单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7706 篇文献，本页显示第 6941 - 6960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6941 | 2024-08-07 |
Deciphering the molecular and clinical characteristics of TREM2, HCST, and TYROBP in cancer immunity: A comprehensive pan-cancer study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26993
PMID:38468942
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研究论文 | 本研究全面分析了TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征，探讨了它们在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次进行了TREM2、HCST和TYROBP的泛癌分析，揭示了它们在免疫相关通路和巨噬细胞分化中的关键作用，并探讨了它们作为免疫治疗标志物的潜力 | NA | 探讨TREM2、HCST和TYROBP在肿瘤免疫治疗中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | mRNA表达数据 | 多种癌症类型 |
| 6942 | 2024-08-07 |
A gene signature linked to fibroblast differentiation for prognostic prediction of mesothelioma
2024-Mar-10, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01180-7
PMID:38462627
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研究论文 | 本研究旨在通过分析与成纤维细胞分化相关的基因集，开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 本研究首次识别了六种成纤维细胞亚型和三种分化状态，并基于这些发现提出了新的分类和预后模型 | 研究结果需要在更多的临床样本中进行验证 | 开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 恶性间皮瘤的成纤维细胞分化相关基因 | 数字病理学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自NCBI-GEO, TCGA和MET-500数据库的数据，包括单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和骨转移肿瘤的RNA测序信息 |
| 6943 | 2024-08-07 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.03.011
PMID:38471639
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研究论文 | 本研究评估了通过调节肿瘤免疫微环境来增强化疗效果的策略，特别是通过敲低Xkr8与化疗联合治疗的效果。 | 本研究首次通过深度单细胞RNA测序揭示了Xkr8敲低如何影响肿瘤免疫微环境，并展示了其在增强化疗疗效中的应用。 | NA | 探讨Xkr8敲低与化疗联合治疗在增强抗肿瘤免疫反应和克服化疗免疫抵抗中的作用。 | Xkr8基因、化疗药物与肿瘤免疫微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 6944 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals diverse B cell phenotypes in patients with anti-NMDAR encephalitis
2024-Mar, Psychiatry and clinical neurosciences
IF:5.0Q1
DOI:10.1111/pcn.13627
PMID:38063052
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、单细胞B细胞受体测序等技术，分析了抗NMDAR脑炎患者与对照组的B细胞表型差异 | 首次详细描述了抗NMDAR脑炎患者脑脊液和外周血中B细胞亚群的组成和转录组特征，并发现非DN细胞在体外能分化为DN细胞和抗体分泌细胞 | 需要进一步研究DN细胞亚群对抗NMDAR脑炎中NR1-IgG抗体产生的潜在贡献 | 探讨抗NMDAR脑炎患者B细胞亚群的表型特征 | 抗NMDAR脑炎患者和对照组的B细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞B细胞受体测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附测定 | NA | RNA, B细胞受体序列, 细胞 | 抗NMDAR脑炎患者和对照组的样本 |
| 6945 | 2024-08-07 |
Preclinical Evidence for the Glucocorticoid-Sparing Potential of a Dual Toll-Like Receptor 7/8 Inhibitor in Autoimmune Diseases
2024-02-15, The Journal of pharmacology and experimental therapeutics
IF:3.1Q2
DOI:10.1124/jpet.123.001744
PMID:37673681
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研究论文 | 本文研究了一种双TLR7/8抑制剂在自身免疫疾病中减少糖皮质激素用量的潜力 | 首次展示了TLR7/8抑制剂与糖皮质激素在减少炎症反应中的协同作用，并提高了糖皮质激素的敏感性 | 研究主要基于体外细胞实验和鼠模型，尚未进行临床试验 | 探索TLR7/8抑制剂在自身免疫疾病治疗中的应用，特别是减少糖皮质激素的用量 | TLR7/8抑制剂在自身免疫疾病中的作用机制及其与糖皮质激素的协同效应 | NA | 自身免疫疾病 | NanoString和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类外周血单个核细胞和MRL/鼠模型 |
| 6946 | 2024-08-07 |
Ultrahigh frequencies of peripherally matured LGI1- and CASPR2-reactive B cells characterize the cerebrospinal fluid in autoimmune encephalitis
2024-Feb-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311049121
PMID:38319973
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研究论文 | 研究利用LGI1和CASPR2抗体介导的自身免疫性脑炎作为人类模型，全面重建和分析脑脊液（CSF）B细胞受体（BCR）特征 | 发现脑脊液中克隆扩增的自体抗原反应性抗体分泌细胞（ASCs）频率极高，且BCR成熟主要在外周获得 | 研究样本量较小，仅包括三名患者 | 探究脑脊液中B细胞受体的特征及其在自身免疫性脑炎中的作用 | LGI1和CASPR2抗体介导的自身免疫性脑炎患者的脑脊液B细胞 | NA | 自身免疫性脑炎 | 细胞分选和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 三名患者 |
| 6947 | 2024-08-04 |
Quantifying the clusterness and trajectoriness of single-cell RNA-seq data
2024-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011866
PMID:38416795
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research paper | 本文提出了多个分数来量化单细胞RNA-seq数据的“聚类性”和“轨迹性”，即数据是呈现为独立的聚类还是连续的进程轨迹 | 引入了基于成对距离分布、持久同源性、向量大小、Ripley's K和连接度的多个新分数来评估数据的特性 | 研究可能受到模拟数据和真实数据领域的局限性影响 | 研究单细胞RNA-seq数据的聚类和轨迹推断的可视化差异 | 单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 数据集 | 使用模拟数据集和真实单细胞RNA-seq数据集 |
| 6948 | 2024-08-07 |
Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale
2024-Feb-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201867
PMID:37982461
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研究论文 | 本研究通过采集小鼠胚胎在E8.5至E9.5期间的30万个单细胞转录组数据，结合先前的数据集，构建了一个密集采样的时间序列，用于追踪早期器官发生过程中的细胞分化轨迹。 | 研究首次在小鼠早期器官发生过程中，通过计算方法重建了血液和内皮细胞的复杂发育波，并发现了由体节衍生的内皮细胞的新程序。 | NA | 旨在预测和验证早期哺乳动物器官发生过程中的细胞分化轨迹。 | 小鼠胚胎在E8.5至E9.5期间的单细胞转录组数据。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过40万个细胞 |
| 6949 | 2024-08-04 |
Transcriptomics and Spatial Proteomics for Discovery and Validation of Missing Proteins in the Human Ovary
2024-01-05, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.3c00545
PMID:38085962
|
研究论文 | 该研究通过转录组学和空间蛋白组学发现并验证了人类卵巢中缺失的蛋白质 | 首次识别并验证了14种在人类卵巢中缺失的蛋白质，提供了新的研究方向 | 样本数量有限，仅包含7到32岁之间的卵巢皮层样本 | 探索人类卵巢中缺失蛋白质的功能和角色 | 卵巢皮层中的卵母细胞和颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq，高分辨率抗体基于蛋白质分析，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个新RNA-seq样本 |
| 6950 | 2024-08-04 |
Research progress and application of single-cell sequencing in head and neck malignant tumors
2024-01, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00691-2
PMID:37968342
|
研究论文 | 本文系统介绍了单细胞测序在头颈部恶性肿瘤中的最新进展和应用 | 本文提出了单细胞测序在研究头颈部恶性肿瘤发病机制中的应用，提供了新视角 | 由于篇幅限制，可能未能详细覆盖所有相关研究进展 | 探讨单细胞测序在头颈部恶性肿瘤临床诊断和治疗中的应用 | 头颈部恶性肿瘤的单细胞基因组和转录组 | 数字病理学 | 头颈部恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 数千个细胞 |
| 6951 | 2024-08-07 |
CILP is a potential pan-cancer marker: combined silico study and in vitro analyses
2024-01, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00688-x
PMID:37968343
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研究论文 | 本研究主要探讨了CILP在肿瘤发生发展中的作用及其作为潜在泛癌标志物的可能性 | 首次系统研究了CILP在多种肿瘤中的表达及其对肿瘤发生和患者生存预后的影响，并通过细胞实验验证了CILP的功能 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验，未来需要更多临床样本验证CILP的泛癌标志物作用 | 探索CILP在肿瘤中的作用及其作为泛癌标志物的潜力 | CILP在不同肿瘤类型中的表达及其对肿瘤发生和患者生存预后的影响 | NA | 肿瘤 | RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 使用了来自UCSC Xena的泛癌数据和GSE152938的单细胞数据，以及人肾细胞癌ACHN和786-O细胞系进行实验验证 |
| 6952 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of infiltrating T cells identifies novel targets for gallbladder cancer immunotherapy
2024-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216675
PMID:38280478
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建T细胞图谱，识别胆囊癌中的T细胞亚型，并基于这些亚型进行分子分型，以期为胆囊癌的个性化治疗提供新策略 | 首次建立了基于促肿瘤微环境的胆囊癌亚型分类标准，并发现Th17和Treg细胞数量之间的反比关系 | NA | 探索胆囊癌免疫治疗的新靶点 | 胆囊癌中的T细胞亚型及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12种T细胞亚型 |
| 6953 | 2024-08-04 |
Integrated profiling identifies ferredoxin 1 as an immune-related biomarker of malignant phenotype in glioma
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26976
PMID:38463788
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研究论文 | 本研究发现Ferredoxin 1 (FDX1)作为胶质瘤恶性表型的免疫相关生物标志物 | 揭示了FDX1在胶质瘤预后和肿瘤免疫浸润中的重要作用，尤其是与免疫相关信号通路的关联 | 对于FDX1在胶质瘤中的作用机制尚未进行深入的机制研究 | 探讨FDX1在胶质瘤中的预后意义及其与免疫细胞浸润的关系 | 胶质瘤样本及其临床病理特征 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 组织微阵列 (TMA) 和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 胶质瘤样本数量未明确说明 |
| 6954 | 2024-08-04 |
CLEC4E upregulation in gastric cancer: A potential therapeutic target correlating with tumor-associated macrophages
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27172
PMID:38463883
|
研究论文 | 本研究探讨了CLEC4E在胃癌中上调的作用及其与肿瘤相关巨噬细胞的关联 | 该研究首次揭示了CLEC4E在胃癌中的高表达与不良预后之间的关系，且CLEC4E可作为潜在的治疗靶点 | 该研究的局限性在于实验主要集中于体外研究，临床应用的验证尚需进一步的研究 | 研究CLEC4E在胃癌中的表达及其可能的治疗靶点 | 研究对象为胃癌样本及肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 人类胃癌样本及共培养模型 |
| 6955 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct transcriptomic profiles and evolutionary patterns in lung cancer brain metastasis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27071
PMID:38463784
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺癌脑转移的转录组特征和进化模式 | 揭示了脑转移肿瘤相较于淋巴结和原发肿瘤的更大转录组变化，并发现了特定的配体-受体对 | NA | 阐明肺癌脑转移的潜在机制并描述其转录组景观，以开发治疗干预措施 | 肺癌脑转移的转录组特征和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个不同的肺癌转移单细胞RNA测序数据集 |
| 6956 | 2024-08-07 |
CDKN1A regulation on chondrogenic differentiation of human chondrocytes in osteoarthritis through single-cell and bulk sequencing analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27466
PMID:38463824
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量测序分析，验证了CDKN1A基因在骨关节炎（OA）中软骨细胞软骨形成分化的作用 | 首次结合单细胞和批量测序方法，探讨CDKN1A在OA软骨细胞软骨形成分化中的作用 | NA | 验证CDKN1A在OA软骨细胞软骨形成分化中的作用 | 人软骨细胞在骨关节炎中的软骨形成分化 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的三个RNA-seq数据集（GSE114007, GSE55235, GSE152805） |
| 6957 | 2024-08-04 |
Interrogations of single-cell RNA splicing landscapes with SCASL define new cell identities with physiological relevance
2024-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46480-9
PMID:38461306
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研究论文 | 本研究介绍了SCASL方法，以探讨单细胞RNA剪接的异质性并确定新的细胞身份 | SCASL方法解决了单细胞RNA剪接数据的偏见和稀疏覆盖问题，并提供了细胞身份分类的新方案 | 该方法的局限性尚未明确提及 | 研究单细胞RNA剪接的异质性及其与生理过程的关系 | 利用SCASL方法分析三阴性乳腺癌的潜在癌前和早期肿瘤阶段的细胞群体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用之前发布的数据集作为例子 |
| 6958 | 2024-08-04 |
Transcriptome and single-cell transcriptomics reveal prognostic value and potential mechanism of anoikis in skin cutaneous melanoma
2024-Mar-09, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-024-00926-0
PMID:38460046
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研究论文 | 本文探讨了皮肤黑色素瘤中anoikis的预后价值和作用机制 | 建立了一种基于anoikis的新分类系统，并发现FASLG基因在耗竭的CD8(+) T细胞中的高表达与预后相关 | 样本量和临床数据的局限性可能影响结果的普适性 | 研究anoikis在皮肤黑色素瘤中的预后价值及其作用机制 | 研究对象为皮肤黑色素瘤的样本，特别是与anoikis相关的基因 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6959 | 2024-08-07 |
[Analysis of the differences in the characteristics of mesenchymal stem cells derived from jaw and long bones based on single-cell RNA-sequencing]
2024-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 研究下颌骨和大腿骨骨髓细胞组成，分析这两种组织来源的间充质干细胞（MSCs）的异质性，探讨不同来源骨MSCs功能特性的差异 | 使用单细胞RNA测序技术分析下颌骨和大腿骨骨髓细胞组成，揭示了下颌骨来源的MSCs（M-MSCs）和大腿骨来源的MSCs（F-MSCs）在基因表达模式和上调信号通路上的显著差异 | NA | 探索不同来源骨MSCs功能特性的差异 | 下颌骨和大腿骨来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 下颌骨和大腿骨的骨髓细胞 |
| 6960 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome reveals a novel mechanism of C-Kit+-liver sinusoidal endothelial cells in NASH
2024-Mar-09, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-024-01215-7
PMID:38461242
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了C-Kit+肝窦内皮细胞在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的新型机制 | 发现了C-Kit+肝窦内皮细胞在NASH中的异质性和复杂性，并确认了其通过恢复Pink1相关线粒体自噬来促进NASH进展的作用 | NA | 理解肝窦内皮细胞（LSECs）如何响应非酒精性脂肪性肝炎（NASH） | C-Kit+肝窦内皮细胞的功能及其在NASH中的作用 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自对照组和MCD饮食喂养小鼠的肝脏单个LSEC样本 |