2024-08-07 |
Decoding the mechanisms of chimeric antigen receptor (CAR) T cell-mediated killing of tumors: insights from granzyme and Fas inhibition
2024-02-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06461-8
PMID:38307835
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研究论文 | 研究揭示了嵌合抗原受体（CAR）T细胞介导的肿瘤杀伤机制，特别是通过抑制粒酶B和Fas的途径 | 发现CAR T细胞杀伤肿瘤的机制具有冗余性，需要同时抑制多个特定于肿瘤细胞的途径 | 研究主要集中在特定的细胞系和特定的抑制剂，可能需要进一步的临床验证 | 提高CAR T细胞治疗癌症的疗效并识别导致肿瘤逃逸的T细胞失败机制 | CAR T细胞、肿瘤细胞、粒酶B抑制剂PI9、Fas途径 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及多种肿瘤细胞系和患者输注产品 |
| 7173 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of the immune system in ME/CFS at baseline and following symptom provocation
2024-01-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101373
PMID:38232699
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研究论文 | 本文研究了慢性疲劳综合症 (ME/CFS) 中免疫系统的单细胞转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示ME/CFS患者在基线和剧烈运动后免疫细胞的变化 | 样本大小和特定群体的选择可能限制了研究结果的普遍适用性 | 探讨ME/CFS中免疫系统的失调 | ME/CFS患者与对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性疲劳综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | ME/CFS患者和对照组的免疫细胞样本 |
| 7174 | 2024-08-07 |
Targeting cell-type-specific, choroid-peripheral immune signaling to treat age-related macular degeneration
2024-01-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101353
PMID:38232696
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了65名包括AMD患者和对照组的外周血单核细胞，并整合现有脉络膜数据，生成AMD中失调的脉络膜-外周免疫交互网络，验证了CYR61在抑制CNV中的作用。 | 首次揭示了CYR61在脉络膜静脉中的上调及其对循环中单核细胞的信号作用，并验证了其在小鼠模型中抑制CNV的作用。 | NA | 旨在通过靶向细胞特异性、脉络膜外周免疫信号来治疗年龄相关性黄斑变性。 | 年龄相关性黄斑变性患者的外周血单核细胞和脉络膜。 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 65名个体 |
| 7175 | 2024-08-07 |
Melatonin alleviates the toxic effect of di(2-ethylhexyl) phthalate on oocyte quality resulting from CEBPB suppression during primordial follicle formation
2024-03-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132997
PMID:38008054
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研究论文 | 本研究通过建立暴露于邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯（DEHP）和褪黑素的怀孕小鼠模型，利用单细胞转录组技术探讨了褪黑素对卵巢细胞中DEHP影响的缓解作用 | 研究发现褪黑素通过增强CEBPB表达，改善了由DEHP引起的原始卵泡形成过程中的损害，并减少了卵巢细胞的凋亡 | NA | 探讨褪黑素如何缓解DEHP对卵子质量的毒性影响，特别是在原始卵泡形成过程中CEBPB抑制的作用 | 怀孕小鼠及其卵巢细胞 | NA | 生殖健康 | 单细胞转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 7176 | 2024-08-07 |
Defining Endogenous Mitochondrial Transfer in Muscle After Rotator Cuff Injury
2024-02, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465231214225
PMID:38174367
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研究论文 | 研究肩袖损伤后肌肉中纤维脂肪原性前体细胞（FAPs）向肌源性细胞的线粒体横向转移及其对β-激动剂处理的反应 | 描述了一种新的内源性线粒体转移过程，该过程在肩袖损伤后FAPs和肌源性细胞之间发生 | 尚未完全阐明FAPs发挥其有益作用的机制 | 研究FAPs向肌源性细胞的线粒体横向转移，并探讨β-激动剂对此过程的影响 | 纤维脂肪原性前体细胞（FAPs）和肌源性细胞 | NA | 肩袖损伤 | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选，流式细胞术，荧光显微镜，旋转盘共聚焦显微镜，双光子显微镜 | NA | RNA | 小鼠模型，C2C12肌母细胞 |
| 7177 | 2024-08-07 |
Intercellular crosstalk shapes purinergic metabolism and signaling in cancer cells
2024-01-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113643
PMID:38175748
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研究论文 | 本文评估了五种癌症细胞系在常氧和缺氧条件下所有关键嘌呤外酶的酶动力学，并结合单细胞RNA测序数据分析了嘌呤代谢的异质性 | 发现嘌呤代谢在癌症组织中具有空间异质性，且在不同细胞类型间存在差异 | NA | 研究细胞间对话如何影响癌症细胞中的嘌呤代谢和信号传导 | 五种癌症细胞系（霍奇金淋巴瘤、多发性骨髓瘤、胰腺腺癌、膀胱癌和胶质母细胞瘤）的嘌呤外酶酶动力学 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五种癌症细胞系，包括恶性细胞、基质细胞和免疫细胞 |
| 7178 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Analysis of Lamina Propria Lymphocytes in the Jejunum Reveals Innate Lymphoid Cell-like Cells in Pigs
2024-01-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300463
PMID:37975680
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析猪空肠中的淋巴细胞，发现猪空肠固有层淋巴细胞中存在类似先天淋巴细胞的细胞 | 首次详细描述了猪空肠先天淋巴细胞的基因表达、亚型分类及各种先天淋巴细胞的标记物 | NA | 探索猪肠道黏膜免疫的深入研究 | 猪空肠固有层淋巴细胞中的先天淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 猪空肠中的多种细胞类型 |
| 7179 | 2024-08-04 |
Alternative Polyadenylation Characterizes Epithelial and Fibroblast Phenotypic Heterogeneity in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-Feb-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16030640
PMID:38339391
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研究论文 | 这篇文章探讨了3'非翻译区选择性聚腺苷酸化(3' UTR-APA)如何特征化胰腺导管腺癌中的表型异质性 | 文章首次揭示了3' UTR-APA事件在肿瘤细胞状态表型异质性中的作用 | 目前未能完全理解转录和表型异质性的机制驱动因素 | 研究3' UTR-APA如何影响肿瘤细胞状态的表型异质性 | 胰腺导管腺癌中的不同细胞状态 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | 最大的单细胞人胰腺导管腺癌(PDAC)数据集 |
| 7180 | 2024-08-04 |
Identification of Hypoxia Prognostic Signature in Glioblastoma Multiforme Based on Bulk and Single-Cell RNA-Seq
2024-Feb-01, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16030633
PMID:38339384
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研究论文 | 本研究旨在基于多组学分析识别脑胶质瘤中的缺氧预后标志 | 提出了一种由六个基因组成的缺氧相关预后标志，并揭示其与免疫细胞浸润的相关性 | 研究可能受限于公共数据库样本的选择和多组学分析的复杂性 | 识别缺氧相关的差异表达基因并构建脑胶质瘤患者的预后模型 | 脑胶质瘤患者的缺氧相关基因 | 数字病理 | 脑胶质瘤 | RNA-Seq | Cox回归 | 基因表达数据 | 从多个公共数据库收集的样本数量不详 |