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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6821 | 2024-08-04 |
The integration of bulk and single-cell sequencing data revealed the function of FKBP10 in the gastric cancer microenvironment
2024-Feb-29, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-1484
PMID:38482445
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研究论文 | 本研究揭示了FKBP10在胃癌微环境中的功能 | 整合了散装和单细胞测序数据,提供了FKBP10及其共表达基因在肿瘤微环境中的影响 | 未提及具体限制 | 研究FKBP10在胃癌微环境中的表达和功能 | 胃癌细胞及其微环境中的相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | qRT-PCR、单细胞和散装测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6822 | 2024-08-07 |
Identification of fatty acid oxidation-related subtypes by integrated analysis of bulk- and single-cell transcriptome profiling in colorectal cancer
2024-Feb-29, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-833
PMID:38482228
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研究论文 | 本研究通过综合分析大量和单细胞转录组数据,识别了结直肠癌中与脂肪酸氧化(FAO)相关的亚型。 | 本研究首次揭示了结直肠癌患者中FAO水平的基因组模式,并构建了FAO相关基因评分(GFAO_Score),有助于精准筛选患者并优化临床策略。 | NA | 研究结直肠癌中脂肪酸氧化的分子生物化学特征及其相互作用机制。 | 结直肠癌患者的脂肪酸氧化水平及其相关基因。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数据来自TCGA和GEO数据库中的结直肠癌患者。 | NA | NA | NA | NA |
| 6823 | 2024-08-07 |
Disulfidptosis-related genes of prognostic signature and immune infiltration features in hepatocellular carcinoma supported by bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Feb-29, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-949
PMID:38482234
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研究论文 | 本研究通过分析肝细胞癌的癌症基因组图谱-肝细胞癌和基因表达综合数据库数据,识别与硫化物应激相关的关键基因,并探讨其在肝细胞癌预后和免疫浸润中的作用 | 首次探讨了硫化物应激相关基因在肝细胞癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | NA | 研究硫化物应激相关基因在肝细胞癌中的预后和免疫治疗作用 | 肝细胞癌患者的基因表达数据和免疫细胞浸润情况 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 使用了来自癌症基因组图谱-肝细胞癌和基因表达综合数据库的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6824 | 2024-08-07 |
Tumoral C2 Regulates the Tumor Microenvironment by Increasing the Ratio of M1/M2 Macrophages and Tertiary Lymphoid Structures to Improve Prognosis in Melanoma
2024-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16050908
PMID:38473271
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研究论文 | 本研究通过多维分析转录组数据,探讨了C2在黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境的调节机制 | 首次发现C2水平的上调与黑色素瘤的良好预后相关,并能增强M1巨噬细胞的招募和极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,需要进一步的人体临床试验验证 | 探究C2在黑色素瘤中的作用及其对免疫治疗效果的影响 | C2在黑色素瘤中的表达及其对肿瘤微环境和免疫细胞的影响 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 转录组分析、免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了C57BL/6小鼠构建的皮下肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6825 | 2024-08-07 |
Identification of bZIP Transcription Factors That Regulate the Development of Leaf Epidermal Cells in Arabidopsis thaliana by Single-Cell RNA Sequencing
2024-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25052553
PMID:38473801
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究了拟南芥叶片表皮细胞的转录组特征,并鉴定了两个bZIP转录因子基因在调控表皮细胞发育中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了拟南芥叶片表皮细胞中bZIP转录因子的表达模式及其在细胞发育中的调控作用 | 研究仅限于3天龄的拟南芥真叶,未涵盖其他发育阶段的叶片 | 探究拟南芥叶片表皮细胞发育的转录调控机制 | 拟南芥叶片表皮细胞中的bZIP转录因子 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3天龄的拟南芥真叶中的表皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6826 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Expression of Immune-Related Genes in Macrophages of Diabetic Kidney Disease
2024-Feb, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01906-2
PMID:37777674
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研究论文 | 本研究旨在识别糖尿病肾病中巨噬细胞的免疫相关基因 | 该研究首次揭示了糖尿病肾病巨噬细胞中免疫相关基因的表达,并确定了相关的标记基因 | 样本量相对较小,仅分析了三只糖尿病小鼠和三只对照小鼠 | 识别糖尿病肾病中的免疫相关基因,以探索其作为治疗靶点的潜力 | 糖尿病小鼠的肾小管细胞和对照小鼠的肾小管细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共分析了59个正常肾小管和66个糖尿病肾病样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6827 | 2024-08-07 |
NMI Functions as Immuno-regulatory Molecule in Sepsis by Regulating Multiple Signaling Pathways
2024-Feb, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01893-4
PMID:37679586
|
研究论文 | 本文探讨了NMI作为免疫调节分子在脓毒症中的作用,通过调节多种信号通路来影响炎症反应 | 首次揭示了NMI通过多种受体和信号通路在脓毒症中的作用机制 | NA | 研究NMI在脓毒症中的功能机制及其对炎症反应的影响 | NMI在脓毒症中的表达及其对免疫和炎症反应的调节作用 | NA | 脓毒症 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的脓毒症患者的中性粒细胞和单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6828 | 2024-08-07 |
Inhibiting PLA2G7 reverses the immunosuppressive function of intratumoral macrophages and augments immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2024-01-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-008094
PMID:38272562
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研究论文 | 本文研究了磷脂酶A2组VII(PLA2G7)在肝细胞癌(HCC)中的作用,并探讨了抑制PLA2G7对肿瘤内巨噬细胞免疫抑制功能的影响及其在免疫治疗中的应用 | 发现PLA2G7在肿瘤内巨噬细胞中的高表达与免疫治疗抵抗和预后不良相关,并通过药物抑制PLA2G7增强了免疫检查点阻断疗法的疗效 | NA | 旨在识别与HCC进展及免疫治疗抵抗相关的巨噬细胞亚群 | 肝细胞癌(HCC)中的肿瘤内巨噬细胞及其对免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及HCC患者的组织样本及HCC小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 6829 | 2024-08-07 |
Biomarkers of Pathologic Complete Response to Neoadjuvant Immunotherapy in Mismatch Repair-Deficient Colorectal Cancer
2024-01-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-2213
PMID:37906636
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研究论文 | 本研究旨在识别错配修复缺陷型结直肠癌患者对新辅助免疫治疗病理完全反应的生物标志物 | 本研究首次综合分析了基因组、转录组和免疫细胞密度,以及肿瘤微环境对病理完全反应的影响 | 样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 探索错配修复缺陷型结直肠癌患者对新辅助免疫治疗反应的生物标志物 | 42名接受新辅助PD-1阻断治疗的错配修复缺陷型结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 下一代测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 免疫细胞密度数据 | 42名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6830 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq and Bulk-Seq Analysis Identifies S100A9 Plasma Cells as a Potentially Effective Immunotherapeutic Agent for Multiple Myeloma
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S452062
PMID:38481477
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和批量测序技术分析多发性骨髓瘤患者,识别出S100A9浆细胞作为潜在有效的免疫治疗剂 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和批量测序技术,识别出S100A9浆细胞在多发性骨髓瘤免疫治疗中的潜在作用 | NA | 研究多发性骨髓瘤的免疫治疗策略 | 多发性骨髓瘤患者的浆细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量测序 | NA | RNA | 多发性骨髓瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6831 | 2024-08-04 |
Combinatorial expression of γ-protocadherins regulates synaptic connectivity in the mouse neocortex
2024-Mar-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89532
PMID:38470230
|
研究论文 | 本文研究了γ-protocadherins在小鼠新皮层突触连接中的作用 | 识别了组合性γ-protocadherin表达在突触连接中的关键角色 | 尚未探讨如何在其他类型神经元中应用这一发现 | 探讨突触形成过程中的连接选择机制 | 小鼠新皮层中的神经元 | 数字病理学 | NA | 5'端单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6832 | 2024-08-04 |
Differentiation is accompanied by a progressive loss in transcriptional memory
2024-Mar-12, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01846-9
PMID:38468285
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研究论文 | 本研究探讨了细胞分化过程中的转录记忆丧失与基因表达变异之间的关系 | 首次提供了关于相同细胞在分化早期阶段转录组分化速度的实验数据 | 研究主要集中在两种分化生物系统,可能限制了广泛应用性 | 研究细胞分化过程中转录记忆如何随着细胞分裂而丧失 | 人CD34+细胞和T2EC鸡初级红细胞前体 | 数字病理学 | NA | scRT-qPCR和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 相关细胞的转录组,包含一代和二代细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6833 | 2024-08-04 |
Principled and interpretable alignability testing and integration of single-cell data
2024-Mar-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313719121
PMID:38416677
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研究论文 | 该文章提出了一种可解释的单细胞数据对齐测试和集成的方法。 | 文章创新性地提出了SMAI框架,提供了严谨的统计检验以评估单细胞数据集的对齐能力,并保持数据结构的完整性。 | 现有方法缺乏对高维单细胞数据集是否可对齐的严格统计检验,并且在对齐过程中可能会严重扭曲数据。 | 研究旨在改进单细胞数据集成的方法,以提高分析的可靠性和可解释性。 | 本研究的对象是不同的单细胞数据集,包括真实和模拟的基准数据集。 | 数字病理学 | NA | 统计检验 | 谱流形对齐与推断框架 | 单细胞数据 | 多种真实和模拟的基准数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6834 | 2024-08-07 |
Adipocyte Precursor-Derived NRG1 Promotes Resistance to FGFR Inhibition in Urothelial Carcinoma
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1398
PMID:38175774
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研究论文 | 本文研究了脂肪细胞前体衍生的NRG1如何促进尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗 | 发现脂肪细胞前体通过旁分泌方式促进对erdafitinib的抵抗,并揭示了NRG1通过激活ERBB3信号传导介导的抵抗机制 | NA | 探讨尿路上皮癌对FGFR抑制剂的抵抗机制 | 尿路上皮癌及其对FGFR抑制剂的抵抗 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6835 | 2024-08-07 |
Adipose Stromal Cell-Derived Cancer-Associated Fibroblasts Suppress FGFR Inhibitor Efficacy
2024-03-04, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3904
PMID:38437636
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研究论文 | 研究揭示了脂肪组织中的前体细胞通过分泌神经调节蛋白1(NRG1)激活HER3信号通路,导致尿路上皮癌对FGFR抑制剂erdafitinib产生耐药性 | 发现NRG1介导的FGFR抑制剂耐药性可通过pertuzumab抗体进行干预 | NA | 探讨脂肪组织来源的细胞如何影响癌症治疗效果 | 脂肪组织中的前体细胞及其在癌症治疗中的作用 | NA | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6836 | 2024-08-04 |
Stromal Signals Dominate Gene Expression Signature Scores That Aim to Describe Cancer Cell-intrinsic Stemness or Mesenchymality Characteristics
2024-02-23, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0383
PMID:38349551
|
研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境对EMT相关基因表达特征分数的影响 | 揭示了肿瘤样本中细胞成分主导EMT特征分数的现象 | 未能深入探讨非癌细胞的具体影响机制 | 验证非癌细胞在肿瘤特征评分中的主导作用 | 已发表的11个与EMT相关的基因表达特征 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 分析了多个肿瘤类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6837 | 2024-08-07 |
EZH2 Inhibition Promotes Tumor Immunogenicity in Lung Squamous Cell Carcinomas
2024-02-13, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0399
PMID:38265267
|
研究论文 | 本研究探讨了抑制甲基转移酶增强子zeste 2 (EZH2)是否能增加肺鳞状细胞癌(LSCC)对免疫检查点抑制剂(ICI)的反应 | 首次证明EZH2抑制剂能增加MHC I/II类分子的表达,并通过单细胞RNA测序和免疫细胞分析揭示了肿瘤抑制表型的变化 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的作用 | 肺鳞状细胞癌(LSCC) | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 染色质免疫沉淀测序 | NA | mRNA和蛋白质 | 使用二维人类癌细胞系和三维小鼠及患者来源的类器官进行体外实验 | NA | NA | NA | NA |
| 6838 | 2024-08-07 |
Data-driven detection of age-related arbitrary monotonic changes in single-cell gene expression distributions
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.16851
PMID:38344300
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新的工作流程,用于检测单细胞表达谱中与年龄相关的任意单调变化分布 | 使用信息论量化分布差异,并通过距离矩阵进行关联分析 | NA | 理解衰老背后的机制 | 单细胞基因表达随年龄的变化 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6839 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Heterogeneity of the Immune Landscape of IDH-Wild-Type High-Grade Gliomas
2024-02-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0211
PMID:38091354
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研究论文 | 本研究构建了IDH野生型高等级胶质瘤的免疫细胞单细胞转录组景观 | 揭示了肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在胶质瘤进展中的潜在作用,并探讨了T细胞的功能失调调节因子AHR | 研究主要聚焦于IDH-WT高等级胶质瘤,可能不适用于其他类型的胶质瘤 | 全面了解IDH-WT高等级胶质瘤的免疫微环境 | IDH-WT高等级胶质瘤患者的肿瘤组织和外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | RNA数据 | 肿瘤组织和外周血单核细胞的样本来自IDH-WT高等级胶质瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6840 | 2024-08-04 |
Signaling Pathway Alterations Driven by BRCA1 and BRCA2 Germline Mutations are Sufficient to Initiate Breast Tumorigenesis by the PIK3CAH1047R Oncogene
2024-01-05, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0330
PMID:38059556
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研究论文 | 本研究生成了BRCA1和BRCA2突变携带者乳腺组织的单细胞转录组图谱,并与健康非携带者进行了比较 | 首次揭示了BRCA1和BRCA2突变对乳腺上皮细胞转录组的特定影响,并阐明了其与肿瘤发生的关系 | 本研究的样本仅限于BRCA1和BRCA2突变携带者,未能涵盖所有类型的乳腺癌变异 | 研究BRCA1和BRCA2突变在乳腺肿瘤发生中的信号通路改变 | BRCA1和BRCA2突变携带者及健康非携带者的乳腺上皮细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | BRCA1和BRCA2突变携带者的乳腺组织样本与健康非携带者样本进行比较 | NA | NA | NA | NA |