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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6781 | 2024-08-04 |
Development of a novel lncRNA-derived immune gene score using machine learning-based ensembles for predicting the survival of HCC
2024-Feb-09, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05608-6
PMID:38334792
|
研究论文 | 本文开发了一种新型的lncRNA衍生免疫基因评分模型,用于预测肝细胞癌(HCC)患者的生存率 | 提出了一种基于机器学习的集成方法来建立lncRNA和免疫基因评分模型 | 研究中使用的单细胞测序数据可能无法完全代表患者体内的真实免疫环境 | 开发一个准确的预测模型以评估肝细胞癌患者的生存期 | 肝细胞癌患者的mRNA和lncRNA表达谱 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | mRNA和lncRNA表达数据 | 使用了来自TCGA、GEO和ICGC的数据集进行模型验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6782 | 2024-08-04 |
Identification and validation of Golgi apparatus-related signature for predicting prognosis and immunotherapy response in breast cancer
2024-Feb-01, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-05612-w
PMID:38300336
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研究论文 | 本研究旨在探讨高尔基体相关基因在乳腺癌预后和免疫治疗反应评估中的预测价值 | 识别并验证了一种由394个高尔基体相关基因组成的预后风险特征,可以有效区分乳腺癌患者的高风险和低风险组 | 未提及具体的研究局限性 | 研究乳腺癌中高尔基体相关基因的预测价值 | 乳腺癌患者的数据和样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qPCR和单细胞测序 | Cox回归分析 | 转录组数据和临床数据 | 涉及394个与乳腺癌预后显著相关的高尔基体相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 6783 | 2024-08-07 |
Chronic active Epstein-Barr virus disease originates from infected hematopoietic stem cells
2024-01-04, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021074
PMID:37824804
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研究论文 | 本研究通过多种检测方法,包括定量聚合酶链反应、PrimeFlow和单细胞RNA测序,分析了慢性活动性EB病毒病(CAEBV)患者的骨髓和外周血细胞,揭示了CAEBV疾病的起源及其对免疫系统的影响 | 首次通过单细胞RNA测序等技术证实CAEBV疾病起源于感染的造血干细胞,并展示了EBV感染对免疫系统的具体影响 | 研究样本量较小,仅包括5名CAEBV患者和少数对照组,可能影响结果的普遍性 | 探究慢性活动性EB病毒病的病因及其对免疫系统的影响 | 慢性活动性EB病毒病患者的骨髓和外周血细胞 | NA | 慢性活动性EB病毒病 | 定量聚合酶链反应、PrimeFlow、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名CAEBV患者、1名EBV相关噬血细胞性淋巴组织细胞增生症患者和2名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 6784 | 2024-08-04 |
CCNA2 and NEK2 regulate glioblastoma progression by targeting the cell cycle
2024-May, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14339
PMID:38516683
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研究论文 | 该研究旨在探究CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤中的分子机制 | 首次系统阐明CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤进展中的作用,并建立了生存预测的诺模图 | 目前研究中并未明确说明样本量和不同亚类型的详细数据 | 探讨CCNA2和NEK2在胶质母细胞瘤中的特定功能和分子机制 | 胶质母细胞瘤中CCNA2和NEK2的表达及其预后 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序、西方印迹法和免疫组化染色 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6785 | 2024-08-04 |
STEP: profiling cellular-specific targets and pathways of bioactive small molecules in tissues via integrating single-cell transcriptomics and chemoproteomics
2024-Mar-20, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d3sc04826h
PMID:38516082
|
研究论文 | 本文提出了一种新颖的多组学集成管道STEP,能够在单细胞分辨率下剖析哺乳动物组织中的蛋白质靶标。 | STEP是一种新策略,首次实现了细胞特异性靶标和功能过程的全球剖析,提供了前所未有的分辨率。 | 未提及具体的局限性 | 本研究旨在提升对生物活性小分子的药物作用机制的理解。 | 研究对象为哺乳动物组织中的生物活性小分子及其细胞靶标。 | 化学生物学 | NA | 单细胞转录组学与化学蛋白组学的集成 | NA | 蛋白质靶标数据 | 采用了经典药物(如阿司匹林、马兜铃酸和顺铂)作为示例 | NA | NA | NA | NA |
| 6786 | 2024-08-04 |
Machine learning combined with single-cell analysis reveals predictive capacity and immunotherapy response of T cell exhaustion-associated lncRNAs in uterine corpus endometrial carcinoma
2024-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111077
PMID:38311301
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研究论文 | 本研究建立了与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 在子宫体内膜癌中的预测模型并研究了其免疫特征 | 首次探讨了与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 在子宫体内膜癌中的作用,并建立了相关的预测模型 | 研究主要基于公共数据库的数据,可能存在信息的偏倚和不足 | 建立与子宫体内膜癌 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA 的预测模型 | 与 T 细胞耗竭相关的长链非编码 RNA | 数字病理学 | 子宫体内膜癌 | 转录组和单细胞测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 使用癌症基因组图谱和基因表达综合数据库中的数据,具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6787 | 2024-08-07 |
Multi-omics reveals the switch role of abnormal methylation in the regulation of decidual macrophages function in recurrent spontaneous abortion
2024-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111071
PMID:38295895
|
研究论文 | 本文通过整合转录组学、DNA甲基化组学和单细胞RNA测序,探讨了DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系 | 首次系统地描绘了异常DNA甲基化在调控蜕膜巨噬细胞功能中的作用,为复发性自然流产的发生机制提供了新的见解 | NA | 阐明DNA甲基化与蜕膜细胞在复发性自然流产中的调控关系 | 复发性自然流产中的DNA甲基化和蜕膜细胞功能 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 转录组学、DNA甲基化组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、DNA甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 涉及22个低甲基化的CpG位点和16个关键通路 | NA | NA | NA | NA |
| 6788 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the MIF-ACKR3 receptor-ligand interaction between iCAFs and tumor cells in esophageal squamous cell carcinoma
2024-05, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111093
PMID:38336189
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了食管鳞状细胞癌(ESCC)样本,揭示了肿瘤微环境中iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3受体-配体相互作用。 | 本研究首次在ESCC中发现并验证了iCAFs与肿瘤细胞之间的MIF-ACKR3相互作用,并揭示了其在肿瘤细胞迁移和侵袭中的作用。 | 研究主要基于GEO数据库中的ESCC样本进行单细胞RNA测序分析,可能存在样本选择偏倚。 | 深入理解食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境异质性,并识别新的治疗靶点。 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)的肿瘤微环境及其细胞间的相互作用。 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 31,283个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6789 | 2024-08-07 |
Histone deacetylase 6 suppression of renal tubular epithelial cell promotes interstitial mineral deposition via alpha-tubulin acetylation
2024-04, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111057
PMID:38242268
|
研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶6(HDAC6)在肾小管上皮细胞中的抑制作用及其通过α-微管蛋白乙酰化促进间质矿物沉积的机制 | 研究发现HDAC6的抑制加剧了MDCK细胞中的矿物沉积,而其过表达则减轻了这一现象,表明HDAC6在调节肾小管上皮细胞矿物沉积中起关键作用 | 研究未观察到与矿物沉积增加相关的成骨相关蛋白表达增加,且单细胞RNA测序结果显示上皮细胞的钙化活性较低,提示成骨性转分化可能并未实际发生 | 探讨HDAC6在肾小管上皮细胞中的作用及其对间质矿物沉积的影响 | 肾小管上皮细胞、高草酸尿大鼠的肾脏组织、体外培养的MDCK细胞及NRK49F细胞 | NA | 肾结石 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肾乳头样本的单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 6790 | 2024-08-04 |
Single cell atlas of Xenoturbella bocki highlights limited cell-type complexity
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45956-y
PMID:38503762
|
研究论文 | 这篇文章展示了对海洋生物Xenoturbella bocki进行单细胞RNA测序的研究,突出了其细胞类型的复杂性有限。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Xenacoelomorpha的细胞类型补充,提供了与其他动物的比较。 | 研究主要集中在单一物种上,可能无法全面代表整个Xenacoelomorpha门的细胞类型多样性。 | 探索Xenacoelomorpha中的细胞类型及其与其他生物的关系,理解动物细胞类型演化。 | 研究对象为海洋生物Xenoturbella bocki及其细胞类型。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及Xenoturbella bocki的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6791 | 2024-08-07 |
Long-term effects of Omicron BA.2 breakthrough infection on immunity-metabolism balance: a 6-month prospective study
2024-Mar-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46692-z
PMID:38503738
|
研究论文 | 本研究追踪了轻度BA.2突破性感染康复者在六个月内的免疫代谢平衡情况 | 首次详细探讨了Omicron BA.2突破性感染后长期免疫代谢失衡的机制和病理特征 | 研究仅限于轻度BA.2突破性感染康复者,可能无法完全代表所有感染情况 | 评估COVID-19长期影响及Omicron突破性感染后的免疫恢复情况,为理解疾病和新一代疫苗管理提供依据 | 轻度BA.2突破性感染康复者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 血液检测数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6792 | 2024-08-04 |
Region-specific cellular and molecular basis of liver regeneration after acute pericentral injury
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.013
PMID:38402618
|
研究论文 | 本研究探讨了急性中心周围损伤后肝脏再生的细胞和分子基础 | 使用Cyp2e1-DreER追踪肝脏再生,并揭示了mTOR/4E-BP1轴和乳酸脱氢酶A在中心周围再生中的重要作用 | 研究主要集中在特定的损伤模式上,可能不适用于所有类型的肝脏损伤 | 研究急性中心周围损伤后肝脏的再生机制 | 重点关注中心周围肝细胞及其再生反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫染色、体内功能测定 | NA | NA | 使用Cyp2e1-DreER命运追踪系统进行的实验,样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 6793 | 2024-08-07 |
Canonical Wnt signaling directs the generation of functional human PSC-derived atrioventricular canal cardiomyocytes in bioprinted cardiac tissues
2024-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.01.008
PMID:38366588
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析和3D生物打印技术,发现阶段特异性激活的规范Wnt信号通路可以生成功能性的人类多能干细胞衍生的房室管(AVC)心肌细胞 | 首次发现规范Wnt信号通路在体外调控AVC心肌细胞分化的关键作用,并提供了一种用于功能性人心脏生物制造的关键细胞来源 | NA | 探索生成功能性3D生物打印人类心脏的方法 | 房室管(AVC)心肌细胞 | 生物工程 | NA | 单细胞RNA测序分析,3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6794 | 2024-08-07 |
A prognostic model based on Scissor+ cancer associated fibroblasts identified from bulk and single cell RNA sequencing data in head and neck squamous cell carcinoma
2024-02, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2023.110984
PMID:38029947
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出与头颈鳞状细胞癌(HNSCC)不良预后相关的成纤维细胞亚群,并构建了一个预测HNSCC患者生存概率的风险模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据,识别出与HNSCC不良预后相关的成纤维细胞亚群,并构建了预测模型 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的准确性和实用性 | 识别与头颈鳞状细胞癌预后相关的成纤维细胞亚群,并构建预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者的成纤维细胞亚群及其预后相关基因 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用The Cancer Genome Atlas (TCGA)和Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6795 | 2024-08-04 |
Comparative and integrative single cell analysis reveals new insights into the transcriptional immaturity of stem cell-derived β cells
2024-Jan-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10013-x
PMID:38267908
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研究论文 | 文章探讨了干细胞衍生的β细胞(SC-β细胞)的转录身份,尤其是与原代胎儿和成年β细胞的关系 | 揭示了SC-β细胞具有独特的转录特征,特别是持续表达和激活前体和神经偏向基因网络 | 尚未明确SC-β细胞与原代β细胞的关系,需要进一步研究 | 研究干细胞衍生β细胞的转录身份及其发育过程中神经转录网络的作用 | 研究对象为干细胞衍生的β细胞、胎儿β细胞和成年β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 转录数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6796 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics systematically discloses the immune-inflammatory responses of peripheral blood mononuclear cells for diabetic nephropathy
2024-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.06.007
PMID:38510479
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6797 | 2024-08-04 |
Exogenous IL-2 delays memory precursors generation and is essential for enhancing memory cells effector functions
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109411
PMID:38510150
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研究论文 | 本研究探讨了外源IL-2信号对记忆前体细胞分化的影响 | 本研究首次揭示外源IL-2延迟记忆前体细胞的生成,并增强了记忆细胞的效应功能 | 本研究的局限性在于未探讨其他细胞因子对记忆前体细胞生成的共同作用 | 研究外源IL-2对CD8 T细胞记忆分化的影响 | CD8 T细胞及其在病毒感染小鼠中的记忆分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 病毒感染小鼠中的转移细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6798 | 2024-08-04 |
scGREAT: Transformer-based deep-language model for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics
2024-Apr-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109352
PMID:38510148
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研究论文 | 提出了一种名为scGREAT的框架,用于从单细胞转录组数据推断基因调控网络。 | scGREAT使用基因嵌入和Transformer来优化推断过程,相较于现有方法具有更好的性能。 | 尽管scGREAT表现良好,但仍可能受到计算开销的限制。 | 研究单细胞转录组数据中的基因调控网络推断。 | 单细胞测序数据和基因调控信息。 | 计算机视觉 | NA | scRNA-seq | Transformer | 表达数据,基因文本信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6799 | 2024-08-07 |
Aortic Cellular Heterogeneity in Health and Disease: Novel Insights Into Aortic Diseases From Single-Cell RNA Transcriptomic Data Sets
2024-Apr, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示健康与疾病状态下主动脉细胞异质性方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了主动脉细胞类型在健康与疾病状态下的异质性及其相关生物过程 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何增强我们对主动脉疾病细胞驱动因素的理解 | 主动脉疾病如动脉粥样硬化、主动脉瘤和主动脉硬化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6800 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptome atlas of Lueyang black-bone chicken skin
2024-Apr, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2024.103513
PMID:38350389
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了黑羽鸡和白羽鸡皮肤细胞的转录组特征 | 首次报道了鸡皮肤细胞的组成和转录组特征,并鉴定了与色素颗粒捕获和沉积相关的特定细胞亚群 | NA | 揭示鸡皮肤细胞的转录组特征,为家禽育种提供重要信息 | 黑羽鸡和白羽鸡的皮肤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 黑羽鸡和白羽鸡的皮肤细胞样本 | NA | NA | NA | NA |