单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7508 篇文献，本页显示第 7081 - 7100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7081 | 2024-08-04 |
Combining Global-Constrained Concept Factorization and a Regularized Gaussian Graphical Model for Clustering Single-Cell RNA-seq Data
2024-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00587-7
PMID:37815679
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的计算方法GCFG，用于聚类单细胞RNA测序数据 | 该方法考虑了全局和局部信息，通过概念分解和正则化高斯图模型相结合来增强聚类性能 | 虽然GCFG在多个数据集上表现出色，但仍需在更多应用场景中验证其有效性 | 旨在提高单细胞RNA-seq数据聚类的准确性和可用性 | 研究对象为单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 正则化高斯图模型 | 基因组数据 | 14个真实的单细胞RNA-seq数据集 |
| 7082 | 2024-08-07 |
Comprehensive scRNA-seq Model Reveals Artery Endothelial Cell Heterogeneity and Metabolic Preference in Human Vascular Disease
2024-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00591-x
PMID:37976024
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，结合深度学习算法，分析了人类血管疾病中的动脉内皮细胞异质性和代谢偏好 | 本研究开发了一种基于细胞聚类的基因集评分系统，有助于识别血管疾病发展的相对阶段，并使用图形神经网络模型估计代谢偏好模式 | NA | 揭示血管疾病中内皮细胞的变化，为临床治疗提供新靶点 | 人类血管疾病中的动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 图形神经网络 | scRNA-seq数据 | 多个类型的人类血管疾病数据集 |
| 7083 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell and bulk expression data to identify and analyze cancer prognosis-related genes
2024-Feb-29, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e25640
PMID:38379985
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研究论文 | 本研究整合了单细胞和批量表达数据，以识别和分析与癌症预后相关的基因 | 该研究结合单细胞测序技术和批量表达分析，提高了对癌症预后相关生物标志物的识别能力 | 研究主要集中在乳腺癌和肺癌，对于其他类型癌症的适用性需要进一步验证 | 探讨利用单细胞和批量表达数据构建癌症预后模型的可能性 | 乳腺癌和肺癌的相关基因及其表达模式 | 数字病理学 | 乳腺癌, 肺癌 | 单细胞测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 涉及多个乳腺癌和正常组织的样本 |
| 7084 | 2024-08-04 |
Signature construction and molecular subtype identification based on liver-specific genes for prediction of prognosis, immune activity, and anti-cancer drug sensitivity in hepatocellular carcinoma
2024-Feb-19, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03242-3
PMID:38374122
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研究论文 | 文章探讨了基于肝特异性基因的肝细胞癌亚型分类及其预后、免疫活性和抗癌药物敏感性的预测 | 提出了肝特异性基因的肝细胞癌亚型分类和五基因预后模型，提供了个性化治疗的新线索 | 样本数量及其来源可能限制了结果的普遍性 | 研究肝特异性基因在肝细胞癌中的作用和分类 | 研究对象为肝细胞癌患者的RNA测序数据及相应细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 从TCGA、ICGC和GEO数据库获取的HCC样本 |
| 7085 | 2024-08-07 |
Deconvolution at the single-cell level reveals ovarian cell-type-specific transcriptomic changes in PCOS
2024-Feb-19, Reproductive biology and endocrinology : RB&E
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s12958-024-01195-w
PMID:38373962
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据对多囊卵巢综合征（PCOS）中的卵巢细胞类型特异性转录组变化进行了解卷积分析 | 首次使用单细胞RNA测序数据对PCOS中的卵巢细胞类型进行解卷积分析，揭示了细胞类型特异性的转录组变化 | 研究仅基于30个样本（15个对照 vs 15个PCOS），样本量相对较小 | 探究PCOS中卵巢组织的分子改变和细胞组成 | 多囊卵巢综合征（PCOS）中的卵巢细胞类型 | 数字病理学 | 生殖内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 30个样本（15个对照 vs 15个PCOS） |
| 7086 | 2024-08-04 |
The cycling and aging mouse female reproductive tract at single-cell resolution
2024-Feb-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.01.021
PMID:38325365
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研究论文 | 本研究系统性地表征了小鼠女性生殖道在生殖周期、妊娠和衰老过程中的形态学和基因表达变化 | 通过单细胞和空间转录组学分析，首次揭示了成纤维细胞在生殖道重塑中的中心和器官特异性角色 | 未提及具体的样本量和实验限制 | 探究生殖周期和衰老如何影响女性生殖道的重塑 | 小鼠的卵巢、输卵管、子宫、宫颈和阴道 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 7087 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing to understand host-virus interactions
2024-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2023.11.009
PMID:38008383
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析宿主与病毒相互作用中的应用及其优缺点 | scRNA-seq技术能够以单细胞分辨率分析宿主和病毒转录本及宿主-病毒相互作用 | NA | 深入探讨scRNA-seq在病毒学研究中的应用，以更好地理解致病机制并发现更有效的治疗策略 | 宿主与病毒的相互作用及免疫图谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录本 | NA |
| 7088 | 2024-08-07 |
Genome-wide DNA methylation of lesional and peri-lesional skin in vitiligo: a comparative and integrated analysis of multi-omics in Chinese population
2024-Feb, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-023-02630-5
PMID:38182908
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研究论文 | 本研究通过比较和整合分析中国人群中白癜风病变和周围皮肤的全基因组DNA甲基化情况 | 首次报道了临床白癜风及其周围皮肤的综合DNA甲基化图谱 | NA | 研究白癜风病变和周围皮肤的DNA甲基化特征，并整合转录组数据以识别差异甲基化和表达基因 | 白癜风患者的病变皮肤、周围皮肤和健康皮肤样本 | 数字病理学 | 白癜风 | Illumina 850K甲基化芯片 | NA | DNA甲基化数据和转录组数据 | 6个病变皮肤样本，6个周围皮肤样本，8个健康皮肤样本 |
| 7089 | 2024-08-07 |
Unraveling T cell exhaustion in the immune microenvironment of osteosarcoma via single-cell RNA transcriptome
2024-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03585-2
PMID:38280005
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了骨肉瘤中的T细胞耗竭现象，并构建了预测模型以评估其对患者预后的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了骨肉瘤中T细胞耗竭的分子特征及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | NA | 探讨T细胞耗竭在骨肉瘤免疫微环境中的作用及其对疾病进展的影响 | 骨肉瘤中的T细胞耗竭现象及其相关基因表达 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 7090 | 2024-08-04 |
Joint L2,p-norm and random walk graph constrained PCA for single-cell RNA-seq data
2024 Jan-Mar, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2023.2188106
PMID:36912759
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研究论文 | 本文提出了一种称为RWPPCA的新方法用于改善单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | RWPPCA结合了随机游走算法和图正则化，以更精确地确定数据点之间的局部几何关系，并引入-Lp范数使主成分更稀疏，提升了解释性 | 传统PCA在挖掘数据的非线性流形结构时存在缺陷，可能会受主成分过密的影响 | 提高单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别的有效性 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 高维数据 | 模拟数据和单细胞RNA测序数据的多个样本 |
| 7091 | 2024-08-04 |
Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy
2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2023.2296668
PMID:38288973
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研究论文 | 该研究探讨了生物钟通路在癌症治疗中的潜在重要性 | 首次全面分析了癌症中的生物钟相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 该研究仅使用了TCGA数据库的数据，可能无法涵盖所有相关表型和样本 | 探索生物钟相关基因在泛癌症中的影响 | 研究多个不同类型肿瘤中的生物钟相关基因表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据 | 使用TCGA数据库的多种癌症相关数据，包括多个肿瘤类型的样本 |
| 7092 | 2024-08-04 |
Association of peripheral B cells and delirium: combined single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1343726
PMID:38379709
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研究论文 | 本研究探讨了外周B细胞与谵妄的关联，分析了炎症压力下的免疫细胞亚群变化。 | 首次结合单细胞测序和孟德尔随机化法来探究外周免疫细胞与谵妄的因果关系 | 本研究的结果可能受到样本量和遗传数据的限制 | 研究外周免疫细胞亚群在炎症应激情况下的变化及其与谵妄的因果关联 | 人类外周血单核细胞(PBMC)及其亚群 | 数字病理学 | 谵妄 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因型数据、单细胞转录组数据 | 70个与PBMC相关的免疫性状 |
| 7093 | 2024-08-04 |
Selective inhibition of DNA ligase IV provides additional efficacy to the treatment of anaplastic thyroid cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1323313
PMID:38380364
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研究论文 | 本研究探讨了选择性抑制DNA连接酶IV对治疗未分化甲状腺癌的额外疗效 | 本研究首次显示了DNA连接酶IV抑制剂与DNA损伤剂联合应用对未分化甲状腺癌的治疗潜力 | 样本量和模型的应用限制了研究结果的广泛适用性 | 探讨选择性抑制DNA连接酶IV对未分化甲状腺癌治疗的影响 | 未分化甲状腺癌细胞系（C643和Hth74）及甲状腺癌不同亚型患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 未分化甲状腺癌 | 单细胞RNA测序，DNA损伤响应监测 | NA | RNA测序数据，细胞培养实验结果 | 多个不同亚型甲状腺癌患者的单细胞数据，使用小鼠异种移植模型进行实验 |
| 7094 | 2024-08-07 |
Distinct Transcriptional Profiles in the Different Phenotypes of Neurofibroma from the Same Subject with Neurofibromatosis 1
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.03.1688
PMID:37301319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析，探讨了同一患者中皮肤神经纤维瘤（cNF）和丛状神经纤维瘤（pNF）的转录特征和微环境差异 | 首次揭示了同一患者中cNF和pNF具有不同的转录特征，pNF中富含具有恶性特征的施万细胞和癌症相关成纤维细胞样表型的成纤维细胞，而cNF中富含带有组织驻留标记的CD8 T细胞 | 研究样本数量有限，仅包括来自不同患者的六例cNF和五例pNF | 探讨神经纤维瘤病1中不同表型的转录特征和微环境差异 | 皮肤神经纤维瘤（cNF）和丛状神经纤维瘤（pNF）的细胞类型和转录特征 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六例cNF和五例pNF样本 |
| 7095 | 2024-08-07 |
ΔNp63 Regulates Homeostasis, Stemness, and Suppression of Inflammation in the Adult Epidermis
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.07.005
PMID:37543242
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研究论文 | 本研究探讨了ΔNp63在成年表皮中的作用，发现其缺失会导致角质形成细胞增殖和自我维持受损，并触发类似银屑病的炎症反应 | 首次揭示了ΔNp63在成年表皮中调控稳态、干细胞特性及抑制炎症的关键作用 | 研究主要集中在ΔNp63的急性遗传消融对成年表皮的影响，未涉及长期或慢性消融的效应 | 探究ΔNp63在成年表皮中的功能及其对表皮稳态、干细胞特性和炎症抑制的调控机制 | ΔNp63在成年表皮中的作用及其对角质形成细胞增殖、自我维持和炎症反应的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 7096 | 2024-08-04 |
Mapping the developmental potential of mouse inner ear organoids at single-cell resolution
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109069
PMID:38375227
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研究论文 | 本文使用单细胞测序研究小鼠内耳类器官的细胞异质性 | 本研究揭示了支持细胞亚型和耳蜗样及前庭样毛细胞的发展轨迹 | 尚未明确改进突触连接和区域特异性的未来策略 | 研究内耳类器官的发育潜能及其对基本科学研究的应用 | 小鼠内耳类器官的感官上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | late-stage小鼠内耳类器官的细胞 |
| 7097 | 2024-08-04 |
A comprehensive pan-cancer analysis of prognostic value and potential clinical implications of FTH1 in cancer immunotherapy
2024-Jan-28, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03625-x
PMID:38281198
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研究论文 | 本文系统探讨了FTH1在癌症免疫疗法中的预后意义和免疫角色 | 本研究揭示了FTH1在肿瘤免疫微环境中的重要作用及其与免疫疗法抵抗之间的关联 | 本文未明确评估不同类型肿瘤对FTH1表达的影响及其潜在机制 | 探讨FTH1在多种癌症免疫治疗中的预后价值和临床潜力 | 探究FTH1作为各种实体癌免疫治疗靶点的潜力 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析和多重免疫荧光染色技术 | NA | NA | NA |
| 7098 | 2024-08-04 |
Integrating bulk-RNA sequencing and single-cell sequencing analyses to characterize adenosine-enriched tumor microenvironment landscape and develop an adenosine-related prognostic signature predicting immunotherapy in lung adenocarcinoma
2024-Jan-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01281-z
PMID:38265702
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研究论文 | 该文章探讨了腺苷信号在肺腺癌肿瘤微环境中的生物学作用，并开发了与腺苷相关的预后特征。 | 文章创新点在于量化腺苷信号，并建立了腺苷相关的预后特征，预测免疫治疗的有效性。 | 数据分析主要集中在腺苷信号与免疫微环境的关系，可能未涵盖其他重要的生物标志物。 | 探讨腺苷信号在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其在免疫治疗中的预后价值。 | 研究对象为肺腺癌样本中的腺苷信号和肿瘤免疫微环境。 | 数字病理学 | 肺癌 | bulk-RNA测序和单细胞测序 | NA | 样本数据 | LUAD样本的具体样本数量未提及 |
| 7099 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptional heterogeneity of Tbx18-positive cardiac cells during heart development
2024-Jan-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01290-6
PMID:38265516
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了Tbx18阳性心脏细胞在心脏发育过程中的转录异质性 | 首次全面揭示了Tbx18阳性心脏细胞在发育过程中的转录景观和细胞异质性 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据，未涉及实验验证 | 探索Tbx18阳性心脏细胞在心脏发育过程中的异质性和转录景观 | Tbx18阳性心脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了已发表的小鼠心脏单细胞RNA测序数据 |
| 7100 | 2024-08-04 |
Transcription Factor IRF7 is Involved in Psoriasis Development and Response to Guselkumab Treatment
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S450048
PMID:38375022
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子IRF7在银屑病发生和guselkumab治疗反应中的作用 | 该研究首次确认了IRF7在银屑病及其对guselkumab治疗反应中的重要性 | 研究可能在样本数量和多样性上存在局限性 | 研究银屑病病因及guselkumab治疗的新治疗策略 | 针对银屑病患者的基因表达及单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对12周guselkumab治疗前后的银屑病皮肤样本进行分析 |