单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
7001 2024-08-07
Synaptic endocytosis in adult adipose stromal cell-derived neurons
2024-03-15, Brain research IF:2.7Q3
研究论文 本研究探讨了从脂肪来源的间充质干细胞(ADSCs)衍生的神经元中的突触内吞作用 首次研究了从ADSCs衍生的神经元中的内吞功能 NA 旨在检查从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用 从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 蛋白质和量子点 NA
7002 2024-08-07
A single-cell atlas of Drosophila trachea reveals glycosylation-mediated Notch signaling in cell fate specification
2024-Mar-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了果蝇气管系统的细胞图谱,揭示了糖基化介导的Notch信号在细胞命运决定中的作用 首次提供了果蝇气管系统的全面单细胞转录组图谱,并发现了糖基化对Notch信号在细胞命运决定中的响应 NA 探究果蝇气管系统的管状形态发生程序 果蝇气管系统的细胞类型和Notch信号在细胞命运决定中的作用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组 9种主要亚型的气管细胞
7003 2024-08-07
MSCsDB: a database of single-cell transcriptomic profiles and in-depth comprehensive analyses of human mesenchymal stem cells
2024-Mar-06, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 介绍了一个名为MSCsDB的数据库,该数据库整合了人类间充质干细胞的单细胞转录组数据,并提供深度综合分析 MSCsDB数据库提供了一个一站式交互查询平台,支持调控子活动、基因本体富集、特征基因可视化和转录因子调控子分析,并开发了专门模块评估MSC质量 NA 旨在通过单细胞RNA测序技术深入研究间充质干细胞的异质性,并提供一个系统分析已发表数据集的平台 人类间充质干细胞的单细胞转录组数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 包括来自26个受试者的5个组织中的470,000个细胞
7004 2024-08-07
Diacylglycerols and Lysophosphatidic Acid, Enriched on Lipoprotein(a), Contribute to Monocyte Inflammation
2024-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 研究探讨了脂蛋白(a)(Lp[a])中富含的二酰甘油(DGs)和溶血磷脂酸(LPA)对单核细胞炎症的贡献 首次揭示了Lp(a)中DGs和LPA对单核细胞炎症的影响,并发现这种炎症部分依赖于NLRP3炎症小体 研究主要集中在体外实验和部分临床样本分析,需要进一步的临床研究来验证这些发现 探讨Lp(a)中其他促炎介质对动脉粥样硬化的影响 脂蛋白(a)(Lp[a])及其相关脂质对单核细胞炎症的影响 心血管疾病 心血管疾病 脂质组学、RNA测序、ELISA、Western blot、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 NA 血液样本、细胞样本 健康个体13人,高Lp(a)水平个体12人,心血管疾病患者若干
7005 2024-08-07
Human surface ectoderm and amniotic ectoderm are sequentially specified according to cellular density
2024-Mar, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过建立人类多能干细胞模型,研究了羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 首次提出人类羊膜外胚层和表面外胚层是根据细胞密度沿着共同非神经外胚层轨迹指定的 NA 探究人类羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 人类羊膜外胚层和表面外胚层 NA NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 NA
7006 2024-08-04
Recent progress in hair follicle stem cell markers and their regulatory roles
2024-Feb-26, World journal of stem cells IF:3.6Q3
研究论文 本文回顾了毛囊干细胞的分子标记物及其调节作用 探讨了单细胞转录组技术提供的详细数据,聚焦于重要的HFSC分子标记物 缺乏HFSC的实验验证和比较不同标记物的实用性 旨在总结和分析毛囊干细胞标记物及其功能 主要研究毛囊干细胞及其在损伤愈合中的功能 数字病理学 NA 单细胞转录组技术 NA NA NA
7007 2024-08-07
Identification and validation of a pyroptosis-related prognostic model for colorectal cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Feb-24, World journal of clinical oncology IF:2.6Q3
研究论文 本研究基于大量和单细胞RNA测序数据,构建并验证了与结直肠癌(CRC)预后相关的细胞焦亡相关预测模型。 首次构建了一个基于细胞焦亡相关基因的结直肠癌预后模型,并验证了其与免疫浸润的相关性。 NA 评估细胞焦亡相关基因对结直肠癌预后的影响及其与免疫浸润的关联。 结直肠癌(CRC)患者的预后及免疫浸润情况。 数字病理学 结直肠癌 RNA测序 LASSO回归算法 基因表达数据 使用了来自TCGA和GEO的数据集,具体样本数量未在摘要中明确。
7008 2024-08-04
Granzyme B+ B cells detected by single-cell sequencing are associated with prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma following liver transplantation
2024-Feb-22, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究探讨了单细胞测序检测到的granzyme B+ B细胞与肝移植后肝内胆管癌患者预后的关系 首次揭示了肿瘤样本中granzyme B+ B细胞的显著增加及其与无病生存的正相关性 研究仅涉及肝内胆管癌,无法广泛适用于其他癌症类型 研究granzyme B+ B细胞在肝内胆管癌中的作用及其对预后的影响 肝移植接受者的肝内胆管癌患者 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞测序 NA 样本数据 25个样本来自基因表达综合数据库以及40名肝移植接受者
7009 2024-08-04
Lack of affinity signature for germinal center cells that have initiated plasma cell differentiation
2024-Feb-13, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 研究表明在浆细胞分化初期,胚中心细胞缺乏亲和力特征 揭示了浆细胞发育的初始阶段是通过非亲和力过程进行的 未具体提及样本的多样性及其对结果的影响 探讨浆细胞分化及其与亲和力的关系 研究Igh B细胞及其在胚中心发育的三种细胞群体 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 涉及3个胚中心细胞群体
7010 2024-08-04
Identification macrophage signatures in prostate cancer by single-cell sequencing and machine learning
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过单细胞测序和机器学习识别前列腺癌中的巨噬细胞特征。 提出了一种基于巨噬细胞相关基因的风险标签,用于预测前列腺癌患者的进展。 样本来源于公共数据库,可能缺乏来自不同临床环境的数据验证。 分析肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的作用,并建立相关的预后模型。 关注肿瘤微环境中巨噬细胞与前列腺癌进展之间的关系。 数字病理学 前列腺癌 单细胞测序、机器学习 NA 基因数据、RNA数据 从多个公共数据库下载的前列腺癌单细胞测序数据
7011 2024-08-07
uPAR (PLAUR) Marks Two Intra-Tumoral Subtypes of Glioblastoma: Insights from Single-Cell RNA Sequencing
2024-Feb-07, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,分析了uPAR(PLAUR)在胶质母细胞瘤(GBM)中的作用及其分子合作者 首次全面研究uPAR在GBM内部亚型中的功能及其分子合作者,无需预设生物学途径 NA 探讨uPAR在胶质母细胞瘤内部亚型中的作用及其分子机制 uPAR在胶质母细胞瘤中的作用及其分子合作者 数字病理学 脑癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 37名胶质母细胞瘤患者
7012 2024-08-07
Bitter taste receptors in the reproductive system: Function and therapeutic implications
2024-Feb, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1
综述 本文综述了第二型味觉受体(TAS2Rs)在生殖系统中的功能及其治疗意义 探讨了TAS2R在生殖健康中的潜在作用,特别是在男性生育、女性生殖细胞功能以及癌症治疗中的应用 存在遗传和功能研究的不足,需要进一步的技术应用如单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9基因编辑 探索TAS2R在生殖系统中的功能及其对生殖健康的影响 TAS2R在男性、女性生殖组织中的作用,以及在癌症治疗中的应用 NA 生殖系统疾病 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 NA NA NA
7013 2024-08-07
Targeting tumor-stromal interactions in triple-negative breast cancer using a human vascularized micro-tumor model
2024-01-05, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用人血管化微肿瘤模型,探索三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子基础及潜在治疗靶点 采用先进的体外微生理系统——血管化微肿瘤模型,结合单细胞RNA测序技术,揭示了正常乳腺组织基质细胞在三阴性乳腺癌微环境中的促癌信号通路 NA 研究三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子机制,并探索潜在的治疗靶点 三阴性乳腺癌中的肿瘤-基质相互作用及其治疗靶点 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 血管化微肿瘤模型 RNA NA
7014 2024-08-04
Tumor-associated macrophages promoting PD-L1 expression in infiltrating B cells through the CXCL12/CXCR4 axis in human hepatocellular carcinoma
2024, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:38455420
研究论文 该研究探讨了肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞通过CXCL12/CXCR4轴促进浸润B细胞PD-L1表达的机制 发现了一种新型的调节性B细胞PD-L1 Bregs,揭示了它们与CXCL12 TAMs之间的相互作用以及其在肝细胞癌中的作用 该研究的局限性可能在于基于单细胞RNA-seq数据的分析,这可能不能完全代表肿瘤微环境的复杂性 研究肝细胞癌中细胞间通信的机制 调节性B细胞、肿瘤相关巨噬细胞及其在肝细胞癌中的相互作用 数字病理学 肝癌 单细胞RNA-seq、免疫组化 小鼠模型 RNA序列数据 使用了小鼠模型进行实验验证,具体样本数量未提供
7015 2024-08-07
Clusterin knockdown has effects on intracellular and secreted von Willebrand factor in human umbilical vein endothelial cells
2024, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 研究了clusterin(CLU)对人类脐静脉内皮细胞中von Willebrand因子(VWF)的调控作用 首次通过单细胞RNA测序分析确定了CLU作为VWF的潜在调控因子,并使用siRNA和CRISPR-Cas9技术验证了CLU敲除对VWF含量的影响 研究仅限于细胞水平,未涉及临床试验或动物模型 探讨CLU在VWF调控中的作用,特别是与von Willebrand病(VWD)相关的调控机制 人类脐静脉内皮细胞(HUVECs)中的VWF和CLU NA von Willebrand病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),siRNA,CRISPR-Cas9 NA RNA 涉及VWD患者的内皮细胞和正常对照内皮细胞
7016 2024-08-07
Single-cell analysis reveals one cancer-associated fibroblasts subtype linked to metastasis in breast cancer: MXRA5 as a potential novel marker for prognosis
2024, American journal of cancer research IF:3.6Q2
PMID:38455411
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了乳腺癌中与转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2,并鉴定了MXRA5作为潜在的新型预后标志物。 首次识别出与乳腺癌转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2,并发现MXRA5可能作为新的标志物参与乳腺癌转移的调控。 研究主要基于单细胞RNA测序数据,未来需要更多的实验验证MXRA5在乳腺癌转移中的具体作用机制。 揭示乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在转移中的作用,寻找新的预后标志物。 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其亚型,以及它们与乳腺癌转移的关系。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个乳腺癌患者的组织样本
7017 2024-08-07
Ezrin's role in gastric cancer progression: Implications for immune microenvironment modulation and therapeutic potential
2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组技术分析胃癌细胞系MKN-45和HGC-27之间的差异表达蛋白,筛选出ezrin作为目标蛋白,并探讨了ezrin表达水平与免疫微环境和基因组变化之间的关系。 首次探讨了ezrin在胃癌中的免疫调节作用及其与基因组不稳定性的关系,并预测了ezrin与免疫治疗和化疗敏感性的关联。 研究主要基于细胞系和数据库分析,未来需要更多临床样本验证ezrin在胃癌中的作用。 阐明ezrin在胃癌中的预后、免疫学和治疗价值。 胃癌细胞系MKN-45和HGC-27,以及TCGA和GEO数据库中的患者信息。 数字病理学 胃癌 蛋白质组技术 NA 蛋白质数据 涉及胃癌细胞系和数据库中的患者信息
7018 2024-08-07
Bulk anda single-cell transcriptome profiling reveals the molecular characteristics of T cell-mediated tumor killing in pancreatic cancer
2024-Mar-15, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本文通过批量和单细胞转录组分析,揭示了胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子特征 开发了TRGscore评分系统,有效预测胰腺癌患者对化疗或免疫治疗的反应及总体生存率 NA 探索胰腺癌中T细胞介导的肿瘤杀伤的分子机制,并识别可能从免疫检查点阻断治疗中获益的患者亚群 胰腺癌患者的T细胞介导的肿瘤杀伤机制 数字病理学 胰腺癌 转录组分析 NA 基因表达数据 涉及胰腺癌患者的样本,分为两个亚群进行分析
7019 2024-08-04
Single-cell nanobiopsy enables multigenerational longitudinal transcriptomics of cancer cells
2024-Mar-08, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文介绍了一种单细胞纳米活检平台,可实时分析癌细胞的转录组 提出了一种基于扫描离子导电显微镜的纳米活检技术,能够在单细胞及其后代中进行多代纵向细胞质采样 该方法的应用仅限于体外实验,尚未在体内验证其有效性 探讨单细胞癌细胞的动态转录组变化及其在治疗反应中的角色 单个胶质母细胞瘤(GBM)脑肿瘤细胞 数字病理学 脑癌 扫描离子导电显微镜(SICM) NA 转录组数据 单个胶质母细胞瘤细胞的多次样本
7020 2024-08-07
Prediction of tumor-reactive T cell receptors from scRNA-seq data for personalized T cell therapy
2024-Mar-07, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为PredicTCR的机器学习分类器,用于从单细胞RNA测序数据中识别肿瘤反应性T细胞受体,以加速个性化T细胞疗法的制造 PredicTCR能够以抗原未知的方式识别肿瘤反应性TILs,相比之前的基因集富集方法,提高了特异性和敏感性 NA 开发一种新的方法来预测肿瘤反应性T细胞受体,以支持个性化T细胞疗法 肿瘤反应性T细胞受体 机器学习 NA scRNA-seq 机器学习分类器 RNA测序数据 来自多种癌症的TILs
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