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当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-06 |
Lysosomal dysfunction-derived autophagy impairment of gingival epithelial cells in diabetes-associated periodontitis with altered protein acetylation
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111273
PMID:38950874
|
研究论文 | 本研究揭示了糖尿病相关牙周炎中牙龈上皮细胞溶酶体功能障碍通过改变蛋白质乙酰化导致自噬受损的分子机制 | 首次发现高糖环境下溶酶体功能障碍通过改变自噬-溶酶体通路相关蛋白的乙酰化水平导致自噬流阻塞 | 研究主要基于体外细胞实验，需要更多体内实验验证 | 探究糖尿病相关牙周炎中牙龈上皮细胞过度炎症反应的分子机制 | 人牙龈上皮细胞和临床牙龈上皮组织 | 分子生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,组织图像 | 临床牙龈上皮组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 662 | 2025-10-06 |
Machine Learning Uncovers Vascular Endothelial Cell Identity Genes by Expression Regulation Features in Single Cells
2024-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.27.609808
PMID:39253493
|
研究论文 | 提出了一种名为SCIG的机器学习方法，用于在单细胞水平识别细胞身份基因 | 利用细胞身份基因独特的遗传序列特征（如顺式调控元件富集模式）和单细胞RNA-seq数据，无需与其他细胞比较即可识别细胞身份基因 | NA | 识别血管内皮细胞的身份基因，理解细胞分化和发育机制 | 人类内皮细胞图谱中的血管内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据，遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 663 | 2025-10-06 |
Dysregulation of phosphoenolpyruvate carboxykinase in cancers: A comprehensive analysis
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111198
PMID:38697449
|
研究论文 | 通过多组学分析探讨磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(PEPCK)在泛癌中的表达失调及其临床意义 | 首次在33种癌症类型中系统分析PEPCK两个亚型(PCK1和PCK2)的表达模式及其与临床预后的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于胶质母细胞瘤 | 阐明PEPCK在癌症发生发展中的作用机制及其临床价值 | 33种癌症类型的患者样本和胶质母细胞瘤细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析(重点关注胶质母细胞瘤) | 生物信息学分析、单细胞测序、体外实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据、突变数据 | TCGA数据库中33种癌症类型的患者样本 | NA | 单细胞测序、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 664 | 2025-10-06 |
Blocking the MIR155HG/miR-155 axis reduces CTGF-induced inflammatory cytokine production and α-SMA expression via upregulating AZGP1 in hypertrophic scar fibroblasts
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111202
PMID:38729323
|
研究论文 | 本研究揭示了MIR155HG/miR-155/AZGP1轴在调控增生性瘢痕成纤维细胞中炎症因子产生和α-SMA表达的作用机制 | 首次发现CTGF通过磷酸化STAT3结合MIR155HG启动子刺激其表达，并阐明MIR155HG通过miR-155-5p/-3p靶向AZGP1调控瘢痕形成的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型，需要进一步体内实验验证 | 探究MIR155HG在增生性瘢痕纤维化中的作用机制 | 增生性瘢痕成纤维细胞(HSFBs) | 分子生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, western blotting, ELISA, 双荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 临床HS和正常皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2025-10-06 |
CXCR4-mediated neutrophil dynamics in periodontitis
2024-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111212
PMID:38719020
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探讨CXCR4在牙周炎中调控中性粒细胞动态的关键作用 | 首次系统揭示CXCR4通过调控中性粒细胞动态参与牙周炎发病的新机制 | 研究样本量有限，具体分子机制仍需进一步验证 | 鉴定牙周炎关键免疫相关致病基因并分析免疫细胞浸润特征 | 牙周组织转录组数据、临床样本和牙周炎小鼠模型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,蛋白互作网络分析 | LASSO回归模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | GEO数据库数据集、临床样本和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 666 | 2025-10-06 |
GeneSurfer Enables Transcriptome-wide Exploration and Functional Annotation of Gene Co-expression Modules in 3D Spatial Transcriptomics Data
2024-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.05.602230
PMID:39005368
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研究论文 | 介绍GeneSurfer交互式工具，用于探索3D空间转录组数据中的基因共表达模块 | 开发首个用于大规模数据集局部基因共表达探索性分析的交互式界面，支持转录组范围的基因过滤、聚类和功能注释 | NA | 开发工具探索3D空间转录组数据中的局部基因共表达模式 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 667 | 2025-10-06 |
Integration analysis of cell division cycle-associated family genes revealed potential mechanisms of gliomagenesis and constructed an artificial intelligence-driven prognostic signature
2024-07, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111168
PMID:38599441
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研究论文 | 本研究通过整合分析细胞分裂周期相关基因家族，揭示了胶质瘤发生的潜在机制并构建了人工智能驱动的预后特征 | 首次系统研究CDCA基因家族在胶质瘤中的作用，结合多组学分析和机器学习算法构建预后模型 | NA | 阐明CDCA基因家族成员在胶质瘤中的功能和作用机制 | 胶质瘤患者和胶质瘤细胞 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组测序，生物信息学分析 | 无监督聚类算法，十种机器学习算法 | 多组学数据 | 八个胶质瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | NA |
| 668 | 2025-10-06 |
Deafness DFNB128 Associated with a Recessive Variant of Human MAP3K1 Recapitulates Hearing Loss of Map3k1-Deficient Mice
2024-Jun-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15070845
PMID:39062623
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研究论文 | 本研究通过发现MAP3K1基因的新型隐性变异与人类非综合征性耳聋DFNB128的关联，并利用小鼠模型验证其功能 | 首次发现MAP3K1基因隐性变异导致人类非综合征性耳聋，并通过计算模型预测其结构改变与表型的关系 | 研究仅基于一个近亲巴基斯坦家系，样本量有限 | 鉴定导致罕见形式耳聋的新致病基因 | 巴基斯坦近亲家系中的耳聋患者和小鼠耳蜗细胞 | 遗传学 | 耳聋 | 微阵列芯片, 外显子组测序, 单细胞转录组测序 | 计算结构建模 | 基因组数据, 转录组数据 | 一个巴基斯坦家系中的两个同胞群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 669 | 2025-10-06 |
Autophagy unrelated transcriptional mechanisms of hydroxychloroquine resistance revealed by integrated multi-omics of evolved cancer cells
2024-Apr, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2024.2402191
PMID:39299930
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示癌细胞对羟氯喹耐药的自噬无关转录机制 | 发现羟氯喹耐药主要通过转录可塑性而非自噬途径实现，识别了糖酵解、外泌作用和染色体凝聚/分离等新耐药机制 | 研究仅使用OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞两种细胞系，样本规模有限 | 探究癌细胞对羟氯喹耐药的分子机制 | OVCAR3卵巢癌细胞和CCL218结直肠癌细胞 | 多组学分析 | 卵巢癌,结直肠癌 | 全基因组筛选,正向遗传筛选,反向遗传筛选,CRISPR-Cas9,RNA-seq,外显子组测序,单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据 | 两种癌细胞系，经过15次药物脉冲追踪处理 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,外显子组测序 | NA | NA |
| 670 | 2025-10-06 |
Niche-DE: niche-differential gene expression analysis in spatial transcriptomics data identifies context-dependent cell-cell interactions
2024-01-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03159-6
PMID:38217002
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研究论文 | 开发了一种名为niche-DE的空间转录组数据分析方法，用于识别细胞类型特异性空间生态位相关基因 | 首次提出针对细胞-细胞相互作用驱动的局部基因表达变化的分析方法，并开发了配套的niche-LR方法揭示配体-受体信号机制 | NA | 识别空间转录组数据中由细胞间相互作用驱动的局部基因表达变化 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 适用于低分辨率点阵空间转录组数据以及单细胞或亚细胞分辨率数据 |
| 671 | 2025-10-06 |
Inflammatory Alterations to Renal Lymphatic Endothelial Cell Gene Expression in Mouse Models of Hypertension
2024, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000539721
PMID:38972305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压小鼠模型中肾淋巴管内皮细胞的基因表达变化 | 首次在高血压模型中系统揭示肾淋巴管内皮细胞的转录组多样性增加和炎症反应特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 评估高血压条件下肾淋巴管内皮细胞的具体变化 | 小鼠肾组织中的CD31+和podoplanin+细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种高血压小鼠模型（血管紧张素II诱导型和盐敏感型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 672 | 2025-10-06 |
Impaired myofibroblast proliferation is a central feature of pathologic post-natal alveolar simplification
2024-Dec-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94425
PMID:39660606
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多种小鼠模型揭示了肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化病理过程的核心特征 | 首次通过单细胞RNA测序在多种BPD模型中系统证实肌成纤维细胞增殖受损是肺泡简化的核心机制，而非传统认为的TGFβ信号增强 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究支气管肺发育不良(BPD)中肺泡简化的发病机制 | 早产儿支气管肺发育不良和多种小鼠肺泡简化模型 | 单细胞生物学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 药理学方法, 遗传学方法 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2025-10-06 |
Transcriptome Assembly at Single-Cell Resolution with Beaver
2024-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.04.621958
PMID:39574665
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研究论文 | 本文提出了一种名为Beaver的单细胞特异性转录本组装工具，用于短读长单细胞RNA测序数据 | 设计了转录本片段图结构，开发了高效的动态规划算法，并整合了两个基于51个精心设计特征的随机森林模型来准确估计候选转录本在单个细胞中表达的可能性 | 仅针对短读长scRNA-seq数据设计，未验证在其他单细胞测序技术上的表现 | 开发能够在单细胞分辨率下准确重建全长转录本的组装方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林, 动态规划算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq3 | Smart-seq3单细胞RNA测序技术 |
| 674 | 2025-10-06 |
Endothelial KLF11 is a novel protector against diabetic atherosclerosis
2024-10-26, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-024-02473-y
PMID:39462409
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞KLF11在糖尿病动脉粥样硬化中的保护作用机制 | 首次发现内皮KLF11通过抑制内皮-间质转化和炎症反应来保护糖尿病动脉粥样硬化 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究KLF11在糖尿病动脉粥样硬化中的保护机制 | 内皮细胞特异性KLF11转基因和敲除小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，功能获得和缺失实验 | NA | 基因表达数据 | 基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 675 | 2025-10-06 |
Atp13a5 Marker Reveals Pericyte Specification in the Mouse Central Nervous System
2024-Oct-23, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0727-24.2024
PMID:39261008
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学鉴定出小鼠中枢神经系统周细胞的特异性标记物Atp13a5，并建立了相应的基因工具模型 | 首次发现Atp13a5作为中枢神经系统周细胞的特异性标记物，并成功构建了兼具tdTomato报告基因和Cre重组酶的基因敲入模型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索中枢神经系统周细胞的功能特性和分子标记 | 小鼠中枢神经系统周细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组测序，基因敲入技术 | 基因敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据，成像数据 | 小鼠胚胎发育阶段（从E15开始）及成年小鼠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 676 | 2025-10-06 |
CXCL9, CXCL10, and CCL19 synergistically recruit T lymphocytes to skin in lichen planus
2024-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.179899
PMID:39190494
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现扁平苔藓中角质形成细胞和成纤维细胞特异性分泌CXCL9、CXCL10和CCL19细胞因子，并证实这些因子能协同增强CD8+ T细胞向皮肤的招募 | 首次揭示CCL19与CXCL9/CXCL10在T细胞招募中的协同作用机制，并发现CCL19可作为扁平苔藿治疗新靶点 | 样本量较小（仅7名患者），需更大规模研究验证发现 | 探究扁平苔藓的分子发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 扁平苔藓患者的配对血液和皮肤样本（病变和非病变组织） | 单细胞转录组学 | 扁平苔藓 | 单细胞RNA测序，体外迁移实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | 7名扁平苔藓患者的配对血液和皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 677 | 2025-10-06 |
LMD: Cluster-Independent Multiscale Marker Identification in Single-cell RNA-seq Data
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.12.566780
PMID:38014159
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研究论文 | 提出了一种名为LMD的新工具，用于在单细胞RNA测序数据中识别局部化基因标记 | 通过构建细胞-细胞亲和图并在细胞图上扩散基因表达值，基于扩散动力学为每个基因评分，实现多分辨率和细粒度的细胞多样性表征 | NA | 开发一种不依赖聚类的多尺度标记识别方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图扩散算法 | 基因表达数据 | 9个单细胞RNA测序数据集，包括小鼠骨髓和毛囊真皮凝聚物数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 678 | 2025-10-06 |
The spatial impact of a Western diet in enriching Galectin-1-regulated Rho, ECM, and SASP signaling in a novel MASH-HCC mouse model
2024-Oct-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00660-3
PMID:39402682
|
研究论文 | 本研究通过新型MASH-HCC小鼠模型探讨西方饮食如何通过Galectin-1信号通路影响肿瘤微环境 | 开发了新型MASH-HCC小鼠模型，首次揭示西方饮食通过空间特异性方式调控Galectin-1介导的Rho信号、ECM重塑和SASP通路 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明西方饮食通过Galectin-1信号通路促进MASH向HCC发展的机制 | MASH-HCC小鼠模型和人类MASH-HCC组织 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学，多重免疫组织化学 | 小鼠疾病模型 | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学，多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 679 | 2025-10-06 |
Colorectal cancer-associated bacteria are broadly distributed in global microbiomes and drivers of precancerous change
2024-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70702-1
PMID:39384807
|
研究论文 | 通过宏基因组分析发现结直肠癌相关细菌在全球微生物组中广泛分布并驱动癌前病变 | 采用参考基因组无关的基因水平聚类方法，首次将约23-40%的肠道细菌与结直肠癌或健康状态关联，并验证了先前未知细菌在癌前病变中的作用 | 研究主要基于已发表的宏基因组数据，需要进一步实验验证具体机制 | 定义全球人群中与结直肠癌和健康相关的肠道细菌规模和成员 | 全球微生物组调查中的肠道细菌 | 微生物组学 | 结直肠癌 | 超深度鸟枪法宏基因组测序，单细胞RNA测序，类器官共培养 | NA | 宏基因组测序数据，单细胞RNA测序数据 | 来自全球微生物组调查的已发表数据 | NA | 宏基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 680 | 2025-10-06 |
Intraocular Immune Response in Human Uveitis: Time to Look Beyond Animal Models
2024-Oct, American journal of ophthalmology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.ajo.2024.04.026
PMID:38703799
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综述 | 探讨研究人类葡萄膜炎眼内免疫反应的现有及未来方法 | 提出超越动物模型的研究策略，强调单细胞RNA测序技术在人眼内免疫细胞分析中的优势 | 当前技术成本高且操作复杂，人眼研究样本获取受限 | 比较人类与动物模型在葡萄膜炎免疫反应研究中的优劣 | 葡萄膜炎患者的眼内组织和液体样本 | 免疫学 | 葡萄膜炎 | 组织病理学分析, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本, 液体样本, 血液样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |