单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7706 篇文献，本页显示第 6821 - 6840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6821 | 2024-08-07 |
scRNA-seq analysis discovered suppression of immunomodulatory dependent inflammatory response in PMBCs exposed to silver nanoparticles
2024-Mar-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02364-0
PMID:38494495
|
研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析揭示了银纳米颗粒暴露下PBMCs中免疫调节依赖性炎症反应的抑制 | 本研究首次深入分析了单细胞水平上细胞与金属离子的关联以及特定的免疫反应 | 研究主要集中在体外模型，未涉及体内模型的验证 | 探究银纳米颗粒对PBMCs的免疫毒性 | 银纳米颗粒对PBMCs的免疫反应 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | PBMCs样本 |
| 6822 | 2024-08-04 |
Protocol to dissect and dissociate the mouse brainstem for single-cell RNA-seq applications
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102908
PMID:38461411
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研究论文 | 本文提供了一种用于解剖和分离小鼠脑干以进行单细胞RNA-seq应用的协议 | 提出了一种针对小脑结构（如脑干核）的单细胞转录组学样本处理的新方法 | 样本产量可能较低，协议主要针对新生小鼠的脑干组织 | 研究小鼠脑干的单细胞转录组学 | 小鼠脑干及其相应的细胞样本 | 数字病理学 | NA | SmartSeq3 cDNA文库准备 | NA | 细胞 | 新生小鼠的脑干组织样本 |
| 6823 | 2024-08-04 |
Protocol for acquiring high-quality fresh mouse lung spatial transcriptomics data
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102825
PMID:38280199
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研究论文 | 本文介绍了一种高质量新鲜小鼠肺部空间转录组数据的获取协议 | 提出了一种新的协议来克服肺泡内腔给空间转录组实验带来的挑战 | 未提及协议在不同实验条件下的适用性 | 旨在为空间转录组学的实验提供一种有效的样本获取方法 | 新鲜小鼠肺组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | cDNA数据 | NA |
| 6824 | 2024-08-04 |
An optimized protocol for isolation of murine pancreatic single cells with high yield and purity
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102836
PMID:38219150
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研究论文 | 本文介绍了一种快速分离小鼠胰腺单细胞的优化协议 | 此研究通过优化解剖顺序、酶组成和操作程序，显著提高了可存活胰腺单细胞的产率和纯度 | NA | 旨在提供一种高效的单细胞分离方法，以支持多种研究领域 | 小鼠胰腺单细胞 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞 | NA |
| 6825 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing comparison of the human metastatic prostate spine tumor microenvironment
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102805
PMID:38341849
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研究论文 | 本文介绍了一种针对前列腺癌患者脊柱肿瘤临床标本的单细胞处理协议 | 提出了一种从手术室到实验室的单细胞处理方法，以应对脊柱肿瘤组织的异质性 | 未提及具体样本的异质性对结果的潜在影响 | 旨在识别脊柱转移瘤患者的预后标志物和治疗靶点 | 涉及前列腺癌患者的脊柱肿瘤标本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床标本 | NA |
| 6826 | 2024-08-07 |
Protocol to study the inheritance and propagation of non-genetically encoded states using barcode decay lineage tracing
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102809
PMID:38180835
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研究论文 | 本文介绍了一种名为条码衰变谱系追踪结合单细胞转录组分析（BdLT-Seq）的实验方案，用于研究非遗传编码状态的继承和传播 | 提出了一种新的BdLT-Seq技术，能够在保持同质性的同时，以定向方式评估克隆进化，从而比较同源细胞谱系间的非遗传分子特征 | NA | 开发一种新的实验方案，用于研究细胞谱系中的非遗传分子特征的继承和传播 | 非遗传编码状态的继承和传播 | 生物技术 | NA | 条码衰变谱系追踪结合单细胞转录组分析（BdLT-Seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 6827 | 2024-08-07 |
Protocol for inferring epithelial-to-mesenchymal transition trajectories from single-cell RNA sequencing data using R
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102819
PMID:38183653
|
研究论文 | 本文介绍了COMET，一个用于从单细胞RNA测序数据推断上皮-间质转化（EMT）轨迹和状态间转换率的R包 | 提出了COMET R包，用于从单细胞RNA测序数据中推断EMT轨迹和状态间转换率 | NA | 研究上皮-间质转化（EMT）在癌症转移过程中的作用及其在癌症预后中的价值 | 上皮-间质转化（EMT）轨迹和状态间转换率 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 连续时间马尔可夫链 | RNA测序数据 | NA |
| 6828 | 2024-08-07 |
Protocol to analyze immune cells in the tumor microenvironment by transcriptome using machine learning
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102684
PMID:38219153
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研究论文 | 本文介绍了一种通过转录组分析肿瘤微环境中免疫细胞表型变化和浸润的协议 | 利用单细胞RNA测序数据和机器学习方法，分析免疫细胞在肿瘤微环境中的表型变化和浸润过程 | NA | 研究免疫治疗在癌症治疗中的应用 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 6829 | 2024-08-07 |
Establishing a 3D culture system for early organogenesis of monkey embryos ex vivo and single-cell transcriptome analysis of cultured embryos
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102835
PMID:38224493
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研究论文 | 本文介绍了一种用于体外培养猕猴胚胎3D培养系统的建立及单细胞转录组分析的方法 | 首次成功在体外培养猕猴胚胎长达25天，并详细描述了原肠形成和早期器官发生的关键发育事件 | NA | 旨在理解早期灵长类胚胎发生的最初4周 | 猕猴胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D培养系统 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 6830 | 2024-08-07 |
Protocol for optimized dissociation of human scalp tissue for hair follicle transcriptomics by scRNA-seq
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102848
PMID:38319786
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的人类头皮组织解离协议，用于通过scRNA-seq进行毛囊转录组学研究 | 提出了一种优化的头皮组织解离方法，以获得高质量的单细胞悬液用于scRNA-seq | NA | 研究人类毛囊的转录组学 | 人类头皮组织和毛囊 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA序列 | NA |
| 6831 | 2024-08-07 |
Protocol for functional profiling of patient-derived organoids for precision oncology
2024-Mar-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102887
PMID:38367233
|
研究论文 | 本文介绍了一种全面的协议，用于生成和培养患者来源的结直肠类器官，以及分离和扩增肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和外周血单个核细胞（PBMCs），以支持精准肿瘤学的功能性分析。 | 该协议支持多种组学分析，如RNA测序（RNA-seq）、全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和（磷酸化）蛋白质组学。 | NA | 为个性化治疗提供基于扰动癌症患者原代肿瘤细胞的精准肿瘤学策略。 | 患者来源的结直肠类器官、肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序（RNA-seq）、全外显子测序（WES）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和（磷酸化）蛋白质组学。 | NA | 细胞 | NA |
| 6832 | 2024-08-07 |
Kidins220 and Aiolos promote thymic iNKT cell development by reducing TCR signals
2024-Mar-15, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj2802
PMID:38489359
|
研究论文 | 研究探讨了Kidins220和Aiolos在调节胸腺iNKT细胞发育中的作用，通过减少TCR信号强度 | 首次揭示了Kidins220在T细胞发育中的作用，并发现Aiolos是Kidins220在iNKT细胞发育中的下游效应因子 | NA | 探究Kidins220和Aiolos在胸腺iNKT细胞发育中的作用 | 胸腺iNKT细胞和常规T细胞的发育 | 免疫学 | NA | scRNA-seq | NA | 细胞 | T细胞特异性Kidins220敲除（T-KO）小鼠 |
| 6833 | 2024-08-04 |
JAK/STAT3 represents a therapeutic target for colorectal cancer patients with stromal-rich tumors
2024-Mar-01, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02958-4
PMID:38424636
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研究论文 | 本研究探讨了抑制JAK/STAT3在不同结直肠癌（CRC）模型中的有效性，并建立了其预后意义。 | 揭示了JAK/STAT3在高间质侵袭性结直肠癌患者中的预后价值，指出抑制其信号通路为有前景的治疗策略。 | 研究中可能存在样本历程偏倚，并且需要在更大规模的人群中验证结果。 | 探讨JAK/STAT3信号传导在结直肠癌中的作用及其抑制对治疗的潜力。 | 研究对象包括结直肠癌细胞系、小鼠模型类器官和患者导向类器官。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序、免疫组化、NanoString GeoMx®空间转录组学 | NA | RNA | 三个独立的CRC患者队列和TransSCOT临床试验队列 |
| 6834 | 2024-08-07 |
Integrative analysis of neuroblastoma by single-cell RNA sequencing identifies the NECTIN2-TIGIT axis as a target for immunotherapy
2024-02-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.12.008
PMID:38181797
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析神经母细胞瘤中的免疫调节相互作用，识别出NECTIN2-TIGIT轴作为免疫治疗的新靶点 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经母细胞瘤中的免疫调节网络，并确定了NECTIN2-TIGIT轴作为关键的免疫检查点 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术，识别和优化神经母细胞瘤的免疫治疗策略 | 高风险神经母细胞瘤患者及其肿瘤中的免疫细胞 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 24个肿瘤样本（包括10个化疗前和14个化疗后，其中有5对匹配样本） |
| 6835 | 2024-08-04 |
Deciphering the heterogeneity of neutrophil cells within circulation and the lung cancer microenvironment pre- and post-operation
2024-02-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09850-z
PMID:38319415
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研究论文 | 该文章探讨了手术前后肺癌微环境中中性粒细胞的异质性 | 提出了一种新的计算方法来评估中性粒细胞亚群的特异性，并开发了多个具有临床应用潜力的基因面板 | 中性粒细胞亚群的识别标准尚未明确 | 研究肺癌微环境中中性粒细胞的特征以及其在疾病状态下的变化 | 收集非小细胞肺癌患者的肿瘤和旁癌组织及术前术后的血液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 四个与NSCLC相关的样本 |
| 6836 | 2024-08-07 |
Leukaemia exposure alters the transcriptional profile and function of BCR::ABL1 negative macrophages in the bone marrow niche
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45471-0
PMID:38316788
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研究论文 | 研究慢性髓系白血病（CML）对骨髓微环境中BCR::ABL1阴性巨噬细胞转录组和功能的影响 | 揭示了CML骨髓微环境中存在的独特亚群未成熟巨噬细胞，并发现CML暴露的巨噬细胞通过减少表面标记CD36的表达，显著降低了凋亡细胞的清除能力 | NA | 探讨CML对骨髓微环境中旁观巨噬细胞的影响 | CML小鼠模型和人类骨髓来源的巨噬细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 6837 | 2024-08-04 |
Strategies for dissecting the complexity of neurodevelopmental disorders
2024-02, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2023.10.009
PMID:37949722
|
综述 | 本文回顾了复杂神经发育障碍的解析策略 | 强调了单细胞CRISPR筛选技术在基因组研究中的高效性和准确性 | 未提及具体针对某一神经发育障碍的应用 | 探讨神经发育障碍的复杂性并提出研究策略 | 包括模型生物、诱导性多能干细胞和单细胞测序技术 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 高通量测序, 单细胞测序, CRISPR | NA | NA | NA |
| 6838 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal a transcriptomic atlas of adult human spinal cord
2024-Jan-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92046
PMID:38289829
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研究论文 | 该文章揭示了成人人体脊髓的转录组图谱，分类了脊髓神经元并分析了其空间分布 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组技术对成人脊髓神经元进行详细分类和空间分布研究 | 成人脊髓的细胞异质性的分子证据相对有限 | 研究成人脊髓神经元的类型和功能异质性 | 来自九名人类供体的脊髓神经元 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单核RNA测序和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 来自九名人类供体的样本 |
| 6839 | 2024-08-04 |
Gene regulatory patterning codes in early cell fate specification of the C. elegans embryo
2024-Jan-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87099
PMID:38284404
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研究论文 | 研究揭示了在秀丽隐杆线虫胚胎发育早期，细胞命运指定中的基因调控模式 | 提出了独特的基因调控编码，展示了不同谱系的基因表达模块和细胞位置的编码 | 研究未能考虑细胞间的交互作用对细胞命运指定的影响 | 探讨细胞命运指定过程中基因表达模式的形成 | 聚焦于秀丽隐杆线虫胚胎细胞早期的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 分析了从1细胞到102细胞阶段的119种胚胎细胞状态 |
| 6840 | 2024-08-07 |
Dandelion uses the single-cell adaptive immune receptor repertoire to explore lymphocyte developmental origins
2024-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01734-7
PMID:37055623
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研究论文 | 本文介绍了Dandelion计算流程，用于单细胞适应性免疫受体（scVDJ-seq）分析，以探索淋巴细胞发育起源 | Dandelion能够应用标准V(D)J分析工作流程于单细胞数据集，提供改进的V(D)J contig注释和非生产性及部分剪接contig的识别 | NA | 研究淋巴细胞生物学，特别是人类胸腺发育轨迹和细胞系承诺的调控因子 | 单细胞基因表达和适应性免疫受体序列数据 | 生物信息学 | NA | scVDJ-seq | NA | 基因表达数据 | NA |