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当前共找到 7466 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-06 |
Redox signalling regulates breast cancer metastasis via phenotypic and metabolic reprogramming due to p63 activation by HIF1α
2024-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02522-5
PMID:38238426
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示氧化还原信号通过HIF1α激活p63调控乳腺癌转移的表型和代谢重编程机制 | 首次发现GPx2敲低通过HIF1α-p63轴驱动混合上皮-间质转化状态，揭示其在原发灶和转移灶中不同的代谢适应性 | 研究基于PyMT乳腺肿瘤模型，结果在人类乳腺癌中的普适性需要进一步验证 | 阐明氧化还原信号调控乳腺癌转移的细胞亚群和转录调控机制 | PyMT乳腺肿瘤模型中的肿瘤细胞亚群及其肺转移灶 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | PyMT/GPx2 KD原发肿瘤及配对肺转移灶样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 662 | 2025-10-06 |
Revealing the role of necroptosis microenvironment: FCGBP + tumor-associated macrophages drive primary liver cancer differentiation towards cHCC-CCA or iCCA
2024-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01908-3
PMID:38017206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了FCGBP+肿瘤相关巨噬细胞通过调控坏死性凋亡微环境驱动原发性肝癌向cHCC-CCA或iCCA分化的机制 | 首次识别FCGBP+SPP1+肿瘤相关巨噬细胞是调控坏死性凋亡微环境的关键细胞，并发现S100A6在癌前细胞向iCCA和cHCC-CCA进展中的重要作用 | 样本量较小（34个单细胞样本和3个空间转录组样本），主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探究坏死性凋亡微环境在原发性肝癌分化中的作用机制 | 原发性肝癌患者组织样本，包括HCC、iCCA和cHCC-CCA | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组织化学 | Seurat, monocle2, AUCell, geneSwitches, SpaCET, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 34个单细胞样本（4例HCC患者和3例iCCA患者），3个空间转录组样本（各1例HCC、iCCA和cHCC-CCA） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 663 | 2025-10-06 |
Apoptosis-related prognostic biomarkers and potential targets for acute kidney injury based on machine learning algorithm and in vivo experiments
2024-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01896-4
PMID:37789227
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法和体内实验识别了三个与细胞凋亡相关的急性肾损伤诊断生物标志物 | 首次结合WGCNA、差异表达分析和机器学习算法鉴定出CBFB、EGF和COL1A1三个核心凋亡相关基因作为AKI诊断标志物，并构建了诊断模型 | 研究样本来源和数量未明确说明，诊断模型需要在更大临床样本中进一步验证 | 开发急性肾损伤的精确诊断生物标志物和治疗方法 | 急性肾损伤患者和AKI小鼠模型 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，差异表达分析，逻辑回归分析，CIBERSORT免疫浸润分析 | 逻辑回归，ROC曲线分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 664 | 2025-10-06 |
Recent advances in differential expression analysis for single-cell RNA-seq and spatially resolved transcriptomic studies
2024-03-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad011
PMID:37022699
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综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序和空间转录组学数据中差异表达分析的最新进展与挑战 | 首次针对多条件、多样本实验设计下的scRNA-seq和SRT数据差异表达分析工具进行系统性梳理，并提供方法选择与开发指导 | 未进行实证方法比较，主要提供理论框架和综述性指导 | 探讨单细胞和空间转录组数据中差异表达分析的特殊挑战与发展方向 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间解析转录组学(SRT)数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 665 | 2025-10-06 |
An improved hierarchical variational autoencoder for cell-cell communication estimation using single-cell RNA-seq data
2024-03-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac056
PMID:36752035
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研究论文 | 提出一种改进的层次变分自编码器模型，利用单细胞RNA-seq数据自动估计细胞间通讯 | 结合层次变分自编码器和传递熵方法，无需依赖先验知识即可自动推断细胞间通讯关系 | 仅在人皮肤疾病和黑色素瘤数据集上进行了验证，需要更多数据集验证通用性 | 开发新方法准确估计肿瘤微环境中的细胞间通讯 | 单细胞RNA测序数据中的细胞间通讯关系 | 生物信息学 | 皮肤疾病, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 层次变分自编码器(HiVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 666 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq data clustering by deep information fusion
2024-03-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad017
PMID:37208992
|
研究论文 | 提出一种基于深度信息融合的单细胞RNA-seq数据聚类方法scDeepFC | 通过深度信息融合网络同时利用基因属性信息和细胞拓扑结构，结合ZINB模型处理dropout事件 | NA | 解决单细胞转录组数据聚类和插补的计算挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度自编码器, 图卷积网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 667 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA sequencing data to genome-wide association analysis data identifies significant cell types in influenza A virus infection and COVID-19
2024-03-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad025
PMID:37340787
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和全基因组关联分析数据，识别与甲型流感病毒感染和COVID-19相关的显著细胞类型 | 首次将流感GWAS数据与scRNA-seq数据整合分析，识别不同人群中的疾病相关细胞类型 | 需要更多后续研究的关注和验证 | 揭示与流感疾病相关的细胞类型，为理解发病机制提供线索 | 甲型流感病毒和COVID-19 | 生物信息学 | 呼吸道传染病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | RolyPoly, LDSC-cts | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 约70,000个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 668 | 2025-10-06 |
Molecular Signatures of Glomerular Neovascularization in a Patient with Diabetic Kidney Disease
2024-Feb-01, Clinical journal of the American Society of Nephrology : CJASN
IF:8.5Q1
DOI:10.2215/CJN.0000000000000276
PMID:37533147
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术分析糖尿病肾病患者肾活检样本中肾小球新生血管的分子特征 | 首次使用三维免疫荧光成像和空间转录组学揭示糖尿病肾病中肾小球周围新生血管的分子特征，突破了传统病理学评估的局限 | 仅基于单个病例分析，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索糖尿病肾病中肾小球新生血管的分子机制 | 66岁女性糖尿病肾病患者 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学，三维免疫荧光成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 1例患者肾活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 669 | 2025-10-06 |
Development and experimental validation of a machine learning-based disulfidptosis-related ferroptosis score for hepatocellular carcinoma
2024-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01900-x
PMID:37875647
|
研究论文 | 开发并实验验证了一种基于机器学习的双硫死亡相关铁死亡评分系统，用于肝细胞癌研究 | 首次构建双硫死亡相关铁死亡(DRF)评分系统，并通过单细胞水平分析和体外实验验证KIF20A功能 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 探索双硫死亡相关铁死亡基因在肝细胞癌中的作用机制 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外实验 | Pearson分析, 差异分析, uniCox回归, lasso, ranger, 多变量Cox回归 | 基因表达数据 | 肝细胞癌患者队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 670 | 2025-10-06 |
Myeloid-specific ablation of Basp1 ameliorates diet-induced NASH in mice by attenuating pro-inflammatory signaling
2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000537
PMID:37505219
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现Basp1是NASH中髓系细胞炎症信号的关键调控因子 | 首次发现Basp1在NASH肝脏中特异性高表达，并通过髓系特异性敲除证实其在NASH发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床意义需要进一步验证 | 探究髓系细胞在NASH发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 小鼠髓系细胞（巨噬细胞和树突状细胞）及人类NASH肝脏样本 | 生物医学研究 | 非酒精性脂肪性肝炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据 | 小鼠模型及人类肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 671 | 2025-10-06 |
A Strategy based on Bioinformatics and Machine Learning Algorithms Reveals Potential Mechanisms of Shelian Capsule against Hepatocellular Carcinoma
2024, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习算法揭示了射莲胶囊抗肝细胞癌的潜在作用机制 | 首次整合生物信息学分析和多种机器学习算法系统研究射莲胶囊抗肝癌的多层次作用机制 | 研究主要基于数据库分析和计算模拟，缺乏实验验证 | 探索射莲胶囊治疗肝细胞癌的潜在药理机制 | 射莲胶囊的活性成分和肝细胞癌相关基因 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析,机器学习算法,单细胞RNA测序,分子对接 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),多种机器学习算法 | 基因表达数据,化合物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,微阵列芯片 | NA | NA |
| 672 | 2025-10-06 |
leptin b and its regeneration enhancer illustrate the regenerative features of zebrafish hearts
2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.556
PMID:36495292
|
研究论文 | 本研究利用leptin b及其组织再生增强子元件解析斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞的异质性 | 首次将lepb作为再生特异性标志物来识别损伤激活的内皮细胞亚群，并发现lepb+内皮细胞作为信号中心与其他心脏细胞相互作用 | 研究仅限于斑马鱼模型，未在哺乳动物中进行验证 | 解析斑马鱼心脏再生的细胞和分子机制 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞（内皮细胞、心外膜和心外膜来源细胞） | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析，转基因品系 | NA | 单细胞转录组数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals the loss of FABP4-positive proliferating valvular endothelial cells relates to functional mitral regurgitation
2024-12-20, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03791-4
PMID:39707349
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析功能性二尖瓣反流患者二尖瓣叶的细胞组成和分子变化 | 首次在功能性二尖瓣反流中发现FABP4阳性增殖性瓣膜内皮细胞亚群的异常减少及其在疾病中的作用 | 样本量较小（仅6例患者），需要更大规模研究验证 | 研究功能性二尖瓣反流的发病机制和分子变化 | 二尖瓣反流患者的二尖瓣叶组织和原代瓣膜内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，免疫组织化学，体外细胞实验 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 6例心脏移植患者（3例二尖瓣反流，3例对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 674 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and bulk transcriptome analysis of R-loop score-based signature with regard to immune microenvironment, lipid metabolism and prognosis in HCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487372
PMID:39850878
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了基于R-loop评分的特征模型，探索其在肝细胞癌免疫微环境、脂质代谢和预后中的作用 | 首次构建了基于R-loop评分的预后模型，揭示了R-loop调节因子CLTC通过调控脂质代谢促进肝癌进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限；样本来源和数量可能存在限制 | 探索R-loop在肝细胞癌进展中的作用机制，并构建预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA分析, 体外实验, 体内实验 | R-loop评分模型, 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 来自GSE149614和CRA002308数据集的HCC患者单细胞数据，TCGA数据库的批量数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 675 | 2025-10-06 |
Epithelial tubule interconnection driven by HGF-Met signaling in the kidney
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416887121
PMID:39705305
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研究论文 | 本研究揭示了HGF-Met信号通路通过MAPK和MMPs促进肾脏上皮小管吻合的机制 | 首次发现HGF能够独立于细胞增殖促进上皮小管吻合，并建立了可视化定量分析小管连接的实验方法 | 研究仅限于胚胎小鼠肾脏模型，尚未在人类或其他成年动物模型中验证 | 探究肾脏上皮小管吻合的分子机制 | 胚胎小鼠肾脏上皮小管 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，荧光图像 | 胚胎小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 676 | 2025-10-06 |
Decoding aging in the heart via single cell dual omics of non-cardiomyocytes
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111469
PMID:39735437
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研究论文 | 通过单细胞双组学技术解析心脏非心肌细胞在衰老过程中的分子变化 | 首次在单细胞水平同时应用转录组和表观基因组分析心脏非心肌细胞的衰老过程，揭示了细胞类型内衰老异质性和细胞间通讯的变化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；仅关注非心肌细胞，未包含心肌细胞分析 | 解析心脏衰老的细胞和分子机制 | 年轻、中年和老年小鼠的心脏非心肌细胞 | 单细胞组学 | 心脏衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 年轻、中年和老年三个年龄组的小鼠心脏非心肌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 677 | 2025-10-06 |
Genomic and the tumor microenvironment heterogeneity in multifocal hepatocellular carcinoma
2024-Dec-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001191
PMID:39666875
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研究论文 | 本研究通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序，深入解析了多灶性肝细胞癌中瘤内转移和多中心发生的肿瘤微环境异质性 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了多灶性肝细胞癌中瘤内转移和多中心发生的基因组和肿瘤微环境差异 | 样本量相对有限(7名患者的23个样本)，需要在更大队列中验证 | 阐明多灶性肝细胞癌中瘤内转移和多中心发生的肿瘤微环境异质性 | 多灶性肝细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 全外显子组测序,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因组数据,转录组数据,图像数据 | 7名患者的23个样本，另有验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子组测序 | NA | NA |
| 678 | 2025-10-06 |
Identification of the key targets for sepsis-associated acute kidney injury by RNA sequencing combined with bioinformatics methods
2024-11-30, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00673-5
PMID:39616313
|
研究论文 | 通过RNA测序结合生物信息学方法识别脓毒症相关急性肾损伤的关键靶点基因 | 首次将脓毒症差异表达基因与肾脏特异性基因进行交集分析，鉴定出CD74和IL32作为脓毒症相关肾损伤的新型生物标志物 | 样本量较小（10例健康对照和22例脓毒症患者），需要更大规模研究验证 | 探索脓毒症患者并发肾损伤的相关基因，为早期识别和预后研究提供可靠靶点 | 脓毒症患者和健康个体的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | RNA测序, 生物信息学分析, 单细胞RNA测序 | 差异表达分析, GO分析, KEGG分析, 生存分析, ROC分析 | RNA测序数据 | 32例样本（10例健康对照，22例脓毒症患者） | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2025-10-06 |
From bioinformatics to clinical applications: a novel prognostic model of cuproptosis-related genes based on single-cell RNA sequencing data in hepatocellular carcinoma
2024-09-09, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00649-5
PMID:39251909
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据开发了一种铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和RNA测序数据构建铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 模型验证仍需更多临床队列验证 | 研究铜死亡相关基因与肝细胞癌预后的关系并构建预后模型 | 肝细胞癌患者和正常对照 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | Cox回归,LASSO回归 | 基因表达数据 | GEO和TCGA数据库中的肝细胞癌患者和正常对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 680 | 2025-10-06 |
Regulator of G-protein signaling expression in human intestinal enteroendocrine cells and potential role in satiety hormone secretion in health and obesity
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105283
PMID:39142076
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研究论文 | 本研究揭示了人肠道内分泌细胞中G蛋白信号调节因子的表达谱及其在饱腹激素分泌和肥胖中的潜在作用 | 首次在瘦型和肥胖个体中通过单细胞RNA测序揭示了肠道内分泌细胞独特的RGS表达谱，并发现RGS9表达与BMI正相关、与餐后GLP-1和PYY负相关 | 样本量相对有限（61例患者），部分数据依赖公开数据集，需要进一步验证RGS的具体作用机制 | 探究RGS在肠道内分泌细胞中的表达特征及其对饱腹激素分泌的调节作用 | 人结肠和空肠L型肠内分泌细胞、61例患者肠道黏膜组织、NCI-H716细胞系 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 体外细胞培养, 激素检测 | NA | 转录组数据, 临床数据, 体外实验数据 | 61例患者（42例肥胖，19例瘦型），公开数据集GSE114853 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |