单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 7464 篇文献，本页显示第 6761 - 6780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6761 | 2024-08-07 |
Single-cell and bulk RNA sequencing highlights the role of M1-like infiltrating macrophages in antibody-mediated rejection after kidney transplantation
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e27865
PMID:38524599
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了肾移植后抗体介导排斥反应中M1样浸润巨噬细胞的作用 | 首次详细描述了肾移植后抗体介导排斥反应中巨噬细胞的亚群及其在病理和预后中的作用 | 研究主要基于已有的数据库和临床数据，未涉及前瞻性临床试验 | 探讨肾移植后抗体介导排斥反应中巨噬细胞的表型、起源和机制 | 肾移植后抗体介导排斥反应中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 五份肾移植后活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6762 | 2024-08-04 |
Dynamic video recognition for cell-encapsulating microfluidic droplets
2024-Mar-25, The Analyst
DOI:10.1039/d4an00022f
PMID:38441128
|
研究论文 | 本研究探讨了在微流体液滴视频识别中应用弱监督细胞计数网络的软件 | 提出了一种实时视频处理方法，能够在没有监督位置信息的情况下准确定位液滴和被包覆的细胞，并显著减少标注工作量 | 未提及研究的具体限制 | 优化液滴微流控技术中的质量控制，并提高基于视频识别的细胞包覆评估 | 主要研究不同微流体结构中包覆六种类型细胞/珠子的液滴 | 数字病理学 | NA | 弱监督细胞计数网络 | NA | 视频 | 六种类型的细胞/珠子液滴 | NA | NA | NA | NA |
| 6763 | 2024-08-04 |
Dynamic YAP expression in the non-parenchymal liver cell compartment controls heterologous cell communication
2024-Mar-04, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05126-1
PMID:38436764
|
研究论文 | 该文章探讨了YAP和TAZ在小鼠非实质性肝细胞中的动态表达如何控制细胞间的通信。 | 提出了一种新的机制，说明YAP如何通过影响非实质性细胞的细胞间通信来促进炎症。 | 研究主要集中在小鼠模型，结果是否适用于人类尚不清楚 | 研究YAP和TAZ的失活对肝细胞特征和细胞间通信的影响 | 使用了专门缺失YAP和TAZ的小鼠模型进行观察 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 免疫组化，单细胞测序，蛋白质组学 | NA | 组织样本，血清 | YAPKO和DKO小鼠，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 6764 | 2024-08-07 |
GLIPR2: a potential biomarker and therapeutic target unveiled - Insights from extensive pan-cancer analyses, with a spotlight on lung adenocarcinoma
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1280525
PMID:38476239
|
研究论文 | 本研究通过广泛的数据集分析，探讨了GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达情况及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力，特别关注肺腺癌。 | 首次全面分析GLIPR2在多种癌症中的表达及其与免疫细胞浸润的关系，揭示了其在肺腺癌中的诊断和预后价值。 | NA | 探讨GLIPR2在多种癌症中的表达及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。 | GLIPR2在多种人类恶性肿瘤中的表达及其与免疫细胞浸润的关系。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序 | NA | 基因组数据 | 多中心队列涵盖多种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 6765 | 2024-08-07 |
Coniferyl ferulate alleviate xylene-caused hematopoietic stem and progenitor cell toxicity by Mgst2
2024, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2024.1334445
PMID:38523643
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了松脂素阿魏酸酯（CF）通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的作用 | 首次揭示了松脂素阿魏酸酯通过靶向Mgst2基因减轻二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的新机制 | NA | 探讨松脂素阿魏酸酯对二甲苯引起的造血干细胞和祖细胞毒性的缓解作用及其分子机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）及二甲苯引起的毒性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的骨髓造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6766 | 2024-08-07 |
ICOS costimulation in combination with CTLA-4 blockade remodels tumor-associated macrophages toward an antitumor phenotype
2024-Apr-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20231263
PMID:38517331
|
研究论文 | 研究探讨了ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗对肿瘤相关巨噬细胞表型的重塑作用 | 发现ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗能显著重塑淋巴和髓系细胞，增强Th1 CD4 T细胞、效应CD8 T细胞和M1样抗肿瘤促炎巨噬细胞的富集 | NA | 研究ICOS共刺激与CTLA-4阻断联合治疗在抗肿瘤治疗中的协同作用及其机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和效应T细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | CyTOF和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及B16-F10细胞疫苗和多种免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6767 | 2024-08-07 |
Single cell deciphering of progression trajectories of the tumor ecosystem in head and neck cancer
2024-Mar-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46912-6
PMID:38519500
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了头颈部鳞状细胞癌在不同阶段的肿瘤生态系统进展轨迹 | 首次揭示了恶性上皮细胞的转录发育轨迹及由TFDP1调控的肿瘤生成上皮亚群，并发现了POSTN纤维母细胞和SPP1巨噬细胞在肿瘤进展中的浸润增加及其与恶性细胞的相互作用增强 | NA | 旨在更好地表征头颈部鳞状细胞癌的肿瘤进展轨迹 | 头颈部鳞状细胞癌的正常组织、癌前组织、早期和晚期癌症组织、淋巴结及复发肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多种组织样本，包括正常组织、癌前组织、早期和晚期癌症组织、淋巴结及复发肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA |
| 6768 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis identifies a tumor immune microenvironment-related lncRNA signature in lung adenocarcinoma
2024-Mar-22, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01866-5
PMID:38519942
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出与肺腺癌肿瘤免疫微环境相关的长非编码RNA（lncRNA）特征 | 首次开发了一种基于肿瘤免疫微环境相关lncRNA的特征（TRLS），该特征在预测肺腺癌患者总体生存方面表现出色，并显示出对免疫治疗的敏感性 | NA | 开发一种新的工具，用于肺腺癌患者的个性化治疗和预后管理 | 肺腺癌患者的肿瘤免疫微环境相关的lncRNA | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 机器学习框架 | RNA测序数据 | 1368名肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6769 | 2024-08-07 |
Involvement of TGFBI-TAGLN axis in cancer stem cell property of head and neck squamous cell carcinoma
2024-03-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-57478-0
PMID:38514830
|
研究论文 | 本研究探讨了TGFBI在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用及其通过TAGLN轴促进癌症干细胞特性的机制 | 首次揭示了TGFBI通过上调TAGLN促进HNSCC中癌症干细胞特性的新机制 | NA | 阐明TGFBI对HNSCC细胞恶性行为的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用TCGA数据库中的RNA测序数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 6770 | 2024-08-04 |
Transcriptomic changes associated with oral immunotherapy for food allergy
2024-Mar, Pediatric allergy and immunology : official publication of the European Society of Pediatric Allergy and Immunology
IF:4.3Q1
DOI:10.1111/pai.14106
PMID:38520061
|
综述 | 这篇综述总结了与口服免疫疗法相关的转录通路的最新进展 | 采用单细胞测序等技术，提供了对口服免疫疗法后基因表达变化的新见解 | 对长期和明确临床结果相关的免疫特征的研究仍然不足 | 研究口服免疫疗法后免疫机制的转录变化 | 关注过敏性食物患者在接受口服免疫疗法后的基因表达变化 | 数字病理学 | 食物过敏 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6771 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals landscape of endometrial cancer response to estrogen and identification of early diagnostic markers
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0301128
PMID:38517922
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了子宫内膜癌对雌激素反应的景观，并识别了早期诊断标志物 | 本研究首次在单细胞分辨率下阐明了子宫内膜癌对雌激素反应的潜在生物学机制，并识别了24个早期诊断标志物 | NA | 探讨子宫内膜癌对雌激素的反应机制，并寻找早期诊断标志物 | 子宫内膜癌细胞及其对雌激素的反应 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组（ST） | 逻辑回归（LR）、高斯朴素贝叶斯（GaussianNB）、k-最近邻（KNN）、支持向量机（SVM）、极端梯度提升（XGB）和神经网络（NK） | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6772 | 2024-08-04 |
Characterization of macrophages in ischemia-reperfusion injury-induced acute kidney injury based on single-cell RNA-Seq and bulk RNA-Seq analysis
2024-Mar-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111754
PMID:38428147
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和总体RNA测序分析来表征缺血再灌注损伤引起的急性肾损伤中的巨噬细胞 | 识别了在缺血再灌注肾损伤中参与的巨噬细胞亚型及相关的中心基因，提出了四个新的生物标志物和潜在的治疗靶点 | 本研究的局限性在于对巨噬细胞功能机制的理解仍不清晰，针对巨噬细胞的策略在急性肾损伤中的效果存在争议 | 探讨缺血再灌注损伤中巨噬细胞的作用及其相关基因 | 本研究的研究对象为参与缺血再灌注引起的急性肾损伤的巨噬细胞亚型及其相关基因 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA-seq和总体RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 包含正常样本和缺血再灌注后3天的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6773 | 2024-08-07 |
Prognostic implication of UBE2C + CD8 + T cell in neoadjuvant immune checkpoint blockade plus chemotherapy for locally advanced esophageal cancer
2024-Mar-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111696
PMID:38412672
|
研究论文 | 本研究旨在探讨免疫检查点抑制剂（ICBs）联合化疗作为新辅助治疗在局部晚期食管癌患者中的早期和中期疗效，并发现与主要病理反应（MPR）相关的免疫预测因子。 | 本研究首次揭示了UBE2C+CD8+T细胞作为局部晚期食管癌患者接受新辅助ICBs联合化疗后的不良预后因子。 | 研究为回顾性分析，样本量相对较小，且仅限于特定时间段内的患者。 | 研究新辅助ICBs联合化疗在局部晚期食管癌中的疗效及免疫预测因子。 | 局部晚期食管癌患者。 | 免疫学 | 食管癌 | Bulk-RNA seq, scRNA seq, 多重免疫荧光 | NA | RNA序列数据, 免疫荧光图像 | 76名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 6774 | 2024-08-04 |
eSVD-DE: cohort-wide differential expression in single-cell RNA-seq data using exponential-family embeddings
2024-Mar-15, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05724-7
PMID:38486150
|
研究论文 | 本文介绍了eSVD-DE，一种针对单细胞RNA测序数据的大规模人群差异表达检测的新方法 | 提出了一种新的矩阵分解方法，能够在去除混杂变量影响的同时进行差异基因测试 | 在较大的数据集中，可能仍然存在一些人类变异的影响 | 旨在更准确地识别单细胞RNA测序数据中群体级的差异表达基因 | 对大量案例和对照个体的单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 层次模型 | 基因表达数据 | 使用了多个生物系统的已发布数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6775 | 2024-08-07 |
Profiling Cell Heterogeneity and Fructose Transporter Expression in the Rat Nephron by Integrating Single-Cell and Microdissected Tubule Segment Transcriptomes
2024-Mar-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25053071
PMID:38474316
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和微切割管状段转录组数据，研究了大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达 | 首次揭示了大鼠近端小管各亚段中果糖转运蛋白的复杂异质性表达模式，并发现S3段是果糖重吸收的主要部位 | 研究仅基于公开数据库的数据，未进行实验验证 | 探究大鼠肾单位中细胞异质性和果糖转运蛋白表达模式 | 大鼠肾单位中的细胞异质性和果糖转运蛋白表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了公开数据库中的大鼠肾脏转录组和蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 6776 | 2024-08-04 |
eSVD-DE: Cohort-wide differential expression in single-cell RNA-seq data using exponential-family embeddings
2024-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.22.568369
PMID:38045428
|
研究论文 | 本文提出了一种新方法eSVD-DE，用于在单细胞RNA-seq数据中分析 cohort-wide 差异表达基因 | eSVD-DE通过矩阵分解汇集基因信息，并引入层次模型以准确测试病例和对照个体的后验均值分布差异 | 本研究在处理人类变异带来的混杂协变量时可能仍然面临一些挑战 | 旨在开发一套新方法，分析大规模聚类中单细胞RNA-seq数据的差异表达基因 | 研究对象为大量病例和对照个体的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 层次模型 | 基因表达数据 | 多个生物系统的已发布数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 6777 | 2024-08-04 |
Adipose tissue macrophage heterogeneity in the single-cell genomics era
2024-Feb, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2024.100031
PMID:38354858
|
研究论文 | 文章讨论了在单细胞基因组学时代脂肪组织巨噬细胞的异质性 | 提出了单细胞转录组技术能够揭示脂肪组织巨噬细胞的高度异质性 | 需要进一步研究以更好地理解ATMs和肥胖对其影响的复杂性 | 探讨肥胖及其引发的炎症如何影响脂肪组织巨噬细胞 | 主要研究脂肪组织巨噬细胞(ATMs)的异质性及其特征 | 数字病理 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6778 | 2024-08-04 |
Long-read single-cell sequencing reveals expressions of hypermutation clusters of isoforms in human liver cancer cells
2024-Jan-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87607
PMID:38206124
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于LOOPSeq技术的合成长读取单细胞测序技术，以分析人类肝癌细胞中的超突变亚型表达 | 本研究的创新点在于应用LOOPSeq技术实现精确的长读取单细胞转录组测序，并识别出特定于肝癌细胞的突变mRNA亚型 | 本研究的局限性未具体提到，故为NA | 本研究旨在揭示人类肝癌细胞中蛋白表达谱的复杂性 | 本研究对象为来自个体的447个肝细胞癌和良性肝脏转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 长读取测序 | NA | 转录组 | 447个转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 6779 | 2024-08-07 |
Stiffness-dependent MSC homing and differentiation into CAFs - implications for breast cancer invasion
2024-01-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.261145
PMID:38108421
|
研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中癌细胞与间充质干细胞（MSCs）在不同硬度基质下的相互作用如何影响三阴性乳腺癌（TNBC）的侵袭性 | 首次展示了在预转移阶段，MSCs向癌症相关成纤维细胞（CAFs）的分化如何促进TNBC的侵袭和转移 | NA | 研究肿瘤微环境中细胞异质性和细胞外基质（ECM）硬化对乳腺癌侵袭性的影响 | 三阴性乳腺癌（TNBC）中的间充质干细胞（MSCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及高侵袭性三阴性乳腺癌（TNBC）的原发肿瘤、次级部位和循环肿瘤细胞簇中的亚群细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 6780 | 2024-08-07 |
The pelvic organs receive no parasympathetic innervation
2024-Mar-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91576
PMID:38488657
|
research paper | 本研究使用单细胞RNA测序技术，发现小鼠盆腔神经节由四种不同于交感和副交感神经元的神经元组成，这些神经元与交感神经元有亲缘关系，但不与副交感神经元相关。研究还表明，脊髓腰段节前神经元在盆腔神经节中与去甲肾上腺素能和胆碱能细胞形成突触，这两种细胞均作为交感神经的传递介质。因此，盆腔器官不接受来自副交感或典型交感神经元的神经支配，而是接受来自交感神经链末端分支的神经支配，负责其特有的功能。 | 本研究首次揭示了盆腔神经节中的神经元类型及其与交感和副交感神经元的关系，并证明了盆腔器官不接受副交感神经的神经支配。 | NA | 探讨盆腔器官的自主神经支配机制 | 小鼠盆腔神经节中的神经元类型及其功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |