单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 7041 - 7060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7041 | 2024-08-04 |
Multimodal Single-Cell Sequencing of B Cells in Primary Sjögren's Syndrome
2024-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42683
PMID:37610265
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研究论文 | 本研究探讨了原发性干燥综合征中B细胞的组成、基因表达和B细胞受体使用情况 | 该研究首次通过多模态单细胞测序揭示了B细胞的异质性和分子特征，提供了更深入的患者分层方法 | 样本量相对较小，可能影响结果的广泛适用性和统计力量 | 确定SSA/SSB抗体分层的原发性干燥综合征（pSS）患者中B细胞的角色 | 研究对象为6名SSA-、8名SSA+单阳性和10名SSA/SSB+双阳性的pSS患者及4名健康对照者 | 数字病理学 | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞变异、多样性及连接（VDJ）基因测序（scVDJ-seq） | NA | 单细胞数据 | 230,000个B细胞，涉及24名参与者（6名SSA-，8名SSA+，10名SSA/SSB+及4名健康对照） | NA | NA | NA | NA |
| 7042 | 2024-08-04 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
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评论 | 本研究讨论了空间组织在生物学中的基础作用及其对免疫系统的影响 | 结合多重组织学和空间转录组学技术，提供了蛋白质和基因表达模式的空间背景 | 承认空间组织剖析技术的挑战和局限性 | 探讨如何通过空间组织剖析改善对区域免疫的理解 | 重点关注组织生态位在健康和疾病中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 多重组织学和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7043 | 2024-08-04 |
Role and Therapeutic Potential for Targeting Fibroblast Growth Factor 10/FGFR1 in Relapsed Rheumatoid Arthritis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42674
PMID:37584284
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研究论文 | 该文章探讨了针对成纤维细胞生长因子10/FGFR1在复发性类风湿关节炎中的作用和治疗潜力 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示FLS异质性及其在复发与缓解中的作用，提出针对FGF10/FGFR1的靶向治疗的新思路 | 样本数量较少，仅包含六个配对的滑膜组织样本，限制了结果的广泛适用性 | 本研究旨在识别成纤维细胞样滑膜细胞(FLSs)的异质性及其在复发性类风湿关节炎中的致病作用 | 研究对象为三名复发性RA患者和三名缓解期患者的滑膜组织样本 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学 | 胶原诱导关节炎(CIA)模型 | 组织样本 | 六个配对的滑膜组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7044 | 2024-08-07 |
Endothelial Response to Type I Interferon Contributes to Vasculopathy and Fibrosis and Predicts Disease Progression of Systemic Sclerosis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42662
PMID:37488975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了I型干扰素在系统性硬化症患者中的作用及其对疾病进展的影响。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞中I型干扰素信号在系统性硬化症中的显著特征，并验证了其在疾病进展预测中的作用。 | 研究样本量相对较小，需要进一步的大规模研究来验证这些发现。 | 探讨I型干扰素在系统性硬化症中的作用及其对疾病进展的影响。 | 系统性硬化症患者的皮肤组织。 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 61名系统性硬化症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 7045 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of the impact of emerging flame retardants on prostate cancer progression: The potential molecular mechanisms and immune infiltration landscape
2024-01, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2023.153681
PMID:38006928
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研究论文 | 研究探讨新兴阻燃剂与前列腺癌之间的关联及其潜在的致癌机制和免疫浸润情况 | 构建了一个具有良好预测能力的前列腺癌风险模型，并验证了六个与阻燃剂相关的预后基因 | NA | 探索新兴阻燃剂与前列腺癌之间的联系及其潜在的致癌机制 | 新兴阻燃剂对前列腺癌进展的影响及其分子机制和免疫浸润情况 | NA | 前列腺癌 | 蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 使用TCGA数据集和GSE70769数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 7046 | 2024-08-07 |
Beyond genome: Advanced omics progress of Panax ginseng
2024-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112022
PMID:38311250
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综述 | 本文综述了人参在基因组学、转录组学和蛋白质组学领域的研究进展 | 讨论并展望了人参基因组等位基因图谱、时空转录组以及翻译后修饰蛋白质组的发展 | NA | 总结人参在不同组学领域的研究现状，并展望未来从系统生物学角度分析人参的研究方向 | 人参的基因组、转录组和蛋白质组 | NA | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7047 | 2024-08-04 |
Unveiling the oncogenic role of CLDN11-secreting fibroblasts in gastric cancer peritoneal metastasis through single-cell sequencing and experimental approaches
2024-Mar-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111647
PMID:38335659
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研究论文 | 本研究探讨了纤维母细胞在胃癌腹膜转移中的作用 | 揭示了CXCR7阳性纤维母细胞通过CLDN11在胃癌腹膜转移中的致癌角色 | 本研究主要基于公用数据库数据，可能存在样本偏倚 | 研究胃癌腹膜转移中纤维母细胞的作用 | 研究了来自腹膜转移和胃癌组织的纤维母细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | 从腹膜转移和胃癌组织提取的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7048 | 2024-08-04 |
Empagliflozin attenuates inflammation levels in autoimmune myocarditis through the STAT3 pathway and macrophage phenotype transformation
2024-Mar, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2024.02.006
PMID:38354482
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研究论文 | 本研究探讨了SGLT-2抑制剂empagliflozin在自身免疫性心肌炎中的抗炎作用及其分子机制 | 发现empagliflozin通过STAT3通路和巨噬细胞表型转化降低自身免疫性心肌炎的炎症水平 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全反映人类的临床情况 | 探索empagliflozin在自身免疫性心肌炎中的抗炎机制 | 实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型及体外巨噬细胞实验 | 数字病理学 | 自身免疫性心肌炎 | HE染色、Sirius红染色、Masson染色、西方印迹、ELISA、免疫荧光染色、逆转录PCR | NA | 基因组空间事件数据集、单细胞测序结果 | 未具体说明样本数量，但使用了小鼠模型和体外细胞实验 | NA | NA | NA | NA |
| 7049 | 2024-08-04 |
High-throughput omics technologies in inflammatory bowel disease
2024-Mar-01, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2024.117828
PMID:38355001
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综述 | 该文章综述了高通量组学技术在炎症性肠病中的应用和进展 | 文章强调了高通量技术在炎症性肠病研究中的重要性和最新进展 | 需要更标准化的方法和大规模数据集处理以实现个体化医学的目标 | 阐明高通量技术在炎症性肠病病理机制研究中的应用 | 高通量技术在炎症性肠病的基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学等领域的应用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 高通量组学技术 | NA | 大数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7050 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Coronary Heterogeneity and Identifies CD133+TRPV4high Endothelial Subpopulation in Regulating Flow-Induced Vascular Tone in Mice
2024-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319516
PMID:38269590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了冠状动脉内皮细胞的异质性并确定了CD133+TRPV4high内皮亚群在调节流动诱导的血管张力中的作用 | 该研究发现了冠状动脉内皮细胞的异质性，并首次识别了CD133+TRPV4high内皮亚群在调节冠状动脉血流中的重要性 | 本研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全适用于人类冠状动脉内皮细胞的研究 | 研究冠状动脉内皮细胞的异质性及其对血流的反应 | 研究对象为小鼠冠状动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 31,962个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7051 | 2024-08-07 |
Cinchophen induces RPA1 related DNA damage and apoptosis to impair ENS development of zebrafish
2024-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116032
PMID:38306819
|
研究论文 | 研究探讨了非甾体抗炎药辛可芬对斑马鱼肠道神经系统发育的影响及其分子机制 | 首次证实辛可芬通过诱导RPA1相关的DNA损伤和细胞凋亡，损害斑马鱼的肠道神经系统发育 | NA | 探究辛可芬对斑马鱼肠道神经系统发育的影响及其分子机制 | 斑马鱼的肠道神经系统 | 数字病理学 | 先天性神经嵴病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7052 | 2024-08-07 |
2-bromoacetamide exposure impairs oocyte maturation in mice and humans primarily via disrupting the cytoskeleton
2024-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116105
PMID:38364760
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研究论文 | 研究探讨了2-溴乙酰胺（BAcAm）对小鼠和人类卵母细胞成熟的影响，发现BAcAm通过破坏细胞骨架主要干扰卵母细胞成熟 | 首次全面展示了BAcAm对卵母细胞成熟的毒性影响 | 研究主要基于体外培养系统，可能与体内环境存在差异 | 探究BAcAm对哺乳动物卵母细胞质量的毒性效应 | 小鼠和人类的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠卵母细胞中识别了605个差异表达基因，其中366个上调，239个下调 | NA | NA | NA | NA |
| 7053 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-Seq reveals the earliest lineage specification and X chromosome dosage compensation in bovine preimplantation embryos
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302035RR
PMID:38363564
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研究论文 | 该研究揭示了牛胚胎早期谱系特征和X染色体剂量补偿的情况。 | 利用单细胞转录组学和基因组编辑方法探讨了牛胚胎中的谱系特征和X染色体剂量补偿的时序和调控。 | 该研究主要集中在牛胚胎模型，可能无法直接推广到其他物种。 | 旨在通过使用牛胚胎模型深入理解早期胚胎发育中的调控机制。 | 研究对象为286个牛个体细胞的转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，基因组编辑 | NA | 转录组数据 | 286个牛个体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7054 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of submandibular gland reveals collagen type XV-positive fibroblasts as a disease-characterizing cell population of IgG4-related disease
2024-02-20, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-024-03289-7
PMID:38378635
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了IgG4相关疾病患者下颌下腺中的非免疫细胞，发现表达胶原蛋白XV的成纤维细胞可能是该疾病的特征性细胞群 | 首次揭示了胶原蛋白XV阳性成纤维细胞在IgG4相关疾病中的作用，并提出其可能作为疾病监测的标志物 | NA | 探讨IgG4相关疾病中非免疫细胞的特征及其潜在的生物标志物 | IgG4相关疾病患者的下颌下腺非免疫细胞 | 数字病理学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IgG4相关疾病患者的下颌下腺非免疫细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7055 | 2024-08-04 |
BPTF cooperates with MYCN and MYC to link neuroblastoma cell cycle control to epigenetic cellular states
2024-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579816
PMID:38405949
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研究论文 | 这篇文章探讨了核小体重塑因子BPTF如何与MYCN和MYC合作，将神经母细胞瘤细胞周期控制与表观遗传细胞状态联系起来 | 文章提出BPTF在神经母细胞瘤中扮演双重角色，既与MYCN/MYC共定位于细胞周期相关基因的启动子，又与CRC共定位于超级增强子以调节细胞身份 | NA | 探讨BPTF在神经母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的相关性 | 神经母细胞瘤细胞及其内在转录调控机制 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | Bulk RNA-seq, 单细胞测序, 组织微阵列, 免疫沉淀/质谱 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7056 | 2024-08-07 |
HHLA2 is more significantly associated with poor prognosis in TSCC than PD-L1
2024-Feb, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13514
PMID:38321252
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研究论文 | 本研究旨在探讨HHLA2作为免疫检查点在舌鳞状细胞癌中的潜力，并与PD-L1进行比较 | 本研究发现HHLA2在舌鳞状细胞癌中表达上调，且与不良预后显著相关，可能成为比PD-L1更有效的免疫治疗靶点 | NA | 研究HHLA2作为免疫检查点在舌鳞状细胞癌中的作用及与PD-L1的比较 | 舌鳞状细胞癌中的HHLA2和PD-L1表达及预后影响 | 数字病理学 | 舌鳞状细胞癌 | RNA测序, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | COX回归模型 | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 | RNA-seq数据来自TCGA，单细胞RNA测序数据来自GEO数据库 | NA | NA | NA | NA |
| 7057 | 2024-08-07 |
Analytical Workflows for Single-Cell Multiomic Data Using the BD Rhapsody Platform
2024-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.963
PMID:38353375
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研究论文 | 本文描述了一个详细的分析流程，包括六个管道，用于单细胞多组学数据的高质量分析 | 提出了一个包括六个管道的详细分析流程，用于处理和分析单细胞多组学数据 | NA | 开发一个高效的分析流程，以从单细胞多组学数据中提取生物学相关信息 | 单细胞多组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达矩阵 | 数千个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7058 | 2024-08-07 |
Recommendations on single-cell RNA sequencing of skin xenografts in the study of genetic skin diseases
2024-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.15036
PMID:38389155
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7059 | 2024-08-07 |
PD-1 signaling uncovers a pathogenic subset of T cells in inflammatory arthritis
2024-01-22, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03259-5
PMID:38254179
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和CRISPR/Cas9筛选分析了类风湿关节炎患者外周血和滑膜液中的T细胞，发现PD-1+ HLA-DRHIGH KLRG1LOW T细胞是一种新的炎症性T细胞亚群 | 本研究首次识别出PD-1+ HLA-DRHIGH KLRG1LOW T细胞作为炎症性T细胞的新亚群，并揭示了与PD-1信号传导相关的新基因 | 本研究仅限于类风湿关节炎患者，且需要进一步研究以全面了解PD-1在滑膜T细胞中的作用 | 探索PD-1信号传导在炎症性关节炎中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液中的T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 流式细胞术，CRISPR/Cas9筛选 | NA | RNA测序数据 | 类风湿关节炎患者的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7060 | 2024-08-07 |
Transcriptional profiling of human cartilage endplate cells identifies novel genes and cell clusters underlying degenerated and non-degenerated phenotypes
2024-01-03, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03220-6
PMID:38173036
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序技术，对非退化和退化的人类软骨终板细胞进行转录组分析，以识别与退化和非退化表型相关的新基因和细胞簇。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了软骨终板细胞的表型异质性，并识别出多个具有独特基因表达和功能特征的软骨细胞和前体细胞亚群。 | 研究样本量较小，批量RNA测序仅包括4个非退化和4个退化样本，单细胞RNA测序仅包括1个非退化和1个退化样本。 | 旨在更好地表征软骨终板细胞的表型及其在软骨终板退化中的可能机制。 | 非退化和退化的人类腰椎软骨终板细胞。 | 数字病理学 | 腰痛 | RNA测序 | NA | RNA | 批量RNA测序：4个非退化样本，4个退化样本；单细胞RNA测序：1个非退化样本，1个退化样本。 | NA | NA | NA | NA |