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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 7001 - 7020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7001 | 2024-08-07 |
Metabolic Landscape of Osteosarcoma: Reprogramming of Lactic Acid Metabolism and Metabolic Communication
2024-Feb-22, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902083
PMID:38420794
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸代谢在骨肉瘤微环境中的重编程及其对肿瘤侵袭、生长和肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了骨肉瘤中乳酸代谢的高亚群及其与其他亚群的独特代谢通信模式，并确定了与乳酸代谢相关的重要基因NDUFAF6 | NA | 探索骨肉瘤微环境中乳酸代谢的重编程及其对肿瘤侵袭、生长和肿瘤微环境的影响 | 骨肉瘤细胞的乳酸代谢及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞基因表达数据分析 | NA | 转录组数据 | 涉及骨肉瘤样本的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 7002 | 2024-08-05 |
Immune Response Associated Gene Signatures in Aortic Dissection Compared to Aortic Aneurysm
2024-Feb-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902064
PMID:38420822
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研究论文 | 该文章研究了与免疫反应相关的基因在主动脉夹层和主动脉瘤中的差异 | 本研究识别了37个在主动脉夹层中显著失调的基因，这些基因之前未与此病相关联 | 样本量较小，且研究仅限于特定基因的分析，可能无法全面反映所有相关的生物过程 | 探讨主动脉夹层中免疫系统的作用及相关基因的特征 | 以主动脉夹层患者、主动脉瘤患者及对照组为对象进行基因表达分析 | 数字病理学 | 主动脉夹层 | 微阵列技术和RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 主动脉夹层4个、主动脉瘤3个及对照组的RNA样本，共37个分析数据点 | NA | NA | NA | NA |
| 7003 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identified Core Genes and Transcription Factors in Mesenchymal Cell Differentiation during Liver Cirrhosis
2024-Feb-06, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902062
PMID:38420807
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别了肝硬化过程中间质细胞分化中的核心基因和转录因子 | 首次通过单细胞转录组和批量RNA测序数据，揭示了肝纤维化过程中间质细胞分化的核心基因和转录因子 | 小鼠模型在反映人类疾病进展和结果方面可能不够准确 | 研究肝纤维化和肝硬化中间质细胞分化的机制 | 人肝硬化和健康肝脏组织以及小鼠健康和纤维化肝脏的间质细胞 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞转录组测序, RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过50,000个人类单细胞和多个小鼠肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7004 | 2024-08-04 |
Extracting, filtering and simulating cellular barcodes using CellBarcode tools
2024-Feb, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00595-7
PMID:38374363
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研究论文 | 介绍CellBarcode和CellBarcodeSim工具，以提高细胞条形码的提取和过滤效率 | 提供了一种新的工具包，支持多种条形码类型的提取和过滤，并探索影响条形码识别的因素 | 目前工具在支持的条形码类型多样性和分析策略上存在局限 | 开发更灵活有效的条形码提取与过滤工具 | 细胞条形码，从批量或单细胞测序数据中提取 | 数字病理学 | NA | PCR，测序 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7005 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals immune cell heterogeneity in acute myeloid leukaemia peripheral blood mononuclear cells after chemotherapy
2024-Feb, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-023-00853-2
PMID:37615858
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序技术分析了急性髓系白血病（AML）患者在接受化疗后的外周血单个核细胞（PBMC）的免疫细胞异质性 | 本研究首次揭示了AML患者化疗后PBMC中T细胞、自然杀伤细胞（NK细胞）、单核细胞、树突状细胞（DCs）和造血干细胞前体（HSC-Prog）的亚群多样性及其转录因子和染色体拷贝数变异（CNV）的显著变化 | NA | 探索AML患者化疗后的免疫微环境，为精准医疗和免疫治疗提供见解 | AML患者化疗后的PBMC微环境 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 5名AML患者和6名健康捐赠者的PBMC | NA | NA | NA | NA |
| 7006 | 2024-08-07 |
Normalizing need not be the norm: count-based math for analyzing single-cell data
2024-Feb, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-023-00408-x
PMID:37947999
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研究论文 | 本文提出了一种不进行归一化处理，而是利用基于计数的代数方法来分析单细胞数据的新方法 | 本文创新地避免了归一化和转换步骤，采用基于计数的代数方法来分析单细胞RNA测序数据，这种方法更简单直观，且避免了常见转换带来的问题 | NA | 探索不进行归一化处理的新方法来分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 计数数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7007 | 2024-08-07 |
Microglia-endothelial cross-talk regulates diabetes-induced retinal vascular dysfunction through remodeling inflammatory microenvironment
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109145
PMID:38414848
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病视网膜病变中微胶质细胞和内皮细胞的转录组特征，并探讨了它们之间的相互作用及其在炎症反应和血管发育中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了糖尿病视网膜病变中微胶质细胞和内皮细胞的亚群及其相互作用，特别是在CSF1和CSF1R信号通路中的作用 | NA | 阐明糖尿病诱导的视网膜血管功能障碍中微胶质细胞和内皮细胞之间的相互作用及其在炎症微环境重塑中的作用 | 微胶质细胞和内皮细胞在糖尿病视网膜病变中的相互作用及其分子机制 | NA | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7008 | 2024-08-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Transcriptomics Revealed HCMV IE2-Related Microglia Responses in Alzheimer's-Like Disease in Transgenic Mice
2024-Mar, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03553-y
PMID:37700217
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研究论文 | 本文研究了人类巨细胞病毒IE2蛋白如何促进小胶质细胞激活，从而导致类似阿尔茨海默病的疾病。 | 建立了IE2转基因小鼠模型，揭示HCMV IE2对小胶质细胞的激活作用及其与阿尔茨海默病的关系 | 研究主要集中在转基因小鼠模型，可能未能全面反映人类AD的复杂性 | 探讨HCMV IE2蛋白与阿尔茨海默病之间的关系及其机制 | 转基因小鼠，特别是表达IE2蛋白的小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠 | 基因表达数据 | IE2转基因小鼠的脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7009 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies senescence as therapeutic target in rhabdomyolysis-induced acute kidney injury
2024-Feb-28, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfad199
PMID:37697719
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在横纹肌溶解诱导的急性肾损伤模型中，识别出与细胞衰老相关的过渡性巨噬细胞亚群，并探讨了衰老抑制剂的治疗潜力。 | 首次揭示了横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中存在与细胞衰老相关的过渡性巨噬细胞亚群，并证明了衰老抑制剂在肾保护中的作用。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证；衰老抑制剂的具体作用机制和长期效果仍需进一步研究。 | 探索横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中免疫细胞的变化，特别是细胞衰老在其中的作用，并评估衰老抑制剂的治疗效果。 | 横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中的免疫细胞，特别是巨噬细胞和肾小管上皮细胞。 | 数字病理学 | 肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约17,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 7010 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals roles of unique retinal microglia types in early diabetic retinopathy
2024-Feb-26, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-024-01282-3
PMID:38409074
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了独特的视网膜小胶质细胞类型在早期糖尿病视网膜病变中的作用 | 首次定义了三种新的小胶质细胞亚型，并构建了一个涉及小胶质细胞和其他视网膜细胞的炎症网络 | 样本量较小，仅包含五个视网膜标本，可能影响结果的普适性 | 探讨早期糖尿病视网膜病变中小胶质细胞的变化及其在炎症反应中的作用 | 采用SD大鼠捐赠的视网膜标本分析早期糖尿病视网膜病变中的细胞变化 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 五个视网膜标本 | NA | NA | NA | NA |
| 7011 | 2024-08-07 |
Single-cell multi-omics analysis of lineage development and spatial organization in the human fetal cerebellum
2024-Feb-26, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-024-00656-1
PMID:38409116
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学分析，探讨了人类胎儿小脑从妊娠第13周到第18周的细胞多样性和发育程序的涌现。 | 本研究首次鉴定了跨物种保守的过渡性颗粒细胞前体，并揭示了小脑叶的物种特异性基因表达模式，以及小脑中潜在的神经上皮新簇。 | NA | 探索人类胎儿小脑的细胞多样性和发育程序。 | 人类胎儿小脑的细胞多样性和发育程序。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | 妊娠第13周到第18周的胎儿样本 | NA | NA | NA | NA |
| 7012 | 2024-08-07 |
Human cytomegalovirus exploits STING signaling and counteracts IFN/ISG induction to facilitate infection of dendritic cells
2024-Feb-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45614-3
PMID:38409141
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研究论文 | 研究人巨细胞病毒（HCMV）如何利用STING信号通路并对抗干扰素/干扰素刺激基因（IFN/ISG）的诱导，以促进树突状细胞的感染 | 首次揭示了HCMV通过激活STING信号通路并抑制干扰素-β的转录，从而促进其在树突状细胞中的复制 | 研究主要集中在单核细胞衍生的树突状细胞上，可能无法完全代表所有树突状细胞类型对HCMV的反应 | 探讨HCMV如何影响树突状细胞的免疫反应，以及病毒如何调控宿主的抗病毒反应 | 人巨细胞病毒（HCMV）和单核细胞衍生的树突状细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及的样本包括单核细胞衍生的树突状细胞的三个亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 7013 | 2024-08-04 |
Microfluidic-assisted single-cell RNA sequencing facilitates the development of neutralizing monoclonal antibodies against SARS-CoV-2
2024-02-13, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00749a
PMID:38165771
|
研究论文 | 本研究探讨了微流控辅助的单细胞RNA测序在抗SARS-CoV-2中和单克隆抗体开发中的应用 | 提出了结合单细胞RNA测序技术的新方法，以提高中和单克隆抗体的开发效率 | 未提供具体的实验数据和样本量 | 研究开发有效的针对SARS-CoV-2的中和单克隆抗体 | 中和单克隆抗体候选者及其相关的B细胞转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7014 | 2024-08-04 |
CTISL: a dynamic stacking multi-class classification approach for identifying cell types from single-cell RNA-seq data
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae063
PMID:38317054
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研究论文 | 提出了一种动态堆叠多类分类方法CTISL，用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型 | CTISL结合了多种分类器，采用二层堆叠模型来提高细胞类型的识别准确性 | 该研究可能仍需在更多的细胞类型和数据集上进行验证以评估其广泛适用性 | 研究目标是开发一个更准确的计算模型，以从scRNA-seq数据集中识别细胞类型 | 研究对象为人类和小鼠的scRNA-seq数据集中的细胞类型 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 堆叠模型 | 基因表达数据 | 涉及17个人类和小鼠scRNA-seq数据集的24个基准实验 | NA | NA | NA | NA |
| 7015 | 2024-08-04 |
scCancer2: data-driven in-depth annotations of the tumor microenvironment at single-level resolution
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae028
PMID:38243719
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研究论文 | 本研究提出了一个数据驱动的框架，以深入注释肿瘤微环境中的细胞类型 | 开发了一个监督机器学习框架，能在新的数据集中计算地转移细胞子类型标签，并整合了空间转录组数据处理模块 | 研究中未使用内部机密参考细胞时的分类器表现有限 | 旨在提高对肿瘤微环境中细胞的准确注释，并改善恶性细胞的识别 | 使用来自15个单细胞RNA-seq数据集的细胞子类型注释共594个样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 监督机器学习分类器 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 594个样本（来自15个数据集）以及175个样本（来自10种癌症类型） | NA | NA | NA | NA |
| 7016 | 2024-08-04 |
SpatialDDLS: an R package to deconvolute spatial transcriptomics data using neural networks
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae072
PMID:38366652
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研究论文 | 本文介绍了SpatialDDLS，一个基于神经网络的算法，用于对空间转录组数据进行细胞类型解卷积 | SpatialDDLS利用单细胞RNA测序数据来模拟混合转录组特征，并训练一个全连接神经网络以揭示每个点的细胞类型多样性 | 大多数现有平台无法达到单细胞分辨率，空间转录组技术在分辨率方面仍存在局限性 | 研究空间转录组数据的细胞类型解卷积 | 空间转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | 全连接神经网络 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7017 | 2024-08-05 |
Identifying Spatial Co-occurrence in Healthy and InflAmed tissues (ISCHIA)
2024-Feb, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-023-00006-5
PMID:38225383
|
研究论文 | 该文章介绍了ISCHIA框架用于分析健康和炎症组织中细胞类型和转录物的空间共现。 | 提出了一种新的方法，通过分析转录组在条形码点上的空间关联，来重建细胞网络。 | 研究依赖于特定的空间转录组数据，可能不适用于其他类型的数据或不同的疾病背景。 | 研究空间转录组数据中细胞类型和转录物的共现关系。 | 应用ISCHIA框架于人类溃疡性结肠炎患者的Visium数据集。 | 数字病理学 | 肠道炎症 | 空间转录组学（ST） | NA | RNA序列 | human ulcerative colitis patients的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 7018 | 2024-08-07 |
Scbean: a python library for single-cell multi-omics data analysis
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae053
PMID:38290765
|
研究论文 | Scbean是一个用户友好的Python库，用于单细胞多组学数据分析 | Scbean提供了一个统一的界面，用于处理单细胞数据中的维度降低、批次效应消除、细胞标签转移和空间变异基因识别等任务，并利用GPU加速提高处理大规模数据集的能力 | NA | 开发一个高效的计算工具，用于单细胞多组学数据的有效分析 | 单细胞多组学数据 | 生物信息学 | NA | Python编程 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7019 | 2024-08-07 |
AGImpute: imputation of scRNA-seq data based on a hybrid GAN with dropouts identification
2024-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae068
PMID:38317025
|
研究论文 | 本文提出了一种名为AGImpute的混合生成对抗网络，用于识别和填补单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | AGImpute通过动态阈值估计策略估计不同细胞中的dropout事件数量，并结合自编码器和生成对抗网络进行dropout事件的填补 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中dropout事件带来的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络（GAN） | 基因表达数据 | 两个模拟数据集和七个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 7020 | 2024-08-07 |
Comprehensive profiling of cell subsets of gastric cancer and liver metastasis based on single cell RNA-sequencing analysis
2024-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1532
PMID:38410212
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对胃癌及其肝转移的细胞亚型进行全面分析 | 揭示了胃癌原发肿瘤和肝转移在基因表达上的差异及其对患者预后的影响 | NA | 通过单细胞RNA测序评估胃癌及其肝转移的细胞亚型，并理解其分子机制 | 胃癌及其肝转移的细胞亚型和分子机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)的GSE163558数据集 | NA | NA | NA | NA |