单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
7041 2024-08-07
Multi-organ single-cell RNA sequencing in mice reveals early hyperglycemia responses that converge on fibroblast dysregulation
2024-02-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了糖尿病小鼠模型中多个器官对高血糖的早期转录反应 首次进行了单细胞和多器官分析,探讨了1型糖尿病相关高血糖的早期功能障碍 研究仅使用了小鼠模型,且仅分析了8周后的数据 探讨糖尿病早期高血糖对多个器官细胞类型的转录反应 心脏、肾脏、肝脏和脾脏的细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 67,611个细胞
7042 2024-08-04
Single-cell insights into immune dysregulation in rheumatoid arthritis flare versus drug-free remission
2024-Feb-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨类风湿性关节炎(RA)在药物撤除后的免疫失调及其发作过程 提出了一种模型来理解RA的免疫失调,为治疗和预防提供了新的研究方向 研究主要集中在药物撤除后的短期效果,可能未能全面覆盖所有RA患者的情况 探讨类风湿性关节炎发作时的免疫机制 分析类风湿性关节炎患者在发作与药物撤除缓解状态下的免疫细胞 数字病理学 类风湿性关节炎 单细胞测序和质谱细胞术 NA 细胞数据 研究涉及类风湿性关节炎患者的循环细胞亚群
7043 2024-08-07
Baf-mediated transcriptional regulation of teashirt is essential for the development of neural progenitor cell lineages
2024-Feb, Experimental & molecular medicine
研究论文 研究通过遗传学方法破坏果蝇神经系统中的进化保守屏障自整合因子(Baf),利用单细胞RNA测序技术揭示了Baf敲降引起的转录组变化,特别是I型神经母细胞中的变化,并发现Baf与转录因子teashirt(tsh)共同作用于异染色质锚定至内核膜的过程,从而调控神经前体细胞谱系的发育 首次揭示了Baf介导的teashirt转录调控是一种新的分子机制,用于调节神经前体细胞谱系的发育 NA 探索异染色质锚定至内核膜的细胞类型特异性或上下文依赖性程序化调控对神经细胞发育的影响 果蝇神经系统中的Baf因子及其对神经前体细胞谱系发育的影响 分子生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 果蝇神经系统中的I型神经母细胞
7044 2024-08-04
A novel variable neighborhood search approach for cell clustering for spatial transcriptomics
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
研究论文 本文提出了一种新的基于可变邻域搜索的细胞聚类方法,结合基因表达和空间坐标进行细胞聚类 引入了基于可变邻域搜索的模型,超越了传统细胞类型聚类,能够在空间域中进行聚类 NA 研究细胞聚类的方法,特别是在空间转录组学领域 细胞聚类,基于基因表达和空间坐标的信息 数字病理学 NA 可变邻域搜索 NA 基因表达矩阵和空间坐标 NA
7045 2024-08-04
scRNA-seq analysis of cells comprising the amphioxus notochord
2024-Apr, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序分析了含有鳃索的头索动物细胞的特性 本研究首次探讨了头索动物鳃索细胞的单细胞特性,揭示了其在脊索发育中的潜在作用 单细胞水平的特性分析仍然在某些细胞群体中存在不足,可能需要进一步的研究 阐明头索动物鳃索细胞的特性和其在脊索发展中的功能 研究对象为头索动物的鳃索细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA数据 NA
7046 2024-08-07
Neoadjuvant chemotherapy-induced remodeling of human hormonal receptor-positive breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-Mar-31, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色分析,探讨了新辅助化疗对人类激素受体阳性乳腺癌免疫微环境的重塑作用 发现了新辅助化疗后增加的先前未被识别的免疫细胞亚群,并验证了它们的抗肿瘤功能,同时识别了化疗耐药癌细胞的新基因组和转录模式 NA 探索化疗耐药机制及化疗如何重塑激素受体阳性乳腺癌的免疫微环境 激素受体阳性乳腺癌样本(新辅助化疗前后的配对样本) 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 配对的新辅助化疗前后的激素受体阳性乳腺癌样本
7047 2024-08-04
Single-cell RNA sequencing reveals epithelial cells driving brain metastasis in lung adenocarcinoma
2024-Mar-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌脑转移的上皮细胞角色 发现了一种与脑转移相关的上皮细胞群体,这些细胞在脑转移中发挥重要作用 缺乏直接证据证明脑转移病灶与淋巴结转移病灶之间的关联 阐明肺腺癌脑转移的细胞起源及其驱动因素 主要研究肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本中的细胞组成 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 样本 涉及的样本包括初级肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本
7048 2024-08-04
Targeting ERBB2 and PIK3R1 as a therapeutic strategy for dilated cardiomyopathy: A single-cell sequencing and mendelian randomization analysis
2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 这篇文章探讨了靶向ERBB2和PIK3R1作为扩张型心肌病的治疗策略。 文章创新地结合了单细胞测序和孟德尔随机化分析来识别药物可治疗的基因。 文章未能找到ERBB2的药物激动剂,并且对PIK3R1和心力衰竭的因果关系的探讨有限。 本研究旨在识别并验证扩张型心肌病中药物可治疗的基因,并分析其与心力衰竭的因果关系。 研究对象是扩张型心肌病中与心力衰竭相关的基因。 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 NA 基因表达数据 四个微阵列表达谱数据集
7049 2024-08-07
Bioinformatics analysis of MMP14+ myeloid cells affecting endothelial-mesenchymal transformation and immune microenvironment in glioma
2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析探讨了MMP14+髓系细胞在胶质瘤中影响内皮间质转化和免疫微环境的作用 识别MMP14为独立的预后标志物,并发现其通过CCL信号通路介导免疫抑制,为胶质瘤治疗提供了新的策略 NA 探讨MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的作用及其对治疗策略的影响 MMP14+髓系细胞在胶质瘤中的功能及其对内皮间质转化和免疫微环境的影响 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 收集了六个批量RNA数据集和一个单细胞RNA测序数据集
7050 2024-08-04
Shotgun lipidomics of human subretinal fluids under rod-dominant retina reveals cone-dominated lipids
2024-Mar, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究利用质谱技术分析视网膜脱离患者的次视网膜液体脂质组成 首次揭示在杆细胞主导的视网膜下,锥细胞主导的脂质在次视网膜液体中的存在 样本量仅限于两位患者,可能影响结果的普遍性 探究次视网膜液体中脂质的组成及其潜在生理意义 研究了来自两位视网膜脱离患者的次视网膜液体样本 数字病理学 视网膜疾病 质谱法 NA 生物分子数据 2个样本来自2位患者
7051 2024-08-04
The detection of Gper1 as an important gene promoting jawbone regeneration in the context of estrogen deficiency
2024-03, Bone IF:3.5Q2
研究论文 本研究揭示了Gper1在雌激素缺乏背景下促进下颌骨再生的重要性 探讨了Gper1如何通过cAMP/PKA/pCREB信号通路促进下颌骨再生 研究主要基于动物模型,临床应用的相关性尚需进一步验证 研究雌激素缺乏条件下维持骨再生的机制 分析接受拔牙手术的女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型 数字病理学 NA 单细胞测序、定量PCR、免疫组织化学等 NA 临床病例数据及动物实验数据 1102名女性患者及雌激素缺乏的大鼠模型
7052 2024-08-07
Genetic lineage tracing identifies adaptive mechanisms of pancreatic islet β cells in various mouse models of diabetes with distinct age of initiation
2024-Mar, Science China. Life sciences
research paper 本研究利用Cre-LoxP系统在不同年龄诱导的糖尿病小鼠模型中,通过单细胞RNA测序探索胰腺β细胞的命运转变及其分子机制 首次揭示了在不同糖尿病模型中,胰腺β细胞通过去分化、转分化和自我复制等机制适应性再生,并明确了关键的分子途径 研究仅限于小鼠模型,未来需在人类样本中验证这些发现 探究胰腺β细胞在不同糖尿病模型中的适应性机制及其分子基础 胰腺β细胞在不同糖尿病小鼠模型中的命运转变 digital pathology 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个糖尿病小鼠模型中的胰腺β细胞
7053 2024-08-07
Allosteric inhibitor of SHP2 enhances macrophage endocytosis and bacteria elimination by increasing caveolae activation and protects against bacterial sepsis
2024-Mar, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 本文研究了SHP2别构抑制剂通过增强巨噬细胞的胞吞作用和细菌清除能力,从而保护机体免受细菌性脓毒症的影响 发现SHP2别构抑制剂能有效维持巨噬细胞中Cav-1的磷酸化,增强其胞吞作用和细菌清除能力 NA 探讨SHP2别构抑制剂在细菌性脓毒症中的治疗潜力 巨噬细胞的胞吞作用和细菌清除能力 NA 细菌性脓毒症 单细胞RNA测序和批量RNA测序 NA RNA NA
7054 2024-08-07
IFN-γ decreases PD-1 in T lymphocytes from convalescent COVID-19 patients via the AKT/GSK3β signaling pathway
2024-02-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文研究了康复期COVID-19患者中IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路降低T淋巴细胞PD-1表达的现象 首次揭示了IFN-γ通过AKT/GSK3β信号通路调控康复期COVID-19患者CD8 T细胞PD-1表达的机制 NA 探讨康复期COVID-19患者免疫状态异常的原因 康复期COVID-19患者的T淋巴细胞和免疫分子 免疫学 COVID-19 scRNA-seq NA 细胞和蛋白质表达数据 康复期COVID-19患者的CD8 T细胞和血浆样本
7055 2024-08-07
Integrated meta-omics reveals the regulatory landscape involved in lipid metabolism between pig breeds
2024-Feb-20, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本文通过综合代谢组学和宏基因组学方法,揭示了不同猪品种间脂质代谢调控的分子机制 首次系统地研究了不同猪品种间脂质代谢的细胞和分子机制,为改善动物生产和人类疾病提供了新的视角 NA 探究不同猪品种间脂质代谢的调控机制 猪的空肠、结肠、肝脏和背最长肌组织的细胞类型 代谢组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 两品种猪的多个组织样本
7056 2024-08-07
Mef2c regulates bone mass through Sost-dependent and -independent mechanisms
2024-02, Bone IF:3.5Q2
研究论文 本文研究了转录因子Mef2c通过Sost依赖和非依赖机制调节骨量的作用 发现了Mef2c通过Sost以外的机制调节骨量,并识别了新的Mef2c转录靶点 NA 识别Mef2c在骨代谢中的新转录靶点 Mef2c在骨形成中的作用及其转录靶点 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 Mef2c; Dmp1-Cre和Mef2c; Bglap-Cre小鼠的股骨细胞亚群
7057 2024-08-07
Single-cell analysis of MYD88L265P and MYD88WT Waldenström macroglobulinemia patients
2024-Feb, HemaSphere IF:7.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞,揭示了肿瘤内克隆异质性及其对B细胞组成的潜在影响 首次在单细胞水平上分析了两种不同基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的转录组特征,揭示了患者间的转录组差异和共同特征 研究样本量较小,仅包括五名MYD88L265P基因型和两名MYD88WT基因型患者以及两名健康对照 评估瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症中的克隆异质性 MYD88L265P和MYD88WT基因型的瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症患者的CD19阳性细胞 数字病理学 瓦尔登斯特伦巨球蛋白血症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 五名MYD88L265P基因型患者、两名MYD88WT基因型患者和两名健康对照
7058 2024-08-04
Molecular classification of small cell lung cancer subtypes: Characteristics, prognostic factors, and clinical translation
2024-Jan-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
综述 本文回顾并总结了小细胞肺癌的分子分类特征、预后因素和临床应用。 研究了基于小细胞肺癌的关键转录因子的新兴分子分类,为肿瘤的病理生理学、转移、免疫微环境及获得性治疗抵抗提供了更多信息 NA 探讨小细胞肺癌的分子分类及其临床转化 小细胞肺癌的不同亚型及其特征 数字病理学 肺癌 单细胞测序分析 NA NA NA
7059 2024-08-04
Single-cell transcriptomics reveal different maturation stages and sublineage commitment of human thymic invariant natural killer T cells
2024-01-19, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究揭示了人类胸腺不变自然杀伤T细胞不同的成熟阶段和亚谱系承诺 首次定义了人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育过程中的成熟阶段,并评估了亚谱系承诺 研究仅限于从胸腺中提取的细胞,缺乏对外周血中细胞的广泛分析 探讨人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育中的成熟阶段和亚谱系承诺 人类Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 从胸腺提取的Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞
7060 2024-08-04
Role of immune cells in the pathogenesis of myocarditis
2024-01-19, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 此文章总结了免疫细胞在心肌炎发病机制中的角色 本研究强调了免疫细胞的复杂性和细胞间相互作用对心肌炎病理过程的重要性 目前尚不清楚心肌炎的详细发病机制 探讨免疫细胞在心肌炎发病机制中的作用 研究涉及心肌炎患者及多种动物模型中的免疫细胞 数字病理学 心肌炎 单细胞测序 NA 细胞数据 NA
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