单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7706 篇文献，本页显示第 6861 - 6880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6861 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-sequencing of cellular heterogeneity and pathogenic mechanisms in paraquat-induced Parkinson's disease with depression
2024-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116169
PMID:38447518
|
研究论文 | 本研究探讨了对于帕金森病合并抑郁症的小鼠模型中细胞异质性及其病理机制的单细胞RNA测序分析 | 揭示了特定的谷氨酸能神经元群体在帕金森病合并抑郁症进展中的作用并建立了全面的基因表达图谱 | 该研究主要依赖小鼠模型，可能无法完全推导到人类疾病的复杂性 | 全面研究在帕金森病背景下抑郁症进展的细胞异质性和机制 | 以PQ诱导的帕金森病合并抑郁症小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用了多只小鼠进行实验 |
| 6862 | 2024-08-04 |
Single-cell and multi-omics analyses highlight cancer-associated fibroblasts-induced immune evasion and epithelial mesenchymal transition for smoking bladder cancer
2024-Mar-15, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2024.153782
PMID:38493947
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研究论文 | 研究揭示了吸烟膀胱癌中癌相关成纤维细胞诱导的免疫逃逸和上皮-间质转化的机制 | 构建了一个新的预后标志，并识别了33个与烟草致癌物相关的关键基因 | 对烟草致癌物及其在膀胱癌预后中的具体功能尚缺乏深入阐述 | 系统评估烟草致癌物对膀胱癌预后的影响 | 膀胱癌特异性烟草致癌物相关基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，癌基因组分析 | 基因×基因交互模型 | 基因数据 | 来自南京膀胱癌队列和TCGA数据库的基因数据 |
| 6863 | 2024-08-04 |
Highly sensitive spatial transcriptomics using FISHnCHIPs of multiple co-expressed genes
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46669-y
PMID:38491027
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FISHnCHIPs的技术，用于高度灵敏的细胞类型和基因表达程序的原位剖析 | FISHnCHIPs能够同时成像~2-35个共同表达的基因，具有~2-20倍于单基因FISH的灵敏度 | 未在摘要中提到具体的局限性 | 旨在提高组织样本的空间转录组学分析的灵敏度 | 涉及鼠类肾脏和脑部的组织样本，以及人类结直肠癌活检样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | FISH | NA | 组织样本 | 分析了多个鼠类样本和一个人类活检样本 |
| 6864 | 2024-08-07 |
A prognostic risk prediction model based on ferroptosis-related long non-coding RNAs in bladder cancer: A bulk RNA-seq research and scRNA-seq validation: Erratum
2024-Mar-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000037547
PMID:38489743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6865 | 2024-08-07 |
Autophagy regulates the maturation of hematopoietic precursors in the embryo
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46453-y
PMID:38490977
|
研究论文 | 本文研究了自噬在胚胎造血前体细胞成熟过程中的作用 | 首次揭示了自噬在胚胎造血前体细胞成熟中的作用，并探讨了自噬相关基因Atg5在血管内皮细胞中的缺失对内皮到造血转变的影响 | NA | 理解调控胚胎造血干细胞发育的机制，促进其再生 | 胚胎造血前体细胞和造血干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | LC3-RFP-EGFP小鼠模型 |
| 6866 | 2024-08-07 |
Sex disparities revealed by single-cell and bulk sequencing and their impacts on the efficacy of immunotherapy in esophageal cancer
2024-Mar-15, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-024-00598-z
PMID:38491510
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研究论文 | 本研究探讨了性别差异对食管癌免疫治疗效果的影响，通过单细胞和批量测序技术揭示了性别在免疫抑制肿瘤微环境中的作用 | 首次系统地描述了食管癌中性别相关的基因组和细胞差异，并构建了一个性别相关的预测免疫治疗效果的特征 | 研究结果主要基于回顾性数据，未来需要前瞻性研究来验证这些发现 | 探索性别差异对食管癌免疫治疗效果的影响及其分子基础 | 食管癌患者及其免疫治疗效果 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | NA | 基因组数据，免疫细胞数据 | 2360名食管癌患者，1425个样本，105,145个免疫细胞 |
| 6867 | 2024-08-04 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells uncovers redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2024-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.04.583414
PMID:38496543
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研究论文 | 本文揭示了在植物茎尖干细胞中表达的冗余调控因子，这对于提高作物产量具有重要意义 | 首次对玉米和拟南芥的茎尖干细胞进行了大规模单细胞RNA测序，识别出保守的干细胞调控因子 | 在现有单细胞分析中，植物茎尖干细胞的获取和调控因子的检测存在困难 | 研究植物茎尖干细胞中的调控因子，以促进作物工程提升生产力 | 玉米和拟南芥的茎尖干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 来自玉米和拟南芥的成千上万的干细胞表达细胞 |
| 6868 | 2024-08-04 |
Defining the T cell transcriptional landscape in pediatric liver transplant rejection at single cell resolution
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.26.582173
PMID:38464256
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研究论文 | 本文探讨了小儿肝脏移植排斥反应中的T细胞转录谱，以单细胞分辨率定义其特征 | 使用单细胞测序和免疫谱系分析揭示了CD8+ T细胞的特异性和基因表达特征，以及在排斥反应中的持续活性 | 本研究的样本量较小，仅包括14名患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 研究小儿肝脏移植在急性细胞排斥中的T细胞反应及其转录特征 | 14名小儿肝脏移植患者的肝活检样本 | 免疫学 | 肝脏移植排斥反应 | 单细胞测序和免疫谱系分析 | CD8+ T细胞克隆类型分析 | 生物样本（肝活检） | 14名患者的30个冷冻保存的肝活检样本 |
| 6869 | 2024-08-07 |
Insulin signaling regulates R2 retrotransposon expression to orchestrate transgenerational rDNA copy number maintenance
2024-Feb-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582629
PMID:38464041
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研究论文 | 本文研究了胰岛素信号通路如何通过调节R2逆转录转座子的表达，来维持代际间核糖体DNA（rDNA）拷贝数的稳定 | 首次揭示了胰岛素受体（InR）作为R2表达的主要抑制因子，并通过单细胞RNA测序发现InR表达与rDNA拷贝数的关系 | NA | 探讨胰岛素信号通路在维持rDNA拷贝数稳定中的作用及其机制 | 胰岛素信号通路、R2逆转录转座子、核糖体DNA拷贝数 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 6870 | 2024-08-04 |
scGIR: deciphering cellular heterogeneity via gene ranking in single-cell weighted gene correlation networks
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae091
PMID:38487851
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研究论文 | 本文介绍了一种新算法scGIR，用于通过基因排名解读单细胞RNA测序中的细胞异质性 | 提出了一种新颖的单细胞基因相关性网络算法，通过权重处理基因表达水平，增强了基因重要性排序 | 尚未在各种细胞类型和实验条件下全面验证该算法的适用性 | 研究单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 针对九个真实的scRNA-seq数据集进行基因重要性分析 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 随机游走模型 | 基因表达数据 | 九个scRNA-seq数据集 |
| 6871 | 2024-08-07 |
Image-activated pico-injection for single-cell analysis
2024-May-15, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.125765
PMID:38346358
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研究论文 | 本文介绍了一种名为图像激活皮科注射（imgPico）的新技术，用于在无需标记的情况下，按需向液滴中补充试剂 | imgPico技术通过实时图像分析检测目标液滴，并进行针对性的皮科注射，提高了液滴应用中试剂添加的精确性和效率 | NA | 研究并优化图像激活皮科注射技术，以提高其在单细胞分析中的应用效果 | 液滴中的单细胞分析 | 计算机视觉 | NA | 图像分析 | NA | 图像 | 分别包含一个、两个和三个细胞的液滴 |
| 6872 | 2024-08-05 |
Bacterial heat shock protein: A new crosstalk between T lymphocyte and macrophage via JAK2/STAT1 pathway in bloodstream infection
2024-May, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127626
PMID:38330817
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研究论文 | 本研究探讨了细菌热休克蛋白在血流感染中T淋巴细胞和巨噬细胞之间的新型相互作用 | 发现了细菌外分泌调节蛋白与宿主免疫细胞之间的相互作用，并识别了JAK2/STAT1通路的激活与T细胞耗竭相关 | 尚未明确该研究在临床治疗中的具体应用效果 | 调查在高度耐药恶性血流感染中细菌与宿主免疫细胞的相互作用 | 单细胞测序结果、感染者的免疫细胞和相关信号通路 | 数字病理学 | NA | 蛋白质组学、单细胞测序 | 细胞模型和动物模型 | 细胞样本与患者血液样本 | 涉及单细胞样本和感染患者的血液样本 |
| 6873 | 2024-08-07 |
Cytokine expression patterns: A single-cell RNA sequencing and machine learning based roadmap for cancer classification
2024-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习技术，分析了肿瘤免疫微环境中的细胞因子表达模式，用于精确的癌症分类 | 首次利用单细胞RNA测序数据结合机器学习模型，识别出不同癌症类型的独特细胞因子表达模式，并应用于癌症分类 | NA | 旨在解决特定类型癌症中细胞因子表达模式的识别问题，并提高癌症分类的准确性 | 肿瘤免疫微环境中的细胞因子表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习分类模型 | 表达数据 | 包括39种癌症，整合了来自多个公共数据库的684个肿瘤单细胞RNA测序样本 |
| 6874 | 2024-08-07 |
Histone Trimethylations and HDAC5 Regulate Spheroid Subpopulation and Differentiation Signaling of Human Adipose-Derived Stem Cells
2024-Mar-15, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad090
PMID:38173411
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研究论文 | 本文研究了人类脂肪干细胞（ASCs）球状体形成的表观遗传调控及其信号协调机制 | 发现了H3K4me3、H3K9me3和HDAC5在干细胞命运和定向分化中的关键作用 | NA | 揭示ASCs球状体形成的细胞命运和分化机制 | 人类脂肪干细胞（ASCs）及其球状体 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用10x Genomics平台分析了ASCs球状体 |
| 6875 | 2024-08-07 |
Decoding the Cell Atlas and Inflammatory Features of Human Intracranial Aneurysm Wall by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Mar-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.032456
PMID:38390814
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人颅内动脉瘤壁的细胞图谱和炎症特征 | 首次在颅内动脉瘤壁中鉴定出具有ABCC9和HIGD1B特征的周细胞，并通过机器学习算法证实了巨噬细胞与动脉瘤破裂的关联 | NA | 深入了解颅内动脉瘤壁的细胞结构和炎症特征，为未破裂动脉瘤的治疗提供新思路 | 破裂和未破裂的人颅内动脉瘤壁 | 数字病理学 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA | 21,332个合格细胞，以及126名患者的血清学结果 |
| 6876 | 2024-08-04 |
TISSUE: uncertainty-calibrated prediction of single-cell spatial transcriptomics improves downstream analyses
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02184-y
PMID:38347138
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研究论文 | 本文提出了一种新框架TISSUE，用于评估空间基因表达预测的不确定性，改善下游分析 | TISSUE框架利用保形推断提供良好校准的预测区间，并减少差异基因表达分析中的假发现率 | 未提及具体的局限性 | 提高单细胞空间转录组学预测的准确性及其下游分析 | 对小鼠成年人侧脑室区域的MERFISH空间转录组数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11个基准数据集及一个小鼠数据集 |
| 6877 | 2024-08-04 |
Correcting PCR amplification errors in unique molecular identifiers to generate accurate numbers of sequencing molecules
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02168-y
PMID:38317008
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研究论文 | 本研究探讨了PCR扩增误差对RNA分子绝对计数的准确性影响。 | 研究展示了一种使用同聚三聚体核苷酸块合成唯一分子标识符的方法，以纠正PCR错误并实现精确计数。 | 研究未提及样本数量及多样性限制。 | 探讨PCR扩增误差对RNA分子计数准确性的影响。 | 研究对象为RNA分子及其测序数据。 | 数字病理 | NA | PCR | NA | RNA数据 | NA |
| 6878 | 2024-08-04 |
In situ single-cell profiling sheds light on IFI27 localisation during SARS-CoV-2 infection
2024-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105016
PMID:38377798
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组技术描绘了SARS-CoV-2感染期间的免疫反应 | 首次识别了在感染部位M1巨噬细胞中IFI27的高表达 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染下的免疫反应 | 感染部位的M1巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组技术 | NA | NA | NA |
| 6879 | 2024-08-04 |
PI3K/mTOR is a therapeutically targetable genetic dependency in diffuse intrinsic pontine glioma
2024-Feb-06, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170329
PMID:38319732
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研究论文 | 本文探讨了针对弥漫性内在脑干胶质瘤的治疗靶点和组合疗法的潜力 | 识别了PIK3CA和MTOR作为可靶向的分子依赖性，并提出了paxalisib与二甲双胍及标准放疗联合的临床相关治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床应用仍需进一步验证 | 开发有效的针对弥漫性中线胶质瘤的治疗策略 | 研究弥漫性内在脑干胶质瘤患者衍生模型及其针对性治疗效果 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9基因删除筛选，空间转录组学，ATAC-Seq | 正交肿瘤模型 | 分子数据 | 多种患者衍生和免疫相容性的异种移植模型 |
| 6880 | 2024-08-07 |
Amphiregulin switches progenitor cell fate for lineage commitment during gastric mucosal regeneration
2024-Mar-14, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.03.009
PMID:38492892
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研究论文 | 研究胃黏膜再生过程中，Amphiregulin如何调控前体细胞的谱系承诺 | 首次揭示了Amphiregulin在胃黏膜再生中对前体细胞谱系承诺的调控作用 | NA | 探讨胃黏膜损伤后前体细胞微环境的调控机制 | 胃黏膜中的Isthmic前体细胞及其在再生过程中的谱系承诺 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胃黏膜上皮细胞 |