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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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6921 | 2024-08-07 |
Adipose Stromal Cell-Derived Cancer-Associated Fibroblasts Suppress FGFR Inhibitor Efficacy
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3904
PMID:38437636
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研究论文 | 研究揭示了脂肪组织中的前体细胞通过分泌神经调节蛋白1(NRG1)激活HER3信号通路,导致尿路上皮癌对FGFR抑制剂erdafitinib产生耐药性 | 发现NRG1介导的FGFR抑制剂耐药性可通过pertuzumab抗体进行干预 | NA | 探讨脂肪组织来源的细胞如何影响癌症治疗效果 | 脂肪组织中的前体细胞及其在癌症治疗中的作用 | NA | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
6922 | 2024-08-07 |
Molecular and Spatial Signatures of Mouse Embryonic Endothelial Cells at Single-Cell Resolution
2024-03, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.323956
PMID:38348657
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术,研究了小鼠胚胎内皮细胞在单细胞分辨率下的分子和空间特征。 | 首次在单细胞分辨率下绘制了胚胎内皮细胞异质性的时空图,并揭示了内皮细胞多样性源于组织起源和血管床位置的双重影响。 | NA | 研究胚胎血管系统发育过程中内皮细胞异质性的建立,特别是动脉和静脉内皮细胞的特化。 | 小鼠胚胎内皮细胞及其前体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 转录组 | 7682个E9.5至E15.5的内皮细胞,15448个内皮细胞的空间转录组分析 |
6923 | 2024-08-07 |
Characterizing Neutrophil Subtypes in Cancer Using scRNA Sequencing Demonstrates the Importance of IL1β/CXCR2 Axis in Generation of Metastasis-specific Neutrophils
2024-02-29, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0319
PMID:38358352
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了健康与恶性肿瘤中中性粒细胞的转录组亚型及其在癌症转移中的作用 | 首次全面检查了健康与恶性肿瘤中不同转录中性粒细胞状态,并揭示了IL1β/CXCR2轴在中性粒细胞从健康到癌症及转移过程中的作用 | 研究主要集中在肺、乳腺癌和结直肠癌数据集上,可能需要进一步验证其他癌症类型的结果 | 探讨中性粒细胞在癌症中的转录组亚型及其在癌症转移中的作用 | 中性粒细胞的转录组亚型及其在癌症中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括公开可用和独立生成的人类和小鼠数据集 |
6924 | 2024-08-04 |
Stromal Signals Dominate Gene Expression Signature Scores That Aim to Describe Cancer Cell-intrinsic Stemness or Mesenchymality Characteristics
2024-02-23, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0383
PMID:38349551
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境对EMT相关基因表达特征分数的影响 | 揭示了肿瘤样本中细胞成分主导EMT特征分数的现象 | 未能深入探讨非癌细胞的具体影响机制 | 验证非癌细胞在肿瘤特征评分中的主导作用 | 已发表的11个与EMT相关的基因表达特征 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 分析了多个肿瘤类型的样本 |
6925 | 2024-08-07 |
EZH2 Inhibition Promotes Tumor Immunogenicity in Lung Squamous Cell Carcinomas
2024-02-13, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0399
PMID:38265267
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研究论文 | 本研究探讨了抑制甲基转移酶增强子zeste 2 (EZH2)是否能增加肺鳞状细胞癌(LSCC)对免疫检查点抑制剂(ICI)的反应 | 首次证明EZH2抑制剂能增加MHC I/II类分子的表达,并通过单细胞RNA测序和免疫细胞分析揭示了肿瘤抑制表型的变化 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的作用 | 肺鳞状细胞癌(LSCC) | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 染色质免疫沉淀测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 使用二维人类癌细胞系和三维小鼠及患者来源的类器官进行体外实验 |
6926 | 2024-08-07 |
Data-driven detection of age-related arbitrary monotonic changes in single-cell gene expression distributions
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16851
PMID:38344300
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研究论文 | 本研究介绍了一种新的工作流程,用于检测单细胞表达谱中与年龄相关的任意单调变化分布 | 使用信息论量化分布差异,并通过距离矩阵进行关联分析 | NA | 理解衰老背后的机制 | 单细胞基因表达随年龄的变化 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
6927 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the links between the metabolic heterogeneity and cell identity in NBM and AML
2024-Mar, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19233
PMID:38009537
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
6928 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Heterogeneity of the Immune Landscape of IDH-Wild-Type High-Grade Gliomas
2024-02-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0211
PMID:38091354
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研究论文 | 本研究构建了IDH野生型高等级胶质瘤的免疫细胞单细胞转录组景观 | 揭示了肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在胶质瘤进展中的潜在作用,并探讨了T细胞的功能失调调节因子AHR | 研究主要聚焦于IDH-WT高等级胶质瘤,可能不适用于其他类型的胶质瘤 | 全面了解IDH-WT高等级胶质瘤的免疫微环境 | IDH-WT高等级胶质瘤患者的肿瘤组织和外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | RNA数据 | 肿瘤组织和外周血单核细胞的样本来自IDH-WT高等级胶质瘤患者 |
6929 | 2024-08-04 |
Signaling Pathway Alterations Driven by BRCA1 and BRCA2 Germline Mutations are Sufficient to Initiate Breast Tumorigenesis by the PIK3CAH1047R Oncogene
2024-01-05, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0330
PMID:38059556
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研究论文 | 本研究生成了BRCA1和BRCA2突变携带者乳腺组织的单细胞转录组图谱,并与健康非携带者进行了比较 | 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变对乳腺上皮细胞转录组的特定影响,并阐明了其与肿瘤发生的关系 | 本研究的样本仅限于BRCA1和BRCA2突变携带者,未能涵盖所有类型的乳腺癌变异 | 研究BRCA1和BRCA2突变在乳腺肿瘤发生中的信号通路改变 | BRCA1和BRCA2突变携带者及健康非携带者的乳腺上皮细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | BRCA1和BRCA2突变携带者的乳腺组织样本与健康非携带者样本进行比较 |
6930 | 2024-08-04 |
Spatial Distribution of Immune Cells Drives Resistance to Neoadjuvant Chemotherapy in Triple-Negative Breast Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0076
PMID:37856875
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探讨三阴性乳腺癌中免疫细胞的空间分布对新辅助化疗的影响 | 研究通过空间转录组学的方法,更深入地理解了三阴性乳腺癌生态系统的复杂元素及其与新辅助化疗反应之间的关系 | 研究基于回顾性病例系列,样本量相对较小,仅包含24名患者 | 旨在探索三阴性乳腺癌对新辅助化疗反应的机制 | 涉及24名三阴性乳腺癌患者,其中12名患者经历了病理完全反应,12名患者则未反应或疾病进展 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 24例三阴性乳腺癌患者 |
6931 | 2024-08-07 |
Bexmarilimab Activates Human Tumor-Associated Macrophages to Support Adaptive Immune Responses in Interferon-Poor Immune Microenvironments
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0350
PMID:37922365
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研究论文 | 本文研究了bexmarilimab在干扰素贫乏的免疫微环境中激活人肿瘤相关巨噬细胞以支持适应性免疫反应的作用。 | 首次揭示了bexmarilimab在低基线干扰素信号的巨噬细胞中效果最佳,并阐明了其在免疫冷肿瘤中的应用潜力。 | 目前尚不清楚bexmarilimab在个体患者中治疗结果的机制。 | 探讨bexmarilimab在卵巢癌腹水巨噬细胞中的反应,并评估其在免疫冷肿瘤中的治疗效果。 | 卵巢癌腹水巨噬细胞及bexmarilimab的治疗效果。 | 免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
6932 | 2024-08-07 |
Combination of Anti-PD-1 and Electroacupuncture Induces a Potent Antitumor Immune Response in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0309
PMID:37956404
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研究论文 | 研究电针(EA)与抗PD-1联合治疗在微卫星稳定(MSS)结直肠癌中的抗肿瘤效果 | 首次探讨了电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的应用,并发现这种联合疗法通过激活STING通路增强了肿瘤的免疫反应 | 研究主要在动物模型中进行,需要进一步的临床试验验证其安全性和有效性 | 探索电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的抗肿瘤效果及机制 | 微卫星稳定的结直肠癌 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个MSS结直肠癌小鼠模型 |
6933 | 2024-08-04 |
BCG vaccination stimulates integrated organ immunity by feedback of the adaptive immune response to imprint prolonged innate antiviral resistance
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01700-0
PMID:38036767
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研究论文 | 本研究探讨了BCG疫苗如何通过适应性免疫反应反馈刺激整合的器官免疫。 | 展示了BCG疫苗通过CD4 T细胞在组织巨噬细胞和上皮细胞中的反馈作用,促进了持久的广泛先天抗病毒抵抗力。 | 仅在小鼠模型中进行,没有在人类实验中验证结果 | 揭示BCG疫苗对异源病原体的非特异性保护机制 | BCG疫苗接种的小鼠 | 免疫学 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术, 空间转录组学 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠数量不明确,但涉及多种病毒感染 |
6934 | 2024-08-04 |
The exploration of mitochondrial-related features helps to reveal the prognosis and immunotherapy methods of colorectal cancer
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1914
PMID:37903487
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研究论文 | 该文章探讨了线粒体相关特征如何揭示结直肠癌的预后和免疫疗法方法 | 文章通过线粒体相关基因风险评分构建预后模型,并与其他模型进行比较,展示了新的预后评估方法 | 该研究可能仅限于数据库中的数据,临床实用性需要进一步验证 | 研究结直肠癌中线粒体特征与肿瘤微环境及免疫景观的关系 | 使用非负矩阵分解(NMF)对结直肠癌患者数据进行亚组分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化和单细胞测序 | 风险评分模型 | 临床数据和基因数据 | 使用内外部队列的 CRC 患者数据进行广泛测试 |
6935 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing to analyze the heterogeneity of hepatocellular carcinoma and establish a prognostic model
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1935
PMID:37994394
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,分析肝细胞癌的异质性,并建立了一个预测模型 | 本研究首次结合单细胞和批量RNA测序数据,探讨了肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联,并开发了一个新的预测模型 | NA | 研究肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联 | 肝细胞癌的肿瘤细胞异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox比例风险模型 | RNA测序数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库,具体样本数量未提及 |
6936 | 2024-08-07 |
The challenge of defining rare genetic programs by single-cell RNA sequencing: Insights from phloem studies
2024-01-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.12.012
PMID:38115581
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
6937 | 2024-08-04 |
Exploration of immune cell heterogeneity by single-cell RNA sequencing and identification of secretory leukocyte protease inhibitor as an oncogene in pancreatic cancer
2024-Mar-13, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24200
PMID:38476085
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索胰腺癌的免疫细胞异质性,并确定分泌性白细胞蛋白酶抑制因子作为一种癌基因。 | 本研究通过发现胰腺癌微环境中八种细胞亚群及其异质性,并识别SLPI为潜在的治疗靶点,具有创新性。 | 研究中未提及样本的临床特征及长期随访数据的相关性。 | 本研究旨在理解胰腺癌的肿瘤微环境及其细胞异质性。 | 研究对象为胰腺癌患者的肿瘤微环境中的细胞亚群。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
6938 | 2024-08-07 |
Prediction of potential targets and toxicological insights of Astragalus in liver cancer based on network pharmacology: Integrating systems biology, drug interaction networks, and toxicological perspectives
2024-Mar-13, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24189
PMID:38476113
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研究论文 | 本研究利用网络药理学方法探讨黄芪在肝癌治疗中的潜在靶点和毒理学见解 | 本研究通过网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接等先进技术,深入分析了黄芪在肝癌治疗中的分子和细胞机制 | NA | 探索黄芪作为肝癌治疗新疗法的潜在靶点和毒理学见解 | 黄芪在肝癌治疗中的作用及其分子和细胞机制 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq | UMAP, tSNE | 基因表达数据 | 涉及20个上调基因和20个下调基因的样本 |
6939 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic sequencing identifies subcutaneous patient-derived xenograft recapitulated medulloblastoma
2024-Mar-13, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12399
PMID:38477441
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序比较了皮下患者源性异种移植(sPDX)、颅内患者源性异种移植(iPDX)和遗传工程小鼠模型(GEMM)在髓母细胞瘤(MB)中的重现性 | 首次在单细胞水平上比较了髓母细胞瘤的实验模型,为不同研究目的的模型选择提供了有价值的见解 | NA | 比较不同模型在髓母细胞瘤中的重现性,以促进肿瘤发生机制的研究 | 髓母细胞瘤(MB)的皮下患者源性异种移植(sPDX)、颅内患者源性异种移植(iPDX)和遗传工程小鼠模型(GEMM) | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从六名患者中获得了初级人类音猬因子(SHH)和3组(G3)MB样本,每个患者样本分别开发了两个sPDX和iPDX模型,还包括三个Patch+/- GEMM模型进行测序 |
6940 | 2024-08-07 |
Analyzing Single Cell RNA Sequencing with Topological Nonnegative Matrix Factorization
2024-Aug-01, Journal of computational and applied mathematics
IF:2.1Q1
DOI:10.1016/j.cam.2024.115842
PMID:38464901
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研究论文 | 本文通过拓扑非负矩阵分解方法分析单细胞RNA测序数据 | 引入了两种持久拉普拉斯正则化的非负矩阵分解方法,即拓扑NMF(TNMF)和鲁棒拓扑NMF(rTNMF),并展示了它们在多个数据集上优于其他基于NMF的方法 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | 12个数据集 |