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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6801 | 2024-08-04 |
Integrated analysis reveals crosstalk between pyroptosis and immune regulation in renal fibrosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1247382
PMID:38343546
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研究论文 | 这项研究探讨了程序性焦亡在肾纤维化中的免疫微环境调节中的潜在作用 | 本研究揭示了程序性焦亡与免疫调节之间的交叉作用,并识别了五种中心调节因子作为肾纤维化的生物标志物 | 本研究的局限性在于使用的是动物模型,可能无法完全反映人类肾纤维化的复杂性 | 研究肾纤维化中程序性焦亡与免疫微环境之间的关系 | 研究对象为肾纤维化患者的样本和小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包括肾纤维化和正常肾样本的27个程序性焦亡相关调节因子的评估 | NA | NA | NA | NA |
| 6802 | 2024-08-07 |
"The Good, the Bad, and the Ugly" - About Diverse Phenotypes of Hepatic Stellate Cells in the Liver
2024, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.01.002
PMID:38216053
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research paper | 本文探讨了肝星状细胞(HSCs)及其激活衍生物在慢性肝损伤进展中的多样性表型及其作用 | 利用遗传谱系追踪模型和单细胞转录组及蛋白质组分析技术,揭示了HSC和MF群体在健康状态及慢性肝损伤各阶段组织变形中的隐藏异质性 | NA | 识别HSC/MF轴上的不同表型,为针对特定MF表型作为慢性肝损伤潜在治疗方法奠定基础 | 肝星状细胞(HSCs)及其激活衍生物,即肌成纤维细胞(MFs) | NA | 肝病 | 遗传谱系追踪模型,单细胞转录组及蛋白质组分析 | NA | 转录组,蛋白质组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6803 | 2024-08-07 |
Modeling gene expression cascades during cell state transitions
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109386
PMID:38500834
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据和贝叶斯推理方法,对细胞状态转换过程中的基因表达动态变化进行建模 | 提出了一种贝叶斯推理方法来推断伪时间序列中细胞的转录动态,从而能够对基因表达的时序差异和调控基因相互作用进行分析 | NA | 研究细胞在分化或对外界刺激响应过程中的基因表达动态变化 | 小鼠胚胎前脑和胰腺样本的单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 贝叶斯推理模型 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎前脑和胰腺样本的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6804 | 2024-08-07 |
Colorectal Cancer-Associated Myofibroblasts Exhibit Enhanced Angiogenin Expression and Signaling via the PLXNB2 Receptor
2024-Apr, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2023.12.036
PMID:38295715
|
研究论文 | 本文研究了结直肠癌相关肌成纤维细胞中血管生成素表达及通过PLXNB2受体的信号传导 | 首次在人类结直肠癌组织中发现肌成纤维细胞中血管生成素和PLXNB2受体表达上调,并探讨了其在肿瘤-基质细胞通讯中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,未涉及临床样本的直接验证 | 探讨血管生成素在人类结直肠癌中的作用及其与肌成纤维细胞的通讯机制 | 结直肠癌组织及其周围的肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 配对的正常人类结肠和结直肠癌组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6805 | 2024-08-07 |
IDO1 Inhibition Promotes Activation of Tumor-intrinsic STAT3 Pathway and Induces Adverse Tumor-protective Effects
2024-Apr-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300545
PMID:38391297
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨IDO1抑制剂在肿瘤微环境中的作用及其对肿瘤细胞的影响 | 发现IDO1抑制剂不仅激活肿瘤内免疫细胞,还促进M2巨噬细胞的浸润和IL-6的分泌,进而激活JAK2/STAT3信号通路,导致肿瘤细胞在高度免疫活性下仍能存活 | 研究主要集中在小鼠模型上,尚未在人类临床试验中验证这些发现 | 探究IDO1抑制剂在癌症治疗中的临床失败原因及其对肿瘤微环境的影响 | IDO1抑制剂对肿瘤内免疫细胞和肿瘤细胞的影响 | 癌症治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠结肠癌细胞CT26移植于BALB/C小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 6806 | 2024-08-04 |
Identification of macrophage-related genes correlated with prognosis and immunotherapy efficacy in non-small cell lung cancer
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27170
PMID:38500993
|
研究论文 | 本文研究了与非小细胞肺癌预后及免疫疗效相关的巨噬细胞相关基因 | 本研究首次识别出与非小细胞肺癌患者预后和免疫疗效相关的特定巨噬细胞相关基因 | 缺乏临床验证和更大规模的样本确认 | 探索能预测非小细胞肺癌预后和药物有效性的基因标志物 | 非小细胞肺癌及其周围组织中的细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6807 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing unveils the hidden powers of zebrafish kidney for generating both hematopoiesis and adaptive antiviral immunity
2024-Mar-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92424
PMID:38497789
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了斑马鱼肾脏在造血和适应性抗病毒免疫中的双重功能 | 首次全面展示了斑马鱼肾脏中59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型,并揭示了其在抗病毒免疫中的多样性功能 | NA | 阐明斑马鱼肾脏在造血和免疫系统中的功能 | 斑马鱼肾脏中的造血干细胞/祖细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 59种造血干细胞/祖细胞和免疫细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 6808 | 2024-08-07 |
scRNA-seq analysis discovered suppression of immunomodulatory dependent inflammatory response in PMBCs exposed to silver nanoparticles
2024-Mar-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02364-0
PMID:38494495
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析揭示了银纳米颗粒暴露下PBMCs中免疫调节依赖性炎症反应的抑制 | 本研究首次深入分析了单细胞水平上细胞与金属离子的关联以及特定的免疫反应 | 研究主要集中在体外模型,未涉及体内模型的验证 | 探究银纳米颗粒对PBMCs的免疫毒性 | 银纳米颗粒对PBMCs的免疫反应 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | PBMCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6809 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics and single-nucleus RNA sequencing reveal a transcriptomic atlas of adult human spinal cord
2024-Jan-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92046
PMID:38289829
|
研究论文 | 该文章揭示了成人人体脊髓的转录组图谱,分类了脊髓神经元并分析了其空间分布 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组技术对成人脊髓神经元进行详细分类和空间分布研究 | 成人脊髓的细胞异质性的分子证据相对有限 | 研究成人脊髓神经元的类型和功能异质性 | 来自九名人类供体的脊髓神经元 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单核RNA测序和空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 来自九名人类供体的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6810 | 2024-08-07 |
Opportunities and tradeoffs in single-cell transcriptomic technologies
2024-01, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2023.10.003
PMID:37953195
|
review | 本文综述了单细胞转录组技术的最新进展及其优缺点 | 介绍了长读长测序方法在单细胞转录组分析中的应用,突破了以往全转录组表征的障碍 | 单细胞转录组分析中仍存在细胞数量与全长转录本覆盖度之间的权衡问题 | 全面概述单细胞转录组分析的可用选项,并强调每种方法的关键优缺点 | 单细胞转录组技术及其应用 | NA | NA | 长读长测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6811 | 2024-08-04 |
Label-free single-cell analysis in microdroplets using a light-scattering-based optofluidic chip
2024-Jun-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116148
PMID:38428071
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研究论文 | 本研究提出了一种新颖的基于光散射的微滴单细胞分析方法 | 采用光散射技术实现对微滴中单细胞的无标签检测和特征分析 | 未提及具体实验数据和临床应用的验证 | 开发一种高通量、无标签的微滴单细胞分析平台 | 主要研究微滴中单细胞的光散射特性 | 数字病理 | NA | 光散射 | NA | NA | 研究中涉及到的微滴单细胞及其人工合成的胶珠 | NA | NA | NA | NA |
| 6812 | 2024-08-04 |
Identity and nature of neural stem cells in the adult human subventricular zone
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109342
PMID:38495819
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研究论文 | 本文探讨了成人人体旁脑室区的神经干细胞的存在及其特征 | 本研究首次通过单细胞转录组学揭示了成人旁脑室区存在多种神经干细胞状态并提供了单细胞细胞图谱 | 研究主要基于新鲜的神经外科样本,可能限制了样本的代表性 | 旨在确认成人人体旁脑室区神经干细胞的存在和特性 | 成人旁脑室区的神经干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞转录组数据 | 新鲜的神经外科样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6813 | 2024-08-07 |
odd skipped-related 2 as a novel mark for labeling the proximal convoluted tubule within the zebrafish kidney
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27582
PMID:38496848
|
研究论文 | 本文通过分析成年斑马鱼肾脏的单细胞转录组数据,发现odd-skipped-related 2(Osr2)在近端卷曲小管(PCT)中的表达,并生成了一种表达增强绿色荧光蛋白(EGFP)的转基因斑马鱼系,用于研究PCT的形态发生。 | 首次识别并利用Osr2作为标记物来标记斑马鱼肾脏中的PCT,并成功生成了一种转基因斑马鱼系,该系可以用于PCT的遗传和化学分析。 | 文章未明确提及研究的具体局限性。 | 研究近端卷曲小管(PCT)的形态发生及其在斑马鱼肾脏中的功能。 | 斑马鱼肾脏中的近端卷曲小管(PCT)。 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 成年斑马鱼肾脏的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6814 | 2024-08-07 |
Temporospatial hierarchy and allele-specific expression of zygotic genome activation revealed by distant interspecific urochordate hybrids
2024-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46780-0
PMID:38493164
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研究论文 | 本文通过研究两种深度分化(1.2亿年前)的栉水母物种的杂交后代,揭示了合子基因组激活(ZGA)的时空层次结构和等位基因特异性表达 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术,揭示了ZGA的两个协调波,分别代表早期发育和管家基因的重新激活,并展示了空间异质性和细胞命运的显著相关性 | NA | 研究合子基因组激活(ZGA)的机制及其在早期胚胎发生中的作用 | 两种深度分化的栉水母物种的杂交后代 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6815 | 2024-08-04 |
Holistic exploration of CHGA and hsa-miR-137 in colorectal cancer via multi-omic data Integration
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27046
PMID:38495181
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研究论文 | 本研究通过多组学数据整合,探索了与结直肠癌相关的mRNA-miRNA网络 | 提出了hsa-miR-137和Chromogranin A作为有前景的结直肠癌生物标志物 | 尽管蛋白质组分析未能直接相关,但多方面的方法提供了对结直肠癌复杂调控机制的全面理解 | 揭示与结直肠癌发病机制有关的复杂mRNA-miRNA网络 | 结直肠癌相关转录组和关键基因,其中特别关注Chromogranin A和hsa-miR-137 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微阵列、Bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | WGCNA | 转录组数据 | 多种数据集的综合,具体样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6816 | 2024-08-07 |
Identification of immune characteristic biomarkers and therapeutic targets in cuproptosis for sepsis by integrated bioinformatics analysis and single-cell RNA sequencing analysis
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27379
PMID:38495196
|
研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和单细胞RNA测序分析,识别了铜依赖性细胞死亡(cuproptosis)在脓毒症中的免疫特征生物标志物和治疗靶点 | 首次揭示了cuproptosis在脓毒症免疫特征中的作用,并识别了关键的差异表达cuproptosis相关基因(DECuGs)和潜在的新药 | 研究依赖于已有的公开数据集,未涉及临床试验验证 | 探索cuproptosis在脓毒症中的免疫特征和潜在的治疗靶点 | 脓毒症患者的免疫细胞和cuproptosis相关基因 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 两个脓毒症数据集(GSE9960和GSE134347),具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6817 | 2024-08-07 |
Tumor-infiltrating CD8+ sub-populations in primary and recurrent glioblastoma: An in-silico study
2024-Mar-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27329
PMID:38495199
|
研究论文 | 研究分析了原发性和复发性胶质母细胞瘤中肿瘤浸润性CD8+ T细胞的亚群,并探讨了其在肿瘤微环境中的作用 | 提供了原发性和复发性胶质母细胞瘤中CD8+ TILs亚群的详细图谱,为未来的精准免疫治疗提供了概念验证 | NA | 研究CD8+ TILs亚群在原发性和复发性胶质母细胞瘤中的分布及其在肿瘤微环境中的作用 | 原发性和复发性胶质母细胞瘤中的肿瘤浸润性CD8+ T细胞亚群 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6818 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal the heterogeneity and microenvironment of vestibular schwannoma
2024-03-04, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noad201
PMID:37862593
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了前庭神经鞘瘤的异质性和微环境 | 首次在单细胞水平上揭示了前庭神经鞘瘤的微环境,并发现了与快速生长相关的特定细胞亚群 | 研究仅限于少数样本,可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 探究前庭神经鞘瘤的细胞异质性和微环境,以增进对该疾病临床表型的理解 | 前庭神经鞘瘤及其正常神经样本 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 7个前庭神经鞘瘤样本和2个正常神经样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6819 | 2024-08-07 |
5 signature genes revealed by single-cell profiling identified unique immune subtypes affecting the prognosis of ovarian cancer
2024-Mar, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202403_35618
PMID:38497886
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据识别出五个与卵巢癌预后相关的标志性基因,并据此将患者分为五个亚型,分析了各亚型的临床预后和治疗反应 | 首次通过单细胞测序数据识别出五个影响卵巢癌预后的标志性基因,并据此进行患者亚型分类,为临床决策提供指导 | NA | 旨在识别预测卵巢癌临床预后的生物标志物,特别是针对免疫治疗和化疗的预后分组 | 卵巢癌患者的基因标志物和预后亚型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 基因表达数据 | TCGA-OV数据库中的患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6820 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell transcriptomics with cellular phenotypes: cell morphology, Ca2+ imaging and electrophysiology
2024-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-023-01174-2
PMID:38495444
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综述 | 本文回顾了单细胞转录组学与细胞表型结合的最新技术进展 | 提出了一系列新的方法将scRNAseq与生物物理测量结合,为转录组数据与细胞功能之间的联系提供了生理学见解 | 文章中未明确提及具体的技术限制或挑战 | 旨在探讨如何通过结合单细胞转录组学和细胞表型来理解细胞状态及其功能 | 研究对象包括细胞形态、钙信号和电生理学等细胞功能指标 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | 转录组数据与生物物理测量数据 | 强调在具有可兴奋细胞类型的组织中的应用,例如大脑、胰岛和视网膜,但具体样本数未说明 | NA | NA | NA | NA |