单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 6921 - 6940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 6921 | 2024-08-07 |
The role of histone H1.2 in pancreatic cancer metastasis and chemoresistance
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.101027
PMID:38290407
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺癌（PC）中的化学耐药性和肿瘤转移之间的联系及其分子和细胞机制 | 构建并验证了一个转移和化学耐药性特征（MCS）评分系统，并发现H1-2的高表达与化学耐药性和上皮-间质转化（EMT）相关 | NA | 探索胰腺癌中化学耐药性和肿瘤转移之间的联系及其可能的分子和细胞机制 | 胰腺癌的化学耐药性和肿瘤转移 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6922 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between histone lactylation and cisplatin resistance in bladder cancer
2024-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2024.101059
PMID:38295753
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了组蛋白乳酸化与膀胱癌顺铂耐药性的关联 | 首次发现H3赖氨酸18乳酸化（H3K18la）在顺铂耐药膀胱癌细胞中的重要作用，并通过靶向抑制H3K18la恢复了顺铂敏感性 | NA | 探讨膀胱癌顺铂耐药的机制，并寻找新的干预靶点 | 膀胱癌顺铂耐药细胞及组蛋白乳酸化 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 特定数量的膀胱癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6923 | 2024-08-04 |
ITGAM-mediated macrophages contribute to basement membrane damage in diabetic nephropathy and atherosclerosis
2024-Feb-27, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-024-03505-1
PMID:38413872
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研究论文 | 本研究分析了ITGAM介导的巨噬细胞在糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的作用 | 发现ITGAM作为关键基因参与了糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的基底膜损伤 | 未提供研究中可能存在的具体局限性信息 | 研究糖尿病肾病和动脉粥样硬化中的基底膜损伤及其相关机制 | 糖尿病肾病和动脉粥样硬化患者的转录组特征 | 生物信息学 | 糖尿病相关并发症 | 转录组分析、免疫浸润分析、单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来源于基因表达综合数据库的糖尿病肾病和动脉粥样硬化患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6924 | 2024-08-04 |
A dynamical perspective: moving towards mechanism in single-cell transcriptomics
2024-Apr-22, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2023.0049
PMID:38432314
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评论 | 本文探讨了单细胞转录组学中从表象描述转向机制理解的重要性 | 提出在单细胞分辨率下捕获动态信息的价值，以获取机制见解 | 未明确指出该研究的具体限制 | 目的在于促进对基因调控的机制理解 | 主要研究单细胞转录组学技术和动态信息 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6925 | 2024-08-04 |
Detecting horizontal gene transfer with metagenomics co-barcoding sequencing
2024-Mar-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03602-23
PMID:38315121
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研究论文 | 本文开发了一种新的元基因组共条形码测序系统，以检测水平基因转移 (HGT) | 引入了元基因组共条形码测序（MECOS），实现了长DNA片段提取和综合生物信息学管道 | 传统方法如短读长程元基因组测序和单细胞测序存在片段短、输入DNA量大、测序成本高等限制 | 旨在揭示微生物群落中水平基因转移的机制 | 研究对象为人类和小鼠的肠道微生物群落 | 数字病理学 | NA | 元基因组共条形码测序 | NA | DNA序列 | 超过3000个HGT块，涉及约6000个基因和100个分类组 | NA | NA | NA | NA |
| 6926 | 2024-08-07 |
Identification and validation of RNA-binding protein SLC3A2 regulates melanocyte ferroptosis in vitiligo by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-Mar-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10147-y
PMID:38438962
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，识别并验证了RNA结合蛋白SLC3A2调控黑色素细胞铁死亡在白癜风中的作用。 | 首次确定了与白癜风相关的RNA结合蛋白基因及其潜在的发病机制，特别是在黑色素细胞中SLC3A2的下调促进铁死亡的作用。 | 研究主要集中在细胞实验层面，未来需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 揭示白癜风的发病机制，特别是RNA结合蛋白在其中的作用。 | 白癜风患者的不同细胞亚群及其RNA结合蛋白基因。 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 14种不同细胞类型，28种细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 6927 | 2024-08-04 |
Domain generalization enables general cancer cell annotation in single-cell and spatial transcriptomics
2024-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46413-6
PMID:38431724
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研究论文 | 该文章介绍了一种基于领域泛化的深度学习算法Cancer-Finder，能够快速识别恶性细胞 | 提出了一种新的算法Cancer-Finder，具有95.16%的准确率并能跨多个数据集进行恶性细胞标注 | 目前研究未提及该算法在其他类型癌症样本上的表现 | 研究旨在提高单细胞和空间转录组数据中恶性细胞的注释准确性 | 研究对象为清晰细胞肾细胞癌的空间转录组样本 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序和空间转录组测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | 5个清晰细胞肾细胞癌的空间转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6928 | 2024-08-04 |
High-throughput mapping of single-neuron projection and molecular features by retrograde barcoded labeling
2024-Feb-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85419
PMID:38390967
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研究论文 | 该文章建立了一种新型的多重追踪方法，同时表征单神经元的投射组和转录组 | 提出了rAAV2-retro条形码的多重追踪方法，能够同时分析神经元投射和转录组特征 | 该研究在复杂脑网络中可能仍面临技术挑战 | 帮助揭示神经电路的组织原则和信息处理机制 | 探究腹内侧前额叶皮层(vmPFC)神经元的投射模式及其分子特征 | 神经科学 | NA | 条形码连接组学 | NA | 转录组数据 | 大量单神经元样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6929 | 2024-08-07 |
Human archetypal pluripotent stem cells differentiate into trophoblast stem cells via endogenous BMP5/7 induction without transitioning through naive state
2024-02-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53381-w
PMID:38332235
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研究论文 | 本研究展示了人类原始多能干细胞可以通过内源性BMP5/7诱导分化为滋养层干细胞，无需经过原始状态 | 本研究首次证明了人类原始多能干细胞可以直接分化为滋养层干细胞，无需添加外源性BMP4，通过激活EGF和WNT通路以及抑制TGFβ、HDAC和ROCK信号通路 | NA | 探索人类多能干细胞向滋养层干细胞分化的机制 | 人类多能干细胞和滋养层干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个原始诱导多能干细胞和胚胎干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 6930 | 2024-08-07 |
Microglia sense astrocyte dysfunction and prevent disease progression in an Alexander disease model
2024-02-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad358
PMID:37955589
|
研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞在亚历山大疾病模型中感知星形胶质细胞功能障碍并防止疾病进展的作用 | 首次展示了微胶质细胞通过P2Y12受体感知星形胶质细胞功能障碍，并通过改变形态和钙信号传导来保护对抗亚历山大疾病病理 | NA | 探究微胶质细胞在亚历山大疾病中的作用及其机制 | 微胶质细胞和星形胶质细胞在亚历山大疾病模型中的相互作用 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 免疫组织化学研究，钙成像，单细胞RNA测序，ATP成像 | NA | 图像数据 | 60TM小鼠模型和野生型小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6931 | 2024-08-07 |
A novel batch-effect correction method for scRNA-seq data based on Adversarial Information Factorization
2024-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011880
PMID:38386700
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研究论文 | 本文提出了一种基于对抗信息分解的新型批次效应校正方法，用于单细胞RNA测序数据 | 该方法不依赖于细胞类型的先验知识或特定的标准化策略，适用于任何下游分析任务，并在多种情况下优于现有技术 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 白血病 | scRNA-seq | 对抗信息分解 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6932 | 2024-08-07 |
Soluble TREM2 triggers microglial dysfunction in neuromyelitis optica spectrum disorders
2024-01-04, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad321
PMID:37740498
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研究论文 | 研究探讨了可溶性触发受体表达于髓样细胞2（sTREM2）在神经脊髓炎视谱系疾病（NMOSD）中的病理生理作用及其作为生物标志物的潜力 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序，揭示了sTREM2与NMOSD风险之间的遗传关联，并阐明了sTREM2介导的微胶质细胞功能障碍的分子机制 | NA | 阐明sTREM2在NMOSD中的病理生理作用及其作为治疗靶点的潜力 | sTREM2在NMOSD患者中的表达及其对微胶质细胞功能的影响 | 神经科学 | 神经脊髓炎视谱系疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类巨噬细胞/微胶质样细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6933 | 2024-08-07 |
Characterizing hedgehog pathway features in senescence associated osteoarthritis through Integrative multi-omics and machine learning analysis
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1255455
PMID:38444758
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和机器学习分析，探讨了Hedgehog信号通路在衰老相关骨关节炎中的特征 | 首次结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq技术，识别并验证了与骨关节炎相关的Hedgehog信号通路中的关键基因 | NA | 旨在阐明Hedgehog信号通路在骨关节炎发病机制中的作用 | 骨关节炎中的Hedgehog信号通路及相关基因 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, scRNA-seq, Real-time PCR | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 涉及八个Bulk RNA-seq数据集和一个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6934 | 2024-08-04 |
Exercise potentially prevents colorectal cancer liver metastases by suppressing tumor epithelial cell stemness via RPS4X downregulation
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26604
PMID:38439884
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研究论文 | 本研究探讨了运动通过下调RPS4X抑制结直肠癌肝转移的机制 | 研究首次揭示了运动通过调节RPS4X表达来抑制结直肠癌的干性和转移风险 | 该研究主要依赖于生物信息学分析和实验验证，临床数据的验证尚未充分 | 研究运动对结直肠癌肝转移的影响及其机制 | 重点研究结直肠癌的上皮细胞及其干性标志物 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序分析、肿瘤微阵列、细胞/动物实验 | NA | 基因表达数据 | 19331个样本，涉及多种癌症数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6935 | 2024-08-07 |
Liver-restricted Type I IFN Signature Precedes Liver Damage in Chronic Hepatitis B Patients Stopping Antiviral Therapy
2024-Mar-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300569
PMID:38294274
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研究论文 | 本研究追踪了停止抗病毒治疗的慢性乙型肝炎患者肝脏中的免疫成分和激活状态，使用流式细胞术和单细胞RNA测序分析，发现I型干扰素信号在肝脏损伤前出现。 | 首次揭示了I型干扰素信号在慢性乙型肝炎患者肝脏损伤前的出现，并确认了MIF在炎症反应中的作用。 | 研究样本量未明确提及，且仅限于慢性乙型肝炎患者，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨慢性乙型肝炎患者停止抗病毒治疗后，肝脏损伤前的早期免疫激活事件。 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏免疫反应。 | NA | 乙型肝炎 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6936 | 2024-08-07 |
CD169+ classical monocyte as an important participant in Graves' ophthalmopathy through CXCL12-CXCR4 axis
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109213
PMID:38439953
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序和多平台分析，探讨了CD169经典单核细胞在Graves眼病中的作用及其通过CXCL12-CXCR4轴的机制 | 首次揭示了CD169经典单核细胞在Graves眼病中的临床意义及其分化为CD169巨噬细胞促进炎症、脂肪生成和纤维化的作用 | 需要进一步研究针对循环中单核细胞和CXCL12-CXCR4轴的治疗策略 | 探究Graves眼病的病理机制及其潜在的治疗靶点 | Graves病和Graves眼病患者 | NA | Graves眼病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括Graves病和Graves眼病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6937 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling implicates the psychological stress-induced disruption of spermatogenesis
2024-Mar-12, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102158
PMID:38439912
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了心理压力对大鼠精子发生的影响，揭示了心理压力导致的细胞和分子层面的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了心理压力对精子发生的细胞和分子机制的影响 | 研究仅限于大鼠模型，未来需要进一步在其他物种中验证这些发现 | 揭示心理压力如何通过细胞和分子机制影响精子发生 | 心理压力对大鼠精子发生的影响 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11,744个睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6938 | 2024-08-07 |
Baf-mediated transcriptional regulation of teashirt is essential for the development of neural progenitor cell lineages
2024-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01169-3
PMID:38374207
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研究论文 | 研究通过遗传学方法破坏果蝇神经系统中的进化保守屏障自整合因子（Baf），利用单细胞RNA测序技术揭示了Baf敲降引起的转录组变化，特别是I型神经母细胞中的变化，并发现Baf与转录因子teashirt（tsh）共同作用于异染色质锚定至内核膜的过程，从而调控神经前体细胞谱系的发育 | 首次揭示了Baf介导的teashirt转录调控是一种新的分子机制，用于调节神经前体细胞谱系的发育 | NA | 探索异染色质锚定至内核膜的细胞类型特异性或上下文依赖性程序化调控对神经细胞发育的影响 | 果蝇神经系统中的Baf因子及其对神经前体细胞谱系发育的影响 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 果蝇神经系统中的I型神经母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6939 | 2024-08-04 |
A novel variable neighborhood search approach for cell clustering for spatial transcriptomics
2024, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.109
PMID:38440167
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研究论文 | 本文提出了一种新的基于可变邻域搜索的细胞聚类方法，结合基因表达和空间坐标进行细胞聚类 | 引入了基于可变邻域搜索的模型，超越了传统细胞类型聚类，能够在空间域中进行聚类 | NA | 研究细胞聚类的方法，特别是在空间转录组学领域 | 细胞聚类，基于基因表达和空间坐标的信息 | 数字病理学 | NA | 可变邻域搜索 | NA | 基因表达矩阵和空间坐标 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6940 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing reveals epithelial cells driving brain metastasis in lung adenocarcinoma
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109258
PMID:38433899
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌脑转移的上皮细胞角色 | 发现了一种与脑转移相关的上皮细胞群体，这些细胞在脑转移中发挥重要作用 | 缺乏直接证据证明脑转移病灶与淋巴结转移病灶之间的关联 | 阐明肺腺癌脑转移的细胞起源及其驱动因素 | 主要研究肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本中的细胞组成 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本 | 涉及的样本包括初级肺腺癌、脑转移和淋巴结转移样本 | NA | NA | NA | NA |