单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7519 篇文献，本页显示第 6901 - 6920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6901 | 2024-08-07 |
WITHDRAWN: The effect of ischemia on expression quantitative trait loci (eQTL) in human myocardium and insights into myocardial injury etiology
2024-Feb-20, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3967889/v1
PMID:38464039
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析了118名接受主动脉瓣置换手术患者的心肌组织样本，探讨缺血对人类心肌表达数量性状位点（eQTL）的影响及其与心肌损伤病因的关系 | 本研究首次在人类心肌组织中识别并复制了缺血条件下的局部表达数量性状位点（cis-eQTL），并结合基因组关联研究，确定了心肌损伤的因果基因 | 研究样本主要集中在接受特定心脏手术的患者，可能限制了结果的普遍性 | 旨在理解人类心肌缺血的病理过程，并探索心肌损伤的病因 | 人类心肌组织样本及心肌损伤的因果基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 118名患者的心肌组织样本及2,371名患者的独立队列 |
| 6902 | 2024-08-07 |
Transcriptome network analysis of inflammation and fibrosis in keloids
2024-Feb, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.12.007
PMID:38242738
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研究论文 | 本文通过转录组测序和微小RNA测序，分析了人类瘢痕疙瘩组织与正常皮肤组织中的炎症和纤维化转录组图谱，并利用单细胞RNA测序研究了细胞间通讯网络和成纤维细胞的多样性 | 本文首次通过多组学数据揭示了瘢痕疙瘩中炎症细胞与成纤维细胞之间的细胞间对话，并发现了可能与瘢痕疙瘩发展相关的miRNA和基因 | 研究样本量较小，仅包括六个瘢痕疙瘩组织和两个正常皮肤样本，可能影响结果的普遍性 | 探究瘢痕疙瘩中炎症和纤维化的转录组图谱 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 转录组测序、微小RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、微小RNA数据、单细胞RNA数据 | 六个瘢痕疙瘩组织和两个正常皮肤样本，共24,086个细胞 |
| 6903 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA profiling reveals classification and characteristics of mononuclear phagocytes in colorectal cancer
2024-Feb, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011176
PMID:38408082
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对结直肠癌中的单核吞噬细胞进行了分类和特征分析 | 本研究发现了与结直肠癌预后相关的新亚群，并揭示了调控单核吞噬细胞分化的转录因子调控网络 | NA | 深入全面地理解单核吞噬细胞的免疫功能 | 结直肠癌中的单核吞噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6种不同的单核吞噬细胞亚群 |
| 6904 | 2024-08-07 |
Quantifying and correcting bias in transcriptional parameter inference from single-cell data
2024-01-02, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2023.10.021
PMID:37885177
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研究论文 | 本文开发了一种理论，用于解释在使用标准电报模型从单细胞数据推断参数时估计偏差的大小和符号 | 本文发现了特定偏差特征，这些特征取决于外在噪声的来源（即哪个参数在细胞间变化最大）和转录活性模式 | 本文假设没有外在噪声，即参数在细胞间不变化，因此估计的参数应理解为近似群体中的平均值 | 量化并修正从单细胞数据推断转录参数时的偏差 | 单细胞数据中的mRNA计数分布和转录参数 | 分子生物学 | NA | 单分子荧光原位杂交，单细胞RNA测序 | 两状态电报模型 | 单细胞数据 | NA |
| 6905 | 2024-08-07 |
Combined BRAF, MEK, and heat-shock protein 90 inhibition in advanced BRAF V600-mutant melanoma
2024-01, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.35029
PMID:37776537
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研究论文 | 本研究探讨了在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中，联合使用BRAF、MEK抑制剂及热休克蛋白90（HSP90）抑制剂的效果。 | 本研究首次尝试在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中联合使用BRAF、MEK及HSP90抑制剂，并评估了其疗效和安全性。 | 联合治疗显示出显著的毒性，需要频繁减少剂量，这可能导致了相对较低的无进展生存期，尽管肿瘤反应率较高。 | 评估在晚期BRAF V600突变型黑色素瘤中，联合使用BRAF、MEK及HSP90抑制剂的疗效和安全性。 | 晚期BRAF V600突变型黑色素瘤患者。 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25名患者 |
| 6906 | 2024-08-07 |
Corrigendum: Dissecting the single-cell transcriptome network of immune environment underlying cervical premalignant lesion, cervical cancer and metastatic lymph nodes
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1386072
PMID:38464538
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6907 | 2024-08-07 |
Fallopian tube single cell analysis reveals myeloid cell alterations in high-grade serous ovarian cancer
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108990
PMID:38384837
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析输卵管和高度浆液性卵巢癌组织，揭示了免疫和基质细胞的转录多样性及其在肿瘤进展中的作用 | 首次综合分析了人类输卵管单细胞RNA测序数据和高度浆液性卵巢癌相关组织，发现了输卵管中丰富的单核细胞，并揭示了单核细胞和巨噬细胞在肿瘤和正常组织中的特定交互作用和功能通路 | NA | 探索高度浆液性卵巢癌早期检测标志物的发现 | 输卵管和高度浆液性卵巢癌组织中的免疫和基质细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及两个独立队列的输卵管和高度浆液性卵巢癌相关组织 |
| 6908 | 2024-08-04 |
Single cell transcriptome analysis of the THY-Tau22 mouse model of Alzheimer's disease reveals sex-dependent dysregulations
2024-Mar-07, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-024-01885-9
PMID:38453894
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析THY-Tau22阿尔茨海默病小鼠模型，揭示了与性别相关的失调现象。 | 研究首次深入探讨了阿尔茨海默病中早期分子变化的性别依赖性，并识别了关键的调控因子。 | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性。 | 旨在探讨阿尔茨海默病的早期分子变化及其性别差异。 | 研究对象是THY-Tau22阿尔茨海默病小鼠模型。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | THY-Tau22小鼠模型的样本量NA |
| 6909 | 2024-08-07 |
NeuroTri2-VISDOT: An open-access tool to harness the power of second trimester human single cell data to inform models of Mendelian neurodevelopmental disorders
2024-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.578438
PMID:38352329
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研究论文 | 本文介绍了一个名为NeuroTri2-VISDOT的网络工具，用于探索第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据，以支持孟德尔神经发育障碍的研究 | 开发了一个易于访问的网络工具，降低了使用单细胞数据分析的门槛，促进了孟德尔神经发育障碍的转化研究 | NA | 提供一个易于访问的工具，帮助研究人员利用第二孕期人类大脑的单细胞数据来构建孟德尔神经发育障碍的模型 | 第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 由Bhaduri等人在2021年产生的第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据集 |
| 6910 | 2024-08-04 |
Tissue-resident memory T cell signatures from single-cell analysis associated with better melanoma prognosis
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109277
PMID:38455971
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研究论文 | 本研究系统性地探讨了组织驻留记忆T细胞与黑色素瘤肿瘤免疫微环境之间的关系 | 提出了基于T细胞浸润的22基因风险评分，以有效分类黑色素瘤患者的生存风险 | NA | 阐明组织驻留记忆T细胞在黑色素瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其与患者生存的关系 | 黑色素瘤患者的组织驻留记忆T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个临床单细胞RNA-seq数据集 |
| 6911 | 2024-08-07 |
Synaptic endocytosis in adult adipose stromal cell-derived neurons
2024-03-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2023.148746
PMID:38184164
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研究论文 | 本研究探讨了从脂肪来源的间充质干细胞（ADSCs）衍生的神经元中的突触内吞作用 | 首次研究了从ADSCs衍生的神经元中的内吞功能 | NA | 旨在检查从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用 | 从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 蛋白质和量子点 | NA |
| 6912 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of Drosophila trachea reveals glycosylation-mediated Notch signaling in cell fate specification
2024-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46455-w
PMID:38448482
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了果蝇气管系统的细胞图谱，揭示了糖基化介导的Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 首次提供了果蝇气管系统的全面单细胞转录组图谱，并发现了糖基化对Notch信号在细胞命运决定中的响应 | NA | 探究果蝇气管系统的管状形态发生程序 | 果蝇气管系统的细胞类型和Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 9种主要亚型的气管细胞 |
| 6913 | 2024-08-07 |
MSCsDB: a database of single-cell transcriptomic profiles and in-depth comprehensive analyses of human mesenchymal stem cells
2024-Mar-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00496-5
PMID:38449024
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研究论文 | 介绍了一个名为MSCsDB的数据库，该数据库整合了人类间充质干细胞的单细胞转录组数据，并提供深度综合分析 | MSCsDB数据库提供了一个一站式交互查询平台，支持调控子活动、基因本体富集、特征基因可视化和转录因子调控子分析，并开发了专门模块评估MSC质量 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入研究间充质干细胞的异质性，并提供一个系统分析已发表数据集的平台 | 人类间充质干细胞的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括来自26个受试者的5个组织中的470,000个细胞 |
| 6914 | 2024-08-07 |
Diacylglycerols and Lysophosphatidic Acid, Enriched on Lipoprotein(a), Contribute to Monocyte Inflammation
2024-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319937
PMID:38269588
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研究论文 | 研究探讨了脂蛋白(a)（Lp[a]）中富含的二酰甘油（DGs）和溶血磷脂酸（LPA）对单核细胞炎症的贡献 | 首次揭示了Lp(a)中DGs和LPA对单核细胞炎症的影响，并发现这种炎症部分依赖于NLRP3炎症小体 | 研究主要集中在体外实验和部分临床样本分析，需要进一步的临床研究来验证这些发现 | 探讨Lp(a)中其他促炎介质对动脉粥样硬化的影响 | 脂蛋白(a)（Lp[a]）及其相关脂质对单核细胞炎症的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 脂质组学、RNA测序、ELISA、Western blot、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 血液样本、细胞样本 | 健康个体13人，高Lp(a)水平个体12人，心血管疾病患者若干 |
| 6915 | 2024-08-04 |
Recent progress in hair follicle stem cell markers and their regulatory roles
2024-Feb-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i2.126
PMID:38455104
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研究论文 | 本文回顾了毛囊干细胞的分子标记物及其调节作用 | 探讨了单细胞转录组技术提供的详细数据，聚焦于重要的HFSC分子标记物 | 缺乏HFSC的实验验证和比较不同标记物的实用性 | 旨在总结和分析毛囊干细胞标记物及其功能 | 主要研究毛囊干细胞及其在损伤愈合中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | NA | NA |
| 6916 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a pyroptosis-related prognostic model for colorectal cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Feb-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i2.329
PMID:38455135
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研究论文 | 本研究基于大量和单细胞RNA测序数据，构建并验证了与结直肠癌（CRC）预后相关的细胞焦亡相关预测模型。 | 首次构建了一个基于细胞焦亡相关基因的结直肠癌预后模型，并验证了其与免疫浸润的相关性。 | NA | 评估细胞焦亡相关基因对结直肠癌预后的影响及其与免疫浸润的关联。 | 结直肠癌（CRC）患者的预后及免疫浸润情况。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | LASSO回归算法 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，具体样本数量未在摘要中明确。 |
| 6917 | 2024-08-04 |
Granzyme B+ B cells detected by single-cell sequencing are associated with prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma following liver transplantation
2024-Feb-22, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03609-x
PMID:38386050
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞测序检测到的granzyme B+ B细胞与肝移植后肝内胆管癌患者预后的关系 | 首次揭示了肿瘤样本中granzyme B+ B细胞的显著增加及其与无病生存的正相关性 | 研究仅涉及肝内胆管癌，无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究granzyme B+ B细胞在肝内胆管癌中的作用及其对预后的影响 | 肝移植接受者的肝内胆管癌患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序 | NA | 样本数据 | 25个样本来自基因表达综合数据库以及40名肝移植接受者 |
| 6918 | 2024-08-04 |
Identification macrophage signatures in prostate cancer by single-cell sequencing and machine learning
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03633-5
PMID:38349474
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习识别前列腺癌中的巨噬细胞特征。 | 提出了一种基于巨噬细胞相关基因的风险标签，用于预测前列腺癌患者的进展。 | 样本来源于公共数据库，可能缺乏来自不同临床环境的数据验证。 | 分析肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的作用，并建立相关的预后模型。 | 关注肿瘤微环境中巨噬细胞与前列腺癌进展之间的关系。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、机器学习 | NA | 基因数据、RNA数据 | 从多个公共数据库下载的前列腺癌单细胞测序数据 |
| 6919 | 2024-08-07 |
uPAR (PLAUR) Marks Two Intra-Tumoral Subtypes of Glioblastoma: Insights from Single-Cell RNA Sequencing
2024-Feb-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25041998
PMID:38396677
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了uPAR（PLAUR）在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用及其分子合作者 | 首次全面研究uPAR在GBM内部亚型中的功能及其分子合作者，无需预设生物学途径 | NA | 探讨uPAR在胶质母细胞瘤内部亚型中的作用及其分子机制 | uPAR在胶质母细胞瘤中的作用及其分子合作者 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 37名胶质母细胞瘤患者 |
| 6920 | 2024-08-07 |
Targeting tumor-stromal interactions in triple-negative breast cancer using a human vascularized micro-tumor model
2024-01-05, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01760-y
PMID:38183074
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研究论文 | 本研究利用人血管化微肿瘤模型，探索三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子基础及潜在治疗靶点 | 采用先进的体外微生理系统——血管化微肿瘤模型，结合单细胞RNA测序技术，揭示了正常乳腺组织基质细胞在三阴性乳腺癌微环境中的促癌信号通路 | NA | 研究三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子机制，并探索潜在的治疗靶点 | 三阴性乳腺癌中的肿瘤-基质相互作用及其治疗靶点 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 血管化微肿瘤模型 | RNA | NA |