单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7519 篇文献，本页显示第 6961 - 6980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6961 | 2024-08-04 |
Molecular classification of small cell lung cancer subtypes: Characteristics, prognostic factors, and clinical translation
2024-Jan-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000002693
PMID:37660289
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综述 | 本文回顾并总结了小细胞肺癌的分子分类特征、预后因素和临床应用。 | 研究了基于小细胞肺癌的关键转录因子的新兴分子分类，为肿瘤的病理生理学、转移、免疫微环境及获得性治疗抵抗提供了更多信息 | NA | 探讨小细胞肺癌的分子分类及其临床转化 | 小细胞肺癌的不同亚型及其特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA |
| 6962 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveal different maturation stages and sublineage commitment of human thymic invariant natural killer T cells
2024-01-19, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad113
PMID:37742056
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研究论文 | 本研究揭示了人类胸腺不变自然杀伤T细胞不同的成熟阶段和亚谱系承诺 | 首次定义了人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育过程中的成熟阶段，并评估了亚谱系承诺 | 研究仅限于从胸腺中提取的细胞，缺乏对外周血中细胞的广泛分析 | 探讨人类不变自然杀伤T细胞在胸腺发育中的成熟阶段和亚谱系承诺 | 人类Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从胸腺提取的Vα24+Vβ11+不变自然杀伤T细胞 |
| 6963 | 2024-08-04 |
Role of immune cells in the pathogenesis of myocarditis
2024-01-19, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad143
PMID:37949833
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研究论文 | 此文章总结了免疫细胞在心肌炎发病机制中的角色 | 本研究强调了免疫细胞的复杂性和细胞间相互作用对心肌炎病理过程的重要性 | 目前尚不清楚心肌炎的详细发病机制 | 探讨免疫细胞在心肌炎发病机制中的作用 | 研究涉及心肌炎患者及多种动物模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心肌炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 6964 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of Treg reveals hallmarks and trajectories of immunological aging
2024-01-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad104
PMID:37675661
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研究论文 | 研究了与年龄相关的免疫衰老对CD4+调节性T细胞的影响 | 识别了6个转录组特异性克隆的调节性T细胞，并揭示了与衰老相关的特征和变化轨迹 | 主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨老化对调节性T细胞的影响以及与免疫衰老相关的机制 | 小鼠淋巴和脂肪组织来源的调节性T细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 针对3个月、18个月和24个月龄小鼠的调节性T细胞进行分析 |
| 6965 | 2024-08-07 |
BCG vaccination induces innate immune memory in γδ T cells in humans
2024-01-05, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad103
PMID:37672677
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研究论文 | 本研究探讨了卡介苗（BCG）疫苗是否能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫，从而增强其对异源细菌和真菌感染的交叉保护作用 | 首次证明了BCG疫苗能在人类γδ T细胞中诱导出训练免疫，增强其对异源细菌和真菌刺激的反应性 | NA | 确定人类γδ T细胞是否能通过BCG疫苗诱导出训练免疫，从而增强其交叉保护作用 | 健康人类志愿者的γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | 健康人类志愿者 |
| 6966 | 2024-08-04 |
Generating single-cell gene expression profiles for high-resolution spatial transcriptomics based on cell boundary images
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.110
PMID:38434932
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研究论文 | 本研究介绍了一种更新的软件STCellbin，能够生成高分辨率的单细胞空间基因表达特征 | 该软件结合了细胞膜/细胞壁染色图像与空间基因表达图，增强了单细胞基因表达轮廓的捕获能力 | NA | 提升空间转录组学中单细胞基因表达的分析精度 | 小鼠肝脏和种子数据集的单细胞基因表达轮廓 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | 多个小鼠肝脏和种子的样本 |
| 6967 | 2024-08-04 |
Advances in the Application of Single-Cell Transcriptomics in Plant Systems and Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0029
PMID:38435807
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综述 | 本文总结了单细胞转录组在植物系统和合成生物学中的应用进展 | 探讨了单细胞RNA测序技术在植物生物系统设计和合成生物学中的潜在应用及未来技术进展的影响 | 目前单细胞RNA测序的应用仅限于少量植物物种，且技术成本较高 | 旨在提供单细胞RNA测序在植物样本中的选择指南，并探讨其在植物系统生物学和合成生物学中的不同应用 | 植物生物系统及其合成生物学研究 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 仅限于少量植物物种，包括模型植物、农业作物和生物能源作物 |
| 6968 | 2024-08-07 |
Integrative Omics Analysis Reveals Metabolic Features of Ground-Glass Opacity-Associated Lung Cancer
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.92437
PMID:38434969
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和转录组学分析，揭示了磨玻璃影（GGO）相关肺癌的代谢特征 | 首次全面探讨了GGO相关肺癌的代谢特征和关键代谢基因，特别是发现MAOB在抑制LUAD细胞增殖和转移中的重要作用 | 研究样本量有限，且仅限于GGO相关肺癌，未来需扩大样本量并验证其他类型肺癌中的发现 | 识别GGO相关肺癌的异常代谢途径和关键代谢基因，为该疾病的诊断和治疗提供新策略 | GGO相关肺癌组织及其邻近正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 代谢组学分析, 转录组学分析, 实时定量PCR | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 40对GGO相关肺癌组织及邻近正常组织 |
| 6969 | 2024-08-07 |
Mendelian Randomization Validates the Immune Landscape Mediated by Aggrephagy in Esophageal Squamous Cell Carcinoma Patients from the Perspectives of Multi-omics
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.93376
PMID:38434988
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研究论文 | 通过生物信息学方法研究食管鳞状细胞癌（ESCC）患者中由自噬介导的免疫景观，并利用孟德尔随机化方法识别与食管癌有因果关系的预后细胞簇基因。 | 揭示了自噬相关簇在介导ESCC患者预后和免疫治疗中的作用，并识别出与食管癌发生有因果关系的基因。 | NA | 阐明自噬在ESCC患者中调节的免疫景观，并识别与食管癌有因果关系的预后细胞簇基因。 | 食管鳞状细胞癌患者的免疫景观和预后细胞簇基因。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NMF聚类 | 单细胞转录组数据 | 19种不同的细胞亚群 |
| 6970 | 2024-08-07 |
Characterizing CD8+ TEMRA Cells in CP/CPPS Patients: Insights from Targeted Single-Cell Transcriptomic and Functional Investigations
2024, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S451199
PMID:38435982
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞转录组学和功能研究，探讨了CD8+ TEMRA细胞在慢性前列腺炎/慢性骨盆疼痛综合征（CP/CPPS）患者中的作用 | 首次详细探索了CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS患者中的具体作用，并揭示了其在疾病发病机制中的关键角色 | 研究样本量较小，仅包括两名CP/CPPS患者和两名健康对照 | 阐明CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | CD8+ TEMRA细胞在CP/CPPS患者中的分子特征和功能 | NA | 慢性前列腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两名CP/CPPS患者和两名健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 6971 | 2024-08-07 |
Co-differential genes between DKD and aging: implications for a diagnostic model of DKD
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17046
PMID:38435999
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研究论文 | 本研究通过筛选糖尿病肾病（DKD）和衰老相关的共同差异基因，构建了一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 发现了DKD和衰老之间的共同差异基因，并基于这些基因开发了一个遗传诊断模型 | NA | 探索糖尿病肾病（DKD）和衰老之间的共同差异基因，并建立一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 糖尿病肾病（DKD）和衰老相关的共同差异基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归 | 基因表达数据 | DKD小鼠模型（通过链脲佐菌素（STZ）注射构建并由组织切片染色确认） |
| 6972 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of anoikis-related genes in diagnosis osteoarthritis: based on machine learning and single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2024.2318210
PMID:38423139
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研究论文 | 本研究通过机器学习和单细胞RNA测序数据，全面分析了与细胞凋亡相关的基因在骨关节炎诊断中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据和机器学习模型，识别出与骨关节炎进展相关的细胞凋亡相关基因和通路 | 研究仅使用了两个微阵列数据集和一个单细胞RNA测序数据集，可能存在数据集选择的局限性 | 发现基于转录组的新型细胞凋亡相关生物标志物和通路，用于骨关节炎的进展诊断 | 骨关节炎及其相关的细胞凋亡机制 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | XGB, SVM, RF, GLM | 基因表达数据 | 25,852个细胞，来自6个骨关节炎软骨样本 |
| 6973 | 2024-08-04 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-Apr, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
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研究论文 | 本文描述了一套用于计算微分流形中的测地线的算法，拓展了大变形微分度量映射算法。 | 首次提出空间特征度量 LDDMM 算法，扩展了现有算法以支持组织尺度的空间特征作用 | 尚未实现通过共同坐标的统计平均整合分子和细胞尺度的人群 | 旨在构建一个跨模态的转录组数据对齐算法以实现共同坐标系统的整合 | 研究对象为小鼠脑中的细胞结构和转录组数据 | 计算解剖学 | NA | MERFISH | LDDMM | 几何测量 | 大量未结构化点 |
| 6974 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals that PTPRG activates the m6A methyltransferase VIRMA to block mitophagy-mediated neuronal death in Alzheimer's disease
2024-Mar, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107098
PMID:38325728
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研究论文 | 本研究揭示了PTPRG通过激活m6A甲基转移酶VIRMA来阻止阿尔茨海默病中的线粒体自噬介导的神经元死亡 | 首次展示PTPRG在阿尔茨海默病进展中的作用，并揭示其通过VIRMA和PRKN相互作用影响神经元存活的机制 | 样本主要集中于特定的大脑区域，可能无法全面代表阿尔茨海默病的复杂病理 | 阐明阿尔茨海默病中神经元死亡的机制，以帮助开发有效的治疗方法 | 85个阿尔茨海默病样本和83个对照样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学 | 5×FAD小鼠模型 | 基因表达数据 | 85个阿尔茨海默病样本和83个对照样本，以及6只App AD小鼠和6只对照C57Bl/6 J小鼠的空间转录组数据 |
| 6975 | 2024-08-04 |
Understanding Mechanisms of Response to CAR T-cell Therapy through Single-Cell Sequencing: Insights and Challenges
2024-Mar-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0212
PMID:38324393
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研究论文 | 本文章讨论了单细胞RNA测序在理解CAR T细胞疗法分子特征中的应用及其面临的挑战 | 采用单细胞RNA测序技术，揭示了与临床结果相关的CAR T细胞的分子特征 | 在解释这种复杂数据类型时存在挑战 | 旨在理解CAR T细胞疗法的反应机制 | 研究重点是CAR T细胞的分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 6976 | 2024-08-04 |
Mutual Regulation of Transcriptomes between Murine Pneumocytes and Fibroblasts Mediates Alveolar Regeneration in Air-Liquid Interface Cultures
2024-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0078OC
PMID:38051640
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研究论文 | 该文章分析了肺成纤维细胞与肺上皮细胞在再生过程中的相互作用 | 通过单细胞转录组学揭示了成纤维细胞与肺泡上皮细胞之间的调节循环 | 本研究的局限性未在摘要中详细说明 | 阐明成纤维细胞和肺上皮细胞在再生过程中的相互作用 | 研究了小鼠肺泡 II 型细胞和成纤维细胞的相互作用 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 6977 | 2024-08-07 |
NLRP3 Inhibition Leads to Impaired Mucosal Fibroblast Function in Patients with Inflammatory Bowel Diseases
2024-Mar-01, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjad164
PMID:37748021
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研究论文 | 研究NLRP3炎症小体在炎症性肠病（IBD）中黏膜炎症和纤维化形成中的作用及其抑制效果 | 首次详细研究了NLRP3炎症小体在IBD患者中黏膜炎症和纤维化过程中的表达和功能，并探讨了NLRP3抑制剂对肠道纤维细胞增殖和胶原蛋白产生的影响 | 研究主要集中在NLRP3炎症小体的抑制作用上，未涉及其他可能的炎症途径或治疗方法 | 探讨NLRP3炎症小体在炎症性肠病中的作用及其抑制剂的治疗潜力 | 炎症性肠病患者的黏膜免疫细胞和纤维细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序和微阵列分析 | NA | RNA | 来自炎症性肠病患者的肠道黏膜免疫细胞和纤维细胞 |
| 6978 | 2024-08-07 |
Dissecting the immune discrepancies in mouse liver allograft tolerance and heart/kidney allograft rejection
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13555
PMID:37748771
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研究论文 | 本文构建了小鼠肝、心和肾同种异体移植模型，并利用单细胞RNA测序技术分析了66,393个细胞，以描述器官移植早期阶段的细胞组成和免疫细胞相互作用，同时通过批量RNA测序分析了移植后第7天至第60天的转录组动态变化。 | 首次详细描述了小鼠肝移植耐受与心/肾移植排斥反应中细胞组成和免疫细胞相互作用的差异，并揭示了Kupffer细胞和巨噬细胞在耐受诱导中的协同功能。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 深入理解实体器官移植中的耐受和排斥机制。 | 小鼠肝、心和肾同种异体移植模型中的细胞组成和免疫细胞相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列 | 66,393个细胞 |
| 6979 | 2024-08-07 |
Integration of human organoids single-cell transcriptomic profiles and human genetics repurposes critical cell type-specific drug targets for severe COVID-19
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13558
PMID:37807299
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研究论文 | 本文构建了一个计算框架，整合了人类类器官单细胞转录组数据、全基因组关联研究统计数据、表达数量性状位点以及基因-药物相互作用数据，以识别与COVID-19严重性相关的关键细胞群体和药物靶点 | 本文创新性地利用人类类器官单细胞转录组数据和遗传学数据，重新定位了针对COVID-19的细胞类型特异性药物靶点 | NA | 识别与COVID-19严重性相关的细胞类型特异性药物靶点，以促进开发有效的治疗方法 | 人类类器官中的39种细胞类型及其与COVID-19严重性的关联 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 计算框架 | 转录组数据 | 八种类器官中的39种细胞类型 |
| 6980 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing gene signatures for classifying and scoring exhausted CD8+ T cells in B-cell acute lymphoblastic leukaemia
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13583
PMID:38030593
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |