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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7081 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of MC1R-inhibited melanocytes
2024-Mar, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13141
PMID:37972124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了MC1R抑制的黑色素细胞,揭示了与黑色素生成和肿瘤转化相关的新基因集。 | 首次定义了MC1R抑制的基因签名(MiGS),并发现TBX3基因在黑色素生成和细胞衰老逃避中的作用。 | NA | 探究MC1R信号减弱如何影响黑色素生成和增加黑色素瘤易感性的机制。 | MC1R抑制的黑色素细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 来自红色头发颜色(RHC)小鼠模型的黑色素细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7082 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome landscape of zebrafish liver reveals hepatocytes and immune cell interactions in understanding nonalcoholic fatty liver disease
2024-Mar, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109428
PMID:38325594
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了斑马鱼肝脏的转录组图谱,揭示了肝细胞与免疫细胞在非酒精性脂肪肝病发展中的相互作用 | 首次构建了斑马鱼肝脏的单细胞转录组图谱,并揭示了肝细胞与免疫细胞在非酒精性脂肪肝病中的相互作用 | NA | 研究非酒精性脂肪肝病中肝细胞与免疫细胞的相互作用 | 斑马鱼肝脏中的肝细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及10种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 7083 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis dissects lncRNA-associated gene networks in Arabidopsis
2024-Feb-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100717
PMID:37715446
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了拟南芥中长非编码RNA(lncRNA)相关的基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下绘制了lncRNA及其相关基因调控网络的转录异质性图谱 | NA | 探索植物lncRNA生物学中的单细胞数据整合分析能力,并深入了解lncRNA表达特异性和相关基因调控 | 拟南芥中的lncRNA及其相关基因调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 28个已发表的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 7084 | 2024-08-07 |
Systems Analysis of Immune Changes after B-cell Depletion in Autoimmune Multiple Sclerosis
2024-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.576204
PMID:38370778
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了B细胞耗竭后在多发性硬化症患者中免疫景观的变化 | 首次全面揭示了B细胞耗竭治疗多发性硬化症后免疫细胞类型特异性变化及其功能影响 | NA | 探索B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的影响 | 多发性硬化症患者的免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 7085 | 2024-08-04 |
Breaks for Precision Medicine in Cancer: Development and Prospects of Spatiotemporal Transcriptomics
2024-Feb, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2023.0116
PMID:38181185
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综述 | 本文回顾了时空转录组学在癌症研究中的整合策略及其最新进展 | 提出时空转录组学与单细胞RNA测序的数据整合,为癌症精确治疗提供新思路 | 对时空转录组学的整体应用仍处于初步探索阶段 | 揭示癌症的基因表达空间模式和细胞群体的空间异质性 | 癌症患者与细胞群体的基因表达及微环境相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7086 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing in melanoma: what have we learned so far?
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104969
PMID:38241976
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序在黑色素瘤中的应用及其带来的见解 | 探讨了单细胞测序技术如何促进对黑色素瘤异质性的理解 | 未明确列出局限性 | 分析黑色素瘤中的肿瘤内异质性及其对治疗反应的影响 | 黑色素瘤细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7087 | 2024-08-07 |
Genomic profiling and associated B cell lineages delineate the efficacy of neoadjuvant anti-PD-1-based therapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104971
PMID:38244291
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研究论文 | 本研究通过整合全外显子测序、单细胞RNA测序和免疫荧光数据,分析了24名接受新辅助PD-1抑制剂联合紫杉醇和铂类化疗的食管鳞状细胞癌(ESCC)患者的样本,以确定与治疗反应的相关性 | 研究发现DNA错配修复(MMR)途径的改变在最佳反应患者中频繁出现,并与肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)相关。此外,识别了B细胞在ESCC中的二分发展轨迹,其中LMO2+生发中心B细胞在响应肿瘤中富集,而CD55+记忆B细胞与组合治疗的较差反应相关 | NA | 旨在通过全面的肿瘤MMR途径改变和肿瘤内B细胞特征评估,改进接受新辅助化疗免疫治疗的ESCC患者的筛选和管理 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 24名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 7088 | 2024-08-07 |
High-dimensional profiling of regulatory T cells in psoriasis reveals an impaired skin-trafficking property
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104985
PMID:38306895
|
研究论文 | 本研究通过高维39标记质谱流式细胞术(CyTOF)面板,深入分析了31名银屑病患者和32名健康对照者的皮肤归巢调节性T细胞(Tregs)的免疫景观,并结合体外趋化因子介导的Treg迁移实验、免疫荧光成像以及公共单细胞RNA测序数据,揭示了银屑病患者Tregs的皮肤归巢特性受损。 | 首次深入探索了银屑病患者皮肤归巢Tregs的分子特性,发现CLAhi Tregs和CLAhiCCR5+ Tregs在银屑病患者中的总体减少,以及功能标记物CD39和FoxP3的升高,CCR7表达增加而CCR4和CLA表达减少,这些变化与疾病严重程度相关。 | NA | 探究银屑病患者皮肤归巢调节性T细胞的分子特性和功能状态。 | 银屑病患者的皮肤归巢调节性T细胞。 | 免疫学 | 银屑病 | 质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 31名银屑病患者和32名健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 7089 | 2024-08-04 |
Glycogen metabolism-mediated intercellular communication in the tumor microenvironment influences liver cancer prognosis
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029697
PMID:38361757
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研究论文 | 本研究揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的作用 | 首次揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的机制 | 暂无该研究的局限性信息 | 探讨糖原代谢在肝细胞癌微环境中的功能及其对预后的影响 | 肝细胞癌肿瘤样本中的69个细胞簇和65个糖原代谢基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 10个HCC肿瘤样本,共计64,545个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7090 | 2024-08-04 |
scRNA-seq revealed high stemness epithelial malignant cell clusters and prognostic models of lung adenocarcinoma
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54135-4
PMID:38355636
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA-seq分析识别肿瘤干细胞相关的预后模型,以预测肺腺癌的预后、化疗药物及免疫治疗效果 | 本研究提出了一种基于干细胞相关基因的模型,以预测肺腺癌的预后和免疫微环境 | 该研究的样本量及数据来源可能限制了结论的广泛适用性 | 研究肺腺癌的预后因素及干细胞特征 | 样本包括高干细胞特征的恶性上皮细胞和肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CoxBoost + RSF模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7091 | 2024-08-04 |
An aging-related immune landscape in the hematopoietic immune system
2024-Jan-02, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00403-2
PMID:38169405
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研究论文 | 本文描述了年轻和老年小鼠的脾脏和骨髓的造血免疫图谱 | 研究揭示了老化过程中造血干细胞的功能和组成发生了重大变化 | 未提及具体的样本数量和多样性 | 探讨老龄化对造血免疫系统的整体影响 | 年轻和老年小鼠的造血免疫系统 | 数字病理 | 老年疾病 | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7092 | 2024-08-07 |
GAS6 attenuates sepsis-induced cardiac dysfunction through NLRP3 inflammasome-dependent mechanism
2024-01, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究探讨了GAS6在脓毒症引起的心脏功能障碍中的心肌调节作用及其通过NLRP3炎症小体的机制 | 首次揭示了GAS6通过调节NLRP3炎症小体减轻脓毒症引起的心脏功能障碍 | NA | 研究GAS6在脓毒症中的心肌保护作用及其机制 | GAS6在脓毒症中的作用及其对心脏功能的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括脓毒症患者和脓毒症小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 7093 | 2024-08-07 |
A deep learning adversarial autoencoder with dynamic batching displays high performance in denoising and ordering scRNA-seq data
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109027
PMID:38361616
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研究论文 | 本文提出了一种动态批量对抗自编码器(DB-AAE),用于提高单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据的去噪效果和生物信号保留 | DB-AAE能够直接从输入数据中捕获最优特征,并增强特征保留,包括细胞类型特异性基因表达模式 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的质量和可靠性 | scRNA-seq数据的去噪和生物信号保留 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 对抗自编码器(AAE) | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7094 | 2024-08-04 |
Biomarkers and prognostic factors of PD-1/PD-L1 inhibitor-based therapy in patients with advanced hepatocellular carcinoma
2024-Feb-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00535-z
PMID:38355603
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综述 | 本文总结了PD-1/PD-L1抑制剂在晚期肝细胞癌患者中的生物标志物和预后因素。 | 首次通过评估单细胞测序和空间转录组学的最新进展,揭示肿瘤异质性以及其生物标志物与预后的关系 | 可能缺乏关于某些预后因素和生物标志物的具体临床应用示例 | 探讨晚期肝细胞癌患者中使用PD-1/PD-L1抑制剂的生物标志物与预后因素 | 晚期肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的相关标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 生物标志物分析 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7095 | 2024-08-07 |
Glycosylation-related genes mediated prognostic signature contribute to prognostic prediction and treatment options in ovarian cancer: based on bulk and single‑cell RNA sequencing data
2024-Feb-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11908-4
PMID:38355446
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据,识别与卵巢癌相关的糖基化相关基因,构建预测预后和免疫治疗的基因签名 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据构建糖基化相关基因签名,用于卵巢癌的预后预测和治疗策略 | NA | 识别卵巢癌中的主要糖基化相关基因,并构建有效的基因签名以预测预后和免疫治疗 | 卵巢癌患者的糖基化相关基因及其在预后和免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | COX回归, LASSO回归 | RNA测序数据 | 1187个糖基化相关基因, 16个基因签名 | NA | NA | NA | NA |
| 7096 | 2024-08-07 |
Fine particulate matter 2.5 induces susceptibility to Pseudomonas aeruginosa infection via expansion of PD-L1high neutrophils in mice
2024-Feb-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02640-x
PMID:38355515
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研究论文 | 本研究探讨了细颗粒物PM2.5暴露如何通过扩张表达PD-L1的高中性粒细胞导致小鼠对铜绿假单胞菌感染的易感性增加 | 首次揭示了PM2.5暴露通过扩张PD-L1高表达的中性粒细胞,影响其吞噬功能,从而增加对铜绿假单胞菌感染的易感性 | 研究主要在动物模型中进行,未来需在人体中验证相关发现 | 探讨PM2.5暴露对呼吸系统健康的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的中性粒细胞和铜绿假单胞菌感染 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多只小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 7097 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomics uncovers an enhanced association between the prion protein gene expression and vesicle dynamics signatures in glioblastomas
2024-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11914-6
PMID:38347462
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研究论文 | 本研究揭示了朊蛋白基因表达与胶质母细胞瘤中的囊泡动力学特征之间增强的关联。 | 本研究首次展示了PrPC作为胶质母细胞瘤中囊泡生物学调节因子的潜在角色,并且引入了一种新的研究工具GBMdiscovery。 | 本研究主要依赖于公开的RNA测序数据,可能存在数据偏倚和适用性限制。 | 研究PRNP/PrPC在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其分子机制。 | 以患者来源的胶质母细胞瘤为研究对象,分析其RNA测序数据。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及来自四项独立研究的患者来源胶质母细胞瘤的公开RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 7098 | 2024-08-04 |
Residual ANTXR1+ myofibroblasts after chemotherapy inhibit anti-tumor immunity via YAP1 signaling pathway
2024-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45595-3
PMID:38346978
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研究论文 | 这篇文章探讨了化疗后残留的ANTXR1+肌成纤维细胞如何通过YAP1信号通路抑制抗肿瘤免疫。 | 首次揭示了高分级浆液性卵巢癌中化疗对CAF群体的影响及其与抗肿瘤免疫的关系,特别是YAP1信号通路的作用。 | 研究主要集中在高分级浆液性卵巢癌,可能不适用于其他类型的癌症。 | 研究化疗对癌症相关成纤维细胞群体的影响,并探讨其对抗肿瘤免疫的作用。 | 针对在高分级浆液性卵巢癌中发现的不同CAF群体进行研究,特别是CAF-S1群体。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞分析、空间转录组学和免疫组化 | NA | 生物组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7099 | 2024-08-04 |
Hypoblast from human pluripotent stem cells regulates epiblast development
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06871-2
PMID:38052228
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研究论文 | 本文报告了利用人类多能干细胞生成真实的原始膜细胞的方法及其在胚胎发育中的作用 | 提出了利用人类多能干细胞生成的原始膜细胞在体外自组织模型中的创新应用 | 受伦理和法律限制,后植入阶段的研究受到限制 | 研究人类胚胎发育过程中的原始膜细胞及其机制 | 人类多能干细胞及其衍生的原始膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 三维双层结构模型 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7100 | 2024-08-07 |
Sstr2 Defines the Cone Differentiation-Competent Late-Stage Retinal Progenitor Cells in the Developing Mouse Retina
2024-Jan-12, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad073
PMID:37935630
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了C57BL/6J小鼠发育中视网膜的转录组,发现生长抑素受体2(Sstr2)在具有光感受器分化潜能的晚期视网膜祖细胞(RPCs)中特异性表达,并验证了Sstr2+细胞在体内分化为视锥细胞、无长突细胞和水平细胞的能力。 | 首次揭示了Sstr2在晚期RPCs中的特异性表达,并证明了Sstr2+细胞具有分化为视锥细胞的能力,为视网膜退行性疾病的治疗提供了新的生物标志物。 | NA | 旨在识别和富集能够分化为视锥细胞的视网膜祖细胞,以用于视网膜退行性疾病的干细胞治疗。 | C57BL/6J小鼠的发育中视网膜及其祖细胞。 | NA | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |