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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6841 | 2024-08-04 |
Spatial Distribution of Immune Cells Drives Resistance to Neoadjuvant Chemotherapy in Triple-Negative Breast Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0076
PMID:37856875
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学探讨三阴性乳腺癌中免疫细胞的空间分布对新辅助化疗的影响 | 研究通过空间转录组学的方法,更深入地理解了三阴性乳腺癌生态系统的复杂元素及其与新辅助化疗反应之间的关系 | 研究基于回顾性病例系列,样本量相对较小,仅包含24名患者 | 旨在探索三阴性乳腺癌对新辅助化疗反应的机制 | 涉及24名三阴性乳腺癌患者,其中12名患者经历了病理完全反应,12名患者则未反应或疾病进展 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 24例三阴性乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6842 | 2024-08-07 |
Bexmarilimab Activates Human Tumor-Associated Macrophages to Support Adaptive Immune Responses in Interferon-Poor Immune Microenvironments
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0350
PMID:37922365
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研究论文 | 本文研究了bexmarilimab在干扰素贫乏的免疫微环境中激活人肿瘤相关巨噬细胞以支持适应性免疫反应的作用。 | 首次揭示了bexmarilimab在低基线干扰素信号的巨噬细胞中效果最佳,并阐明了其在免疫冷肿瘤中的应用潜力。 | 目前尚不清楚bexmarilimab在个体患者中治疗结果的机制。 | 探讨bexmarilimab在卵巢癌腹水巨噬细胞中的反应,并评估其在免疫冷肿瘤中的治疗效果。 | 卵巢癌腹水巨噬细胞及bexmarilimab的治疗效果。 | 免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6843 | 2024-08-07 |
Combination of Anti-PD-1 and Electroacupuncture Induces a Potent Antitumor Immune Response in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2024-01-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0309
PMID:37956404
|
研究论文 | 研究电针(EA)与抗PD-1联合治疗在微卫星稳定(MSS)结直肠癌中的抗肿瘤效果 | 首次探讨了电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的应用,并发现这种联合疗法通过激活STING通路增强了肿瘤的免疫反应 | 研究主要在动物模型中进行,需要进一步的临床试验验证其安全性和有效性 | 探索电针与抗PD-1联合治疗在MSS结直肠癌中的抗肿瘤效果及机制 | 微卫星稳定的结直肠癌 | 肿瘤学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个MSS结直肠癌小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6844 | 2024-08-04 |
BCG vaccination stimulates integrated organ immunity by feedback of the adaptive immune response to imprint prolonged innate antiviral resistance
2024-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01700-0
PMID:38036767
|
研究论文 | 本研究探讨了BCG疫苗如何通过适应性免疫反应反馈刺激整合的器官免疫。 | 展示了BCG疫苗通过CD4 T细胞在组织巨噬细胞和上皮细胞中的反馈作用,促进了持久的广泛先天抗病毒抵抗力。 | 仅在小鼠模型中进行,没有在人类实验中验证结果 | 揭示BCG疫苗对异源病原体的非特异性保护机制 | BCG疫苗接种的小鼠 | 免疫学 | 呼吸道疾病 | 流式细胞术, 空间转录组学 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠数量不明确,但涉及多种病毒感染 | NA | NA | NA | NA |
| 6845 | 2024-08-04 |
The exploration of mitochondrial-related features helps to reveal the prognosis and immunotherapy methods of colorectal cancer
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1914
PMID:37903487
|
研究论文 | 该文章探讨了线粒体相关特征如何揭示结直肠癌的预后和免疫疗法方法 | 文章通过线粒体相关基因风险评分构建预后模型,并与其他模型进行比较,展示了新的预后评估方法 | 该研究可能仅限于数据库中的数据,临床实用性需要进一步验证 | 研究结直肠癌中线粒体特征与肿瘤微环境及免疫景观的关系 | 使用非负矩阵分解(NMF)对结直肠癌患者数据进行亚组分析 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组化和单细胞测序 | 风险评分模型 | 临床数据和基因数据 | 使用内外部队列的 CRC 患者数据进行广泛测试 | NA | NA | NA | NA |
| 6846 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing to analyze the heterogeneity of hepatocellular carcinoma and establish a prognostic model
2024-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1935
PMID:37994394
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,分析肝细胞癌的异质性,并建立了一个预测模型 | 本研究首次结合单细胞和批量RNA测序数据,探讨了肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联,并开发了一个新的预测模型 | NA | 研究肝细胞癌肿瘤异质性与治疗反应和预后的关联 | 肝细胞癌的肿瘤细胞异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox比例风险模型 | RNA测序数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库,具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6847 | 2024-08-07 |
The challenge of defining rare genetic programs by single-cell RNA sequencing: Insights from phloem studies
2024-01-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2023.12.012
PMID:38115581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6848 | 2024-08-07 |
Deciphering the molecular and clinical characteristics of TREM2, HCST, and TYROBP in cancer immunity: A comprehensive pan-cancer study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26993
PMID:38468942
|
研究论文 | 本研究全面分析了TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征,探讨了它们在肿瘤免疫治疗中的作用 | 首次进行了TREM2、HCST和TYROBP的泛癌分析,揭示了它们在免疫相关通路和巨噬细胞分化中的关键作用,并探讨了它们作为免疫治疗标志物的潜力 | NA | 探讨TREM2、HCST和TYROBP在肿瘤免疫治疗中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | TREM2、HCST和TYROBP在多种癌症中的分子和临床特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | mRNA表达数据 | 多种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 6849 | 2024-08-07 |
A gene signature linked to fibroblast differentiation for prognostic prediction of mesothelioma
2024-Mar-10, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01180-7
PMID:38462627
|
研究论文 | 本研究旨在通过分析与成纤维细胞分化相关的基因集,开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 本研究首次识别了六种成纤维细胞亚型和三种分化状态,并基于这些发现提出了新的分类和预后模型 | 研究结果需要在更多的临床样本中进行验证 | 开发一种新的恶性间皮瘤分类和预后预测模型 | 恶性间皮瘤的成纤维细胞分化相关基因 | 数字病理学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自NCBI-GEO, TCGA和MET-500数据库的数据,包括单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据和骨转移肿瘤的RNA测序信息 | NA | NA | NA | NA |
| 6850 | 2024-08-07 |
Knocking down of Xkr8 enhances chemotherapy efficacy through modulating tumor immune microenvironment
2024-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.03.011
PMID:38471639
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研究论文 | 本研究评估了通过调节肿瘤免疫微环境来增强化疗效果的策略,特别是通过敲低Xkr8与化疗联合治疗的效果。 | 本研究首次通过深度单细胞RNA测序揭示了Xkr8敲低如何影响肿瘤免疫微环境,并展示了其在增强化疗疗效中的应用。 | NA | 探讨Xkr8敲低与化疗联合治疗在增强抗肿瘤免疫反应和克服化疗免疫抵抗中的作用。 | Xkr8基因、化疗药物与肿瘤免疫微环境。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6851 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals diverse B cell phenotypes in patients with anti-NMDAR encephalitis
2024-Mar, Psychiatry and clinical neurosciences
IF:5.0Q1
DOI:10.1111/pcn.13627
PMID:38063052
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、单细胞B细胞受体测序等技术,分析了抗NMDAR脑炎患者与对照组的B细胞表型差异 | 首次详细描述了抗NMDAR脑炎患者脑脊液和外周血中B细胞亚群的组成和转录组特征,并发现非DN细胞在体外能分化为DN细胞和抗体分泌细胞 | 需要进一步研究DN细胞亚群对抗NMDAR脑炎中NR1-IgG抗体产生的潜在贡献 | 探讨抗NMDAR脑炎患者B细胞亚群的表型特征 | 抗NMDAR脑炎患者和对照组的B细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞B细胞受体测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附测定 | NA | RNA, B细胞受体序列, 细胞 | 抗NMDAR脑炎患者和对照组的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6852 | 2024-08-04 |
Quantifying the clusterness and trajectoriness of single-cell RNA-seq data
2024-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011866
PMID:38416795
|
research paper | 本文提出了多个分数来量化单细胞RNA-seq数据的“聚类性”和“轨迹性”,即数据是呈现为独立的聚类还是连续的进程轨迹 | 引入了基于成对距离分布、持久同源性、向量大小、Ripley's K和连接度的多个新分数来评估数据的特性 | 研究可能受到模拟数据和真实数据领域的局限性影响 | 研究单细胞RNA-seq数据的聚类和轨迹推断的可视化差异 | 单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 数据集 | 使用模拟数据集和真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6853 | 2024-08-04 |
Transcriptomics and Spatial Proteomics for Discovery and Validation of Missing Proteins in the Human Ovary
2024-01-05, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.3c00545
PMID:38085962
|
研究论文 | 该研究通过转录组学和空间蛋白组学发现并验证了人类卵巢中缺失的蛋白质 | 首次识别并验证了14种在人类卵巢中缺失的蛋白质,提供了新的研究方向 | 样本数量有限,仅包含7到32岁之间的卵巢皮层样本 | 探索人类卵巢中缺失蛋白质的功能和角色 | 卵巢皮层中的卵母细胞和颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq,高分辨率抗体基于蛋白质分析,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 四个新RNA-seq样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6854 | 2024-08-04 |
Research progress and application of single-cell sequencing in head and neck malignant tumors
2024-01, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00691-2
PMID:37968342
|
研究论文 | 本文系统介绍了单细胞测序在头颈部恶性肿瘤中的最新进展和应用 | 本文提出了单细胞测序在研究头颈部恶性肿瘤发病机制中的应用,提供了新视角 | 由于篇幅限制,可能未能详细覆盖所有相关研究进展 | 探讨单细胞测序在头颈部恶性肿瘤临床诊断和治疗中的应用 | 头颈部恶性肿瘤的单细胞基因组和转录组 | 数字病理学 | 头颈部恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 数千个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6855 | 2024-08-07 |
CILP is a potential pan-cancer marker: combined silico study and in vitro analyses
2024-01, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00688-x
PMID:37968343
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研究论文 | 本研究主要探讨了CILP在肿瘤发生发展中的作用及其作为潜在泛癌标志物的可能性 | 首次系统研究了CILP在多种肿瘤中的表达及其对肿瘤发生和患者生存预后的影响,并通过细胞实验验证了CILP的功能 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,未来需要更多临床样本验证CILP的泛癌标志物作用 | 探索CILP在肿瘤中的作用及其作为泛癌标志物的潜力 | CILP在不同肿瘤类型中的表达及其对肿瘤发生和患者生存预后的影响 | NA | 肿瘤 | RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 使用了来自UCSC Xena的泛癌数据和GSE152938的单细胞数据,以及人肾细胞癌ACHN和786-O细胞系进行实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6856 | 2024-08-04 |
Integrated profiling identifies ferredoxin 1 as an immune-related biomarker of malignant phenotype in glioma
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26976
PMID:38463788
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研究论文 | 本研究发现Ferredoxin 1 (FDX1)作为胶质瘤恶性表型的免疫相关生物标志物 | 揭示了FDX1在胶质瘤预后和肿瘤免疫浸润中的重要作用,尤其是与免疫相关信号通路的关联 | 对于FDX1在胶质瘤中的作用机制尚未进行深入的机制研究 | 探讨FDX1在胶质瘤中的预后意义及其与免疫细胞浸润的关系 | 胶质瘤样本及其临床病理特征 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 组织微阵列 (TMA) 和单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 胶质瘤样本数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6857 | 2024-08-04 |
CLEC4E upregulation in gastric cancer: A potential therapeutic target correlating with tumor-associated macrophages
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27172
PMID:38463883
|
研究论文 | 本研究探讨了CLEC4E在胃癌中上调的作用及其与肿瘤相关巨噬细胞的关联 | 该研究首次揭示了CLEC4E在胃癌中的高表达与不良预后之间的关系,且CLEC4E可作为潜在的治疗靶点 | 该研究的局限性在于实验主要集中于体外研究,临床应用的验证尚需进一步的研究 | 研究CLEC4E在胃癌中的表达及其可能的治疗靶点 | 研究对象为胃癌样本及肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 人类胃癌样本及共培养模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6858 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct transcriptomic profiles and evolutionary patterns in lung cancer brain metastasis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27071
PMID:38463784
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺癌脑转移的转录组特征和进化模式 | 揭示了脑转移肿瘤相较于淋巴结和原发肿瘤的更大转录组变化,并发现了特定的配体-受体对 | NA | 阐明肺癌脑转移的潜在机制并描述其转录组景观,以开发治疗干预措施 | 肺癌脑转移的转录组特征和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个不同的肺癌转移单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6859 | 2024-08-07 |
CDKN1A regulation on chondrogenic differentiation of human chondrocytes in osteoarthritis through single-cell and bulk sequencing analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27466
PMID:38463824
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量测序分析,验证了CDKN1A基因在骨关节炎(OA)中软骨细胞软骨形成分化的作用 | 首次结合单细胞和批量测序方法,探讨CDKN1A在OA软骨细胞软骨形成分化中的作用 | NA | 验证CDKN1A在OA软骨细胞软骨形成分化中的作用 | 人软骨细胞在骨关节炎中的软骨形成分化 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的三个RNA-seq数据集(GSE114007, GSE55235, GSE152805) | NA | NA | NA | NA |
| 6860 | 2024-08-04 |
Interrogations of single-cell RNA splicing landscapes with SCASL define new cell identities with physiological relevance
2024-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46480-9
PMID:38461306
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研究论文 | 本研究介绍了SCASL方法,以探讨单细胞RNA剪接的异质性并确定新的细胞身份 | SCASL方法解决了单细胞RNA剪接数据的偏见和稀疏覆盖问题,并提供了细胞身份分类的新方案 | 该方法的局限性尚未明确提及 | 研究单细胞RNA剪接的异质性及其与生理过程的关系 | 利用SCASL方法分析三阴性乳腺癌的潜在癌前和早期肿瘤阶段的细胞群体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA数据 | 使用之前发布的数据集作为例子 | NA | NA | NA | NA |